MarkerName	Allele1	Allele2	Freq1	FreqSE	MinFreq	MaxFreq	Effect	StdErr	P-value	Direction	HetISq	HetChiSq	HetDf	HetPVal
4 : 117872290 : SNP	t	c	0.5175	0.0223	0.4693	0.5294	0.0019	0.0085	0.8257	--+++	0.0	1.298	4	0.8617
8 : 95515267 : SNP	t	g	0.0662	0.0064	0.0487	0.0701	0.0090	0.0175	0.6078	+-?++	11.8	3.401	3	0.3338
5 : 108351008 : SNP	t	c	0.0735	0.0089	0.0507	0.0815	-0.0243	0.0171	0.1552	--??+	0.0	1.748	2	0.4173
13 : 95641486 : SNP	a	g	0.5833	0.0081	0.5504	0.5894	-0.0048	0.0085	0.5728	--+-+	59.1	9.779	4	0.04431
19 : 55385406 : SNP	a	g	0.0822	0.0093	0.0734	0.0926	0.0140	0.0286	0.6232	+??--	0.0	1.216	2	0.5444
5 : 160642675 : SNP	t	c	0.9566	0.0070	0.9434	0.9687	-0.0008	0.0224	0.9707	+-?+-	0.0	1.489	3	0.6848
1 : 150884271 : SNP	a	g	0.0873	0.0149	0.0759	0.1127	0.0418	0.0154	0.006597	+++-+	0.0	2.391	4	0.6642
11 : 34797355 : SNP	t	c	0.4900	0.0149	0.4567	0.5028	-0.0127	0.0085	0.1358	--+-+	0.0	1.627	4	0.804
14 : 59795509 : SNP	c	g	0.9504	0.0025	0.9484	0.9535	-0.0374	0.0244	0.1257	--???	0.0	0.291	1	0.5896
3 : 22254567 : SNP	c	g	0.0740	0.0029	0.0691	0.0839	0.0166	0.0176	0.3454	0+?++	5.2	3.165	3	0.3669
3 : 85284590 : SNP	a	c	0.0727	0.0113	0.0655	0.1040	-0.0136	0.0171	0.4273	-+?+-	13.9	3.485	3	0.3226
15 : 56417930 : SNP	a	g	0.9122	0.0113	0.9041	0.9455	-0.0123	0.0159	0.4375	--??-	30.5	2.877	2	0.2372
21 : 41554805 : SNP	t	c	0.9219	0.0000	0.9219	0.9219	-0.0340	0.0414	0.412	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 20915000 : SNP	a	g	0.1127	0.0051	0.1011	0.1164	0.0036	0.0137	0.79	--+-+	0.0	1.407	4	0.843
21 : 20227599 : SNP	a	g	0.1837	0.0072	0.1646	0.2051	-0.0038	0.0107	0.7228	--+-+	0.0	3.049	4	0.5496
2 : 62124053 : SNP	t	c	0.0262	0.0000	0.0262	0.0262	0.0340	0.0425	0.4232	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 61303940 : SNP	a	c	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	0.0250	0.0475	0.5988	+????	0.0	0.000	0	1
22 : 44763606 : SNP	a	g	0.3413	0.0090	0.3331	0.3638	-0.0070	0.0093	0.4469	--++-	0.0	0.946	4	0.9179
1 : 246585880 : SNP	t	c	0.0427	0.0008	0.0418	0.0435	0.0183	0.0228	0.4225	-+??+	40.1	3.337	2	0.1886
2 : 212881444 : SNP	a	g	0.1295	0.0138	0.1013	0.1411	0.0170	0.0130	0.1899	++-++	22.5	5.161	4	0.2712
6 : 75547817 : INDEL	d	r	0.1318	0.0052	0.1251	0.1404	-0.0103	0.0127	0.4158	-+++-	0.0	2.542	4	0.6372
7 : 83863151 : SNP	t	c	0.2985	0.0116	0.2518	0.3303	-0.0063	0.0093	0.5027	-++--	0.0	3.568	4	0.4676
10 : 2387895 : SNP	a	g	0.0151	0.0000	0.0151	0.0151	0.0610	0.0495	0.2181	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 45390944 : SNP	a	g	0.6422	0.0175	0.6249	0.6695	0.0017	0.0092	0.8568	+----	47.1	7.568	4	0.1088
5 : 178280334 : SNP	a	t	0.6435	0.0092	0.6024	0.6470	-0.0129	0.0090	0.1513	---+-	25.0	5.335	4	0.2546
1 : 70164015 : INDEL	i	r	0.4258	0.0029	0.4213	0.4334	-0.0189	0.0086	0.0272	-----	0.0	0.638	4	0.9588
14 : 87488116 : SNP	a	t	0.7372	0.0061	0.7256	0.7454	0.0209	0.0126	0.09915	+++++	0.0	0.587	4	0.9645
2 : 35754640 : SNP	t	c	0.0606	0.0053	0.0528	0.0650	0.0028	0.0207	0.8911	++?-+	22.8	3.885	3	0.2741
6 : 53089910 : INDEL	d	r	0.0953	0.0101	0.0834	0.1123	-0.0167	0.0151	0.2676	--?+-	0.0	1.781	3	0.619
1 : 43697968 : SNP	a	g	0.6703	0.0061	0.6556	0.6878	-0.0006	0.0093	0.9521	+--++	0.0	3.471	4	0.4823
9 : 72370560 : INDEL	i	r	0.1351	0.0062	0.1143	0.1413	-0.0160	0.0127	0.2066	--+--	0.0	2.246	4	0.6906
18 : 19586240 : SNP	t	c	0.9395	0.0059	0.9331	0.9462	-0.0222	0.0187	0.235	+-?++	57.8	7.107	3	0.06856
4 : 54695430 : SNP	c	g	0.9755	0.0000	0.9755	0.9755	-0.0200	0.0414	0.6294	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 55304509 : SNP	a	g	0.6848	0.0176	0.6701	0.7219	0.0021	0.0092	0.8235	-+--+	0.0	3.564	4	0.4682
2 : 134475215 : SNP	a	g	0.3030	0.0231	0.2890	0.3620	-0.0125	0.0091	0.1687	+----	0.0	3.292	4	0.5103
6 : 54502348 : SNP	t	c	0.0876	0.0030	0.0820	0.0902	0.0153	0.0151	0.3106	++-+-	3.8	4.159	4	0.3849
8 : 38736971 : SNP	a	g	0.4922	0.0112	0.4739	0.5220	-0.0038	0.0086	0.6596	+-++-	0.0	1.566	4	0.815
18 : 43595802 : SNP	t	c	0.0811	0.0066	0.0654	0.0856	0.0100	0.0163	0.5398	-+?++	62.9	8.095	3	0.0441
1 : 24908625 : SNP	a	c	0.7422	0.0163	0.7226	0.7847	0.0086	0.0099	0.384	++++-	0.0	3.046	4	0.5501
10 : 43897470 : SNP	t	c	0.7705	0.0102	0.7580	0.7806	-0.0066	0.0103	0.5254	--+--	0.0	1.456	4	0.8344
3 : 145744929 : SNP	t	g	0.0540	0.0025	0.0509	0.0560	-0.0349	0.0261	0.1815	--???	0.0	0.450	1	0.5023
9 : 21210847 : SNP	t	c	0.0433	0.0076	0.0343	0.0604	-0.0095	0.0231	0.6797	-+?+-	0.0	0.827	3	0.843
10 : 5903837 : SNP	a	g	0.9387	0.0012	0.9378	0.9414	-0.0059	0.0189	0.7565	+-?--	73.5	11.321	3	0.01011
6 : 14275517 : SNP	a	c	0.9736	0.0000	0.9736	0.9736	-0.0060	0.0546	0.9125	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 89645427 : SNP	a	g	0.9432	0.0040	0.9415	0.9535	-0.0032	0.0194	0.8709	--??+	75.6	8.199	2	0.01658
10 : 11431451 : SNP	t	c	0.0217	0.0000	0.0217	0.0217	0.0150	0.0516	0.7711	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 64353269 : SNP	a	g	0.3908	0.0114	0.3800	0.4093	0.0029	0.0089	0.7441	-+++-	0.0	3.070	4	0.5461
2 : 115374585 : SNP	c	g	0.0656	0.0031	0.0580	0.0717	0.0123	0.0173	0.4766	-+?-+	70.4	10.142	3	0.01739
13 : 62720278 : SNP	c	g	0.6155	0.0070	0.6028	0.6345	0.0060	0.0089	0.5018	+--+-	0.0	2.859	4	0.5817
15 : 50917095 : SNP	a	g	0.1056	0.0025	0.0969	0.1078	-0.0064	0.0140	0.6464	----+	0.0	1.346	4	0.8535
22 : 27927298 : SNP	t	c	0.9435	0.0069	0.9348	0.9642	0.0182	0.0192	0.3424	+-?-+	0.0	1.428	3	0.699
18 : 43572325 : SNP	a	g	0.1308	0.0071	0.1175	0.1454	0.0033	0.0129	0.8013	---++	48.9	7.820	4	0.09838
3 : 145677515 : SNP	a	g	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	0.0040	0.0485	0.9343	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 16513157 : SNP	a	g	0.9250	0.0057	0.9045	0.9286	0.0102	0.0163	0.5306	+-+++	14.4	4.674	4	0.3224
6 : 116061851 : SNP	a	c	0.9880	0.0000	0.9880	0.9880	0.0260	0.0586	0.6574	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 111340970 : SNP	c	g	0.1798	0.0055	0.1697	0.1876	0.0039	0.0111	0.7251	++--+	0.0	0.390	4	0.9833
2 : 29544324 : SNP	t	c	0.9861	0.0000	0.9861	0.9861	0.0980	0.0596	0.1003	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 105982384 : SNP	a	t	0.0170	0.0000	0.0170	0.0170	0.0460	0.0475	0.3329	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 16706753 : INDEL	d	r	0.0581	0.0046	0.0521	0.0620	-0.0264	0.0192	0.1688	-+??-	16.3	2.388	2	0.303
7 : 65824419 : SNP	t	c	0.8915	0.0187	0.8609	0.9053	0.0053	0.0141	0.706	--+-+	0.0	3.374	4	0.4974
11 : 57293538 : SNP	a	g	0.2336	0.0104	0.2239	0.2532	-0.0025	0.0105	0.8107	-0--+	0.0	1.499	4	0.8269
8 : 33186277 : SNP	t	c	0.7750	0.0044	0.7581	0.7816	-0.0043	0.0104	0.6783	-+-+-	25.2	5.347	4	0.2535
8 : 139574925 : INDEL	d	r	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	0.0260	0.0475	0.5842	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 129529544 : SNP	t	c	0.0917	0.0106	0.0659	0.1023	0.0009	0.0150	0.9508	--+-+	19.7	4.981	4	0.2892
8 : 27507374 : SNP	t	c	0.2535	0.0176	0.2324	0.2886	0.0055	0.0097	0.574	-+-++	0.0	1.660	4	0.7979
1 : 208105316 : SNP	t	c	0.0464	0.0116	0.0390	0.0705	-0.0330	0.0213	0.1209	--?++	7.3	3.237	3	0.3565
10 : 134740088 : SNP	a	t	0.0584	0.0085	0.0523	0.0851	0.0151	0.0188	0.4234	++?++	0.0	0.726	3	0.8671
4 : 77106137 : SNP	c	g	0.0514	0.0044	0.0446	0.0569	0.0194	0.0202	0.3371	+-??+	59.0	4.872	2	0.0875
20 : 58786242 : SNP	t	c	0.3459	0.0149	0.3015	0.3565	0.0035	0.0093	0.7036	-+++-	0.0	1.334	4	0.8555
1 : 182618260 : SNP	a	g	0.9700	0.0033	0.9663	0.9729	0.0175	0.0282	0.5346	++???	0.0	0.149	1	0.6996
5 : 84025813 : SNP	a	g	0.4136	0.0122	0.4074	0.4426	0.0005	0.0085	0.9577	+++--	2.6	4.106	4	0.3918
6 : 24884615 : SNP	t	c	0.1517	0.0060	0.1366	0.1592	-0.0027	0.0117	0.821	--+++	0.4	4.015	4	0.4039
8 : 143611456 : SNP	t	c	0.6510	0.0036	0.6405	0.6544	-0.0212	0.0096	0.02759	---+-	4.4	4.186	4	0.3814
9 : 86774888 : SNP	t	g	0.1421	0.0056	0.1277	0.1463	-0.0042	0.0123	0.7317	--+++	0.0	1.585	4	0.8114
18 : 54032363 : SNP	t	g	0.0521	0.0037	0.0435	0.0556	-0.0587	0.0204	0.004045	--??-	73.0	7.408	2	0.02462
3 : 33132144 : SNP	a	g	0.2749	0.0159	0.2380	0.2833	-0.0099	0.0093	0.2857	-++--	0.0	3.748	4	0.4412
7 : 145740195 : SNP	a	g	0.3810	0.0094	0.3694	0.3943	0.0036	0.0091	0.6922	++--+	13.5	4.624	4	0.3281
13 : 59382351 : SNP	a	t	0.6242	0.0061	0.6155	0.6290	0.0061	0.0086	0.4803	+-++-	44.8	7.243	4	0.1236
13 : 95129410 : SNP	t	c	0.2274	0.0135	0.2106	0.2401	-0.0175	0.0109	0.1082	---+-	0.0	2.149	4	0.7084
8 : 144300396 : SNP	t	c	0.9328	0.0000	0.9328	0.9328	-0.1468	0.0656	0.02523	????-	0.0	0.000	0	1
5 : 30438723 : INDEL	i	r	0.0271	0.0000	0.0271	0.0271	0.0160	0.0576	0.7813	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 1353310 : SNP	c	g	0.6770	0.0168	0.6431	0.7155	-0.0071	0.0091	0.4374	--++-	46.2	7.439	4	0.1145
4 : 140782542 : SNP	t	c	0.3250	0.0065	0.3115	0.3309	-0.0056	0.0092	0.5371	+----	13.1	4.604	4	0.3304
5 : 42517667 : SNP	t	c	0.9665	0.0031	0.9627	0.9690	-0.0152	0.0298	0.6093	+-???	0.0	0.501	1	0.4789
20 : 22380296 : SNP	c	g	0.0655	0.0062	0.0564	0.0823	0.0063	0.0175	0.7186	-++--	10.1	4.448	4	0.3488
12 : 21322972 : SNP	c	g	0.0367	0.0075	0.0258	0.0488	-0.0149	0.0244	0.5416	-+??-	0.0	0.269	2	0.8742
13 : 26760602 : SNP	t	g	0.6900	0.0071	0.6825	0.7068	-0.0132	0.0093	0.1585	-+---	9.8	4.434	4	0.3504
3 : 175670966 : SNP	a	g	0.0206	0.0000	0.0206	0.0206	0.0620	0.0505	0.2199	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 230281 : SNP	t	c	0.6031	0.0064	0.5974	0.6129	-0.0088	0.0087	0.3111	--+--	0.0	3.680	4	0.451
2 : 70717078 : SNP	t	c	0.3438	0.0070	0.3267	0.3511	0.0027	0.0091	0.7659	+-++-	0.0	3.063	4	0.5473
3 : 194395181 : SNP	a	g	0.0506	0.0081	0.0378	0.0629	0.0015	0.0215	0.9436	++?--	28.8	4.211	3	0.2396
13 : 75222447 : SNP	c	g	0.7827	0.0117	0.7601	0.8188	0.0062	0.0106	0.5607	+++-+	0.0	0.465	4	0.9768
2 : 29957242 : SNP	t	c	0.0287	0.0000	0.0287	0.0287	0.0730	0.0425	0.08554	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 104227273 : SNP	a	g	0.1545	0.0125	0.1452	0.1910	-0.0038	0.0119	0.7522	-++++	0.0	3.004	4	0.5572
2 : 60282647 : SNP	c	g	0.1289	0.0106	0.1013	0.1444	-0.0320	0.0137	0.01982	---+-	0.0	2.291	4	0.6824
2 : 116112914 : INDEL	d	r	0.0644	0.0057	0.0615	0.0869	0.0091	0.0179	0.6097	++-++	26.3	5.428	4	0.2461
10 : 74069126 : SNP	t	c	0.6353	0.0094	0.6212	0.6427	0.0157	0.0091	0.08387	++-++	0.0	3.642	4	0.4566
10 : 95018932 : SNP	a	c	0.5286	0.0136	0.5164	0.5472	-0.0069	0.0085	0.4163	+---+	52.7	8.462	4	0.07605
10 : 67720012 : SNP	t	c	0.0194	0.0000	0.0194	0.0194	0.0750	0.0556	0.1773	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 106863047 : SNP	t	c	0.4030	0.0220	0.3755	0.4649	-0.0120	0.0085	0.1591	-+++-	0.0	3.549	4	0.4705
2 : 41645711 : SNP	t	c	0.0237	0.0000	0.0237	0.0237	-0.0100	0.0455	0.826	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 62634659 : SNP	a	c	0.4450	0.0087	0.4396	0.4631	-0.0071	0.0091	0.4362	--+--	0.0	1.046	4	0.9027
6 : 84035444 : INDEL	d	r	0.0195	0.0000	0.0195	0.0195	0.0440	0.0455	0.3334	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 86676021 : SNP	a	g	0.0803	0.0095	0.0562	0.0855	0.0282	0.0166	0.08863	+-?++	0.0	2.816	3	0.4209
3 : 121870586 : SNP	a	c	0.7917	0.0094	0.7733	0.8159	-0.0134	0.0106	0.205	--++-	54.7	8.827	4	0.06557
10 : 132498184 : INDEL	i	r	0.0740	0.0051	0.0661	0.0788	-0.0186	0.0173	0.2816	--?+-	0.0	0.901	3	0.8251
5 : 104671375 : SNP	t	c	0.6408	0.0054	0.6345	0.6488	0.0032	0.0091	0.7217	-++++	0.0	1.377	4	0.8482
1 : 182007092 : SNP	c	g	0.9854	0.0000	0.9854	0.9854	0.0340	0.0485	0.4835	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 81586628 : SNP	t	c	0.5347	0.0107	0.5040	0.5465	0.0055	0.0098	0.5718	+-++-	0.0	2.076	4	0.7218
11 : 32739329 : SNP	a	t	0.9354	0.0062	0.9224	0.9422	0.0306	0.0221	0.166	+-?--	16.6	3.597	3	0.3084
10 : 88343325 : SNP	a	g	0.8763	0.0180	0.8335	0.8924	0.0033	0.0133	0.8051	-+-++	0.0	3.041	4	0.5511
1 : 69622160 : SNP	t	c	0.7061	0.0066	0.6912	0.7122	-0.0073	0.0092	0.426	--+++	45.5	7.336	4	0.1192
22 : 29429558 : SNP	t	g	0.0187	0.0000	0.0187	0.0187	0.0210	0.0445	0.6368	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 63600236 : SNP	t	c	0.4223	0.0198	0.3975	0.4824	-0.0019	0.0086	0.8277	+----	29.3	5.654	4	0.2265
8 : 22616759 : INDEL	d	r	0.1148	0.0034	0.1086	0.1189	0.0009	0.0152	0.9535	+-?+-	57.6	7.084	3	0.06928
12 : 98530899 : INDEL	d	r	0.0174	0.0000	0.0174	0.0174	0.0310	0.0475	0.5141	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 12279990 : SNP	t	g	0.2049	0.0094	0.1892	0.2186	-0.0034	0.0107	0.7476	-++-+	0.0	2.558	4	0.6344
15 : 40645893 : SNP	a	g	0.0753	0.0051	0.0721	0.0956	-0.0001	0.0173	0.9952	--+?+	0.0	0.833	3	0.8415
10 : 97225252 : SNP	a	t	0.0912	0.0080	0.0802	0.1093	0.0261	0.0152	0.08637	++?-+	0.0	1.424	3	0.7
6 : 112810922 : SNP	a	g	0.3355	0.0065	0.3131	0.3458	-0.0098	0.0094	0.3006	-+-+-	0.0	0.866	4	0.9293
3 : 185676164 : SNP	t	c	0.0186	0.0000	0.0186	0.0186	-0.0400	0.0485	0.4097	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 58317347 : SNP	a	g	0.9369	0.0041	0.9339	0.9458	0.0010	0.0179	0.9539	-+?-+	57.0	6.978	3	0.07261
14 : 55999725 : SNP	t	c	0.8312	0.0136	0.8235	0.8620	0.0071	0.0116	0.5392	-+-+-	0.0	2.636	4	0.6205
8 : 128453400 : INDEL	d	r	0.2496	0.0234	0.2373	0.2983	-0.0175	0.0111	0.1147	-+-+-	27.5	5.515	4	0.2384
2 : 162146272 : SNP	a	g	0.1273	0.0163	0.1023	0.1413	-0.0186	0.0135	0.168	--++-	0.0	0.787	4	0.9401
4 : 53132692 : SNP	t	c	0.4580	0.0167	0.4340	0.4813	0.0030	0.0085	0.7269	++++-	0.0	0.173	4	0.9965
19 : 8147709 : SNP	c	g	0.5475	0.0072	0.5414	0.5708	-0.0057	0.0086	0.5046	-+---	0.0	2.852	4	0.583
10 : 17129721 : SNP	a	g	0.9770	0.0000	0.9770	0.9770	0.0380	0.0414	0.3592	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 116097829 : SNP	a	g	0.9844	0.0000	0.9844	0.9844	-0.0230	0.0505	0.6491	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 86406671 : SNP	t	c	0.3236	0.0212	0.2762	0.3380	-0.0121	0.0093	0.1917	---+-	0.0	1.900	4	0.7542
5 : 120918731 : SNP	t	c	0.0618	0.0066	0.0532	0.0723	0.0113	0.0197	0.5667	++?-+	0.0	0.459	3	0.9278
12 : 115015868 : SNP	a	t	0.0655	0.0051	0.0579	0.0732	0.0009	0.0183	0.9628	-+?-+	0.0	0.404	3	0.9394
6 : 123414078 : SNP	t	g	0.2066	0.0101	0.1933	0.2282	-0.0056	0.0106	0.5952	---+-	0.0	2.626	4	0.6223
15 : 98899784 : SNP	a	g	0.1327	0.0102	0.0990	0.1386	-0.0096	0.0128	0.452	----+	61.4	10.362	4	0.03476
11 : 8976056 : SNP	a	g	0.0382	0.0030	0.0357	0.0419	-0.0055	0.0249	0.826	+-???	0.0	0.562	1	0.4535
13 : 20967990 : SNP	t	c	0.1341	0.0149	0.1102	0.1543	0.0165	0.0166	0.3224	++?++	0.0	0.713	3	0.8701
7 : 90448949 : SNP	a	t	0.2451	0.0119	0.2111	0.2542	-0.0247	0.0099	0.01259	----+	0.0	1.666	4	0.7968
8 : 134268158 : SNP	c	g	0.9595	0.0024	0.9541	0.9618	0.0211	0.0231	0.3607	++??+	0.0	0.263	2	0.8768
21 : 21133980 : SNP	t	c	0.2416	0.0069	0.2247	0.2619	-0.0073	0.0110	0.5076	-++++	0.0	3.024	4	0.5538
5 : 175263950 : SNP	a	t	0.3372	0.0226	0.3157	0.3832	-0.0031	0.0091	0.7292	-++--	0.0	1.297	4	0.862
7 : 3369615 : SNP	a	g	0.2898	0.0129	0.2676	0.3055	0.0064	0.0093	0.488	++---	0.0	2.388	4	0.6649
17 : 46191010 : SNP	t	c	0.2371	0.0159	0.1897	0.2486	0.0164	0.0101	0.1033	+-+++	20.3	5.018	4	0.2855
19 : 12615214 : SNP	a	g	0.4873	0.0165	0.4338	0.5038	-0.0034	0.0086	0.6966	+----	0.0	2.490	4	0.6463
10 : 100880833 : SNP	t	c	0.0295	0.0016	0.0274	0.0307	0.0498	0.0292	0.08839	++???	0.0	0.429	1	0.5124
16 : 4306917 : SNP	t	c	0.0862	0.0061	0.0815	0.0972	-0.0010	0.0169	0.9541	+-?+-	69.9	9.962	3	0.01889
2 : 228521340 : SNP	a	g	0.9138	0.0031	0.9091	0.9159	-0.0056	0.0311	0.8567	-???-	0.0	0.006	1	0.9383
5 : 22586669 : INDEL	d	r	0.0259	0.0000	0.0259	0.0259	-0.0210	0.0414	0.6124	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 36966093 : SNP	t	g	0.3805	0.0213	0.3569	0.4215	-0.0041	0.0091	0.6539	-++++	37.8	6.430	4	0.1692
15 : 88166633 : SNP	t	c	0.0148	0.0000	0.0148	0.0148	-0.0140	0.0586	0.8113	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 22067361 : SNP	a	g	0.0346	0.0008	0.0339	0.0355	0.0203	0.0294	0.489	++???	0.0	0.165	1	0.6847
10 : 58642380 : SNP	a	g	0.4998	0.0137	0.4898	0.5383	0.0106	0.0085	0.2139	++++-	17.0	4.819	4	0.3063
6 : 165609342 : SNP	a	g	0.7368	0.0122	0.7264	0.7603	-0.0017	0.0098	0.8605	-+---	0.0	3.972	4	0.4098
10 : 72538442 : SNP	t	c	0.0889	0.0033	0.0809	0.0916	0.0082	0.0154	0.5946	++?--	40.2	5.013	3	0.1709
5 : 59198596 : INDEL	d	r	0.1317	0.0051	0.1137	0.1380	-0.0081	0.0129	0.5327	----+	0.0	1.541	4	0.8193
11 : 122528870 : SNP	t	c	0.3667	0.0165	0.3301	0.3756	-0.0006	0.0090	0.9439	-+--+	20.1	5.005	4	0.2867
1 : 62598369 : SNP	a	g	0.0273	0.0007	0.0263	0.0278	-0.0142	0.0294	0.6296	--???	0.0	0.032	1	0.8589
16 : 9416637 : SNP	t	c	0.8106	0.0066	0.8016	0.8257	-0.0080	0.0111	0.4722	---++	59.7	9.935	4	0.04154
5 : 141937469 : SNP	a	t	0.0311	0.0019	0.0295	0.0334	0.0041	0.0295	0.8895	+-???	0.0	0.234	1	0.6286
13 : 23808316 : SNP	t	c	0.8514	0.0076	0.8385	0.8702	-0.0250	0.0120	0.03707	-----	0.0	3.307	4	0.5079
2 : 157507076 : SNP	t	c	0.9102	0.0087	0.8918	0.9235	0.0177	0.0152	0.2449	+++++	0.0	0.036	4	0.9998
16 : 6920457 : SNP	a	g	0.3195	0.0221	0.3027	0.3641	0.0060	0.0091	0.5077	+-+++	23.1	5.202	4	0.2672
8 : 78158533 : SNP	t	c	0.2465	0.0123	0.2216	0.2583	-0.0015	0.0099	0.8756	-++--	0.0	2.683	4	0.6122
13 : 77335958 : INDEL	d	r	0.1333	0.0057	0.1223	0.1398	0.0042	0.0135	0.7526	-++-+	0.0	2.027	4	0.7308
4 : 112861833 : INDEL	i	r	0.0464	0.0057	0.0419	0.0649	-0.0231	0.0210	0.2729	-+?--	25.7	4.040	3	0.2572
4 : 57669038 : SNP	a	g	0.0447	0.0004	0.0442	0.0450	0.0111	0.0229	0.6274	-+??+	0.0	0.896	2	0.6388
9 : 24573250 : SNP	a	t	0.7047	0.0113	0.6940	0.7286	-0.0006	0.0094	0.9522	0+++-	0.0	1.528	4	0.8216
5 : 18695431 : INDEL	i	r	0.2432	0.0064	0.2380	0.2605	-0.0123	0.0100	0.2149	----+	37.9	6.444	4	0.1683
19 : 34375631 : SNP	t	c	0.3364	0.0135	0.3239	0.3588	-0.0015	0.0090	0.8721	-++--	59.8	9.941	4	0.04143
13 : 62759261 : SNP	t	c	0.4200	0.0070	0.4153	0.4311	-0.0079	0.0085	0.3568	--+-+	0.0	3.603	4	0.4624
16 : 8455607 : SNP	c	g	0.8814	0.0116	0.8572	0.8917	-0.0046	0.0150	0.7597	--+-+	0.0	1.062	4	0.9003
17 : 45599591 : SNP	t	c	0.4828	0.0128	0.4675	0.5008	0.0077	0.0114	0.4997	+++--	0.0	3.927	4	0.416
7 : 140719702 : SNP	t	c	0.0541	0.0052	0.0486	0.0688	0.0171	0.0191	0.3704	++?-+	0.0	0.979	3	0.8063
3 : 119087843 : SNP	a	g	0.1074	0.0097	0.0995	0.1282	0.0028	0.0139	0.8431	-++-+	0.0	1.945	4	0.7458
3 : 148287904 : SNP	t	g	0.7139	0.0090	0.7039	0.7349	0.0051	0.0094	0.586	+-+-+	0.0	1.692	4	0.7923
6 : 44499162 : SNP	t	g	0.1090	0.0134	0.0949	0.1350	0.0188	0.0145	0.193	++?+-	0.0	0.691	3	0.8754
5 : 128461463 : SNP	t	c	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	0.0690	0.0465	0.1378	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 119173948 : INDEL	d	r	0.8225	0.0066	0.8164	0.8458	-0.0050	0.0112	0.6546	--+++	0.0	2.563	4	0.6333
9 : 24598447 : SNP	a	g	0.9618	0.0024	0.9566	0.9634	0.0037	0.0236	0.8741	+-??+	65.6	5.811	2	0.05473
3 : 72951892 : SNP	a	g	0.9737	0.0000	0.9737	0.9737	0.0820	0.0576	0.1547	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 121225831 : SNP	a	g	0.0342	0.0022	0.0316	0.0385	-0.0063	0.0246	0.7985	+-??-	0.0	0.226	2	0.8933
16 : 31339625 : SNP	a	g	0.3497	0.0057	0.3452	0.3717	-0.0269	0.0099	0.006317	--+-?	18.6	3.685	3	0.2975
18 : 677240 : SNP	a	g	0.3119	0.0042	0.3072	0.3213	-0.0041	0.0092	0.6503	--+--	14.7	4.690	4	0.3206
9 : 103852974 : SNP	t	c	0.9770	0.0000	0.9770	0.9770	-0.0070	0.0414	0.8659	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 25065821 : SNP	a	g	0.8540	0.0077	0.8415	0.8587	0.0014	0.0354	0.9678	???-+	33.7	1.507	1	0.2195
4 : 61139516 : SNP	a	g	0.0889	0.0031	0.0830	0.0935	-0.0317	0.0153	0.03838	--?+-	0.0	1.100	3	0.777
16 : 54022310 : SNP	a	c	0.9532	0.0045	0.9439	0.9561	0.0239	0.0219	0.2736	++??+	0.0	0.411	2	0.8142
8 : 27338359 : SNP	a	g	0.0570	0.0125	0.0484	0.0895	0.0235	0.0190	0.216	++?++	0.0	0.125	3	0.9886
6 : 56103747 : SNP	t	g	0.9238	0.0076	0.9069	0.9311	-0.0250	0.0169	0.1385	---+-	0.0	0.499	4	0.9736
5 : 178341880 : SNP	t	c	0.2399	0.0089	0.2050	0.2468	-0.0011	0.0101	0.9142	-++-+	0.0	0.585	4	0.9647
2 : 38806857 : SNP	a	g	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	0.0170	0.0445	0.7023	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 140757385 : SNP	c	g	0.5656	0.0206	0.5316	0.5934	0.0117	0.0132	0.3758	-+-?+	32.3	4.433	3	0.2184
6 : 68702904 : SNP	t	c	0.7994	0.0066	0.7881	0.8055	-0.0052	0.0106	0.6262	--+-+	9.6	4.424	4	0.3517
2 : 140041250 : SNP	a	g	0.4203	0.0141	0.3768	0.4383	-0.0059	0.0085	0.4865	-++--	46.5	7.471	4	0.113
3 : 195731297 : SNP	a	g	0.1753	0.0247	0.1470	0.2065	0.0169	0.0157	0.2797	+++++	0.0	2.604	4	0.626
8 : 125560080 : SNP	t	c	0.5276	0.0157	0.4943	0.5373	-0.0094	0.0087	0.2792	---+-	0.0	0.362	4	0.9855
22 : 42095573 : SNP	a	g	0.9700	0.0000	0.9700	0.9700	-0.0260	0.0607	0.6682	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 46368541 : SNP	t	c	0.4228	0.0381	0.3915	0.5181	0.0114	0.0086	0.1848	+++-+	0.0	0.477	4	0.9757
6 : 3829444 : INDEL	d	r	0.0404	0.0000	0.0404	0.0404	0.0190	0.0394	0.6298	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 1903418 : SNP	a	g	0.1566	0.0097	0.1422	0.1685	-0.0053	0.0124	0.6686	+---+	45.6	7.348	4	0.1186
17 : 78254067 : SNP	t	c	0.4522	0.0107	0.4391	0.4686	0.0178	0.0090	0.04752	+++--	0.0	2.132	4	0.7114
2 : 107078616 : SNP	t	c	0.1488	0.0103	0.1328	0.1645	0.0001	0.0301	0.9986	??+--	0.0	1.416	2	0.4925
11 : 85942305 : SNP	a	g	0.9889	0.0000	0.9889	0.9889	0.0170	0.0596	0.7756	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 105558335 : SNP	c	g	0.3490	0.0184	0.2913	0.3584	0.0037	0.0092	0.6904	+-+++	0.0	1.756	4	0.7804
13 : 111826124 : SNP	a	t	0.7995	0.0034	0.7976	0.8113	-0.0029	0.0111	0.7962	-++-+	0.0	1.385	4	0.8468
4 : 86326527 : SNP	a	t	0.8024	0.0067	0.7772	0.8176	-0.0064	0.0112	0.5668	---++	0.0	2.228	4	0.6939
16 : 12675019 : SNP	a	t	0.8380	0.0022	0.8342	0.8460	-0.0003	0.0115	0.9812	----+	44.5	7.204	4	0.1255
8 : 41390952 : SNP	t	g	0.9664	0.0000	0.9664	0.9664	0.0260	0.0566	0.646	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 730289 : SNP	t	c	0.9165	0.0016	0.9145	0.9185	-0.0178	0.0194	0.3574	--?+-	0.0	0.594	3	0.8979
18 : 26127280 : SNP	t	c	0.7181	0.0095	0.6955	0.7264	0.0038	0.0097	0.698	-++--	0.0	1.413	4	0.842
5 : 14974983 : SNP	a	c	0.1394	0.0088	0.1182	0.1537	0.0125	0.0126	0.3212	+++--	41.0	6.779	4	0.148
22 : 18919899 : SNP	a	t	0.4244	0.0183	0.4014	0.4810	-0.0035	0.0091	0.7019	-++--	69.1	12.960	4	0.01147
14 : 42062198 : SNP	t	c	0.9447	0.0014	0.9424	0.9455	-0.0534	0.0346	0.1227	-???-	0.0	0.005	1	0.945
8 : 2356752 : INDEL	i	r	0.6025	0.0145	0.5724	0.6219	-0.0087	0.0096	0.3667	-+-+-	20.5	5.029	4	0.2843
12 : 63609471 : SNP	c	g	0.5564	0.0292	0.4929	0.5748	0.0033	0.0085	0.6942	-+++-	35.0	6.154	4	0.188
21 : 16241868 : SNP	t	c	0.5011	0.0084	0.4941	0.5293	0.0048	0.0105	0.6434	+0++-	0.0	1.150	4	0.8862
13 : 51855539 : INDEL	i	r	0.0936	0.0047	0.0867	0.1016	0.0349	0.0160	0.02895	++?++	0.0	0.825	3	0.8435
3 : 165286724 : SNP	a	c	0.9315	0.0078	0.9185	0.9413	0.0112	0.0178	0.5289	+-?--	0.0	0.847	3	0.8382
6 : 93976849 : SNP	a	t	0.0173	0.0000	0.0173	0.0173	-0.0430	0.0485	0.3755	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 107046027 : SNP	c	g	0.9534	0.0038	0.9402	0.9562	0.0278	0.0228	0.2233	++?+?	0.0	0.067	2	0.9668
7 : 10634473 : SNP	a	c	0.6871	0.0086	0.6747	0.7040	0.0149	0.0092	0.1053	++-++	0.0	1.434	4	0.8383
1 : 95111598 : SNP	t	c	0.2928	0.0229	0.2384	0.3172	0.0146	0.0093	0.1186	+--++	0.0	2.258	4	0.6884
2 : 68916387 : SNP	a	t	0.0584	0.0005	0.0578	0.0588	0.0100	0.0247	0.6859	-+???	48.7	1.951	1	0.1625
8 : 19511051 : SNP	a	t	0.0613	0.0062	0.0532	0.0710	0.0051	0.0187	0.7855	+-?++	16.0	3.571	3	0.3117
3 : 171063189 : SNP	a	c	0.7631	0.0134	0.7368	0.7830	0.0132	0.0101	0.1919	++---	0.0	3.917	4	0.4174
7 : 122231428 : SNP	t	g	0.7408	0.0136	0.7239	0.7543	0.0250	0.0102	0.01431	+++++	0.0	0.661	4	0.9561
8 : 119375605 : SNP	a	g	0.3001	0.0083	0.2755	0.3113	-0.0073	0.0094	0.4356	+---+	0.0	2.606	4	0.6257
5 : 143134247 : SNP	t	c	0.4324	0.0170	0.4150	0.4660	-0.0214	0.0089	0.01613	---+-	42.7	6.980	4	0.137
11 : 75202063 : SNP	a	g	0.6699	0.0190	0.6431	0.7098	-0.0022	0.0092	0.8102	--+-+	0.0	2.645	4	0.6188
10 : 90215629 : SNP	t	c	0.3741	0.0207	0.3384	0.4019	-0.0008	0.0086	0.9288	--+-+	2.6	4.105	4	0.392
2 : 83221199 : INDEL	i	r	0.0868	0.0022	0.0811	0.0900	-0.0259	0.0155	0.09518	---+-	0.0	3.567	4	0.4677
1 : 55723756 : SNP	a	c	0.1706	0.0118	0.1417	0.1807	0.0111	0.0116	0.337	++-+-	0.0	0.917	4	0.9221
2 : 10173612 : SNP	a	g	0.1132	0.0029	0.1107	0.1205	-0.0213	0.0141	0.1314	----+	0.0	0.754	4	0.9445
17 : 26574820 : SNP	a	g	0.0995	0.0037	0.0958	0.1106	-0.0019	0.0149	0.8997	+-++-	0.0	2.194	4	0.7
6 : 35124480 : SNP	t	c	0.7256	0.0188	0.6890	0.7426	0.0125	0.0097	0.1953	+-+++	0.7	4.029	4	0.4021
10 : 125138297 : SNP	t	c	0.0261	0.0000	0.0261	0.0261	-0.0380	0.0404	0.3473	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 80834447 : SNP	t	c	0.9479	0.0024	0.9398	0.9518	-0.0021	0.0201	0.9174	-+?+-	0.0	0.940	3	0.8158
9 : 37490578 : SNP	t	c	0.0429	0.0109	0.0358	0.0596	0.0128	0.0271	0.6367	+???-	76.1	4.187	1	0.04073
2 : 202114026 : SNP	a	g	0.1445	0.0064	0.1276	0.1516	0.0043	0.0120	0.72	--++-	77.6	17.883	4	0.001301
1 : 88401736 : SNP	a	g	0.9193	0.0035	0.9175	0.9326	0.0114	0.0200	0.5671	++?-?	0.0	0.126	2	0.939
20 : 12793247 : SNP	t	g	0.1079	0.0053	0.1042	0.1198	-0.0213	0.0139	0.1252	--+--	39.8	6.645	4	0.1559
4 : 185350577 : SNP	t	c	0.3205	0.0118	0.2729	0.3416	-0.0018	0.0100	0.8572	-++-+	0.0	1.314	4	0.859
4 : 107473017 : SNP	c	g	0.9119	0.0107	0.8845	0.9260	0.0146	0.0156	0.3491	-+?++	19.1	3.706	3	0.295
8 : 68557925 : SNP	a	g	0.3379	0.0052	0.3239	0.3466	-0.0011	0.0091	0.9031	----+	9.7	4.428	4	0.3511
3 : 171168582 : SNP	t	c	0.9686	0.0000	0.9686	0.9686	-0.0110	0.0465	0.813	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 13129670 : SNP	a	t	0.1989	0.0130	0.1818	0.2214	0.0118	0.0108	0.2753	++++-	0.0	2.738	4	0.6025
13 : 105396821 : SNP	t	c	0.4540	0.0120	0.4339	0.4653	-0.0020	0.0085	0.8188	-+-+-	0.0	1.670	4	0.7961
5 : 5859558 : SNP	t	c	0.0463	0.0051	0.0336	0.0511	-0.0115	0.0214	0.5923	--??-	0.0	0.082	2	0.9599
5 : 39395397 : SNP	a	g	0.2412	0.0114	0.2144	0.2507	-0.0188	0.0099	0.05786	--+--	0.0	0.502	4	0.9733
5 : 162890517 : SNP	c	g	0.7887	0.0164	0.7582	0.8090	0.0006	0.0105	0.9564	+++--	47.6	7.628	4	0.1062
2 : 145882987 : SNP	a	g	0.9881	0.0000	0.9881	0.9881	0.0280	0.0617	0.6498	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 88909208 : SNP	a	g	0.1194	0.0142	0.0902	0.1316	0.0228	0.0149	0.1262	+++-+	2.9	4.120	4	0.39
19 : 48544256 : SNP	a	g	0.0952	0.0053	0.0841	0.0995	-0.0099	0.0153	0.5152	--++-	0.0	1.494	4	0.8277
3 : 135983497 : SNP	t	c	0.2032	0.0140	0.1814	0.2281	-0.0009	0.0106	0.9323	-+--+	0.0	1.321	4	0.8578
11 : 8899999 : SNP	t	c	0.3888	0.0203	0.3748	0.4382	-0.0136	0.0091	0.1342	-+--+	35.7	6.220	4	0.1833
2 : 124655623 : SNP	t	c	0.3940	0.0071	0.3907	0.4170	-0.0005	0.0086	0.9565	++---	11.1	4.501	4	0.3425
5 : 12183983 : SNP	a	g	0.8551	0.0081	0.8377	0.8596	0.0129	0.0119	0.2773	+++++	0.0	1.328	4	0.8566
12 : 76332628 : SNP	c	g	0.9400	0.0038	0.9277	0.9426	0.0191	0.0187	0.3088	+-?++	0.0	2.182	3	0.5355
1 : 77136957 : SNP	t	c	0.0131	0.0000	0.0131	0.0131	0.0480	0.0556	0.3879	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 179922388 : SNP	a	g	0.1107	0.0085	0.1025	0.1276	0.0004	0.0137	0.9744	+--++	0.0	3.406	4	0.4923
2 : 212031914 : SNP	c	g	0.5734	0.0119	0.5648	0.6144	-0.0023	0.0085	0.7883	---++	0.0	3.840	4	0.4281
7 : 116789943 : SNP	a	g	0.0325	0.0015	0.0306	0.0350	-0.0005	0.0244	0.9831	-+??+	0.0	0.703	2	0.7037
9 : 114033504 : SNP	a	g	0.8460	0.0036	0.8419	0.8625	0.0126	0.0120	0.2938	+-+--	45.4	7.328	4	0.1195
5 : 113604682 : SNP	a	g	0.1241	0.0124	0.1080	0.1447	-0.0281	0.0154	0.06728	--+--	0.0	2.545	4	0.6366
20 : 30678552 : SNP	t	c	0.2696	0.0124	0.2601	0.2975	0.0043	0.0097	0.6576	++---	34.9	6.146	4	0.1885
2 : 78316178 : SNP	a	c	0.1088	0.0098	0.0863	0.1157	-0.0079	0.0139	0.5689	-+-+-	0.0	1.882	4	0.7574
8 : 144130250 : SNP	c	g	0.9534	0.0000	0.9534	0.9534	0.0507	0.0674	0.4519	????+	0.0	0.000	0	1
20 : 60873677 : INDEL	d	r	0.0507	0.0027	0.0442	0.0558	0.0015	0.0203	0.94	+-?++	9.7	3.322	3	0.3447
11 : 103424788 : SNP	a	g	0.2291	0.0035	0.2252	0.2385	0.0018	0.0099	0.8548	+++--	0.0	0.402	4	0.9823
9 : 135500944 : SNP	a	g	0.8989	0.0087	0.8805	0.9282	-0.0053	0.0143	0.7106	+-++-	7.3	4.317	4	0.3648
11 : 131675746 : SNP	a	c	0.2254	0.0162	0.1964	0.2456	-0.0007	0.0105	0.9496	-+--+	0.0	2.354	4	0.671
2 : 224590432 : SNP	t	c	0.0335	0.0125	0.0237	0.0495	-0.0483	0.0319	0.1298	-???-	0.0	0.003	1	0.9587
15 : 58334587 : SNP	t	c	0.4479	0.0128	0.4234	0.4655	-0.0102	0.0085	0.2295	---+-	0.0	1.126	4	0.8901
4 : 42210739 : INDEL	i	r	0.3398	0.0045	0.3325	0.3471	-0.0015	0.0207	0.9428	??-+-	0.0	1.874	2	0.3917
10 : 52223148 : SNP	t	c	0.8630	0.0188	0.8278	0.8769	-0.0013	0.0124	0.9136	-+--+	0.0	0.957	4	0.9162
10 : 12835045 : SNP	a	g	0.5845	0.0290	0.5594	0.6503	-0.0093	0.0087	0.2834	-----	0.0	2.235	4	0.6927
4 : 8264582 : SNP	t	c	0.4476	0.0123	0.4207	0.4614	0.0119	0.0092	0.1961	+++-+	0.0	1.386	4	0.8467
10 : 109934488 : SNP	t	c	0.9592	0.0000	0.9592	0.9592	-0.0480	0.0384	0.2115	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 131804631 : SNP	c	g	0.5215	0.0026	0.5183	0.5249	-0.0003	0.0085	0.9683	++++-	24.0	5.263	4	0.2613
4 : 67580322 : SNP	a	t	0.1260	0.0014	0.1235	0.1299	-0.0073	0.0128	0.5691	+---+	40.0	6.667	4	0.1546
3 : 158549674 : SNP	t	c	0.1849	0.0130	0.1737	0.2082	-0.0183	0.0110	0.09507	---+-	0.0	3.708	4	0.4469
16 : 75893084 : SNP	a	g	0.9567	0.0070	0.9491	0.9632	0.0173	0.0259	0.5049	-+???	0.0	0.854	1	0.3554
16 : 87232383 : SNP	t	c	0.6275	0.0134	0.6138	0.6533	0.0080	0.0091	0.3809	+-+++	0.0	2.266	4	0.687
6 : 36125978 : SNP	c	g	0.2179	0.0160	0.1875	0.2375	-0.0016	0.0105	0.8813	---+-	0.0	2.633	4	0.6209
9 : 27703432 : SNP	t	c	0.2250	0.0088	0.2082	0.2576	0.0047	0.0101	0.6391	-++-+	64.1	11.154	4	0.02488
10 : 2266729 : SNP	c	g	0.0328	0.0011	0.0318	0.0341	0.0045	0.0285	0.8737	+-???	0.0	0.940	1	0.3324
6 : 91931446 : SNP	t	c	0.9224	0.0143	0.8973	0.9330	0.0325	0.0197	0.09828	++?++	0.0	0.765	3	0.8579
16 : 66181703 : SNP	t	c	0.0682	0.0041	0.0576	0.0705	0.0280	0.0176	0.1124	++??-	25.4	2.682	2	0.2616
4 : 188353750 : SNP	a	g	0.5987	0.0065	0.5897	0.6076	0.0005	0.0086	0.9495	+--+-	0.0	2.097	4	0.7179
11 : 437050 : SNP	a	g	0.3913	0.0088	0.3818	0.4149	-0.0067	0.0112	0.548	+---+	32.7	5.944	4	0.2033
6 : 67657381 : SNP	a	g	0.2828	0.0200	0.2695	0.3292	0.0158	0.0097	0.1028	-++-+	30.0	5.717	4	0.2213
6 : 148953132 : SNP	a	t	0.0353	0.0026	0.0337	0.0396	-0.0125	0.0320	0.6968	-???+	54.1	2.180	1	0.1398
22 : 26856517 : SNP	a	g	0.9864	0.0000	0.9864	0.9864	0.0880	0.0586	0.1334	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 36038192 : INDEL	d	r	0.2863	0.0029	0.2795	0.2896	-0.0059	0.0092	0.5246	-++++	0.0	2.351	4	0.6714
1 : 179724091 : SNP	t	g	0.2829	0.0074	0.2570	0.2986	-0.0071	0.0093	0.4462	-0++-	0.0	1.968	4	0.7416
14 : 96829302 : SNP	t	c	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	-0.0480	0.0546	0.3792	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 14508888 : INDEL	i	r	0.7056	0.0165	0.6928	0.7472	0.0073	0.0093	0.4319	++--+	0.0	3.698	4	0.4485
10 : 24029375 : SNP	c	g	0.1992	0.0263	0.1811	0.2531	0.0112	0.0108	0.3019	+++++	0.0	1.496	4	0.8273
2 : 142388464 : SNP	t	c	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	0.0610	0.0435	0.1605	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 169487682 : SNP	a	c	0.0101	0.0000	0.0101	0.0101	0.0060	0.0627	0.9237	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 36510996 : SNP	t	c	0.7267	0.0054	0.7134	0.7329	0.0051	0.0094	0.5892	+--+-	53.5	8.605	4	0.07176
4 : 124929520 : INDEL	d	r	0.0749	0.0174	0.0550	0.1050	0.0271	0.0173	0.1166	++?-+	0.0	2.891	3	0.4088
3 : 22607618 : SNP	a	t	0.5204	0.0127	0.5081	0.5373	0.0098	0.0087	0.2591	++-+-	0.0	2.662	4	0.6159
11 : 134356443 : SNP	t	g	0.0833	0.0039	0.0792	0.0960	-0.0398	0.0175	0.02337	--++-	7.8	4.341	4	0.3619
15 : 98777987 : SNP	a	g	0.3044	0.0239	0.2903	0.3536	-0.0052	0.0093	0.575	--+++	0.0	3.100	4	0.5413
14 : 44091351 : SNP	a	c	0.1690	0.0123	0.1495	0.1831	0.0144	0.0114	0.206	++--+	50.8	8.122	4	0.08721
15 : 100726470 : SNP	a	g	0.0741	0.0086	0.0614	0.0818	0.0044	0.0172	0.7964	+-?+-	0.0	1.418	3	0.7014
9 : 97402623 : SNP	a	c	0.0816	0.0090	0.0700	0.1059	0.0196	0.0156	0.2089	+-+-+	34.0	6.056	4	0.195
14 : 73709248 : INDEL	i	r	0.0555	0.0028	0.0532	0.0590	0.0051	0.0220	0.8168	+-???	0.0	0.197	1	0.657
9 : 76050242 : SNP	a	c	0.9378	0.0052	0.9357	0.9527	-0.0175	0.0184	0.3439	+-??-	59.7	4.968	2	0.08339
2 : 113948858 : INDEL	i	r	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	-0.1430	0.0495	0.003889	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 9512265 : SNP	t	c	0.0465	0.0015	0.0453	0.0484	-0.0383	0.0261	0.1428	--???	0.0	0.017	1	0.8962
11 : 117929672 : SNP	t	c	0.3212	0.0177	0.2835	0.3583	0.0097	0.0092	0.2945	+--++	0.0	2.401	4	0.6625
5 : 33546432 : SNP	a	g	0.6542	0.0092	0.6435	0.6717	-0.0100	0.0091	0.2736	--++-	0.0	1.628	4	0.8037
1 : 105868011 : SNP	c	g	0.1366	0.0221	0.1131	0.1784	-0.0218	0.0130	0.09419	-----	0.0	2.270	4	0.6862
10 : 123911345 : SNP	t	c	0.8150	0.0117	0.7723	0.8226	0.0180	0.0112	0.1099	+0-++	0.0	2.418	4	0.6593
11 : 24895212 : SNP	a	g	0.5037	0.0067	0.4876	0.5119	-0.0081	0.0088	0.3606	-----	0.0	3.685	4	0.4502
8 : 20322758 : SNP	a	g	0.9390	0.0030	0.9342	0.9447	0.0056	0.0181	0.7552	-+?+-	0.0	2.295	3	0.5134
1 : 248110057 : SNP	t	c	0.0332	0.0011	0.0325	0.0349	0.0563	0.0327	0.08488	+???+	0.0	0.210	1	0.647
11 : 122521031 : SNP	c	g	0.7431	0.0110	0.7339	0.7640	0.0014	0.0100	0.891	+-++-	11.4	4.516	4	0.3406
21 : 36919218 : SNP	t	c	0.9545	0.0050	0.9510	0.9661	-0.0103	0.0211	0.6269	--??+	0.0	0.268	2	0.8747
18 : 72713091 : SNP	a	g	0.1620	0.0133	0.1537	0.1961	-0.0194	0.0118	0.09941	---+-	0.0	1.837	4	0.7657
3 : 65682352 : SNP	a	c	0.0717	0.0019	0.0659	0.0726	0.0095	0.0178	0.5949	-+?++	23.0	3.897	3	0.2728
2 : 26962280 : SNP	a	g	0.5748	0.0137	0.5301	0.5862	-0.0069	0.0085	0.4202	--+++	0.0	2.495	4	0.6455
15 : 67233647 : SNP	a	g	0.4219	0.0162	0.4054	0.4500	0.0089	0.0094	0.3446	+++-+	0.0	0.430	4	0.98
5 : 163086731 : SNP	t	c	0.0771	0.0072	0.0595	0.0836	-0.0101	0.0168	0.5492	+-??-	0.0	0.568	2	0.7528
6 : 94638942 : SNP	t	g	0.4031	0.0253	0.3847	0.4548	0.0097	0.0085	0.2543	++-++	15.4	4.729	4	0.3163
10 : 115355171 : INDEL	i	r	0.5827	0.0155	0.5708	0.6192	-0.0183	0.0089	0.04065	--++-	0.0	3.080	4	0.5446
8 : 71922139 : SNP	a	t	0.4796	0.0097	0.4559	0.4852	-0.0046	0.0085	0.5882	---+-	0.0	0.308	4	0.9893
5 : 53735375 : SNP	t	c	0.8613	0.0081	0.8475	0.8751	0.0021	0.0126	0.866	+---+	0.0	2.315	4	0.678
10 : 126808467 : SNP	t	c	0.9393	0.0039	0.9341	0.9452	-0.0033	0.0190	0.8644	-+?+-	0.0	0.513	3	0.9161
13 : 99986028 : SNP	a	g	0.7186	0.0078	0.7019	0.7288	-0.0065	0.0092	0.4801	+---+	0.0	3.463	4	0.4835
10 : 26565822 : SNP	a	g	0.8126	0.0044	0.8069	0.8169	0.0025	0.0110	0.8185	+---+	0.0	1.935	4	0.7478
2 : 187861492 : SNP	t	c	0.1087	0.0067	0.0836	0.1124	0.0040	0.0134	0.7656	+++--	6.7	4.285	4	0.3688
20 : 59136449 : SNP	t	c	0.0679	0.0029	0.0654	0.0767	0.0296	0.0172	0.08474	++?++	0.0	1.249	3	0.7413
6 : 46910210 : SNP	t	c	0.0476	0.0044	0.0406	0.0508	0.0323	0.0218	0.1393	-+??+	68.8	6.417	2	0.04042
20 : 55392174 : SNP	a	c	0.8821	0.0061	0.8750	0.8873	0.0083	0.0389	0.8318	???++	0.0	0.036	1	0.8496
5 : 13821965 : SNP	a	g	0.0285	0.0000	0.0285	0.0285	-0.0300	0.0384	0.4348	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 21704905 : SNP	a	g	0.9688	0.0031	0.9639	0.9708	0.0039	0.0333	0.9065	-???+	67.5	3.081	1	0.07923
2 : 105629395 : SNP	c	g	0.5517	0.0138	0.5403	0.5936	0.0015	0.0086	0.8639	--+-+	0.0	1.017	4	0.9072
22 : 21022819 : INDEL	d	r	0.0207	0.0000	0.0207	0.0207	0.0420	0.0505	0.406	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 40114575 : SNP	t	c	0.0828	0.0093	0.0592	0.0926	-0.0122	0.0164	0.4593	--+?-	0.0	0.317	3	0.9568
7 : 158717184 : SNP	a	g	0.8309	0.0051	0.8258	0.8414	-0.0008	0.0114	0.9455	--+-+	0.0	0.746	4	0.9455
7 : 26608665 : SNP	a	t	0.0823	0.0085	0.0628	0.0928	0.0051	0.0160	0.7492	-+?++	0.0	0.207	3	0.9764
3 : 159316458 : SNP	a	g	0.9784	0.0000	0.9784	0.9784	-0.0410	0.0435	0.3456	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 27716737 : SNP	t	c	0.9754	0.0000	0.9754	0.9754	-0.0240	0.0394	0.5427	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 4411829 : SNP	a	g	0.4143	0.0057	0.3884	0.4186	0.0005	0.0086	0.9573	+---+	0.0	3.838	4	0.4284
2 : 63926197 : SNP	t	c	0.5422	0.0042	0.5380	0.5592	-0.0114	0.0085	0.1804	--+-+	0.0	3.889	4	0.4212
5 : 180340689 : SNP	a	g	0.2690	0.0111	0.2424	0.2814	0.0047	0.0150	0.7528	?-++-	0.0	1.203	3	0.7523
3 : 13106302 : SNP	t	c	0.5391	0.0162	0.5295	0.5867	-0.0015	0.0085	0.861	+---+	0.0	1.253	4	0.8692
9 : 132033760 : SNP	a	g	0.2425	0.0148	0.2089	0.2538	-0.0011	0.0101	0.9153	-++-+	0.0	0.422	4	0.9806
12 : 96684370 : SNP	t	c	0.6581	0.0058	0.6389	0.6670	-0.0014	0.0091	0.8808	--+-+	0.0	2.684	4	0.612
4 : 9081111 : SNP	t	g	0.1433	0.0078	0.1387	0.1592	0.0210	0.0341	0.5369	??+-+	18.1	2.442	2	0.2949
10 : 20355167 : SNP	a	t	0.7554	0.0079	0.7400	0.7763	0.0087	0.0100	0.3851	0+--+	0.0	3.837	4	0.4285
3 : 4772145 : SNP	a	g	0.1735	0.0107	0.1573	0.2040	-0.0136	0.0113	0.2272	----+	57.3	9.369	4	0.05251
4 : 11491589 : SNP	a	t	0.0426	0.0014	0.0416	0.0455	-0.0145	0.0223	0.5162	+-??+	48.8	3.907	2	0.1418
10 : 107455046 : SNP	a	g	0.8361	0.0063	0.8161	0.8422	0.0097	0.0113	0.3904	+---+	0.0	1.000	4	0.9098
6 : 83908738 : SNP	a	g	0.7564	0.0067	0.7500	0.7722	0.0198	0.0106	0.06331	++++-	6.8	4.294	4	0.3677
19 : 11048908 : SNP	t	g	0.0404	0.0031	0.0377	0.0461	0.0347	0.0244	0.1561	++??+	16.1	2.384	2	0.3036
6 : 20816537 : SNP	a	g	0.9081	0.0037	0.9002	0.9113	0.0158	0.0148	0.2862	+++++	0.0	3.007	4	0.5567
7 : 125778073 : SNP	t	c	0.1236	0.0030	0.1188	0.1335	-0.0248	0.0128	0.0529	-++++	65.0	11.429	4	0.02214
21 : 18265042 : SNP	t	c	0.2524	0.0074	0.2425	0.2631	-0.0091	0.0101	0.3658	+----	59.5	9.865	4	0.04276
13 : 33553649 : SNP	a	g	0.5075	0.0054	0.5057	0.5319	-0.0138	0.0088	0.115	-+---	0.0	2.227	4	0.6942
9 : 103809117 : SNP	t	c	0.3848	0.0103	0.3665	0.4100	0.0104	0.0087	0.2336	++-++	38.9	6.551	4	0.1616
9 : 137822602 : INDEL	d	r	0.1597	0.0039	0.1557	0.1660	-0.0207	0.0151	0.1709	-----	0.0	2.520	4	0.641
14 : 65118877 : INDEL	d	r	0.0373	0.0049	0.0331	0.0431	0.0018	0.0261	0.9435	++???	0.0	0.001	1	0.9698
15 : 30372571 : SNP	t	g	0.1233	0.0085	0.1075	0.1339	0.0139	0.0196	0.48	++?--	0.0	2.132	3	0.5454
21 : 44541216 : SNP	a	g	0.0984	0.0087	0.0862	0.1125	-0.0089	0.0154	0.5643	++?+-	48.0	5.770	3	0.1234
4 : 140435317 : SNP	t	c	0.8481	0.0055	0.8321	0.8514	-0.0109	0.0122	0.374	-++--	0.0	1.825	4	0.7678
15 : 71077543 : INDEL	i	r	0.1135	0.0121	0.0970	0.1361	0.0065	0.0139	0.6403	++-++	0.0	0.879	4	0.9275
18 : 36105830 : SNP	a	g	0.9850	0.0000	0.9850	0.9850	0.0010	0.0516	0.9845	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 29106013 : INDEL	d	r	0.0113	0.0000	0.0113	0.0113	0.0790	0.0627	0.2075	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 32580241 : SNP	a	c	0.7557	0.0236	0.7110	0.7722	0.0035	0.0211	0.869	??--+	0.0	0.852	2	0.6533
5 : 168305191 : SNP	t	c	0.3731	0.0076	0.3652	0.3978	-0.0155	0.0096	0.1054	-----	0.0	2.287	4	0.6831
10 : 55032722 : SNP	t	c	0.9689	0.0056	0.9581	0.9722	0.0168	0.0260	0.5194	+-??+	28.8	2.807	2	0.2457
4 : 15460758 : SNP	a	c	0.2869	0.0120	0.2527	0.2928	0.0076	0.0098	0.4377	++--+	0.2	4.006	4	0.4052
10 : 116071480 : SNP	t	c	0.8397	0.0172	0.8256	0.8671	-0.0046	0.0150	0.7597	-+--+	0.0	2.014	4	0.7332
12 : 90213070 : SNP	t	c	0.2333	0.0153	0.1962	0.2424	-0.0073	0.0099	0.4612	-+-+-	51.4	8.227	4	0.08362
9 : 103372446 : INDEL	d	r	0.0729	0.0092	0.0554	0.0834	-0.0017	0.0169	0.9196	0-?+-	0.0	0.550	3	0.9077
4 : 19911255 : INDEL	d	r	0.0534	0.0095	0.0465	0.0725	0.0156	0.0196	0.4258	-+?++	0.0	2.495	3	0.4762
4 : 174748680 : SNP	a	g	0.2647	0.0246	0.2454	0.3142	-0.0037	0.0102	0.7141	----+	0.0	2.780	4	0.5953
10 : 27787221 : SNP	t	g	0.8450	0.0041	0.8375	0.8577	0.0046	0.0119	0.6993	--+++	34.3	6.092	4	0.1924
14 : 53860917 : SNP	t	g	0.6343	0.0041	0.6194	0.6378	-0.0216	0.0091	0.01789	----+	0.0	2.259	4	0.6882
8 : 69600649 : SNP	a	g	0.9477	0.0024	0.9436	0.9499	0.0159	0.0202	0.4311	++??-	62.0	5.264	2	0.07192
6 : 167823742 : SNP	t	c	0.7293	0.0205	0.6858	0.7441	0.0034	0.0097	0.7249	-++-+	3.8	4.160	4	0.3848
1 : 60971078 : SNP	a	c	0.9747	0.0000	0.9747	0.9747	0.0110	0.0414	0.7907	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 36714005 : SNP	a	g	0.4048	0.0126	0.3920	0.4391	-0.0007	0.0085	0.9388	+----	0.0	3.825	4	0.4302
8 : 116588549 : SNP	t	g	0.4644	0.0187	0.4334	0.4930	0.0059	0.0098	0.55	++--+	0.0	1.380	4	0.8476
2 : 226213478 : SNP	t	g	0.0199	0.0000	0.0199	0.0199	-0.0170	0.0485	0.7261	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 57987876 : SNP	t	c	0.4970	0.0071	0.4917	0.5122	-0.0087	0.0088	0.3248	-----	10.7	4.480	4	0.3449
21 : 42221247 : SNP	a	g	0.2330	0.0094	0.2213	0.2659	-0.0214	0.0109	0.05021	-----	0.0	0.279	4	0.9911
4 : 76372702 : SNP	a	g	0.2441	0.0134	0.2235	0.2633	-0.0079	0.0118	0.5018	0-++-	0.0	2.863	4	0.581
8 : 92663415 : INDEL	i	r	0.0427	0.0090	0.0330	0.0575	-0.0005	0.0218	0.982	--?-+	18.4	3.678	3	0.2984
3 : 137352129 : SNP	c	g	0.7383	0.0096	0.7289	0.7498	-0.0051	0.0100	0.6091	+-++-	5.3	4.226	4	0.3763
7 : 124002977 : SNP	a	t	0.2054	0.0069	0.1735	0.2111	0.0227	0.0106	0.03265	++-++	36.5	6.298	4	0.178
5 : 272906 : SNP	a	c	0.9315	0.0016	0.9293	0.9328	-0.0133	0.0291	0.6489	-??--	0.0	0.063	2	0.9691
5 : 163347548 : SNP	t	c	0.1814	0.0109	0.1695	0.2096	0.0139	0.0110	0.2052	++-+-	50.8	8.132	4	0.08685
10 : 59909337 : SNP	a	c	0.9777	0.0000	0.9777	0.9777	0.0460	0.0425	0.2786	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 117107873 : SNP	t	c	0.3623	0.0129	0.3524	0.3802	-0.0037	0.0089	0.6817	--++-	0.0	1.451	4	0.8354
14 : 53000646 : SNP	a	g	0.9173	0.0177	0.8836	0.9337	0.0244	0.0159	0.1238	++?+-	13.0	3.449	3	0.3275
14 : 105423476 : SNP	t	c	0.0315	0.0036	0.0280	0.0353	-0.0290	0.0258	0.2611	--??+	0.0	1.906	2	0.3856
6 : 91855901 : SNP	a	g	0.1533	0.0142	0.1234	0.1734	0.0178	0.0135	0.1884	-++++	0.0	3.800	4	0.4338
4 : 165225302 : SNP	t	c	0.3995	0.0137	0.3882	0.4433	0.0199	0.0091	0.02944	+++-+	0.0	2.255	4	0.689
12 : 43137088 : SNP	t	c	0.0867	0.0014	0.0840	0.0894	0.0174	0.0151	0.2494	++?--	19.4	3.721	3	0.2932
1 : 165072120 : SNP	t	c	0.8940	0.0106	0.8723	0.9092	0.0137	0.0140	0.3286	++--+	0.0	0.977	4	0.9132
2 : 169331148 : INDEL	d	r	0.1860	0.0141	0.1553	0.2082	-0.0128	0.0108	0.2365	-+-+-	11.6	4.525	4	0.3396
1 : 61009286 : SNP	t	c	0.4876	0.0077	0.4824	0.5050	0.0045	0.0085	0.5984	+-+-+	32.6	5.936	4	0.204
19 : 28499385 : SNP	a	g	0.4980	0.0067	0.4894	0.5157	0.0091	0.0092	0.3232	+-+-?	20.8	3.786	3	0.2855
8 : 136902787 : SNP	t	g	0.7144	0.0075	0.6949	0.7188	0.0052	0.0097	0.5921	+0+-+	0.0	1.082	4	0.8971
10 : 110576336 : SNP	a	t	0.9170	0.0040	0.9129	0.9255	-0.0398	0.0156	0.01074	--?+-	0.0	2.997	3	0.3921
21 : 43183456 : INDEL	d	r	0.0215	0.0000	0.0215	0.0215	-0.0100	0.0435	0.818	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 118845578 : SNP	t	g	0.2979	0.0052	0.2953	0.3149	0.0093	0.0092	0.31	+++--	0.0	2.463	4	0.6512
13 : 107833155 : SNP	t	c	0.0290	0.0000	0.0290	0.0290	-0.0260	0.0526	0.6209	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 114325686 : SNP	t	g	0.0237	0.0000	0.0237	0.0237	0.0850	0.0465	0.06755	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 100372220 : SNP	a	t	0.0288	0.0000	0.0288	0.0288	0.0510	0.0505	0.313	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 149055278 : SNP	t	c	0.0455	0.0034	0.0431	0.0503	-0.0242	0.0337	0.4726	-???-	0.0	0.013	1	0.9085
9 : 82052462 : SNP	c	g	0.1119	0.0123	0.0811	0.1223	-0.0188	0.0136	0.1653	----+	48.0	7.689	4	0.1036
2 : 113844310 : SNP	t	c	0.9072	0.0125	0.8988	0.9399	-0.0115	0.0151	0.4483	+-++-	55.2	8.920	4	0.06313
1 : 225935497 : SNP	t	c	0.3583	0.0101	0.3528	0.3851	0.0095	0.0091	0.297	+++0+	0.0	0.483	4	0.9751
4 : 164177549 : SNP	a	g	0.1068	0.0080	0.0961	0.1206	-0.0037	0.0150	0.8045	00?--	0.0	0.232	3	0.9722
7 : 116468914 : SNP	a	g	0.6032	0.0058	0.5869	0.6115	0.0059	0.0085	0.4896	+-+++	0.0	2.690	4	0.611
6 : 131046661 : SNP	a	c	0.5194	0.0161	0.5024	0.5545	0.0060	0.0085	0.4837	++--+	0.0	2.147	4	0.7088
8 : 31738869 : SNP	a	c	0.1833	0.0103	0.1691	0.1965	0.0139	0.0111	0.2095	++-++	55.9	9.063	4	0.05956
1 : 105130233 : SNP	t	c	0.2363	0.0068	0.2169	0.2505	0.0027	0.0098	0.7828	+++--	0.0	1.755	4	0.7808
11 : 54851522 : SNP	t	c	0.3244	0.0215	0.2963	0.3614	0.0051	0.0152	0.738	+--+?	27.7	4.148	3	0.2459
8 : 33343838 : SNP	c	g	0.0141	0.0000	0.0141	0.0141	-0.1050	0.0566	0.06362	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 11702697 : SNP	c	g	0.9196	0.0096	0.9055	0.9345	-0.0145	0.0215	0.4993	--?+-	0.0	0.483	3	0.9226
7 : 139528226 : SNP	t	c	0.0101	0.0000	0.0101	0.0101	0.1050	0.0617	0.0886	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 55648535 : SNP	t	c	0.9842	0.0000	0.9842	0.9842	0.0650	0.0566	0.2509	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 34540399 : SNP	t	g	0.1169	0.0073	0.1113	0.1413	-0.0330	0.0134	0.01403	-----	11.0	4.495	4	0.3432
4 : 53697746 : SNP	a	g	0.0817	0.0056	0.0734	0.0867	-0.0028	0.0158	0.8572	+-?--	0.0	1.763	3	0.623
4 : 25947097 : SNP	a	c	0.5958	0.0069	0.5905	0.6115	-0.0080	0.0085	0.3512	--+++	65.1	11.476	4	0.0217
11 : 71301093 : SNP	a	g	0.2969	0.0163	0.2700	0.3080	0.0049	0.0210	0.8146	??-++	0.0	0.141	2	0.9319
17 : 52008292 : INDEL	d	r	0.0577	0.0023	0.0544	0.0596	-0.0164	0.0184	0.3724	-+?++	7.3	3.238	3	0.3564
18 : 52551716 : SNP	t	c	0.3089	0.0116	0.2777	0.3158	0.0053	0.0092	0.562	-++-+	0.0	3.227	4	0.5205
1 : 4415584 : SNP	t	c	0.8751	0.0079	0.8634	0.8875	0.0000	0.0129	0.9989	---++	10.8	4.483	4	0.3446
5 : 78939551 : SNP	a	g	0.9074	0.0065	0.8979	0.9141	0.0293	0.0148	0.04804	+++++	0.0	2.747	4	0.6011
17 : 35572413 : SNP	t	c	0.0677	0.0070	0.0615	0.0756	0.0182	0.0205	0.3743	+-???	60.8	2.551	1	0.1102
11 : 85128307 : SNP	t	c	0.8272	0.0056	0.8093	0.8360	-0.0061	0.0114	0.5927	-++--	34.9	6.149	4	0.1883
5 : 2080467 : SNP	a	t	0.5254	0.0063	0.5188	0.5317	0.0088	0.0086	0.3027	++-+-	0.0	1.624	4	0.8044
6 : 53032907 : INDEL	i	r	0.0150	0.0000	0.0150	0.0150	-0.0910	0.0505	0.07179	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 164045980 : SNP	a	g	0.0395	0.0004	0.0389	0.0398	-0.0523	0.0266	0.04937	--???	0.0	0.055	1	0.814
5 : 177182485 : SNP	a	g	0.9120	0.0003	0.9118	0.9126	-0.0213	0.0442	0.6293	???-+	62.9	2.694	1	0.1007
12 : 130306221 : INDEL	d	r	0.0541	0.0071	0.0475	0.0698	0.0012	0.0239	0.9588	++??-	0.0	0.155	2	0.9256
2 : 116170335 : SNP	a	g	0.7062	0.0105	0.6832	0.7144	0.0024	0.0092	0.7924	+++--	0.0	0.677	4	0.9541
2 : 45570757 : SNP	a	g	0.4390	0.0121	0.4116	0.4551	-0.0198	0.0101	0.04949	----+	68.2	12.564	4	0.01362
14 : 20519713 : SNP	a	g	0.0814	0.0095	0.0577	0.0865	0.0230	0.0159	0.1482	++?++	0.0	0.805	3	0.8483
7 : 131862444 : SNP	t	c	0.1087	0.0075	0.0997	0.1321	0.0144	0.0137	0.2938	+--+-	72.8	14.703	4	0.00536
13 : 78789039 : INDEL	d	r	0.0303	0.0031	0.0285	0.0357	0.0149	0.0323	0.6451	+???-	0.0	0.641	1	0.4232
4 : 148044681 : SNP	t	c	0.8109	0.0122	0.7852	0.8198	0.0028	0.0110	0.7967	+---+	56.2	9.122	4	0.05811
9 : 71548981 : SNP	c	g	0.9543	0.0016	0.9528	0.9564	0.0393	0.0208	0.05855	++??+	0.0	0.135	2	0.9349
19 : 45475713 : SNP	a	g	0.5880	0.0117	0.5672	0.6053	-0.0260	0.0091	0.00441	-----	50.1	8.010	4	0.09121
3 : 144126216 : SNP	a	c	0.5456	0.0073	0.5336	0.5553	-0.0120	0.0085	0.1602	-+---	17.6	4.853	4	0.3027
13 : 64769723 : SNP	c	g	0.5595	0.0051	0.5415	0.5691	-0.0205	0.0085	0.01648	--+--	0.0	2.369	4	0.6682
20 : 15607678 : SNP	t	g	0.0962	0.0067	0.0892	0.1154	0.0074	0.0151	0.6209	+-?-+	26.9	4.107	3	0.2502
18 : 75882916 : SNP	a	g	0.1055	0.0056	0.1000	0.1120	0.0094	0.0138	0.4958	-+--+	0.0	2.745	4	0.6013
5 : 53751383 : INDEL	i	r	0.5941	0.0188	0.5765	0.6215	0.0086	0.0092	0.3504	++--+	0.0	2.605	4	0.626
1 : 211838730 : SNP	a	c	0.9674	0.0020	0.9639	0.9692	-0.0031	0.0249	0.9013	--??+	0.0	1.339	2	0.512
4 : 119721727 : SNP	t	c	0.0603	0.0080	0.0380	0.0647	-0.0150	0.0194	0.4393	--??-	0.0	1.744	2	0.418
4 : 58301394 : SNP	t	c	0.1233	0.0094	0.0955	0.1328	0.0313	0.0130	0.01636	+++++	0.0	1.033	4	0.9048
7 : 54650281 : SNP	t	c	0.9557	0.0018	0.9535	0.9574	0.0175	0.0220	0.4265	+-??+	0.0	1.265	2	0.5312
9 : 3946970 : SNP	t	c	0.0717	0.0046	0.0597	0.0749	0.0225	0.0170	0.1866	+-?+-	0.0	2.614	3	0.455
2 : 151819342 : INDEL	d	r	0.1009	0.0072	0.0888	0.1243	0.0146	0.0144	0.3102	++--+	0.0	3.941	4	0.414
11 : 11507586 : SNP	c	g	0.8702	0.0065	0.8639	0.8824	-0.0271	0.0128	0.03473	-----	0.0	0.308	4	0.9893
22 : 37992850 : SNP	c	g	0.2362	0.0081	0.2284	0.2573	0.0004	0.0100	0.9702	----+	0.0	1.812	4	0.7702
21 : 19217471 : SNP	t	c	0.2403	0.0117	0.2288	0.2680	0.0089	0.0099	0.3681	+-+++	38.7	6.527	4	0.1631
2 : 120244039 : SNP	a	g	0.0202	0.0000	0.0202	0.0202	-0.0040	0.0556	0.9426	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 51385275 : INDEL	i	r	0.3785	0.0159	0.3656	0.4208	0.0105	0.0090	0.2444	+++-+	0.0	1.904	4	0.7534
6 : 30187887 : SNP	t	c	0.3712	0.0115	0.3570	0.3806	0.0021	0.0197	0.9167	??-++	0.0	0.471	2	0.79
1 : 205240913 : SNP	a	g	0.0886	0.0079	0.0809	0.1043	0.0211	0.0152	0.1646	+-+-+	48.4	7.752	4	0.1011
12 : 30560726 : SNP	t	c	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	0.0640	0.0445	0.1502	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 43311483 : SNP	a	g	0.9232	0.0022	0.9207	0.9274	0.0088	0.0167	0.5961	++?+-	0.0	2.926	3	0.4032
4 : 1242214 : SNP	t	c	0.4688	0.0197	0.4259	0.4957	-0.0029	0.0086	0.7374	--+++	4.9	4.206	4	0.3789
9 : 15302613 : SNP	a	g	0.1830	0.0040	0.1781	0.1963	0.0010	0.0120	0.9366	+-+-+	0.0	2.862	4	0.5812
6 : 114376866 : SNP	t	c	0.9738	0.0060	0.9650	0.9779	0.0399	0.0350	0.2554	+???+	0.0	0.438	1	0.508
14 : 103503426 : INDEL	d	r	0.0220	0.0000	0.0220	0.0220	-0.0770	0.0414	0.06319	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 119641429 : SNP	t	c	0.4967	0.0129	0.4807	0.5085	-0.0062	0.0085	0.4673	-++--	4.2	4.177	4	0.3826
1 : 205817574 : SNP	t	c	0.0569	0.0045	0.0520	0.0618	-0.0229	0.0191	0.2321	-+?--	0.0	1.456	3	0.6924
6 : 148637380 : SNP	t	g	0.4059	0.0098	0.3824	0.4268	0.0033	0.0092	0.716	-++++	27.6	5.522	4	0.2378
14 : 71115919 : SNP	a	g	0.0309	0.0000	0.0309	0.0309	0.0130	0.0374	0.7282	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 62834205 : SNP	a	g	0.3687	0.0333	0.3257	0.4037	0.0159	0.0100	0.1109	+++-+	0.0	1.414	4	0.8418
6 : 63201672 : SNP	t	c	0.3752	0.0076	0.3493	0.3795	-0.0067	0.0098	0.4979	--++?	61.6	7.813	3	0.05004
11 : 45612380 : SNP	a	g	0.0457	0.0009	0.0449	0.0468	-0.0272	0.0219	0.2147	--??-	0.0	0.061	2	0.9699
10 : 9485470 : SNP	a	g	0.5119	0.0083	0.4942	0.5182	-0.0044	0.0085	0.6086	--+++	0.0	1.381	4	0.8475
3 : 152032091 : SNP	t	c	0.1061	0.0033	0.1015	0.1119	-0.0140	0.0162	0.3854	+----	0.0	3.971	4	0.4099
6 : 167640732 : SNP	t	c	0.7723	0.0044	0.7657	0.7766	-0.0003	0.0104	0.9733	+---+	0.0	3.452	4	0.4853
3 : 192423209 : SNP	a	g	0.0332	0.0000	0.0332	0.0332	0.0840	0.0384	0.02876	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 114589545 : SNP	c	g	0.8704	0.0097	0.8548	0.8843	0.0226	0.0128	0.07701	++++-	0.0	2.224	4	0.6946
10 : 57839049 : SNP	a	g	0.4878	0.0105	0.4687	0.5189	0.0095	0.0085	0.2645	+++-+	0.0	0.607	4	0.9623
16 : 8530445 : SNP	c	g	0.1884	0.0074	0.1849	0.2159	-0.0024	0.0110	0.828	-++--	0.0	1.507	4	0.8254
19 : 2828020 : SNP	t	c	0.4666	0.0153	0.4373	0.4845	0.0012	0.0090	0.8917	+-+--	0.0	0.196	4	0.9955
20 : 56057819 : SNP	t	g	0.8167	0.0032	0.8101	0.8193	0.0015	0.0117	0.8953	++++-	0.0	1.183	4	0.8809
8 : 2750762 : SNP	t	c	0.4109	0.0197	0.3665	0.4223	-0.0047	0.0086	0.5812	+-++-	60.8	10.205	4	0.03711
17 : 27074565 : SNP	c	g	0.5628	0.0037	0.5547	0.5666	0.0025	0.0085	0.7735	-+-++	47.3	7.590	4	0.1078
14 : 85359236 : SNP	a	g	0.1086	0.0137	0.0954	0.1371	-0.0232	0.0140	0.09811	--+++	49.6	7.943	4	0.09369
9 : 34507173 : SNP	t	c	0.1752	0.0168	0.1270	0.1837	0.0050	0.0115	0.6622	+++-+	53.2	8.556	4	0.07322
13 : 104747405 : SNP	t	c	0.4740	0.0171	0.4463	0.4982	0.0214	0.0085	0.01217	++-++	0.0	2.636	4	0.6205
2 : 159913502 : SNP	a	t	0.8906	0.0071	0.8769	0.8975	-0.0092	0.0134	0.493	-0+-+	0.0	1.980	4	0.7395
11 : 96997932 : SNP	t	c	0.2054	0.0096	0.1890	0.2169	0.0075	0.0124	0.5463	-+-++	0.0	3.710	4	0.4467
19 : 22123495 : SNP	t	c	0.8797	0.0111	0.8733	0.9058	0.0146	0.0138	0.2898	+++--	0.0	3.687	4	0.45
18 : 57162721 : SNP	a	t	0.7109	0.0237	0.6599	0.7270	0.0131	0.0097	0.1754	++--+	0.0	2.388	4	0.6648
3 : 134577691 : SNP	a	g	0.6730	0.0114	0.6514	0.6860	0.0050	0.0091	0.5846	+-+-+	0.0	2.575	4	0.6312
2 : 47815544 : SNP	a	g	0.8423	0.0063	0.8332	0.8580	0.0062	0.0129	0.6305	-+-++	0.0	2.186	4	0.7015
6 : 58519218 : INDEL	i	r	0.4208	0.0278	0.3586	0.4370	0.0199	0.0089	0.02574	+++++	0.0	3.733	4	0.4434
13 : 85659216 : INDEL	d	r	0.2839	0.0184	0.2435	0.3060	0.0232	0.0098	0.01828	+-+++	7.0	4.302	4	0.3667
7 : 113968292 : INDEL	i	r	0.0772	0.0027	0.0756	0.0839	0.0004	0.0173	0.9838	-+?++	0.0	0.076	3	0.9946
11 : 34978005 : SNP	t	g	0.0332	0.0081	0.0270	0.0477	-0.0149	0.0257	0.5627	--??-	0.0	0.049	2	0.9756
15 : 81167233 : SNP	t	c	0.5995	0.0065	0.5739	0.6041	0.0038	0.0090	0.6755	+---+	0.0	0.368	4	0.985
12 : 50930808 : SNP	t	c	0.9836	0.0000	0.9836	0.9836	0.0930	0.0505	0.06577	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 104192323 : SNP	t	c	0.0106	0.0000	0.0106	0.0106	0.0060	0.0607	0.9212	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 58585508 : SNP	a	t	0.0334	0.0000	0.0334	0.0334	0.0330	0.0505	0.5138	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 112871071 : SNP	c	g	0.1919	0.0037	0.1885	0.2057	-0.0016	0.0111	0.8877	+--++	0.0	0.496	4	0.9739
8 : 142326677 : SNP	t	c	0.9384	0.0114	0.9180	0.9472	-0.0191	0.0197	0.3313	--?--	0.0	2.824	3	0.4196
1 : 199775703 : SNP	t	c	0.0481	0.0052	0.0403	0.0553	-0.0064	0.0234	0.7836	+-??+	0.0	0.384	2	0.8252
9 : 71679466 : SNP	a	c	0.9565	0.0032	0.9500	0.9585	0.0358	0.0240	0.135	++??+	0.0	1.720	2	0.4232
3 : 165360155 : SNP	t	c	0.1377	0.0115	0.1258	0.1585	-0.0064	0.0126	0.6107	--++-	0.0	3.944	4	0.4136
7 : 144851208 : INDEL	d	r	0.3176	0.0129	0.3059	0.3369	0.0112	0.0112	0.3134	++++-	0.0	1.445	4	0.8363
20 : 36589100 : SNP	a	c	0.2412	0.0111	0.2264	0.2569	-0.0124	0.0099	0.2131	---+-	0.0	3.074	4	0.5456
5 : 117322882 : SNP	t	c	0.8779	0.0080	0.8554	0.8991	-0.0108	0.0133	0.4141	---+-	71.1	13.846	4	0.007805
1 : 31988128 : SNP	a	g	0.5090	0.0183	0.4698	0.5212	-0.0091	0.0085	0.2874	----+	28.6	5.600	4	0.2311
3 : 59527037 : SNP	t	g	0.4822	0.0138	0.4358	0.4949	-0.0075	0.0085	0.3794	---+-	0.0	0.872	4	0.9285
16 : 7950831 : SNP	a	g	0.0377	0.0009	0.0364	0.0383	0.0728	0.0281	0.009692	++???	0.0	0.725	1	0.3944
3 : 162918577 : SNP	t	g	0.3185	0.0123	0.2959	0.3421	0.0044	0.0091	0.6316	-+-+-	0.0	3.818	4	0.4312
22 : 29821849 : SNP	t	c	0.1828	0.0104	0.1589	0.1953	0.0141	0.0114	0.2138	++++-	0.0	3.046	4	0.5501
14 : 28435287 : SNP	t	c	0.1827	0.0084	0.1664	0.1910	-0.0064	0.0111	0.5672	-++--	0.0	2.336	4	0.6743
4 : 58942997 : SNP	t	c	0.8894	0.0079	0.8857	0.9102	-0.0052	0.0150	0.7293	--+-+	26.3	5.431	4	0.2459
6 : 15533733 : SNP	t	c	0.0918	0.0034	0.0874	0.0992	0.0004	0.0147	0.9803	-+-++	4.5	4.190	4	0.381
9 : 105290387 : SNP	a	t	0.0741	0.0032	0.0711	0.0779	-0.0157	0.0165	0.3432	--?--	0.0	0.219	3	0.9745
7 : 127399500 : SNP	a	g	0.8332	0.0130	0.8147	0.8503	-0.0010	0.0118	0.9292	++---	0.0	2.503	4	0.644
5 : 2289617 : SNP	a	g	0.3768	0.0214	0.3430	0.4299	-0.0058	0.0095	0.544	++---	0.0	3.542	4	0.4715
12 : 96785497 : SNP	a	g	0.9799	0.0000	0.9799	0.9799	-0.0020	0.0505	0.9684	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 62481460 : SNP	t	c	0.9209	0.0128	0.9140	0.9498	-0.0181	0.0190	0.342	--?+-	0.0	0.710	3	0.8708
4 : 98585563 : SNP	t	g	0.9594	0.0081	0.9438	0.9673	-0.0003	0.0259	0.992	+-??+	59.5	4.933	2	0.08487
4 : 127985438 : SNP	t	g	0.1317	0.0182	0.1147	0.1647	-0.0067	0.0130	0.6031	---+-	0.0	2.358	4	0.6702
1 : 114763319 : SNP	c	g	0.9192	0.0176	0.8897	0.9322	0.0088	0.0168	0.6019	-+?+-	22.5	3.873	3	0.2755
14 : 96740082 : SNP	a	g	0.5252	0.0171	0.4894	0.5364	0.0060	0.0085	0.4783	+--++	0.0	2.525	4	0.6402
1 : 204529302 : SNP	a	c	0.3284	0.0227	0.3025	0.3771	-0.0004	0.0091	0.9642	+-+--	57.0	9.305	4	0.05392
14 : 65276435 : SNP	a	g	0.0286	0.0010	0.0272	0.0294	0.0210	0.0294	0.4764	++???	0.0	0.138	1	0.7101
15 : 87131220 : SNP	t	c	0.5931	0.0101	0.5869	0.6148	-0.0094	0.0086	0.2704	--+++	3.2	4.131	4	0.3886
18 : 31695059 : SNP	a	g	0.0114	0.0000	0.0114	0.0114	0.0160	0.0576	0.7813	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 22849208 : SNP	c	g	0.0369	0.0000	0.0369	0.0369	-0.0380	0.0374	0.3096	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 4212516 : SNP	a	c	0.6777	0.0138	0.6537	0.6903	0.0033	0.0102	0.7426	+--++	0.0	3.330	4	0.5042
1 : 172719659 : SNP	t	c	0.4396	0.0120	0.4263	0.4553	0.0105	0.0086	0.2238	+++-+	48.6	7.777	4	0.1001
11 : 69795390 : INDEL	d	r	0.1095	0.0198	0.0850	0.1410	0.0343	0.0213	0.1084	++?-+	0.0	2.029	3	0.5664
2 : 106059781 : SNP	a	g	0.3708	0.0296	0.3293	0.4013	0.0351	0.0255	0.1685	??-++	0.0	1.355	2	0.5078
17 : 66480597 : INDEL	i	r	0.2249	0.0082	0.2115	0.2497	-0.0024	0.0104	0.8148	+---+	0.0	3.000	4	0.5578
5 : 138364394 : SNP	t	c	0.6759	0.0232	0.6490	0.7369	0.0023	0.0092	0.8009	++--+	0.0	0.779	4	0.9412
20 : 14697914 : SNP	t	c	0.5131	0.0051	0.4973	0.5167	-0.0115	0.0085	0.1776	--+--	0.0	1.234	4	0.8725
4 : 58239508 : SNP	t	c	0.0743	0.0087	0.0572	0.0860	-0.0054	0.0169	0.7492	+-?-+	2.3	3.071	3	0.3809
15 : 78024099 : SNP	a	g	0.0874	0.0078	0.0804	0.1123	-0.0075	0.0156	0.6286	-+?--	0.0	1.747	3	0.6265
3 : 133146527 : SNP	t	c	0.6425	0.0133	0.6208	0.6631	0.0050	0.0096	0.6041	+++--	72.8	14.729	4	0.005297
7 : 95226811 : SNP	a	t	0.8038	0.0103	0.7806	0.8101	-0.0082	0.0106	0.4407	-+-+-	0.0	2.867	4	0.5803
7 : 5830557 : SNP	c	g	0.0521	0.0035	0.0486	0.0560	0.0016	0.0207	0.9402	-+??-	0.0	0.705	2	0.7031
8 : 24795851 : SNP	a	g	0.5879	0.0235	0.5233	0.6051	-0.0062	0.0087	0.475	-+---	46.3	7.443	4	0.1143
2 : 119000235 : SNP	t	g	0.9506	0.0070	0.9368	0.9571	0.0234	0.0206	0.2568	++??+	0.0	0.257	2	0.8794
5 : 3610527 : SNP	t	c	0.9375	0.0062	0.9322	0.9455	0.0279	0.0184	0.1289	++?++	0.0	2.016	3	0.5691
1 : 111855630 : INDEL	d	r	0.0529	0.0058	0.0451	0.0676	0.0435	0.0221	0.04929	++?+-	24.2	3.959	3	0.266
1 : 245977881 : SNP	a	g	0.8924	0.0103	0.8850	0.9159	0.0120	0.0137	0.3829	-+-++	38.9	6.546	4	0.1619
7 : 155661252 : SNP	a	g	0.0554	0.0069	0.0504	0.0691	-0.0421	0.0212	0.04748	-+?--	33.6	4.519	3	0.2106
12 : 87774131 : SNP	t	c	0.7260	0.0187	0.6890	0.7382	0.0038	0.0097	0.6911	+----	25.7	5.387	4	0.2498
16 : 84474043 : SNP	a	c	0.5713	0.0090	0.5540	0.5809	-0.0041	0.0089	0.6465	+---+	60.5	10.128	4	0.03833
21 : 34174449 : SNP	t	g	0.0411	0.0039	0.0350	0.0463	-0.0293	0.0228	0.1986	--??+	55.2	4.463	2	0.1074
2 : 163880570 : SNP	t	g	0.4220	0.0200	0.3732	0.4364	-0.0080	0.0091	0.3761	-++--	0.0	3.409	4	0.4919
6 : 10295616 : SNP	c	g	0.0446	0.0000	0.0446	0.0446	-0.0270	0.0364	0.4581	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 83622777 : SNP	a	g	0.2910	0.0105	0.2681	0.2990	0.0038	0.0096	0.6914	+-+++	11.7	4.531	4	0.3388
2 : 206049491 : SNP	t	c	0.9690	0.0027	0.9659	0.9713	-0.0065	0.0292	0.8235	-+???	28.5	1.399	1	0.237
2 : 150511173 : SNP	t	c	0.0439	0.0081	0.0388	0.0587	-0.0081	0.0242	0.7373	--??+	0.0	0.097	2	0.9525
3 : 64693140 : SNP	a	g	0.9678	0.0000	0.9678	0.9678	0.0050	0.0414	0.904	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 99519642 : SNP	a	c	0.6251	0.0192	0.5835	0.6426	0.0018	0.0089	0.8429	++-+-	53.9	8.672	4	0.06985
10 : 4529818 : SNP	t	c	0.5861	0.0246	0.5629	0.6434	0.0083	0.0086	0.3332	++-+-	0.0	3.042	4	0.5507
3 : 95592947 : SNP	t	c	0.9543	0.0046	0.9491	0.9583	-0.0367	0.0251	0.1434	--???	0.0	0.004	1	0.9527
5 : 43468352 : SNP	a	t	0.4806	0.0115	0.4375	0.5078	-0.0004	0.0091	0.9676	++---	3.4	4.140	4	0.3874
2 : 75074055 : SNP	t	g	0.2884	0.0164	0.2656	0.3277	0.0113	0.0108	0.2981	-++++	0.0	2.063	4	0.7242
6 : 77376536 : SNP	a	g	0.8976	0.0091	0.8894	0.9191	-0.0125	0.0143	0.3829	0+---	42.4	6.942	4	0.139
2 : 145714757 : INDEL	d	r	0.2501	0.0064	0.2465	0.2646	-0.0184	0.0098	0.05939	--+--	57.4	9.388	4	0.0521
10 : 50947507 : SNP	a	g	0.4577	0.0150	0.4205	0.5148	-0.0137	0.0085	0.1082	---+-	32.5	5.926	4	0.2047
14 : 78052681 : SNP	a	c	0.5846	0.0096	0.5759	0.5977	-0.0061	0.0087	0.4815	---+-	0.0	0.949	4	0.9174
3 : 69795660 : SNP	t	g	0.7744	0.0106	0.7513	0.7894	0.0027	0.0115	0.8126	+-+++	0.0	3.900	4	0.4198
12 : 24448675 : INDEL	i	r	0.7786	0.0042	0.7737	0.7955	-0.0129	0.0108	0.23	---+-	0.0	1.529	4	0.8215
7 : 112065883 : SNP	t	c	0.9844	0.0000	0.9844	0.9844	-0.0810	0.0637	0.2034	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 54787340 : SNP	t	c	0.6442	0.0131	0.6041	0.6531	-0.0085	0.0091	0.3508	---++	0.0	2.989	4	0.5596
5 : 44448003 : SNP	a	g	0.9237	0.0026	0.9198	0.9266	-0.0040	0.0166	0.8087	--?++	0.0	1.687	3	0.6398
7 : 70685811 : SNP	a	g	0.4155	0.0224	0.3599	0.4323	-0.0171	0.0086	0.04586	-+---	41.3	6.814	4	0.146
3 : 128841443 : SNP	a	g	0.0165	0.0000	0.0165	0.0165	-0.0560	0.0617	0.3638	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 156491089 : SNP	a	g	0.8716	0.0136	0.8594	0.9063	-0.0035	0.0128	0.7851	0-++-	19.9	4.991	4	0.2882
1 : 185400748 : SNP	t	c	0.6851	0.0158	0.6720	0.7199	-0.0204	0.0092	0.02638	--+--	0.0	3.879	4	0.4226
20 : 7603311 : SNP	t	c	0.1953	0.0198	0.1769	0.2457	-0.0124	0.0107	0.2466	--+-+	0.0	1.313	4	0.8591
3 : 166249247 : SNP	a	c	0.2784	0.0200	0.2476	0.3166	0.0157	0.0093	0.09171	++-++	0.0	0.450	4	0.9782
15 : 62124679 : SNP	t	c	0.0869	0.0056	0.0812	0.0954	0.0341	0.0154	0.02656	+-?++	44.9	5.446	3	0.1419
5 : 123007836 : SNP	a	g	0.7813	0.0126	0.7695	0.7979	0.0010	0.0103	0.9214	-++-+	53.5	8.607	4	0.07172
2 : 45206238 : SNP	t	c	0.5003	0.0150	0.4668	0.5109	-0.0004	0.0085	0.9627	+-++-	0.0	3.031	4	0.5527
7 : 25494186 : INDEL	i	r	0.4223	0.0231	0.4054	0.4821	0.0107	0.0091	0.2399	+++--	0.0	1.551	4	0.8175
6 : 153776384 : SNP	t	c	0.7727	0.0172	0.7633	0.8187	-0.0019	0.0101	0.852	-+-+-	7.5	4.326	4	0.3637
3 : 180412969 : SNP	t	c	0.9801	0.0000	0.9801	0.9801	-0.0430	0.0516	0.4042	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 94782516 : INDEL	i	r	0.1337	0.0188	0.1088	0.1630	0.0169	0.0146	0.2466	+-+++	11.3	4.511	4	0.3412
19 : 55785715 : INDEL	i	r	0.4316	0.0210	0.3937	0.4675	0.0034	0.0098	0.7293	+++--	48.2	7.723	4	0.1023
8 : 131868338 : SNP	a	g	0.3844	0.0090	0.3590	0.4064	0.0059	0.0086	0.4932	-+-+-	55.2	8.924	4	0.06302
21 : 21240976 : SNP	a	g	0.8566	0.0050	0.8394	0.8619	0.0084	0.0123	0.4963	++--+	22.6	5.171	4	0.2702
3 : 34041316 : SNP	t	c	0.0197	0.0000	0.0197	0.0197	0.0460	0.0465	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 12550763 : SNP	a	g	0.2637	0.0087	0.2432	0.2678	-0.0156	0.0098	0.1115	--++-	27.0	5.477	4	0.2418
3 : 72375939 : SNP	a	t	0.6552	0.0084	0.6346	0.6670	-0.0051	0.0091	0.5801	--+-+	0.0	3.584	4	0.4652
6 : 115832110 : SNP	t	c	0.0379	0.0023	0.0361	0.0408	0.0148	0.0261	0.5722	-+???	51.4	2.059	1	0.1513
13 : 76696778 : INDEL	i	r	0.8890	0.0093	0.8741	0.9041	-0.0111	0.0150	0.4562	--+-+	0.0	1.954	4	0.7442
11 : 81466995 : INDEL	i	r	0.0519	0.0090	0.0371	0.0612	0.0132	0.0220	0.548	+-??+	0.0	1.596	2	0.4503
2 : 208186963 : SNP	t	g	0.2748	0.0049	0.2608	0.2807	-0.0075	0.0098	0.4456	-++--	0.0	2.278	4	0.6848
1 : 190328217 : SNP	t	c	0.4522	0.0266	0.4277	0.5144	0.0076	0.0085	0.3741	+-+++	0.0	2.378	4	0.6666
5 : 173752420 : SNP	a	g	0.9022	0.0086	0.8936	0.9276	-0.0181	0.0147	0.2206	-----	0.0	0.173	4	0.9965
9 : 34417595 : SNP	t	c	0.1357	0.0062	0.1118	0.1414	-0.0096	0.0127	0.4524	--+--	0.0	0.549	4	0.9686
3 : 119280020 : SNP	a	g	0.8656	0.0185	0.8313	0.8808	0.0042	0.0129	0.7482	++++-	0.0	1.475	4	0.8311
5 : 167452456 : SNP	a	g	0.0262	0.0000	0.0262	0.0262	-0.0030	0.0404	0.9409	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 115554314 : SNP	a	g	0.3640	0.0124	0.3571	0.3892	-0.0022	0.0091	0.8081	--+-+	0.4	4.016	4	0.4039
18 : 73665145 : SNP	t	c	0.1953	0.0176	0.1763	0.2292	-0.0008	0.0107	0.9434	++--+	3.7	4.155	4	0.3854
15 : 27372355 : SNP	t	g	0.3476	0.0119	0.3400	0.3692	0.0029	0.0090	0.7502	-++-+	0.0	2.312	4	0.6786
3 : 14294705 : SNP	a	g	0.1056	0.0113	0.0809	0.1278	0.0096	0.0143	0.5025	-+-++	16.2	4.770	4	0.3117
6 : 51805674 : SNP	a	t	0.9273	0.0097	0.9018	0.9392	0.0002	0.0215	0.9927	-+?-+	0.0	0.904	3	0.8245
13 : 69629258 : SNP	a	t	0.0336	0.0010	0.0323	0.0344	-0.0225	0.0271	0.406	--???	0.0	0.005	1	0.9429
2 : 235416564 : SNP	t	g	0.7976	0.0038	0.7796	0.7997	-0.0257	0.0128	0.04389	-----	57.6	9.431	4	0.05119
16 : 85239797 : INDEL	i	r	0.0205	0.0000	0.0205	0.0205	0.0280	0.0526	0.5943	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 199510208 : SNP	c	g	0.9849	0.0000	0.9849	0.9849	-0.0050	0.0495	0.9196	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 32227082 : SNP	a	g	0.1822	0.0092	0.1722	0.2000	0.0245	0.0234	0.2941	??-++	26.5	2.721	2	0.2566
4 : 21591033 : SNP	a	g	0.0407	0.0026	0.0386	0.0440	0.0040	0.0244	0.8697	+-???	3.7	1.038	1	0.3082
10 : 110702426 : SNP	a	g	0.8169	0.0048	0.8109	0.8266	0.0090	0.0111	0.4137	+--++	0.0	1.514	4	0.8242
4 : 146955395 : SNP	a	c	0.7896	0.0161	0.7556	0.8142	-0.0066	0.0104	0.5233	+-+--	0.0	3.262	4	0.5149
19 : 41017484 : SNP	a	t	0.7096	0.0065	0.7032	0.7355	0.0028	0.0092	0.7654	---++	4.9	4.207	4	0.3788
7 : 79155264 : SNP	a	g	0.1190	0.0112	0.1025	0.1358	-0.0160	0.0141	0.2562	-+---	0.0	1.403	4	0.8436
5 : 145246085 : SNP	t	g	0.4245	0.0052	0.4159	0.4384	-0.0149	0.0090	0.09983	---+-	50.5	8.073	4	0.08894
4 : 61509614 : SNP	a	g	0.1142	0.0084	0.0888	0.1214	0.0003	0.0134	0.9795	++---	5.4	4.228	4	0.3761
10 : 5533919 : SNP	t	c	0.4595	0.0232	0.4334	0.5340	0.0047	0.0085	0.5796	-++++	0.0	3.081	4	0.5444
2 : 162276981 : SNP	t	c	0.5156	0.0123	0.4835	0.5233	-0.0189	0.0093	0.04163	-+---	0.0	3.113	4	0.5391
1 : 36965036 : SNP	t	c	0.0258	0.0035	0.0226	0.0297	0.0131	0.0308	0.6711	+-???	36.9	1.586	1	0.2079
17 : 48635052 : SNP	a	g	0.5874	0.0103	0.5751	0.6094	-0.0075	0.0086	0.3874	--++-	57.1	9.317	4	0.05364
1 : 177298001 : SNP	c	g	0.8680	0.0160	0.8351	0.8820	0.0034	0.0127	0.7892	+-+-+	0.0	0.568	4	0.9665
15 : 40553897 : SNP	t	c	0.8668	0.0062	0.8615	0.8838	-0.0094	0.0132	0.4764	-++--	41.5	6.834	4	0.1449
12 : 78309046 : SNP	t	c	0.1199	0.0068	0.1027	0.1357	-0.0194	0.0133	0.1447	----+	34.5	6.109	4	0.1912
4 : 39442681 : SNP	c	g	0.0701	0.0057	0.0651	0.0779	-0.0114	0.0173	0.5096	-+?-+	12.1	3.412	3	0.3324
12 : 66913729 : SNP	a	c	0.4641	0.0081	0.4534	0.4796	-0.0033	0.0085	0.7015	+----	36.4	6.292	4	0.1784
1 : 56611464 : SNP	a	c	0.9826	0.0000	0.9826	0.9826	-0.0400	0.0495	0.4193	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 97165610 : SNP	a	c	0.2965	0.0167	0.2806	0.3321	-0.0032	0.0092	0.7263	-+---	0.0	1.141	4	0.8877
10 : 83276112 : SNP	a	t	0.0863	0.0115	0.0686	0.0962	0.0058	0.0158	0.716	+-?+-	33.6	4.516	3	0.2109
6 : 76909672 : SNP	a	g	0.0472	0.0055	0.0360	0.0532	0.0326	0.0215	0.1289	++??+	0.0	1.220	2	0.5435
4 : 68897182 : SNP	a	g	0.7734	0.0222	0.7362	0.8004	-0.0013	0.0110	0.9027	-++-+	0.0	3.214	4	0.5227
11 : 51269677 : SNP	t	c	0.8730	0.0140	0.8606	0.8888	0.0115	0.0526	0.8266	??++?	0.0	0.001	1	0.9714
6 : 52075816 : SNP	a	g	0.2459	0.0123	0.2338	0.2633	0.0063	0.0099	0.5265	++-++	0.0	1.508	4	0.8252
2 : 2569690 : SNP	t	c	0.0241	0.0000	0.0241	0.0241	0.0190	0.0414	0.6466	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 58540484 : SNP	t	g	0.9570	0.0022	0.9544	0.9592	0.0193	0.0232	0.4056	+-??+	28.8	2.807	2	0.2457
12 : 103475970 : SNP	a	g	0.0139	0.0000	0.0139	0.0139	0.0070	0.0536	0.896	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 90346669 : SNP	a	g	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	0.0070	0.0566	0.9016	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 17777201 : SNP	a	g	0.9062	0.0092	0.8947	0.9297	0.0124	0.0149	0.4079	++++-	0.0	1.711	4	0.7888
12 : 82244333 : SNP	t	c	0.2294	0.0078	0.2164	0.2413	-0.0079	0.0101	0.4333	--+--	38.4	6.495	4	0.1651
9 : 137742694 : SNP	t	c	0.8372	0.0124	0.8274	0.8674	0.0146	0.0129	0.257	+++--	0.0	2.308	4	0.6794
6 : 108753792 : SNP	a	g	0.0127	0.0000	0.0127	0.0127	-0.0420	0.0556	0.45	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 19705396 : SNP	t	g	0.0805	0.0143	0.0590	0.0912	0.0058	0.0176	0.7442	+-?++	0.0	2.455	3	0.4834
18 : 55596274 : SNP	t	c	0.9470	0.0010	0.9458	0.9485	-0.0238	0.0199	0.2311	--??+	0.0	0.606	2	0.7384
7 : 153944997 : SNP	c	g	0.0366	0.0006	0.0361	0.0373	0.0250	0.0290	0.39	++???	0.0	0.114	1	0.736
22 : 32698594 : SNP	t	c	0.0375	0.0000	0.0375	0.0375	-0.0110	0.0404	0.7856	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 15069304 : SNP	t	c	0.0264	0.0014	0.0253	0.0281	-0.0080	0.0298	0.7881	-+???	0.0	0.061	1	0.8049
9 : 95349517 : SNP	t	c	0.3003	0.0187	0.2864	0.3391	-0.0105	0.0093	0.2588	-+---	0.0	3.991	4	0.4072
10 : 112223192 : SNP	a	g	0.0202	0.0000	0.0202	0.0202	0.0450	0.0465	0.3332	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 25457686 : SNP	t	c	0.7445	0.0179	0.7074	0.7596	0.0123	0.0099	0.2152	+-+++	0.0	3.112	4	0.5393
3 : 115660309 : SNP	a	t	0.7854	0.0155	0.7661	0.8132	-0.0047	0.0106	0.6567	--++-	24.3	5.284	4	0.2594
8 : 104729076 : SNP	t	c	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	0.1330	0.0607	0.02832	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 62576249 : INDEL	i	r	0.6442	0.0039	0.6309	0.6523	-0.0000	0.0091	0.998	--+-+	0.0	3.241	4	0.5183
3 : 60609663 : SNP	a	g	0.1479	0.0103	0.1288	0.1566	0.0163	0.0124	0.1885	+--++	20.2	5.014	4	0.2859
17 : 12264477 : SNP	t	g	0.5727	0.0068	0.5571	0.5774	-0.0036	0.0086	0.674	--+-0	0.0	2.247	4	0.6904
4 : 34806444 : SNP	t	c	0.1885	0.0205	0.1565	0.2228	-0.0066	0.0136	0.6267	--++-	0.0	1.299	4	0.8616
16 : 31094679 : SNP	t	c	0.2341	0.0117	0.1993	0.2434	0.0088	0.0101	0.3843	+++++	0.0	0.433	4	0.9797
3 : 63962339 : SNP	a	g	0.1552	0.0044	0.1537	0.1737	0.0144	0.0120	0.2294	+-+++	0.0	1.399	4	0.8444
6 : 101483131 : SNP	a	t	0.5069	0.0123	0.4885	0.5532	-0.0001	0.0085	0.9915	+--+-	0.0	2.132	4	0.7115
12 : 115701133 : SNP	a	g	0.7380	0.0164	0.7017	0.7489	0.0005	0.0098	0.9585	0-+-+	0.0	2.393	4	0.6639
20 : 12533112 : SNP	a	c	0.9850	0.0000	0.9850	0.9850	-0.0610	0.0566	0.2812	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 144502978 : SNP	a	g	0.9270	0.0024	0.9238	0.9292	0.0179	0.0167	0.2862	++?++	0.0	0.544	3	0.909
3 : 158418257 : SNP	t	c	0.6265	0.0095	0.6154	0.6373	0.0089	0.0091	0.3279	++-++	0.0	0.859	4	0.9304
2 : 21909738 : SNP	t	c	0.9802	0.0000	0.9802	0.9802	0.0020	0.0425	0.9624	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 243185679 : SNP	t	c	0.1052	0.0037	0.1029	0.1112	-0.0465	0.0428	0.2773	???--	0.0	0.003	1	0.9543
21 : 25049198 : SNP	t	c	0.0611	0.0044	0.0529	0.0647	-0.0188	0.0181	0.3007	--?++	0.0	1.053	3	0.7884
4 : 168319264 : SNP	t	c	0.0235	0.0000	0.0235	0.0235	0.0250	0.0465	0.5908	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 124844954 : SNP	a	g	0.0621	0.0000	0.0621	0.0621	-0.0830	0.0709	0.2417	????-	0.0	0.000	0	1
12 : 77585968 : SNP	t	c	0.9098	0.0091	0.8919	0.9182	-0.0249	0.0151	0.1005	--?-+	0.0	1.808	3	0.6132
16 : 53453939 : SNP	t	g	0.9282	0.0088	0.9085	0.9421	-0.0354	0.0178	0.0472	-+?--	0.0	1.821	3	0.6105
12 : 68582627 : SNP	a	g	0.5191	0.0104	0.5051	0.5388	0.0122	0.0085	0.1525	+++++	0.0	1.037	4	0.9041
10 : 20880696 : SNP	a	c	0.0640	0.0070	0.0556	0.0733	-0.0172	0.0184	0.3495	--?++	0.0	2.322	3	0.5084
12 : 90539177 : SNP	a	c	0.7973	0.0099	0.7882	0.8222	-0.0189	0.0107	0.07641	---++	0.0	1.625	4	0.8043
19 : 42032339 : SNP	a	g	0.9612	0.0025	0.9579	0.9632	-0.0188	0.0247	0.4452	--???	0.0	0.125	1	0.7233
2 : 130071251 : SNP	a	g	0.4118	0.0156	0.3844	0.4286	-0.0042	0.0094	0.6587	--++-	0.0	3.153	4	0.5325
4 : 7754006 : SNP	a	g	0.0903	0.0112	0.0618	0.1009	0.0021	0.0157	0.8913	+--+-	0.0	2.881	4	0.5779
16 : 6135185 : SNP	a	c	0.8401	0.0044	0.8215	0.8436	0.0038	0.0119	0.7463	+0-++	0.0	0.364	4	0.9853
2 : 203692010 : SNP	a	g	0.0618	0.0072	0.0493	0.0708	-0.0100	0.0184	0.5864	--??+	0.0	0.641	2	0.7257
12 : 44415149 : SNP	a	g	0.1673	0.0051	0.1641	0.1786	-0.0088	0.0112	0.4359	-+-+-	0.0	1.829	4	0.7671
4 : 74483739 : SNP	t	g	0.7893	0.0092	0.7805	0.8003	0.0204	0.0106	0.05405	+++++	0.0	1.162	4	0.8843
2 : 113701807 : SNP	c	g	0.4625	0.0161	0.4275	0.4819	-0.0050	0.0085	0.5541	--+--	42.0	6.893	4	0.1416
11 : 60372678 : SNP	a	c	0.1037	0.0089	0.0946	0.1173	0.0027	0.0156	0.8622	-+-+-	30.7	5.772	4	0.2169
2 : 214581880 : SNP	a	t	0.4521	0.0109	0.4371	0.4689	0.0096	0.0091	0.2923	++--+	0.0	3.009	4	0.5563
3 : 29779962 : SNP	a	t	0.9629	0.0062	0.9506	0.9661	-0.0238	0.0242	0.3251	--??+	0.0	1.991	2	0.3696
16 : 13998475 : SNP	c	g	0.0621	0.0015	0.0601	0.0645	0.0256	0.0203	0.2085	-+?++	0.0	1.875	3	0.5987
11 : 29712729 : INDEL	d	r	0.0301	0.0007	0.0292	0.0306	0.0221	0.0278	0.425	++???	0.0	0.302	1	0.5828
10 : 26818574 : SNP	t	c	0.1646	0.0102	0.1320	0.1760	-0.0048	0.0115	0.6777	--++-	0.0	2.169	4	0.7047
15 : 47192181 : SNP	t	g	0.9108	0.0095	0.9030	0.9370	-0.0148	0.0152	0.3307	-----	0.0	2.781	4	0.5951
12 : 16198088 : SNP	a	c	0.6115	0.0315	0.5452	0.6280	-0.0088	0.0091	0.3299	--+-+	43.1	7.032	4	0.1342
3 : 152224083 : SNP	a	g	0.0215	0.0000	0.0215	0.0215	0.0260	0.0445	0.5588	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 221485125 : SNP	a	g	0.9857	0.0000	0.9857	0.9857	0.0220	0.0516	0.6696	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 105644898 : SNP	a	g	0.2047	0.0196	0.1787	0.2329	-0.0156	0.0106	0.1413	--++-	0.0	2.537	4	0.6381
2 : 240900691 : SNP	c	g	0.8435	0.0050	0.8285	0.8507	-0.0181	0.0119	0.128	-----	0.0	0.063	4	0.9995
3 : 137004802 : SNP	c	g	0.1298	0.0053	0.1216	0.1371	0.0062	0.0126	0.6208	+--++	0.0	2.227	4	0.6942
6 : 47349167 : SNP	a	g	0.6717	0.0095	0.6524	0.6844	0.0082	0.0091	0.3677	+--++	0.0	3.013	4	0.5556
5 : 18823641 : SNP	a	g	0.8933	0.0057	0.8752	0.8998	0.0045	0.0140	0.7492	+--++	0.0	3.711	4	0.4465
5 : 55251510 : INDEL	i	r	0.1358	0.0060	0.1283	0.1486	-0.0120	0.0126	0.3424	-----	0.0	1.840	4	0.7651
3 : 171605843 : SNP	a	g	0.0522	0.0013	0.0505	0.0532	-0.0009	0.0244	0.9718	-+???	0.0	0.026	1	0.873
2 : 200943696 : SNP	t	c	0.0286	0.0005	0.0282	0.0293	0.0188	0.0309	0.5432	+-???	55.5	2.249	1	0.1337
1 : 67136365 : SNP	c	g	0.9063	0.0105	0.8963	0.9328	-0.0301	0.0153	0.0483	--?-+	52.1	6.270	3	0.09921
11 : 43013511 : SNP	t	g	0.8373	0.0117	0.8201	0.8628	0.0080	0.0120	0.5055	+-+++	0.0	2.117	4	0.7143
10 : 790012 : SNP	t	c	0.8477	0.0074	0.8378	0.8649	-0.0270	0.0132	0.04061	-----	0.0	1.438	4	0.8375
15 : 74806437 : SNP	a	g	0.1233	0.0061	0.1077	0.1354	-0.0088	0.0130	0.5011	+--+-	0.0	3.183	4	0.5278
8 : 82518120 : INDEL	i	r	0.1454	0.0036	0.1328	0.1475	-0.0014	0.0122	0.9065	-+---	0.0	0.857	4	0.9307
2 : 108188637 : SNP	t	g	0.9609	0.0085	0.9418	0.9671	0.0267	0.0231	0.2486	+-?++	30.0	4.286	3	0.2322
4 : 160402239 : SNP	t	c	0.2890	0.0116	0.2717	0.3070	-0.0043	0.0093	0.6427	--++-	0.0	0.071	4	0.9994
1 : 246275162 : SNP	c	g	0.0986	0.0093	0.0859	0.1143	-0.0033	0.0144	0.8204	+++--	0.0	2.955	4	0.5655
3 : 116326293 : SNP	a	c	0.4908	0.0268	0.4267	0.5283	0.0006	0.0086	0.9424	-++-+	35.7	6.219	4	0.1834
21 : 46685592 : SNP	c	g	0.4039	0.0185	0.3857	0.4404	0.0065	0.0110	0.5535	-++++	0.0	1.377	4	0.8482
12 : 61339092 : SNP	t	c	0.4421	0.0024	0.4311	0.4431	0.0137	0.0086	0.1084	++---	0.0	3.456	4	0.4846
3 : 166855509 : INDEL	d	r	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	-0.0160	0.0455	0.725	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 13148653 : SNP	a	t	0.8572	0.0050	0.8488	0.8641	-0.0034	0.0124	0.7839	---+-	0.0	1.043	4	0.9032
10 : 21443345 : SNP	a	g	0.1423	0.0128	0.1062	0.1531	-0.0083	0.0123	0.5017	-+-+-	33.4	6.002	4	0.199
13 : 83484832 : SNP	a	g	0.8944	0.0046	0.8912	0.9087	0.0066	0.0141	0.6385	--+++	11.4	4.515	4	0.3407
4 : 40371256 : SNP	a	g	0.8475	0.0055	0.8343	0.8512	0.0010	0.0121	0.9363	+-++-	0.0	2.516	4	0.6419
1 : 172511171 : SNP	t	c	0.2413	0.0100	0.2333	0.2616	-0.0093	0.0099	0.3505	+----	0.0	2.656	4	0.617
2 : 163858149 : SNP	a	g	0.7541	0.0147	0.7154	0.7766	0.0008	0.0099	0.9339	-++--	69.9	13.300	4	0.009897
1 : 93820588 : SNP	a	g	0.1809	0.0083	0.1656	0.1924	-0.0055	0.0114	0.6267	--+++	43.3	7.056	4	0.133
3 : 10783125 : SNP	t	c	0.9520	0.0040	0.9492	0.9576	-0.0154	0.0239	0.5198	--???	0.0	0.006	1	0.9368
3 : 162822452 : SNP	t	c	0.1511	0.0081	0.1306	0.1604	0.0034	0.0120	0.7739	+-++-	0.0	1.526	4	0.822
4 : 58097310 : SNP	t	c	0.0643	0.0052	0.0518	0.0694	-0.0056	0.0188	0.7657	--??+	0.0	1.018	2	0.601
6 : 21013682 : SNP	t	c	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	0.0700	0.0536	0.1914	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 73190893 : SNP	t	c	0.8917	0.0162	0.8751	0.9184	0.0155	0.0201	0.4424	+-?++	28.0	4.166	3	0.2441
19 : 54217642 : SNP	a	g	0.1011	0.0089	0.0840	0.1058	-0.0080	0.0419	0.8481	???--	0.0	0.125	1	0.7239
2 : 211536523 : SNP	t	c	0.0386	0.0044	0.0348	0.0436	0.0234	0.0268	0.3826	++???	0.0	0.077	1	0.7819
16 : 47873163 : SNP	a	g	0.0467	0.0000	0.0467	0.0467	0.0240	0.0435	0.5809	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 122665055 : SNP	t	c	0.2725	0.0076	0.2495	0.2767	0.0205	0.0098	0.0361	++-++	0.0	0.746	4	0.9455
13 : 111411343 : SNP	a	g	0.6932	0.0072	0.6804	0.7037	0.0137	0.0092	0.1358	++++-	34.6	6.119	4	0.1904
3 : 169263506 : SNP	t	c	0.8435	0.0045	0.8387	0.8524	-0.0128	0.0119	0.282	+--+-	57.6	9.427	4	0.05128
8 : 51830867 : SNP	a	c	0.7543	0.0024	0.7504	0.7580	-0.0076	0.0098	0.4402	0----	0.0	1.454	4	0.8347
9 : 101931600 : SNP	a	g	0.2524	0.0088	0.2436	0.2831	-0.0077	0.0099	0.4383	--++-	0.0	2.525	4	0.6402
12 : 12162337 : INDEL	d	r	0.0526	0.0056	0.0440	0.0593	0.0066	0.0195	0.7347	+-?+-	15.5	3.552	3	0.3141
8 : 104702683 : SNP	a	g	0.8361	0.0127	0.8117	0.8654	0.0155	0.0114	0.176	++--+	0.0	2.437	4	0.656
2 : 76348441 : SNP	t	g	0.3689	0.0172	0.3314	0.3804	-0.0079	0.0091	0.3849	-+-+-	0.0	2.150	4	0.7083
4 : 80654572 : SNP	a	g	0.6068	0.0116	0.5746	0.6170	-0.0032	0.0087	0.7116	-+++-	13.7	4.636	4	0.3267
4 : 13149468 : INDEL	i	r	0.2540	0.0199	0.2140	0.2852	-0.0183	0.0116	0.1147	--++-	0.0	3.045	4	0.5503
4 : 69606897 : SNP	t	g	0.1040	0.0080	0.0889	0.1083	0.0220	0.0327	0.5	???+-	54.3	2.189	1	0.139
4 : 75176211 : SNP	t	c	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	-0.0940	0.0586	0.1089	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 37121839 : SNP	a	t	0.9821	0.0000	0.9821	0.9821	-0.0010	0.0455	0.9825	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 190771253 : SNP	a	g	0.5669	0.0123	0.5491	0.5839	0.0082	0.0085	0.3375	+++-+	42.2	6.921	4	0.1401
5 : 128623849 : SNP	t	c	0.8942	0.0100	0.8728	0.9078	0.0114	0.0147	0.4393	--?++	49.0	5.885	3	0.1173
11 : 86957784 : SNP	t	g	0.9689	0.0018	0.9670	0.9705	-0.0217	0.0308	0.4817	--???	0.0	0.319	1	0.572
6 : 112547433 : SNP	t	c	0.9622	0.0111	0.9420	0.9705	0.0064	0.0251	0.7975	-+?-+	0.0	1.176	3	0.7588
8 : 17090513 : SNP	a	g	0.8656	0.0116	0.8449	0.8752	0.0065	0.0124	0.6022	++++-	0.0	2.773	4	0.5965
14 : 83924263 : SNP	a	g	0.5614	0.0098	0.5567	0.5874	-0.0000	0.0085	0.9968	0--++	0.0	1.597	4	0.8093
15 : 54991362 : SNP	a	c	0.0411	0.0002	0.0409	0.0413	0.0115	0.0247	0.6412	++???	0.0	0.242	1	0.6229
3 : 107265642 : SNP	a	g	0.6552	0.0035	0.6511	0.6654	-0.0032	0.0092	0.7286	+--+-	0.0	1.783	4	0.7755
2 : 109797663 : SNP	t	c	0.8194	0.0094	0.7999	0.8323	-0.0010	0.0112	0.9316	-++-+	0.0	1.388	4	0.8463
11 : 12311730 : SNP	a	g	0.9834	0.0000	0.9834	0.9834	-0.0690	0.0505	0.1722	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 122776260 : SNP	a	g	0.1700	0.0036	0.1537	0.1766	0.0300	0.0115	0.008811	++-++	0.0	1.199	4	0.8782
17 : 28676023 : SNP	a	t	0.9620	0.0016	0.9586	0.9631	-0.0142	0.0232	0.5411	-+??-	0.0	0.279	2	0.8697
4 : 136422205 : SNP	t	c	0.7987	0.0091	0.7848	0.8067	0.0003	0.0106	0.9749	++-+-	15.3	4.723	4	0.3169
2 : 219902653 : SNP	t	c	0.9601	0.0044	0.9550	0.9668	-0.0016	0.0247	0.9484	+-??-	0.0	0.428	2	0.8072
3 : 51349887 : SNP	a	c	0.0258	0.0065	0.0188	0.0355	-0.0091	0.0288	0.7515	--??+	0.0	1.152	2	0.5621
7 : 12205417 : SNP	a	g	0.4488	0.0101	0.4275	0.4748	-0.0051	0.0085	0.548	--+--	0.0	3.658	4	0.4542
4 : 34677320 : SNP	a	g	0.9605	0.0013	0.9585	0.9614	-0.0092	0.0243	0.7045	-+??-	0.0	1.586	2	0.4525
4 : 18281140 : SNP	c	g	0.3026	0.0078	0.2895	0.3304	-0.0019	0.0092	0.8338	-+--+	3.0	4.122	4	0.3897
10 : 18254655 : SNP	t	c	0.2073	0.0059	0.1856	0.2160	-0.0041	0.0107	0.7021	--+++	27.0	5.481	4	0.2414
8 : 3670179 : SNP	c	g	0.0155	0.0000	0.0155	0.0155	0.0000	0.0526	1	0????	0.0	0.000	0	1
3 : 66658562 : SNP	t	c	0.3225	0.0120	0.2767	0.3285	0.0049	0.0092	0.5954	+-+--	3.0	4.123	4	0.3896
13 : 109531809 : SNP	t	c	0.1237	0.0047	0.1191	0.1314	-0.0127	0.0131	0.3339	--+-+	35.2	6.177	4	0.1863
1 : 188339640 : SNP	c	g	0.9572	0.0004	0.9567	0.9575	-0.0123	0.0244	0.6132	+-???	74.0	3.841	1	0.05
5 : 125815602 : SNP	a	g	0.6011	0.0205	0.5809	0.6495	0.0018	0.0090	0.8424	+++--	0.0	0.451	4	0.9781
6 : 44538961 : SNP	a	g	0.9628	0.0080	0.9473	0.9677	0.0057	0.0241	0.8115	++??-	77.8	9.025	2	0.01097
11 : 108297190 : SNP	a	g	0.1381	0.0167	0.1260	0.1746	-0.0037	0.0128	0.7753	+--++	0.0	2.052	4	0.7262
6 : 104535468 : INDEL	d	r	0.4602	0.0127	0.4304	0.4671	-0.0034	0.0085	0.692	-+++-	0.0	2.016	4	0.7328
10 : 113650677 : SNP	t	c	0.6985	0.0063	0.6850	0.7057	0.0054	0.0093	0.5598	+++--	30.9	5.791	4	0.2153
4 : 150125471 : SNP	t	c	0.5059	0.0065	0.4973	0.5230	0.0086	0.0085	0.3122	+++--	10.2	4.456	4	0.3478
11 : 71926242 : SNP	a	g	0.9723	0.0016	0.9703	0.9736	0.0277	0.0312	0.3743	+-???	0.0	0.891	1	0.3452
20 : 37552926 : SNP	t	c	0.0223	0.0000	0.0223	0.0223	0.0040	0.0586	0.9456	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 111287157 : SNP	t	c	0.5619	0.0290	0.5043	0.5930	-0.0071	0.0090	0.4324	-+---	56.3	9.155	4	0.05735
20 : 1348873 : SNP	t	g	0.0339	0.0000	0.0339	0.0339	0.0210	0.0485	0.6652	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 103728606 : SNP	a	g	0.9436	0.0007	0.9428	0.9442	0.0217	0.0193	0.2604	++?+-	0.0	0.577	3	0.9018
10 : 26654840 : SNP	a	c	0.5417	0.0112	0.5253	0.5570	0.0023	0.0085	0.7887	+--++	13.8	4.641	4	0.3261
4 : 70120657 : SNP	t	c	0.4613	0.0330	0.3940	0.4842	-0.0020	0.0089	0.8196	--+++	0.5	4.021	4	0.4032
10 : 106071001 : SNP	a	g	0.6933	0.0085	0.6713	0.7056	0.0054	0.0092	0.5573	++-++	0.0	0.591	4	0.964
11 : 87490227 : SNP	t	c	0.9510	0.0115	0.9312	0.9592	-0.0066	0.0213	0.755	-+?--	0.0	2.963	3	0.3973
5 : 74267134 : SNP	a	g	0.2673	0.0098	0.2422	0.2783	0.0106	0.0098	0.2802	-++-+	3.7	4.155	4	0.3854
2 : 129378543 : SNP	a	c	0.9600	0.0005	0.9597	0.9609	-0.0248	0.0299	0.4068	-???-	39.3	1.647	1	0.1994
19 : 33943081 : SNP	a	c	0.7986	0.0205	0.7505	0.8157	0.0161	0.0105	0.125	+++-+	23.0	5.193	4	0.2681
12 : 26828407 : SNP	t	c	0.1921	0.0091	0.1788	0.2178	-0.0269	0.0107	0.01188	--++-	63.8	11.061	4	0.02589
9 : 83187240 : SNP	a	g	0.0747	0.0061	0.0597	0.0787	0.0200	0.0174	0.251	++??+	0.0	0.510	2	0.7749
3 : 162773559 : SNP	a	c	0.1157	0.0189	0.0947	0.1620	-0.0254	0.0135	0.05957	-----	0.0	0.557	4	0.9678
2 : 10044951 : SNP	a	g	0.7498	0.0128	0.7436	0.7914	0.0021	0.0099	0.831	+----	0.0	2.696	4	0.6098
2 : 141842483 : SNP	a	g	0.8436	0.0100	0.8346	0.8683	-0.0285	0.0122	0.01929	---+-	0.0	2.249	4	0.6901
18 : 57474571 : SNP	a	c	0.1096	0.0076	0.1018	0.1260	-0.0023	0.0137	0.8641	++--+	0.3	4.013	4	0.4043
3 : 82547468 : SNP	c	g	0.8814	0.0093	0.8686	0.9020	0.0031	0.0134	0.8173	-++--	0.0	3.642	4	0.4566
9 : 657340 : SNP	a	g	0.5204	0.0099	0.5022	0.5349	0.0172	0.0085	0.04318	++-++	0.0	1.927	4	0.7493
4 : 29739038 : SNP	a	t	0.5018	0.0190	0.4731	0.5554	-0.0066	0.0086	0.4433	----+	34.6	6.112	4	0.1909
9 : 88847177 : SNP	t	c	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	-0.0300	0.0505	0.5528	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 6816689 : SNP	a	g	0.0325	0.0013	0.0307	0.0335	-0.0157	0.0275	0.5693	-+???	0.0	0.884	1	0.3472
20 : 29558463 : SNP	t	c	0.7159	0.0127	0.6841	0.7309	-0.0338	0.0209	0.1051	??---	0.0	1.763	2	0.4141
16 : 7012874 : SNP	a	t	0.3851	0.0106	0.3735	0.4114	0.0072	0.0091	0.4311	+0+-+	0.0	3.137	4	0.5352
2 : 37862743 : SNP	c	g	0.9507	0.0032	0.9463	0.9544	0.0149	0.0219	0.4974	++??-	0.0	0.806	2	0.6682
11 : 66661515 : SNP	a	g	0.0215	0.0000	0.0215	0.0215	-0.0510	0.0414	0.2185	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 37274522 : SNP	t	c	0.1121	0.0153	0.0686	0.1261	-0.0041	0.0137	0.7667	-+--+	0.0	1.468	4	0.8322
2 : 59560128 : SNP	t	c	0.9835	0.0000	0.9835	0.9835	-0.0280	0.0485	0.5639	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 28040545 : SNP	a	g	0.9585	0.0032	0.9561	0.9627	-0.0107	0.0251	0.6699	-+???	0.0	0.582	1	0.4455
11 : 58015531 : SNP	a	g	0.4017	0.0116	0.3651	0.4256	0.0014	0.0086	0.8713	+-+-+	62.3	10.605	4	0.03138
7 : 68248266 : SNP	t	c	0.5664	0.0155	0.5535	0.5944	0.0124	0.0091	0.1733	++-++	35.7	6.219	4	0.1834
4 : 134255466 : SNP	a	g	0.0107	0.0000	0.0107	0.0107	0.0180	0.0607	0.7666	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 37635591 : SNP	t	c	0.3698	0.0062	0.3653	0.3881	0.0028	0.0091	0.7571	-++-+	0.0	1.106	4	0.8933
9 : 38653926 : SNP	a	c	0.8047	0.0060	0.7917	0.8157	0.0200	0.0110	0.06949	+-+++	0.0	3.810	4	0.4324
11 : 103232761 : SNP	a	g	0.6655	0.0064	0.6544	0.6828	-0.0022	0.0091	0.8125	+---+	0.0	2.966	4	0.5636
3 : 60781395 : SNP	a	g	0.0684	0.0065	0.0640	0.0821	0.0097	0.0180	0.5894	++?--	0.0	2.906	3	0.4064
8 : 10422973 : SNP	a	t	0.1771	0.0072	0.1614	0.1900	0.0120	0.0113	0.288	-++-+	0.3	4.012	4	0.4043
1 : 77220314 : SNP	c	g	0.1105	0.0153	0.0996	0.1397	0.0077	0.0142	0.5887	+-+--	0.0	3.027	4	0.5534
15 : 47059692 : SNP	a	g	0.9077	0.0064	0.8996	0.9232	-0.0108	0.0152	0.4786	+---+	27.5	5.517	4	0.2382
5 : 158539430 : SNP	t	c	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	-0.0850	0.0546	0.1194	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 15551156 : SNP	c	g	0.2168	0.0166	0.1951	0.2477	-0.0187	0.0107	0.0786	--++-	0.0	1.244	4	0.8707
15 : 24187530 : SNP	t	c	0.4039	0.0128	0.3719	0.4286	0.0018	0.0091	0.8411	+--++	62.8	10.760	4	0.0294
11 : 132960066 : SNP	a	g	0.9488	0.0011	0.9477	0.9514	-0.0277	0.0211	0.189	--??-	0.0	1.924	2	0.3821
3 : 139173565 : SNP	a	g	0.8538	0.0170	0.8059	0.8701	0.0053	0.0120	0.6577	++-+-	4.3	4.181	4	0.3821
20 : 55007957 : SNP	c	g	0.7854	0.0066	0.7676	0.7894	-0.0096	0.0119	0.4205	+----	0.0	1.470	4	0.8319
11 : 4543586 : SNP	c	g	0.6386	0.0125	0.6051	0.6505	0.0002	0.0091	0.9855	-++-+	0.0	2.905	4	0.5738
6 : 117385806 : SNP	a	t	0.0385	0.0001	0.0383	0.0386	-0.0226	0.0266	0.3966	-+???	32.3	1.478	1	0.2241
14 : 96430457 : SNP	a	c	0.0846	0.0253	0.0650	0.1265	-0.0210	0.0177	0.2365	--?-+	56.3	6.873	3	0.07607
18 : 45743612 : SNP	a	g	0.0905	0.0059	0.0825	0.1083	-0.0203	0.0152	0.182	---++	0.0	2.622	4	0.6229
4 : 141587240 : SNP	a	g	0.1590	0.0109	0.1323	0.1656	0.0130	0.0122	0.2861	++++-	0.0	0.890	4	0.926
7 : 6146482 : SNP	t	c	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	-0.1270	0.0556	0.02236	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 74202524 : SNP	a	g	0.2922	0.0245	0.2751	0.3490	0.0091	0.0096	0.3446	+0+++	0.0	0.627	4	0.96
10 : 19469449 : SNP	t	c	0.1980	0.0111	0.1633	0.2182	-0.0064	0.0107	0.5503	----+	0.0	3.014	4	0.5554
7 : 55196572 : SNP	a	t	0.9374	0.0078	0.9162	0.9449	0.0136	0.0183	0.4582	++?+-	0.6	3.019	3	0.3887
17 : 524297 : SNP	t	c	0.1125	0.0195	0.0981	0.1484	0.0033	0.0137	0.8122	+--+-	73.2	14.911	4	0.00489
17 : 75388812 : SNP	t	g	0.2242	0.0034	0.2097	0.2277	-0.0119	0.0100	0.2345	-++--	0.0	3.973	4	0.4096
16 : 67212812 : INDEL	i	r	0.0694	0.0029	0.0593	0.0744	-0.0037	0.0172	0.8296	-+?+-	26.7	4.094	3	0.2515
6 : 32445600 : SNP	a	g	0.3271	0.0129	0.3043	0.3363	-0.0356	0.0193	0.06501	??---	0.0	0.954	2	0.6207
7 : 17668495 : SNP	t	g	0.8760	0.0091	0.8569	0.8833	0.0010	0.0131	0.9385	+--+-	0.0	2.541	4	0.6373
10 : 6124080 : SNP	a	g	0.9509	0.0008	0.9503	0.9519	0.0108	0.0222	0.6275	+-???	0.0	0.591	1	0.4418
13 : 22814004 : SNP	c	g	0.0499	0.0059	0.0435	0.0564	0.0505	0.0248	0.04154	++??+	17.3	2.418	2	0.2985
8 : 3197447 : SNP	a	c	0.2596	0.0125	0.2112	0.2652	0.0161	0.0099	0.1051	+++-+	18.2	4.890	4	0.2987
1 : 15444899 : SNP	c	g	0.8266	0.0045	0.8218	0.8389	0.0211	0.0112	0.05956	+++++	0.0	3.221	4	0.5215
13 : 99048693 : INDEL	d	r	0.8448	0.0039	0.8382	0.8560	-0.0219	0.0126	0.08303	-----	0.0	1.815	4	0.7697
13 : 23880410 : SNP	a	t	0.0934	0.0038	0.0892	0.0995	-0.0065	0.0155	0.6741	--+--	0.0	0.395	4	0.9829
8 : 103112888 : SNP	t	c	0.5523	0.0080	0.5399	0.5742	-0.0027	0.0085	0.7509	--+++	0.0	2.957	4	0.5651
5 : 144432267 : SNP	c	g	0.0252	0.0000	0.0252	0.0252	-0.0840	0.0404	0.03776	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 14446074 : SNP	a	t	0.1712	0.0110	0.1443	0.1769	0.0005	0.0114	0.9637	--+++	26.9	5.474	4	0.242
14 : 59947733 : SNP	a	g	0.9453	0.0043	0.9403	0.9495	0.0163	0.0196	0.4051	-+??+	37.5	3.201	2	0.2018
11 : 29822846 : SNP	a	c	0.0982	0.0087	0.0748	0.1173	0.0058	0.0143	0.6839	-++-+	41.0	6.781	4	0.1479
2 : 66911948 : SNP	a	c	0.4536	0.0216	0.4335	0.4947	0.0025	0.0085	0.7667	+++--	38.8	6.536	4	0.1625
2 : 212541377 : SNP	t	c	0.7106	0.0273	0.6522	0.7294	-0.0044	0.0093	0.6351	+----	0.0	2.264	4	0.6874
18 : 65934636 : SNP	a	g	0.6609	0.0082	0.6458	0.6691	0.0118	0.0091	0.1944	++-+-	44.5	7.207	4	0.1253
3 : 41083660 : SNP	t	c	0.0154	0.0000	0.0154	0.0154	0.0170	0.0495	0.7314	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 45410990 : SNP	t	c	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	0.0490	0.0516	0.3419	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 189279348 : SNP	t	c	0.8785	0.0028	0.8741	0.8840	0.0132	0.0130	0.31	++-+-	18.0	4.878	4	0.3001
8 : 75938619 : SNP	c	g	0.7015	0.0160	0.6532	0.7300	-0.0082	0.0092	0.3767	+--+-	33.7	6.036	4	0.1965
17 : 50579218 : SNP	a	t	0.9568	0.0035	0.9534	0.9648	0.0059	0.0220	0.7892	+-??+	0.0	1.598	2	0.4499
20 : 48706395 : SNP	c	g	0.2202	0.0050	0.2072	0.2304	0.0098	0.0104	0.3461	+-+-+	0.0	1.103	4	0.8938
1 : 64140382 : SNP	c	g	0.1212	0.0081	0.0995	0.1275	0.0058	0.0130	0.6532	+-++-	2.3	4.092	4	0.3937
5 : 125354938 : SNP	a	c	0.3740	0.0087	0.3565	0.3938	0.0032	0.0089	0.7179	+----	62.6	10.687	4	0.03032
12 : 3550279 : SNP	a	t	0.2548	0.0216	0.2140	0.2969	-0.0074	0.0130	0.5703	--+++	9.0	4.393	4	0.3554
3 : 194269323 : SNP	a	t	0.8945	0.0145	0.8830	0.9364	-0.0089	0.0154	0.5651	--?+-	0.0	1.524	3	0.6767
4 : 6806678 : INDEL	i	r	0.0973	0.0059	0.0914	0.1059	-0.0056	0.0171	0.7416	+-?-+	33.3	4.499	3	0.2124
5 : 64905544 : SNP	a	g	0.2455	0.0108	0.2117	0.2511	-0.0079	0.0099	0.4224	-+--+	0.0	3.869	4	0.424
19 : 10210513 : INDEL	d	r	0.1960	0.0172	0.1718	0.2126	0.0114	0.0157	0.4678	+-+++	0.0	0.858	4	0.9305
7 : 71621875 : SNP	t	c	0.0195	0.0000	0.0195	0.0195	-0.0240	0.0495	0.628	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 12973707 : SNP	c	g	0.9496	0.0067	0.9366	0.9565	-0.0271	0.0203	0.1828	--?--	0.0	0.200	3	0.9775
1 : 227095437 : SNP	t	g	0.9801	0.0000	0.9801	0.9801	0.0410	0.0455	0.3674	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 19788402 : SNP	a	g	0.6852	0.0175	0.6753	0.7282	0.0065	0.0092	0.4822	++++-	13.5	4.627	4	0.3278
4 : 75148721 : INDEL	i	r	0.2221	0.0084	0.2170	0.2479	0.0100	0.0103	0.3339	+-+-+	0.0	1.319	4	0.8582
4 : 171807110 : SNP	t	g	0.9689	0.0066	0.9565	0.9735	0.0074	0.0262	0.7789	--??+	38.6	3.260	2	0.196
2 : 228371792 : SNP	a	g	0.3821	0.0096	0.3461	0.3915	-0.0002	0.0089	0.9849	++-+-	12.7	4.583	4	0.3329
13 : 111527197 : INDEL	i	r	0.1137	0.0132	0.0984	0.1392	-0.0177	0.0141	0.2078	--++-	0.0	1.316	4	0.8586
11 : 38298609 : SNP	a	c	0.9661	0.0000	0.9661	0.9661	-0.0250	0.0334	0.4536	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 119162987 : SNP	a	c	0.9617	0.0073	0.9504	0.9721	0.0017	0.0239	0.9425	+-??+	0.0	0.597	2	0.7418
6 : 3931034 : SNP	t	c	0.9482	0.0089	0.9272	0.9553	-0.0190	0.0215	0.3772	--?+-	0.0	0.965	3	0.8098
14 : 41032400 : SNP	a	t	0.7299	0.0082	0.7223	0.7558	0.0038	0.0098	0.7	+++--	52.9	8.498	4	0.07495
18 : 2404344 : SNP	t	c	0.1532	0.0074	0.1404	0.1622	0.0117	0.0126	0.354	+-+-+	33.4	6.009	4	0.1985
17 : 1406564 : SNP	a	g	0.0637	0.0059	0.0591	0.0744	0.0000	0.0334	0.9996	+??+-	78.8	9.440	2	0.008915
12 : 68005294 : SNP	a	g	0.9439	0.0052	0.9323	0.9479	-0.0137	0.0196	0.4871	+-?--	33.9	4.537	3	0.209
19 : 52215974 : SNP	a	g	0.0816	0.0092	0.0691	0.1000	0.0305	0.0286	0.2872	+??++	0.0	0.581	2	0.7479
4 : 41879173 : SNP	a	g	0.9545	0.0027	0.9487	0.9563	-0.0214	0.0222	0.3364	--??+	0.0	0.548	2	0.7603
6 : 69821600 : SNP	c	g	0.9378	0.0076	0.9108	0.9418	0.0054	0.0184	0.768	++?+-	0.0	1.191	3	0.7552
11 : 5132951 : SNP	t	c	0.6347	0.0165	0.6175	0.6890	0.0091	0.0092	0.3195	++-++	0.0	1.118	4	0.8915
3 : 19116958 : SNP	a	g	0.8436	0.0106	0.8224	0.8493	0.0021	0.0119	0.8588	-+--+	0.0	3.999	4	0.4062
13 : 81052788 : SNP	a	g	0.0604	0.0060	0.0539	0.0659	0.0151	0.0298	0.6129	-+???	73.4	3.765	1	0.05233
1 : 5700007 : SNP	c	g	0.8476	0.0154	0.8352	0.8890	0.0038	0.0120	0.7536	+--+-	0.0	3.891	4	0.421
20 : 3043700 : SNP	a	g	0.6439	0.0110	0.6198	0.6628	0.0042	0.0109	0.7027	-++++	0.0	2.840	4	0.585
11 : 87860095 : SNP	a	g	0.7658	0.0173	0.7176	0.7785	-0.0126	0.0100	0.2076	--++-	0.0	2.389	4	0.6647
4 : 175838816 : SNP	a	g	0.5481	0.0094	0.5261	0.5570	0.0113	0.0088	0.2011	++-++	0.0	2.833	4	0.5861
2 : 116247326 : SNP	a	g	0.7084	0.0060	0.6996	0.7163	0.0037	0.0092	0.6837	++-+-	13.1	4.606	4	0.3302
6 : 94841667 : SNP	t	c	0.8254	0.0187	0.8125	0.8680	0.0065	0.0113	0.5665	+-+-+	23.0	5.193	4	0.2681
9 : 128839349 : SNP	t	c	0.9897	0.0000	0.9897	0.9897	0.0310	0.0596	0.6032	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 71355058 : SNP	a	g	0.1017	0.0191	0.0859	0.1463	0.0009	0.0148	0.9512	-+++-	0.0	1.275	4	0.8657
1 : 169723742 : SNP	a	g	0.9089	0.0063	0.8962	0.9143	-0.0088	0.0153	0.5684	---++	0.0	0.534	4	0.9701
11 : 16243932 : SNP	a	t	0.2594	0.0154	0.2199	0.2705	0.0019	0.0099	0.8496	+++--	0.0	1.837	4	0.7657
8 : 67812155 : SNP	a	g	0.0489	0.0000	0.0489	0.0489	0.0160	0.0404	0.6923	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 22056434 : SNP	a	g	0.2046	0.0173	0.1892	0.2395	-0.0132	0.0107	0.2186	+----	9.2	4.405	4	0.354
12 : 131609373 : SNP	a	g	0.1923	0.0065	0.1690	0.2066	0.0059	0.0113	0.5983	+-+++	12.4	4.565	4	0.335
2 : 58755062 : INDEL	i	r	0.9640	0.0005	0.9636	0.9647	0.0081	0.0280	0.7732	-+???	36.3	1.570	1	0.2103
4 : 170626300 : SNP	t	g	0.0290	0.0000	0.0290	0.0290	-0.0390	0.0364	0.2839	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 72921381 : SNP	a	g	0.5773	0.0057	0.5602	0.5938	-0.0063	0.0089	0.4747	-+-+-	0.0	3.274	4	0.5131
6 : 157376672 : SNP	a	g	0.2124	0.0170	0.2014	0.2590	-0.0036	0.0107	0.7324	-++-+	0.0	3.096	4	0.5418
14 : 41374305 : SNP	a	g	0.8831	0.0077	0.8777	0.9007	-0.0074	0.0135	0.5831	-+-+-	0.0	1.932	4	0.7483
3 : 101615010 : SNP	t	c	0.7867	0.0089	0.7776	0.8060	-0.0087	0.0106	0.4115	+-+--	28.7	5.607	4	0.2305
21 : 21347879 : SNP	t	g	0.1514	0.0082	0.1369	0.1617	-0.0018	0.0119	0.8808	++---	0.0	3.765	4	0.4387
22 : 37995831 : SNP	t	c	0.5592	0.0243	0.5380	0.6166	-0.0037	0.0086	0.6695	+-+-+	0.0	1.593	4	0.8101
6 : 55378532 : SNP	a	c	0.0279	0.0023	0.0267	0.0328	0.0026	0.0275	0.9245	++??-	65.0	5.707	2	0.05765
9 : 36816714 : SNP	t	g	0.3386	0.0136	0.3123	0.3754	0.0070	0.0092	0.4456	-++++	7.1	4.306	4	0.3661
10 : 55216633 : SNP	a	g	0.5326	0.0046	0.5231	0.5488	-0.0010	0.0086	0.91	+--+-	22.8	5.184	4	0.269
17 : 64959012 : INDEL	d	r	0.1305	0.0164	0.1048	0.1528	0.0024	0.0170	0.8892	-+?+-	0.0	1.483	3	0.6862
5 : 2629200 : SNP	a	g	0.0741	0.0000	0.0741	0.0741	-0.0039	0.0583	0.9467	????-	0.0	0.000	0	1
8 : 79798666 : SNP	a	g	0.5821	0.0311	0.5140	0.5976	0.0122	0.0085	0.151	++-++	54.7	8.838	4	0.06527
5 : 171210621 : INDEL	d	r	0.1143	0.0050	0.0970	0.1166	0.0033	0.0130	0.7986	+-++-	37.7	6.422	4	0.1698
19 : 58012078 : SNP	t	g	0.1984	0.0164	0.1878	0.2311	-0.0002	0.0112	0.9879	-+--+	0.0	3.952	4	0.4125
7 : 158724789 : SNP	c	g	0.7069	0.0066	0.6757	0.7103	-0.0178	0.0094	0.05784	--+--	0.0	0.985	4	0.9121
13 : 101116949 : SNP	a	g	0.7797	0.0081	0.7530	0.8009	-0.0061	0.0107	0.5683	---++	0.0	1.401	4	0.844
8 : 51164492 : SNP	a	c	0.3018	0.0212	0.2543	0.3463	-0.0045	0.0093	0.6241	-+-+-	0.0	3.918	4	0.4172
8 : 120790858 : SNP	c	g	0.4327	0.0211	0.3753	0.4770	0.0034	0.0085	0.6882	-++--	0.0	2.262	4	0.6878
5 : 149518505 : SNP	t	c	0.0593	0.0029	0.0531	0.0616	0.0018	0.0191	0.9269	-+?++	13.5	3.469	3	0.3248
11 : 70496641 : SNP	a	g	0.6788	0.0196	0.6365	0.6970	-0.0117	0.0091	0.1966	+---+	53.2	8.546	4	0.07351
7 : 100784434 : SNP	t	c	0.4304	0.0186	0.3922	0.4593	0.0095	0.0087	0.2752	+++-+	0.0	2.209	4	0.6974
11 : 1273833 : SNP	t	c	0.4891	0.0104	0.4666	0.5002	0.0094	0.0085	0.2671	-+++-	47.6	7.635	4	0.1059
16 : 76397847 : SNP	t	c	0.8983	0.0063	0.8912	0.9189	-0.0247	0.0143	0.0834	----+	40.1	6.679	4	0.1539
3 : 188398642 : SNP	c	g	0.8554	0.0072	0.8491	0.8720	0.0040	0.0126	0.75	++-+-	35.7	6.219	4	0.1834
13 : 59004527 : SNP	a	g	0.0103	0.0000	0.0103	0.0103	-0.0750	0.0617	0.2239	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 117874853 : INDEL	i	r	0.3497	0.0096	0.3367	0.3745	0.0001	0.0092	0.9872	----+	0.0	2.905	4	0.5738
4 : 90130778 : INDEL	d	r	0.0754	0.0000	0.0754	0.0754	-0.0757	0.0603	0.2093	????-	0.0	0.000	0	1
12 : 26491363 : SNP	a	g	0.0111	0.0000	0.0111	0.0111	-0.0210	0.0607	0.7292	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 111481533 : SNP	t	g	0.0645	0.0031	0.0624	0.0755	0.0136	0.0175	0.436	+-?--	5.5	3.176	3	0.3653
4 : 82876319 : SNP	t	c	0.8010	0.0077	0.7817	0.8087	-0.0021	0.0106	0.8431	+---+	58.1	9.543	4	0.04886
3 : 173974845 : SNP	a	g	0.7902	0.0119	0.7461	0.7961	0.0212	0.0106	0.04517	+++++	45.7	7.373	4	0.1175
13 : 94990500 : SNP	a	g	0.0346	0.0039	0.0288	0.0372	-0.0372	0.0268	0.166	--???	0.0	0.454	1	0.5007
14 : 65337839 : SNP	c	g	0.1372	0.0082	0.1176	0.1534	0.0009	0.0126	0.9457	+-+--	0.0	2.083	4	0.7205
5 : 84151445 : SNP	t	c	0.1536	0.0069	0.1478	0.1631	-0.0046	0.0124	0.7133	+--+-	0.0	0.531	4	0.9704
4 : 30028281 : INDEL	d	r	0.0513	0.0025	0.0475	0.0542	-0.0122	0.0203	0.5487	--??+	0.0	1.424	2	0.4907
13 : 24579938 : SNP	a	g	0.9900	0.0000	0.9900	0.9900	-0.0130	0.0617	0.833	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 25683424 : INDEL	i	r	0.1317	0.0161	0.1207	0.1638	-0.0196	0.0137	0.1514	---+-	0.0	2.291	4	0.6823
17 : 13334508 : SNP	c	g	0.1459	0.0200	0.1194	0.1681	0.0086	0.0173	0.6184	++-+-	47.5	7.615	4	0.1067
17 : 51476599 : SNP	a	g	0.1996	0.0147	0.1598	0.2276	0.0028	0.0106	0.7943	-++-+	12.4	4.568	4	0.3345
7 : 110640840 : SNP	t	c	0.5923	0.0118	0.5642	0.5993	-0.0211	0.0085	0.01319	-----	0.0	1.803	4	0.7719
4 : 93353063 : SNP	a	g	0.6883	0.0052	0.6804	0.7088	-0.0038	0.0092	0.6758	0-++-	10.9	4.488	4	0.344
1 : 212003391 : SNP	a	g	0.0115	0.0000	0.0115	0.0115	0.0410	0.0647	0.5263	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 95728622 : SNP	t	g	0.9242	0.0056	0.9170	0.9331	-0.0201	0.0165	0.2226	--?--	0.0	0.125	3	0.9887
3 : 32048276 : SNP	t	c	0.2490	0.0176	0.2220	0.2839	0.0021	0.0099	0.8352	+---+	0.0	1.900	4	0.7542
6 : 32434830 : SNP	t	c	0.2280	0.0136	0.2144	0.2416	0.0613	0.0348	0.07838	??++?	9.8	1.108	1	0.2924
15 : 70666320 : SNP	t	c	0.4826	0.0162	0.4649	0.5081	-0.0142	0.0085	0.09596	-----	0.0	1.618	4	0.8056
13 : 83940739 : SNP	t	c	0.5902	0.0074	0.5596	0.5953	-0.0008	0.0086	0.9293	+-+--	0.0	3.634	4	0.4577
21 : 29450144 : SNP	t	c	0.7442	0.0077	0.7279	0.7523	0.0063	0.0099	0.5254	+++--	42.9	7.001	4	0.1358
19 : 52178063 : SNP	t	g	0.2925	0.0069	0.2630	0.2980	-0.0063	0.0098	0.5217	-+-+-	13.8	4.640	4	0.3263
7 : 44239888 : INDEL	d	r	0.0733	0.0040	0.0714	0.0826	-0.0147	0.0170	0.3871	--?+-	0.0	1.045	3	0.7904
6 : 148172371 : SNP	t	c	0.1400	0.0073	0.1216	0.1446	0.0194	0.0123	0.1137	++-++	0.0	2.707	4	0.608
11 : 25332979 : SNP	t	c	0.7410	0.0046	0.7281	0.7585	0.0024	0.0098	0.8088	++-++	0.0	1.076	4	0.8981
13 : 77498035 : SNP	a	g	0.0103	0.0000	0.0103	0.0103	-0.0490	0.0637	0.4416	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 13720550 : SNP	c	g	0.0708	0.0053	0.0620	0.0756	0.0083	0.0180	0.643	+-?++	0.0	2.493	3	0.4766
2 : 146102263 : SNP	t	c	0.9473	0.0039	0.9438	0.9568	-0.0124	0.0199	0.534	--??+	0.0	1.288	2	0.5252
5 : 41323025 : SNP	a	g	0.9386	0.0088	0.9286	0.9550	0.0131	0.0193	0.4973	-+??+	55.9	4.532	2	0.1037
15 : 25367335 : SNP	t	c	0.9422	0.0051	0.9250	0.9466	-0.0263	0.0196	0.1781	--?+-	60.1	7.522	3	0.057
6 : 159567845 : SNP	t	c	0.6651	0.0184	0.6282	0.6790	0.0001	0.0093	0.9918	-++-+	8.3	4.364	4	0.359
13 : 33559306 : SNP	t	c	0.1424	0.0040	0.1385	0.1502	0.0106	0.0125	0.3971	++---	0.0	2.232	4	0.6932
9 : 14518282 : SNP	a	g	0.2526	0.0108	0.2397	0.2678	-0.0010	0.0099	0.919	-+--+	0.0	3.815	4	0.4316
12 : 27689921 : SNP	t	c	0.8038	0.0086	0.7936	0.8171	0.0058	0.0107	0.5876	++---	6.7	4.289	4	0.3683
6 : 42198235 : SNP	a	t	0.0801	0.0029	0.0741	0.0827	0.0107	0.0167	0.5246	+-?--	34.6	4.589	3	0.2045
15 : 65226441 : SNP	a	g	0.9826	0.0000	0.9826	0.9826	0.0210	0.0475	0.6585	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 14650672 : SNP	t	c	0.9868	0.0000	0.9868	0.9868	0.0630	0.0546	0.2484	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 72645447 : SNP	t	c	0.9013	0.0052	0.8889	0.9107	0.0142	0.0147	0.3356	0+-++	31.5	5.838	4	0.2116
12 : 120554724 : SNP	t	c	0.2179	0.0097	0.2031	0.2337	-0.0135	0.0111	0.2248	--++-	5.3	4.225	4	0.3764
12 : 115669739 : SNP	t	c	0.9701	0.0000	0.9701	0.9701	0.0400	0.0576	0.4875	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 185234505 : SNP	t	g	0.3515	0.0190	0.3147	0.3790	0.0044	0.0092	0.6319	+++--	0.0	2.521	4	0.6409
12 : 121268624 : SNP	t	c	0.3584	0.0230	0.3133	0.3843	0.0043	0.0091	0.6355	-+--+	0.0	2.766	4	0.5977
17 : 66226922 : SNP	t	c	0.8770	0.0061	0.8716	0.8900	-0.0114	0.0130	0.3835	--+--	0.0	0.613	4	0.9616
19 : 54473054 : SNP	a	g	0.6165	0.0139	0.5869	0.6279	0.0009	0.0092	0.9191	++++-	0.0	2.363	4	0.6694
9 : 71688218 : SNP	t	c	0.5432	0.0139	0.5133	0.5660	0.0074	0.0085	0.3884	-++-+	41.5	6.837	4	0.1448
16 : 83152261 : SNP	a	g	0.3265	0.0099	0.3075	0.3420	-0.0128	0.0101	0.2059	---+-	0.0	3.132	4	0.5359
6 : 144739380 : SNP	t	c	0.0125	0.0000	0.0125	0.0125	-0.0500	0.0617	0.4174	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 71837965 : SNP	a	c	0.1486	0.0051	0.1335	0.1636	0.0152	0.0122	0.2117	++-+-	14.0	4.649	4	0.3252
12 : 96928210 : SNP	a	g	0.0526	0.0017	0.0518	0.0565	0.0067	0.0193	0.7295	-+??-	58.2	4.785	2	0.0914
12 : 10801900 : INDEL	d	r	0.4339	0.0152	0.4120	0.4615	-0.0011	0.0085	0.8965	-++++	0.0	1.786	4	0.7751
14 : 75679642 : SNP	c	g	0.9198	0.0004	0.9193	0.9210	-0.0216	0.0172	0.2088	-+?+-	65.3	8.643	3	0.03444
7 : 92208466 : SNP	a	t	0.0803	0.0153	0.0678	0.1157	-0.0036	0.0161	0.8254	----+	30.0	5.711	4	0.2218
5 : 111756389 : SNP	t	c	0.9692	0.0000	0.9692	0.9692	0.0830	0.0465	0.07427	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 66055456 : SNP	c	g	0.8393	0.0098	0.8109	0.8665	0.0026	0.0114	0.8198	+--++	0.0	1.053	4	0.9017
2 : 137401769 : SNP	t	c	0.1697	0.0342	0.1491	0.2353	0.0047	0.0115	0.6823	++-+-	32.5	5.922	4	0.205
8 : 65974632 : SNP	a	t	0.3782	0.0241	0.3435	0.4344	-0.0120	0.0091	0.1858	-----	27.2	5.498	4	0.2399
8 : 81460682 : SNP	t	c	0.0601	0.0048	0.0576	0.0694	-0.0063	0.0188	0.7379	00?+-	0.0	1.163	3	0.7618
4 : 32200748 : SNP	a	g	0.4126	0.0121	0.4028	0.4478	-0.0126	0.0086	0.1398	--+-+	0.0	1.701	4	0.7906
14 : 93306674 : SNP	t	c	0.6613	0.0063	0.6486	0.6670	0.0145	0.0091	0.1106	-++++	49.6	7.929	4	0.09423
9 : 26207358 : SNP	t	c	0.3194	0.0042	0.3110	0.3252	-0.0012	0.0092	0.892	+--++	0.0	2.728	4	0.6044
2 : 4179606 : SNP	t	c	0.2157	0.0064	0.2026	0.2359	-0.0167	0.0105	0.1124	-++--	27.4	5.513	4	0.2386
9 : 92738714 : SNP	a	c	0.3493	0.0065	0.3373	0.3550	0.0036	0.0091	0.6907	--+++	0.0	3.476	4	0.4815
4 : 3828535 : SNP	c	g	0.8911	0.0011	0.8893	0.8917	-0.0618	0.0456	0.1755	???-+	81.9	5.527	1	0.01872
8 : 99741891 : SNP	a	g	0.0552	0.0030	0.0529	0.0590	0.0101	0.0215	0.6393	++???	0.0	0.086	1	0.7697
10 : 68437687 : SNP	a	g	0.3972	0.0115	0.3706	0.4051	0.0167	0.0086	0.05169	+-+-+	43.0	7.019	4	0.1349
6 : 87837796 : INDEL	d	r	0.3828	0.0116	0.3674	0.4009	0.0216	0.0099	0.02974	++-++	0.0	2.279	4	0.6846
20 : 42117529 : INDEL	d	r	0.4443	0.0093	0.4353	0.4548	-0.0058	0.0086	0.5017	+-++-	73.3	14.995	4	0.004712
3 : 70222422 : SNP	a	g	0.6280	0.0327	0.5753	0.6712	0.0152	0.0091	0.09487	+-+++	27.8	5.538	4	0.2364
1 : 199664562 : SNP	t	c	0.2834	0.0168	0.2491	0.2952	0.0099	0.0100	0.3233	+---+	7.9	4.344	4	0.3615
9 : 93638736 : INDEL	d	r	0.0665	0.0093	0.0581	0.0945	0.0115	0.0178	0.5177	--?-+	35.9	4.683	3	0.1965
20 : 31448696 : SNP	t	c	0.4481	0.0304	0.4281	0.5137	-0.0200	0.0086	0.01972	---+-	0.0	1.577	4	0.813
2 : 9674686 : SNP	a	c	0.6664	0.0181	0.6422	0.6978	0.0096	0.0092	0.2965	+-+++	24.2	5.280	4	0.2597
3 : 297348 : SNP	t	g	0.8563	0.0147	0.8208	0.8739	-0.0134	0.0121	0.2679	--++-	26.4	5.436	4	0.2454
22 : 40550105 : SNP	t	c	0.4212	0.0212	0.4062	0.4637	-0.0123	0.0090	0.1744	-----	0.0	0.571	4	0.9663
2 : 29746681 : SNP	a	t	0.1027	0.0042	0.0986	0.1185	-0.0043	0.0142	0.7632	-+-++	7.2	4.308	4	0.3659
6 : 137126133 : SNP	a	g	0.5820	0.0178	0.5441	0.5955	-0.0070	0.0086	0.4104	-+-+-	0.0	0.479	4	0.9755
8 : 59807881 : SNP	a	c	0.9712	0.0000	0.9712	0.9712	0.0300	0.0374	0.4225	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 47463772 : SNP	a	g	0.7170	0.0073	0.7016	0.7472	0.0098	0.0094	0.2981	++-++	0.0	0.413	4	0.9814
12 : 64733138 : SNP	t	c	0.2797	0.0071	0.2749	0.2960	-0.0062	0.0094	0.5065	0-+-+	0.0	1.367	4	0.8498
10 : 126905011 : SNP	t	c	0.9030	0.0132	0.8782	0.9110	-0.0037	0.0154	0.8129	+-++-	13.3	4.614	4	0.3292
5 : 6456939 : SNP	a	g	0.0733	0.0057	0.0643	0.0772	0.0018	0.0198	0.9274	-+?--	0.0	2.280	3	0.5163
6 : 138390198 : SNP	t	c	0.0773	0.0036	0.0723	0.0819	-0.0238	0.0202	0.2392	+-?-?	25.7	2.693	2	0.2601
2 : 118718692 : SNP	t	g	0.9575	0.0062	0.9504	0.9629	0.0415	0.0244	0.08864	++???	0.0	0.200	1	0.6546
7 : 84957230 : SNP	a	g	0.4376	0.0069	0.4177	0.4438	-0.0067	0.0085	0.434	--+++	46.7	7.501	4	0.1117
11 : 17371793 : SNP	t	c	0.3311	0.0118	0.3066	0.3443	-0.0127	0.0092	0.1681	---+-	0.0	0.948	4	0.9176
1 : 164579918 : SNP	a	g	0.0544	0.0070	0.0339	0.0572	0.0047	0.0204	0.8189	+-??+	36.9	3.168	2	0.2052
2 : 113855863 : SNP	a	c	0.1856	0.0104	0.1578	0.1910	-0.0074	0.0110	0.5	---++	0.0	1.934	4	0.7479
7 : 23268617 : SNP	a	c	0.0315	0.0000	0.0315	0.0315	-0.0890	0.0364	0.01446	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 12584737 : INDEL	d	r	0.3960	0.0129	0.3731	0.4271	0.0047	0.0085	0.5824	-+---	20.4	5.023	4	0.2849
6 : 83543659 : SNP	t	c	0.1463	0.0113	0.1144	0.1528	-0.0093	0.0122	0.4424	+-+--	0.0	3.255	4	0.5161
16 : 15915858 : SNP	t	c	0.7461	0.0217	0.7110	0.7643	-0.0078	0.0097	0.4195	-----	0.0	0.758	4	0.9439
2 : 20106598 : SNP	a	t	0.1576	0.0141	0.1366	0.1803	-0.0082	0.0116	0.4797	-++-+	24.1	5.269	4	0.2608
12 : 53738433 : SNP	t	g	0.6999	0.0182	0.6549	0.7157	0.0076	0.0093	0.4171	+--++	0.0	0.980	4	0.9128
3 : 71981586 : SNP	a	c	0.0170	0.0000	0.0170	0.0170	-0.0180	0.0485	0.7107	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 121472981 : SNP	a	g	0.7818	0.0197	0.7661	0.8316	-0.0040	0.0108	0.7121	--+--	5.3	4.223	4	0.3767
12 : 22402369 : SNP	t	c	0.3172	0.0243	0.2952	0.3723	0.0108	0.0099	0.2769	++++-	0.0	2.366	4	0.6687
5 : 152960335 : SNP	a	g	0.0771	0.0093	0.0618	0.0891	-0.0061	0.0169	0.7177	-+?--	0.0	1.947	3	0.5834
7 : 1932374 : SNP	a	c	0.0733	0.0047	0.0697	0.0859	-0.0101	0.0188	0.5918	--?++	0.0	1.380	3	0.7103
18 : 67931823 : SNP	t	c	0.6468	0.0328	0.5607	0.6658	0.0083	0.0091	0.3595	++++-	0.0	2.603	4	0.6263
9 : 28056514 : SNP	t	c	0.8443	0.0117	0.8191	0.8547	0.0078	0.0120	0.5151	+-++-	0.0	2.825	4	0.5875
11 : 131930732 : SNP	a	c	0.9764	0.0038	0.9719	0.9796	0.0399	0.0324	0.2177	++???	0.0	0.535	1	0.4645
18 : 61394352 : SNP	t	c	0.2544	0.0090	0.2393	0.2812	-0.0148	0.0099	0.1363	---+-	0.0	1.482	4	0.8299
3 : 107074226 : SNP	t	c	0.0455	0.0051	0.0396	0.0575	-0.0063	0.0219	0.773	--?+-	0.0	0.159	3	0.984
14 : 66969331 : SNP	a	g	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	-0.0260	0.0505	0.607	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 15251688 : SNP	a	g	0.0880	0.0079	0.0758	0.0949	0.0042	0.0158	0.7888	-+?+-	0.0	0.412	3	0.9377
11 : 32855458 : SNP	t	g	0.1699	0.0103	0.1614	0.1892	0.0020	0.0112	0.8605	+--++	0.0	3.548	4	0.4707
4 : 20652241 : SNP	t	c	0.9219	0.0054	0.9154	0.9272	-0.0110	0.0162	0.4988	--?--	0.0	0.385	3	0.9433
1 : 152991060 : SNP	a	g	0.4845	0.0106	0.4747	0.5110	-0.0090	0.0085	0.2899	-+---	9.3	4.408	4	0.3536
5 : 80344761 : SNP	t	c	0.3922	0.0196	0.3643	0.4402	0.0115	0.0087	0.1878	++-++	0.0	0.896	4	0.9251
3 : 44039889 : SNP	a	g	0.4797	0.0049	0.4645	0.4912	0.0010	0.0086	0.9054	-++++	0.0	0.062	4	0.9995
11 : 2897480 : SNP	c	g	0.9791	0.0000	0.9791	0.9791	-0.0970	0.0445	0.02919	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 11548817 : SNP	a	g	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	0.0010	0.0455	0.9825	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 9338435 : SNP	a	c	0.4269	0.0112	0.4171	0.4570	-0.0052	0.0085	0.5408	-++--	14.9	4.703	4	0.3192
4 : 33487826 : SNP	t	g	0.0169	0.0000	0.0169	0.0169	0.0280	0.0475	0.5556	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 70972158 : SNP	a	c	0.6647	0.0253	0.5983	0.6855	-0.0092	0.0091	0.3104	-+-+-	0.0	3.446	4	0.4861
17 : 62619440 : SNP	a	c	0.9352	0.0013	0.9331	0.9369	-0.0165	0.0187	0.3767	--?-+	5.8	3.184	3	0.3642
8 : 99168084 : SNP	a	t	0.0373	0.0012	0.0363	0.0389	-0.0052	0.0264	0.845	+-???	57.0	2.324	1	0.1274
9 : 105099285 : SNP	a	g	0.1197	0.0064	0.0944	0.1240	-0.0136	0.0131	0.2976	+----	0.0	2.153	4	0.7076
5 : 120107890 : SNP	a	c	0.0599	0.0073	0.0433	0.0652	0.0073	0.0193	0.7068	+-??+	52.9	4.248	2	0.1196
12 : 24580997 : INDEL	d	r	0.1835	0.0105	0.1734	0.1986	0.0101	0.0117	0.3874	+-+++	0.0	2.537	4	0.6381
2 : 19078261 : SNP	c	g	0.3299	0.0111	0.3228	0.3543	-0.0003	0.0091	0.9705	-+-+-	32.4	5.920	4	0.2052
12 : 40895026 : SNP	t	c	0.5459	0.0078	0.5391	0.5616	0.0011	0.0085	0.894	+---+	0.0	2.666	4	0.6152
2 : 50440939 : SNP	a	t	0.8081	0.0134	0.7700	0.8369	0.0029	0.0108	0.7864	++---	26.8	5.466	4	0.2427
1 : 105615821 : SNP	a	g	0.9819	0.0000	0.9819	0.9819	0.0140	0.0495	0.7775	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 7581717 : SNP	t	c	0.6049	0.0087	0.5995	0.6317	0.0019	0.0086	0.823	+-+-+	33.7	6.036	4	0.1964
7 : 36153547 : SNP	t	c	0.0720	0.0056	0.0655	0.0822	-0.0049	0.0171	0.7727	-+?-+	0.0	1.148	3	0.7654
11 : 73234183 : SNP	a	g	0.0984	0.0083	0.0698	0.1064	-0.0024	0.0143	0.8675	--+-+	0.0	2.763	4	0.5982
11 : 78005264 : SNP	t	c	0.9776	0.0000	0.9776	0.9776	-0.0140	0.0546	0.7976	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 32987134 : SNP	t	c	0.3297	0.0109	0.3011	0.3501	-0.0082	0.0093	0.3801	-+-+-	0.0	1.122	4	0.8907
5 : 57466736 : SNP	a	g	0.1538	0.0149	0.1390	0.1838	0.0013	0.0118	0.9143	-++-+	4.9	4.206	4	0.3789
2 : 52523884 : SNP	t	c	0.9719	0.0015	0.9701	0.9732	0.0472	0.0297	0.1116	++???	0.0	0.090	1	0.7636
3 : 134664105 : SNP	t	g	0.1342	0.0170	0.0946	0.1500	-0.0083	0.0127	0.5142	--++-	13.3	4.615	4	0.3291
11 : 99511408 : SNP	t	c	0.6806	0.0124	0.6548	0.7082	0.0025	0.0092	0.7865	-++++	62.3	10.607	4	0.03135
16 : 56247976 : SNP	a	t	0.0760	0.0104	0.0479	0.0852	0.0157	0.0172	0.3605	++??+	0.0	0.430	2	0.8065
7 : 21328761 : SNP	c	g	0.1302	0.0059	0.1252	0.1513	-0.0278	0.0126	0.02731	--++-	43.0	7.017	4	0.135
17 : 63864728 : SNP	t	c	0.0588	0.0000	0.0588	0.0589	-0.0336	0.0292	0.2491	-???+	2.5	1.026	1	0.3112
13 : 81699122 : SNP	a	g	0.9444	0.0069	0.9328	0.9532	-0.0171	0.0192	0.3734	0+?--	28.4	4.191	3	0.2415
16 : 85349538 : INDEL	i	r	0.0892	0.0023	0.0881	0.0954	0.0457	0.0280	0.1034	+??++	38.2	3.235	2	0.1984
14 : 90858484 : SNP	t	c	0.7991	0.0064	0.7816	0.8067	-0.0185	0.0107	0.084	-++--	0.0	2.233	4	0.693
2 : 222407973 : SNP	t	c	0.5286	0.0104	0.5231	0.5532	-0.0061	0.0085	0.4756	-++--	0.0	3.034	4	0.5522
7 : 29487835 : SNP	a	t	0.1761	0.0164	0.1618	0.2075	0.0047	0.0113	0.6797	+-+-+	26.6	5.452	4	0.244
6 : 151977473 : SNP	t	c	0.2952	0.0110	0.2696	0.3039	0.0113	0.0093	0.2212	+++++	19.9	4.997	4	0.2876
4 : 190123963 : SNP	t	c	0.9469	0.0050	0.9350	0.9505	-0.0339	0.0206	0.1001	--?--	0.0	1.680	3	0.6413
8 : 65350488 : SNP	a	g	0.8966	0.0098	0.8889	0.9197	-0.0041	0.0139	0.7659	+----	0.0	2.761	4	0.5985
5 : 157006818 : SNP	a	g	0.2777	0.0085	0.2706	0.3032	-0.0076	0.0097	0.4367	---++	0.0	1.306	4	0.8604
2 : 54660484 : SNP	a	g	0.0312	0.0031	0.0296	0.0377	-0.0273	0.0255	0.2847	-+??+	38.5	3.253	2	0.1967
6 : 46944414 : SNP	a	c	0.4355	0.0034	0.4324	0.4491	-0.0009	0.0085	0.9164	+----	17.2	4.833	4	0.3048
11 : 90357764 : SNP	a	g	0.2876	0.0065	0.2750	0.3013	0.0069	0.0092	0.4511	+-+++	0.0	1.824	4	0.7682
13 : 63399772 : SNP	t	c	0.7457	0.0060	0.7247	0.7526	0.0113	0.0098	0.2452	++--+	0.0	2.043	4	0.7279
12 : 38903301 : SNP	a	g	0.0155	0.0000	0.0155	0.0155	-0.0570	0.0495	0.2498	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 72409782 : SNP	t	c	0.5991	0.0134	0.5872	0.6426	0.0082	0.0090	0.3665	+-+-+	19.2	4.952	4	0.2922
8 : 101632370 : SNP	c	g	0.1260	0.0098	0.1156	0.1433	-0.0327	0.0136	0.01603	-0---	0.0	3.998	4	0.4063
16 : 76155704 : INDEL	i	r	0.2151	0.0061	0.2023	0.2268	0.0019	0.0105	0.8566	+++--	12.1	4.552	4	0.3364
7 : 102500711 : SNP	t	c	0.8343	0.0083	0.8240	0.8571	0.0123	0.0114	0.2807	+-++-	63.8	11.052	4	0.02598
2 : 236407769 : SNP	t	c	0.5146	0.0114	0.4883	0.5210	0.0016	0.0085	0.8469	-+-++	0.0	2.807	4	0.5905
3 : 14263903 : SNP	c	g	0.8092	0.0076	0.7904	0.8311	0.0018	0.0112	0.87	-+-+-	0.0	3.160	4	0.5314
8 : 41419388 : SNP	a	g	0.0930	0.0148	0.0827	0.1213	-0.0007	0.0150	0.9603	-++-+	1.6	4.064	4	0.3974
3 : 196834372 : SNP	a	c	0.0533	0.0045	0.0479	0.0612	-0.0282	0.0196	0.1494	--?+-	0.0	1.010	3	0.7987
20 : 748336 : SNP	t	c	0.8947	0.0090	0.8911	0.9207	-0.0117	0.0149	0.4295	--?++	0.0	1.275	3	0.735
18 : 57503266 : SNP	a	g	0.0113	0.0000	0.0113	0.0113	-0.0720	0.0637	0.2582	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 29538598 : SNP	a	t	0.0294	0.0000	0.0294	0.0294	0.0660	0.0465	0.1558	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 54944432 : SNP	t	c	0.9674	0.0040	0.9627	0.9708	0.0293	0.0317	0.3541	++???	0.0	0.248	1	0.6182
16 : 12233364 : SNP	t	c	0.0491	0.0110	0.0413	0.0782	0.0064	0.0231	0.7815	0+?-+	0.0	0.571	3	0.903
12 : 3931681 : SNP	t	c	0.0644	0.0053	0.0590	0.0719	-0.0281	0.0180	0.1175	--?+-	0.0	1.740	3	0.6281
6 : 136140996 : SNP	t	c	0.0537	0.0041	0.0479	0.0565	-0.0072	0.0265	0.7861	-+???	27.3	1.376	1	0.2408
20 : 16619876 : SNP	t	c	0.0380	0.0075	0.0322	0.0587	-0.0195	0.0232	0.4004	--?++	23.0	3.895	3	0.273
1 : 84034387 : SNP	a	g	0.0337	0.0000	0.0337	0.0337	0.0070	0.0465	0.8803	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 227132801 : SNP	t	g	0.9831	0.0000	0.9831	0.9831	-0.0870	0.0516	0.0915	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 100597879 : SNP	a	t	0.9746	0.0000	0.9746	0.9746	0.0040	0.0475	0.9329	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 6489547 : SNP	c	g	0.1096	0.0134	0.0882	0.1273	-0.0150	0.0163	0.3565	--?--	0.0	0.515	3	0.9157
6 : 110805660 : SNP	t	c	0.6691	0.0113	0.6507	0.7045	0.0027	0.0091	0.7668	++--+	0.0	1.939	4	0.747
6 : 86128808 : INDEL	d	r	0.1398	0.0185	0.1120	0.1656	0.0263	0.0133	0.04865	+++++	0.0	1.896	4	0.7549
20 : 60392237 : SNP	a	g	0.4304	0.0195	0.4034	0.4595	-0.0123	0.0085	0.1515	-++--	24.9	5.329	4	0.2551
5 : 33761256 : INDEL	i	r	0.1246	0.0065	0.1150	0.1330	-0.0059	0.0128	0.6444	++---	0.0	2.444	4	0.6547
1 : 167839990 : SNP	t	c	0.5086	0.0267	0.4654	0.5350	-0.0036	0.0098	0.7128	-+--+	40.6	6.734	4	0.1507
8 : 5603681 : SNP	t	c	0.1815	0.0114	0.1496	0.1908	-0.0105	0.0116	0.3661	---+-	0.0	1.527	4	0.8219
3 : 24872585 : SNP	a	t	0.1181	0.0056	0.1142	0.1292	0.0041	0.0133	0.7567	++---	32.8	5.953	4	0.2027
20 : 4627047 : SNP	t	c	0.0345	0.0024	0.0323	0.0375	-0.0151	0.0244	0.5357	--??-	0.0	0.211	2	0.8997
6 : 149494093 : SNP	a	g	0.7879	0.0063	0.7722	0.7968	0.0048	0.0106	0.6471	++---	5.3	4.226	4	0.3763
10 : 97340559 : INDEL	d	r	0.1455	0.0213	0.1270	0.1871	0.0126	0.0120	0.2925	-++--	32.8	5.956	4	0.2024
13 : 30737755 : SNP	c	g	0.6230	0.0130	0.6082	0.6429	0.0055	0.0091	0.5442	-+-++	0.0	2.820	4	0.5884
15 : 51465758 : SNP	a	g	0.6284	0.0106	0.6184	0.6520	0.0037	0.0090	0.6784	-+-++	0.0	0.912	4	0.9229
14 : 71030355 : SNP	t	c	0.9053	0.0158	0.8775	0.9184	-0.0140	0.0147	0.3382	--++-	10.3	4.458	4	0.3475
13 : 60168579 : SNP	a	c	0.8742	0.0192	0.8499	0.9037	0.0282	0.0161	0.08039	-++++	12.6	4.579	4	0.3333
19 : 35870676 : SNP	a	g	0.0178	0.0000	0.0178	0.0178	0.1050	0.0516	0.04168	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 59024646 : SNP	t	c	0.1885	0.0137	0.1773	0.2155	0.0016	0.0113	0.8844	+-+--	0.0	2.237	4	0.6922
19 : 16845333 : SNP	a	c	0.6711	0.0424	0.6058	0.7082	0.0099	0.0132	0.453	+++-+	37.2	6.370	4	0.1732
13 : 21242806 : SNP	a	g	0.0475	0.0123	0.0375	0.0736	0.0065	0.0212	0.7592	++?++	0.0	0.080	3	0.9941
3 : 176136668 : SNP	c	g	0.1595	0.0119	0.1281	0.1693	-0.0150	0.0115	0.1928	---+-	0.0	1.560	4	0.816
20 : 38154131 : SNP	t	c	0.4854	0.0038	0.4698	0.4886	0.0004	0.0091	0.9663	+-+--	0.0	1.880	4	0.7577
6 : 22675462 : SNP	a	g	0.0478	0.0037	0.0386	0.0505	0.0307	0.0208	0.1388	++??-	54.9	4.437	2	0.1088
5 : 14494470 : SNP	t	c	0.0432	0.0000	0.0432	0.0432	0.0090	0.0404	0.8239	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 38548215 : INDEL	d	r	0.8997	0.0095	0.8744	0.9062	0.0099	0.0255	0.6973	+??--	58.7	4.839	2	0.08897
10 : 16852000 : INDEL	d	r	0.1147	0.0113	0.0780	0.1219	0.0063	0.0143	0.6624	+++--	8.2	4.356	4	0.36
6 : 44474688 : SNP	a	g	0.2618	0.0185	0.2436	0.3004	0.0011	0.0098	0.9093	-++++	0.0	1.416	4	0.8413
5 : 156032520 : SNP	t	c	0.0403	0.0013	0.0396	0.0426	-0.0057	0.0318	0.857	-???+	83.4	6.034	1	0.01404
17 : 75788137 : SNP	a	g	0.3631	0.0074	0.3496	0.3702	-0.0042	0.0092	0.6479	--+-+	0.0	3.762	4	0.4391
22 : 25658746 : SNP	a	g	0.1982	0.0179	0.1827	0.2311	0.0063	0.0235	0.7879	??+--	78.5	9.289	2	0.009615
19 : 38123793 : SNP	t	c	0.2037	0.0150	0.1900	0.2316	0.0185	0.0104	0.07558	+++-+	0.0	1.974	4	0.7405
8 : 29477995 : SNP	t	c	0.3810	0.0127	0.3567	0.4202	-0.0011	0.0091	0.9066	+---+	5.1	4.215	4	0.3776
22 : 29142762 : SNP	t	c	0.0239	0.0000	0.0239	0.0239	-0.0310	0.0414	0.4545	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 110148094 : SNP	t	c	0.6313	0.0114	0.6083	0.6467	-0.0059	0.0091	0.5125	----+	0.0	2.628	4	0.6218
6 : 103830506 : SNP	a	g	0.2640	0.0065	0.2395	0.2687	-0.0194	0.0101	0.05398	--+--	0.0	1.239	4	0.8717
7 : 129402055 : SNP	a	c	0.6630	0.0125	0.6422	0.7006	0.0037	0.0094	0.6927	+-+++	0.0	2.224	4	0.6947
2 : 180304203 : SNP	a	g	0.5809	0.0199	0.5517	0.6206	-0.0064	0.0086	0.4537	--++-	0.0	2.569	4	0.6323
8 : 93358410 : SNP	t	c	0.8248	0.0046	0.8173	0.8313	0.0061	0.0113	0.586	+--+-	16.4	4.785	4	0.3101
5 : 114823331 : INDEL	i	r	0.8373	0.0076	0.8159	0.8524	-0.0057	0.0116	0.6245	+----	8.0	4.350	4	0.3607
22 : 37347011 : SNP	a	g	0.8695	0.0107	0.8501	0.8813	-0.0521	0.0164	0.001466	--?--	0.0	1.970	3	0.5787
10 : 78006551 : SNP	t	g	0.9555	0.0079	0.9444	0.9671	-0.0221	0.0243	0.3636	-+??-	0.0	0.641	2	0.7259
6 : 1135935 : INDEL	d	r	0.1397	0.0128	0.1265	0.1640	0.0046	0.0160	0.7729	+-?+-	0.0	2.281	3	0.5163
12 : 42765250 : SNP	t	c	0.3960	0.0107	0.3640	0.4055	0.0035	0.0086	0.685	++---	0.0	3.617	4	0.4604
13 : 55225003 : SNP	t	c	0.4929	0.0030	0.4796	0.4994	-0.0022	0.0085	0.798	-+-+-	0.0	3.973	4	0.4096
4 : 165374005 : SNP	a	c	0.1767	0.0110	0.1686	0.2085	0.0045	0.0113	0.6935	+-+++	0.0	1.875	4	0.7588
7 : 77420388 : SNP	a	g	0.6014	0.0103	0.5816	0.6200	-0.0024	0.0085	0.7812	-++--	0.0	2.118	4	0.714
6 : 137124287 : SNP	a	g	0.5825	0.0174	0.5460	0.5959	-0.0076	0.0086	0.3712	-0-+-	0.0	0.690	4	0.9526
18 : 62757529 : SNP	c	g	0.9074	0.0075	0.8923	0.9147	0.0021	0.0152	0.8925	++?-+	0.0	2.485	3	0.478
20 : 5245152 : SNP	a	g	0.4054	0.0108	0.3892	0.4172	-0.0165	0.0086	0.05664	-----	0.0	1.949	4	0.7452
10 : 74178677 : SNP	t	c	0.6486	0.0197	0.5941	0.6644	0.0179	0.0090	0.04797	++-++	0.0	1.775	4	0.777
4 : 14414180 : SNP	t	c	0.0215	0.0000	0.0215	0.0215	-0.0470	0.0445	0.2906	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 181256307 : SNP	t	c	0.5028	0.0223	0.4516	0.5139	0.0030	0.0086	0.7289	+---+	0.0	2.150	4	0.7082
9 : 24842590 : SNP	t	g	0.6692	0.0052	0.6594	0.6844	0.0017	0.0091	0.8554	++-+-	0.0	2.967	4	0.5634
16 : 78763037 : SNP	c	g	0.7844	0.0039	0.7788	0.7917	0.0126	0.0112	0.2598	+-+++	0.0	2.734	4	0.6033
2 : 242449625 : SNP	a	g	0.9047	0.0138	0.8728	0.9217	0.0088	0.0156	0.5713	++?--	0.0	0.573	3	0.9027
8 : 14509273 : SNP	c	g	0.7994	0.0084	0.7812	0.8122	0.0039	0.0107	0.7134	+--+-	0.0	2.683	4	0.6123
15 : 27050312 : SNP	t	c	0.7526	0.0216	0.7375	0.8117	0.0136	0.0112	0.2215	++-++	0.0	1.482	4	0.8298
3 : 149255888 : SNP	c	g	0.1301	0.0068	0.1207	0.1475	-0.0019	0.0140	0.889	-++-+	4.4	4.184	4	0.3817
5 : 118637812 : SNP	a	g	0.9772	0.0000	0.9772	0.9772	0.0200	0.0404	0.6209	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 45647215 : INDEL	d	r	0.0575	0.0131	0.0488	0.0789	-0.0013	0.0214	0.9528	0+?--	0.0	1.168	3	0.7606
4 : 186818758 : SNP	a	g	0.0304	0.0021	0.0276	0.0320	0.0098	0.0292	0.737	+-???	48.4	1.938	1	0.1639
2 : 132328985 : INDEL	i	r	0.4628	0.0129	0.4246	0.4742	0.0129	0.0105	0.2168	+++++	0.0	0.706	4	0.9506
9 : 136807674 : SNP	t	c	0.5799	0.0150	0.5686	0.6236	-0.0024	0.0086	0.784	++---	0.0	2.527	4	0.6399
1 : 189940650 : SNP	a	g	0.0123	0.0000	0.0123	0.0123	-0.0250	0.0627	0.69	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 13984666 : SNP	a	g	0.2457	0.0130	0.2343	0.2808	0.0009	0.0099	0.9309	---++	0.0	0.885	4	0.9267
18 : 44116145 : SNP	t	c	0.0362	0.0061	0.0292	0.0472	0.0082	0.0245	0.7385	++??-	0.0	1.956	2	0.3761
2 : 154952317 : SNP	a	g	0.0214	0.0000	0.0214	0.0214	-0.0180	0.0536	0.7369	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 24961463 : SNP	t	c	0.3485	0.0193	0.3142	0.3655	-0.0071	0.0092	0.4364	+-+--	80.8	20.862	4	0.0003373
15 : 96552122 : INDEL	i	r	0.0175	0.0000	0.0175	0.0175	0.0560	0.0556	0.3138	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 30261660 : INDEL	d	r	0.3968	0.0067	0.3810	0.4044	0.0145	0.0091	0.1117	+++-+	0.0	2.634	4	0.6209
10 : 29870375 : SNP	a	g	0.5972	0.0047	0.5913	0.6121	-0.0051	0.0086	0.5568	--++-	0.0	3.182	4	0.5278
9 : 114047460 : SNP	a	t	0.9528	0.0033	0.9400	0.9560	0.0231	0.0206	0.2636	+-?++	51.3	6.165	3	0.1039
20 : 24994275 : SNP	a	g	0.1121	0.0060	0.0926	0.1186	0.0041	0.0135	0.7623	++++-	0.0	2.221	4	0.6952
4 : 144680317 : SNP	t	c	0.6761	0.0220	0.6343	0.6991	0.0055	0.0092	0.5488	+-+-+	0.0	3.010	4	0.5561
3 : 41852887 : SNP	t	c	0.1476	0.0129	0.1334	0.1708	0.0104	0.0121	0.3901	++--+	0.0	1.165	4	0.8838
2 : 181812942 : SNP	c	g	0.6119	0.0048	0.6058	0.6272	-0.0153	0.0091	0.09184	-----	0.0	1.918	4	0.7508
3 : 89865683 : SNP	t	c	0.0420	0.0060	0.0371	0.0606	-0.0123	0.0241	0.6102	+-?+?	32.1	2.945	2	0.2293
4 : 96982176 : SNP	t	c	0.7913	0.0078	0.7864	0.8097	0.0166	0.0105	0.1147	++-+-	0.0	3.141	4	0.5345
14 : 86221911 : SNP	t	c	0.5220	0.0082	0.5027	0.5332	0.0019	0.0085	0.8205	+-+--	0.0	1.521	4	0.8228
21 : 16894185 : SNP	a	t	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	-0.1090	0.0617	0.07711	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 209943719 : SNP	t	c	0.9780	0.0000	0.9780	0.9780	0.0330	0.0465	0.4779	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 22366367 : INDEL	d	r	0.6035	0.0063	0.5907	0.6088	-0.0116	0.0091	0.2	--++-	1.4	4.058	4	0.3981
5 : 6422476 : SNP	t	c	0.6652	0.0059	0.6429	0.6850	0.0084	0.0092	0.3597	+-++-	29.2	5.652	4	0.2267
3 : 125579541 : SNP	a	g	0.3704	0.0088	0.3532	0.3764	0.0047	0.0192	0.8067	??--+	0.0	0.093	2	0.9547
2 : 76941470 : SNP	c	g	0.9483	0.0044	0.9399	0.9548	0.0069	0.0205	0.7352	++?--	0.0	2.332	3	0.5063
2 : 196940478 : INDEL	i	r	0.0573	0.0056	0.0488	0.0618	0.0307	0.0215	0.153	++??+	18.0	2.440	2	0.2953
14 : 62968647 : SNP	a	t	0.1858	0.0140	0.1771	0.2156	0.0007	0.0111	0.9517	++---	4.9	4.205	4	0.379
10 : 108918515 : SNP	t	c	0.1061	0.0053	0.1030	0.1267	0.0437	0.0154	0.0045	++?--	26.0	4.052	3	0.2559
9 : 37008041 : SNP	t	g	0.3637	0.0217	0.3122	0.3873	0.0007	0.0090	0.935	-+++-	0.0	3.265	4	0.5145
16 : 70070037 : SNP	a	g	0.0505	0.0000	0.0505	0.0505	0.0488	0.0660	0.4597	????+	0.0	0.000	0	1
11 : 94373287 : SNP	c	g	0.9255	0.0088	0.9194	0.9387	0.0043	0.0223	0.8477	-+??+	49.6	3.964	2	0.1378
12 : 69253231 : SNP	a	g	0.4151	0.0176	0.4035	0.4531	-0.0158	0.0092	0.08601	---+-	0.0	1.248	4	0.8702
2 : 203505018 : SNP	a	t	0.7257	0.0102	0.6955	0.7348	0.0161	0.0103	0.1183	+++--	9.2	4.407	4	0.3537
1 : 97866777 : SNP	a	t	0.0462	0.0000	0.0462	0.0462	0.0020	0.0364	0.9562	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 23884098 : SNP	a	g	0.9682	0.0007	0.9676	0.9691	0.0354	0.0300	0.2378	++???	0.0	0.128	1	0.7206
1 : 146886575 : INDEL	d	r	0.5637	0.0081	0.5508	0.5747	-0.0211	0.0091	0.0206	--+-+	0.0	3.135	4	0.5354
1 : 97105662 : INDEL	i	r	0.6937	0.0071	0.6873	0.7107	-0.0072	0.0097	0.4574	--+-+	0.0	0.814	4	0.9366
4 : 168472966 : SNP	t	c	0.6015	0.0133	0.5824	0.6274	-0.0177	0.0098	0.07115	+-+--	57.0	9.295	4	0.05413
5 : 125040755 : SNP	t	g	0.7583	0.0097	0.7360	0.7801	0.0013	0.0100	0.898	+---+	0.0	3.797	4	0.4341
2 : 40534841 : SNP	c	g	0.2435	0.0094	0.2348	0.2683	0.0014	0.0100	0.8853	+-+--	0.0	1.728	4	0.7857
3 : 120672324 : SNP	t	c	0.2464	0.0083	0.2353	0.2788	-0.0032	0.0098	0.7426	-+--+	0.0	3.787	4	0.4356
22 : 21360430 : SNP	t	c	0.1157	0.0046	0.0987	0.1205	-0.0045	0.0135	0.7402	--+--	0.0	0.910	4	0.9231
4 : 90155694 : SNP	t	c	0.0401	0.0095	0.0318	0.0580	-0.0060	0.0229	0.7926	+-?--	0.0	2.938	3	0.4012
6 : 121783829 : SNP	t	c	0.4416	0.0086	0.4059	0.4470	0.0015	0.0091	0.8646	+--+-	29.1	5.640	4	0.2277
11 : 127687313 : SNP	c	g	0.1629	0.0039	0.1579	0.1777	0.0001	0.0125	0.9923	+---+	48.3	7.743	4	0.1015
7 : 75302668 : INDEL	d	r	0.4727	0.0251	0.4523	0.5124	0.0032	0.0093	0.7334	+--++	19.8	4.989	4	0.2884
7 : 101206286 : SNP	t	c	0.0651	0.0056	0.0490	0.0678	0.0015	0.0183	0.9335	-+??-	0.0	0.588	2	0.7451
3 : 62706158 : SNP	a	g	0.1264	0.0169	0.1103	0.1644	-0.0001	0.0132	0.9961	---++	1.9	4.078	4	0.3956
2 : 106451751 : SNP	t	g	0.5646	0.0104	0.5525	0.5971	-0.0014	0.0085	0.8711	+--++	0.0	3.097	4	0.5417
13 : 88082977 : SNP	t	c	0.9814	0.0000	0.9814	0.9814	-0.0140	0.0465	0.7634	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 8750481 : SNP	t	g	0.9880	0.0000	0.9880	0.9880	0.0430	0.0617	0.4856	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 60260035 : SNP	t	c	0.3282	0.0291	0.2542	0.3445	-0.0050	0.0093	0.5882	--+++	43.5	7.080	4	0.1317
13 : 115012895 : SNP	a	g	0.0331	0.0031	0.0298	0.0366	0.0004	0.0260	0.9882	++??-	0.0	0.058	2	0.9716
3 : 176982407 : SNP	t	c	0.2368	0.0124	0.2161	0.2534	0.0218	0.0161	0.1755	+++++	0.0	0.912	4	0.9228
1 : 185567987 : SNP	t	c	0.3571	0.0066	0.3488	0.3672	0.0126	0.0091	0.1676	++-+-	0.0	2.201	4	0.6989
6 : 150786096 : SNP	a	g	0.3766	0.0245	0.3616	0.4310	0.0047	0.0090	0.6032	+---+	0.0	2.454	4	0.6529
21 : 18368124 : INDEL	d	r	0.1661	0.0079	0.1571	0.1820	0.0177	0.0118	0.1337	+++-+	0.0	1.626	4	0.804
6 : 169393922 : SNP	a	g	0.2943	0.0170	0.2701	0.3092	-0.0053	0.0104	0.6081	-+--+	0.0	3.698	4	0.4484
1 : 171376603 : SNP	a	t	0.7559	0.0101	0.7362	0.7710	-0.0043	0.0118	0.7171	-+--+	53.7	8.637	4	0.07084
7 : 4594150 : SNP	a	g	0.2103	0.0053	0.1930	0.2147	0.0126	0.0106	0.2348	+++++	0.0	1.196	4	0.8787
7 : 158789265 : SNP	t	c	0.1912	0.0072	0.1736	0.1949	0.0040	0.0112	0.7198	++++-	0.0	2.696	4	0.6099
11 : 18433720 : SNP	c	g	0.8763	0.0119	0.8596	0.8890	0.0215	0.0135	0.1111	-++++	61.5	10.392	4	0.03431
12 : 40378784 : SNP	a	g	0.2834	0.0094	0.2607	0.2926	-0.0164	0.0095	0.08217	-----	0.0	0.513	4	0.9722
4 : 44961310 : SNP	t	g	0.9873	0.0000	0.9873	0.9873	-0.0670	0.0556	0.2282	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 129646775 : SNP	a	g	0.9064	0.0114	0.8978	0.9370	-0.0055	0.0147	0.7086	--++-	29.7	5.688	4	0.2237
8 : 142464967 : SNP	t	c	0.5671	0.0077	0.5611	0.5926	0.0102	0.0086	0.2348	+++++	0.0	1.807	4	0.7712
15 : 43610672 : SNP	a	g	0.8774	0.0136	0.8533	0.8963	-0.0047	0.0131	0.7182	--+++	18.5	4.911	4	0.2966
11 : 134512957 : SNP	a	g	0.0608	0.0051	0.0560	0.0697	-0.0241	0.0189	0.2006	--?+-	0.0	0.619	3	0.8921
12 : 12031465 : SNP	a	c	0.5662	0.0088	0.5527	0.5729	-0.0171	0.0098	0.08138	----+	0.0	0.592	4	0.964
3 : 112829257 : SNP	a	g	0.7026	0.0065	0.6958	0.7277	-0.0059	0.0092	0.519	---+-	0.0	2.231	4	0.6934
4 : 21743932 : SNP	t	c	0.9859	0.0000	0.9859	0.9859	-0.0150	0.0536	0.7795	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 45098868 : SNP	a	g	0.0692	0.0057	0.0655	0.0814	0.0232	0.0175	0.1846	++?+-	0.0	2.355	3	0.502
1 : 164002045 : SNP	a	c	0.1409	0.0169	0.1184	0.1700	0.0152	0.0121	0.2105	+--++	27.5	5.516	4	0.2383
10 : 15983180 : SNP	c	g	0.8019	0.0088	0.7905	0.8186	0.0218	0.0233	0.3487	??+++	0.0	0.518	2	0.7718
2 : 67903629 : SNP	a	c	0.2307	0.0284	0.1996	0.2878	-0.0089	0.0102	0.383	+-+--	53.5	8.597	4	0.072
6 : 13560645 : SNP	c	g	0.8617	0.0057	0.8508	0.8829	-0.0065	0.0141	0.6463	-++--	0.0	2.728	4	0.6044
9 : 19474357 : SNP	t	c	0.5261	0.0131	0.4978	0.5352	0.0164	0.0086	0.05621	+++-+	7.4	4.320	4	0.3644
8 : 21588554 : SNP	a	g	0.5173	0.0141	0.5052	0.5415	-0.0073	0.0104	0.48	-+-+-	51.3	8.213	4	0.08408
14 : 66738025 : SNP	t	c	0.9588	0.0000	0.9588	0.9588	-0.0660	0.0475	0.1648	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 39890543 : SNP	t	c	0.2823	0.0110	0.2317	0.3080	0.0102	0.0095	0.2829	++-++	0.0	0.809	4	0.9372
6 : 152383319 : SNP	t	c	0.8973	0.0057	0.8902	0.9096	0.0068	0.0144	0.6344	-++-+	12.0	4.544	4	0.3373
5 : 152534905 : SNP	a	g	0.2092	0.0063	0.2011	0.2252	0.0027	0.0106	0.8015	++-++	0.0	3.798	4	0.434
3 : 66990091 : SNP	t	c	0.9436	0.0022	0.9406	0.9452	-0.0168	0.0195	0.3882	--??-	0.0	1.020	2	0.6005
5 : 49827978 : SNP	a	c	0.9038	0.0015	0.9027	0.9058	0.0013	0.0164	0.9359	+-?-?	58.5	4.823	2	0.08968
2 : 206950635 : INDEL	i	r	0.0978	0.0189	0.0804	0.1338	0.0190	0.0155	0.2205	++?--	0.0	2.232	3	0.5257
6 : 6126845 : SNP	a	c	0.1082	0.0071	0.0926	0.1161	0.0068	0.0138	0.6222	+--+-	0.0	1.522	4	0.8228
5 : 118583487 : SNP	a	g	0.9448	0.0051	0.9353	0.9491	-0.0111	0.0190	0.5574	-+?-+	0.0	2.882	3	0.4102
20 : 2148632 : SNP	a	c	0.8729	0.0090	0.8614	0.8984	0.0025	0.0131	0.8469	--+++	5.7	4.240	4	0.3744
2 : 16435898 : SNP	t	c	0.9160	0.0053	0.9060	0.9195	0.0261	0.0160	0.1031	++?-+	0.0	2.486	3	0.4778
17 : 51560801 : SNP	a	t	0.1974	0.0177	0.1710	0.2388	0.0008	0.0105	0.9428	-++-+	0.0	2.129	4	0.7121
11 : 18503737 : SNP	a	g	0.8761	0.0089	0.8593	0.8859	-0.0047	0.0130	0.7156	-+-+-	0.0	1.634	4	0.8026
17 : 72273292 : SNP	a	g	0.1639	0.0257	0.1036	0.1901	0.0138	0.0119	0.2435	+++-+	0.0	2.768	4	0.5973
10 : 86016741 : SNP	t	g	0.9210	0.0103	0.8989	0.9355	0.0169	0.0171	0.3227	++?--	58.6	7.245	3	0.06449
18 : 73739016 : SNP	a	g	0.5019	0.0054	0.4786	0.5050	-0.0038	0.0085	0.6537	--+++	0.0	0.960	4	0.9159
2 : 162827718 : SNP	t	c	0.0170	0.0000	0.0170	0.0170	-0.0430	0.0485	0.3755	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 107174439 : SNP	a	c	0.0391	0.0022	0.0335	0.0400	-0.0326	0.0230	0.1573	--??+	0.0	1.715	2	0.4243
5 : 120390032 : SNP	a	g	0.0240	0.0054	0.0204	0.0321	0.0538	0.0353	0.1278	+???+	0.0	0.014	1	0.9063
7 : 103868668 : INDEL	i	r	0.1773	0.0047	0.1707	0.1821	0.0111	0.0113	0.325	++-++	0.0	0.711	4	0.9499
2 : 53552372 : SNP	a	t	0.5459	0.0068	0.5355	0.5592	0.0048	0.0085	0.5697	+-+--	28.5	5.592	4	0.2318
16 : 79639021 : SNP	t	c	0.0164	0.0000	0.0164	0.0164	0.0590	0.0637	0.3542	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 171592182 : SNP	t	c	0.6313	0.0073	0.6146	0.6448	0.0003	0.0091	0.9748	--+++	0.0	3.755	4	0.4402
3 : 27719152 : SNP	a	g	0.9332	0.0159	0.9075	0.9447	0.0107	0.0181	0.5535	+-?-+	11.4	3.384	3	0.3361
15 : 79602521 : SNP	a	g	0.9077	0.0036	0.9051	0.9221	-0.0162	0.0156	0.2999	-0---	50.7	8.110	4	0.08764
6 : 111336435 : SNP	a	c	0.8830	0.0051	0.8714	0.8915	0.0060	0.0132	0.6489	++---	19.7	4.983	4	0.289
15 : 51865877 : SNP	t	c	0.4960	0.0165	0.4692	0.5276	-0.0023	0.0085	0.791	-+--+	0.0	2.413	4	0.6603
20 : 46334256 : SNP	a	g	0.1976	0.0129	0.1766	0.2299	-0.0148	0.0107	0.167	----+	0.0	3.990	4	0.4074
6 : 33756026 : SNP	t	c	0.5448	0.0109	0.5248	0.5543	0.0057	0.0085	0.5062	-+-++	0.0	3.160	4	0.5314
17 : 77675706 : SNP	a	g	0.6406	0.0111	0.6033	0.6490	0.0313	0.0138	0.02317	?++++	41.1	5.091	3	0.1653
6 : 128640284 : SNP	a	g	0.0701	0.0094	0.0582	0.0822	-0.0140	0.0172	0.4145	--?++	0.0	2.138	3	0.5443
1 : 86683390 : SNP	a	g	0.9742	0.0053	0.9684	0.9791	-0.0268	0.0312	0.3902	--???	0.0	0.744	1	0.3885
4 : 134505359 : SNP	t	c	0.1328	0.0115	0.1198	0.1687	0.0052	0.0128	0.6861	-+--+	66.8	12.030	4	0.01713
6 : 34006614 : SNP	a	g	0.7779	0.0171	0.7422	0.7886	-0.0030	0.0105	0.7757	--+-+	0.0	1.939	4	0.7469
2 : 69079608 : SNP	a	t	0.0664	0.0037	0.0575	0.0714	-0.0114	0.0176	0.516	+-?--	0.0	2.959	3	0.398
2 : 180177128 : SNP	t	c	0.0751	0.0070	0.0568	0.0783	0.0021	0.0172	0.901	-+??+	0.0	0.425	2	0.8085
13 : 102137705 : SNP	a	g	0.1811	0.0155	0.1682	0.2189	0.0073	0.0111	0.511	+--++	0.0	3.310	4	0.5074
12 : 119976149 : SNP	a	g	0.1299	0.0077	0.1208	0.1436	-0.0046	0.0128	0.7184	-+--+	0.0	3.844	4	0.4276
14 : 23033608 : SNP	c	g	0.0441	0.0046	0.0366	0.0475	-0.0035	0.0230	0.8782	--??+	0.0	0.020	2	0.9898
1 : 248626438 : SNP	a	g	0.2654	0.0055	0.2621	0.2746	-0.0272	0.0303	0.3703	???+-	72.2	3.592	1	0.05805
2 : 56974139 : SNP	a	g	0.1832	0.0141	0.1714	0.2101	0.0046	0.0111	0.6816	+++--	0.0	1.583	4	0.8118
7 : 144281505 : SNP	t	c	0.1584	0.0133	0.1173	0.1689	-0.0066	0.0120	0.5802	-++-+	0.0	1.363	4	0.8506
11 : 90118064 : SNP	a	c	0.8835	0.0025	0.8788	0.8897	-0.0132	0.0146	0.3637	+----	0.0	1.352	4	0.8525
12 : 129438034 : SNP	t	c	0.8334	0.0036	0.8286	0.8437	0.0000	0.0114	0.9997	+---+	13.2	4.606	4	0.3302
9 : 140416777 : SNP	t	c	0.3460	0.0109	0.3257	0.3590	0.0036	0.0255	0.8876	??+-+	0.0	1.380	2	0.5017
3 : 121775134 : SNP	t	c	0.0934	0.0018	0.0892	0.0947	-0.0068	0.0145	0.6395	--?++	34.9	4.609	3	0.2028
6 : 27193521 : SNP	a	t	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	-0.0740	0.0475	0.1193	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 208051049 : SNP	a	g	0.0218	0.0000	0.0218	0.0218	0.0090	0.0425	0.8321	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 111032305 : SNP	a	g	0.0802	0.0076	0.0684	0.0872	-0.0206	0.0162	0.2034	--?--	0.0	1.758	3	0.6241
3 : 79165723 : SNP	a	g	0.0239	0.0000	0.0239	0.0239	-0.0110	0.0505	0.8277	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 92171233 : SNP	a	g	0.7105	0.0078	0.7050	0.7283	0.0043	0.0098	0.6583	-++--	0.0	2.452	4	0.6533
15 : 35542258 : SNP	a	g	0.9579	0.0048	0.9481	0.9624	0.0174	0.0239	0.4664	++??-	0.0	1.316	2	0.5179
6 : 138774401 : SNP	a	g	0.8336	0.0201	0.7970	0.8783	0.0044	0.0113	0.6999	+--++	0.0	2.655	4	0.617
12 : 2133393 : SNP	t	c	0.0608	0.0065	0.0553	0.0734	0.0158	0.0197	0.4229	++?-+	0.0	1.352	3	0.7167
18 : 59877056 : INDEL	d	r	0.0367	0.0015	0.0353	0.0385	-0.0032	0.0233	0.892	-+??+	8.5	2.185	2	0.3353
3 : 79512104 : SNP	a	g	0.9873	0.0000	0.9873	0.9873	0.0660	0.0546	0.2266	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 36474139 : SNP	a	g	0.3123	0.0051	0.3046	0.3160	-0.0076	0.0092	0.4071	---+-	0.0	2.129	4	0.7121
5 : 119450945 : SNP	a	g	0.8548	0.0046	0.8512	0.8678	0.0000	0.0120	0.9975	++---	0.0	0.984	4	0.9122
12 : 124659948 : SNP	c	g	0.9848	0.0000	0.9848	0.9848	-0.0020	0.0536	0.9702	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 88534966 : SNP	a	g	0.0999	0.0071	0.0947	0.1154	-0.0108	0.0142	0.4493	--++-	0.0	1.275	4	0.8655
3 : 3419760 : SNP	a	t	0.3162	0.0055	0.3093	0.3306	0.0041	0.0092	0.6584	++-+-	0.0	3.052	4	0.5491
10 : 6803024 : SNP	t	c	0.7151	0.0102	0.6873	0.7425	-0.0092	0.0096	0.3401	-+-++	17.0	4.819	4	0.3063
12 : 46576294 : SNP	a	c	0.0466	0.0106	0.0369	0.0648	0.0005	0.0218	0.9833	+-?+-	17.5	3.635	3	0.3036
3 : 136696584 : SNP	t	c	0.5336	0.0062	0.5199	0.5431	0.0182	0.0085	0.03239	+++++	3.2	4.132	4	0.3884
12 : 9566302 : SNP	a	g	0.5492	0.0140	0.5230	0.5594	0.0018	0.0200	0.9287	??++-	56.8	4.630	2	0.09878
10 : 29041750 : INDEL	i	r	0.4403	0.0106	0.4311	0.4560	0.0240	0.0091	0.008318	+-+++	45.8	7.386	4	0.1169
13 : 57942326 : INDEL	d	r	0.5252	0.0113	0.4934	0.5470	0.0007	0.0085	0.9384	-+-++	0.0	1.459	4	0.8339
2 : 161722893 : SNP	a	c	0.5558	0.0319	0.4643	0.5740	-0.0077	0.0085	0.3652	--+-+	7.5	4.324	4	0.364
13 : 71378485 : SNP	a	g	0.2683	0.0209	0.2307	0.2928	-0.0036	0.0097	0.7141	--+-+	0.0	1.100	4	0.8943
11 : 59559075 : SNP	t	g	0.9431	0.0055	0.9396	0.9571	0.0037	0.0197	0.8505	+-??-	0.0	0.063	2	0.9691
6 : 667546 : SNP	c	g	0.0332	0.0070	0.0280	0.0427	0.0027	0.0358	0.9398	+???-	37.0	1.587	1	0.2077
5 : 108452460 : SNP	t	g	0.0386	0.0003	0.0384	0.0391	-0.0464	0.0247	0.06006	--???	0.0	0.348	1	0.5551
7 : 72873493 : SNP	a	g	0.0635	0.0073	0.0562	0.0728	-0.0027	0.0208	0.8967	++?--	0.0	1.227	3	0.7465
3 : 159828024 : SNP	a	g	0.5143	0.0202	0.4721	0.5254	0.0078	0.0088	0.3785	+++-+	0.0	0.973	4	0.9138
18 : 38617737 : SNP	t	c	0.2449	0.0061	0.2382	0.2655	-0.0090	0.0098	0.3613	-+++-	0.0	2.561	4	0.6338
9 : 117570856 : SNP	a	g	0.1219	0.0052	0.1167	0.1281	0.0017	0.0132	0.8988	++---	47.4	7.606	4	0.1071
1 : 4609122 : SNP	t	c	0.0842	0.0052	0.0808	0.1032	0.0138	0.0156	0.3762	++?-+	29.6	4.263	3	0.2344
6 : 153639160 : SNP	t	c	0.9368	0.0121	0.9233	0.9489	0.0413	0.0228	0.06963	++??+	0.0	0.244	2	0.885
21 : 22022579 : INDEL	i	r	0.5395	0.0091	0.5229	0.5532	-0.0011	0.0091	0.9031	--+-+	32.8	5.951	4	0.2029
18 : 49987612 : SNP	a	t	0.0706	0.0029	0.0683	0.0742	0.0196	0.0189	0.2992	++???	15.5	1.184	1	0.2766
20 : 8840293 : SNP	t	c	0.6977	0.0212	0.6781	0.7436	0.0076	0.0093	0.4113	+-+++	10.5	4.468	4	0.3463
5 : 148364067 : SNP	a	g	0.0322	0.0005	0.0318	0.0329	0.0224	0.0285	0.4314	+-???	0.0	0.702	1	0.402
1 : 25222108 : INDEL	d	r	0.0307	0.0000	0.0307	0.0307	0.0010	0.0414	0.9808	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 189932145 : SNP	a	c	0.8147	0.0109	0.8076	0.8524	0.0124	0.0107	0.2435	+++--	36.1	6.258	4	0.1807
12 : 25539316 : SNP	c	g	0.9311	0.0104	0.9140	0.9406	0.0186	0.0177	0.2918	+-?++	75.3	12.124	3	0.00697
4 : 30279789 : SNP	a	c	0.6811	0.0056	0.6744	0.6913	0.0011	0.0142	0.9407	+-+-+	49.7	7.945	4	0.09362
18 : 26456104 : SNP	a	g	0.0232	0.0000	0.0232	0.0232	-0.0620	0.0435	0.1538	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 21217347 : INDEL	i	r	0.8292	0.0126	0.8200	0.8570	-0.0083	0.0120	0.4859	--+-+	67.3	12.225	4	0.01575
7 : 96543890 : SNP	t	g	0.2472	0.0076	0.2350	0.2656	0.0060	0.0110	0.5864	+-+++	0.0	2.633	4	0.621
4 : 104819056 : SNP	t	c	0.6489	0.0103	0.6342	0.6634	0.0032	0.0091	0.7291	+-+--	23.1	5.199	4	0.2675
7 : 2041432 : SNP	a	g	0.5961	0.0086	0.5896	0.6088	-0.0046	0.0085	0.5902	-++--	41.8	6.874	4	0.1427
5 : 104300802 : SNP	t	c	0.4747	0.0189	0.4170	0.4837	-0.0024	0.0085	0.7766	++--+	54.5	8.799	4	0.06633
5 : 112063011 : SNP	a	t	0.9886	0.0000	0.9886	0.9886	0.1010	0.0576	0.07962	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 1505635 : SNP	a	g	0.1447	0.0125	0.1262	0.1662	0.0111	0.0162	0.4922	++--+	55.4	8.961	4	0.06209
1 : 86372214 : SNP	a	c	0.8730	0.0187	0.8396	0.8898	-0.0124	0.0130	0.3408	-+-++	34.6	6.117	4	0.1906
8 : 6412954 : SNP	a	c	0.9878	0.0000	0.9878	0.9878	0.1330	0.0617	0.03101	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 58569066 : SNP	a	g	0.8111	0.0097	0.7996	0.8296	-0.0005	0.0108	0.9609	-++-+	0.0	2.886	4	0.5771
3 : 144646842 : SNP	a	g	0.7620	0.0048	0.7562	0.7669	0.0002	0.0104	0.9828	+++-+	44.7	7.237	4	0.1239
9 : 209359 : SNP	c	g	0.7073	0.0090	0.6800	0.7206	-0.0022	0.0092	0.8135	--+-+	0.0	2.905	4	0.5739
11 : 111527775 : SNP	t	c	0.2970	0.0386	0.2655	0.3747	0.0083	0.0094	0.3752	+---+	0.0	3.577	4	0.4663
5 : 108030538 : SNP	a	g	0.4632	0.0137	0.4423	0.4954	0.0017	0.0085	0.8435	+--++	20.5	5.029	4	0.2844
3 : 164119960 : SNP	a	g	0.3516	0.0117	0.3279	0.3625	0.0181	0.0091	0.04736	+++++	13.0	4.598	4	0.331
5 : 173565520 : SNP	t	g	0.5476	0.0099	0.5330	0.5586	-0.0197	0.0086	0.0215	-----	0.0	1.195	4	0.879
3 : 140477722 : SNP	t	c	0.4674	0.0076	0.4447	0.4767	-0.0023	0.0085	0.7863	+--++	0.0	3.626	4	0.459
14 : 63697246 : SNP	t	c	0.0735	0.0023	0.0687	0.0792	0.0026	0.0171	0.8771	+0?-+	0.0	0.549	3	0.9079
4 : 162044740 : SNP	a	g	0.1929	0.0072	0.1823	0.2034	-0.0056	0.0113	0.6218	-+---	21.6	5.104	4	0.2768
3 : 52755586 : SNP	a	g	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	0.0150	0.0475	0.7522	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 97801181 : SNP	a	g	0.9827	0.0000	0.9827	0.9827	-0.0020	0.0516	0.9691	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 7718590 : SNP	t	c	0.5348	0.0236	0.5224	0.5973	0.0017	0.0084	0.835	+++--	0.0	1.168	4	0.8833
9 : 94062924 : SNP	t	g	0.8964	0.0042	0.8876	0.9023	-0.0094	0.0140	0.5035	---+-	0.0	2.584	4	0.6296
7 : 101730309 : SNP	t	g	0.8105	0.0107	0.7745	0.8187	-0.0107	0.0110	0.3319	--+-+	0.0	2.495	4	0.6455
18 : 38779506 : SNP	t	c	0.9824	0.0000	0.9824	0.9824	0.0270	0.0526	0.6075	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 192382989 : SNP	a	g	0.9098	0.0040	0.9015	0.9149	-0.0045	0.0150	0.7633	---++	0.0	2.599	4	0.627
5 : 7559418 : SNP	a	g	0.6097	0.0054	0.6069	0.6326	-0.0122	0.0086	0.153	--+-+	0.0	3.200	4	0.5249
8 : 23750791 : SNP	a	c	0.4198	0.0157	0.3620	0.4475	-0.0132	0.0085	0.1206	-----	0.0	0.612	4	0.9617
6 : 15169696 : SNP	a	c	0.0554	0.0074	0.0467	0.0647	-0.0240	0.0198	0.2272	-+??-	0.0	1.795	2	0.4076
5 : 96657785 : SNP	a	g	0.5437	0.0136	0.5309	0.5755	-0.0010	0.0085	0.908	-+--+	20.9	5.058	4	0.2814
10 : 130947035 : SNP	t	c	0.5228	0.0102	0.5058	0.5508	0.0106	0.0122	0.3833	+-+++	0.0	2.637	4	0.6202
13 : 109529548 : SNP	c	g	0.8734	0.0044	0.8656	0.8772	0.0115	0.0128	0.3693	++-+-	32.0	5.884	4	0.208
20 : 49073892 : SNP	a	g	0.2306	0.0217	0.1840	0.2528	0.0079	0.0105	0.4513	++--+	0.0	1.556	4	0.8166
17 : 56518301 : INDEL	i	r	0.2131	0.0197	0.2023	0.2552	-0.0234	0.0105	0.02601	-----	0.0	0.542	4	0.9692
1 : 111002370 : SNP	t	c	0.9716	0.0000	0.9716	0.9716	0.0030	0.0485	0.9507	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 100624164 : SNP	t	c	0.8510	0.0070	0.8357	0.8638	0.0161	0.0136	0.2375	+++-+	17.2	4.830	4	0.3052
3 : 163120367 : SNP	t	c	0.8627	0.0108	0.8343	0.8754	0.0324	0.0144	0.02452	++-++	0.0	2.000	4	0.7358
14 : 30575110 : SNP	a	g	0.9495	0.0091	0.9368	0.9561	-0.0052	0.0329	0.8736	-???+	79.3	4.829	1	0.02798
10 : 69088407 : SNP	a	g	0.5307	0.0216	0.4745	0.5506	0.0124	0.0087	0.1555	++-++	0.0	1.656	4	0.7987
4 : 161122075 : SNP	a	t	0.0495	0.0022	0.0478	0.0523	-0.0302	0.0237	0.2024	--???	0.0	0.002	1	0.9672
14 : 85737357 : SNP	c	g	0.1546	0.0061	0.1343	0.1578	0.0222	0.0120	0.06346	+-+-+	0.0	3.611	4	0.4612
3 : 22247449 : SNP	t	c	0.8595	0.0062	0.8462	0.8715	0.0049	0.0122	0.6881	++--+	0.0	3.735	4	0.443
15 : 46476157 : SNP	a	g	0.5929	0.0227	0.5433	0.6160	-0.0027	0.0085	0.7532	--++-	40.9	6.763	4	0.1489
22 : 34161718 : SNP	t	c	0.1767	0.0092	0.1650	0.1855	-0.0004	0.0120	0.9744	+-+--	0.0	2.394	4	0.6637
14 : 61664876 : INDEL	d	r	0.2694	0.0043	0.2540	0.2722	-0.0056	0.0098	0.5662	-+--+	0.0	2.003	4	0.7352
8 : 13918349 : SNP	a	g	0.5571	0.0114	0.5383	0.5895	-0.0115	0.0085	0.1771	-----	0.0	3.812	4	0.4321
14 : 83072074 : SNP	t	c	0.0485	0.0020	0.0462	0.0514	0.0108	0.0212	0.6107	++??-	81.0	10.536	2	0.005155
13 : 113008064 : SNP	t	c	0.8522	0.0073	0.8241	0.8592	0.0124	0.0121	0.3049	+-+++	0.0	2.404	4	0.6619
2 : 160495225 : INDEL	i	r	0.3713	0.0237	0.3224	0.4231	0.0072	0.0091	0.4314	+-+-+	49.9	7.987	4	0.09206
3 : 20335581 : SNP	c	g	0.6213	0.0095	0.6013	0.6339	0.0126	0.0091	0.1653	++-+-	16.5	4.789	4	0.3097
15 : 80464669 : SNP	a	g	0.7251	0.0114	0.7072	0.7360	0.0168	0.0097	0.08335	+++++	0.0	1.200	4	0.8782
19 : 35280692 : SNP	t	c	0.0349	0.0016	0.0341	0.0383	-0.0002	0.0255	0.9928	+-??+	44.3	3.592	2	0.1659
4 : 31994073 : INDEL	i	r	0.6840	0.0204	0.6726	0.7366	-0.0018	0.0092	0.8417	-++-+	35.2	6.168	4	0.1869
3 : 192670768 : SNP	a	g	0.5104	0.0170	0.4977	0.5366	0.0005	0.0091	0.9539	+--+-	0.0	2.938	4	0.5682
3 : 34748290 : SNP	a	c	0.1672	0.0150	0.1483	0.1945	0.0029	0.0133	0.8284	0-+++	18.3	4.894	4	0.2983
8 : 1098938 : SNP	a	g	0.6619	0.0037	0.6529	0.6655	0.0065	0.0091	0.477	+-+++	0.0	0.995	4	0.9105
20 : 2106355 : SNP	a	g	0.3979	0.0039	0.3873	0.4050	-0.0050	0.0089	0.5696	0-+--	0.0	3.768	4	0.4383
5 : 22656335 : SNP	a	g	0.0671	0.0116	0.0547	0.0865	0.0155	0.0183	0.3954	+-?-+	0.0	1.992	3	0.5741
7 : 143124105 : SNP	c	g	0.0243	0.0000	0.0243	0.0243	0.0010	0.0596	0.9866	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 25313268 : SNP	a	g	0.1271	0.0177	0.1168	0.1632	0.0007	0.0129	0.9579	+----	0.0	1.507	4	0.8254
9 : 110570206 : SNP	a	c	0.9112	0.0055	0.9012	0.9250	0.0098	0.0154	0.5223	+++--	0.0	2.782	4	0.5949
7 : 215202 : SNP	a	g	0.1068	0.0053	0.0975	0.1098	-0.0050	0.0367	0.8927	???-+	0.0	0.813	1	0.3672
3 : 16779060 : SNP	a	t	0.9262	0.0031	0.9241	0.9346	-0.0236	0.0168	0.1617	--?--	0.0	0.234	3	0.972
3 : 40256184 : SNP	c	g	0.9467	0.0046	0.9403	0.9517	0.0043	0.0198	0.8287	++??-	82.2	11.251	2	0.003604
5 : 120368378 : SNP	a	g	0.8322	0.0158	0.8034	0.8436	0.0381	0.0138	0.005595	+++++	0.0	0.470	4	0.9764
6 : 31161247 : SNP	t	c	0.9294	0.0058	0.9197	0.9329	0.0121	0.0387	0.7547	???+-	0.0	0.444	1	0.505
15 : 85101311 : SNP	c	g	0.0352	0.0000	0.0352	0.0352	0.0510	0.0394	0.1958	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 113732319 : SNP	t	c	0.1328	0.0102	0.1158	0.1455	-0.0060	0.0124	0.6322	+--+-	13.1	4.604	4	0.3304
3 : 83241703 : SNP	t	c	0.4654	0.0220	0.4474	0.5160	-0.0027	0.0089	0.7639	+---+	0.0	2.936	4	0.5686
19 : 52163278 : SNP	a	t	0.8502	0.0183	0.8119	0.8903	0.0185	0.0119	0.1195	+++-+	0.0	3.065	4	0.5471
5 : 171210392 : SNP	t	c	0.3111	0.0117	0.3009	0.3399	0.0109	0.0091	0.2328	++++-	0.0	1.540	4	0.8195
8 : 1008103 : SNP	a	g	0.2476	0.0209	0.1895	0.2643	0.0041	0.0100	0.6819	+----	0.0	2.910	4	0.573
11 : 55725218 : SNP	c	g	0.8733	0.0201	0.8553	0.9264	-0.0132	0.0131	0.3132	---++	0.0	3.304	4	0.5083
4 : 39701948 : SNP	t	c	0.0520	0.0015	0.0506	0.0544	0.0202	0.0230	0.3805	++??-	0.0	0.361	2	0.8347
18 : 39400552 : SNP	t	c	0.9333	0.0053	0.9193	0.9399	0.0056	0.0178	0.7545	+-?++	0.0	0.554	3	0.9069
8 : 25210093 : INDEL	d	r	0.0287	0.0070	0.0216	0.0357	0.0114	0.0313	0.7165	-+???	24.4	1.323	1	0.25
12 : 6274352 : SNP	a	g	0.6290	0.0237	0.5668	0.6627	0.0137	0.0088	0.1187	+--++	0.0	2.165	4	0.7055
20 : 55659653 : SNP	t	c	0.0700	0.0042	0.0633	0.0732	0.0164	0.0181	0.3639	-+?++	0.0	2.982	3	0.3943
18 : 22627578 : SNP	a	g	0.1766	0.0189	0.1638	0.2143	-0.0245	0.0111	0.02728	--+--	27.7	5.535	4	0.2366
6 : 107104053 : SNP	a	g	0.9350	0.0057	0.9311	0.9495	-0.0201	0.0201	0.3172	--??+	0.0	0.720	2	0.6978
5 : 168258297 : SNP	a	g	0.5696	0.0049	0.5668	0.5793	0.0043	0.0086	0.6149	++++-	0.0	0.280	4	0.991
2 : 112511619 : INDEL	i	r	0.0712	0.0000	0.0712	0.0712	0.1159	0.0651	0.07502	????+	0.0	0.000	0	1
9 : 106275874 : INDEL	d	r	0.0187	0.0000	0.0187	0.0187	-0.0170	0.0455	0.7086	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 30963685 : SNP	t	c	0.7300	0.0111	0.7203	0.7535	-0.0227	0.0148	0.1251	?-+--	5.8	3.184	3	0.3641
2 : 179216548 : INDEL	i	r	0.0167	0.0000	0.0167	0.0167	-0.0220	0.0495	0.6569	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 12382866 : SNP	a	t	0.3235	0.0101	0.3103	0.3385	0.0041	0.0092	0.6546	+-+-+	8.3	4.362	4	0.3592
20 : 46125385 : INDEL	i	r	0.4179	0.0174	0.3974	0.4572	0.0048	0.0085	0.5743	++--+	9.9	4.438	4	0.3499
9 : 14442490 : SNP	t	c	0.4094	0.0072	0.3924	0.4144	-0.0095	0.0086	0.27	--++-	0.0	0.990	4	0.9114
19 : 8796421 : SNP	t	c	0.9197	0.0096	0.9060	0.9330	-0.0157	0.0189	0.4057	--?++	0.0	1.603	3	0.6588
11 : 5714878 : SNP	a	g	0.0343	0.0042	0.0295	0.0422	-0.0232	0.0247	0.346	-+??-	16.1	2.384	2	0.3037
17 : 74702300 : SNP	a	g	0.7873	0.0093	0.7722	0.8086	0.0157	0.0153	0.3067	+-+++	40.1	6.679	4	0.1539
6 : 124578330 : INDEL	d	r	0.2952	0.0088	0.2843	0.3085	0.0075	0.0097	0.4389	++++-	49.1	7.854	4	0.09709
5 : 121678005 : SNP	a	c	0.1872	0.0128	0.1585	0.2194	-0.0016	0.0113	0.8901	+---+	0.0	3.111	4	0.5394
11 : 120346414 : INDEL	d	r	0.2391	0.0069	0.2318	0.2474	0.0066	0.0103	0.5185	+----	41.0	6.780	4	0.148
2 : 71072548 : SNP	c	g	0.0176	0.0000	0.0176	0.0176	-0.0550	0.0485	0.257	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 115305479 : SNP	t	c	0.0378	0.0023	0.0344	0.0394	0.0014	0.0274	0.9606	-+???	47.9	1.918	1	0.166
4 : 94995859 : SNP	a	g	0.5873	0.0040	0.5769	0.5963	0.0087	0.0086	0.3106	-++-+	75.5	16.322	4	0.002616
8 : 9197250 : SNP	a	g	0.7901	0.0066	0.7791	0.7998	0.0120	0.0106	0.2577	++-+-	0.0	3.535	4	0.4726
5 : 29856732 : SNP	t	c	0.7497	0.0139	0.7374	0.7750	0.0038	0.0101	0.7085	++-+-	24.9	5.329	4	0.2552
1 : 181179048 : SNP	t	c	0.0461	0.0035	0.0408	0.0497	-0.0422	0.0217	0.05217	--??-	0.0	0.589	2	0.7448
4 : 182895078 : SNP	a	g	0.4466	0.0116	0.4213	0.4687	-0.0007	0.0085	0.9373	-+--+	0.0	3.349	4	0.5013
4 : 61306272 : SNP	a	g	0.0565	0.0045	0.0503	0.0604	0.0248	0.0192	0.1959	++??-	40.4	3.358	2	0.1866
17 : 64491214 : SNP	t	g	0.0342	0.0000	0.0342	0.0342	-0.0050	0.0384	0.8964	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 138160473 : SNP	t	c	0.5287	0.0052	0.5162	0.5401	0.0028	0.0085	0.7455	++-+-	0.0	1.126	4	0.8902
9 : 30531968 : SNP	a	g	0.9149	0.0046	0.9041	0.9177	0.0218	0.0154	0.1572	+++--	34.3	6.089	4	0.1926
15 : 56512649 : SNP	t	c	0.1259	0.0086	0.1067	0.1439	0.0145	0.0134	0.2788	++---	0.0	2.927	4	0.57
19 : 51372395 : SNP	t	c	0.5341	0.0051	0.5214	0.5407	0.0106	0.0085	0.2145	-++++	0.0	3.674	4	0.452
20 : 46855167 : SNP	t	g	0.0872	0.0052	0.0800	0.0955	-0.0029	0.0155	0.8524	---++	30.3	5.738	4	0.2196
5 : 21175062 : INDEL	d	r	0.1003	0.0114	0.0825	0.1186	0.0019	0.0145	0.8937	--+++	15.5	4.736	4	0.3155
16 : 1867841 : SNP	c	g	0.0679	0.0044	0.0579	0.0706	-0.0027	0.0172	0.8752	-+?--	0.0	2.507	3	0.474
1 : 34866656 : SNP	t	c	0.5094	0.0069	0.5055	0.5383	-0.0017	0.0086	0.8403	+---+	23.2	5.207	4	0.2667
14 : 67826910 : SNP	a	g	0.9705	0.0100	0.9567	0.9778	0.0131	0.0335	0.6955	+???-	0.0	0.238	1	0.6259
2 : 172829964 : SNP	t	c	0.9697	0.0000	0.9697	0.9697	-0.0210	0.0364	0.5639	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 32856588 : SNP	c	g	0.0259	0.0000	0.0259	0.0259	0.0640	0.0495	0.1963	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 26853916 : SNP	t	c	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	0.0180	0.0414	0.6641	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 89799478 : SNP	a	t	0.2049	0.0096	0.1848	0.2163	-0.0000	0.0107	0.9977	--++-	0.0	2.495	4	0.6455
5 : 82214821 : SNP	t	c	0.1816	0.0137	0.1513	0.1940	-0.0011	0.0146	0.9371	+-+--	0.0	3.185	4	0.5274
5 : 86779818 : SNP	a	g	0.0225	0.0000	0.0225	0.0225	-0.0090	0.0425	0.8321	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 95769048 : SNP	a	g	0.7931	0.0222	0.7436	0.8052	0.0263	0.0109	0.01543	+++++	50.6	8.101	4	0.08795
2 : 212805874 : SNP	t	c	0.9570	0.0143	0.9298	0.9668	0.0289	0.0229	0.2066	++??-	0.0	0.946	2	0.6232
2 : 189069658 : SNP	a	g	0.8050	0.0148	0.7880	0.8336	-0.0094	0.0106	0.3787	--++-	17.6	4.851	4	0.3029
9 : 133497929 : SNP	a	g	0.9591	0.0039	0.9544	0.9624	0.0135	0.0256	0.5977	-+???	69.3	3.254	1	0.07124
8 : 131707107 : SNP	a	g	0.0216	0.0000	0.0216	0.0216	-0.0190	0.0414	0.6466	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 96785087 : SNP	t	c	0.0489	0.0021	0.0463	0.0508	-0.0061	0.0230	0.7898	-+??+	68.8	6.407	2	0.04063
3 : 80356904 : SNP	c	g	0.0767	0.0037	0.0708	0.0798	0.0153	0.0167	0.3573	++?++	0.0	1.212	3	0.7502
10 : 115327683 : INDEL	d	r	0.3057	0.0118	0.2966	0.3279	-0.0141	0.0105	0.1787	--++-	10.4	4.464	4	0.3468
7 : 26469714 : SNP	c	g	0.6718	0.0129	0.6520	0.6843	0.0102	0.0091	0.2652	+++--	0.0	2.831	4	0.5865
14 : 102086686 : SNP	a	c	0.0388	0.0057	0.0348	0.0469	0.0479	0.0372	0.1979	+???+	0.0	0.024	1	0.8765
12 : 71090081 : INDEL	d	r	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	-0.0160	0.0566	0.7775	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 52160893 : SNP	a	g	0.3172	0.0072	0.3126	0.3452	-0.0002	0.0092	0.9794	-+--+	0.0	0.990	4	0.9112
12 : 11233113 : SNP	t	c	0.1027	0.0088	0.0866	0.1075	0.0502	0.0421	0.2333	???++	0.0	0.011	1	0.9175
6 : 141925480 : SNP	t	c	0.7804	0.0077	0.7599	0.7905	-0.0028	0.0106	0.7882	+--+-	0.0	3.135	4	0.5355
3 : 163539483 : SNP	t	g	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	-0.0530	0.0566	0.3491	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 35280971 : SNP	t	c	0.0315	0.0038	0.0280	0.0377	0.0020	0.0264	0.9396	-+??-	67.6	6.181	2	0.04549
18 : 63494161 : SNP	t	c	0.7124	0.0192	0.6675	0.7375	-0.0035	0.0093	0.7085	+++--	0.0	3.404	4	0.4926
7 : 153373747 : SNP	c	g	0.0602	0.0047	0.0567	0.0673	0.0086	0.0186	0.6435	++?-+	0.0	2.009	3	0.5705
2 : 173379334 : SNP	t	g	0.8843	0.0125	0.8594	0.8925	-0.0010	0.0142	0.9452	-+?--	24.6	3.977	3	0.2639
1 : 160169230 : SNP	a	g	0.0324	0.0008	0.0314	0.0330	-0.0195	0.0288	0.4978	--???	0.0	0.113	1	0.7366
13 : 95926131 : SNP	a	g	0.2280	0.0135	0.2117	0.2670	-0.0082	0.0106	0.4352	--++-	51.6	8.265	4	0.08234
12 : 15221301 : SNP	a	g	0.7580	0.0124	0.7327	0.7845	0.0110	0.0100	0.2736	+-+-+	0.0	1.054	4	0.9016
4 : 95750023 : SNP	a	g	0.5623	0.0088	0.5548	0.5902	0.0078	0.0085	0.3585	+-+-+	45.2	7.306	4	0.1206
2 : 161029218 : SNP	a	g	0.4266	0.0289	0.3630	0.4521	-0.0001	0.0086	0.9944	++---	31.5	5.841	4	0.2114
3 : 64103135 : SNP	t	c	0.8123	0.0097	0.8004	0.8296	-0.0023	0.0111	0.8393	-+++-	0.0	2.168	4	0.7049
11 : 117054709 : SNP	c	g	0.9431	0.0028	0.9406	0.9469	0.0249	0.0195	0.201	+-??+	51.5	4.122	2	0.1273
4 : 19606947 : SNP	a	g	0.2110	0.0102	0.1948	0.2203	-0.0057	0.0103	0.5793	--+--	0.0	3.813	4	0.4319
2 : 215115922 : SNP	t	c	0.0104	0.0000	0.0104	0.0104	-0.0170	0.0596	0.7756	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 129420194 : SNP	t	c	0.1495	0.0153	0.1133	0.1657	0.0042	0.0122	0.7324	-+-+-	0.0	2.225	4	0.6945
3 : 140705369 : SNP	c	g	0.9574	0.0061	0.9464	0.9643	0.0077	0.0229	0.7352	++??-	57.5	4.704	2	0.09517
1 : 55317685 : SNP	a	g	0.2049	0.0111	0.1962	0.2275	0.0002	0.0106	0.9862	-++-+	0.0	2.181	4	0.7024
22 : 39372015 : SNP	t	c	0.3977	0.0137	0.3733	0.4198	0.0067	0.0133	0.6117	+--+-	42.7	6.983	4	0.1368
7 : 32123836 : SNP	t	g	0.9838	0.0000	0.9838	0.9838	0.0500	0.0516	0.3321	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 87707024 : SNP	t	g	0.8724	0.0119	0.8393	0.8798	0.0112	0.0139	0.4221	+-+++	41.5	6.832	4	0.145
4 : 71979529 : SNP	a	c	0.9695	0.0043	0.9638	0.9727	0.0109	0.0300	0.7158	+0???	0.0	0.074	1	0.7855
11 : 117823425 : SNP	a	g	0.4343	0.0064	0.4234	0.4620	0.0036	0.0086	0.6759	+---+	0.0	1.698	4	0.7911
5 : 21697670 : SNP	t	c	0.9677	0.0029	0.9618	0.9703	-0.0015	0.0249	0.9524	++??-	0.0	0.402	2	0.818
8 : 136841715 : SNP	t	c	0.6573	0.0130	0.6504	0.6846	0.0112	0.0092	0.2238	0++-+	0.0	3.922	4	0.4166
6 : 11902804 : SNP	t	c	0.0686	0.0044	0.0641	0.0789	0.0050	0.0176	0.7781	+-?--	0.0	0.654	3	0.8839
18 : 963538 : SNP	a	g	0.0139	0.0000	0.0139	0.0139	-0.0560	0.0596	0.3478	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 16713555 : SNP	c	g	0.1276	0.0113	0.1110	0.1454	-0.0162	0.0129	0.2091	--+--	11.1	4.499	4	0.3427
4 : 91669114 : SNP	a	c	0.4062	0.0215	0.3820	0.4475	-0.0056	0.0091	0.5395	-+---	30.1	5.725	4	0.2206
7 : 37294680 : SNP	a	g	0.7114	0.0156	0.6788	0.7206	-0.0126	0.0093	0.1744	----+	0.0	3.604	4	0.4622
20 : 22127894 : SNP	t	c	0.9616	0.0006	0.9609	0.9621	0.0011	0.0249	0.9638	+-???	70.3	3.366	1	0.06656
8 : 19400825 : SNP	c	g	0.0305	0.0000	0.0305	0.0305	0.0120	0.0374	0.7483	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 81618519 : SNP	a	g	0.9292	0.0114	0.9078	0.9401	-0.0095	0.0170	0.5752	-+?-+	48.6	5.841	3	0.1196
11 : 114614517 : INDEL	d	r	0.0878	0.0062	0.0847	0.1079	-0.0069	0.0151	0.6486	+--+-	0.0	1.818	4	0.7692
14 : 68225375 : SNP	t	c	0.0539	0.0027	0.0523	0.0584	0.0598	0.0305	0.04983	+???+	0.0	0.010	1	0.92
19 : 16073235 : SNP	t	c	0.2391	0.0211	0.2265	0.2810	0.0113	0.0099	0.2562	++--+	37.8	6.435	4	0.1689
8 : 13716524 : SNP	t	g	0.2924	0.0266	0.2369	0.3178	0.0096	0.0120	0.4235	++++-	0.0	3.570	4	0.4673
9 : 24970615 : SNP	a	g	0.0297	0.0011	0.0287	0.0309	0.0236	0.0289	0.4153	++???	0.0	0.423	1	0.5155
11 : 121822656 : SNP	a	g	0.5750	0.0047	0.5591	0.5804	0.0011	0.0086	0.9013	-+--+	21.2	5.077	4	0.2795
15 : 56003916 : INDEL	i	r	0.0793	0.0098	0.0652	0.0931	-0.0299	0.0165	0.07004	--?--	30.4	4.311	3	0.2298
2 : 153434689 : SNP	t	g	0.8495	0.0221	0.7947	0.8708	0.0036	0.0117	0.7593	+-+++	0.0	3.504	4	0.4773
21 : 33849257 : INDEL	i	r	0.0195	0.0000	0.0195	0.0195	-0.0040	0.0475	0.9329	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 35798624 : SNP	t	g	0.9457	0.0020	0.9442	0.9484	-0.0082	0.0212	0.6994	+-???	0.0	0.726	1	0.3942
4 : 4010842 : SNP	a	t	0.7722	0.0059	0.7592	0.7759	0.0039	0.0286	0.8913	??-++	21.6	2.551	2	0.2792
12 : 82526972 : SNP	t	g	0.0735	0.0052	0.0671	0.0781	0.0070	0.0181	0.7006	++??-	60.1	5.013	2	0.08156
6 : 161948803 : SNP	c	g	0.0547	0.0084	0.0482	0.0707	-0.0323	0.0197	0.1006	-+?--	0.0	2.431	3	0.4878
2 : 171925228 : SNP	t	c	0.3847	0.0333	0.3664	0.4627	0.0082	0.0087	0.3466	+++--	0.0	3.093	4	0.5424
18 : 22108362 : SNP	t	c	0.1189	0.0069	0.1102	0.1438	-0.0103	0.0132	0.4322	+-+--	4.3	4.181	4	0.382
1 : 224361454 : SNP	a	g	0.8486	0.0166	0.8146	0.8611	-0.0014	0.0123	0.9064	-++--	52.5	8.415	4	0.07752
2 : 31557347 : SNP	t	c	0.6560	0.0021	0.6541	0.6659	0.0005	0.0091	0.9583	+--+-	48.3	7.734	4	0.1018
1 : 6578067 : SNP	a	c	0.1347	0.0150	0.1111	0.1535	0.0037	0.0139	0.7894	-++-+	0.0	2.025	4	0.7312
11 : 39951653 : INDEL	i	r	0.1983	0.0153	0.1872	0.2279	0.0041	0.0108	0.7036	-+--+	2.9	4.119	4	0.3901
12 : 2860193 : INDEL	i	r	0.8540	0.0078	0.8344	0.8603	0.0037	0.0124	0.7649	+--++	31.6	5.844	4	0.2111
12 : 67651408 : SNP	t	c	0.7165	0.0253	0.6956	0.7699	0.0028	0.0096	0.7748	++-+-	0.0	1.477	4	0.8308
15 : 52458805 : SNP	t	c	0.7983	0.0157	0.7665	0.8174	-0.0230	0.0107	0.03198	-----	0.0	3.731	4	0.4436
7 : 139873174 : SNP	c	g	0.9562	0.0030	0.9509	0.9599	-0.0090	0.0226	0.6907	+-??-	0.0	0.328	2	0.8487
19 : 3013227 : SNP	a	g	0.7135	0.0223	0.6911	0.7638	0.0124	0.0110	0.2598	+0+--	42.0	6.892	4	0.1417
21 : 44383072 : SNP	t	c	0.3608	0.0332	0.2947	0.4009	0.0048	0.0098	0.6258	+-+++	0.0	0.466	4	0.9767
2 : 199800232 : SNP	t	c	0.3015	0.0202	0.2528	0.3205	-0.0026	0.0093	0.7781	-+--+	0.0	1.675	4	0.7953
3 : 116996709 : SNP	t	c	0.7785	0.0205	0.7266	0.7910	0.0134	0.0105	0.2012	+++--	0.0	2.789	4	0.5937
2 : 240751463 : INDEL	d	r	0.1219	0.0079	0.1024	0.1554	-0.0084	0.0142	0.5558	--++-	0.0	1.420	4	0.8408
17 : 53533337 : SNP	a	g	0.9048	0.0081	0.8847	0.9164	0.0114	0.0153	0.4582	-++-+	16.7	4.800	4	0.3084
8 : 107251414 : SNP	a	c	0.9310	0.0084	0.9257	0.9513	0.0000	0.0189	0.9999	+-?+-	37.0	4.764	3	0.1899
8 : 114909016 : SNP	t	c	0.8475	0.0061	0.8422	0.8647	-0.0061	0.0120	0.6088	---++	0.0	3.962	4	0.4111
9 : 75877116 : SNP	a	g	0.3530	0.0097	0.3374	0.3617	0.0073	0.0088	0.403	0+++-	0.0	3.300	4	0.5089
2 : 41831812 : SNP	a	g	0.1035	0.0116	0.0694	0.1134	0.0088	0.0154	0.5701	+-+-+	0.0	2.572	4	0.6317
6 : 81455009 : SNP	a	g	0.0418	0.0027	0.0355	0.0444	0.0387	0.0221	0.08019	++??-	0.0	0.680	2	0.7119
1 : 181401494 : SNP	t	c	0.4670	0.0205	0.4227	0.4843	0.0044	0.0085	0.6065	+-+-+	30.6	5.767	4	0.2172
11 : 89502376 : SNP	a	c	0.5658	0.0226	0.5337	0.6060	-0.0174	0.0217	0.4222	??---	0.0	0.587	2	0.7455
1 : 71175522 : SNP	a	g	0.2921	0.0100	0.2779	0.3122	-0.0085	0.0098	0.3834	----+	0.0	1.368	4	0.8498
5 : 144219860 : SNP	a	g	0.8523	0.0054	0.8405	0.8577	0.0018	0.0119	0.8805	+---+	30.5	5.753	4	0.2184
6 : 130604511 : SNP	a	g	0.7026	0.0045	0.6924	0.7055	-0.0038	0.0092	0.6759	-+-++	47.6	7.635	4	0.1059
15 : 87090137 : SNP	t	c	0.9551	0.0043	0.9493	0.9584	0.0291	0.0215	0.1749	++??+	0.0	0.471	2	0.7902
2 : 23253337 : SNP	c	g	0.8167	0.0133	0.7968	0.8367	0.0203	0.0113	0.07295	++-++	0.0	1.157	4	0.8851
5 : 106116276 : SNP	t	g	0.4312	0.0095	0.4109	0.4390	0.0125	0.0085	0.1435	+++++	0.0	0.733	4	0.9472
6 : 25305147 : SNP	a	g	0.9545	0.0036	0.9507	0.9580	0.0036	0.0218	0.8692	-+??+	0.0	0.264	2	0.8762
2 : 210520023 : SNP	t	c	0.9796	0.0000	0.9796	0.9796	0.0000	0.0465	1	0????	0.0	0.000	0	1
11 : 19763042 : INDEL	d	r	0.2211	0.0125	0.2035	0.2360	0.0020	0.0106	0.852	-+-+-	0.0	3.010	4	0.5561
7 : 53857154 : SNP	a	g	0.1013	0.0082	0.0837	0.1120	0.0103	0.0143	0.47	++++-	0.0	2.435	4	0.6562
6 : 52529666 : SNP	a	c	0.7990	0.0034	0.7880	0.8057	0.0081	0.0107	0.4479	+++--	67.9	12.462	4	0.01423
2 : 62637094 : SNP	a	g	0.9792	0.0000	0.9792	0.9792	0.0190	0.0485	0.6954	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 57595677 : SNP	a	g	0.1280	0.0202	0.0956	0.1561	0.0120	0.0176	0.4966	++?++	0.0	0.440	3	0.9318
22 : 27293494 : SNP	t	g	0.6573	0.0186	0.6442	0.7055	-0.0016	0.0092	0.8629	-++--	56.7	9.243	4	0.05531
22 : 20997645 : SNP	a	g	0.1892	0.0213	0.1641	0.2266	-0.0091	0.0118	0.4422	+-+--	0.0	2.019	4	0.7322
3 : 98460301 : SNP	t	c	0.0130	0.0000	0.0130	0.0130	-0.0220	0.0576	0.7026	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 38825883 : SNP	t	g	0.1502	0.0058	0.1463	0.1672	0.0072	0.0121	0.5474	++--+	0.0	0.868	4	0.9291
3 : 190337657 : SNP	a	g	0.9502	0.0053	0.9403	0.9547	0.0099	0.0214	0.643	-+??+	0.0	1.608	2	0.4475
2 : 31323530 : SNP	a	g	0.0195	0.0000	0.0195	0.0195	-0.0770	0.0465	0.09774	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 161839507 : SNP	t	c	0.1766	0.0098	0.1516	0.2135	-0.0115	0.0113	0.3101	-----	0.0	1.264	4	0.8675
13 : 77364599 : SNP	t	c	0.9657	0.0050	0.9566	0.9723	0.0306	0.0244	0.2099	++??+	0.0	1.060	2	0.5885
14 : 60928201 : SNP	a	g	0.9133	0.0082	0.8961	0.9184	0.0060	0.0154	0.6989	-+?-+	0.0	1.975	3	0.5777
13 : 81060103 : SNP	t	c	0.3664	0.0196	0.3197	0.3997	-0.0047	0.0090	0.6012	0--+-	0.0	1.613	4	0.8064
4 : 87763887 : SNP	a	c	0.8480	0.0047	0.8341	0.8592	-0.0087	0.0125	0.4872	--+++	0.0	3.212	4	0.523
15 : 83611095 : SNP	t	c	0.1048	0.0058	0.0998	0.1171	0.0024	0.0139	0.8648	++--+	0.0	3.227	4	0.5206
5 : 144952379 : SNP	t	c	0.9823	0.0000	0.9823	0.9823	0.0280	0.0485	0.5639	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 84848873 : SNP	t	c	0.0284	0.0000	0.0284	0.0284	-0.0080	0.0425	0.8505	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 21764019 : SNP	a	g	0.2417	0.0061	0.2320	0.2476	-0.0009	0.0100	0.9303	+-++-	0.0	2.795	4	0.5927
15 : 91355608 : SNP	a	t	0.9778	0.0000	0.9778	0.9778	0.0490	0.0607	0.4192	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 64020391 : SNP	t	c	0.0438	0.0037	0.0360	0.0479	0.0105	0.0215	0.6267	0+??+	0.0	0.281	2	0.8688
5 : 124128272 : SNP	a	g	0.0408	0.0000	0.0408	0.0408	-0.0120	0.0394	0.7608	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 108193357 : SNP	a	g	0.0260	0.0000	0.0260	0.0260	-0.0070	0.0455	0.8777	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 43417715 : INDEL	d	r	0.2883	0.0165	0.2773	0.3469	0.0069	0.0093	0.4606	+--+-	50.7	8.114	4	0.08751
5 : 139568764 : SNP	a	g	0.2087	0.0039	0.1963	0.2116	-0.0267	0.0106	0.01188	-----	33.4	6.002	4	0.199
6 : 81042243 : SNP	a	g	0.1738	0.0092	0.1550	0.1900	0.0076	0.0113	0.5006	-++-+	0.0	2.021	4	0.7319
15 : 91343636 : SNP	t	g	0.1797	0.0153	0.1476	0.2053	0.0258	0.0112	0.02143	+-+++	36.1	6.264	4	0.1803
1 : 40524690 : SNP	a	t	0.2698	0.0164	0.2327	0.2782	-0.0173	0.0095	0.06759	--++-	30.2	5.734	4	0.2199
4 : 73797562 : SNP	t	c	0.7519	0.0272	0.7333	0.8167	0.0300	0.0099	0.002488	+++++	0.0	1.508	4	0.8252
1 : 99577988 : SNP	t	g	0.0760	0.0030	0.0738	0.0867	-0.0217	0.0162	0.1801	--?--	0.0	1.686	3	0.6401
19 : 20240258 : SNP	c	g	0.1075	0.0066	0.1013	0.1195	-0.0018	0.0137	0.893	+--+-	0.0	0.072	4	0.9994
1 : 90598712 : SNP	a	g	0.3177	0.0094	0.3095	0.3393	0.0001	0.0093	0.9941	---++	0.0	1.612	4	0.8066
2 : 190611084 : SNP	t	c	0.2644	0.0092	0.2507	0.2993	0.0066	0.0101	0.5121	++--+	0.0	2.710	4	0.6076
3 : 150752855 : SNP	a	g	0.1384	0.0070	0.1275	0.1488	-0.0125	0.0126	0.3191	-++--	16.0	4.762	4	0.3126
3 : 84631462 : SNP	a	t	0.5842	0.0178	0.5491	0.6079	-0.0002	0.0090	0.9841	+-+++	0.7	4.028	4	0.4022
1 : 10390582 : INDEL	i	r	0.3592	0.0145	0.3415	0.3851	-0.0077	0.0090	0.3942	-++-+	0.0	3.137	4	0.5352
21 : 47736303 : SNP	a	g	0.0490	0.0086	0.0426	0.0646	-0.0053	0.0206	0.7984	-+?+-	0.0	0.883	3	0.8294
20 : 22510539 : SNP	c	g	0.9648	0.0044	0.9578	0.9675	-0.0610	0.0309	0.04841	-???-	0.0	0.879	1	0.3486
18 : 21483356 : SNP	a	t	0.0228	0.0000	0.0228	0.0228	-0.0330	0.0455	0.4682	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 139407234 : SNP	a	g	0.0401	0.0029	0.0371	0.0437	0.0423	0.0278	0.1276	-+??+	61.8	5.236	2	0.07295
16 : 67744292 : INDEL	i	r	0.1120	0.0130	0.1015	0.1374	0.0093	0.0142	0.5137	++---	39.5	6.611	4	0.158
16 : 79515206 : SNP	a	g	0.0247	0.0000	0.0247	0.0247	-0.1020	0.0536	0.05693	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 168228522 : SNP	a	g	0.9101	0.0059	0.9039	0.9277	-0.0294	0.0149	0.0479	-----	0.0	3.453	4	0.485
14 : 21246840 : SNP	t	g	0.2420	0.0130	0.2263	0.2665	-0.0051	0.0100	0.6115	-+---	0.0	3.645	4	0.4562
17 : 71088265 : SNP	a	g	0.1835	0.0063	0.1769	0.2010	0.0144	0.0134	0.2825	+++--	0.0	3.410	4	0.4917
12 : 17468235 : SNP	t	g	0.5442	0.0138	0.5112	0.5543	-0.0046	0.0085	0.5934	-+++-	0.0	2.542	4	0.6371
4 : 186691547 : SNP	a	c	0.8911	0.0072	0.8857	0.9076	-0.0170	0.0147	0.2452	-+--+	24.1	5.269	4	0.2608
5 : 43013954 : SNP	a	c	0.3103	0.0293	0.2392	0.3318	0.0037	0.0093	0.6882	++--+	38.0	6.448	4	0.1681
6 : 119990151 : SNP	a	g	0.9848	0.0000	0.9848	0.9848	-0.0540	0.0505	0.2853	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 46295900 : SNP	a	g	0.9245	0.0098	0.9060	0.9336	0.0075	0.0165	0.6487	++?--	26.2	4.063	3	0.2547
8 : 5654167 : SNP	a	g	0.9365	0.0021	0.9341	0.9408	-0.0012	0.0186	0.9499	+-??-	0.0	0.251	2	0.8822
3 : 25270350 : SNP	t	c	0.8762	0.0128	0.8686	0.9069	0.0032	0.0132	0.8072	+-+--	50.8	8.128	4	0.08699
3 : 141851230 : SNP	a	g	0.1284	0.0040	0.1189	0.1322	0.0178	0.0127	0.1623	+++++	0.0	2.897	4	0.5753
6 : 45595551 : SNP	a	g	0.2576	0.0095	0.2440	0.2747	-0.0006	0.0098	0.9497	-++--	0.0	2.024	4	0.7314
4 : 14144208 : SNP	a	g	0.5936	0.0270	0.5532	0.6348	-0.0210	0.0087	0.01563	-+---	7.7	4.333	4	0.3628
14 : 58112856 : SNP	a	c	0.1346	0.0190	0.1042	0.1473	-0.0052	0.0180	0.773	+-?++	47.4	5.707	3	0.1268
3 : 74963192 : SNP	t	c	0.2236	0.0128	0.1882	0.2332	-0.0099	0.0102	0.3284	-+++-	0.0	3.248	4	0.5172
13 : 85735539 : SNP	t	c	0.8141	0.0082	0.8050	0.8309	-0.0165	0.0111	0.1361	-----	0.0	1.835	4	0.7661
2 : 24384091 : SNP	a	g	0.0722	0.0053	0.0678	0.0830	0.0193	0.0165	0.2422	+---+	0.0	2.045	4	0.7275
5 : 26300552 : SNP	t	c	0.9694	0.0000	0.9694	0.9694	-0.0160	0.0364	0.6602	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 168143028 : SNP	c	g	0.9136	0.0131	0.8878	0.9218	-0.0144	0.0165	0.3839	+-?--	0.0	2.552	3	0.466
7 : 14615577 : SNP	a	g	0.9279	0.0156	0.9080	0.9405	-0.0057	0.0283	0.8414	+??+-	0.0	0.826	2	0.6616
18 : 66163401 : SNP	t	c	0.0224	0.0000	0.0224	0.0224	0.0320	0.0546	0.5577	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 130153987 : SNP	t	c	0.5292	0.0139	0.4966	0.5376	-0.0017	0.0085	0.8435	+++--	0.0	1.656	4	0.7987
8 : 6089844 : SNP	t	c	0.0912	0.0059	0.0864	0.1025	0.0330	0.0148	0.02546	++--+	0.0	1.936	4	0.7476
1 : 103494942 : SNP	t	g	0.3143	0.0064	0.3053	0.3238	-0.0015	0.0093	0.8739	+-+++	0.0	2.206	4	0.698
15 : 92729739 : SNP	t	c	0.0965	0.0098	0.0712	0.1051	0.0110	0.0152	0.4681	++--+	0.0	3.318	4	0.5061
9 : 110833257 : SNP	a	g	0.7057	0.0115	0.6994	0.7293	0.0025	0.0092	0.7851	-++-+	0.0	2.887	4	0.577
7 : 5216883 : SNP	a	g	0.0379	0.0001	0.0378	0.0380	-0.0067	0.0259	0.7943	+-???	84.1	6.288	1	0.01215
12 : 121173809 : INDEL	d	r	0.0650	0.0056	0.0606	0.0762	0.0090	0.0182	0.6208	-+?++	50.6	6.068	3	0.1083
17 : 212343 : SNP	t	c	0.3431	0.0223	0.3210	0.3774	-0.0004	0.0123	0.9766	+--++	0.0	0.896	4	0.9251
17 : 78726403 : SNP	c	g	0.2476	0.0074	0.2295	0.2620	0.0024	0.0099	0.8089	+-++-	44.1	7.160	4	0.1277
17 : 67713614 : SNP	t	c	0.1123	0.0032	0.1095	0.1215	0.0101	0.0136	0.4574	+-+++	0.0	1.334	4	0.8555
22 : 45427765 : SNP	a	g	0.0844	0.0119	0.0728	0.1175	-0.0141	0.0159	0.3763	-+?-+	0.0	2.377	3	0.4979
22 : 49088868 : INDEL	d	r	0.0283	0.0030	0.0258	0.0318	-0.0351	0.0299	0.2415	-+???	56.6	2.304	1	0.129
8 : 34608110 : SNP	a	g	0.8552	0.0070	0.8380	0.8640	-0.0146	0.0120	0.2238	---++	0.0	2.066	4	0.7236
2 : 96686723 : SNP	a	g	0.6462	0.0212	0.6251	0.7214	-0.0064	0.0099	0.5164	----?	0.0	0.090	3	0.9931
6 : 74815484 : SNP	a	t	0.1647	0.0045	0.1609	0.1792	0.0265	0.0113	0.01921	++-+-	0.0	3.705	4	0.4474
14 : 98587669 : SNP	t	c	0.6057	0.0174	0.5691	0.6168	0.0071	0.0085	0.4036	+---+	0.0	3.783	4	0.4361
8 : 70564667 : SNP	a	g	0.9552	0.0055	0.9457	0.9624	0.0380	0.0218	0.08077	++??+	8.2	2.179	2	0.3364
2 : 148114191 : SNP	t	c	0.0145	0.0000	0.0145	0.0145	-0.0280	0.0607	0.6443	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 63051164 : SNP	t	g	0.9431	0.0061	0.9382	0.9527	-0.0364	0.0196	0.06399	+-??-	76.7	8.572	2	0.01376
4 : 113510368 : SNP	t	c	0.9036	0.0058	0.8957	0.9086	0.0072	0.0144	0.6182	+++-+	0.0	0.826	4	0.9349
2 : 211806183 : SNP	t	g	0.1400	0.0128	0.1318	0.1646	0.0005	0.0123	0.9678	-++++	30.2	5.735	4	0.2199
10 : 55592355 : SNP	t	c	0.5767	0.0209	0.5622	0.6324	-0.0140	0.0085	0.1005	-+---	0.0	1.849	4	0.7636
9 : 120255966 : SNP	t	c	0.4930	0.0089	0.4805	0.5016	0.0093	0.0085	0.2717	-+-++	0.0	3.294	4	0.5099
6 : 163101437 : SNP	a	g	0.7865	0.0043	0.7807	0.8066	0.0093	0.0104	0.3744	-++++	23.1	5.204	4	0.267
2 : 139212490 : SNP	a	g	0.6720	0.0072	0.6624	0.6946	0.0085	0.0092	0.3524	++---	56.2	9.138	4	0.05775
7 : 139683375 : SNP	a	g	0.9839	0.0000	0.9839	0.9839	0.0580	0.0505	0.2512	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 73530235 : SNP	t	c	0.1428	0.0083	0.1233	0.1629	0.0104	0.0122	0.3962	++++-	0.0	0.883	4	0.927
1 : 72014193 : SNP	a	g	0.2807	0.0154	0.2426	0.2915	0.0097	0.0094	0.305	+-+-+	0.0	2.478	4	0.6485
21 : 31616086 : INDEL	i	r	0.0493	0.0081	0.0424	0.0634	-0.0253	0.0199	0.2048	--?--	0.0	1.322	3	0.724
15 : 79913113 : SNP	a	g	0.9169	0.0126	0.8932	0.9250	0.0112	0.0160	0.4818	+-?++	25.6	4.030	3	0.2583
9 : 36897799 : SNP	a	c	0.9292	0.0127	0.9038	0.9378	-0.0125	0.0172	0.4688	-+?-+	0.0	1.774	3	0.6206
21 : 37652840 : SNP	t	c	0.1110	0.0054	0.1059	0.1182	0.0115	0.0134	0.3921	+++++	0.0	0.928	4	0.9205
16 : 23923433 : SNP	a	t	0.4046	0.0304	0.3830	0.4654	0.0068	0.0090	0.4495	++++-	0.0	1.725	4	0.7861
5 : 31067897 : SNP	t	c	0.1898	0.0091	0.1792	0.2119	0.0003	0.0109	0.9762	+-++-	0.0	1.810	4	0.7706
16 : 7210609 : SNP	a	t	0.0690	0.0036	0.0617	0.0718	-0.0186	0.0184	0.3125	--??-	0.0	0.095	2	0.9538
6 : 88101092 : INDEL	i	r	0.7488	0.0290	0.6929	0.7746	-0.0221	0.0098	0.0246	-----	0.0	3.894	4	0.4205
1 : 190690248 : SNP	t	c	0.9900	0.0000	0.9900	0.9900	-0.1420	0.0627	0.02347	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 111911775 : SNP	a	g	0.7753	0.0082	0.7683	0.7949	0.0151	0.0102	0.1399	+--+-	59.7	9.919	4	0.04182
4 : 14447457 : SNP	c	g	0.9428	0.0008	0.9425	0.9460	0.0032	0.0188	0.8665	-+?+-	0.0	2.599	3	0.4577
18 : 67345034 : SNP	t	c	0.1924	0.0098	0.1783	0.2065	0.0051	0.0108	0.6332	+++--	0.0	1.184	4	0.8807
8 : 57568540 : SNP	a	g	0.4638	0.0108	0.4572	0.4879	0.0026	0.0086	0.7646	+-+++	0.0	0.669	4	0.9551
14 : 77994283 : SNP	a	c	0.9272	0.0032	0.9236	0.9365	0.0415	0.0171	0.01519	++?-+	0.0	2.924	3	0.4034
14 : 96547201 : SNP	a	g	0.2600	0.0080	0.2431	0.2764	0.0004	0.0098	0.9668	++---	0.0	1.371	4	0.8492
19 : 1792997 : SNP	t	c	0.7338	0.0058	0.6997	0.7399	-0.0051	0.0102	0.6192	-----	0.0	0.203	4	0.9952
20 : 50111125 : SNP	c	g	0.9479	0.0075	0.9340	0.9524	-0.0125	0.0211	0.5523	-+?--	24.4	3.968	3	0.2649
17 : 3407617 : SNP	a	c	0.7223	0.0120	0.7147	0.7541	-0.0029	0.0099	0.7739	-+++-	0.0	3.793	4	0.4347
17 : 26284469 : SNP	t	g	0.7584	0.0099	0.7495	0.7813	-0.0042	0.0107	0.6939	--+-+	0.0	0.463	4	0.977
5 : 89572699 : SNP	a	t	0.4246	0.0287	0.3970	0.4810	-0.0091	0.0087	0.2945	0----	0.0	1.380	4	0.8477
9 : 124551623 : INDEL	d	r	0.1353	0.0035	0.1290	0.1454	0.0067	0.0153	0.6604	-+--+	0.0	3.683	4	0.4506
9 : 30278424 : SNP	t	c	0.1496	0.0087	0.1389	0.1707	-0.0068	0.0119	0.5666	---+-	46.3	7.451	4	0.1139
6 : 168246915 : SNP	t	c	0.0814	0.0046	0.0743	0.0855	0.0309	0.0202	0.1257	+-?++	46.5	5.611	3	0.1321
4 : 64301610 : SNP	a	g	0.1111	0.0104	0.1043	0.1439	-0.0050	0.0138	0.7187	-+--+	12.6	4.577	4	0.3335
4 : 14874376 : SNP	t	c	0.2333	0.0105	0.2193	0.2564	-0.0079	0.0100	0.4258	+--+-	0.0	1.582	4	0.8119
9 : 7554362 : SNP	a	t	0.0117	0.0000	0.0117	0.0117	-0.1300	0.0566	0.02165	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 50778204 : SNP	a	g	0.1177	0.0079	0.0958	0.1349	-0.0051	0.0135	0.7049	+--++	47.3	7.591	4	0.1078
4 : 138429333 : SNP	t	g	0.0725	0.0096	0.0656	0.0892	-0.0153	0.0181	0.3985	-+?+-	0.0	1.975	3	0.5776
2 : 22439743 : SNP	t	c	0.4389	0.0171	0.4112	0.4684	0.0138	0.0091	0.1292	++++-	0.0	2.131	4	0.7117
6 : 29829494 : SNP	a	g	0.0697	0.0038	0.0675	0.0761	-0.0017	0.0390	0.9654	???+-	0.0	0.189	1	0.664
20 : 37283372 : SNP	t	c	0.4457	0.0096	0.4150	0.4526	0.0053	0.0085	0.5385	++---	0.0	3.015	4	0.5553
2 : 163361685 : SNP	a	g	0.9253	0.0086	0.9200	0.9391	-0.0067	0.0223	0.7625	-??++	0.0	0.713	2	0.7003
6 : 45259431 : SNP	a	t	0.3110	0.0083	0.2803	0.3184	-0.0107	0.0092	0.2459	-----	0.0	0.624	4	0.9604
10 : 9689866 : INDEL	d	r	0.0220	0.0000	0.0220	0.0220	-0.0570	0.0516	0.2689	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 19025741 : SNP	c	g	0.2843	0.0118	0.2538	0.2915	-0.0066	0.0095	0.4818	--++-	0.0	1.139	4	0.888
11 : 4567845 : SNP	a	t	0.4070	0.0059	0.3995	0.4201	0.0114	0.0086	0.1818	+--+-	37.8	6.432	4	0.1691
4 : 180755521 : INDEL	i	r	0.1217	0.0055	0.1173	0.1377	-0.0072	0.0129	0.5754	+--++	32.5	5.922	4	0.205
2 : 170973461 : SNP	c	g	0.1287	0.0133	0.0942	0.1381	-0.0149	0.0134	0.2658	--+--	0.0	2.385	4	0.6653
10 : 66994483 : SNP	a	g	0.1043	0.0045	0.0981	0.1112	0.0039	0.0140	0.7817	+-+--	0.0	3.552	4	0.47
14 : 59209182 : SNP	t	c	0.7095	0.0181	0.6744	0.7214	-0.0029	0.0093	0.7589	+-++-	0.0	2.943	4	0.5674
13 : 87025183 : INDEL	d	r	0.0651	0.0041	0.0616	0.0707	-0.0071	0.0183	0.6971	+-?++	53.1	6.398	3	0.09375
13 : 72593586 : INDEL	d	r	0.9672	0.0000	0.9672	0.9672	-0.0550	0.0404	0.1738	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 5664715 : SNP	a	c	0.1102	0.0080	0.1022	0.1219	0.0068	0.0137	0.6215	+++--	20.5	5.034	4	0.2839
3 : 132746676 : SNP	t	c	0.5687	0.0088	0.5620	0.5974	-0.0059	0.0085	0.4898	----+	0.0	1.159	4	0.8848
12 : 119337104 : SNP	a	g	0.1079	0.0089	0.0956	0.1157	0.0113	0.0139	0.4141	++++-	0.0	3.037	4	0.5516
14 : 69064457 : SNP	t	c	0.9046	0.0041	0.8943	0.9084	-0.0252	0.0150	0.09242	--?+-	0.0	0.609	3	0.8943
11 : 75965299 : SNP	t	c	0.0924	0.0078	0.0809	0.1019	-0.0202	0.0149	0.1763	--+--	0.0	2.171	4	0.7043
9 : 98994439 : SNP	a	g	0.4986	0.0150	0.4840	0.5180	-0.0092	0.0086	0.2838	-----	0.0	2.116	4	0.7145
22 : 37949320 : SNP	a	g	0.2837	0.0182	0.2455	0.3229	-0.0037	0.0098	0.7049	-++--	28.5	5.591	4	0.2319
13 : 38233081 : SNP	a	t	0.6182	0.0119	0.6078	0.6339	0.0134	0.0086	0.1178	++-+-	22.8	5.179	4	0.2694
21 : 40491526 : SNP	a	g	0.0873	0.0092	0.0774	0.1050	-0.0036	0.0163	0.827	-0+++	0.0	2.063	4	0.7242
3 : 103830434 : SNP	a	g	0.2114	0.0130	0.2031	0.2443	-0.0220	0.0105	0.03694	--++-	0.0	3.402	4	0.493
9 : 4509691 : SNP	c	g	0.9360	0.0037	0.9343	0.9458	0.0210	0.0181	0.2464	+-??+	0.0	0.915	2	0.633
13 : 109093949 : SNP	c	g	0.0858	0.0057	0.0825	0.0983	0.0119	0.0157	0.4499	-+?-+	37.9	4.830	3	0.1847
2 : 123888634 : SNP	a	g	0.0320	0.0003	0.0318	0.0323	-0.0314	0.0283	0.2667	--???	9.9	1.110	1	0.2922
8 : 100751385 : SNP	t	c	0.0393	0.0004	0.0389	0.0396	-0.0150	0.0249	0.547	--???	0.0	0.135	1	0.7129
13 : 100338361 : SNP	t	c	0.9509	0.0065	0.9438	0.9641	-0.0342	0.0208	0.09904	-+??-	68.6	6.371	2	0.04135
10 : 11244910 : INDEL	d	r	0.7096	0.0158	0.6943	0.7299	0.0040	0.0108	0.707	-++++	0.0	2.816	4	0.5891
12 : 10007897 : SNP	t	c	0.5665	0.0065	0.5590	0.5967	-0.0031	0.0086	0.7199	-+--+	0.0	3.809	4	0.4325
8 : 95917290 : SNP	t	c	0.6560	0.0084	0.6262	0.6617	0.0030	0.0091	0.7408	----+	21.1	5.072	4	0.28
3 : 75176229 : SNP	t	g	0.2165	0.0100	0.1845	0.2241	-0.0075	0.0107	0.4834	-0+++	0.0	2.588	4	0.629
13 : 39854254 : SNP	a	g	0.9503	0.0050	0.9473	0.9587	0.0179	0.0206	0.3853	++??+	0.0	0.503	2	0.7777
4 : 150514543 : SNP	a	g	0.7263	0.0078	0.7205	0.7460	0.0129	0.0098	0.1881	+-+-+	53.5	8.603	4	0.07182
5 : 150623058 : INDEL	d	r	0.2959	0.0273	0.2658	0.3557	-0.0078	0.0092	0.3971	-+++-	3.5	4.146	4	0.3866
6 : 35068947 : SNP	c	g	0.8415	0.0168	0.8139	0.8763	0.0103	0.0119	0.3853	+--++	0.0	1.080	4	0.8974
4 : 154958246 : SNP	a	g	0.8067	0.0049	0.7980	0.8188	0.0076	0.0108	0.478	++---	0.0	1.460	4	0.8338
8 : 110115676 : SNP	t	c	0.3103	0.0154	0.2766	0.3248	-0.0137	0.0092	0.1372	--+--	0.0	2.529	4	0.6394
13 : 39846955 : SNP	a	g	0.3811	0.0163	0.3622	0.3975	-0.0226	0.0092	0.01389	--+--	0.0	3.529	4	0.4735
7 : 96461630 : SNP	a	c	0.0259	0.0000	0.0259	0.0259	-0.0510	0.0394	0.1958	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 26173302 : SNP	a	g	0.6163	0.0108	0.6101	0.6442	-0.0063	0.0089	0.4803	----+	45.8	7.387	4	0.1168
14 : 55220249 : SNP	a	c	0.6928	0.0178	0.6585	0.7129	-0.0041	0.0103	0.6933	-+-+-	0.0	2.252	4	0.6895
9 : 80126470 : SNP	a	c	0.9821	0.0000	0.9821	0.9821	0.0020	0.0566	0.9718	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 55485185 : INDEL	d	r	0.8648	0.0036	0.8508	0.8738	-0.0079	0.0127	0.5352	+-++-	38.5	6.503	4	0.1646
6 : 32354834 : SNP	a	g	0.1464	0.0146	0.1355	0.1718	-0.0057	0.0252	0.8212	??++-	41.0	3.392	2	0.1834
19 : 28211764 : SNP	t	c	0.2996	0.0014	0.2947	0.3025	-0.0161	0.0103	0.1198	+---?	50.0	5.996	3	0.1118
11 : 73936875 : SNP	t	g	0.0161	0.0000	0.0161	0.0161	0.0140	0.0495	0.7775	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 27163976 : SNP	a	g	0.7563	0.0106	0.7401	0.7716	-0.0048	0.0099	0.6279	--+-+	0.0	1.957	4	0.7436
10 : 97371903 : SNP	c	g	0.4867	0.0131	0.4563	0.5074	-0.0036	0.0085	0.6681	+-++-	60.9	10.234	4	0.03666
7 : 49275835 : SNP	t	g	0.7942	0.0111	0.7844	0.8097	-0.0068	0.0106	0.522	--+-+	0.0	0.891	4	0.9259
12 : 11364328 : SNP	t	c	0.0446	0.0064	0.0357	0.0503	0.0016	0.0246	0.9466	--??+	54.7	4.412	2	0.1102
3 : 68878962 : SNP	t	c	0.4715	0.0147	0.4615	0.5115	-0.0091	0.0085	0.283	---+-	70.2	13.414	4	0.00942
6 : 159069940 : SNP	t	g	0.1333	0.0047	0.1227	0.1413	0.0016	0.0125	0.8962	---++	0.0	1.912	4	0.752
9 : 108627215 : SNP	t	g	0.8546	0.0035	0.8486	0.8578	0.0178	0.0128	0.1639	++--+	0.0	1.352	4	0.8525
6 : 70878028 : INDEL	d	r	0.0103	0.0000	0.0103	0.0103	-0.0620	0.0586	0.2903	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 78248511 : SNP	a	g	0.7818	0.0119	0.7755	0.8127	-0.0093	0.0107	0.3828	--+-+	0.0	2.501	4	0.6445
2 : 166903270 : SNP	a	g	0.0559	0.0000	0.0559	0.0559	-0.0300	0.0455	0.5096	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 107460972 : SNP	c	g	0.9526	0.0031	0.9498	0.9574	0.0056	0.0217	0.7947	+-??+	0.0	0.083	2	0.9593
5 : 30051449 : SNP	c	g	0.0539	0.0066	0.0505	0.0771	0.0160	0.0191	0.4001	+-?+-	62.0	7.903	3	0.04807
5 : 153663571 : SNP	t	c	0.0875	0.0092	0.0741	0.0955	-0.0194	0.0160	0.2245	--?--	0.0	1.586	3	0.6626
6 : 79353950 : SNP	a	g	0.8823	0.0061	0.8680	0.8860	0.0011	0.0133	0.9323	-++-+	0.0	2.773	4	0.5964
2 : 49494681 : SNP	t	g	0.5162	0.0071	0.5044	0.5371	0.0010	0.0085	0.9029	+-+++	0.0	1.785	4	0.7753
13 : 103431253 : SNP	a	g	0.0212	0.0000	0.0212	0.0212	-0.0430	0.0516	0.4042	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 108009411 : SNP	t	c	0.3498	0.0114	0.3202	0.3605	-0.0028	0.0091	0.7573	+++--	10.9	4.488	4	0.344
9 : 25696454 : SNP	t	g	0.9748	0.0000	0.9748	0.9748	0.0140	0.0435	0.7474	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 122603918 : SNP	t	c	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	-0.0330	0.0495	0.5053	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 155036763 : SNP	t	c	0.5492	0.0103	0.5353	0.5672	-0.0084	0.0085	0.3244	+----	0.0	2.989	4	0.5596
12 : 41173766 : SNP	t	c	0.4224	0.0020	0.4207	0.4282	-0.0032	0.0085	0.7053	+--+-	0.0	2.552	4	0.6353
3 : 6736320 : SNP	a	g	0.3380	0.0153	0.3180	0.3702	-0.0041	0.0091	0.656	----+	44.9	7.257	4	0.1229
6 : 32511718 : SNP	a	g	0.1269	0.0045	0.1157	0.1299	-0.0200	0.0272	0.4618	??-+-	0.0	0.367	2	0.8323
9 : 30537209 : SNP	c	g	0.7785	0.0134	0.7525	0.7894	-0.0116	0.0105	0.2686	-0++-	0.0	2.618	4	0.6236
11 : 97416158 : SNP	a	c	0.9492	0.0030	0.9467	0.9534	0.0067	0.0214	0.7543	-+??+	0.0	1.492	2	0.4743
19 : 46970421 : SNP	a	g	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	-0.0380	0.0586	0.5169	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 24459938 : SNP	a	g	0.9526	0.0070	0.9364	0.9578	0.0286	0.0214	0.182	+-??+	71.4	6.999	2	0.03021
20 : 4247229 : SNP	a	g	0.3251	0.0083	0.3021	0.3465	0.0036	0.0092	0.6958	++++-	0.0	2.177	4	0.7032
19 : 48707061 : SNP	c	g	0.5614	0.0088	0.5350	0.5666	0.0049	0.0085	0.5677	-+-+-	19.9	4.995	4	0.2879
12 : 9864472 : SNP	t	c	0.9862	0.0000	0.9862	0.9862	0.1740	0.0607	0.00412	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 104988895 : SNP	t	c	0.0387	0.0049	0.0339	0.0458	-0.0227	0.0232	0.3278	-+??-	73.0	7.416	2	0.02452
3 : 64104388 : SNP	t	c	0.5431	0.0064	0.5359	0.5563	0.0130	0.0085	0.1277	+-+++	62.6	10.706	4	0.03007
1 : 92598807 : SNP	a	t	0.6249	0.0095	0.6177	0.6590	0.0045	0.0086	0.602	++-+-	11.6	4.525	4	0.3396
6 : 101804912 : SNP	a	g	0.0797	0.0019	0.0779	0.0827	0.0026	0.0164	0.8746	--?-+	63.6	8.237	3	0.04136
7 : 47064029 : SNP	a	g	0.2048	0.0118	0.1971	0.2318	-0.0057	0.0105	0.5898	---++	8.3	4.362	4	0.3592
20 : 11991888 : SNP	a	g	0.5961	0.0054	0.5884	0.6087	-0.0065	0.0086	0.4475	-++--	0.0	2.155	4	0.7072
5 : 7929077 : SNP	c	g	0.0126	0.0000	0.0126	0.0126	0.0080	0.0607	0.8951	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 66962140 : SNP	a	c	0.1769	0.0057	0.1666	0.1914	0.0064	0.0113	0.5733	+--++	0.0	1.530	4	0.8214
14 : 72887527 : SNP	a	t	0.2590	0.0301	0.2138	0.3003	0.0103	0.0135	0.4443	+-+++	0.0	1.944	4	0.746
21 : 39617078 : SNP	t	c	0.0268	0.0033	0.0248	0.0323	0.0546	0.0338	0.1063	+???+	0.0	0.071	1	0.7903
4 : 35104304 : SNP	t	c	0.1589	0.0167	0.1387	0.1891	-0.0050	0.0119	0.6705	-+---	9.0	4.396	4	0.355
1 : 34233391 : SNP	a	c	0.0839	0.0088	0.0760	0.1033	0.0021	0.0157	0.8955	-++-+	0.0	0.876	4	0.928
8 : 121870474 : INDEL	d	r	0.0349	0.0000	0.0349	0.0349	0.0180	0.0414	0.6641	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 168265874 : SNP	t	c	0.0795	0.0075	0.0600	0.0855	0.0308	0.0164	0.06021	++??+	0.0	0.096	2	0.953
1 : 179094668 : SNP	a	g	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	-0.0140	0.0556	0.8012	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 10012631 : INDEL	i	r	0.1152	0.0056	0.1105	0.1237	0.0142	0.0184	0.4394	+-?-+	53.2	6.408	3	0.09337
2 : 34902925 : SNP	a	g	0.0156	0.0000	0.0156	0.0156	0.0380	0.0576	0.5096	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 79787461 : SNP	t	c	0.2305	0.0094	0.2251	0.2519	0.0074	0.0105	0.4812	-++++	0.0	3.002	4	0.5575
7 : 78315782 : SNP	t	c	0.0174	0.0000	0.0174	0.0174	-0.0300	0.0485	0.5364	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 36819256 : SNP	t	c	0.6386	0.0050	0.6308	0.6610	0.0018	0.0091	0.8424	+-+++	0.0	3.460	4	0.484
1 : 2398881 : INDEL	d	r	0.3635	0.0254	0.3048	0.3896	-0.0011	0.0161	0.9438	+?--+	0.0	2.804	3	0.4229
4 : 172156089 : SNP	a	g	0.8814	0.0061	0.8784	0.9004	0.0025	0.0135	0.8516	++--+	0.0	1.587	4	0.8112
2 : 31486101 : SNP	t	c	0.0279	0.0000	0.0279	0.0279	0.0370	0.0435	0.3946	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 30201037 : INDEL	d	r	0.7070	0.0389	0.6313	0.7293	0.0034	0.0096	0.723	+++--	0.0	2.834	4	0.5859
12 : 5507679 : SNP	a	g	0.7546	0.0143	0.7369	0.7989	0.0108	0.0099	0.2739	+++++	0.0	0.659	4	0.9563
2 : 132714986 : SNP	t	c	0.3985	0.0406	0.3359	0.4398	0.0140	0.0133	0.2935	+-+++	41.2	6.804	4	0.1466
1 : 176159389 : SNP	t	c	0.0858	0.0084	0.0718	0.0934	-0.0211	0.0153	0.1676	--+--	55.2	8.921	4	0.06311
13 : 89240807 : SNP	a	g	0.2528	0.0324	0.2311	0.3176	0.0146	0.0098	0.1377	+++--	12.6	4.579	4	0.3333
16 : 22871605 : SNP	a	g	0.1122	0.0076	0.0924	0.1168	-0.0186	0.0158	0.2382	--?+-	0.0	0.445	3	0.9308
4 : 15263974 : SNP	t	c	0.5118	0.0229	0.4542	0.5314	-0.0103	0.0085	0.2294	---+-	0.0	1.264	4	0.8674
16 : 87597937 : SNP	t	g	0.8314	0.0124	0.8173	0.8673	0.0040	0.0117	0.7314	-++++	0.0	2.043	4	0.7279
5 : 42432868 : SNP	a	g	0.8019	0.0171	0.7645	0.8281	-0.0043	0.0105	0.6824	-+-++	0.0	2.181	4	0.7025
5 : 80355777 : SNP	t	c	0.1770	0.0090	0.1575	0.1898	-0.0077	0.0111	0.4877	--++-	0.0	2.280	4	0.6844
6 : 37482871 : SNP	t	c	0.5349	0.0128	0.5265	0.5632	0.0078	0.0085	0.361	+++--	6.3	4.269	4	0.3708
6 : 92194331 : SNP	t	c	0.6019	0.0077	0.5866	0.6197	-0.0031	0.0091	0.7333	-++--	32.9	5.964	4	0.2019
10 : 109666686 : SNP	t	c	0.8016	0.0067	0.7851	0.8129	0.0098	0.0105	0.3533	-++-+	0.0	1.526	4	0.822
9 : 38782525 : INDEL	d	r	0.0710	0.0026	0.0694	0.0761	0.0315	0.0200	0.1147	+-?++	20.5	3.775	3	0.2869
2 : 28478824 : SNP	t	c	0.0547	0.0089	0.0489	0.0711	0.0256	0.0194	0.1881	-+?++	16.6	3.597	3	0.3084
5 : 133710810 : SNP	a	g	0.0861	0.0135	0.0778	0.1122	0.0071	0.0151	0.6391	-++++	0.0	1.851	4	0.7631
2 : 86507205 : SNP	t	c	0.0372	0.0018	0.0350	0.0388	0.0040	0.0232	0.8617	-+??-	58.3	4.799	2	0.09076
1 : 163316657 : INDEL	i	r	0.0316	0.0000	0.0316	0.0316	0.0730	0.0546	0.1811	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 235749391 : SNP	a	g	0.3552	0.0302	0.2888	0.3944	-0.0117	0.0092	0.2032	---+-	0.0	1.097	4	0.8947
1 : 82164397 : SNP	a	t	0.9782	0.0000	0.9782	0.9782	0.0350	0.0404	0.3867	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 78194509 : SNP	t	c	0.6312	0.0230	0.5807	0.6596	-0.0029	0.0091	0.7525	----+	33.2	5.989	4	0.2
6 : 140274846 : SNP	a	t	0.9832	0.0000	0.9832	0.9832	-0.0590	0.0617	0.3387	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 39496143 : INDEL	d	r	0.1759	0.0264	0.1544	0.2303	-0.0223	0.0112	0.04665	--+--	0.0	3.633	4	0.458
6 : 117620139 : SNP	a	g	0.7487	0.0121	0.7175	0.7761	-0.0112	0.0101	0.2667	--+--	0.0	3.469	4	0.4826
3 : 157006962 : SNP	c	g	0.4055	0.0080	0.3765	0.4140	0.0054	0.0085	0.5287	-++--	60.1	10.034	4	0.03986
10 : 22408338 : SNP	a	g	0.0191	0.0000	0.0191	0.0191	-0.0240	0.0627	0.7018	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 46269974 : SNP	a	c	0.2314	0.0135	0.2040	0.2470	0.0096	0.0105	0.3596	++-+-	28.2	5.573	4	0.2333
15 : 73565521 : SNP	t	g	0.4668	0.0182	0.4441	0.5060	0.0034	0.0085	0.6939	++--+	0.0	0.811	4	0.937
16 : 88607731 : SNP	c	g	0.9104	0.0055	0.9048	0.9182	0.0286	0.0186	0.1241	++?-+	63.2	8.143	3	0.04315
4 : 59605383 : SNP	a	g	0.2998	0.0271	0.2780	0.3535	-0.0042	0.0094	0.6531	+----	21.8	5.117	4	0.2755
7 : 39331323 : SNP	t	c	0.5119	0.0154	0.4959	0.5580	0.0133	0.0085	0.118	+++-+	26.6	5.446	4	0.2445
4 : 79181007 : SNP	a	c	0.6821	0.0081	0.6726	0.7040	-0.0234	0.0097	0.01586	--++-	38.7	6.521	4	0.1635
2 : 70637858 : SNP	t	c	0.1183	0.0059	0.1067	0.1249	0.0151	0.0133	0.2567	+++--	13.2	4.610	4	0.3297
1 : 59095562 : SNP	a	c	0.8902	0.0124	0.8681	0.9065	-0.0012	0.0138	0.9332	---+-	0.0	1.575	4	0.8132
19 : 37419358 : SNP	a	c	0.5551	0.0217	0.5154	0.5748	-0.0244	0.0085	0.004181	---+-	56.5	9.198	4	0.05634
11 : 100875024 : SNP	t	c	0.7387	0.0215	0.6785	0.7643	-0.0004	0.0099	0.9712	-+---	11.9	4.542	4	0.3376
12 : 52836222 : SNP	t	g	0.6178	0.0067	0.6104	0.6377	0.0114	0.0086	0.1848	++-++	0.0	0.502	4	0.9733
12 : 128630028 : SNP	t	c	0.1424	0.0048	0.1376	0.1496	-0.0031	0.0120	0.7993	--+++	0.0	3.817	4	0.4313
7 : 147862632 : SNP	a	g	0.4291	0.0122	0.4222	0.4679	-0.0029	0.0087	0.7397	+---+	0.0	1.638	4	0.802
1 : 37597374 : SNP	c	g	0.8553	0.0094	0.8465	0.8677	-0.0251	0.0149	0.09104	-----	0.0	0.357	4	0.9859
2 : 57443472 : SNP	c	g	0.7429	0.0086	0.7122	0.7496	-0.0190	0.0104	0.06668	+----	30.2	5.728	4	0.2204
15 : 94509362 : SNP	t	c	0.0287	0.0014	0.0276	0.0306	0.0020	0.0302	0.9465	-+???	61.2	2.577	1	0.1084
1 : 83096252 : SNP	a	g	0.2329	0.0187	0.2164	0.2647	0.0009	0.0110	0.9343	-+-++	51.7	8.289	4	0.08156
5 : 5276319 : SNP	a	g	0.0305	0.0005	0.0299	0.0309	0.0083	0.0278	0.7655	+-???	0.0	0.732	1	0.3922
6 : 57152403 : SNP	c	g	0.0151	0.0000	0.0151	0.0151	0.0320	0.0556	0.5649	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 134162866 : SNP	a	g	0.4998	0.0054	0.4748	0.5032	-0.0002	0.0085	0.9814	+--+0	0.0	2.437	4	0.656
6 : 9051650 : SNP	a	g	0.2371	0.0141	0.2274	0.2697	-0.0028	0.0100	0.776	-++-+	0.0	3.256	4	0.5159
15 : 59328429 : SNP	a	g	0.6736	0.0170	0.6388	0.6873	-0.0122	0.0091	0.1788	--+++	9.5	4.420	4	0.3522
3 : 196536043 : SNP	t	c	0.2021	0.0171	0.1896	0.2424	-0.0123	0.0116	0.2914	-----	0.0	2.682	4	0.6123
12 : 47518314 : SNP	a	g	0.9656	0.0068	0.9526	0.9714	-0.0178	0.0250	0.476	--??+	0.0	1.260	2	0.5325
1 : 194714035 : SNP	c	g	0.7392	0.0143	0.7190	0.7632	-0.0174	0.0097	0.07447	-+--+	18.7	4.921	4	0.2955
6 : 29905566 : SNP	t	c	0.4261	0.0186	0.4164	0.4637	0.0459	0.0193	0.01774	??+++	61.9	5.256	2	0.07222
8 : 85857772 : SNP	c	g	0.2840	0.0065	0.2726	0.2926	0.0036	0.0095	0.7085	+-+++	0.0	1.067	4	0.8995
13 : 93090546 : SNP	t	c	0.0408	0.0073	0.0351	0.0502	-0.0215	0.0366	0.557	-???+	58.5	2.410	1	0.1206
22 : 38012873 : SNP	t	c	0.0157	0.0000	0.0157	0.0157	0.0090	0.0495	0.8558	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 111767194 : SNP	t	c	0.6883	0.0092	0.6684	0.7070	0.0134	0.0092	0.1435	+++-+	0.0	3.448	4	0.4858
14 : 78800072 : SNP	t	g	0.4935	0.0101	0.4628	0.5012	-0.0144	0.0086	0.09251	---+-	0.0	0.879	4	0.9276
16 : 3712590 : SNP	t	c	0.9772	0.0000	0.9772	0.9772	0.0180	0.0475	0.7048	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 80340759 : SNP	a	g	0.9183	0.0046	0.9046	0.9259	-0.0006	0.0157	0.9709	+-+-+	0.0	2.244	4	0.691
4 : 163270099 : SNP	a	t	0.8020	0.0163	0.7658	0.8165	-0.0011	0.0109	0.9232	++---	0.0	0.848	4	0.9319
14 : 30897754 : SNP	a	g	0.0350	0.0017	0.0325	0.0361	0.0437	0.0276	0.1132	++???	0.0	0.000	1	0.9865
6 : 56378307 : SNP	t	c	0.0455	0.0044	0.0396	0.0488	-0.0221	0.0234	0.3451	--???	0.0	0.121	1	0.7276
2 : 170340832 : SNP	t	g	0.8635	0.0129	0.8475	0.8899	0.0098	0.0126	0.4369	++--+	0.0	0.477	4	0.9757
12 : 12494394 : SNP	a	c	0.8726	0.0052	0.8597	0.8771	-0.0015	0.0128	0.9051	+---+	0.0	2.571	4	0.6319
3 : 190890752 : INDEL	d	r	0.3332	0.0202	0.3109	0.3868	-0.0021	0.0091	0.8198	+--++	0.0	2.868	4	0.5802
14 : 85608831 : INDEL	d	r	0.1340	0.0046	0.1254	0.1382	-0.0126	0.0124	0.3096	---+-	61.4	10.371	4	0.03462
5 : 112436122 : SNP	a	g	0.7854	0.0040	0.7799	0.7936	-0.0155	0.0126	0.2174	---+-	40.5	6.722	4	0.1513
4 : 99417717 : SNP	a	g	0.9473	0.0002	0.9470	0.9475	-0.0177	0.0230	0.4404	+-???	35.9	1.561	1	0.2116
13 : 55304009 : SNP	a	g	0.0349	0.0052	0.0299	0.0449	0.0156	0.0241	0.519	-+??+	0.0	0.917	2	0.6322
2 : 35203773 : SNP	t	c	0.5629	0.0101	0.5528	0.6079	0.0036	0.0086	0.6788	+---+	0.0	3.562	4	0.4686
20 : 57352370 : SNP	t	c	0.1591	0.0103	0.1367	0.1652	0.0047	0.0117	0.689	-+-++	56.6	9.217	4	0.0559
2 : 68884666 : SNP	a	g	0.5364	0.0042	0.5330	0.5560	-0.0014	0.0085	0.8671	-+--+	12.0	4.543	4	0.3375
10 : 131454829 : SNP	c	g	0.9797	0.0000	0.9797	0.9797	-0.0590	0.0475	0.2143	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 19522769 : SNP	a	g	0.9390	0.0075	0.9247	0.9436	-0.0127	0.0184	0.4919	--?+-	0.0	1.393	3	0.7072
5 : 91888639 : SNP	a	g	0.0316	0.0006	0.0313	0.0328	0.0039	0.0310	0.8988	-???+	19.1	1.236	1	0.2662
18 : 26802760 : SNP	a	t	0.0749	0.0086	0.0527	0.0801	0.0260	0.0170	0.126	++??+	23.3	2.609	2	0.2713
2 : 31491468 : SNP	t	c	0.1275	0.0092	0.1155	0.1565	0.0028	0.0132	0.8296	-+-++	33.6	6.022	4	0.1975
5 : 159107849 : SNP	a	g	0.2630	0.0340	0.2319	0.3318	0.0036	0.0098	0.7128	++-+-	43.4	7.065	4	0.1325
20 : 44378577 : SNP	t	c	0.3551	0.0156	0.3339	0.4165	0.0106	0.0094	0.258	++--?	0.0	1.244	3	0.7424
11 : 18905923 : SNP	t	c	0.7787	0.0112	0.7564	0.7903	-0.0129	0.0102	0.2074	---+-	0.0	1.369	4	0.8496
20 : 13057970 : INDEL	d	r	0.3086	0.0137	0.2977	0.3370	-0.0057	0.0093	0.5389	---++	0.0	1.054	4	0.9014
5 : 16893865 : INDEL	d	r	0.0299	0.0004	0.0296	0.0304	0.0367	0.0293	0.21	++???	0.0	0.838	1	0.3601
14 : 99061675 : SNP	t	c	0.7911	0.0114	0.7623	0.8351	0.0017	0.0111	0.881	++-+-	0.0	1.881	4	0.7576
4 : 99556688 : SNP	a	c	0.8944	0.0073	0.8724	0.9034	-0.0114	0.0142	0.4209	-+--+	64.0	11.107	4	0.02538
9 : 131917714 : SNP	c	g	0.7112	0.0099	0.7019	0.7284	-0.0055	0.0094	0.5575	+----	61.6	10.408	4	0.03409
7 : 118173485 : SNP	t	c	0.4163	0.0186	0.3844	0.4537	-0.0115	0.0085	0.177	---++	0.0	0.967	4	0.9147
5 : 78301838 : SNP	a	c	0.9676	0.0006	0.9668	0.9681	-0.0301	0.0293	0.3032	--???	0.0	0.749	1	0.3869
6 : 164088444 : SNP	a	g	0.0415	0.0015	0.0381	0.0425	-0.0076	0.0238	0.748	--??+	0.0	0.115	2	0.9441
6 : 168587727 : SNP	a	c	0.1819	0.0137	0.1735	0.2203	0.0038	0.0113	0.7384	++-+-	0.0	1.007	4	0.9087
20 : 58121287 : SNP	t	c	0.1781	0.0150	0.1601	0.2021	-0.0208	0.0115	0.07213	+-++-	76.8	17.211	4	0.001759
11 : 77963133 : SNP	a	g	0.8428	0.0020	0.8417	0.8479	-0.0012	0.0116	0.916	-+--+	66.9	12.073	4	0.01682
13 : 84872465 : SNP	t	g	0.0178	0.0000	0.0178	0.0178	0.0320	0.0465	0.4913	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 68771284 : SNP	a	g	0.6289	0.0067	0.6224	0.6528	0.0045	0.0089	0.6144	++---	34.0	6.060	4	0.1947
16 : 28058730 : SNP	a	c	0.4979	0.0188	0.4578	0.5157	0.0014	0.0085	0.8713	+---+	41.7	6.860	4	0.1435
14 : 58438870 : SNP	a	g	0.2861	0.0142	0.2740	0.3131	-0.0155	0.0092	0.09197	-----	0.0	3.228	4	0.5204
14 : 74669359 : SNP	a	g	0.3083	0.0122	0.2945	0.3325	-0.0022	0.0092	0.8128	+--+-	0.0	3.025	4	0.5536
17 : 13196860 : SNP	c	g	0.8462	0.0103	0.8231	0.8553	-0.0007	0.0124	0.9572	+---+	35.6	6.206	4	0.1843
2 : 55445518 : SNP	t	c	0.9732	0.0002	0.9730	0.9733	0.0300	0.0305	0.3243	-+???	59.0	2.436	1	0.1185
4 : 126416289 : SNP	a	g	0.9868	0.0000	0.9868	0.9868	-0.0540	0.0556	0.3314	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 71442979 : SNP	a	g	0.0979	0.0114	0.0837	0.1242	-0.0242	0.0192	0.2078	--?--	0.0	0.971	3	0.8082
13 : 55763861 : SNP	a	t	0.2894	0.0094	0.2829	0.3125	0.0008	0.0092	0.9318	-+++-	49.9	7.989	4	0.09197
22 : 46037881 : SNP	t	g	0.2076	0.0070	0.1975	0.2253	0.0082	0.0106	0.4413	+++-+	0.0	0.440	4	0.9791
10 : 58930842 : INDEL	i	r	0.2492	0.0123	0.2172	0.2729	0.0005	0.0098	0.9565	-+++-	48.5	7.774	4	0.1002
17 : 15113540 : SNP	t	c	0.3651	0.0086	0.3274	0.3700	-0.0080	0.0091	0.3812	-+-+-	34.2	6.079	4	0.1933
1 : 219542942 : SNP	t	c	0.0803	0.0082	0.0627	0.1036	0.0238	0.0156	0.1273	+++++	0.0	1.127	4	0.8899
7 : 89949597 : SNP	a	g	0.2398	0.0066	0.2188	0.2532	-0.0123	0.0098	0.2103	-+-+-	41.9	6.880	4	0.1424
7 : 88305027 : SNP	a	g	0.4043	0.0398	0.3663	0.4876	0.0214	0.0086	0.01332	++--+	0.0	2.463	4	0.6513
4 : 124397309 : SNP	a	g	0.8859	0.0117	0.8784	0.9183	-0.0008	0.0141	0.9524	-++--	56.1	9.119	4	0.0582
5 : 159255426 : SNP	t	c	0.0805	0.0099	0.0733	0.0941	0.0518	0.0488	0.2889	???++	0.0	0.175	1	0.6758
12 : 67517413 : SNP	t	g	0.1400	0.0152	0.1162	0.1599	-0.0084	0.0125	0.504	-++-+	13.2	4.610	4	0.3297
11 : 126915962 : SNP	a	g	0.1362	0.0128	0.1053	0.1447	0.0160	0.0124	0.1981	++---	31.6	5.849	4	0.2107
10 : 15379583 : SNP	c	g	0.1936	0.0170	0.1694	0.2266	0.0375	0.0137	0.006228	+++++	0.0	2.574	4	0.6314
13 : 69132248 : SNP	t	c	0.8002	0.0139	0.7912	0.8367	-0.0104	0.0107	0.3311	--+--	0.0	1.820	4	0.7688
14 : 99484345 : SNP	a	g	0.2832	0.0143	0.2383	0.2942	0.0050	0.0099	0.6122	+--+-	16.8	4.805	4	0.3078
4 : 40373017 : SNP	t	c	0.3270	0.0147	0.3192	0.3641	0.0027	0.0091	0.7629	-++--	0.0	3.403	4	0.4928
20 : 1688034 : SNP	a	c	0.8610	0.0060	0.8416	0.8639	-0.0254	0.0133	0.05533	-+---	15.8	4.752	4	0.3137
12 : 13292319 : SNP	t	c	0.9812	0.0000	0.9812	0.9812	-0.0060	0.0596	0.9199	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 6870668 : SNP	a	t	0.4020	0.0116	0.3876	0.4235	0.0054	0.0086	0.53	-+-++	19.3	4.957	4	0.2917
16 : 7090741 : SNP	c	g	0.9558	0.0015	0.9526	0.9571	-0.0122	0.0226	0.5893	-+??-	0.0	0.255	2	0.8803
2 : 145010905 : SNP	a	g	0.0397	0.0016	0.0378	0.0410	0.0076	0.0298	0.7987	+-???	70.1	3.341	1	0.06758
7 : 126158824 : SNP	t	c	0.6184	0.0105	0.6041	0.6369	-0.0062	0.0086	0.4718	-++--	8.2	4.356	4	0.36
7 : 10187785 : SNP	t	c	0.9604	0.0046	0.9448	0.9632	-0.0233	0.0233	0.3181	--?++	38.5	4.878	3	0.1809
7 : 95238041 : SNP	c	g	0.4364	0.0111	0.4258	0.4580	-0.0009	0.0085	0.9186	+-+-+	51.9	8.313	4	0.08076
2 : 228335209 : SNP	t	c	0.0703	0.0081	0.0604	0.0905	0.0257	0.0216	0.2327	++?-+	0.0	0.461	3	0.9275
5 : 68065423 : SNP	t	c	0.6010	0.0150	0.5912	0.6374	-0.0089	0.0086	0.2968	0----	0.0	1.966	4	0.7421
9 : 3086953 : SNP	t	c	0.3283	0.0161	0.3097	0.3567	-0.0027	0.0111	0.8072	0--++	0.0	2.799	4	0.592
7 : 79768594 : SNP	a	t	0.1323	0.0045	0.1260	0.1364	0.0030	0.0151	0.8445	+-+-+	0.0	1.986	4	0.7384
9 : 13597273 : SNP	c	g	0.5668	0.0140	0.5301	0.5735	-0.0092	0.0087	0.2924	+-+--	52.3	8.385	4	0.07844
1 : 188116855 : SNP	a	g	0.5205	0.0110	0.5131	0.5431	-0.0068	0.0085	0.4269	-+-++	58.8	9.702	4	0.04575
3 : 68492075 : SNP	a	g	0.2466	0.0060	0.2335	0.2637	0.0021	0.0099	0.8283	++---	43.2	7.041	4	0.1338
3 : 106428552 : SNP	a	t	0.2336	0.0113	0.1911	0.2387	0.0049	0.0125	0.6938	-+-++	39.9	6.658	4	0.1551
4 : 100451375 : SNP	a	g	0.5242	0.0339	0.4452	0.5558	0.0088	0.0085	0.2996	++-+-	52.5	8.414	4	0.07754
12 : 63719444 : SNP	a	g	0.9842	0.0000	0.9842	0.9842	0.0470	0.0485	0.3327	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 44066458 : SNP	t	c	0.0283	0.0013	0.0273	0.0299	-0.0303	0.0307	0.3233	--???	0.0	0.292	1	0.5889
2 : 241506983 : SNP	t	c	0.9348	0.0047	0.9245	0.9389	-0.0229	0.0193	0.2343	-+?-+	0.0	2.299	3	0.5128
9 : 111308433 : SNP	a	g	0.3478	0.0295	0.3228	0.4055	-0.0050	0.0091	0.5806	-++--	0.0	2.371	4	0.6679
3 : 151677661 : SNP	a	t	0.2304	0.0073	0.2235	0.2550	0.0050	0.0103	0.6298	+--++	0.0	1.505	4	0.8258
1 : 59612873 : SNP	t	c	0.0573	0.0111	0.0515	0.0845	0.0117	0.0273	0.667	+??++	0.0	0.026	2	0.987
13 : 73095271 : SNP	a	g	0.6873	0.0075	0.6703	0.6928	-0.0009	0.0092	0.9247	++---	0.0	2.594	4	0.6278
12 : 23734115 : SNP	t	c	0.8996	0.0046	0.8824	0.9061	0.0233	0.0145	0.109	++?+-	0.0	0.599	3	0.8966
6 : 18702837 : SNP	t	g	0.2463	0.0094	0.2245	0.2535	0.0102	0.0098	0.3002	+++--	0.0	1.504	4	0.8259
5 : 73855650 : SNP	a	g	0.8686	0.0082	0.8473	0.8923	-0.0180	0.0130	0.1648	--+++	0.0	2.635	4	0.6207
20 : 30640585 : INDEL	i	r	0.0501	0.0000	0.0501	0.0501	-0.0350	0.0404	0.3867	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 13610731 : SNP	t	c	0.2762	0.0086	0.2689	0.2979	-0.0078	0.0098	0.4221	---++	0.0	1.653	4	0.7993
17 : 10916890 : SNP	t	c	0.9660	0.0078	0.9543	0.9712	-0.0052	0.0303	0.8633	-???-	0.0	0.000	1	0.9915
8 : 4005703 : SNP	a	g	0.0354	0.0011	0.0347	0.0377	-0.0040	0.0248	0.8715	+-??+	0.0	0.251	2	0.8822
19 : 18270132 : SNP	a	g	0.9777	0.0000	0.9777	0.9777	0.0080	0.0435	0.854	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 238277253 : SNP	a	g	0.9732	0.0004	0.9726	0.9735	-0.0092	0.0307	0.7642	--???	0.0	0.001	1	0.9746
3 : 21404321 : SNP	a	t	0.0349	0.0035	0.0304	0.0409	-0.0168	0.0247	0.4956	--??-	0.0	0.498	2	0.7797
9 : 94076720 : SNP	a	g	0.0445	0.0035	0.0392	0.0471	0.0223	0.0223	0.317	++??+	0.0	0.150	2	0.9276
7 : 7674086 : SNP	a	g	0.3774	0.0075	0.3699	0.3970	-0.0092	0.0089	0.3031	--++-	0.0	3.288	4	0.5108
1 : 33127764 : SNP	t	c	0.0287	0.0000	0.0287	0.0287	-0.0020	0.0394	0.9595	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 43228017 : SNP	a	t	0.4757	0.0179	0.4363	0.4938	0.0067	0.0086	0.4367	+++--	0.0	2.936	4	0.5686
19 : 21470033 : SNP	a	t	0.9690	0.0007	0.9682	0.9696	0.0173	0.0285	0.5437	-+???	0.8	1.008	1	0.3154
3 : 168666076 : SNP	t	g	0.4168	0.0120	0.3984	0.4293	0.0183	0.0097	0.05938	++-++	0.0	2.621	4	0.6231
12 : 86135652 : SNP	a	t	0.8122	0.0217	0.7617	0.8318	0.0162	0.0110	0.1416	+++++	0.0	0.231	4	0.9938
4 : 65843378 : SNP	a	c	0.1298	0.0173	0.1100	0.1617	0.0119	0.0130	0.363	+++-+	0.0	1.752	4	0.7813
15 : 85112536 : SNP	t	g	0.7109	0.0162	0.6875	0.7281	0.0093	0.0095	0.3293	+++-+	0.0	2.403	4	0.6621
2 : 66636850 : SNP	t	c	0.0213	0.0000	0.0213	0.0213	0.0500	0.0435	0.25	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 15606397 : SNP	a	g	0.1535	0.0177	0.1430	0.1864	-0.0219	0.0140	0.1181	--?--	33.5	4.512	3	0.2112
3 : 95141385 : SNP	a	c	0.9810	0.0000	0.9810	0.9810	-0.0270	0.0455	0.5528	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 44871062 : SNP	a	g	0.3619	0.0215	0.3466	0.4064	0.0036	0.0091	0.6957	+++--	0.0	1.291	4	0.8628
12 : 107789962 : SNP	t	c	0.9645	0.0102	0.9460	0.9721	0.0237	0.0256	0.3564	++??+	0.0	0.428	2	0.8072
17 : 56730593 : SNP	a	g	0.3287	0.0232	0.3131	0.3763	-0.0201	0.0091	0.02746	--+--	4.1	4.172	4	0.3832
8 : 80256920 : SNP	t	c	0.3665	0.0264	0.2933	0.3823	-0.0077	0.0098	0.4318	-+--+	57.5	9.409	4	0.05166
2 : 36390140 : SNP	t	c	0.9869	0.0000	0.9869	0.9869	0.1000	0.0576	0.08265	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 12092987 : SNP	a	g	0.2557	0.0083	0.2326	0.2650	0.0147	0.0098	0.1334	++-++	10.0	4.443	4	0.3493
9 : 130758404 : SNP	a	g	0.9199	0.0075	0.9046	0.9252	0.0002	0.0159	0.992	-+-++	38.1	6.465	4	0.167
21 : 21440968 : SNP	a	c	0.0913	0.0025	0.0892	0.0962	-0.0118	0.0156	0.4473	+----	0.0	1.301	4	0.8612
3 : 120565748 : SNP	a	g	0.0303	0.0000	0.0303	0.0303	-0.0880	0.0465	0.05843	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 76345648 : SNP	t	g	0.4297	0.0261	0.3573	0.4572	-0.0110	0.0086	0.2007	---+-	0.0	3.396	4	0.4939
3 : 9627759 : SNP	a	c	0.5028	0.0082	0.4850	0.5118	-0.0116	0.0091	0.2048	-+---	0.0	2.349	4	0.6718
7 : 51914384 : SNP	t	c	0.0189	0.0000	0.0189	0.0189	0.0330	0.0485	0.4964	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 42219195 : SNP	a	g	0.7991	0.0174	0.7854	0.8416	-0.0027	0.0108	0.8061	-+--+	23.3	5.215	4	0.2659
22 : 47013204 : SNP	t	c	0.0392	0.0017	0.0366	0.0405	-0.0130	0.0246	0.5961	--??-	0.0	0.363	2	0.8339
7 : 71052399 : SNP	a	t	0.9724	0.0000	0.9724	0.9724	0.0060	0.0425	0.8876	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 148562425 : SNP	c	g	0.7744	0.0183	0.7393	0.7907	0.0108	0.0108	0.3152	++++-	10.5	4.469	4	0.3463
6 : 18889319 : SNP	t	c	0.0380	0.0038	0.0340	0.0421	-0.0158	0.0238	0.5072	--??+	45.8	3.688	2	0.1582
18 : 69084598 : SNP	a	g	0.0258	0.0000	0.0258	0.0258	0.0760	0.0414	0.06669	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 40976249 : SNP	t	c	0.3594	0.0209	0.3369	0.4004	0.0008	0.0091	0.9257	+-++-	32.2	5.899	4	0.2068
7 : 97948427 : SNP	a	g	0.0786	0.0065	0.0728	0.0904	-0.0174	0.0180	0.332	--?-?	0.0	0.548	2	0.7602
11 : 26746195 : SNP	c	g	0.0109	0.0000	0.0109	0.0109	0.1540	0.0637	0.0156	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 189026708 : SNP	a	g	0.4830	0.0043	0.4709	0.4909	-0.0014	0.0085	0.8694	-0-++	0.0	0.754	4	0.9446
4 : 136233454 : SNP	t	c	0.9558	0.0000	0.9558	0.9558	-0.0740	0.0445	0.09616	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 69564423 : INDEL	i	r	0.4926	0.0059	0.4857	0.5046	-0.0029	0.0085	0.7354	+-++-	0.0	3.973	4	0.4097
5 : 27631066 : SNP	a	g	0.7172	0.0237	0.6547	0.7300	-0.0069	0.0097	0.4766	---+-	0.0	3.848	4	0.427
10 : 132277690 : SNP	t	c	0.8898	0.0094	0.8716	0.9032	0.0035	0.0138	0.8004	++++-	0.0	1.250	4	0.8697
13 : 29704273 : SNP	a	g	0.1686	0.0058	0.1594	0.1830	-0.0015	0.0114	0.8986	-++-+	0.0	3.545	4	0.4711
9 : 137433689 : SNP	a	g	0.0472	0.0063	0.0423	0.0584	-0.0402	0.0210	0.05534	+-?+-	63.5	8.217	3	0.04174
8 : 20604463 : SNP	a	g	0.6455	0.0185	0.6182	0.6770	0.0015	0.0097	0.8808	--+++	32.2	5.901	4	0.2066
16 : 59165132 : INDEL	i	r	0.0276	0.0027	0.0254	0.0309	0.0061	0.0312	0.8458	-+???	58.8	2.426	1	0.1193
1 : 11010551 : SNP	t	c	0.0473	0.0028	0.0411	0.0489	0.0253	0.0228	0.2683	+-??+	0.0	0.729	2	0.6945
18 : 9872622 : SNP	a	c	0.0760	0.0049	0.0732	0.0879	0.0182	0.0176	0.2996	++?-+	0.0	0.950	3	0.8133
11 : 90883808 : SNP	a	c	0.2063	0.0067	0.2008	0.2342	-0.0083	0.0106	0.432	-+---	0.0	1.626	4	0.8041
1 : 168586902 : SNP	t	c	0.3763	0.0145	0.3519	0.3935	0.0095	0.0089	0.2853	++++-	0.0	1.510	4	0.8249
5 : 151024527 : SNP	a	g	0.5929	0.0050	0.5735	0.5974	0.0068	0.0087	0.4329	++-+-	26.2	5.421	4	0.2468
12 : 71761273 : SNP	t	g	0.6016	0.0144	0.5888	0.6395	0.0047	0.0088	0.5907	++-++	0.0	3.437	4	0.4875
2 : 219996616 : SNP	c	g	0.6304	0.0220	0.5870	0.6489	0.0086	0.0091	0.3438	++++-	0.0	1.875	4	0.7587
19 : 28995037 : SNP	a	g	0.1285	0.0025	0.1241	0.1380	0.0046	0.0132	0.7293	++---	0.0	1.249	4	0.87
6 : 24180812 : SNP	a	g	0.5898	0.0077	0.5670	0.6018	-0.0061	0.0086	0.4788	--+++	0.0	3.867	4	0.4242
7 : 137794782 : INDEL	i	r	0.0352	0.0017	0.0330	0.0382	-0.0052	0.0239	0.8285	++??-	0.0	0.589	2	0.745
18 : 68720581 : INDEL	i	r	0.1221	0.0037	0.1097	0.1239	-0.0046	0.0135	0.7348	++--+	11.1	4.498	4	0.3428
1 : 245657408 : SNP	a	c	0.0521	0.0015	0.0500	0.0532	0.0178	0.0220	0.4177	+-???	0.0	1.000	1	0.3173
18 : 22009659 : SNP	a	g	0.9186	0.0035	0.9157	0.9275	-0.0035	0.0159	0.828	++?--	0.0	0.923	3	0.8199
13 : 65043281 : SNP	t	c	0.9262	0.0066	0.9048	0.9314	0.0086	0.0165	0.6046	++-+-	42.3	6.927	4	0.1398
2 : 113387987 : SNP	t	c	0.9794	0.0000	0.9794	0.9794	-0.0900	0.0435	0.0384	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 39980305 : SNP	t	c	0.9416	0.0069	0.9273	0.9455	0.0023	0.0189	0.9017	+-?-+	0.0	1.795	3	0.6161
5 : 56428564 : SNP	t	c	0.5444	0.0040	0.5412	0.5601	-0.0032	0.0085	0.7098	--++-	2.8	4.117	4	0.3904
14 : 103227011 : SNP	t	c	0.7775	0.0081	0.7595	0.8048	0.0079	0.0107	0.4599	++--+	0.0	2.456	4	0.6525
17 : 17629959 : SNP	t	c	0.0260	0.0000	0.0260	0.0260	-0.0280	0.0425	0.5096	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 143690416 : SNP	a	g	0.5548	0.0250	0.5005	0.5686	-0.0052	0.0085	0.5405	--+++	7.5	4.326	4	0.3637
13 : 99686104 : SNP	t	c	0.4983	0.0112	0.4887	0.5215	0.0196	0.0085	0.02146	+-+++	24.4	5.289	4	0.2589
2 : 21360583 : SNP	a	g	0.6202	0.0115	0.5988	0.6305	0.0129	0.0089	0.1452	++++-	0.0	1.772	4	0.7776
2 : 129491813 : INDEL	i	r	0.4018	0.0277	0.3809	0.4504	0.0025	0.0101	0.8071	+-+-+	54.0	8.702	4	0.06898
8 : 38466355 : SNP	a	g	0.3696	0.0356	0.3420	0.4410	-0.0062	0.0091	0.4936	+-+--	5.1	4.214	4	0.3779
6 : 11736747 : SNP	t	c	0.1187	0.0075	0.1076	0.1252	-0.0027	0.0133	0.8394	--+++	0.0	3.438	4	0.4874
2 : 172040070 : INDEL	i	r	0.0167	0.0000	0.0167	0.0167	-0.0160	0.0485	0.7416	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 74932425 : SNP	a	c	0.1000	0.0060	0.0960	0.1258	-0.0452	0.0142	0.001453	--+--	0.0	3.379	4	0.4966
7 : 12357429 : SNP	a	g	0.7845	0.0058	0.7779	0.7979	0.0045	0.0106	0.6716	++---	0.0	3.363	4	0.4991
7 : 5840612 : SNP	a	g	0.9806	0.0000	0.9806	0.9806	0.0200	0.0516	0.6981	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 66182354 : SNP	t	c	0.5410	0.0171	0.4918	0.5531	-0.0022	0.0108	0.8387	-+---	0.0	1.127	4	0.89
18 : 14043954 : SNP	t	c	0.2201	0.0107	0.1980	0.2355	-0.0020	0.0104	0.8501	---++	0.0	1.928	4	0.749
19 : 2553658 : SNP	t	c	0.0845	0.0000	0.0845	0.0845	0.0238	0.0610	0.6964	????+	0.0	0.000	0	1
12 : 128284655 : SNP	a	g	0.9218	0.0108	0.9149	0.9431	-0.0004	0.0185	0.9848	++?-+	0.0	2.092	3	0.5534
10 : 71950148 : SNP	a	g	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	0.0230	0.0455	0.6131	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 44260153 : SNP	t	c	0.1533	0.0224	0.1237	0.1868	-0.0370	0.0166	0.02548	---+-	20.2	5.013	4	0.286
4 : 15440932 : SNP	a	c	0.3618	0.0058	0.3504	0.3670	0.0064	0.0089	0.4722	-+-++	45.8	7.385	4	0.1169
6 : 134419216 : SNP	a	t	0.6820	0.0078	0.6682	0.6932	-0.0219	0.0092	0.0173	---+-	40.1	6.683	4	0.1536
2 : 55887960 : SNP	t	c	0.9875	0.0000	0.9875	0.9875	0.0280	0.0586	0.633	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 45147060 : SNP	a	t	0.2861	0.0056	0.2745	0.2943	0.0079	0.0092	0.3897	-+--+	0.0	2.758	4	0.5991
18 : 6655030 : SNP	t	c	0.5244	0.0253	0.4926	0.5768	-0.0141	0.0086	0.1009	--+--	25.8	5.388	4	0.2498
20 : 21331033 : SNP	a	g	0.9443	0.0006	0.9440	0.9456	-0.0155	0.0207	0.4522	--??+	0.0	0.672	2	0.7148
15 : 24914213 : SNP	t	g	0.9665	0.0033	0.9642	0.9714	0.0143	0.0276	0.603	+-???	0.0	0.455	1	0.5
19 : 15866848 : SNP	a	t	0.5707	0.0101	0.5526	0.6014	0.0023	0.0085	0.7854	+--++	46.7	7.503	4	0.1116
2 : 19288816 : SNP	a	g	0.8817	0.0087	0.8634	0.8889	0.0105	0.0137	0.4451	++-+-	25.6	5.374	4	0.251
14 : 71555596 : SNP	a	g	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	-0.0560	0.0516	0.2774	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 7288767 : SNP	a	c	0.0829	0.0038	0.0665	0.0845	-0.0107	0.0160	0.5031	--?+-	0.0	0.668	3	0.8808
18 : 63489243 : SNP	t	c	0.0363	0.0047	0.0315	0.0423	0.0013	0.0238	0.9558	++??-	0.0	1.777	2	0.4114
10 : 8983204 : SNP	a	g	0.3648	0.0227	0.3102	0.4077	-0.0026	0.0087	0.7635	+----	0.0	1.658	4	0.7984
20 : 59510507 : SNP	a	g	0.0886	0.0107	0.0822	0.1113	0.0043	0.0153	0.7789	-++++	0.0	3.536	4	0.4724
18 : 9696427 : SNP	a	g	0.0311	0.0000	0.0311	0.0311	-0.0290	0.0394	0.462	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 96559810 : SNP	t	c	0.5699	0.0249	0.5140	0.5871	-0.0153	0.0085	0.07385	--++-	0.0	1.668	4	0.7965
18 : 35363287 : SNP	t	c	0.3671	0.0106	0.3594	0.4043	0.0005	0.0091	0.9573	--+++	0.0	3.927	4	0.416
20 : 35256287 : SNP	t	c	0.8980	0.0057	0.8940	0.9207	-0.0187	0.0154	0.2267	-+?--	50.8	6.097	3	0.107
13 : 73484089 : SNP	a	g	0.6956	0.0135	0.6852	0.7255	-0.0045	0.0093	0.6264	---++	4.1	4.169	4	0.3836
4 : 182913756 : SNP	t	c	0.0350	0.0000	0.0350	0.0350	0.0850	0.0404	0.03554	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 46403350 : SNP	t	g	0.1400	0.0101	0.1288	0.1577	0.0120	0.0129	0.3523	+-+-+	24.4	5.291	4	0.2588
12 : 30142522 : SNP	a	g	0.8453	0.0076	0.8392	0.8624	-0.0157	0.0118	0.1861	---++	38.5	6.499	4	0.1648
5 : 50803852 : SNP	t	c	0.0972	0.0029	0.0847	0.1003	0.0182	0.0143	0.2021	+-+++	0.0	3.563	4	0.4684
22 : 22495811 : INDEL	i	r	0.1652	0.0217	0.1502	0.2142	0.0128	0.0117	0.2731	+++?-	0.0	0.566	3	0.9041
9 : 93482553 : SNP	a	c	0.9870	0.0000	0.9870	0.9870	0.0440	0.0576	0.4451	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 63653299 : SNP	a	c	0.0492	0.0028	0.0449	0.0518	-0.0177	0.0227	0.4361	+-??-	22.9	2.596	2	0.2731
19 : 49071756 : SNP	a	g	0.4938	0.0134	0.4739	0.5165	0.0013	0.0086	0.8841	++--+	0.0	0.367	4	0.9851
13 : 72477350 : INDEL	i	r	0.8108	0.0187	0.7865	0.8408	-0.0084	0.0171	0.6242	+----	33.0	5.973	4	0.2012
6 : 140549940 : SNP	a	g	0.2046	0.0044	0.1941	0.2130	-0.0069	0.0107	0.5152	--+-+	10.6	4.473	4	0.3458
10 : 55133063 : INDEL	d	r	0.0959	0.0037	0.0826	0.1029	-0.0072	0.0150	0.6304	-+-0-	0.0	0.661	4	0.956
6 : 37933881 : SNP	a	g	0.3879	0.0334	0.2935	0.4049	0.0083	0.0088	0.346	-+++-	14.9	4.698	4	0.3197
8 : 69513803 : SNP	t	g	0.5062	0.0208	0.4884	0.5549	0.0002	0.0085	0.985	++-+-	0.0	1.421	4	0.8406
5 : 111174340 : SNP	a	g	0.9340	0.0095	0.9272	0.9632	0.0011	0.0187	0.9517	-+??+	69.5	6.561	2	0.03762
20 : 4012523 : INDEL	i	r	0.7954	0.0097	0.7762	0.8037	0.0171	0.0133	0.199	++++-	0.0	1.812	4	0.7704
17 : 43939225 : SNP	a	g	0.3263	0.0257	0.3096	0.3762	0.0030	0.0191	0.8773	??-++	0.0	1.368	2	0.5047
11 : 130422126 : SNP	a	g	0.0451	0.0020	0.0424	0.0468	-0.0523	0.0230	0.02305	--??+	42.1	3.453	2	0.1779
13 : 95707731 : SNP	t	c	0.5301	0.0110	0.5043	0.5442	0.0056	0.0086	0.5106	+++--	66.7	12.002	4	0.01733
15 : 80656136 : SNP	t	c	0.8941	0.0062	0.8813	0.9046	-0.0008	0.0138	0.9521	+--+-	21.3	5.086	4	0.2786
2 : 153982272 : SNP	t	c	0.1938	0.0106	0.1830	0.2171	0.0003	0.0110	0.9798	-+-+-	0.0	3.045	4	0.5503
4 : 57004455 : SNP	a	c	0.6869	0.0088	0.6631	0.6946	-0.0126	0.0092	0.1725	--+--	0.0	1.749	4	0.7818
5 : 118027598 : SNP	a	g	0.8085	0.0036	0.7978	0.8140	-0.0002	0.0107	0.9873	-+++-	0.0	3.382	4	0.496
20 : 48057192 : SNP	a	g	0.0124	0.0000	0.0124	0.0124	-0.1260	0.0576	0.02876	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 41464119 : SNP	a	c	0.8275	0.0224	0.7823	0.8459	0.0137	0.0113	0.2251	++-++	0.0	1.175	4	0.8823
11 : 9241219 : SNP	a	g	0.2141	0.0131	0.2019	0.2569	0.0011	0.0105	0.9136	++---	13.5	4.622	4	0.3283
19 : 43361847 : SNP	t	c	0.0797	0.0086	0.0712	0.0914	-0.0651	0.0292	0.02594	-??--	0.0	0.200	2	0.9046
17 : 6295373 : SNP	a	g	0.8033	0.0217	0.7678	0.8373	-0.0073	0.0155	0.6371	-+-+-	0.0	3.122	4	0.5377
3 : 174841534 : SNP	a	t	0.4508	0.0140	0.4224	0.4595	0.0162	0.0086	0.05778	+--++	58.3	9.601	4	0.04771
9 : 97159948 : SNP	t	c	0.0925	0.0058	0.0798	0.1088	0.0084	0.0163	0.6085	-++-+	0.0	1.292	4	0.8627
4 : 59439059 : SNP	t	c	0.2192	0.0100	0.2090	0.2369	-0.0073	0.0107	0.4975	+----	0.0	2.115	4	0.7146
15 : 67519487 : SNP	t	c	0.4801	0.0147	0.4658	0.4989	0.0039	0.0085	0.645	+++-+	0.0	1.786	4	0.775
12 : 114401881 : SNP	a	g	0.6754	0.0246	0.6191	0.6904	-0.0163	0.0091	0.07289	-----	0.0	3.952	4	0.4125
11 : 103231440 : SNP	t	c	0.6653	0.0063	0.6544	0.6828	-0.0022	0.0091	0.8127	+---+	0.0	2.965	4	0.5637
2 : 31295044 : SNP	t	c	0.4664	0.0095	0.4473	0.4849	-0.0130	0.0085	0.1268	---+-	0.0	1.468	4	0.8322
2 : 52505721 : SNP	a	g	0.0309	0.0025	0.0288	0.0339	-0.0076	0.0305	0.8025	--???	0.0	0.021	1	0.8848
9 : 28410294 : SNP	a	g	0.9714	0.0000	0.9714	0.9714	-0.0500	0.0485	0.3028	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 178100779 : INDEL	d	r	0.0290	0.0030	0.0270	0.0353	0.0008	0.0267	0.9761	--??+	10.9	2.245	2	0.3254
4 : 78351923 : SNP	t	c	0.8717	0.0077	0.8452	0.8775	-0.0252	0.0128	0.0481	+----	71.9	14.228	4	0.006601
5 : 44510769 : SNP	t	c	0.1917	0.0073	0.1661	0.2041	0.0128	0.0108	0.2375	+++++	0.0	1.943	4	0.7463
14 : 82252034 : SNP	a	g	0.9694	0.0040	0.9613	0.9719	0.0394	0.0259	0.1289	-+??+	61.4	5.180	2	0.07502
20 : 16595619 : SNP	t	c	0.2749	0.0132	0.2425	0.2857	-0.0005	0.0093	0.9551	++---	49.4	7.912	4	0.09485
8 : 134603498 : SNP	a	g	0.4039	0.0208	0.3866	0.4484	0.0006	0.0085	0.9457	++-++	0.0	2.395	4	0.6636
19 : 28656530 : SNP	a	c	0.3551	0.0131	0.3419	0.3817	0.0133	0.0086	0.1206	+++-+	0.0	1.408	4	0.8428
2 : 35161208 : SNP	t	g	0.0234	0.0000	0.0234	0.0234	0.0460	0.0404	0.2553	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 49733234 : SNP	a	g	0.0162	0.0000	0.0162	0.0162	0.0020	0.0586	0.9728	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 13741769 : SNP	a	c	0.2448	0.0061	0.2280	0.2621	0.0025	0.0100	0.7982	+-+--	4.8	4.200	4	0.3796
6 : 111248237 : SNP	a	g	0.7821	0.0059	0.7753	0.8017	-0.0005	0.0104	0.9595	-+--+	0.0	1.460	4	0.8336
10 : 5670541 : SNP	c	g	0.7134	0.0103	0.7037	0.7341	-0.0012	0.0094	0.8958	-+-+-	0.0	2.292	4	0.6822
5 : 102983244 : SNP	t	c	0.5221	0.0045	0.5154	0.5276	-0.0111	0.0087	0.2001	---+-	0.0	1.549	4	0.8179
3 : 177801769 : SNP	t	g	0.7575	0.0198	0.7152	0.7706	0.0104	0.0098	0.2893	+0+--	40.7	6.747	4	0.1499
15 : 62325178 : INDEL	i	r	0.0248	0.0000	0.0248	0.0248	0.0100	0.0516	0.8462	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 35579190 : SNP	a	t	0.7676	0.0106	0.7366	0.7835	-0.0034	0.0100	0.7332	00+--	0.0	1.036	4	0.9043
5 : 102127168 : SNP	t	c	0.6462	0.0127	0.6374	0.6961	-0.0004	0.0088	0.9625	+-++-	19.2	4.948	4	0.2927
10 : 82331567 : SNP	t	c	0.0901	0.0008	0.0883	0.0906	0.0237	0.0148	0.1095	-++++	51.7	8.281	4	0.08182
6 : 139953574 : SNP	c	g	0.0605	0.0018	0.0566	0.0618	-0.0237	0.0193	0.2198	--??-	0.0	0.418	2	0.8115
13 : 62761303 : SNP	a	c	0.0766	0.0062	0.0657	0.0843	-0.0065	0.0163	0.6887	--?--	0.0	1.067	3	0.785
10 : 4178026 : SNP	t	g	0.0470	0.0027	0.0398	0.0484	0.0274	0.0209	0.1891	++??+	0.0	0.507	2	0.7761
13 : 89725830 : SNP	t	g	0.9765	0.0000	0.9765	0.9765	0.0160	0.0425	0.7063	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 154426097 : SNP	a	g	0.4172	0.0072	0.4021	0.4269	0.0077	0.0086	0.3708	-++++	7.7	4.333	4	0.3628
10 : 19101814 : SNP	a	g	0.0750	0.0082	0.0697	0.0913	0.0166	0.0179	0.3561	+-?+-	51.7	6.209	3	0.1019
2 : 52760556 : SNP	t	c	0.9472	0.0053	0.9419	0.9553	0.0456	0.0227	0.04475	++??+	0.0	0.311	2	0.8561
7 : 157121569 : SNP	a	g	0.9251	0.0025	0.9238	0.9330	0.0059	0.0211	0.7787	+??-+	0.0	0.764	2	0.6825
2 : 42259707 : SNP	a	c	0.1234	0.0132	0.0782	0.1357	0.0131	0.0129	0.3113	+++++	0.0	0.303	4	0.9896
6 : 108996647 : SNP	a	g	0.9744	0.0000	0.9744	0.9744	-0.0190	0.0384	0.6209	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 171945776 : SNP	a	g	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	0.0350	0.0425	0.4097	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 80847132 : SNP	t	g	0.9804	0.0000	0.9804	0.9804	-0.0240	0.0455	0.5978	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 70324650 : SNP	a	g	0.7893	0.0110	0.7802	0.8232	0.0003	0.0103	0.9766	-0+++	22.5	5.158	4	0.2714
17 : 10112542 : SNP	t	c	0.0124	0.0000	0.0124	0.0124	-0.0060	0.0596	0.9199	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 130561629 : SNP	a	g	0.0893	0.0052	0.0746	0.0987	-0.0538	0.0153	0.0004315	--+--	36.9	6.335	4	0.1755
8 : 17484526 : SNP	a	g	0.0806	0.0074	0.0663	0.0892	0.0034	0.0161	0.8344	-+?-+	0.0	0.218	3	0.9746
11 : 21958418 : SNP	a	g	0.4574	0.0257	0.3888	0.4799	-0.0062	0.0085	0.4655	--+0+	0.0	3.735	4	0.4431
13 : 62848281 : SNP	t	c	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	-0.1180	0.0546	0.03064	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 36969169 : INDEL	d	r	0.1121	0.0093	0.1037	0.1303	0.0052	0.0137	0.7076	+-+++	0.0	1.195	4	0.8789
7 : 38963439 : SNP	c	g	0.6952	0.0175	0.6735	0.7260	-0.0090	0.0092	0.3325	--+++	0.0	0.901	4	0.9244
11 : 98817084 : SNP	a	g	0.6335	0.0195	0.6053	0.6646	-0.0143	0.0090	0.113	--++-	9.9	4.438	4	0.3499
3 : 112480052 : SNP	a	g	0.0147	0.0000	0.0147	0.0147	0.0560	0.0596	0.3478	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 4741570 : SNP	a	c	0.9011	0.0098	0.8828	0.9087	-0.0054	0.0149	0.7173	--?+-	0.0	0.350	3	0.9504
15 : 74460734 : SNP	t	c	0.9414	0.0000	0.9414	0.9414	0.0060	0.0404	0.882	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 81182035 : SNP	a	g	0.9736	0.0083	0.9621	0.9796	0.0119	0.0352	0.735	-???+	0.0	0.611	1	0.4342
4 : 35885729 : SNP	t	c	0.1686	0.0057	0.1634	0.1820	-0.0170	0.0113	0.1334	---+-	0.0	0.967	4	0.9147
15 : 94345845 : SNP	a	t	0.8746	0.0054	0.8698	0.8822	0.0195	0.0138	0.1568	+---+	61.1	10.271	4	0.0361
10 : 78369985 : SNP	a	t	0.9734	0.0000	0.9734	0.9734	-0.0540	0.0404	0.1817	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 79176988 : SNP	a	g	0.9340	0.0015	0.9322	0.9352	0.0051	0.0203	0.8005	+-???	0.0	0.425	1	0.5146
10 : 110172699 : SNP	a	g	0.8433	0.0061	0.8202	0.8499	0.0209	0.0120	0.08226	++-++	0.0	3.148	4	0.5333
12 : 69985536 : SNP	a	g	0.6673	0.0079	0.6537	0.6764	-0.0082	0.0091	0.3727	--+-+	0.0	1.968	4	0.7416
11 : 22010155 : SNP	a	t	0.1399	0.0091	0.1195	0.1497	-0.0031	0.0125	0.804	-+--+	0.0	1.881	4	0.7577
15 : 52729070 : SNP	a	g	0.8231	0.0235	0.7740	0.8610	-0.0046	0.0112	0.679	0---+	0.0	3.575	4	0.4666
5 : 77877361 : SNP	t	c	0.4306	0.0161	0.4145	0.4502	-0.0027	0.0092	0.7672	--+-+	0.0	1.744	4	0.7828
1 : 119159978 : SNP	a	t	0.0444	0.0056	0.0407	0.0579	-0.0477	0.0286	0.09454	-??--	0.0	0.442	2	0.8017
4 : 114020593 : SNP	t	c	0.5947	0.0122	0.5733	0.6109	-0.0096	0.0085	0.2615	+---+	37.0	6.349	4	0.1746
13 : 81468474 : SNP	t	g	0.1374	0.0101	0.1253	0.1560	0.0033	0.0126	0.7917	++--+	0.0	2.771	4	0.5968
15 : 26221571 : SNP	t	g	0.0592	0.0017	0.0565	0.0605	-0.0036	0.0206	0.8616	+-?++	48.9	5.871	3	0.1181
6 : 105934081 : INDEL	d	r	0.0811	0.0054	0.0715	0.1012	-0.0052	0.0162	0.7485	--+-+	0.0	2.372	4	0.6678
8 : 124445116 : SNP	t	c	0.3607	0.0085	0.3417	0.3693	-0.0143	0.0092	0.1204	---+-	0.0	1.192	4	0.8794
11 : 32434152 : SNP	t	c	0.9811	0.0000	0.9811	0.9811	-0.0030	0.0435	0.945	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 26286468 : SNP	a	g	0.4499	0.0295	0.3730	0.4643	-0.0036	0.0086	0.6763	---++	0.0	1.736	4	0.7841
5 : 126044135 : SNP	a	g	0.9011	0.0046	0.8914	0.9068	-0.0099	0.0159	0.5349	-+---	0.0	2.815	4	0.5893
3 : 107573939 : SNP	a	c	0.9738	0.0000	0.9738	0.9738	0.0510	0.0394	0.1958	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 55384628 : SNP	t	c	0.6048	0.0098	0.5639	0.6095	0.0224	0.0092	0.01459	++-++	0.0	3.113	4	0.5391
15 : 91088884 : SNP	c	g	0.7883	0.0040	0.7866	0.8055	0.0126	0.0113	0.2648	++---	36.1	6.255	4	0.1809
10 : 119331597 : SNP	a	g	0.3322	0.0097	0.3247	0.3463	-0.0086	0.0091	0.346	-+++-	65.8	11.702	4	0.01971
11 : 124445701 : SNP	a	g	0.0490	0.0010	0.0485	0.0509	0.0452	0.0288	0.1166	+???-	58.3	2.396	1	0.1216
11 : 42726511 : SNP	a	c	0.0492	0.0030	0.0467	0.0528	-0.0097	0.0232	0.6763	+-???	0.0	0.491	1	0.4835
1 : 93654998 : SNP	c	g	0.0866	0.0063	0.0785	0.1033	0.0044	0.0155	0.7747	+++--	0.0	3.309	4	0.5075
19 : 52379626 : SNP	a	c	0.0141	0.0000	0.0141	0.0141	-0.0060	0.0536	0.9108	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 162094140 : SNP	a	c	0.0187	0.0000	0.0187	0.0187	0.0620	0.0455	0.1729	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 156596842 : SNP	t	c	0.1252	0.0081	0.1038	0.1377	-0.0063	0.0129	0.6267	---+-	0.0	1.704	4	0.79
3 : 42992660 : SNP	t	c	0.7919	0.0087	0.7751	0.8046	-0.0027	0.0106	0.7993	+++--	37.3	6.378	4	0.1727
5 : 5881356 : INDEL	d	r	0.3153	0.0106	0.2849	0.3374	-0.0096	0.0094	0.3078	-----	0.0	0.270	4	0.9917
12 : 63234066 : SNP	t	c	0.0167	0.0000	0.0167	0.0167	0.0850	0.0617	0.1681	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 16638631 : SNP	t	c	0.1903	0.0119	0.1813	0.2077	-0.0196	0.0264	0.458	??---	0.0	0.725	2	0.6959
18 : 57859933 : SNP	c	g	0.1215	0.0087	0.1092	0.1356	0.0061	0.0140	0.6608	+-+-?	20.2	3.758	3	0.2888
10 : 74011116 : SNP	c	g	0.6046	0.0074	0.5936	0.6133	0.0136	0.0086	0.1121	++-++	9.5	4.419	4	0.3523
1 : 169261356 : SNP	a	g	0.3627	0.0120	0.3429	0.3864	-0.0080	0.0091	0.3781	---++	4.1	4.173	4	0.3831
7 : 40256809 : SNP	a	c	0.4540	0.0080	0.4466	0.4743	-0.0011	0.0085	0.8934	-+-++	26.2	5.422	4	0.2466
11 : 32076311 : SNP	t	c	0.4852	0.0137	0.4729	0.5175	0.0125	0.0091	0.1675	+++-+	21.7	5.111	4	0.2761
2 : 82153239 : SNP	t	c	0.3216	0.0123	0.3106	0.3446	-0.0285	0.0091	0.001745	--+--	2.5	4.102	4	0.3924
11 : 4482492 : SNP	a	g	0.9180	0.0026	0.9137	0.9215	-0.0042	0.0164	0.7992	+-?--	0.0	0.807	3	0.8479
2 : 237603352 : SNP	t	c	0.7614	0.0087	0.7412	0.7760	0.0071	0.0102	0.4883	+-+--	0.0	3.649	4	0.4556
15 : 63470818 : SNP	t	g	0.0220	0.0000	0.0220	0.0220	0.0250	0.0455	0.5826	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 173357810 : SNP	t	c	0.7041	0.0144	0.6867	0.7542	0.0116	0.0094	0.2179	0+++-	30.6	5.765	4	0.2174
1 : 228106921 : SNP	a	g	0.1113	0.0044	0.0989	0.1174	-0.0106	0.0139	0.4466	-----	0.0	0.910	4	0.9231
3 : 143352837 : SNP	a	g	0.1695	0.0051	0.1627	0.1761	0.0202	0.0115	0.0778	+++++	0.0	2.954	4	0.5655
11 : 80254456 : SNP	t	c	0.1891	0.0157	0.1743	0.2201	0.0026	0.0110	0.8109	----+	18.3	4.897	4	0.298
2 : 221885293 : INDEL	d	r	0.0927	0.0036	0.0841	0.0974	-0.0233	0.0147	0.114	--+--	0.0	3.638	4	0.4572
5 : 171244788 : SNP	t	c	0.9681	0.0000	0.9681	0.9681	0.0210	0.0526	0.6895	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 29395679 : SNP	t	g	0.3777	0.0099	0.3528	0.3936	0.0060	0.0086	0.4835	-++++	0.0	3.844	4	0.4275
4 : 123727746 : SNP	a	g	0.0231	0.0000	0.0231	0.0231	-0.0480	0.0435	0.2695	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 80586207 : SNP	c	g	0.9550	0.0117	0.9359	0.9647	-0.0321	0.0228	0.158	+-?--	13.9	3.485	3	0.3227
18 : 7419084 : SNP	t	c	0.0645	0.0035	0.0612	0.0689	-0.0031	0.0199	0.8758	+-?-+	0.0	1.149	3	0.7652
2 : 234927610 : SNP	c	g	0.3230	0.0126	0.2974	0.3325	0.0101	0.0090	0.2625	++++-	42.5	6.958	4	0.1381
6 : 103195294 : SNP	a	t	0.0698	0.0087	0.0443	0.0742	-0.0117	0.0181	0.5192	--??-	0.0	0.210	2	0.9005
6 : 166954739 : SNP	t	c	0.0232	0.0000	0.0232	0.0232	-0.0580	0.0455	0.2023	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 40049458 : SNP	a	g	0.0241	0.0000	0.0241	0.0241	-0.0430	0.0414	0.2995	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 62047553 : SNP	t	c	0.2651	0.0106	0.2577	0.2921	-0.0016	0.0097	0.8685	---++	0.0	3.592	4	0.464
9 : 36034570 : SNP	a	g	0.1046	0.0076	0.0991	0.1304	0.0132	0.0145	0.3637	+-?++	0.0	2.959	3	0.3981
4 : 171175522 : SNP	a	g	0.6050	0.0055	0.5952	0.6303	-0.0061	0.0086	0.4794	+----	57.4	9.395	4	0.05194
3 : 29051075 : SNP	a	g	0.8776	0.0039	0.8707	0.8815	-0.0160	0.0132	0.2262	-----	0.0	0.782	4	0.9408
8 : 89371765 : SNP	a	g	0.9539	0.0060	0.9423	0.9603	0.0089	0.0208	0.6677	+-?+-	31.4	4.372	3	0.224
10 : 126070 : SNP	t	c	0.1078	0.0100	0.0649	0.1268	-0.0205	0.0138	0.1383	--+--	0.0	3.795	4	0.4345
11 : 114347651 : SNP	a	g	0.8911	0.0088	0.8611	0.8975	0.0086	0.0137	0.5326	+---+	48.2	7.724	4	0.1022
3 : 74710819 : SNP	a	c	0.8004	0.0171	0.7846	0.8420	0.0166	0.0109	0.1263	++++-	0.0	1.698	4	0.7911
10 : 130217130 : SNP	a	g	0.0606	0.0034	0.0569	0.0684	-0.0015	0.0192	0.9377	-+?++	21.2	3.805	3	0.2833
10 : 110157587 : SNP	t	c	0.4464	0.0171	0.4126	0.4652	0.0118	0.0085	0.1682	+-+++	32.1	5.890	4	0.2075
3 : 49139169 : SNP	a	g	0.0475	0.0000	0.0475	0.0475	-0.0020	0.0536	0.9702	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 83649679 : SNP	a	g	0.9463	0.0084	0.9323	0.9535	0.0016	0.0311	0.9588	-??++	0.0	1.332	2	0.5136
2 : 182907978 : SNP	a	g	0.8177	0.0101	0.8086	0.8368	-0.0144	0.0108	0.1805	--++-	29.9	5.708	4	0.2221
3 : 96563519 : SNP	t	g	0.9719	0.0008	0.9713	0.9730	-0.0012	0.0294	0.9673	-+???	3.6	1.037	1	0.3086
5 : 620486 : SNP	t	g	0.0431	0.0115	0.0339	0.0612	-0.0198	0.0267	0.4581	-??++	46.0	3.705	2	0.1569
9 : 19487363 : SNP	a	c	0.0137	0.0000	0.0137	0.0137	0.0120	0.0536	0.8228	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 56587609 : SNP	a	g	0.2663	0.0092	0.2388	0.2784	-0.0062	0.0098	0.5269	--+--	0.0	1.180	4	0.8813
3 : 105741572 : SNP	t	c	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	0.0570	0.0576	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 999862 : SNP	t	c	0.0551	0.0037	0.0456	0.0567	-0.0092	0.0201	0.6463	--??-	0.0	0.127	2	0.9383
3 : 75570607 : SNP	a	g	0.6421	0.0119	0.6192	0.6499	0.0110	0.0259	0.6709	??+--	8.2	2.179	2	0.3364
17 : 42426940 : SNP	a	g	0.1076	0.0174	0.0783	0.1243	-0.0029	0.0200	0.884	++?--	0.0	1.395	3	0.7066
1 : 170863662 : SNP	t	c	0.0323	0.0045	0.0293	0.0412	0.0282	0.0262	0.2816	++??-	0.0	1.487	2	0.4755
19 : 43281070 : SNP	a	t	0.5675	0.0329	0.5317	0.6282	-0.0299	0.0250	0.232	??---	0.0	0.234	2	0.8897
2 : 37230888 : SNP	a	g	0.8077	0.0034	0.8021	0.8127	0.0105	0.0107	0.3259	++++-	0.0	3.086	4	0.5436
7 : 31445815 : SNP	t	c	0.1402	0.0050	0.1364	0.1537	-0.0005	0.0123	0.9707	---++	14.7	4.690	4	0.3206
20 : 12232682 : SNP	t	c	0.7223	0.0074	0.6962	0.7325	0.0134	0.0098	0.1716	+++-+	0.0	2.328	4	0.6756
8 : 56995469 : SNP	a	g	0.2261	0.0341	0.2067	0.2944	-0.0068	0.0104	0.5158	--+++	0.0	1.573	4	0.8136
4 : 189131782 : SNP	t	c	0.8360	0.0059	0.8248	0.8414	0.0312	0.0292	0.2845	??-++	47.9	3.838	2	0.1468
17 : 701122 : SNP	a	g	0.2664	0.0078	0.2489	0.2719	0.0098	0.0099	0.3218	+-+++	0.0	2.410	4	0.6607
10 : 130281955 : SNP	a	g	0.2083	0.0176	0.1896	0.2401	-0.0140	0.0109	0.1994	-++--	0.0	3.382	4	0.4961
5 : 51546641 : SNP	a	c	0.5347	0.0128	0.5119	0.5633	0.0055	0.0085	0.5206	-++++	0.0	3.942	4	0.4139
2 : 26742511 : SNP	a	g	0.5690	0.0155	0.5410	0.5985	-0.0070	0.0086	0.4125	-+++-	0.0	2.343	4	0.6729
4 : 145703225 : SNP	t	c	0.0629	0.0034	0.0570	0.0659	0.0049	0.0182	0.7884	-+?++	46.7	5.625	3	0.1313
5 : 43180464 : SNP	a	g	0.1186	0.0081	0.1099	0.1381	0.0017	0.0134	0.899	+---+	0.0	3.668	4	0.4527
1 : 117644058 : SNP	a	g	0.9757	0.0000	0.9757	0.9757	0.0330	0.0485	0.4964	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 61924590 : SNP	a	c	0.1313	0.0039	0.1228	0.1394	-0.0005	0.0162	0.9758	+--+?	55.1	6.680	3	0.08284
8 : 14067513 : INDEL	i	r	0.6639	0.0092	0.6544	0.6734	0.0073	0.0091	0.4263	+---+	0.0	3.825	4	0.4302
10 : 64563699 : INDEL	d	r	0.0774	0.0046	0.0708	0.0868	0.0093	0.0165	0.5732	++?--	0.0	1.144	3	0.7664
7 : 79517399 : INDEL	i	r	0.2004	0.0086	0.1788	0.2122	-0.0088	0.0111	0.4277	+----	39.5	6.613	4	0.1578
6 : 31359160 : INDEL	d	r	0.0582	0.0000	0.0582	0.0582	0.0633	0.0518	0.2217	????+	0.0	0.000	0	1
20 : 46569706 : SNP	a	c	0.6533	0.0104	0.6384	0.6670	0.0087	0.0094	0.3537	+++--	34.4	6.098	4	0.192
1 : 83482095 : INDEL	i	r	0.1356	0.0115	0.1088	0.1449	0.0016	0.0128	0.8981	-+++-	53.5	8.605	4	0.07177
20 : 8851321 : SNP	t	c	0.6983	0.0191	0.6797	0.7385	0.0086	0.0093	0.356	+-+++	19.1	4.945	4	0.293
16 : 23608045 : SNP	a	g	0.9018	0.0064	0.8842	0.9078	0.0132	0.0144	0.3608	0+--+	0.0	2.363	4	0.6694
2 : 55606834 : SNP	a	t	0.0187	0.0000	0.0187	0.0187	0.0170	0.0475	0.7205	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 33500843 : SNP	t	c	0.7544	0.0194	0.7042	0.7654	-0.0097	0.0099	0.3281	--+--	0.0	2.635	4	0.6207
6 : 99915801 : INDEL	d	r	0.4035	0.0073	0.3971	0.4140	0.0051	0.0086	0.5482	++-++	0.0	2.211	4	0.697
6 : 100746217 : SNP	t	c	0.3025	0.0187	0.2904	0.3438	-0.0046	0.0092	0.6161	--+--	0.0	0.585	4	0.9647
11 : 73551583 : SNP	c	g	0.9539	0.0031	0.9513	0.9598	0.0162	0.0213	0.446	++??-	0.0	1.118	2	0.5719
12 : 8697920 : SNP	t	c	0.1747	0.0064	0.1592	0.1857	-0.0329	0.0115	0.004192	--+--	0.0	2.232	4	0.6931
12 : 41051496 : SNP	t	c	0.2650	0.0065	0.2604	0.2875	-0.0011	0.0098	0.9106	+--+-	10.9	4.488	4	0.344
14 : 22796794 : SNP	a	t	0.9228	0.0053	0.9112	0.9288	0.0157	0.0163	0.3366	++?-+	0.0	1.802	3	0.6145
20 : 58662969 : SNP	a	g	0.9114	0.0020	0.9083	0.9129	0.0058	0.0310	0.8516	?+?-+	0.0	0.552	2	0.7588
7 : 6941888 : SNP	a	c	0.7693	0.0249	0.7314	0.7881	-0.0118	0.0120	0.3233	-++-+	54.0	8.694	4	0.06923
5 : 175687581 : SNP	c	g	0.8719	0.0131	0.8532	0.8842	0.0092	0.0168	0.5835	+--+-	0.0	3.022	4	0.5541
7 : 158555706 : SNP	t	c	0.8777	0.0128	0.8566	0.8956	-0.0271	0.0133	0.04259	-----	0.0	0.501	4	0.9734
3 : 39489619 : SNP	a	c	0.4935	0.0083	0.4671	0.5181	-0.0066	0.0085	0.4418	-+++-	59.3	9.825	4	0.04349
2 : 12106199 : SNP	t	c	0.0701	0.0099	0.0599	0.0953	0.0165	0.0200	0.4092	+-?-+	15.1	3.535	3	0.3162
3 : 71233345 : SNP	t	c	0.0654	0.0000	0.0654	0.0654	0.0350	0.0374	0.3494	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 57438172 : SNP	t	c	0.0244	0.0000	0.0244	0.0244	-0.0050	0.0394	0.8991	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 182334344 : SNP	a	g	0.0191	0.0000	0.0191	0.0191	-0.0430	0.0475	0.3654	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 93606711 : SNP	c	g	0.9770	0.0000	0.9770	0.9770	-0.0170	0.0596	0.7756	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 29025068 : SNP	a	t	0.2573	0.0112	0.2458	0.3043	0.0033	0.0098	0.7356	-+-++	20.3	5.022	4	0.2851
18 : 70335358 : SNP	t	c	0.1010	0.0111	0.0714	0.1073	-0.0117	0.0145	0.4203	+--++	0.0	3.899	4	0.4199
7 : 22377287 : SNP	c	g	0.1071	0.0091	0.0752	0.1123	0.0001	0.0139	0.997	-++-+	0.0	1.542	4	0.8192
19 : 51091617 : SNP	a	g	0.2489	0.0144	0.2319	0.2622	0.0081	0.0114	0.4778	++-++	38.3	6.480	4	0.1661
1 : 216717143 : SNP	a	c	0.3412	0.0095	0.3313	0.3711	0.0009	0.0091	0.9179	+0--+	43.3	7.055	4	0.133
5 : 99077829 : SNP	c	g	0.1043	0.0073	0.0903	0.1140	0.0031	0.0143	0.8264	--+++	0.0	2.824	4	0.5877
7 : 18468321 : SNP	a	g	0.9732	0.0002	0.9730	0.9733	0.0475	0.0302	0.1161	++???	0.0	0.004	1	0.9488
10 : 88551464 : SNP	t	c	0.0969	0.0072	0.0875	0.1125	-0.0270	0.0188	0.1499	--?+-	0.0	2.561	3	0.4643
10 : 26636925 : SNP	t	g	0.4317	0.0093	0.4236	0.4608	0.0037	0.0085	0.6618	++-+-	8.5	4.370	4	0.3583
5 : 18457422 : SNP	c	g	0.0554	0.0055	0.0523	0.0667	0.0179	0.0195	0.3605	+-?-+	34.6	4.588	3	0.2046
15 : 35815546 : SNP	t	c	0.9477	0.0183	0.9194	0.9608	0.0178	0.0202	0.3787	+-?++	0.0	0.822	3	0.8443
16 : 5587792 : SNP	t	c	0.3061	0.0048	0.3010	0.3255	-0.0092	0.0092	0.3184	--+--	0.0	0.895	4	0.9252
7 : 94032212 : SNP	a	g	0.8830	0.0173	0.8501	0.8929	0.0055	0.0133	0.6809	-+-+-	66.2	11.824	4	0.01871
4 : 68070195 : SNP	a	c	0.0942	0.0076	0.0882	0.1128	0.0045	0.0161	0.7817	++?-+	23.1	3.903	3	0.2721
8 : 132198555 : SNP	t	c	0.5216	0.0197	0.4956	0.5687	0.0045	0.0085	0.5946	++-+-	26.6	5.449	4	0.2443
7 : 21649141 : SNP	a	g	0.8373	0.0103	0.8155	0.8442	0.0050	0.0115	0.6681	++--+	0.0	0.276	4	0.9913
5 : 125015836 : INDEL	i	r	0.2462	0.0030	0.2410	0.2557	0.0074	0.0104	0.4783	+-+-+	25.1	5.337	4	0.2544
8 : 97150045 : SNP	t	c	0.5947	0.0123	0.5823	0.6229	0.0016	0.0086	0.8481	++---	66.8	12.043	4	0.01704
1 : 76083408 : SNP	a	g	0.6377	0.0186	0.6070	0.6622	-0.0013	0.0090	0.8813	-++-+	30.2	5.733	4	0.22
9 : 24825057 : SNP	t	c	0.0105	0.0000	0.0105	0.0105	-0.0660	0.0596	0.2685	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 10148609 : SNP	a	c	0.4542	0.0121	0.4455	0.4915	0.0124	0.0092	0.1781	++-+?	0.0	2.414	3	0.491
5 : 42398465 : SNP	t	c	0.8423	0.0054	0.8359	0.8593	-0.0047	0.0120	0.6956	---++	0.0	0.752	4	0.9448
3 : 40158878 : SNP	t	c	0.2628	0.0049	0.2505	0.2677	0.0180	0.0098	0.06443	++-++	0.0	1.315	4	0.8589
1 : 102581053 : SNP	a	g	0.8170	0.0041	0.8051	0.8221	0.0113	0.0110	0.306	+++++	0.0	1.835	4	0.7662
6 : 141101454 : SNP	t	c	0.3148	0.0194	0.2746	0.3406	0.0128	0.0092	0.1649	+++--	57.6	9.425	4	0.05132
1 : 179443110 : SNP	a	g	0.4547	0.0077	0.4262	0.4588	0.0103	0.0085	0.2286	++-++	0.0	2.423	4	0.6585
4 : 61423829 : SNP	a	g	0.8626	0.0105	0.8527	0.8945	-0.0111	0.0123	0.3662	-++-+	23.0	5.192	4	0.2682
7 : 34654086 : INDEL	i	r	0.1838	0.0167	0.1668	0.2131	-0.0074	0.0112	0.5081	+--+-	0.0	1.642	4	0.8012
1 : 214665843 : SNP	a	g	0.0447	0.0010	0.0435	0.0455	0.0620	0.0256	0.01547	++???	37.7	1.604	1	0.2053
3 : 55578846 : SNP	t	c	0.4610	0.0096	0.4446	0.4957	-0.0112	0.0085	0.1888	+--+-	35.9	6.241	4	0.1819
2 : 170817858 : SNP	t	c	0.6239	0.0220	0.6118	0.6788	0.0011	0.0086	0.8947	++---	0.0	2.430	4	0.6572
7 : 66593785 : SNP	t	c	0.2380	0.0165	0.2221	0.2582	-0.0095	0.0142	0.5031	?----	0.0	0.723	3	0.8677
9 : 74937728 : SNP	a	g	0.2327	0.0081	0.2123	0.2440	-0.0057	0.0101	0.5734	+--+-	41.5	6.842	4	0.1445
6 : 168728989 : SNP	a	g	0.0629	0.0032	0.0598	0.0684	0.0035	0.0194	0.8578	+-?-+	27.9	4.160	3	0.2447
4 : 63561640 : SNP	a	g	0.7723	0.0101	0.7441	0.7797	-0.0130	0.0118	0.2702	-+-+-	2.1	4.088	4	0.3943
9 : 1155484 : SNP	t	c	0.2846	0.0135	0.2760	0.3109	-0.0104	0.0096	0.2801	-+---	0.0	3.199	4	0.525
1 : 228290033 : SNP	t	c	0.9842	0.0000	0.9842	0.9842	0.0580	0.0505	0.2512	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 42425286 : SNP	t	c	0.1458	0.0107	0.1197	0.1553	-0.0118	0.0123	0.3343	---++	0.0	2.357	4	0.6704
4 : 125362276 : SNP	t	c	0.4233	0.0109	0.4122	0.4563	-0.0051	0.0090	0.5688	0-++-	0.0	2.177	4	0.7033
5 : 172198952 : SNP	t	c	0.3245	0.0257	0.2638	0.3382	0.0095	0.0093	0.3096	++-++	0.0	3.011	4	0.556
5 : 140301543 : SNP	a	g	0.4770	0.0068	0.4733	0.4935	0.0005	0.0085	0.9513	+---+	0.0	3.720	4	0.4453
6 : 63173964 : SNP	a	g	0.9549	0.0020	0.9523	0.9565	-0.0076	0.0232	0.7449	+-???	0.0	0.417	1	0.5185
14 : 56065167 : SNP	a	t	0.9037	0.0085	0.8943	0.9220	0.0239	0.0147	0.1045	+++-+	0.0	0.755	4	0.9443
6 : 121519347 : SNP	a	t	0.8570	0.0044	0.8504	0.8667	0.0105	0.0123	0.3912	+-+--	25.2	5.349	4	0.2533
8 : 17923589 : SNP	t	c	0.9641	0.0021	0.9615	0.9657	0.0217	0.0269	0.4187	++???	0.0	0.040	1	0.8417
10 : 12594436 : SNP	a	g	0.1597	0.0112	0.1472	0.1701	-0.0107	0.0116	0.3592	-++--	20.8	5.054	4	0.2819
5 : 89344942 : SNP	t	c	0.8304	0.0098	0.8102	0.8405	-0.0016	0.0116	0.8914	+-+-+	49.4	7.906	4	0.0951
14 : 82626411 : SNP	t	g	0.0279	0.0000	0.0279	0.0279	-0.0100	0.0465	0.8297	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 72245915 : SNP	t	g	0.4372	0.0153	0.4005	0.4472	0.0037	0.0091	0.6861	+++--	0.0	1.356	4	0.8517
1 : 31926776 : SNP	a	g	0.7049	0.0150	0.6773	0.7422	-0.0162	0.0097	0.09644	-----	0.0	1.084	4	0.8968
8 : 19711958 : SNP	t	c	0.5340	0.0266	0.4871	0.5677	-0.0037	0.0086	0.6621	-+-+-	0.0	2.530	4	0.6392
18 : 68526601 : SNP	a	g	0.3818	0.0278	0.3193	0.4044	-0.0023	0.0086	0.7921	-++--	20.9	5.057	4	0.2815
6 : 45843611 : SNP	t	c	0.7350	0.0097	0.7225	0.7550	-0.0004	0.0098	0.9701	+-+--	7.5	4.327	4	0.3636
13 : 105158722 : SNP	a	g	0.5972	0.0346	0.5219	0.6157	0.0020	0.0091	0.8254	+-+--	50.2	8.032	4	0.0904
18 : 93016 : SNP	c	g	0.1497	0.0107	0.1301	0.1555	0.0012	0.0379	0.9755	???+-	0.0	0.543	1	0.4612
5 : 128993984 : INDEL	d	r	0.1147	0.0123	0.0966	0.1408	-0.0038	0.0136	0.7824	--+-+	58.3	9.584	4	0.04806
2 : 166895203 : SNP	a	c	0.3159	0.0177	0.3026	0.3686	0.0047	0.0091	0.6073	0-+++	18.1	4.886	4	0.2992
2 : 213404347 : INDEL	i	r	0.4236	0.0203	0.3781	0.4428	0.0112	0.0089	0.2069	++---	42.6	6.968	4	0.1376
6 : 162725986 : INDEL	d	r	0.0497	0.0025	0.0480	0.0584	-0.0186	0.0204	0.3611	--?-+	0.0	1.271	3	0.736
1 : 223123669 : SNP	t	c	0.4658	0.0151	0.4341	0.4746	0.0168	0.0182	0.3549	??++-	34.0	3.029	2	0.22
10 : 773386 : SNP	t	c	0.1895	0.0100	0.1742	0.2103	0.0253	0.0112	0.02395	+++++	0.0	2.995	4	0.5587
1 : 32031843 : SNP	a	g	0.9052	0.0158	0.8966	0.9482	0.0081	0.0158	0.61	0+-+-	0.0	1.424	4	0.84
5 : 61369605 : SNP	t	c	0.8670	0.0092	0.8561	0.8811	-0.0200	0.0128	0.118	+----	43.7	7.110	4	0.1302
4 : 29568252 : SNP	a	t	0.9821	0.0000	0.9821	0.9821	0.0330	0.0485	0.4964	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 127617246 : SNP	t	g	0.8606	0.0107	0.8361	0.8907	0.0055	0.0127	0.6668	-++-+	0.0	1.926	4	0.7494
12 : 96879382 : SNP	c	g	0.0132	0.0000	0.0132	0.0132	0.0590	0.0536	0.2708	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 54913174 : SNP	t	c	0.4856	0.0110	0.4703	0.5154	0.0029	0.0085	0.7369	++---	1.8	4.074	4	0.3961
10 : 124992759 : INDEL	d	r	0.2418	0.0078	0.2214	0.2527	0.0025	0.0104	0.8095	++-+-	61.9	10.487	4	0.03298
10 : 43719286 : SNP	a	g	0.8299	0.0080	0.8141	0.8466	-0.0073	0.0114	0.5216	+---+	7.6	4.331	4	0.363
13 : 83456700 : SNP	c	g	0.7672	0.0038	0.7599	0.7745	0.0113	0.0103	0.2747	+-+++	14.3	4.666	4	0.3233
14 : 59431951 : SNP	a	c	0.2758	0.0077	0.2638	0.2832	-0.0070	0.0094	0.4591	+0---	45.3	7.318	4	0.12
12 : 28092765 : SNP	a	g	0.2993	0.0241	0.2823	0.3746	0.0081	0.0092	0.3781	+-++-	36.0	6.254	4	0.181
13 : 74442137 : SNP	a	g	0.5538	0.0141	0.5444	0.5838	0.0015	0.0092	0.8738	--+++	0.0	1.807	4	0.7711
2 : 49368952 : SNP	c	g	0.0344	0.0027	0.0322	0.0376	-0.0185	0.0266	0.4879	+-???	55.1	2.226	1	0.1357
8 : 84782369 : SNP	a	g	0.9068	0.0018	0.9050	0.9127	0.0165	0.0146	0.2565	+----	7.6	4.328	4	0.3635
2 : 77199169 : SNP	a	t	0.8077	0.0022	0.8017	0.8131	-0.0078	0.0112	0.4863	-+++-	0.0	2.827	4	0.5872
3 : 195492817 : SNP	t	c	0.7317	0.0076	0.7270	0.7641	0.0153	0.0095	0.108	+++++	0.0	2.426	4	0.6579
16 : 54485959 : SNP	a	g	0.5788	0.0217	0.5007	0.6156	-0.0045	0.0087	0.6035	-+++-	0.0	3.574	4	0.4668
4 : 797490 : SNP	a	g	0.0338	0.0000	0.0338	0.0338	-0.0410	0.0495	0.4078	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 63863709 : INDEL	i	r	0.0865	0.0105	0.0567	0.0914	-0.0060	0.0159	0.7057	--?++	33.5	4.514	3	0.211
2 : 85555478 : SNP	t	c	0.5463	0.0164	0.5329	0.5800	0.0004	0.0086	0.9587	-+--+	42.2	6.926	4	0.1398
1 : 150362154 : SNP	t	c	0.6120	0.0110	0.5818	0.6497	0.0153	0.0089	0.08527	+++--	52.2	8.372	4	0.07885
15 : 91927040 : SNP	a	g	0.4520	0.0124	0.4408	0.4886	0.0006	0.0086	0.9457	++++-	0.0	3.420	4	0.4902
7 : 105083206 : INDEL	i	r	0.5656	0.0118	0.5424	0.5765	0.0044	0.0116	0.7019	-+++-	35.4	6.189	4	0.1854
19 : 51997253 : SNP	t	c	0.8768	0.0050	0.8646	0.8833	-0.0009	0.0144	0.9491	-+-++	0.0	0.580	4	0.9653
8 : 113223958 : SNP	a	g	0.0797	0.0030	0.0771	0.0832	-0.0075	0.0201	0.708	-+???	55.6	2.251	1	0.1335
8 : 136809117 : INDEL	d	r	0.3470	0.0134	0.3293	0.3710	0.0021	0.0091	0.8142	++---	0.0	1.757	4	0.7804
3 : 9557738 : INDEL	d	r	0.0615	0.0068	0.0433	0.0660	0.0241	0.0186	0.1951	++?-+	0.0	1.169	3	0.7605
2 : 218944808 : SNP	a	g	0.4351	0.0283	0.4039	0.4895	-0.0032	0.0085	0.7101	-0++-	0.0	0.137	4	0.9978
1 : 5230746 : SNP	a	g	0.4217	0.0206	0.4104	0.4690	-0.0048	0.0086	0.5742	--+-+	51.3	8.218	4	0.0839
5 : 67255505 : SNP	t	c	0.8801	0.0073	0.8662	0.8848	-0.0012	0.0133	0.9274	+-++-	0.0	1.254	4	0.869
17 : 28092803 : SNP	t	c	0.4745	0.0178	0.4357	0.4899	0.0098	0.0085	0.2493	++++-	0.0	2.093	4	0.7187
9 : 86045625 : SNP	a	g	0.0385	0.0022	0.0353	0.0401	0.0081	0.0255	0.7522	+-???	67.6	3.090	1	0.07879
1 : 170186610 : SNP	t	c	0.3245	0.0117	0.3043	0.3665	-0.0102	0.0091	0.2602	-+-+-	7.4	4.322	4	0.3642
7 : 24484602 : SNP	a	c	0.3494	0.0139	0.3182	0.3805	0.0165	0.0091	0.07103	+-+-+	3.5	4.146	4	0.3866
9 : 19364042 : SNP	a	g	0.5319	0.0113	0.5129	0.5554	-0.0059	0.0091	0.5176	----+	0.0	1.326	4	0.8569
14 : 89360196 : SNP	a	g	0.7389	0.0155	0.7143	0.7608	-0.0001	0.0098	0.9931	-++++	21.5	5.098	4	0.2774
18 : 48033965 : SNP	t	c	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	-0.0790	0.0586	0.1778	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 6860186 : SNP	t	c	0.0941	0.0078	0.0665	0.0989	-0.0089	0.0146	0.5395	+---+	28.6	5.606	4	0.2306
19 : 39542089 : SNP	a	g	0.4442	0.0156	0.4112	0.4570	0.0086	0.0086	0.3127	+--++	0.0	3.945	4	0.4134
4 : 106285876 : SNP	t	c	0.2172	0.0181	0.2000	0.2481	-0.0219	0.0103	0.03329	--++-	6.3	4.270	4	0.3708
6 : 151493819 : SNP	t	c	0.4816	0.0237	0.4234	0.5141	0.0133	0.0100	0.1856	+-+++	41.2	6.799	4	0.1469
2 : 73477257 : SNP	a	c	0.0256	0.0047	0.0224	0.0324	0.0654	0.0358	0.06735	+???+	0.0	0.392	1	0.5314
8 : 98543734 : INDEL	i	r	0.0318	0.0045	0.0282	0.0375	0.0628	0.0331	0.058	++???	55.6	2.254	1	0.1333
12 : 106929933 : SNP	a	g	0.2022	0.0071	0.1743	0.2071	-0.0149	0.0113	0.1876	--++-	65.8	11.710	4	0.01964
1 : 203518456 : SNP	a	t	0.5387	0.0192	0.4823	0.5503	0.0308	0.0199	0.1213	??+++	0.0	0.978	2	0.6133
1 : 212771356 : SNP	t	c	0.9118	0.0056	0.9004	0.9178	0.0049	0.0157	0.7548	-+?-+	0.7	3.023	3	0.3882
10 : 62503198 : SNP	a	t	0.3107	0.0209	0.2782	0.3385	-0.0009	0.0092	0.9215	-+---	26.7	5.460	4	0.2433
10 : 59532870 : SNP	a	g	0.8607	0.0067	0.8541	0.8747	-0.0121	0.0125	0.3309	+-+--	32.2	5.900	4	0.2068
1 : 193131541 : SNP	t	c	0.0498	0.0029	0.0456	0.0540	-0.0038	0.0203	0.853	-+?++	31.2	4.363	3	0.2248
2 : 143305365 : SNP	a	c	0.9413	0.0048	0.9318	0.9440	0.0135	0.0192	0.4814	++?--	26.1	4.062	3	0.2549
8 : 105531749 : SNP	a	t	0.2194	0.0084	0.1859	0.2282	-0.0030	0.0105	0.7723	+--+-	0.0	2.166	4	0.7053
5 : 131315884 : SNP	a	g	0.5888	0.0043	0.5830	0.5974	-0.0019	0.0086	0.8214	+--++	29.0	5.636	4	0.2281
4 : 101137084 : SNP	t	c	0.2481	0.0137	0.2295	0.2793	-0.0033	0.0099	0.7423	+----	0.0	2.223	4	0.6948
7 : 44114901 : SNP	a	g	0.2306	0.0065	0.2262	0.2492	-0.0057	0.0099	0.5603	-----	0.0	0.729	4	0.9477
16 : 5268538 : SNP	a	c	0.0358	0.0013	0.0339	0.0375	-0.0314	0.0240	0.1905	--??-	0.0	0.896	2	0.639
3 : 117212471 : SNP	a	g	0.0346	0.0080	0.0303	0.0506	0.0125	0.0259	0.629	-+??+	46.9	3.767	2	0.1521
21 : 23422492 : SNP	a	t	0.1150	0.0161	0.0890	0.1254	-0.0013	0.0184	0.9439	-+?++	57.5	7.059	3	0.07004
2 : 148595355 : SNP	t	c	0.3019	0.0059	0.2750	0.3083	-0.0022	0.0092	0.8132	+++--	0.0	2.727	4	0.6044
14 : 96160474 : SNP	a	g	0.4328	0.0099	0.4142	0.4578	0.0006	0.0087	0.9484	-+--+	0.0	3.063	4	0.5473
5 : 103208916 : SNP	a	t	0.6309	0.0180	0.6131	0.6854	0.0026	0.0086	0.7677	--+++	48.6	7.775	4	0.1002
20 : 6045576 : SNP	t	c	0.7796	0.0077	0.7676	0.7875	-0.0076	0.0105	0.4666	-0-+-	0.0	2.289	4	0.6828
17 : 31757511 : SNP	a	g	0.1005	0.0103	0.0919	0.1203	-0.0027	0.0142	0.846	+-+--	17.7	4.861	4	0.3018
4 : 140711966 : SNP	t	c	0.7143	0.0115	0.6952	0.7407	0.0091	0.0099	0.3568	+--++	7.4	4.320	4	0.3644
6 : 12462171 : SNP	t	c	0.1957	0.0007	0.1948	0.1963	0.0121	0.0107	0.2596	++---	0.0	3.791	4	0.435
5 : 22736942 : SNP	t	c	0.9679	0.0043	0.9611	0.9722	0.0188	0.0274	0.493	-+??+	42.5	3.478	2	0.1757
1 : 233968326 : SNP	t	c	0.2577	0.0156	0.2445	0.2908	0.0046	0.0097	0.6388	0+++-	0.0	2.022	4	0.7317
14 : 27362941 : SNP	a	g	0.2029	0.0045	0.1901	0.2103	0.0039	0.0106	0.7145	++++-	0.0	2.053	4	0.7259
6 : 92600614 : SNP	t	g	0.8220	0.0076	0.8162	0.8385	-0.0279	0.0112	0.01246	---+-	0.0	1.532	4	0.821
3 : 120320939 : SNP	t	c	0.1312	0.0169	0.1217	0.1695	-0.0163	0.0136	0.2304	--++-	0.0	2.774	4	0.5963
9 : 90054043 : INDEL	d	r	0.6180	0.0097	0.5968	0.6397	0.0172	0.0091	0.06007	-++++	44.1	7.161	4	0.1276
12 : 109525735 : SNP	t	g	0.8335	0.0061	0.8213	0.8390	0.0050	0.0113	0.6556	+++-+	8.4	4.369	4	0.3583
8 : 4099341 : SNP	t	c	0.6600	0.0186	0.6386	0.7024	0.0027	0.0094	0.7754	-++++	0.0	2.195	4	0.7
11 : 45490149 : SNP	t	c	0.0453	0.0092	0.0386	0.0642	-0.0255	0.0294	0.3852	-??-+	0.0	0.889	2	0.6412
6 : 145791424 : INDEL	d	r	0.5076	0.0079	0.4909	0.5144	0.0120	0.0085	0.1583	+++-+	0.0	1.926	4	0.7494
1 : 169260704 : SNP	t	c	0.0964	0.0147	0.0869	0.1254	0.0047	0.0145	0.7471	-++-+	0.0	3.699	4	0.4482
12 : 131876897 : SNP	c	g	0.4265	0.0114	0.4113	0.4446	0.0012	0.0091	0.8921	-+++-	0.0	2.407	4	0.6614
11 : 106291272 : SNP	a	c	0.5493	0.0208	0.5329	0.5922	0.0003	0.0086	0.9697	-+++-	0.0	1.975	4	0.7403
21 : 40490075 : SNP	c	g	0.2429	0.0059	0.2371	0.2558	-0.0014	0.0100	0.891	+---+	0.0	2.148	4	0.7086
13 : 49445676 : SNP	a	g	0.0358	0.0036	0.0322	0.0429	-0.0139	0.0243	0.5681	--??+	27.5	2.757	2	0.2519
4 : 23506683 : SNP	t	c	0.0380	0.0076	0.0318	0.0528	-0.0028	0.0239	0.9067	++??-	0.0	0.986	2	0.6107
9 : 115326420 : SNP	a	g	0.1249	0.0068	0.1147	0.1340	-0.0071	0.0133	0.5934	-++-+	29.6	5.679	4	0.2245
2 : 229721578 : SNP	c	g	0.0727	0.0009	0.0718	0.0741	0.0050	0.0181	0.7826	++?--	42.7	5.234	3	0.1554
4 : 32066389 : SNP	a	g	0.8564	0.0183	0.8479	0.9029	-0.0114	0.0124	0.3583	-0++-	0.0	3.233	4	0.5196
1 : 217445081 : SNP	a	g	0.8841	0.0106	0.8753	0.9090	0.0060	0.0132	0.6524	++---	0.0	1.189	4	0.8799
7 : 75431706 : SNP	t	c	0.4378	0.0274	0.4005	0.4783	0.0050	0.0104	0.6288	-+-++	0.0	2.096	4	0.7182
3 : 141420500 : SNP	t	g	0.1222	0.0089	0.1125	0.1320	0.0157	0.0142	0.2695	-+?-+	52.2	6.277	3	0.09889
6 : 33517790 : SNP	a	c	0.2580	0.0191	0.2182	0.2743	-0.0037	0.0096	0.6968	---++	0.0	3.480	4	0.4809
9 : 10832706 : SNP	t	c	0.2622	0.0075	0.2558	0.2792	-0.0173	0.0097	0.07614	----+	0.0	1.791	4	0.7741
19 : 19824276 : SNP	a	g	0.4457	0.0134	0.4367	0.4757	-0.0013	0.0087	0.8843	0--+-	0.0	1.948	4	0.7454
1 : 12619998 : INDEL	i	r	0.0911	0.0077	0.0860	0.1192	-0.0040	0.0169	0.8126	+-?+-	11.3	3.384	3	0.3361
1 : 28423250 : INDEL	i	r	0.2203	0.0125	0.1941	0.2329	0.0023	0.0138	0.866	-++-+	27.4	5.506	4	0.2392
13 : 89642010 : SNP	a	t	0.7604	0.0044	0.7573	0.7710	0.0030	0.0099	0.7648	0++--	13.3	4.613	4	0.3293
13 : 58851350 : SNP	a	g	0.8199	0.0063	0.8108	0.8321	-0.0018	0.0113	0.8753	++---	0.0	2.466	4	0.6508
18 : 33789924 : SNP	t	c	0.0787	0.0112	0.0436	0.0848	-0.0158	0.0173	0.3624	+-??-	27.7	2.765	2	0.251
6 : 62188432 : SNP	t	c	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	-0.0230	0.0505	0.6491	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 62856756 : SNP	a	g	0.9690	0.0000	0.9690	0.9690	-0.0820	0.0445	0.06524	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 177786299 : SNP	t	c	0.8785	0.0089	0.8719	0.8924	0.0109	0.0183	0.5531	-+?++	31.3	4.365	3	0.2246
3 : 181108814 : SNP	a	g	0.4779	0.0145	0.4452	0.5058	0.0096	0.0085	0.2591	+++--	0.0	2.405	4	0.6617
5 : 110913486 : SNP	c	g	0.0341	0.0007	0.0332	0.0346	-0.0189	0.0290	0.5138	--???	0.0	0.248	1	0.6186
11 : 123820926 : INDEL	d	r	0.0654	0.0055	0.0616	0.0816	-0.0130	0.0188	0.4888	-+?--	0.0	0.333	3	0.9537
5 : 112726019 : SNP	t	c	0.5363	0.0396	0.4414	0.5668	0.0054	0.0086	0.5317	++-++	0.0	0.547	4	0.9688
1 : 241913637 : SNP	a	g	0.8298	0.0061	0.8193	0.8542	-0.0034	0.0113	0.7642	-+++-	54.0	8.703	4	0.06898
4 : 119742877 : INDEL	i	r	0.0600	0.0078	0.0387	0.0643	-0.0128	0.0193	0.507	+-??-	0.0	1.539	2	0.4633
20 : 12688262 : SNP	a	g	0.3436	0.0158	0.3248	0.3690	-0.0026	0.0102	0.796	+-+--	12.3	4.562	4	0.3353
13 : 72767758 : SNP	t	c	0.9138	0.0062	0.8969	0.9224	-0.0326	0.0156	0.03689	--?--	60.5	7.598	3	0.05508
6 : 126759641 : INDEL	i	r	0.4722	0.0182	0.4621	0.5143	-0.0004	0.0085	0.9667	0+-+-	7.1	4.304	4	0.3664
18 : 34009962 : SNP	a	g	0.8379	0.0088	0.8249	0.8555	0.0039	0.0127	0.7597	+-++-	0.0	3.197	4	0.5255
4 : 10129796 : SNP	c	g	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	0.0560	0.0475	0.2385	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 100293145 : SNP	c	g	0.1578	0.0015	0.1555	0.1597	0.0189	0.0123	0.1257	+++++	0.0	2.826	4	0.5873
5 : 15209311 : SNP	a	c	0.5690	0.0155	0.5333	0.5789	0.0020	0.0085	0.8118	+--+-	30.3	5.741	4	0.2193
7 : 109705689 : SNP	c	g	0.6809	0.0293	0.6165	0.7000	0.0048	0.0091	0.5997	0++++	0.0	2.084	4	0.7204
17 : 66259383 : INDEL	d	r	0.4479	0.0227	0.4186	0.4830	-0.0035	0.0099	0.7228	+--++	0.0	3.962	4	0.4112
10 : 89103335 : SNP	a	c	0.5298	0.0070	0.5262	0.5456	-0.0072	0.0221	0.7453	??--+	0.0	0.693	2	0.707
2 : 58046995 : SNP	a	g	0.3720	0.0154	0.3246	0.3843	0.0057	0.0086	0.5059	+-++-	0.0	0.989	4	0.9114
8 : 112674740 : SNP	t	c	0.2719	0.0114	0.2584	0.2988	-0.0081	0.0094	0.3886	--+--	0.0	1.128	4	0.8898
2 : 28827912 : SNP	a	g	0.1090	0.0036	0.0926	0.1104	-0.0090	0.0136	0.5082	-+--+	50.0	7.993	4	0.09184
1 : 97732528 : SNP	t	c	0.0475	0.0071	0.0420	0.0640	0.0478	0.0215	0.0264	++?-+	45.8	5.534	3	0.1366
1 : 41300682 : SNP	t	c	0.0553	0.0044	0.0482	0.0581	-0.0068	0.0226	0.7634	--??+	51.5	4.122	2	0.1273
3 : 21830849 : SNP	t	g	0.0331	0.0000	0.0331	0.0331	0.0510	0.0485	0.2932	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 6127921 : SNP	a	c	0.8711	0.0039	0.8645	0.8777	0.0012	0.0127	0.9248	-+---	34.3	6.090	4	0.1925
2 : 79316928 : SNP	t	c	0.0300	0.0006	0.0292	0.0305	0.0312	0.0285	0.2735	+-???	7.4	1.080	1	0.2987
9 : 113468736 : SNP	t	c	0.5509	0.0151	0.5128	0.5621	-0.0005	0.0085	0.955	++---	0.0	1.541	4	0.8194
8 : 2039034 : SNP	a	t	0.9326	0.0038	0.9297	0.9378	-0.0042	0.0190	0.8255	+-?-?	0.0	1.010	2	0.6035
4 : 139229103 : SNP	a	g	0.7108	0.0165	0.6871	0.7343	-0.0023	0.0107	0.8283	--++-	0.0	1.256	4	0.8687
11 : 26133582 : SNP	a	c	0.0137	0.0000	0.0137	0.0137	0.0820	0.0546	0.133	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 82478590 : SNP	a	g	0.0644	0.0045	0.0607	0.0763	0.0220	0.0182	0.2268	++?++	0.0	0.068	3	0.9953
4 : 8222113 : INDEL	i	r	0.1208	0.0110	0.1039	0.1349	-0.0157	0.0178	0.3791	--?--	0.0	0.118	3	0.9896
12 : 119027938 : SNP	a	c	0.7264	0.0061	0.7215	0.7417	-0.0132	0.0097	0.1754	--+--	3.0	4.124	4	0.3895
8 : 90711982 : SNP	c	g	0.4209	0.0116	0.4065	0.4321	-0.0064	0.0093	0.4911	-++--	0.0	2.350	4	0.6718
13 : 64820417 : SNP	t	c	0.0684	0.0021	0.0667	0.0723	0.0090	0.0172	0.5982	++?-+	41.3	5.112	3	0.1638
10 : 127740129 : SNP	t	g	0.9748	0.0000	0.9748	0.9748	0.0280	0.0536	0.6012	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 27264403 : SNP	a	g	0.2078	0.0064	0.1852	0.2110	-0.0175	0.0105	0.09685	--+--	0.0	1.689	4	0.7926
11 : 79409087 : SNP	c	g	0.0136	0.0000	0.0136	0.0136	-0.0550	0.0536	0.3046	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 161711252 : SNP	a	g	0.6232	0.0043	0.6205	0.6326	0.0035	0.0087	0.688	+-+-+	19.9	4.996	4	0.2877
2 : 146053387 : SNP	c	g	0.9107	0.0036	0.9012	0.9158	0.0171	0.0155	0.2719	+++--	0.0	2.116	4	0.7144
7 : 42708561 : SNP	t	g	0.9887	0.0000	0.9887	0.9887	-0.0270	0.0637	0.6716	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 4414529 : SNP	c	g	0.0840	0.0014	0.0805	0.0859	-0.0283	0.0157	0.07239	--?+-	7.7	3.251	3	0.3545
7 : 121290877 : INDEL	i	r	0.3525	0.0113	0.3396	0.3694	0.0079	0.0097	0.4152	0+-++	0.0	3.645	4	0.4561
17 : 43015300 : SNP	a	g	0.4876	0.0096	0.4665	0.4954	-0.0083	0.0085	0.3322	-----	0.0	2.033	4	0.7297
9 : 36397080 : SNP	a	g	0.8350	0.0217	0.8087	0.8694	-0.0189	0.0164	0.2482	-+---	43.8	7.122	4	0.1296
7 : 125640459 : SNP	t	c	0.7893	0.0095	0.7705	0.8004	-0.0001	0.0106	0.9953	-+++-	30.5	5.758	4	0.218
13 : 95643937 : SNP	c	g	0.6807	0.0124	0.6538	0.6882	-0.0014	0.0092	0.8829	+-+-+	70.3	13.475	4	0.009174
3 : 8113945 : SNP	t	c	0.9607	0.0041	0.9579	0.9675	0.0137	0.0248	0.5806	+-??+	61.4	5.175	2	0.07519
1 : 171138644 : SNP	a	g	0.0750	0.0099	0.0671	0.0948	-0.0043	0.0163	0.7911	-+?--	0.0	2.927	3	0.4031
10 : 110823811 : SNP	t	c	0.8689	0.0091	0.8488	0.8762	0.0218	0.0124	0.07995	+--++	0.0	3.187	4	0.527
9 : 97306520 : SNP	c	g	0.7323	0.0339	0.7053	0.7894	0.0032	0.0124	0.7942	+-+--	53.1	8.532	4	0.07392
18 : 2282084 : SNP	a	g	0.7186	0.0123	0.6904	0.7638	0.0126	0.0099	0.2027	+++--	0.0	2.464	4	0.6511
3 : 107219226 : SNP	a	c	0.5901	0.0089	0.5616	0.6012	0.0031	0.0085	0.719	-++++	0.0	2.629	4	0.6217
4 : 20932463 : SNP	a	t	0.9156	0.0131	0.8882	0.9277	0.0299	0.0158	0.0582	+++-+	0.0	3.321	4	0.5055
19 : 51433003 : SNP	a	g	0.0711	0.0078	0.0624	0.0845	0.0186	0.0177	0.2923	-+?++	0.0	2.274	3	0.5175
10 : 62124299 : INDEL	i	r	0.0369	0.0000	0.0369	0.0369	0.0280	0.0394	0.4776	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 27707497 : SNP	t	c	0.8458	0.0130	0.8295	0.8652	-0.0285	0.0180	0.114	--?+-	44.4	5.393	3	0.1452
10 : 52757241 : SNP	t	g	0.1293	0.0068	0.1106	0.1383	0.0052	0.0126	0.6789	++---	0.0	2.317	4	0.6777
9 : 81585474 : INDEL	i	r	0.0239	0.0000	0.0239	0.0239	0.0600	0.0576	0.2977	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 51249246 : SNP	a	t	0.1954	0.0103	0.1810	0.2113	-0.0440	0.0319	0.168	??---	0.0	1.198	2	0.5493
14 : 88306383 : SNP	a	c	0.0197	0.0000	0.0197	0.0197	0.0000	0.0445	1	0????	0.0	0.000	0	1
6 : 168629933 : SNP	a	t	0.0805	0.0066	0.0769	0.0955	0.0114	0.0172	0.508	++?--	59.5	7.416	3	0.05975
11 : 103485351 : SNP	t	g	0.1190	0.0023	0.1147	0.1278	0.0016	0.0141	0.9124	-++-+	0.0	1.941	4	0.7466
13 : 21579957 : SNP	a	c	0.9716	0.0020	0.9691	0.9732	0.0145	0.0317	0.6476	-+???	61.5	2.600	1	0.1068
3 : 94776301 : SNP	a	c	0.3662	0.0089	0.3498	0.3740	0.0135	0.0086	0.1144	+++--	0.0	3.980	4	0.4087
7 : 133726952 : SNP	a	g	0.1858	0.0054	0.1754	0.1957	0.0184	0.0111	0.09683	++++-	0.0	2.072	4	0.7225
7 : 98283873 : SNP	a	g	0.3198	0.0153	0.3062	0.3486	-0.0139	0.0097	0.1501	---+-	0.0	0.592	4	0.9639
5 : 157785566 : SNP	a	c	0.0538	0.0051	0.0496	0.0599	0.0047	0.0218	0.8297	++???	0.0	0.041	1	0.8389
12 : 131931845 : SNP	t	c	0.8069	0.0155	0.7753	0.8292	0.0007	0.0107	0.9486	-+++-	43.7	7.107	4	0.1303
5 : 161137887 : SNP	a	t	0.4985	0.0175	0.4724	0.5233	0.0140	0.0093	0.1308	-+-++	52.4	8.407	4	0.07774
1 : 217916261 : SNP	a	g	0.4230	0.0200	0.4104	0.4637	0.0013	0.0085	0.8744	++--+	0.0	1.754	4	0.7809
2 : 50613327 : SNP	a	t	0.7502	0.0109	0.7359	0.7606	-0.0031	0.0098	0.7555	+++--	0.0	2.487	4	0.647
15 : 63696183 : SNP	t	c	0.6249	0.0057	0.6144	0.6372	-0.0127	0.0086	0.1406	--+-+	0.0	3.917	4	0.4174
19 : 7976112 : SNP	a	g	0.1507	0.0105	0.1418	0.1640	0.0289	0.0238	0.2235	+??-+	0.0	0.271	2	0.8734
5 : 57977835 : SNP	t	c	0.1758	0.0077	0.1551	0.1828	-0.0144	0.0115	0.2084	--+++	0.0	1.518	4	0.8234
1 : 202308344 : SNP	a	g	0.4660	0.0191	0.4138	0.4806	-0.0067	0.0085	0.4313	-----	0.0	0.355	4	0.986
1 : 230156182 : SNP	a	g	0.1264	0.0089	0.1114	0.1380	0.0344	0.0133	0.009525	+++++	0.0	1.215	4	0.8756
13 : 97865044 : SNP	a	t	0.9102	0.0043	0.9041	0.9161	-0.0099	0.0149	0.5045	--+-+	13.4	4.616	4	0.329
1 : 205369730 : SNP	t	c	0.3133	0.0159	0.2826	0.3309	0.0145	0.0092	0.1147	+++++	0.0	1.086	4	0.8965
22 : 24256894 : SNP	t	c	0.7336	0.0032	0.7277	0.7397	0.0152	0.0098	0.1201	+++++	0.0	0.715	4	0.9494
13 : 59145550 : SNP	t	c	0.8595	0.0038	0.8535	0.8740	0.0023	0.0122	0.8516	++---	18.9	4.933	4	0.2942
15 : 98057072 : SNP	t	c	0.9643	0.0000	0.9643	0.9643	0.0530	0.0465	0.2544	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 116513182 : SNP	a	g	0.1507	0.0038	0.1382	0.1601	0.0071	0.0127	0.5736	++---	54.1	8.714	4	0.06865
11 : 59180883 : SNP	t	g	0.7376	0.0101	0.7247	0.7548	-0.0085	0.0098	0.3893	---+-	34.2	6.076	4	0.1936
7 : 153899034 : SNP	t	c	0.9718	0.0000	0.9718	0.9718	-0.0800	0.0384	0.03728	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 74513706 : SNP	t	c	0.3237	0.0095	0.3140	0.3511	-0.0042	0.0091	0.6439	-+++-	0.0	3.965	4	0.4107
6 : 26413235 : SNP	t	c	0.1620	0.0130	0.1475	0.1752	0.0006	0.0114	0.9565	-+++-	14.7	4.691	4	0.3206
5 : 22489161 : SNP	t	c	0.1208	0.0118	0.0997	0.1512	0.0236	0.0138	0.08718	+++-+	0.0	3.070	4	0.5461
16 : 87583089 : SNP	t	c	0.1144	0.0078	0.0937	0.1196	-0.0182	0.0137	0.1832	-++++	23.7	5.245	4	0.263
6 : 116705531 : SNP	a	c	0.0484	0.0046	0.0454	0.0582	-0.0001	0.0209	0.9978	++?-+	0.0	2.001	3	0.5722
10 : 26525116 : SNP	t	c	0.0236	0.0000	0.0236	0.0236	-0.0520	0.0596	0.3833	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 132450444 : SNP	t	c	0.0575	0.0061	0.0479	0.0645	-0.0048	0.0197	0.809	++?--	0.0	2.179	3	0.536
1 : 222834071 : SNP	a	g	0.9159	0.0063	0.9109	0.9277	-0.0255	0.0235	0.2762	-??--	0.0	0.430	2	0.8067
16 : 19753267 : SNP	t	c	0.8223	0.0146	0.7861	0.8347	0.0213	0.0113	0.0606	+-+-+	0.0	3.166	4	0.5304
16 : 54032493 : SNP	a	g	0.9279	0.0052	0.9249	0.9370	-0.0274	0.0316	0.3872	-???-	0.0	0.167	1	0.6827
1 : 111884013 : SNP	t	c	0.5117	0.0095	0.4915	0.5245	-0.0015	0.0085	0.8586	+-+--	0.0	1.066	4	0.8996
10 : 61813046 : SNP	a	g	0.8782	0.0245	0.8254	0.8979	0.0010	0.0136	0.9411	++-+-	32.6	5.931	4	0.2044
15 : 102205728 : SNP	a	g	0.0742	0.0025	0.0670	0.0756	-0.0008	0.0169	0.9605	++?+-	22.4	3.864	3	0.2765
8 : 8566414 : SNP	t	g	0.2413	0.0094	0.2150	0.2490	-0.0019	0.0100	0.8507	0++--	0.0	2.420	4	0.659
18 : 56099642 : SNP	a	g	0.0391	0.0007	0.0381	0.0397	-0.0004	0.0232	0.985	-+??+	73.3	7.495	2	0.02357
2 : 133521907 : SNP	t	c	0.0143	0.0000	0.0143	0.0143	0.0610	0.0627	0.3304	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 161375247 : SNP	t	g	0.9722	0.0000	0.9722	0.9722	0.0270	0.0384	0.4821	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 30718022 : SNP	t	c	0.8382	0.0081	0.8299	0.8565	0.0208	0.0118	0.07751	++++-	0.0	2.418	4	0.6593
2 : 130120652 : SNP	a	g	0.3301	0.0076	0.3265	0.3484	0.0073	0.0090	0.4177	+++-+	0.0	0.760	4	0.9437
13 : 97861924 : SNP	a	g	0.9363	0.0063	0.9281	0.9463	-0.0195	0.0179	0.276	--?-+	0.0	1.706	3	0.6356
15 : 101146222 : SNP	a	g	0.2708	0.0058	0.2576	0.2758	-0.0059	0.0099	0.5491	-+---	0.0	1.815	4	0.7698
5 : 54894808 : SNP	a	g	0.6352	0.0138	0.6035	0.6428	-0.0070	0.0092	0.445	+----	0.0	3.816	4	0.4315
2 : 133527526 : SNP	t	c	0.8731	0.0052	0.8612	0.8809	0.0001	0.0128	0.9909	++---	0.0	2.599	4	0.6269
14 : 25204407 : SNP	t	c	0.0926	0.0127	0.0832	0.1321	-0.0394	0.0148	0.007692	--+--	5.2	4.220	4	0.377
7 : 92746431 : SNP	t	c	0.0157	0.0000	0.0157	0.0157	0.0050	0.0556	0.9283	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 139640479 : SNP	t	c	0.1485	0.0039	0.1346	0.1567	0.0032	0.0122	0.7921	+--++	8.5	4.373	4	0.3579
11 : 121872227 : SNP	a	g	0.0745	0.0043	0.0648	0.0826	-0.0180	0.0195	0.3573	+-?-+	29.0	4.226	3	0.2381
6 : 16772225 : SNP	t	c	0.4228	0.0128	0.4033	0.4340	0.0001	0.0103	0.9931	-+-+-	42.3	6.937	4	0.1392
14 : 23691230 : SNP	t	c	0.6374	0.0064	0.6262	0.6435	0.0025	0.0112	0.8225	-++-+	0.0	3.221	4	0.5216
5 : 25328210 : SNP	t	c	0.1485	0.0103	0.1256	0.1587	-0.0035	0.0124	0.7751	+--+-	0.0	3.840	4	0.428
3 : 7401109 : SNP	t	c	0.5565	0.0149	0.5313	0.6032	0.0028	0.0086	0.7471	-++--	53.2	8.549	4	0.07341
5 : 21791245 : SNP	t	c	0.9601	0.0042	0.9521	0.9648	-0.0489	0.0229	0.03268	--??-	0.0	0.892	2	0.6402
15 : 80774782 : SNP	c	g	0.2606	0.0046	0.2426	0.2635	0.0016	0.0098	0.8747	-++++	0.0	3.245	4	0.5177
12 : 105436450 : SNP	t	c	0.6192	0.0151	0.6115	0.6544	-0.0061	0.0089	0.4976	-0---	0.0	0.339	4	0.9872
14 : 88806983 : SNP	a	g	0.6492	0.0114	0.6329	0.6591	0.0072	0.0091	0.4288	++++-	0.0	2.389	4	0.6646
15 : 61032054 : SNP	a	t	0.8750	0.0024	0.8713	0.8775	0.0219	0.0133	0.09924	+-+-+	32.2	5.898	4	0.2069
17 : 43677790 : SNP	t	c	0.8662	0.0003	0.8660	0.8668	0.0371	0.0414	0.3705	???-+	0.0	0.630	1	0.4274
8 : 32307206 : SNP	a	c	0.9010	0.0082	0.8752	0.9090	0.0160	0.0141	0.2545	+++-+	0.0	3.633	4	0.458
19 : 7445589 : SNP	a	c	0.0428	0.0082	0.0368	0.0580	0.0398	0.0268	0.1375	+??++	0.6	2.012	2	0.3657
20 : 24439105 : SNP	a	g	0.0194	0.0000	0.0194	0.0194	0.0460	0.0455	0.3119	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 163666085 : SNP	t	c	0.5928	0.0163	0.5549	0.6018	-0.0123	0.0086	0.1525	---+-	0.0	2.157	4	0.707
7 : 13212263 : INDEL	d	r	0.2896	0.0202	0.2503	0.3122	0.0036	0.0093	0.6947	+++--	0.0	2.716	4	0.6064
13 : 82403201 : SNP	t	c	0.3957	0.0086	0.3887	0.4128	-0.0060	0.0089	0.4969	-+---	5.9	4.251	4	0.3731
3 : 98474653 : INDEL	i	r	0.4499	0.0080	0.4231	0.4588	-0.0120	0.0086	0.1613	--+-+	0.0	2.142	4	0.7096
19 : 28254484 : SNP	t	g	0.7712	0.0082	0.7670	0.8013	-0.0194	0.0113	0.08454	---+?	0.0	1.058	3	0.7871
3 : 27668567 : SNP	t	c	0.5572	0.0094	0.5438	0.5658	-0.0147	0.0090	0.104	-0-+-	39.6	6.628	4	0.1569
11 : 114570189 : SNP	t	g	0.5370	0.0216	0.5173	0.5926	-0.0108	0.0086	0.2095	-+-+-	0.0	2.125	4	0.7128
1 : 146875026 : SNP	a	g	0.6202	0.0153	0.5987	0.6363	-0.0242	0.0089	0.00671	-----	0.0	2.852	4	0.583
3 : 27243466 : INDEL	d	r	0.2314	0.0171	0.2130	0.2502	0.0075	0.0109	0.493	+-+-+	58.9	9.738	4	0.04507
15 : 27142132 : SNP	c	g	0.2335	0.0012	0.2327	0.2358	-0.0182	0.0281	0.5175	??++-	0.0	1.515	2	0.4687
3 : 125649288 : SNP	a	g	0.1714	0.0274	0.1235	0.1910	-0.0056	0.0151	0.7111	-+---	0.0	3.294	4	0.5098
4 : 158464188 : SNP	t	c	0.1216	0.0042	0.1139	0.1310	0.0066	0.0128	0.6037	++--+	0.0	1.092	4	0.8956
3 : 111522510 : SNP	a	c	0.9744	0.0000	0.9744	0.9744	0.0150	0.0394	0.7036	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 31217377 : SNP	t	g	0.8632	0.0050	0.8527	0.8673	-0.0017	0.0125	0.8925	++---	45.6	7.347	4	0.1186
10 : 130179954 : SNP	a	c	0.0636	0.0041	0.0608	0.0729	0.0089	0.0180	0.62	+-?++	51.8	6.219	3	0.1014
1 : 105696945 : INDEL	d	r	0.0419	0.0000	0.0419	0.0419	-0.0890	0.0566	0.1159	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 84778496 : SNP	t	c	0.1799	0.0118	0.1610	0.1965	0.0025	0.0114	0.8288	-+--+	0.0	2.359	4	0.67
9 : 90083031 : SNP	a	c	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	0.0300	0.0546	0.5826	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 72519949 : SNP	a	t	0.9340	0.0090	0.9178	0.9416	0.0199	0.0175	0.2575	++-++	0.0	0.525	4	0.9711
13 : 24324341 : SNP	a	g	0.8318	0.0085	0.8186	0.8431	0.0192	0.0113	0.08922	++++-	20.6	5.035	4	0.2837
15 : 84747605 : SNP	a	g	0.7268	0.0168	0.7099	0.7662	-0.0090	0.0101	0.3704	-++--	0.0	3.651	4	0.4553
7 : 66127418 : SNP	t	c	0.9533	0.0158	0.9348	0.9730	-0.0293	0.0363	0.4189	-??-+	52.1	4.171	2	0.1242
7 : 107056268 : INDEL	d	r	0.1514	0.0097	0.1312	0.1578	0.0019	0.0141	0.895	--+++	41.2	6.801	4	0.1468
6 : 141427169 : INDEL	d	r	0.6351	0.0077	0.6166	0.6494	-0.0052	0.0091	0.5665	+-++-	27.7	5.531	4	0.237
13 : 106238579 : SNP	a	t	0.7609	0.0044	0.7509	0.7751	-0.0089	0.0101	0.3749	+----	35.7	6.225	4	0.1829
5 : 80204325 : INDEL	d	r	0.3020	0.0145	0.2730	0.3133	0.0164	0.0098	0.09551	++++-	0.0	1.713	4	0.7884
8 : 122376549 : SNP	c	g	0.9431	0.0047	0.9396	0.9500	0.0033	0.0231	0.8847	+-??+	0.0	0.920	2	0.6314
6 : 114043524 : SNP	a	t	0.9249	0.0102	0.9145	0.9473	0.0268	0.0176	0.1289	++?+-	26.5	4.081	3	0.2528
2 : 219273449 : INDEL	i	r	0.3341	0.0121	0.3141	0.3551	-0.0063	0.0099	0.5265	-+---	60.0	10.007	4	0.04031
4 : 9846797 : SNP	a	c	0.1568	0.0210	0.1230	0.1732	0.0312	0.0161	0.05279	+++++	0.0	1.941	4	0.7467
4 : 129667411 : SNP	a	g	0.2843	0.0126	0.2415	0.2904	-0.0004	0.0095	0.9642	--+-+	35.2	6.172	4	0.1867
8 : 77399276 : SNP	a	g	0.9518	0.0021	0.9502	0.9546	-0.0126	0.0242	0.6032	--???	0.0	0.128	1	0.72
15 : 53483459 : SNP	c	g	0.7023	0.0141	0.6816	0.7210	-0.0026	0.0092	0.7766	-++-+	0.0	3.787	4	0.4355
7 : 102688352 : SNP	a	g	0.0337	0.0040	0.0293	0.0409	0.0172	0.0265	0.5167	++??+	0.0	0.314	2	0.8546
2 : 208248404 : SNP	c	g	0.8088	0.0116	0.8000	0.8342	-0.0054	0.0108	0.6166	----+	1.3	4.051	4	0.3991
6 : 104223859 : SNP	a	c	0.1226	0.0042	0.1071	0.1286	0.0113	0.0133	0.3952	++-+-	0.0	0.572	4	0.9661
13 : 90255940 : SNP	t	c	0.9638	0.0022	0.9608	0.9668	-0.0301	0.0242	0.2137	--??+	0.0	1.013	2	0.6025
1 : 234588333 : SNP	c	g	0.0858	0.0079	0.0783	0.1045	-0.0144	0.0162	0.374	--?--	0.0	1.947	3	0.5835
12 : 76690076 : SNP	t	c	0.6155	0.0168	0.5853	0.6378	-0.0249	0.0092	0.0065	---+-	0.0	3.774	4	0.4375
6 : 81173813 : SNP	a	g	0.9330	0.0027	0.9245	0.9373	-0.0058	0.0174	0.7395	+-?+-	0.0	2.474	3	0.4799
4 : 12550358 : SNP	a	g	0.1702	0.0135	0.1509	0.1936	-0.0040	0.0114	0.7251	+---+	34.8	6.131	4	0.1895
9 : 95009479 : INDEL	d	r	0.0433	0.0021	0.0416	0.0474	-0.0129	0.0226	0.5679	--??+	0.0	1.125	2	0.5699
15 : 95064211 : SNP	t	c	0.8572	0.0074	0.8484	0.8731	0.0209	0.0122	0.08588	+++++	0.0	0.256	4	0.9925
14 : 59587285 : SNP	a	g	0.0195	0.0000	0.0195	0.0195	-0.0280	0.0425	0.5096	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 44247049 : SNP	t	c	0.1965	0.0137	0.1659	0.2042	0.0110	0.0112	0.3294	+-+++	0.0	1.834	4	0.7662
2 : 123422389 : SNP	a	g	0.1372	0.0136	0.1172	0.1657	-0.0237	0.0131	0.07107	-----	23.3	5.212	4	0.2662
1 : 154512710 : SNP	t	c	0.8089	0.0066	0.7911	0.8297	-0.0088	0.0107	0.4098	+----	15.6	4.737	4	0.3154
11 : 123865086 : SNP	a	c	0.1672	0.0038	0.1616	0.1816	0.0146	0.0113	0.1947	++-++	12.7	4.583	4	0.3328
7 : 106760498 : SNP	t	c	0.0983	0.0045	0.0930	0.1156	-0.0136	0.0146	0.3506	0---+	28.1	5.562	4	0.2343
17 : 74823646 : SNP	t	c	0.2712	0.0091	0.2575	0.3086	-0.0001	0.0098	0.9948	-++-+	0.0	3.333	4	0.5037
1 : 221684242 : SNP	t	c	0.0561	0.0078	0.0463	0.0729	-0.0200	0.0191	0.2955	--?-+	30.4	4.309	3	0.23
2 : 53473391 : SNP	a	t	0.8101	0.0209	0.7636	0.8485	-0.0055	0.0129	0.6664	---++	2.3	4.093	4	0.3936
8 : 4068535 : SNP	t	g	0.8480	0.0060	0.8336	0.8526	0.0018	0.0121	0.8806	+----	0.0	2.189	4	0.701
4 : 40142210 : INDEL	d	r	0.1436	0.0228	0.1256	0.1841	-0.0236	0.0154	0.1261	+----	41.1	6.791	4	0.1473
11 : 465902 : SNP	a	g	0.9884	0.0000	0.9884	0.9884	-0.0120	0.0607	0.8432	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 84852690 : SNP	a	t	0.0658	0.0046	0.0590	0.0732	-0.0014	0.0183	0.9402	+-?+-	19.2	3.713	3	0.2942
2 : 85052029 : SNP	a	c	0.0365	0.0008	0.0350	0.0372	-0.0213	0.0240	0.374	+-??-	40.0	3.333	2	0.1889
5 : 42858101 : SNP	c	g	0.2818	0.0184	0.2424	0.2939	0.0064	0.0118	0.5851	++--+	50.4	8.065	4	0.08923
10 : 85355094 : SNP	a	g	0.0206	0.0000	0.0206	0.0206	-0.0040	0.0445	0.9283	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 10491209 : SNP	a	g	0.0713	0.0082	0.0479	0.0754	-0.0029	0.0178	0.8691	++??-	0.0	1.047	2	0.5925
1 : 163554312 : SNP	t	c	0.9016	0.0084	0.8795	0.9122	-0.0205	0.0146	0.1599	--?--	0.0	1.952	3	0.5825
12 : 40621589 : SNP	c	g	0.9895	0.0000	0.9895	0.9895	0.0470	0.0617	0.4459	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 38665792 : SNP	a	g	0.9734	0.0000	0.9734	0.9734	-0.0500	0.0414	0.2277	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 158044134 : SNP	a	t	0.9816	0.0000	0.9816	0.9816	0.0210	0.0495	0.6716	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 26851074 : SNP	a	g	0.7555	0.0101	0.7504	0.8053	0.0072	0.0099	0.4661	-+--+	50.3	8.043	4	0.09001
2 : 165833470 : SNP	t	c	0.1607	0.0041	0.1505	0.1737	-0.0023	0.0121	0.8487	-++--	28.3	5.583	4	0.2326
1 : 80181984 : SNP	t	c	0.9861	0.0000	0.9861	0.9861	0.0060	0.0536	0.9108	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 90492505 : SNP	a	t	0.7067	0.0103	0.7004	0.7319	-0.0166	0.0092	0.07248	-+---	0.0	3.565	4	0.4681
7 : 18969241 : SNP	c	g	0.5178	0.0202	0.4791	0.5461	-0.0077	0.0085	0.3643	0--+-	0.0	1.161	4	0.8845
12 : 26984563 : INDEL	d	r	0.0411	0.0002	0.0410	0.0413	-0.0228	0.0278	0.4132	--???	0.0	0.001	1	0.9721
2 : 964652 : SNP	t	c	0.0166	0.0000	0.0166	0.0166	-0.0490	0.0637	0.4416	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 100157647 : SNP	a	g	0.4528	0.0166	0.4154	0.4763	-0.0048	0.0086	0.5751	0-++-	0.0	1.137	4	0.8883
8 : 1665389 : SNP	c	g	0.1642	0.0124	0.1459	0.1835	0.0034	0.0146	0.8143	0+++-	0.0	1.691	4	0.7923
1 : 230974774 : SNP	t	c	0.2818	0.0141	0.2493	0.2886	0.0132	0.0095	0.1643	++--+	0.0	2.396	4	0.6634
8 : 38784680 : SNP	a	g	0.9521	0.0044	0.9413	0.9578	0.0063	0.0245	0.7954	++?-+	0.0	1.405	3	0.7044
9 : 1781823 : SNP	a	c	0.2961	0.0182	0.2820	0.3384	0.0058	0.0093	0.5327	-+--+	58.0	9.526	4	0.04921
3 : 54233655 : INDEL	i	r	0.2214	0.0206	0.1804	0.2406	0.0089	0.0102	0.3807	-+-++	0.0	1.518	4	0.8235
6 : 26411402 : SNP	a	g	0.0448	0.0061	0.0386	0.0534	-0.0263	0.0216	0.2227	-0??-	0.0	1.445	2	0.4855
6 : 164359631 : SNP	a	c	0.5166	0.0223	0.4963	0.5685	0.0102	0.0093	0.2699	+++-+	0.0	2.772	4	0.5966
17 : 66818534 : SNP	a	g	0.5902	0.0143	0.5694	0.6021	-0.0090	0.0085	0.2918	+----	0.0	2.512	4	0.6424
21 : 47453771 : SNP	c	g	0.9134	0.0052	0.9054	0.9167	-0.0143	0.0453	0.7529	???--	0.0	0.072	1	0.7883
1 : 7378773 : SNP	a	g	0.9748	0.0000	0.9748	0.9748	0.0240	0.0404	0.5528	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 53576169 : SNP	a	g	0.5095	0.0141	0.4791	0.5274	-0.0195	0.0085	0.02168	---+-	0.0	3.674	4	0.4519
18 : 38768401 : INDEL	d	r	0.1346	0.0216	0.1004	0.1548	0.0120	0.0175	0.4935	0++++	0.0	0.330	4	0.9878
22 : 49446381 : SNP	t	c	0.9704	0.0000	0.9704	0.9704	0.0000	0.0394	1	0????	0.0	0.000	0	1
7 : 79007234 : SNP	a	t	0.3980	0.0121	0.3810	0.4232	0.0007	0.0085	0.932	+-+++	17.1	4.827	4	0.3056
5 : 18842617 : SNP	t	c	0.9068	0.0061	0.9023	0.9225	-0.0014	0.0167	0.9308	--+++	0.0	2.589	4	0.6288
2 : 58967888 : SNP	a	g	0.9737	0.0000	0.9737	0.9737	0.0350	0.0404	0.3867	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 52635956 : SNP	a	t	0.7573	0.0046	0.7448	0.7650	-0.0118	0.0098	0.231	-++-+	61.5	10.376	4	0.03454
5 : 30369937 : SNP	t	c	0.0316	0.0045	0.0277	0.0367	0.0228	0.0282	0.4201	+-???	0.0	0.897	1	0.3436
4 : 176215150 : SNP	t	c	0.0482	0.0130	0.0314	0.0676	-0.0176	0.0221	0.4267	-+?--	0.0	2.299	3	0.5127
11 : 35365963 : SNP	a	g	0.2681	0.0157	0.2308	0.2804	-0.0167	0.0095	0.07738	-0+-+	0.0	3.353	4	0.5006
2 : 240838336 : SNP	a	t	0.1303	0.0047	0.1205	0.1333	0.0496	0.0301	0.09902	??-++	25.0	2.668	2	0.2634
12 : 104300919 : INDEL	i	r	0.1347	0.0092	0.1263	0.1564	-0.0023	0.0152	0.8816	--+++	31.2	5.811	4	0.2137
9 : 73172801 : SNP	t	c	0.7016	0.0076	0.6846	0.7360	0.0053	0.0092	0.5656	+----	16.4	4.783	4	0.3103
3 : 59295141 : SNP	a	g	0.8740	0.0059	0.8648	0.8833	-0.0148	0.0129	0.2515	---+-	0.0	0.327	4	0.988
4 : 98153386 : SNP	a	g	0.2383	0.0053	0.2311	0.2433	0.0132	0.0100	0.1864	++-++	0.0	1.806	4	0.7715
3 : 140438356 : SNP	a	g	0.8861	0.0036	0.8774	0.8901	-0.0217	0.0137	0.1121	-+---	41.6	6.855	4	0.1438
2 : 51722633 : SNP	t	c	0.8404	0.0032	0.8338	0.8451	-0.0201	0.0119	0.09087	----+	0.0	3.954	4	0.4123
11 : 50712353 : SNP	t	g	0.3560	0.0140	0.3471	0.3843	-0.0164	0.0196	0.4043	??--+	65.9	5.867	2	0.0532
5 : 33348265 : INDEL	i	r	0.0323	0.0004	0.0318	0.0326	-0.0689	0.0273	0.01164	--???	66.6	2.993	1	0.08365
6 : 169094880 : SNP	t	c	0.9093	0.0084	0.9007	0.9269	0.0058	0.0149	0.6959	++---	25.9	5.397	4	0.2489
5 : 180588977 : SNP	c	g	0.1857	0.0081	0.1687	0.2102	0.0021	0.0113	0.8544	+---+	0.0	0.806	4	0.9376
5 : 43321519 : SNP	t	c	0.5025	0.0079	0.4998	0.5377	-0.0059	0.0085	0.4867	--+-+	64.4	11.240	4	0.024
2 : 197941935 : SNP	a	g	0.2847	0.0075	0.2782	0.3035	-0.0035	0.0094	0.7071	-+---	0.0	0.212	4	0.9948
8 : 55738011 : SNP	t	g	0.6689	0.0307	0.6498	0.7457	0.0093	0.0092	0.3098	-+++-	32.8	5.951	4	0.2029
20 : 13447277 : SNP	a	c	0.5673	0.0109	0.5535	0.5947	-0.0137	0.0086	0.1099	+---+	67.4	12.260	4	0.01552
14 : 39770161 : INDEL	d	r	0.9063	0.0116	0.8975	0.9246	-0.0092	0.0168	0.585	+-?--	0.0	1.733	3	0.6296
2 : 20324562 : SNP	a	g	0.0340	0.0042	0.0283	0.0407	0.0029	0.0254	0.9077	+-??+	87.2	15.669	2	0.0003958
1 : 211324548 : SNP	a	g	0.7131	0.0071	0.7040	0.7331	-0.0096	0.0094	0.3052	----+	0.0	3.146	4	0.5337
9 : 80602944 : SNP	a	c	0.2012	0.0043	0.1924	0.2126	0.0012	0.0108	0.9097	+--+-	33.2	5.986	4	0.2002
17 : 74930674 : SNP	t	c	0.3667	0.0176	0.3371	0.4171	0.0159	0.0089	0.07455	+++-+	31.9	5.873	4	0.2088
8 : 40068556 : SNP	a	g	0.3781	0.0053	0.3660	0.3856	0.0113	0.0086	0.1895	+--++	25.1	5.344	4	0.2538
6 : 68873067 : SNP	a	g	0.1268	0.0106	0.1042	0.1359	-0.0233	0.0130	0.07332	-+---	0.0	3.247	4	0.5173
1 : 213606736 : SNP	a	c	0.9525	0.0024	0.9508	0.9583	0.0061	0.0213	0.7762	+-??-	40.6	3.365	2	0.1859
1 : 227235098 : SNP	t	g	0.8578	0.0092	0.8387	0.8708	-0.0061	0.0122	0.614	-+--+	0.0	1.287	4	0.8636
13 : 49290191 : SNP	t	c	0.9544	0.0035	0.9509	0.9580	-0.0072	0.0213	0.7363	+-??-	7.1	2.152	2	0.3409
19 : 43548981 : SNP	a	c	0.0998	0.0202	0.0692	0.1152	0.0303	0.0226	0.1792	?++++	0.0	0.008	3	0.9998
5 : 36217997 : SNP	a	t	0.3754	0.0085	0.3569	0.3910	0.0036	0.0085	0.6715	+++-+	40.7	6.743	4	0.1501
20 : 61303742 : SNP	t	c	0.2335	0.0082	0.2101	0.2723	-0.0157	0.0100	0.1169	---+-	2.3	4.093	4	0.3936
5 : 153326544 : SNP	t	c	0.9580	0.0013	0.9569	0.9606	-0.0136	0.0225	0.5447	-+??-	0.0	1.972	2	0.373
21 : 32586289 : SNP	a	g	0.9136	0.0106	0.8954	0.9230	0.0052	0.0163	0.751	+-?++	0.0	0.579	3	0.9012
5 : 3659712 : SNP	c	g	0.0542	0.0062	0.0402	0.0587	-0.0169	0.0205	0.4098	+-??+	47.7	3.822	2	0.148
13 : 28244545 : SNP	a	g	0.9444	0.0051	0.9406	0.9584	-0.0071	0.0192	0.7131	-+??-	55.1	4.455	2	0.1078
1 : 113593613 : SNP	c	g	0.0390	0.0000	0.0390	0.0390	0.0200	0.0516	0.6981	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 129168174 : INDEL	i	r	0.6601	0.0214	0.6389	0.7064	-0.0073	0.0098	0.4562	-+---	0.0	1.603	4	0.8082
1 : 105645969 : SNP	a	c	0.8876	0.0053	0.8756	0.9076	-0.0089	0.0141	0.5304	+--++	0.0	3.667	4	0.4529
11 : 36247139 : SNP	a	g	0.9853	0.0000	0.9853	0.9853	-0.0160	0.0526	0.7608	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 13434317 : SNP	a	g	0.9878	0.0000	0.9878	0.9878	-0.0790	0.0586	0.1778	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 91358927 : SNP	a	g	0.4243	0.0124	0.4147	0.4524	0.0087	0.0086	0.3108	+-+++	12.4	4.568	4	0.3346
15 : 99991764 : INDEL	d	r	0.0121	0.0000	0.0121	0.0121	0.0580	0.0586	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 98847208 : SNP	t	g	0.6077	0.0168	0.5962	0.6374	-0.0172	0.0254	0.4991	??-+-	0.0	0.986	2	0.6108
7 : 144846011 : SNP	a	g	0.7213	0.0085	0.7077	0.7296	-0.0087	0.0097	0.3706	+-+--	0.0	3.075	4	0.5454
8 : 80151988 : SNP	a	t	0.3083	0.0283	0.2913	0.3665	-0.0013	0.0091	0.8873	-++++	0.0	3.298	4	0.5093
7 : 107818166 : SNP	a	g	0.8124	0.0236	0.7885	0.8507	-0.0117	0.0134	0.3846	-+---	0.0	0.402	4	0.9823
1 : 118284347 : SNP	t	c	0.9817	0.0000	0.9817	0.9817	0.0370	0.0445	0.4055	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 12070138 : SNP	a	g	0.0627	0.0017	0.0617	0.0656	0.0647	0.0312	0.03817	+???+	17.9	1.218	1	0.2698
5 : 171665888 : SNP	t	c	0.0844	0.0067	0.0692	0.0958	0.0226	0.0180	0.2092	++?-+	0.0	0.877	3	0.831
1 : 244161548 : SNP	t	c	0.0977	0.0071	0.0801	0.1027	0.0106	0.0150	0.4788	+--++	0.0	3.586	4	0.4649
11 : 65730945 : SNP	t	g	0.5130	0.0084	0.5070	0.5398	-0.0018	0.0085	0.8356	--+++	54.8	8.846	4	0.06506
2 : 23649702 : SNP	t	c	0.5874	0.0082	0.5602	0.5965	-0.0136	0.0085	0.1106	---++	82.1	22.345	4	0.0001711
3 : 131649098 : SNP	a	g	0.7118	0.0081	0.6949	0.7385	0.0016	0.0094	0.8616	-+--+	0.0	2.200	4	0.6991
16 : 26973567 : SNP	a	g	0.4589	0.0100	0.4265	0.4657	-0.0135	0.0085	0.1121	---+-	0.0	1.499	4	0.8268
11 : 118405068 : SNP	a	g	0.8624	0.0150	0.8535	0.9018	0.0045	0.0128	0.7236	++---	0.0	2.114	4	0.7148
7 : 80850824 : SNP	t	g	0.5652	0.0131	0.5539	0.5836	0.0075	0.0090	0.4041	++-+-	0.0	2.025	4	0.7311
4 : 138788533 : SNP	a	g	0.2763	0.0094	0.2638	0.3052	0.0146	0.0094	0.12	++++-	0.0	3.162	4	0.531
2 : 102126837 : SNP	t	c	0.6405	0.0347	0.5680	0.6666	-0.0007	0.0091	0.936	+--++	0.0	2.045	4	0.7275
2 : 120495475 : SNP	a	c	0.9763	0.0000	0.9763	0.9763	-0.0330	0.0414	0.4259	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 81772994 : SNP	t	c	0.6689	0.0027	0.6593	0.6719	-0.0035	0.0091	0.705	--+-+	0.0	1.173	4	0.8825
10 : 81494512 : SNP	a	g	0.9588	0.0000	0.9588	0.9588	0.0872	0.0618	0.1582	????+	0.0	0.000	0	1
17 : 48290293 : SNP	a	g	0.9105	0.0045	0.9022	0.9168	0.0101	0.0157	0.5206	-+?-+	0.0	2.714	3	0.4378
2 : 141960315 : INDEL	i	r	0.8613	0.0077	0.8429	0.8701	0.0112	0.0123	0.3611	++-+-	0.0	2.898	4	0.575
12 : 75501022 : SNP	t	c	0.8358	0.0171	0.8010	0.8695	0.0015	0.0117	0.8986	--+++	0.0	2.723	4	0.6052
9 : 72911975 : SNP	c	g	0.9299	0.0063	0.9266	0.9466	-0.0132	0.0171	0.439	--?++	0.0	1.622	3	0.6543
6 : 27852793 : SNP	a	g	0.0460	0.0129	0.0382	0.0772	-0.0104	0.0213	0.6251	-+?--	0.0	0.674	3	0.8792
16 : 20262776 : SNP	t	g	0.1197	0.0099	0.1032	0.1283	0.0042	0.0131	0.7494	---++	43.5	7.085	4	0.1314
13 : 63962844 : SNP	t	c	0.5687	0.0025	0.5653	0.5747	0.0111	0.0092	0.2239	+++-+	38.3	6.483	4	0.1659
6 : 110726384 : SNP	t	c	0.6295	0.0118	0.6033	0.6359	0.0002	0.0091	0.9826	+--++	0.0	3.850	4	0.4267
6 : 166659795 : SNP	a	t	0.2642	0.0111	0.2452	0.2751	-0.0068	0.0100	0.4976	----+	0.0	0.688	4	0.9528
10 : 106691207 : SNP	a	g	0.8015	0.0176	0.7658	0.8143	-0.0013	0.0105	0.904	+---+	8.9	4.392	4	0.3556
12 : 18021750 : SNP	t	c	0.1708	0.0040	0.1616	0.1739	-0.0006	0.0113	0.9574	-+-++	2.6	4.105	4	0.392
7 : 103660476 : SNP	t	c	0.0928	0.0107	0.0640	0.0998	-0.0138	0.0163	0.3968	-+?--	0.0	1.078	3	0.7824
10 : 26277544 : SNP	t	c	0.0510	0.0055	0.0460	0.0647	-0.0382	0.0199	0.05452	-+?--	0.0	2.586	3	0.4599
15 : 32361340 : SNP	t	g	0.9595	0.0039	0.9499	0.9615	-0.0159	0.0229	0.4868	--??+	0.0	0.709	2	0.7014
3 : 47500662 : SNP	a	g	0.5931	0.0056	0.5746	0.6000	0.0192	0.0090	0.03309	-++++	59.0	9.766	4	0.04456
10 : 59758221 : SNP	t	c	0.6549	0.0080	0.6243	0.6611	0.0106	0.0091	0.2462	++-++	3.1	4.126	4	0.3892
7 : 66823060 : SNP	a	c	0.3862	0.0116	0.3767	0.4107	-0.0102	0.0086	0.2339	-++-+	47.4	7.605	4	0.1072
11 : 120520282 : SNP	t	g	0.0303	0.0044	0.0263	0.0352	-0.0362	0.0308	0.2404	--???	0.0	0.067	1	0.7962
12 : 31788106 : SNP	c	g	0.6955	0.0098	0.6783	0.7088	-0.0135	0.0094	0.1514	+----	69.0	12.905	4	0.01175
11 : 78217460 : SNP	a	g	0.8235	0.0037	0.8144	0.8254	0.0101	0.0112	0.3702	-+--+	76.0	16.666	4	0.002244
2 : 56373616 : SNP	a	g	0.0125	0.0000	0.0125	0.0125	-0.0380	0.0596	0.524	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 93136444 : SNP	t	g	0.2191	0.0026	0.2142	0.2214	0.0042	0.0104	0.6886	++--+	0.0	0.187	4	0.9959
1 : 194238677 : SNP	a	g	0.9794	0.0000	0.9794	0.9794	-0.0250	0.0445	0.5741	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 208032881 : SNP	a	g	0.0808	0.0132	0.0699	0.1045	0.0173	0.0164	0.2917	++?-+	0.0	0.462	3	0.9273
5 : 32960575 : SNP	t	c	0.9206	0.0056	0.9072	0.9260	0.0103	0.0157	0.5107	++-++	0.0	0.816	4	0.9363
10 : 27640044 : SNP	t	c	0.3670	0.0118	0.3409	0.3766	-0.0054	0.0096	0.574	+0---	33.8	6.038	4	0.1963
3 : 87933616 : SNP	a	t	0.8924	0.0101	0.8646	0.9053	-0.0120	0.0151	0.4245	-+--?	0.0	2.207	3	0.5307
6 : 83135625 : SNP	t	c	0.9460	0.0025	0.9429	0.9502	0.0013	0.0204	0.9506	-+??-	0.0	0.978	2	0.6131
4 : 96016762 : SNP	t	c	0.4988	0.0158	0.4670	0.5107	-0.0077	0.0085	0.3643	-----	0.0	0.414	4	0.9813
1 : 190546931 : SNP	a	g	0.4654	0.0384	0.3761	0.4898	-0.0070	0.0086	0.4116	-++--	9.6	4.427	4	0.3513
20 : 33133184 : SNP	a	c	0.4910	0.0119	0.4804	0.5439	-0.0036	0.0096	0.705	---+-	0.0	1.689	4	0.7928
19 : 49437986 : INDEL	d	r	0.1528	0.0092	0.1455	0.1655	-0.0064	0.0139	0.6439	-+?-+	26.9	4.105	3	0.2504
3 : 126780664 : SNP	t	g	0.0817	0.0098	0.0578	0.0917	0.0131	0.0167	0.4327	+-?++	0.0	0.468	3	0.926
10 : 14509558 : SNP	a	g	0.0357	0.0023	0.0339	0.0387	0.0178	0.0271	0.511	++???	0.0	0.116	1	0.7337
11 : 69390921 : SNP	a	g	0.0323	0.0011	0.0314	0.0336	-0.0157	0.0288	0.585	-+???	0.0	0.357	1	0.5499
20 : 4269403 : SNP	t	c	0.3300	0.0094	0.3012	0.3511	0.0067	0.0091	0.4627	++++-	0.0	2.654	4	0.6173
2 : 230903875 : SNP	a	g	0.6204	0.0081	0.6056	0.6275	0.0168	0.0087	0.05387	+++-+	0.0	2.351	4	0.6715
4 : 156285691 : INDEL	i	r	0.4358	0.0340	0.3781	0.4807	-0.0098	0.0099	0.3253	---+-	0.0	1.476	4	0.8309
11 : 115326149 : SNP	a	g	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	0.0000	0.0526	1	0????	0.0	0.000	0	1
14 : 51526184 : SNP	a	g	0.9422	0.0033	0.9376	0.9468	0.0050	0.0187	0.7889	++?-+	0.0	0.813	3	0.8463
18 : 7256050 : INDEL	d	r	0.6405	0.0226	0.5997	0.6740	0.0211	0.0098	0.03138	+--++	51.5	8.254	4	0.0827
11 : 63664096 : SNP	a	g	0.5628	0.0073	0.5478	0.5712	0.0073	0.0085	0.3902	++++-	16.1	4.765	4	0.3123
2 : 65289825 : SNP	a	g	0.6276	0.0167	0.5890	0.6439	0.0013	0.0089	0.8809	-++--	0.0	0.990	4	0.9113
5 : 152845931 : SNP	a	t	0.9654	0.0000	0.9654	0.9654	0.0570	0.0374	0.1275	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 5130854 : SNP	a	g	0.2582	0.0084	0.2446	0.2737	0.0215	0.0100	0.03182	+++++	0.0	1.711	4	0.7888
5 : 83303783 : SNP	t	c	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	-0.0400	0.0505	0.4287	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 77183529 : SNP	t	c	0.1423	0.0162	0.1143	0.1567	-0.0134	0.0127	0.2885	----+	0.0	3.182	4	0.5278
2 : 161290337 : SNP	a	c	0.9779	0.0000	0.9779	0.9779	0.1100	0.0425	0.009573	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 33200816 : INDEL	i	r	0.4633	0.0170	0.4506	0.4990	0.0047	0.0091	0.6064	+---+	0.0	1.539	4	0.8196
8 : 39925825 : SNP	t	c	0.0394	0.0054	0.0359	0.0552	-0.0128	0.0226	0.5727	+-?--	0.0	1.167	3	0.7609
6 : 52147692 : SNP	a	t	0.5045	0.0079	0.5002	0.5277	0.0032	0.0086	0.7053	-++-+	0.0	2.872	4	0.5795
17 : 11777058 : SNP	a	g	0.0497	0.0038	0.0456	0.0532	0.0426	0.0244	0.08089	++??+	0.0	0.596	2	0.7422
1 : 201283171 : SNP	a	g	0.0897	0.0083	0.0843	0.1058	-0.0212	0.0150	0.1582	-0---	0.0	2.147	4	0.7088
5 : 113112929 : SNP	t	g	0.4200	0.0130	0.3841	0.4326	0.0036	0.0085	0.6712	+--++	0.0	2.493	4	0.6458
18 : 1123506 : SNP	a	c	0.9493	0.0070	0.9401	0.9550	-0.0090	0.0206	0.6632	-+??+	0.0	0.765	2	0.6822
1 : 17722230 : SNP	a	g	0.9639	0.0037	0.9584	0.9664	-0.0002	0.0344	0.9954	+???-	8.2	1.089	1	0.2967
1 : 150652420 : SNP	a	t	0.4086	0.0107	0.3873	0.4425	-0.0149	0.0086	0.08333	--+--	17.7	4.860	4	0.302
2 : 3995278 : SNP	a	g	0.3784	0.0163	0.3485	0.4055	-0.0087	0.0091	0.3405	--+--	0.0	0.926	4	0.9208
8 : 23724309 : SNP	a	g	0.9166	0.0034	0.9123	0.9201	0.0036	0.0159	0.8233	+-?--	39.5	4.962	3	0.1746
1 : 47788378 : SNP	c	g	0.3189	0.0073	0.2973	0.3247	0.0077	0.0092	0.4037	++-++	0.0	3.843	4	0.4277
1 : 199447742 : SNP	c	g	0.8388	0.0139	0.8253	0.8553	-0.0007	0.0163	0.9678	+----	0.0	3.738	4	0.4426
15 : 51857220 : SNP	t	c	0.4855	0.0146	0.4581	0.5153	-0.0002	0.0085	0.9812	+-++-	0.0	1.719	4	0.7873
19 : 6681551 : SNP	t	c	0.8792	0.0086	0.8578	0.8896	0.0031	0.0135	0.8167	-++-+	0.0	2.855	4	0.5824
10 : 8646175 : SNP	a	t	0.6235	0.0205	0.6129	0.6755	-0.0033	0.0086	0.7062	-+-+-	0.0	3.424	4	0.4895
17 : 17103399 : INDEL	d	r	0.0483	0.0060	0.0433	0.0555	0.0098	0.0405	0.8085	+???-	0.0	0.610	1	0.4349
17 : 30389174 : INDEL	d	r	0.1505	0.0176	0.1274	0.1702	0.0285	0.0159	0.07267	++-++	0.0	1.939	4	0.747
10 : 67755443 : SNP	a	g	0.1417	0.0101	0.1354	0.1691	0.0014	0.0125	0.9133	++---	2.2	4.089	4	0.394
13 : 113473595 : INDEL	d	r	0.2861	0.0121	0.2754	0.3105	-0.0029	0.0098	0.77	-+-+-	0.0	1.601	4	0.8086
8 : 25891653 : SNP	a	g	0.7498	0.0030	0.7383	0.7524	-0.0021	0.0098	0.8297	--+-+	0.0	2.479	4	0.6483
16 : 87063327 : SNP	a	g	0.0233	0.0070	0.0185	0.0336	-0.0506	0.0359	0.1591	-???-	0.0	0.507	1	0.4765
9 : 16998232 : SNP	t	c	0.6278	0.0225	0.5805	0.6544	0.0018	0.0086	0.8299	-+++-	0.0	3.090	4	0.5429
4 : 163839789 : SNP	a	g	0.4001	0.0164	0.3859	0.4217	0.0016	0.0104	0.8769	--+++	0.0	0.598	4	0.9633
2 : 141199906 : SNP	t	g	0.9505	0.0048	0.9468	0.9608	0.0439	0.0206	0.03303	++??+	0.0	0.081	2	0.9602
2 : 79284409 : SNP	a	t	0.7518	0.0280	0.7114	0.7940	-0.0086	0.0111	0.44	--+-+	0.0	2.324	4	0.6764
8 : 11845324 : SNP	t	g	0.0508	0.0053	0.0465	0.0584	-0.0009	0.0203	0.9648	++?--	14.5	3.510	3	0.3195
1 : 222727128 : INDEL	d	r	0.1222	0.0083	0.1089	0.1349	0.0073	0.0290	0.8013	??-++	0.0	1.578	2	0.4542
4 : 168542115 : SNP	t	c	0.1490	0.0119	0.1234	0.1618	-0.0130	0.0119	0.2733	-+---	0.0	1.907	4	0.7528
15 : 26828960 : SNP	t	c	0.1546	0.0065	0.1436	0.1691	-0.0016	0.0120	0.894	-+--+	0.0	3.771	4	0.4379
2 : 198031325 : SNP	a	c	0.0600	0.0077	0.0518	0.0692	0.0168	0.0193	0.3835	++?+-	0.0	2.643	3	0.4499
9 : 122965218 : SNP	t	c	0.8944	0.0078	0.8734	0.9038	0.0093	0.0136	0.4947	++--+	32.3	5.911	4	0.2059
13 : 19761359 : SNP	t	g	0.9321	0.0052	0.9170	0.9378	-0.0019	0.0189	0.9205	--?+?	49.4	3.954	2	0.1385
10 : 86982458 : SNP	t	c	0.3472	0.0040	0.3306	0.3495	0.0097	0.0091	0.2885	++-+-	38.0	6.449	4	0.168
6 : 87183062 : SNP	t	c	0.3862	0.0142	0.3509	0.3943	-0.0095	0.0086	0.267	--++-	0.0	1.805	4	0.7715
15 : 98618123 : SNP	a	c	0.2611	0.0095	0.2340	0.2858	0.0168	0.0098	0.08565	+++-+	49.5	7.915	4	0.09475
10 : 28458235 : INDEL	d	r	0.0750	0.0076	0.0551	0.0788	-0.0111	0.0163	0.4966	+-?-+	40.6	5.052	3	0.168
2 : 108806340 : SNP	a	g	0.3480	0.0063	0.3320	0.3537	0.0099	0.0091	0.2785	++--+	50.4	8.064	4	0.08927
1 : 59024985 : SNP	a	g	0.6811	0.0120	0.6631	0.6991	0.0044	0.0093	0.6374	++-+-	0.0	3.231	4	0.5199
4 : 169078955 : SNP	a	g	0.9862	0.0000	0.9862	0.9862	0.1100	0.0566	0.052	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 163695392 : SNP	t	c	0.0575	0.0089	0.0524	0.0738	-0.0278	0.0191	0.1442	+-?--	28.9	4.217	3	0.2389
15 : 99501545 : SNP	t	c	0.0352	0.0025	0.0316	0.0370	0.0528	0.0263	0.04427	++???	0.0	0.220	1	0.6391
4 : 37515525 : SNP	t	c	0.0545	0.0025	0.0505	0.0573	0.0095	0.0196	0.6271	+-?--	0.0	2.256	3	0.5211
7 : 2755372 : SNP	t	g	0.3000	0.0039	0.2943	0.3075	0.0071	0.0093	0.4465	++---	0.0	1.453	4	0.8349
12 : 77575849 : SNP	t	g	0.0595	0.0098	0.0500	0.0783	0.0148	0.0186	0.4284	++?-+	0.0	1.308	3	0.7272
6 : 56317110 : SNP	a	g	0.1515	0.0126	0.1247	0.1645	-0.0136	0.0127	0.286	-----	0.0	0.509	4	0.9726
3 : 73124211 : SNP	c	g	0.8762	0.0140	0.8452	0.8875	-0.0234	0.0133	0.07873	-----	0.0	3.745	4	0.4417
4 : 45019861 : SNP	a	g	0.8401	0.0138	0.8302	0.8711	0.0202	0.0117	0.08452	++++-	15.3	4.722	4	0.317
15 : 48269197 : SNP	a	g	0.9720	0.0000	0.9720	0.9720	-0.0050	0.0374	0.8937	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 76195356 : SNP	t	c	0.0569	0.0085	0.0433	0.0659	0.0244	0.0214	0.2542	++??+	0.0	1.497	2	0.473
1 : 73021456 : SNP	a	g	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	0.0910	0.0556	0.1017	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 91755101 : SNP	a	t	0.1995	0.0000	0.1995	0.1995	-0.0154	0.0636	0.8087	???-?	0.0	0.000	0	1
4 : 4583921 : SNP	a	g	0.0623	0.0061	0.0554	0.0712	-0.0025	0.0212	0.9051	-+?+-	0.0	0.631	3	0.8893
6 : 23811203 : SNP	a	g	0.3343	0.0115	0.3103	0.3558	0.0085	0.0093	0.3559	+----	70.6	13.615	4	0.008631
1 : 52601675 : SNP	t	c	0.3316	0.0111	0.3185	0.3431	0.0145	0.0112	0.1936	+++++	0.0	1.392	4	0.8455
13 : 105551911 : INDEL	d	r	0.4011	0.0245	0.3504	0.4216	0.0016	0.0089	0.8552	--+++	0.0	2.963	4	0.564
7 : 22250097 : SNP	c	g	0.6939	0.0138	0.6464	0.7007	0.0163	0.0093	0.08002	+-+-+	42.0	6.901	4	0.1412
5 : 169193670 : SNP	t	g	0.9449	0.0067	0.9362	0.9510	0.0115	0.0198	0.5615	0+??+	0.0	0.727	2	0.6952
5 : 98341873 : SNP	a	g	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	0.0040	0.0536	0.9405	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 93049853 : SNP	t	c	0.9517	0.0030	0.9477	0.9560	0.0001	0.0233	0.9976	+-??-	0.0	0.638	2	0.7269
5 : 16357489 : SNP	a	g	0.6838	0.0080	0.6650	0.6904	0.0048	0.0092	0.5993	-+-+-	49.1	7.858	4	0.09693
1 : 111873170 : INDEL	d	r	0.0377	0.0000	0.0377	0.0377	0.0080	0.0394	0.8392	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 34063162 : SNP	t	c	0.5093	0.0113	0.4931	0.5264	0.0173	0.0085	0.04327	+++++	0.0	1.950	4	0.745
12 : 116629223 : SNP	a	c	0.1901	0.0210	0.1730	0.2316	-0.0208	0.0107	0.05174	-----	0.0	0.460	4	0.9773
16 : 83103934 : SNP	c	g	0.4765	0.0121	0.4520	0.5118	-0.0004	0.0086	0.9645	+---+	16.9	4.812	4	0.3071
3 : 46183560 : SNP	t	g	0.9274	0.0036	0.9257	0.9366	0.0214	0.0174	0.218	++??+	0.0	0.436	2	0.8043
2 : 210407956 : SNP	t	c	0.9316	0.0077	0.9189	0.9387	0.0204	0.0180	0.2579	++?++	0.0	0.270	3	0.9656
1 : 7312172 : SNP	t	c	0.6046	0.0099	0.5837	0.6111	-0.0112	0.0086	0.1932	+----	0.0	3.912	4	0.418
14 : 68501714 : SNP	a	c	0.1844	0.0195	0.1688	0.2330	-0.0104	0.0110	0.3471	--+--	41.3	6.814	4	0.146
18 : 8093029 : SNP	t	c	0.6500	0.0124	0.6268	0.6575	-0.0008	0.0091	0.9334	0-+-+	0.0	0.857	4	0.9306
3 : 27856710 : SNP	a	t	0.5209	0.0316	0.5026	0.5971	-0.0007	0.0086	0.9366	-+--+	0.0	1.926	4	0.7493
10 : 69234874 : SNP	a	c	0.7824	0.0064	0.7692	0.7939	0.0253	0.0106	0.01665	+++++	0.0	1.227	4	0.8736
3 : 149997691 : SNP	t	c	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	-0.0410	0.0495	0.4078	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 57720573 : SNP	a	c	0.2916	0.0222	0.2625	0.3297	-0.0056	0.0093	0.5519	---++	23.4	5.219	4	0.2656
5 : 177604827 : SNP	t	c	0.1234	0.0139	0.1140	0.1593	0.0118	0.0133	0.3764	-++++	0.0	1.978	4	0.7397
7 : 39702605 : SNP	a	g	0.9143	0.0092	0.9060	0.9302	0.0060	0.0158	0.7047	-+?+-	20.7	3.783	3	0.2859
18 : 35859679 : SNP	t	c	0.2312	0.0074	0.2134	0.2398	-0.0117	0.0100	0.2428	--+-+	0.0	1.369	4	0.8495
16 : 10848421 : SNP	t	c	0.0608	0.0168	0.0451	0.0873	-0.0023	0.0211	0.9144	--?-+	0.0	0.276	3	0.9644
11 : 70473802 : SNP	a	g	0.0651	0.0052	0.0559	0.0694	-0.0197	0.0187	0.2913	--?++	0.0	1.174	3	0.7591
14 : 24272946 : SNP	a	g	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	0.0010	0.0475	0.9832	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 70786676 : SNP	a	g	0.0158	0.0000	0.0158	0.0158	-0.0110	0.0607	0.8561	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 46326576 : SNP	t	g	0.2920	0.0105	0.2521	0.3002	-0.0056	0.0092	0.5464	++---	22.4	5.153	4	0.2719
7 : 115064566 : SNP	a	g	0.0119	0.0000	0.0119	0.0119	0.0850	0.0586	0.1471	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 41176666 : SNP	a	g	0.5961	0.0334	0.5639	0.6685	-0.0039	0.0092	0.6714	-+++-	0.0	0.573	4	0.966
5 : 112507046 : SNP	a	g	0.0872	0.0112	0.0589	0.0977	0.0070	0.0162	0.6683	0+??-	42.1	3.455	2	0.1777
14 : 32188849 : INDEL	i	r	0.0387	0.0052	0.0325	0.0456	0.0050	0.0232	0.83	+-??-	0.0	1.262	2	0.532
8 : 128489389 : INDEL	d	r	0.0347	0.0019	0.0330	0.0369	-0.0171	0.0261	0.5129	--???	0.0	0.130	1	0.7188
1 : 158469859 : SNP	a	g	0.4512	0.0169	0.4284	0.4780	0.0047	0.0085	0.5811	++-++	0.0	1.664	4	0.7973
20 : 3327014 : SNP	a	g	0.7705	0.0165	0.7558	0.7931	0.0105	0.0100	0.2963	+-+--	30.8	5.784	4	0.2159
14 : 81006116 : SNP	t	c	0.1479	0.0122	0.1207	0.1595	-0.0111	0.0120	0.3535	----+	47.0	7.543	4	0.1098
1 : 201167568 : INDEL	i	r	0.4915	0.0151	0.4820	0.5251	0.0057	0.0086	0.5091	-+--+	58.6	9.671	4	0.04635
6 : 31303190 : SNP	a	g	0.4574	0.0183	0.4377	0.4968	0.0077	0.0184	0.6762	??+-+	0.0	0.248	2	0.8832
16 : 52787785 : SNP	a	g	0.9223	0.0031	0.9188	0.9254	0.0191	0.0168	0.2564	+0?--	44.0	5.355	3	0.1476
15 : 95422695 : SNP	t	c	0.8926	0.0061	0.8823	0.9016	-0.0109	0.0140	0.4338	-++--	33.4	6.005	4	0.1987
15 : 97457871 : SNP	c	g	0.2239	0.0071	0.2039	0.2297	-0.0086	0.0101	0.3911	--+-+	0.0	0.405	4	0.9821
6 : 70342926 : SNP	t	c	0.7994	0.0103	0.7926	0.8284	-0.0000	0.0107	0.9982	-+++-	30.1	5.723	4	0.2208
7 : 34487337 : SNP	a	g	0.3849	0.0064	0.3784	0.4135	0.0120	0.0087	0.1706	+-+++	0.0	0.800	4	0.9385
6 : 79191881 : SNP	a	g	0.0963	0.0052	0.0922	0.1082	-0.0039	0.0146	0.7915	--+++	0.0	1.221	4	0.8747
7 : 42309284 : SNP	a	g	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	0.0570	0.0505	0.2594	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 52035040 : SNP	a	t	0.0169	0.0000	0.0169	0.0169	0.0860	0.0485	0.07633	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 17640457 : INDEL	i	r	0.0416	0.0018	0.0392	0.0429	0.0519	0.0261	0.04647	++???	0.0	0.066	1	0.7978
4 : 108695945 : SNP	c	g	0.9013	0.0091	0.8712	0.9106	-0.0064	0.0152	0.6732	--+++	5.0	4.211	4	0.3782
12 : 39388027 : SNP	a	g	0.6540	0.0188	0.6379	0.7062	-0.0033	0.0092	0.7169	+----	0.0	2.989	4	0.5596
7 : 124691046 : SNP	a	t	0.3861	0.0104	0.3546	0.4058	0.0068	0.0086	0.4272	++---	25.5	5.366	4	0.2518
3 : 30065907 : SNP	a	t	0.5500	0.0161	0.4952	0.5620	0.0068	0.0085	0.4252	0-+++	26.9	5.473	4	0.2421
14 : 73783933 : SNP	t	c	0.7674	0.0230	0.7519	0.8256	0.0147	0.0100	0.1408	+-+++	0.0	1.518	4	0.8234
13 : 75592587 : SNP	t	c	0.4182	0.0073	0.4076	0.4467	-0.0035	0.0085	0.68	--+++	0.0	3.248	4	0.5172
1 : 110025881 : SNP	a	g	0.6914	0.0203	0.6731	0.7392	-0.0078	0.0093	0.4046	---++	0.0	3.048	4	0.5498
19 : 12549281 : SNP	a	g	0.7840	0.0165	0.7614	0.8088	-0.0184	0.0110	0.0956	0----	0.0	3.288	4	0.5108
11 : 23494477 : SNP	t	g	0.0155	0.0000	0.0155	0.0155	-0.0240	0.0495	0.628	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 123786453 : SNP	a	g	0.1782	0.0123	0.1418	0.1877	0.0055	0.0112	0.627	+--+-	50.0	7.995	4	0.09175
12 : 101055288 : SNP	t	g	0.9873	0.0000	0.9873	0.9873	-0.0110	0.0576	0.8486	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 4964967 : INDEL	d	r	0.5785	0.0168	0.5608	0.6041	0.0086	0.0108	0.4274	+++--	0.0	3.038	4	0.5515
13 : 32060530 : SNP	a	g	0.1069	0.0090	0.0989	0.1281	0.0081	0.0167	0.6273	-+?++	0.0	1.508	3	0.6804
18 : 7411266 : INDEL	d	r	0.2259	0.0063	0.2230	0.2509	-0.0121	0.0111	0.2757	-+---	68.6	12.753	4	0.01255
19 : 21854270 : SNP	a	g	0.8163	0.0106	0.7987	0.8352	-0.0021	0.0130	0.8697	+--+-	0.0	3.346	4	0.5017
6 : 10883860 : SNP	a	c	0.0158	0.0000	0.0158	0.0158	-0.0180	0.0526	0.732	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 148625926 : SNP	a	g	0.0582	0.0046	0.0545	0.0641	0.0140	0.0202	0.4869	+-??+	0.0	0.915	2	0.6329
6 : 98231307 : SNP	a	g	0.1560	0.0053	0.1385	0.1596	-0.0053	0.0120	0.6596	-+--+	60.8	10.215	4	0.03696
9 : 17685027 : SNP	a	g	0.8943	0.0070	0.8894	0.9164	0.0138	0.0140	0.3239	++++-	0.0	1.717	4	0.7877
9 : 76924292 : SNP	t	g	0.7442	0.0157	0.7113	0.7600	-0.0017	0.0099	0.8619	++-+-	44.7	7.230	4	0.1242
2 : 190815715 : SNP	t	g	0.0660	0.0033	0.0554	0.0685	0.0080	0.0180	0.6588	-+?++	46.2	5.576	3	0.1342
11 : 34965557 : SNP	t	c	0.3365	0.0124	0.3211	0.3786	-0.0047	0.0092	0.6068	--+-+	64.3	11.212	4	0.02428
2 : 216507546 : SNP	a	c	0.0640	0.0084	0.0498	0.0746	0.0146	0.0184	0.4294	-+?++	0.0	2.029	3	0.5665
2 : 211868920 : SNP	a	c	0.0517	0.0019	0.0473	0.0537	0.0173	0.0207	0.4039	-+??+	66.3	5.939	2	0.05134
7 : 21818103 : SNP	a	c	0.3987	0.0048	0.3945	0.4053	-0.0179	0.0086	0.03608	--+-+	58.9	9.737	4	0.04509
16 : 63265907 : SNP	t	c	0.6838	0.0244	0.6694	0.7427	0.0054	0.0092	0.5573	+-+-+	0.0	2.938	4	0.5683
5 : 94040908 : SNP	c	g	0.7127	0.0210	0.6673	0.7304	-0.0095	0.0093	0.31	-+--+	38.4	6.489	4	0.1655
2 : 221952769 : SNP	a	t	0.9692	0.0078	0.9543	0.9739	0.0600	0.0273	0.02797	++??+	42.5	3.476	2	0.1759
4 : 22540635 : SNP	a	c	0.9130	0.0040	0.9046	0.9160	0.0088	0.0157	0.5745	++?-+	12.3	3.422	3	0.3311
12 : 92714278 : SNP	t	g	0.4916	0.0153	0.4702	0.5147	0.0123	0.0086	0.1516	+++-+	0.0	1.106	4	0.8933
3 : 20070169 : SNP	t	g	0.1975	0.0037	0.1942	0.2088	-0.0275	0.0117	0.0187	--+--	0.0	3.147	4	0.5335
13 : 61652722 : SNP	a	c	0.6772	0.0063	0.6689	0.6855	0.0139	0.0091	0.128	+--++	62.3	10.599	4	0.03146
20 : 46656767 : SNP	t	g	0.3449	0.0134	0.3294	0.3650	-0.0102	0.0091	0.2636	--+--	0.0	3.276	4	0.5127
21 : 23762441 : INDEL	d	r	0.0437	0.0021	0.0412	0.0454	0.0148	0.0266	0.5777	++???	0.0	0.098	1	0.7542
1 : 32386834 : SNP	t	c	0.0369	0.0000	0.0369	0.0369	0.0510	0.0384	0.1843	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 85221849 : INDEL	d	r	0.0152	0.0000	0.0152	0.0152	0.0050	0.0556	0.9283	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 85618324 : SNP	t	c	0.7913	0.0102	0.7810	0.8067	0.0041	0.0112	0.7124	+-++-	0.0	1.863	4	0.7609
20 : 49195248 : SNP	a	g	0.5070	0.0153	0.4878	0.5274	0.0075	0.0085	0.3791	+-+++	0.0	3.036	4	0.5518
19 : 55277522 : SNP	t	c	0.1656	0.0171	0.1412	0.1887	0.0136	0.0328	0.6776	??+-+	0.0	1.646	2	0.439
11 : 92011025 : INDEL	i	r	0.6632	0.0132	0.6207	0.6783	-0.0116	0.0100	0.2425	+---+	0.0	3.722	4	0.445
12 : 47088021 : SNP	a	c	0.9311	0.0017	0.9295	0.9343	-0.0067	0.0172	0.6954	-+?+-	0.0	2.980	3	0.3947
2 : 72137643 : SNP	t	c	0.9874	0.0000	0.9874	0.9874	-0.0630	0.0566	0.2657	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 76081949 : SNP	a	g	0.1587	0.0131	0.1269	0.1718	-0.0058	0.0286	0.8385	??-+-	0.0	1.060	2	0.5886
6 : 109078381 : SNP	t	c	0.9864	0.0000	0.9864	0.9864	-0.0080	0.0576	0.8896	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 44599248 : SNP	t	c	0.7928	0.0141	0.7760	0.8207	-0.0009	0.0105	0.9324	-++-+	6.3	4.268	4	0.3709
1 : 191131143 : SNP	a	t	0.6168	0.0069	0.6000	0.6423	0.0043	0.0091	0.6346	+-++-	10.2	4.454	4	0.3481
18 : 77672353 : SNP	t	c	0.0260	0.0000	0.0260	0.0260	-0.0200	0.0607	0.7416	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 146950824 : INDEL	d	r	0.9775	0.0000	0.9775	0.9775	0.0010	0.0485	0.9836	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 17004403 : SNP	t	c	0.7387	0.0360	0.7125	0.8020	-0.0155	0.0145	0.2862	?-?--	0.0	0.720	2	0.6978
1 : 212626163 : SNP	t	c	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	0.1090	0.0526	0.03811	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 62516026 : SNP	t	c	0.7246	0.0109	0.7023	0.7330	0.0114	0.0097	0.2373	++--+	0.0	1.604	4	0.8081
7 : 66442363 : SNP	a	g	0.6039	0.0324	0.5727	0.6475	-0.0026	0.0107	0.8095	----+	0.0	2.978	4	0.5615
2 : 154540738 : SNP	c	g	0.0229	0.0000	0.0229	0.0229	-0.0780	0.0425	0.06618	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 80938706 : SNP	c	g	0.2548	0.0070	0.2443	0.2752	-0.0305	0.0098	0.001828	-----	0.0	0.912	4	0.9228
7 : 124991738 : INDEL	i	r	0.3241	0.0159	0.3038	0.3575	-0.0111	0.0125	0.3742	+----	18.5	4.906	4	0.2971
3 : 67655676 : SNP	t	c	0.4498	0.0030	0.4437	0.4544	-0.0024	0.0085	0.781	-++--	35.4	6.192	4	0.1853
11 : 129026963 : SNP	t	c	0.8528	0.0169	0.8380	0.8945	-0.0027	0.0120	0.8249	-+-++	29.1	5.641	4	0.2276
14 : 27199557 : SNP	a	c	0.1485	0.0067	0.1421	0.1585	0.0126	0.0119	0.2888	-++++	13.6	4.630	4	0.3274
13 : 24550462 : INDEL	d	r	0.3490	0.0065	0.3350	0.3546	0.0046	0.0092	0.6141	+-+-+	0.0	3.984	4	0.4082
6 : 81810450 : INDEL	d	r	0.7227	0.0241	0.6737	0.7362	0.0118	0.0097	0.2209	+-+-+	0.0	2.729	4	0.6041
6 : 4053889 : SNP	t	c	0.3152	0.0110	0.2979	0.3355	0.0104	0.0093	0.2643	+++--	0.0	2.586	4	0.6294
12 : 60077343 : SNP	a	c	0.9358	0.0078	0.9274	0.9441	-0.0128	0.0183	0.4854	-+?++	0.0	2.227	3	0.5267
1 : 119091205 : SNP	t	c	0.7825	0.0112	0.7747	0.8225	0.0079	0.0105	0.4505	+-+++	0.0	2.528	4	0.6396
8 : 90723091 : SNP	a	g	0.0392	0.0001	0.0391	0.0394	-0.0301	0.0256	0.2394	--???	0.0	0.779	1	0.3774
7 : 156908952 : SNP	a	g	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	0.0390	0.0556	0.483	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 31198213 : SNP	t	g	0.7714	0.0034	0.7640	0.7731	-0.0089	0.0217	0.6822	??-+-	0.0	1.688	2	0.4299
12 : 63899548 : SNP	t	c	0.3107	0.0209	0.2876	0.3697	-0.0061	0.0092	0.5054	----+	0.0	0.783	4	0.9407
11 : 59071037 : INDEL	d	r	0.6271	0.0158	0.6123	0.6486	-0.0141	0.0100	0.1569	-+-+-	33.9	6.054	4	0.1952
15 : 24341812 : SNP	a	g	0.7546	0.0134	0.7397	0.7772	-0.0023	0.0155	0.8798	-+--+	0.0	1.721	4	0.7869
11 : 21877332 : SNP	t	g	0.6706	0.0042	0.6663	0.6844	-0.0141	0.0091	0.1239	-+---	27.6	5.525	4	0.2375
1 : 198925194 : SNP	t	g	0.6055	0.0072	0.5799	0.6115	-0.0015	0.0086	0.86	+-+-+	0.0	2.838	4	0.5854
7 : 91337768 : SNP	t	c	0.0792	0.0041	0.0746	0.0831	0.0015	0.0205	0.9402	--??+	0.0	0.732	2	0.6936
14 : 88486653 : SNP	t	c	0.0465	0.0083	0.0404	0.0577	0.0086	0.0358	0.811	-???+	8.5	1.092	1	0.2959
8 : 5984498 : SNP	t	c	0.4682	0.0161	0.4582	0.5035	0.0067	0.0085	0.4306	++--+	18.2	4.889	4	0.2989
6 : 81725351 : SNP	a	t	0.1814	0.0050	0.1717	0.1974	0.0033	0.0112	0.7688	++---	22.6	5.170	4	0.2703
6 : 97530244 : SNP	c	g	0.9783	0.0000	0.9783	0.9783	0.0170	0.0505	0.7366	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 86044292 : SNP	a	g	0.0786	0.0095	0.0540	0.0909	0.0181	0.0160	0.259	++--+	59.5	9.874	4	0.0426
17 : 3233590 : SNP	a	g	0.9110	0.0106	0.8939	0.9213	0.0106	0.0161	0.5121	++?-+	44.5	5.407	3	0.1443
18 : 10696227 : SNP	t	c	0.3505	0.0188	0.3106	0.3697	0.0106	0.0091	0.2473	+++++	0.0	0.367	4	0.9851
5 : 30664110 : SNP	c	g	0.9430	0.0000	0.9430	0.9430	-0.0120	0.0384	0.7547	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 62043653 : SNP	t	c	0.8375	0.0056	0.8263	0.8456	0.0093	0.0126	0.4588	+++-?	26.0	4.052	3	0.2559
10 : 58587715 : INDEL	d	r	0.0372	0.0000	0.0372	0.0372	0.0280	0.0576	0.627	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 147734508 : SNP	a	g	0.2835	0.0147	0.2489	0.3167	0.0043	0.0093	0.6392	+--+-	0.0	2.479	4	0.6484
11 : 51372480 : SNP	a	g	0.4135	0.0330	0.3452	0.4385	0.0026	0.0091	0.7724	-++-+	25.0	5.332	4	0.2549
5 : 141751471 : SNP	t	c	0.0124	0.0000	0.0124	0.0124	-0.0570	0.0586	0.331	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 235656632 : SNP	t	g	0.1099	0.0052	0.1060	0.1240	-0.0155	0.0139	0.2639	----+	0.0	2.495	4	0.6455
7 : 100421101 : SNP	a	g	0.0844	0.0159	0.0682	0.1161	-0.0180	0.0159	0.2571	--?++	48.8	5.863	3	0.1185
4 : 162844090 : SNP	a	g	0.6635	0.0054	0.6512	0.6712	-0.0261	0.0091	0.004166	-+++-	50.4	8.058	4	0.08949
13 : 48054954 : SNP	t	c	0.9591	0.0000	0.9591	0.9591	-0.0280	0.0344	0.4153	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 90822175 : SNP	t	g	0.9794	0.0000	0.9794	0.9794	0.0030	0.0445	0.9462	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 40994218 : SNP	a	g	0.0805	0.0076	0.0708	0.0944	0.0191	0.0159	0.2307	++?++	0.0	1.752	3	0.6253
8 : 125423217 : SNP	a	c	0.0685	0.0040	0.0611	0.0735	0.0392	0.0180	0.02951	++?++	0.0	0.266	3	0.9662
2 : 172036804 : SNP	t	g	0.9832	0.0000	0.9832	0.9832	0.0170	0.0485	0.7261	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 74202347 : SNP	a	g	0.5083	0.0078	0.4875	0.5155	-0.0063	0.0090	0.4866	---++	0.7	4.029	4	0.4021
7 : 2239971 : SNP	t	g	0.1735	0.0041	0.1600	0.1766	-0.0161	0.0113	0.1547	---++	44.7	7.239	4	0.1238
7 : 112608534 : SNP	a	c	0.1035	0.0072	0.0798	0.1125	0.0015	0.0146	0.9178	++-+-	38.7	6.520	4	0.1635
2 : 84225376 : SNP	a	g	0.9332	0.0085	0.9230	0.9473	-0.0060	0.0175	0.7336	-+?--	0.0	2.328	3	0.5071
10 : 131128952 : SNP	t	c	0.6535	0.0194	0.6277	0.7032	-0.0012	0.0090	0.898	-+++-	0.0	3.587	4	0.4647
11 : 99425803 : SNP	t	g	0.6609	0.0171	0.6265	0.6708	-0.0015	0.0091	0.873	+-+--	0.0	1.750	4	0.7817
7 : 12206706 : INDEL	d	r	0.1030	0.0034	0.0874	0.1057	0.0101	0.0139	0.4699	++---	0.0	3.740	4	0.4423
8 : 131411185 : SNP	t	c	0.3619	0.0075	0.3295	0.3664	-0.0071	0.0088	0.4179	-+-+-	0.0	2.032	4	0.7298
2 : 23823989 : SNP	a	g	0.8976	0.0041	0.8940	0.9153	0.0030	0.0141	0.8305	-++-+	21.2	5.076	4	0.2796
4 : 56921498 : SNP	a	t	0.6842	0.0109	0.6738	0.7020	0.0047	0.0092	0.6109	++--+	0.0	0.912	4	0.9228
2 : 21125742 : SNP	t	c	0.7346	0.0245	0.6863	0.7507	0.0023	0.0097	0.8131	+-+-+	0.0	0.991	4	0.9112
8 : 92018671 : SNP	t	c	0.9142	0.0049	0.8970	0.9169	0.0065	0.0152	0.6712	++-++	0.0	0.668	4	0.9553
17 : 29979018 : SNP	a	g	0.0566	0.0061	0.0519	0.0682	-0.0493	0.0195	0.01141	--?--	0.0	0.164	3	0.9832
18 : 31206166 : SNP	t	c	0.4271	0.0223	0.3823	0.4575	-0.0058	0.0087	0.5084	+---+	0.0	1.977	4	0.7401
14 : 62983371 : SNP	t	c	0.7794	0.0124	0.7530	0.7863	0.0001	0.0105	0.9932	--+++	0.0	1.352	4	0.8524
2 : 98441362 : SNP	a	t	0.7094	0.0297	0.6374	0.7350	0.0138	0.0093	0.1359	+++-+	0.0	0.966	4	0.915
11 : 8616255 : SNP	a	g	0.5181	0.0165	0.4792	0.5336	-0.0080	0.0085	0.3492	----+	1.1	4.046	4	0.3998
15 : 98898245 : SNP	t	c	0.4237	0.0172	0.3917	0.4382	-0.0006	0.0086	0.944	---++	0.0	2.751	4	0.6004
19 : 5821968 : SNP	t	c	0.0483	0.0100	0.0414	0.0670	0.0005	0.0290	0.9873	+??-+	0.0	0.247	2	0.8839
2 : 46781898 : SNP	c	g	0.3931	0.0120	0.3571	0.3992	0.0016	0.0087	0.8548	+--+-	33.1	5.976	4	0.201
17 : 79504073 : SNP	t	c	0.0716	0.0016	0.0693	0.0732	-0.0015	0.0192	0.9397	--?-+	0.0	0.589	3	0.899
15 : 67293073 : SNP	a	t	0.5411	0.0081	0.5153	0.5474	-0.0163	0.0089	0.06616	--++-	27.1	5.490	4	0.2406
7 : 68873507 : SNP	a	g	0.1913	0.0063	0.1837	0.2039	-0.0212	0.0113	0.06188	--+-+	32.4	5.915	4	0.2056
5 : 128560780 : SNP	a	g	0.1289	0.0048	0.1179	0.1380	0.0260	0.0127	0.04089	++--+	0.0	1.490	4	0.8283
3 : 128181471 : SNP	a	g	0.0122	0.0000	0.0122	0.0122	-0.0660	0.0586	0.2603	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 26688220 : SNP	a	g	0.9706	0.0000	0.9706	0.9706	-0.0130	0.0526	0.8047	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 150813097 : SNP	t	c	0.1493	0.0080	0.1452	0.1673	0.0145	0.0120	0.2266	+-+-+	0.0	1.712	4	0.7885
7 : 16942259 : SNP	c	g	0.8317	0.0173	0.7989	0.8439	-0.0032	0.0117	0.7834	+---+	0.0	3.655	4	0.4548
10 : 101683965 : SNP	t	c	0.3949	0.0208	0.3769	0.4472	-0.0008	0.0091	0.929	+-+--	53.1	8.531	4	0.07396
8 : 5306942 : SNP	t	c	0.9707	0.0058	0.9598	0.9743	-0.0029	0.0272	0.9156	+-??-	46.1	3.712	2	0.1563
11 : 90224672 : SNP	t	c	0.8666	0.0086	0.8503	0.8744	0.0058	0.0131	0.6565	+-+-+	0.0	3.445	4	0.4862
1 : 62310795 : SNP	a	g	0.0450	0.0014	0.0439	0.0468	0.0627	0.0247	0.01108	++???	0.0	0.076	1	0.783
3 : 139454512 : SNP	t	c	0.9829	0.0000	0.9829	0.9829	0.1290	0.0546	0.01812	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 94016039 : INDEL	d	r	0.0384	0.0029	0.0353	0.0412	0.0229	0.0313	0.4636	-+???	0.0	0.663	1	0.4154
5 : 97247089 : SNP	a	g	0.9532	0.0013	0.9504	0.9539	0.0237	0.0213	0.2668	++??+	0.0	0.191	2	0.9088
15 : 36160112 : SNP	t	g	0.0368	0.0000	0.0368	0.0368	0.0760	0.0516	0.1404	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 87901964 : SNP	a	g	0.4118	0.0095	0.3921	0.4385	0.0027	0.0090	0.7609	+-+-+	0.0	1.734	4	0.7846
7 : 154932459 : SNP	t	c	0.1786	0.0327	0.1317	0.2125	-0.0286	0.0150	0.0569	-----	55.1	8.900	4	0.06364
5 : 65528130 : SNP	t	g	0.8339	0.0051	0.8094	0.8358	-0.0119	0.0115	0.2987	+----	36.8	6.334	4	0.1756
8 : 40996924 : SNP	a	g	0.7648	0.0189	0.7534	0.8129	0.0062	0.0102	0.5425	0++-+	0.0	0.957	4	0.9162
22 : 39170961 : SNP	c	g	0.9288	0.0058	0.9243	0.9375	0.0105	0.0210	0.618	++?--	0.0	1.599	3	0.6596
2 : 106563226 : SNP	a	g	0.2023	0.0075	0.1970	0.2317	0.0061	0.0105	0.5634	+-+-+	0.0	2.119	4	0.714
15 : 41799711 : SNP	t	c	0.1397	0.0256	0.1274	0.2144	-0.0157	0.0160	0.3281	-+--?	0.0	2.498	3	0.4757
12 : 33361836 : SNP	a	g	0.7223	0.0107	0.7067	0.7705	0.0051	0.0101	0.6149	+++-?	55.4	6.723	3	0.08128
8 : 131046123 : SNP	t	c	0.9120	0.0045	0.8998	0.9159	0.0017	0.0148	0.9077	+-++-	0.0	3.916	4	0.4176
10 : 109948948 : SNP	a	g	0.9646	0.0008	0.9640	0.9657	-0.0101	0.0295	0.7322	+-???	0.0	0.432	1	0.5112
2 : 28112655 : SNP	c	g	0.9492	0.0027	0.9400	0.9516	-0.0122	0.0217	0.5731	--?++	44.6	5.420	3	0.1435
1 : 10874877 : SNP	a	c	0.6958	0.0183	0.6518	0.7260	0.0062	0.0102	0.5441	+++-+	0.0	1.463	4	0.8332
8 : 94092534 : SNP	t	g	0.6009	0.0143	0.5898	0.6314	-0.0071	0.0086	0.4102	--+--	0.0	2.385	4	0.6653
15 : 86357061 : SNP	a	t	0.7509	0.0178	0.7308	0.7914	-0.0040	0.0101	0.691	0---+	16.3	4.779	4	0.3107
2 : 54689027 : SNP	a	g	0.4799	0.0249	0.4250	0.5090	0.0027	0.0087	0.7605	+-+-+	0.0	1.380	4	0.8476
16 : 70809702 : INDEL	d	r	0.0117	0.0000	0.0117	0.0117	0.0680	0.0566	0.2297	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 29904903 : SNP	t	c	0.1373	0.0096	0.1128	0.1509	-0.0064	0.0128	0.6155	-+---	0.0	1.858	4	0.7619
10 : 13862184 : SNP	t	c	0.8522	0.0067	0.8384	0.8588	0.0014	0.0132	0.9143	-+-++	36.7	6.318	4	0.1766
11 : 87027323 : INDEL	i	r	0.0130	0.0000	0.0130	0.0130	-0.0990	0.0617	0.1084	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 137173489 : SNP	a	g	0.1674	0.0306	0.1454	0.2334	-0.0208	0.0115	0.07036	-++--	0.0	3.765	4	0.4388
11 : 20403904 : SNP	c	g	0.8785	0.0071	0.8598	0.8855	-0.0072	0.0133	0.5903	+--+-	0.0	2.734	4	0.6032
12 : 43047043 : SNP	c	g	0.8434	0.0058	0.8365	0.8714	0.0103	0.0120	0.3896	++---	7.0	4.299	4	0.367
8 : 6004899 : SNP	a	c	0.4767	0.0078	0.4534	0.4871	0.0136	0.0085	0.1099	+---+	70.8	13.709	4	0.008285
13 : 103320688 : SNP	t	c	0.2976	0.0056	0.2808	0.3044	-0.0013	0.0092	0.8902	+-++-	0.0	2.106	4	0.7163
18 : 73748631 : SNP	a	g	0.3184	0.0106	0.2857	0.3492	-0.0035	0.0105	0.7398	-++--	0.0	1.319	4	0.8582
3 : 187607504 : SNP	t	c	0.1968	0.0038	0.1807	0.1995	0.0189	0.0107	0.0772	++-+-	18.0	4.877	4	0.3002
2 : 27178965 : SNP	c	g	0.6146	0.0151	0.5814	0.6253	0.0003	0.0087	0.9762	0++--	0.0	1.097	4	0.8948
4 : 40913982 : SNP	t	c	0.1200	0.0073	0.1078	0.1255	-0.0084	0.0131	0.5235	--+++	0.0	0.615	4	0.9614
5 : 7583327 : SNP	a	g	0.3190	0.0053	0.3015	0.3269	0.0050	0.0091	0.5865	-++++	0.0	3.134	4	0.5357
3 : 135138484 : SNP	a	g	0.1840	0.0072	0.1702	0.2069	-0.0091	0.0112	0.4176	---++	0.0	3.078	4	0.5448
1 : 243963175 : SNP	a	g	0.6785	0.0110	0.6693	0.7018	-0.0032	0.0092	0.7247	+-+--	0.0	3.112	4	0.5392
10 : 95393928 : SNP	c	g	0.4066	0.0170	0.3731	0.4207	-0.0025	0.0096	0.7918	-0-++	0.0	0.345	4	0.9867
11 : 102512086 : SNP	t	c	0.5847	0.0188	0.5742	0.6351	-0.0004	0.0086	0.9648	-+--+	24.0	5.263	4	0.2613
11 : 104639955 : SNP	c	g	0.0290	0.0000	0.0290	0.0290	0.0690	0.0374	0.06506	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 61493620 : SNP	t	c	0.1947	0.0054	0.1796	0.2056	-0.0004	0.0107	0.9711	+----	0.0	3.627	4	0.4589
7 : 159105036 : SNP	t	g	0.8729	0.0105	0.8533	0.8843	-0.0073	0.0210	0.7278	?+---	2.3	3.071	3	0.3809
15 : 100395612 : SNP	a	g	0.9140	0.0024	0.9128	0.9192	0.0131	0.0155	0.3979	+-?-+	17.9	3.656	3	0.3011
4 : 164137902 : SNP	t	c	0.9565	0.0065	0.9489	0.9621	-0.0056	0.0261	0.8297	+-???	0.0	0.225	1	0.6356
9 : 116845223 : SNP	t	c	0.8481	0.0053	0.8302	0.8537	-0.0073	0.0123	0.5541	--+-+	0.0	0.601	4	0.963
7 : 49149604 : SNP	t	c	0.8480	0.0092	0.8271	0.8563	0.0123	0.0118	0.2973	+--++	54.8	8.851	4	0.06492
4 : 91531123 : SNP	a	g	0.2564	0.0052	0.2520	0.2642	0.0001	0.0098	0.9898	+-+++	27.9	5.545	4	0.2358
8 : 21621920 : SNP	c	g	0.9701	0.0000	0.9701	0.9701	-0.0460	0.0596	0.4405	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 15397270 : SNP	t	c	0.5478	0.0082	0.5311	0.5575	-0.0080	0.0085	0.35	--+-+	0.0	1.429	4	0.8391
1 : 161445514 : SNP	t	c	0.1931	0.0198	0.1798	0.2505	-0.0039	0.0114	0.7335	+--+-	53.0	8.502	4	0.07483
7 : 44971600 : SNP	a	g	0.8552	0.0094	0.8351	0.8607	0.0103	0.0125	0.4106	-++-+	0.0	2.254	4	0.6891
5 : 172337314 : SNP	a	g	0.7422	0.0131	0.7065	0.7587	-0.0025	0.0098	0.7959	+++--	18.2	4.889	4	0.2989
1 : 115763690 : SNP	t	c	0.9817	0.0000	0.9817	0.9817	-0.0230	0.0445	0.6051	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 42801012 : SNP	t	g	0.0476	0.0049	0.0435	0.0648	-0.0027	0.0212	0.8976	--?++	0.0	2.602	3	0.4571
10 : 84505567 : SNP	t	c	0.2376	0.0151	0.2257	0.2764	0.0001	0.0102	0.9919	-++++	0.0	3.539	4	0.4719
5 : 28436992 : SNP	a	t	0.9258	0.0158	0.8982	0.9367	0.0083	0.0172	0.6318	+-?-+	0.0	1.458	3	0.692
8 : 101901901 : SNP	a	g	0.6921	0.0169	0.6785	0.7274	0.0061	0.0094	0.5144	+--++	12.8	4.585	4	0.3326
6 : 160301358 : SNP	t	c	0.1692	0.0042	0.1649	0.1855	-0.0141	0.0113	0.2135	-+--+	58.4	9.617	4	0.04739
5 : 97472490 : SNP	t	g	0.1692	0.0060	0.1646	0.1882	0.0226	0.0117	0.05265	+++-+	0.0	1.307	4	0.8601
12 : 58122875 : SNP	t	c	0.1666	0.0086	0.1326	0.1717	-0.0023	0.0119	0.8465	-+-++	29.6	5.681	4	0.2242
1 : 234856390 : SNP	a	g	0.1488	0.0106	0.1378	0.1597	-0.0029	0.0125	0.8153	+-+--	49.4	7.903	4	0.0952
21 : 39185760 : SNP	a	g	0.4948	0.0176	0.4724	0.5287	0.0139	0.0085	0.1039	++-++	15.7	4.745	4	0.3145
1 : 79899105 : SNP	a	g	0.4439	0.0303	0.4234	0.5056	0.0022	0.0085	0.795	++---	0.0	0.693	4	0.9522
10 : 108409764 : SNP	a	t	0.9228	0.0069	0.9185	0.9431	-0.0158	0.0162	0.3298	+-?--	50.9	6.114	3	0.1062
5 : 3080520 : SNP	c	g	0.1262	0.0044	0.1202	0.1353	-0.0092	0.0129	0.4789	-+++-	34.4	6.095	4	0.1922
11 : 60387018 : SNP	c	g	0.0285	0.0002	0.0283	0.0287	-0.0554	0.0307	0.07134	--???	0.0	0.764	1	0.382
9 : 89264871 : SNP	t	c	0.6656	0.0149	0.6555	0.7011	-0.0040	0.0093	0.6648	++---	0.0	2.894	4	0.5758
12 : 125605887 : SNP	a	g	0.7213	0.0097	0.7097	0.7426	0.0011	0.0094	0.9053	-+-++	0.0	1.998	4	0.7361
13 : 82755088 : SNP	t	c	0.7439	0.0172	0.7269	0.7797	0.0146	0.0099	0.1405	++-+-	17.7	4.861	4	0.3019
7 : 10256513 : SNP	a	g	0.7668	0.0065	0.7492	0.7764	-0.0098	0.0104	0.3488	--++-	7.2	4.313	4	0.3653
17 : 31709285 : SNP	t	g	0.1431	0.0087	0.1216	0.1610	-0.0241	0.0123	0.05009	-----	0.0	2.813	4	0.5896
19 : 20203425 : SNP	t	c	0.0140	0.0000	0.0140	0.0140	-0.0180	0.0536	0.7369	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 120519987 : SNP	a	c	0.8132	0.0101	0.7835	0.8193	-0.0060	0.0126	0.6342	---+-	0.0	3.136	4	0.5353
6 : 147205946 : SNP	a	g	0.8483	0.0041	0.8443	0.8537	-0.0029	0.0119	0.8048	++--+	54.9	8.861	4	0.06468
10 : 126751899 : SNP	t	c	0.0415	0.0094	0.0370	0.0612	-0.0147	0.0365	0.6865	+??-?	57.9	2.375	1	0.1233
11 : 30567409 : INDEL	d	r	0.3559	0.0205	0.3081	0.3664	0.0068	0.0101	0.4967	-++-+	0.0	3.770	4	0.438
5 : 5830328 : SNP	a	c	0.0145	0.0000	0.0145	0.0145	0.0250	0.0596	0.6751	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 78978500 : SNP	a	c	0.3008	0.0103	0.2878	0.3246	0.0028	0.0092	0.759	-++--	48.3	7.734	4	0.1018
16 : 62284255 : SNP	a	g	0.5857	0.0138	0.5468	0.5958	-0.0066	0.0085	0.4413	+----	0.0	2.682	4	0.6124
2 : 75484653 : SNP	t	c	0.5801	0.0062	0.5740	0.6156	-0.0104	0.0086	0.2263	----+	42.7	6.984	4	0.1367
1 : 154039854 : SNP	t	c	0.2544	0.0102	0.2426	0.2829	0.0057	0.0110	0.6048	++++-	0.0	3.779	4	0.4367
4 : 187109314 : SNP	t	c	0.5899	0.0060	0.5713	0.5961	-0.0095	0.0090	0.291	--+--	7.0	4.303	4	0.3665
10 : 115385650 : SNP	t	c	0.1175	0.0100	0.0957	0.1281	-0.0012	0.0135	0.9285	+-+--	27.7	5.533	4	0.2369
4 : 83100433 : SNP	a	t	0.1121	0.0084	0.0989	0.1250	-0.0022	0.0140	0.8753	+--++	0.0	1.300	4	0.8614
3 : 168736552 : SNP	t	c	0.9190	0.0102	0.8996	0.9263	-0.0105	0.0159	0.5104	-+++-	9.1	4.400	4	0.3546
18 : 35780195 : SNP	t	c	0.9350	0.0048	0.9313	0.9461	0.0203	0.0185	0.2741	++?-+	0.0	0.830	3	0.8423
22 : 36631039 : SNP	t	c	0.6442	0.0067	0.6277	0.6613	-0.0062	0.0091	0.4961	---++	0.0	1.668	4	0.7966
2 : 64927788 : INDEL	d	r	0.8176	0.0251	0.7948	0.8597	0.0046	0.0169	0.7849	+--++	53.3	8.563	4	0.07301
2 : 227283903 : SNP	t	c	0.7866	0.0212	0.7478	0.8044	0.0049	0.0105	0.6382	-+-++	0.0	2.205	4	0.6981
2 : 212139124 : SNP	a	g	0.8759	0.0074	0.8671	0.8836	-0.0042	0.0130	0.7472	+-+-+	6.1	4.259	4	0.3721
20 : 22263864 : SNP	a	g	0.0344	0.0019	0.0320	0.0358	0.0835	0.0271	0.002051	++???	0.0	0.539	1	0.463
10 : 80817775 : SNP	t	c	0.4215	0.0186	0.4086	0.4741	0.0027	0.0088	0.7638	-+-++	0.0	3.393	4	0.4943
4 : 146744253 : SNP	a	g	0.0326	0.0000	0.0326	0.0326	0.0360	0.0374	0.3358	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 73099347 : SNP	a	g	0.0513	0.0061	0.0477	0.0690	0.0003	0.0205	0.9901	+-?--	0.0	2.476	3	0.4797
4 : 67332904 : SNP	t	c	0.9752	0.0057	0.9693	0.9807	-0.0155	0.0327	0.6355	-0???	0.0	0.210	1	0.6466
3 : 163574522 : INDEL	d	r	0.0857	0.0035	0.0813	0.0917	0.0064	0.0158	0.6862	+--+-	0.0	2.317	4	0.6776
3 : 94914240 : SNP	a	g	0.3874	0.0110	0.3724	0.4040	0.0091	0.0086	0.2854	+++--	15.7	4.744	4	0.3146
7 : 151038052 : SNP	c	g	0.1001	0.0077	0.0948	0.1166	0.0385	0.0250	0.1226	+?-+-	0.0	2.861	3	0.4136
11 : 71534813 : SNP	t	g	0.0597	0.0051	0.0566	0.0681	-0.0191	0.0428	0.6549	???-+	22.7	1.293	1	0.2554
20 : 49872076 : SNP	t	g	0.1986	0.0109	0.1684	0.2060	0.0094	0.0108	0.384	+++++	0.0	0.502	4	0.9733
7 : 137906062 : SNP	a	t	0.9868	0.0000	0.9868	0.9868	0.0040	0.0586	0.9456	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 224888632 : SNP	a	g	0.0420	0.0037	0.0349	0.0450	0.0095	0.0224	0.673	+-??-	0.0	0.442	2	0.8017
4 : 18413870 : SNP	t	c	0.8649	0.0274	0.8402	0.9092	-0.0140	0.0200	0.483	--?--	0.0	0.051	3	0.997
1 : 7006698 : SNP	a	t	0.6054	0.0074	0.5929	0.6156	-0.0099	0.0086	0.2506	-----	0.0	1.517	4	0.8236
4 : 124654571 : SNP	t	c	0.7812	0.0178	0.7549	0.8123	-0.0145	0.0107	0.1745	--+--	28.7	5.610	4	0.2302
2 : 197535392 : SNP	a	t	0.6822	0.0094	0.6696	0.6918	0.0103	0.0091	0.2622	+-+++	0.0	1.505	4	0.8257
11 : 1085135 : SNP	t	c	0.9123	0.0047	0.9081	0.9191	-0.0704	0.0216	0.001127	--?--	12.2	3.415	3	0.3319
13 : 104627773 : SNP	t	c	0.1946	0.0067	0.1803	0.2005	0.0009	0.0107	0.9316	-+-++	7.3	4.314	4	0.3652
3 : 56826324 : SNP	a	c	0.6089	0.0449	0.5176	0.6332	-0.0012	0.0089	0.8883	---++	41.7	6.862	4	0.1434
4 : 177970855 : SNP	t	c	0.8144	0.0089	0.7991	0.8367	-0.0030	0.0119	0.7975	-++-+	48.6	7.787	4	0.09969
5 : 50792240 : SNP	a	g	0.2736	0.0230	0.2319	0.3012	-0.0129	0.0096	0.1807	--+--	0.0	1.843	4	0.7646
12 : 26237627 : SNP	a	g	0.0475	0.0081	0.0403	0.0606	0.0206	0.0227	0.3637	++?++	0.0	0.177	3	0.9813
3 : 141703015 : SNP	t	c	0.8930	0.0055	0.8873	0.9042	-0.0218	0.0140	0.12	--++-	0.0	3.235	4	0.5194
7 : 37241941 : INDEL	d	r	0.0240	0.0000	0.0240	0.0240	0.0170	0.0414	0.6817	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 43958047 : SNP	a	t	0.6895	0.0153	0.6808	0.7301	-0.0064	0.0092	0.4852	----+	0.0	2.450	4	0.6537
5 : 103123949 : INDEL	d	r	0.5016	0.0098	0.4905	0.5253	-0.0037	0.0091	0.6857	+---+	34.5	6.111	4	0.191
14 : 31916792 : SNP	t	c	0.4727	0.0064	0.4590	0.4803	-0.0065	0.0085	0.4428	+----	0.0	3.461	4	0.4839
3 : 101271306 : SNP	a	g	0.0454	0.0000	0.0454	0.0454	0.0900	0.0404	0.02603	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 90380872 : SNP	t	g	0.9894	0.0000	0.9894	0.9894	-0.0160	0.0637	0.8016	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 131246732 : SNP	a	g	0.7451	0.0102	0.7322	0.7549	-0.0099	0.0098	0.3146	-----	0.0	1.766	4	0.7787
11 : 83307861 : INDEL	d	r	0.6458	0.0077	0.6369	0.6659	0.0001	0.0091	0.9917	+--++	29.8	5.697	4	0.2229
3 : 5111640 : SNP	a	c	0.6866	0.0061	0.6672	0.6928	0.0052	0.0112	0.644	+---+	0.0	3.873	4	0.4234
13 : 99753828 : SNP	a	g	0.2694	0.0071	0.2636	0.2916	0.0272	0.0102	0.007567	+++++	0.0	1.840	4	0.7652
10 : 32492652 : SNP	a	t	0.5556	0.0075	0.5452	0.5619	0.0088	0.0085	0.3014	+-+++	13.0	4.598	4	0.3311
1 : 60649323 : SNP	t	g	0.6443	0.0221	0.6246	0.7002	0.0028	0.0086	0.7469	--+++	25.7	5.382	4	0.2503
20 : 51227513 : INDEL	d	r	0.0257	0.0000	0.0257	0.0257	0.0310	0.0617	0.6152	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 48135385 : INDEL	d	r	0.0990	0.0125	0.0860	0.1215	-0.0171	0.0158	0.2807	----+	0.0	2.853	4	0.5827
17 : 55187841 : SNP	t	c	0.3978	0.0020	0.3938	0.4035	0.0049	0.0091	0.5922	-+--+	0.0	2.152	4	0.7079
2 : 206489860 : SNP	t	g	0.8538	0.0093	0.8340	0.8647	0.0056	0.0142	0.6917	+-++-	0.0	1.802	4	0.7721
11 : 17514301 : SNP	t	c	0.9764	0.0000	0.9764	0.9764	0.0260	0.0404	0.5202	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 1540627 : INDEL	d	r	0.3737	0.0174	0.3338	0.3859	-0.0035	0.0086	0.6814	-+---	0.0	1.806	4	0.7713
5 : 32062937 : SNP	a	g	0.7070	0.0132	0.6659	0.7158	-0.0002	0.0093	0.9807	+--++	32.4	5.917	4	0.2054
11 : 56999154 : SNP	t	c	0.0372	0.0000	0.0372	0.0372	0.0130	0.0495	0.793	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 31327650 : SNP	t	g	0.7064	0.0158	0.6870	0.7327	-0.0049	0.0104	0.6379	----+	36.1	6.258	4	0.1807
13 : 91019786 : SNP	a	g	0.9051	0.0035	0.8926	0.9098	-0.0335	0.0146	0.02192	--?+-	42.7	5.237	3	0.1553
2 : 52583758 : SNP	t	c	0.0285	0.0016	0.0271	0.0304	-0.0420	0.0297	0.1572	--???	0.0	0.014	1	0.9069
4 : 189692974 : SNP	t	c	0.1577	0.0154	0.1211	0.1712	-0.0150	0.0120	0.2079	+--+-	24.0	5.261	4	0.2616
2 : 237257205 : INDEL	d	r	0.3532	0.0217	0.3231	0.3857	-0.0141	0.0109	0.1952	-++--	56.3	9.143	4	0.05762
8 : 102194257 : SNP	a	g	0.6568	0.0135	0.6496	0.6918	-0.0043	0.0092	0.6413	-++--	0.0	3.403	4	0.4928
1 : 223861504 : SNP	c	g	0.9537	0.0021	0.9512	0.9555	-0.0350	0.0246	0.1559	--???	0.0	0.058	1	0.8101
2 : 104346306 : INDEL	i	r	0.0169	0.0000	0.0169	0.0169	0.0410	0.0566	0.4689	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 69227337 : SNP	a	g	0.9022	0.0088	0.8729	0.9071	0.0045	0.0146	0.7554	+-+++	18.0	4.878	4	0.3001
15 : 85963906 : SNP	a	g	0.6261	0.0050	0.6154	0.6301	-0.0017	0.0089	0.8492	+---+	0.0	0.840	4	0.933
10 : 2005651 : SNP	c	g	0.2545	0.0214	0.2020	0.2705	0.0032	0.0101	0.7516	+-+--	0.0	2.776	4	0.596
15 : 42640606 : SNP	t	c	0.9196	0.0048	0.9130	0.9256	0.0130	0.0161	0.4203	++?++	0.0	0.268	3	0.9659
8 : 127929167 : SNP	t	c	0.6560	0.0052	0.6532	0.6750	-0.0033	0.0092	0.7215	+----	35.3	6.187	4	0.1856
15 : 90980320 : INDEL	d	r	0.2997	0.0104	0.2889	0.3111	-0.0047	0.0097	0.6272	+-+++	0.0	2.385	4	0.6653
3 : 99432026 : SNP	a	c	0.9132	0.0059	0.9105	0.9270	0.0169	0.0153	0.2665	++?-+	0.0	2.402	3	0.4932
2 : 177847238 : SNP	a	g	0.9800	0.0000	0.9800	0.9800	-0.0420	0.0445	0.345	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 70569116 : SNP	a	g	0.0702	0.0089	0.0453	0.0779	0.0394	0.0178	0.02643	++??+	0.0	0.865	2	0.6489
4 : 19435753 : SNP	t	c	0.9398	0.0035	0.9352	0.9430	0.0065	0.0187	0.7276	+-??-	24.6	2.652	2	0.2655
8 : 61133347 : SNP	a	c	0.5895	0.0133	0.5814	0.6183	-0.0047	0.0086	0.5827	---++	48.5	7.768	4	0.1005
18 : 33193212 : SNP	t	c	0.5015	0.0130	0.4831	0.5297	0.0026	0.0085	0.7642	-+++-	0.0	3.332	4	0.5039
12 : 118300597 : SNP	t	c	0.1879	0.0329	0.1527	0.2477	-0.0082	0.0128	0.5235	++---	12.4	4.568	4	0.3346
12 : 19562230 : SNP	t	c	0.9650	0.0003	0.9648	0.9654	-0.0188	0.0259	0.4663	-+???	0.0	0.609	1	0.4353
7 : 64449629 : SNP	a	g	0.6013	0.0181	0.5892	0.6421	-0.0014	0.0086	0.8723	+----	0.0	3.266	4	0.5143
10 : 52020819 : SNP	a	g	0.8825	0.0107	0.8620	0.8915	-0.0035	0.0133	0.7942	+--++	13.9	4.644	4	0.3258
5 : 8534654 : SNP	t	c	0.4364	0.0117	0.4118	0.4428	-0.0099	0.0086	0.2491	--+-+	0.0	2.341	4	0.6733
3 : 64444616 : SNP	t	c	0.4505	0.0147	0.4395	0.4834	0.0146	0.0091	0.1076	+-+++	0.0	2.978	4	0.5616
21 : 45650009 : SNP	t	c	0.2997	0.0265	0.2850	0.3526	-0.0076	0.0097	0.4361	+--+-	9.5	4.418	4	0.3524
3 : 159075663 : SNP	t	c	0.0178	0.0000	0.0178	0.0178	0.0170	0.0465	0.7147	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 1864386 : SNP	a	g	0.8802	0.0064	0.8743	0.8946	-0.0072	0.0137	0.5983	+-+--	48.9	7.832	4	0.09792
3 : 31383187 : SNP	t	c	0.1272	0.0263	0.0823	0.1571	-0.0205	0.0194	0.2886	-+?--	49.8	5.977	3	0.1127
7 : 48199770 : INDEL	d	r	0.0937	0.0082	0.0834	0.1083	0.0044	0.0165	0.7887	+-?+-	0.0	0.441	3	0.9317
16 : 26379462 : SNP	a	c	0.1592	0.0039	0.1522	0.1724	-0.0131	0.0119	0.2702	--++-	0.0	3.462	4	0.4837
16 : 19354089 : SNP	t	c	0.0540	0.0075	0.0482	0.0727	0.0163	0.0197	0.41	+-?+-	14.1	3.492	3	0.3217
2 : 69909358 : SNP	a	g	0.1421	0.0106	0.1107	0.1500	0.0069	0.0121	0.5696	+-+-+	0.0	2.639	4	0.62
4 : 164362927 : SNP	a	g	0.7849	0.0091	0.7777	0.8051	0.0144	0.0102	0.157	+++-+	0.0	0.678	4	0.954
2 : 226066633 : SNP	a	g	0.9417	0.0108	0.9216	0.9530	0.0175	0.0191	0.3598	++?++	0.0	0.807	3	0.8479
4 : 163083156 : SNP	t	g	0.0213	0.0000	0.0213	0.0213	0.0410	0.0425	0.3342	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 4473308 : INDEL	d	r	0.2138	0.0128	0.1886	0.2211	0.0227	0.0131	0.08408	+++++	0.0	2.920	4	0.5714
3 : 169434771 : SNP	a	g	0.9213	0.0101	0.9056	0.9343	0.0064	0.0220	0.7724	-+??+	0.0	0.218	2	0.8966
3 : 188600380 : SNP	a	g	0.1298	0.0082	0.1209	0.1386	-0.0117	0.0129	0.3666	----+	0.0	1.159	4	0.8849
7 : 3299553 : INDEL	d	r	0.2641	0.0060	0.2351	0.2671	-0.0051	0.0104	0.6233	+-+--	0.0	1.433	4	0.8385
5 : 54950172 : SNP	a	g	0.6427	0.0066	0.6286	0.6518	-0.0003	0.0091	0.9722	++--+	34.8	6.137	4	0.1892
12 : 112432709 : SNP	a	g	0.9072	0.0094	0.9007	0.9302	-0.0010	0.0153	0.9493	-+?+-	0.0	0.228	3	0.9729
20 : 49146539 : SNP	a	g	0.0120	0.0000	0.0120	0.0120	-0.0240	0.0566	0.6716	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 26415848 : INDEL	i	r	0.1625	0.0126	0.1487	0.1783	0.0013	0.0116	0.9078	-+++-	7.2	4.312	4	0.3654
3 : 104857595 : SNP	a	g	0.0812	0.0053	0.0763	0.0901	-0.0115	0.0164	0.4855	--?+-	41.1	5.090	3	0.1653
3 : 123368043 : INDEL	i	r	0.0475	0.0012	0.0466	0.0502	0.0083	0.0229	0.7176	-+??+	25.9	2.697	2	0.2596
7 : 80866153 : SNP	t	g	0.4526	0.0133	0.4367	0.4713	-0.0130	0.0095	0.1715	--+-+	0.0	3.671	4	0.4524
15 : 93218077 : SNP	a	g	0.2013	0.0064	0.1890	0.2130	-0.0082	0.0107	0.4431	--+--	0.0	2.561	4	0.6337
4 : 127780983 : SNP	a	t	0.0651	0.0039	0.0620	0.0700	-0.0073	0.0206	0.7216	+-???	41.1	1.698	1	0.1925
6 : 704587 : SNP	a	g	0.8976	0.0098	0.8817	0.9221	-0.0211	0.0142	0.1372	---+-	0.0	0.738	4	0.9465
1 : 20595891 : SNP	t	c	0.6560	0.0139	0.6319	0.6760	0.0216	0.0091	0.01781	+++-+	53.0	8.506	4	0.07469
7 : 107796245 : SNP	a	t	0.1131	0.0040	0.1083	0.1201	0.0076	0.0141	0.5919	-+-++	0.0	2.190	4	0.7009
13 : 111060764 : SNP	t	c	0.2642	0.0086	0.2482	0.2758	-0.0118	0.0098	0.2261	+----	0.0	2.324	4	0.6765
8 : 73798957 : SNP	t	c	0.3305	0.0076	0.3228	0.3582	0.0021	0.0091	0.8159	0+--+	0.0	1.215	4	0.8757
1 : 230407701 : SNP	t	c	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	-0.0290	0.0536	0.5883	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 130493206 : SNP	t	g	0.9368	0.0003	0.9364	0.9371	-0.0168	0.0184	0.3601	-+??+	0.0	1.670	2	0.4339
9 : 9888209 : SNP	a	g	0.0234	0.0000	0.0234	0.0234	-0.0210	0.0485	0.6652	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 36933883 : SNP	a	g	0.0425	0.0040	0.0405	0.0544	-0.0207	0.0219	0.3443	--?--	0.0	1.683	3	0.6406
19 : 28261958 : SNP	a	g	0.7710	0.0084	0.7667	0.8018	-0.0198	0.0113	0.07844	---+?	0.0	1.118	3	0.7727
12 : 118432194 : SNP	a	c	0.1389	0.0021	0.1314	0.1412	-0.0056	0.0123	0.6464	---++	62.5	10.680	4	0.0304
14 : 36644539 : SNP	a	g	0.9270	0.0047	0.9172	0.9295	0.0379	0.0165	0.02155	++?++	0.0	0.406	3	0.9391
12 : 122912186 : SNP	t	g	0.1110	0.0039	0.1005	0.1166	-0.0093	0.0139	0.5047	-++-+	26.0	5.402	4	0.2484
11 : 107227356 : SNP	c	g	0.7538	0.0037	0.7468	0.7616	0.0187	0.0100	0.0626	+-+--	68.2	12.572	4	0.01357
5 : 164696859 : SNP	a	c	0.4922	0.0130	0.4496	0.5060	-0.0034	0.0085	0.6856	+--++	63.0	10.810	4	0.02879
10 : 115055230 : SNP	a	g	0.9667	0.0000	0.9667	0.9667	-0.0330	0.0566	0.5599	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 60773973 : SNP	t	c	0.3440	0.0080	0.3259	0.3566	0.0008	0.0092	0.9287	--+++	0.0	2.732	4	0.6036
13 : 97208710 : INDEL	i	r	0.0292	0.0000	0.0292	0.0292	0.0780	0.0637	0.2207	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 239957616 : SNP	t	c	0.0768	0.0030	0.0713	0.0869	-0.0176	0.0162	0.278	---++	41.3	6.817	4	0.1459
2 : 46292043 : SNP	a	g	0.0226	0.0000	0.0226	0.0226	-0.0850	0.0404	0.03554	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 37815623 : SNP	a	g	0.0604	0.0083	0.0380	0.0654	0.0049	0.0193	0.8007	++??-	0.0	0.009	2	0.9955
1 : 228384537 : SNP	t	c	0.6412	0.0196	0.6180	0.6908	-0.0077	0.0089	0.3913	+--+-	47.3	7.585	4	0.108
4 : 76115202 : SNP	a	g	0.9454	0.0197	0.9159	0.9601	-0.0241	0.0204	0.2385	--?--	0.0	0.485	3	0.9222
13 : 56506432 : INDEL	d	r	0.1581	0.0091	0.1374	0.1655	-0.0036	0.0116	0.7603	+--+-	0.0	2.961	4	0.5643
20 : 30984802 : SNP	a	c	0.6295	0.0165	0.6161	0.6641	0.0005	0.0091	0.9524	0+-+-	2.3	4.094	4	0.3934
3 : 145261283 : INDEL	i	r	0.2784	0.0130	0.2599	0.2894	0.0035	0.0104	0.7368	-+-++	0.0	3.428	4	0.4889
1 : 36311143 : SNP	t	g	0.9373	0.0107	0.9186	0.9444	-0.0005	0.0192	0.9788	+-?++	21.2	3.809	3	0.2828
1 : 151189419 : SNP	t	c	0.5609	0.0182	0.5212	0.5871	-0.0144	0.0104	0.1665	-0+--	35.4	6.189	4	0.1855
15 : 57920801 : SNP	t	c	0.3950	0.0040	0.3877	0.4058	-0.0013	0.0089	0.8876	-+-+-	24.7	5.311	4	0.2568
6 : 39233422 : SNP	t	g	0.0304	0.0007	0.0298	0.0313	-0.0027	0.0281	0.9243	-+???	61.4	2.594	1	0.1073
3 : 143158652 : INDEL	i	r	0.1547	0.0086	0.1303	0.1618	-0.0013	0.0120	0.9155	--+++	40.2	6.686	4	0.1534
13 : 60004980 : SNP	t	g	0.0572	0.0052	0.0523	0.0675	-0.0167	0.0192	0.3832	-+?--	64.9	8.551	3	0.03589
2 : 25741445 : INDEL	d	r	0.3678	0.0068	0.3523	0.3776	0.0003	0.0092	0.9722	-++--	0.0	1.390	4	0.846
10 : 67568987 : SNP	t	c	0.1715	0.0078	0.1513	0.1935	-0.0002	0.0115	0.9888	--+-+	0.0	3.319	4	0.5059
4 : 4448018 : SNP	a	g	0.0343	0.0011	0.0334	0.0357	0.0253	0.0273	0.3539	++???	0.0	0.116	1	0.7331
20 : 52954952 : SNP	t	c	0.6124	0.0188	0.5876	0.6398	0.0015	0.0091	0.8691	-+-++	0.0	3.347	4	0.5016
5 : 60095668 : SNP	t	c	0.4956	0.0123	0.4693	0.5074	0.0146	0.0086	0.0881	++--+	0.0	3.086	4	0.5436
6 : 70551689 : SNP	t	c	0.1525	0.0078	0.1341	0.1580	0.0122	0.0121	0.3111	++---	5.6	4.237	4	0.3748
7 : 52397520 : SNP	a	g	0.7253	0.0087	0.7106	0.7332	0.0234	0.0099	0.01854	++--+	0.0	3.905	4	0.419
15 : 67514190 : SNP	t	c	0.7668	0.0068	0.7492	0.7729	-0.0215	0.0100	0.03229	--++-	0.0	2.644	4	0.619
6 : 121025700 : SNP	a	t	0.3793	0.0053	0.3673	0.3873	-0.0086	0.0086	0.3151	----+	0.0	3.801	4	0.4336
17 : 42216588 : SNP	t	g	0.2594	0.0197	0.2413	0.3041	-0.0011	0.0098	0.911	+--++	0.0	1.531	4	0.8211
13 : 39517665 : SNP	a	g	0.9429	0.0122	0.9169	0.9511	-0.0204	0.0188	0.2771	--?--	0.0	0.577	3	0.9016
9 : 2687426 : SNP	t	c	0.9348	0.0033	0.9309	0.9379	0.0116	0.0184	0.5271	-+??+	0.0	1.549	2	0.4608
1 : 163160281 : SNP	a	g	0.8391	0.0150	0.8193	0.8698	0.0052	0.0116	0.656	-++-+	52.3	8.379	4	0.07863
6 : 152656934 : SNP	t	c	0.1262	0.0070	0.1128	0.1325	-0.0114	0.0132	0.3902	-+-+-	66.7	12.009	4	0.01729
4 : 132782202 : SNP	a	g	0.1946	0.0071	0.1784	0.1988	-0.0396	0.0244	0.1052	??---	40.9	3.383	2	0.1842
7 : 47478221 : SNP	a	g	0.0449	0.0003	0.0446	0.0452	-0.0536	0.0256	0.03634	--???	16.4	1.197	1	0.274
6 : 30694741 : SNP	t	c	0.9659	0.0000	0.9659	0.9659	0.0198	0.0632	0.7541	????+	0.0	0.000	0	1
17 : 30215669 : SNP	a	g	0.8038	0.0167	0.7697	0.8155	-0.0194	0.0109	0.07407	-----	0.0	1.538	4	0.8199
8 : 97950343 : SNP	t	c	0.0357	0.0052	0.0330	0.0462	-0.0157	0.0249	0.5293	+-??-	16.3	2.388	2	0.3029
16 : 10416853 : SNP	t	c	0.4444	0.0063	0.4397	0.4622	-0.0058	0.0087	0.5046	-++-+	60.2	10.048	4	0.03963
11 : 26303363 : SNP	t	c	0.9775	0.0000	0.9775	0.9775	-0.0810	0.0425	0.05641	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 55320891 : SNP	t	c	0.2303	0.0152	0.1982	0.2473	-0.0128	0.0101	0.2055	---+-	51.8	8.304	4	0.08106
2 : 221301502 : SNP	t	c	0.1804	0.0086	0.1649	0.1899	0.0037	0.0111	0.7379	++++-	0.0	2.146	4	0.709
6 : 4330353 : SNP	c	g	0.8912	0.0061	0.8885	0.9081	-0.0034	0.0145	0.8174	++---	0.0	3.391	4	0.4946
12 : 82455940 : SNP	a	g	0.6365	0.0109	0.6100	0.6596	0.0015	0.0089	0.8684	-0-++	0.0	3.632	4	0.458
16 : 25559953 : SNP	a	g	0.8736	0.0147	0.8635	0.9095	-0.0054	0.0131	0.6828	+---+	0.0	1.606	4	0.8077
11 : 117899803 : SNP	a	g	0.2185	0.0134	0.2018	0.2589	0.0001	0.0111	0.9901	--+++	0.0	2.815	4	0.5892
1 : 238912378 : SNP	a	g	0.4270	0.0083	0.4043	0.4420	0.0020	0.0091	0.8228	-+--+	0.0	3.479	4	0.4811
11 : 41088628 : SNP	a	c	0.2458	0.0058	0.2297	0.2489	0.0022	0.0099	0.8261	+-+++	0.0	2.021	4	0.7319
5 : 74091350 : INDEL	d	r	0.0219	0.0000	0.0219	0.0219	0.0320	0.0435	0.4616	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 1795895 : SNP	t	g	0.0240	0.0000	0.0240	0.0240	0.1000	0.0627	0.1106	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 149276979 : SNP	t	c	0.9588	0.0077	0.9481	0.9643	-0.0260	0.0387	0.5009	-???+	0.0	0.886	1	0.3466
14 : 27192299 : INDEL	i	r	0.4033	0.0118	0.3763	0.4296	-0.0096	0.0086	0.2687	+----	10.2	4.454	4	0.3481
8 : 61568210 : SNP	a	g	0.4935	0.0066	0.4852	0.5149	-0.0154	0.0085	0.07034	---++	11.1	4.501	4	0.3425
2 : 188646078 : SNP	t	c	0.0603	0.0075	0.0534	0.0734	0.0092	0.0189	0.6271	+-?-+	0.0	2.926	3	0.4032
4 : 21971190 : SNP	t	c	0.0260	0.0000	0.0260	0.0260	-0.0350	0.0394	0.3747	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 13866310 : SNP	t	c	0.1820	0.0117	0.1473	0.1894	-0.0028	0.0113	0.8038	+-++-	11.7	4.531	4	0.3389
5 : 172773963 : INDEL	d	r	0.1008	0.0090	0.0826	0.1089	0.0005	0.0169	0.9745	--?++	0.0	2.330	3	0.5067
1 : 238284796 : SNP	t	c	0.0578	0.0070	0.0374	0.0611	-0.0323	0.0192	0.09326	--??-	0.0	1.154	2	0.5617
7 : 34754183 : SNP	t	c	0.0256	0.0000	0.0256	0.0256	-0.0020	0.0425	0.9624	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 683594 : SNP	a	g	0.1782	0.0050	0.1750	0.1859	-0.0686	0.0331	0.03813	???--	0.0	0.020	1	0.8875
15 : 38024837 : SNP	a	t	0.9377	0.0067	0.9334	0.9577	0.0150	0.0191	0.4329	-+??-	49.0	3.925	2	0.1405
16 : 11242522 : SNP	a	g	0.0917	0.0066	0.0641	0.0953	0.0264	0.0154	0.08575	++?--	0.0	1.233	3	0.7452
14 : 38322929 : SNP	a	g	0.0528	0.0001	0.0527	0.0530	-0.0211	0.0202	0.2962	--??+	42.7	3.491	2	0.1746
14 : 41151032 : SNP	t	c	0.8830	0.0054	0.8622	0.8856	0.0199	0.0134	0.1369	+++++	0.0	0.918	4	0.922
15 : 86627338 : SNP	t	c	0.0179	0.0000	0.0179	0.0179	0.0260	0.0455	0.5676	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 156411647 : SNP	a	g	0.5276	0.0153	0.4935	0.5401	0.0053	0.0085	0.5332	-++-+	43.2	7.045	4	0.1335
2 : 98843446 : SNP	t	c	0.1403	0.0066	0.1112	0.1530	0.0203	0.0130	0.1182	+++++	0.0	0.866	4	0.9294
6 : 113706244 : SNP	a	c	0.1108	0.0096	0.0888	0.1182	-0.0314	0.0139	0.02437	-----	0.0	0.209	4	0.9949
6 : 106333604 : SNP	a	t	0.9448	0.0059	0.9321	0.9505	0.0115	0.0202	0.5685	-+??+	0.0	1.759	2	0.4151
8 : 122829941 : SNP	t	g	0.8098	0.0108	0.7989	0.8307	-0.0069	0.0111	0.5348	-+--+	0.0	3.423	4	0.4897
4 : 7498659 : SNP	t	c	0.0193	0.0000	0.0193	0.0193	0.0110	0.0536	0.8373	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 174656837 : SNP	a	g	0.1401	0.0060	0.1253	0.1433	-0.0068	0.0123	0.5829	+-+-+	0.0	3.337	4	0.5031
5 : 145850459 : INDEL	i	r	0.6423	0.0057	0.6357	0.6601	0.0014	0.0090	0.8781	--+++	0.0	3.986	4	0.4079
6 : 65997914 : SNP	a	g	0.5943	0.0152	0.5839	0.6266	0.0035	0.0086	0.6837	+----	28.0	5.557	4	0.2347
9 : 4474334 : SNP	t	c	0.0153	0.0000	0.0153	0.0153	0.0080	0.0526	0.879	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 39031842 : SNP	t	c	0.6580	0.0122	0.6151	0.6817	-0.0157	0.0091	0.08528	--+--	0.0	2.068	4	0.7232
4 : 134444611 : SNP	a	c	0.4967	0.0154	0.4760	0.5220	0.0061	0.0085	0.4776	-+--+	38.5	6.509	4	0.1642
5 : 67135226 : SNP	a	g	0.9382	0.0041	0.9298	0.9428	0.0175	0.0188	0.3507	++?+-	0.0	1.125	3	0.7711
6 : 16818805 : SNP	t	c	0.3119	0.0223	0.2991	0.3584	0.0088	0.0093	0.34	++--+	0.0	2.088	4	0.7197
9 : 105121165 : SNP	a	g	0.0530	0.0060	0.0475	0.0648	-0.0184	0.0196	0.3485	+-?--	31.8	4.401	3	0.2212
11 : 5419669 : SNP	a	g	0.1058	0.0035	0.0878	0.1086	0.0082	0.0141	0.5619	++++-	0.0	1.683	4	0.7938
11 : 115070814 : SNP	a	g	0.9514	0.0095	0.9341	0.9608	0.0264	0.0213	0.2147	++??+	0.0	1.448	2	0.4848
11 : 54947496 : SNP	a	g	0.2402	0.0000	0.2402	0.2402	-0.0626	0.0652	0.3371	??-??	0.0	0.000	0	1
13 : 85947423 : SNP	a	t	0.0518	0.0000	0.0518	0.0518	0.0480	0.0334	0.1502	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 4401627 : SNP	a	g	0.5221	0.0147	0.4911	0.5534	-0.0124	0.0085	0.1455	--++-	0.0	3.399	4	0.4933
2 : 133924702 : SNP	t	c	0.1279	0.0095	0.1138	0.1401	0.0110	0.0130	0.3964	+--++	0.0	2.169	4	0.7047
6 : 25712163 : SNP	t	c	0.9706	0.0009	0.9699	0.9717	-0.0283	0.0300	0.3447	-+???	90.2	10.249	1	0.001367
7 : 17558465 : SNP	a	c	0.8833	0.0102	0.8727	0.9191	-0.0209	0.0133	0.1142	----+	65.5	11.601	4	0.02058
16 : 85415465 : SNP	c	g	0.1243	0.0057	0.1118	0.1348	-0.0078	0.0128	0.5444	-----	0.0	0.150	4	0.9973
7 : 71349229 : SNP	a	c	0.0680	0.0059	0.0552	0.0726	0.0055	0.0174	0.7532	--??+	5.1	2.107	2	0.3488
11 : 123720075 : SNP	t	g	0.4709	0.0099	0.4614	0.4905	-0.0008	0.0085	0.9275	-++-+	10.3	4.458	4	0.3476
1 : 219820549 : SNP	a	g	0.0446	0.0100	0.0385	0.0714	-0.0203	0.0220	0.3545	+-?--	0.0	2.026	3	0.5671
13 : 48423539 : SNP	a	g	0.0360	0.0118	0.0276	0.0551	-0.0253	0.0245	0.3007	0-?--	0.0	1.073	3	0.7837
6 : 107637486 : SNP	t	c	0.2073	0.0148	0.1777	0.2247	-0.0068	0.0106	0.5172	-+++-	30.4	5.744	4	0.2191
8 : 14773785 : SNP	t	c	0.0794	0.0121	0.0685	0.1008	-0.0005	0.0165	0.9749	-+?-+	24.5	3.975	3	0.2642
4 : 110534793 : SNP	t	c	0.3106	0.0063	0.2964	0.3195	0.0019	0.0097	0.8481	+-++-	0.0	2.443	4	0.6548
1 : 87213181 : INDEL	d	r	0.1962	0.0090	0.1898	0.2202	-0.0230	0.0108	0.03215	--++-	0.0	1.808	4	0.771
14 : 29081039 : SNP	a	t	0.6804	0.0140	0.6524	0.6903	-0.0012	0.0091	0.8962	+--++	0.0	1.076	4	0.898
6 : 140776223 : SNP	a	g	0.9247	0.0052	0.9195	0.9315	-0.0089	0.0190	0.639	+-?--	0.0	0.448	3	0.9302
18 : 37055677 : SNP	a	g	0.4709	0.0157	0.4516	0.5123	0.0044	0.0085	0.6091	++-++	0.0	1.406	4	0.8431
3 : 110809027 : SNP	a	c	0.9096	0.0052	0.9060	0.9179	-0.0327	0.0213	0.1252	-??+-	0.0	0.814	2	0.6658
3 : 194612501 : SNP	a	g	0.8809	0.0157	0.8740	0.9394	0.0179	0.0133	0.178	+-+++	0.0	2.704	4	0.6086
4 : 96711284 : SNP	t	c	0.8559	0.0032	0.8476	0.8604	0.0130	0.0121	0.2802	+++--	0.0	1.883	4	0.7573
6 : 95638152 : SNP	a	g	0.0307	0.0000	0.0307	0.0307	-0.0240	0.0566	0.6716	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 32481855 : SNP	a	g	0.0877	0.0084	0.0668	0.0940	-0.0238	0.0158	0.1314	--?+-	0.0	2.709	3	0.4388
6 : 98145304 : SNP	t	g	0.8133	0.0092	0.7925	0.8201	0.0037	0.0112	0.7378	++-++	0.0	1.460	4	0.8337
4 : 138710270 : SNP	a	g	0.3031	0.0113	0.2914	0.3270	0.0013	0.0095	0.8879	+-+-+	40.1	6.679	4	0.1539
15 : 63451858 : SNP	t	g	0.4512	0.0134	0.4337	0.4796	0.0056	0.0089	0.5245	-+--+	67.0	12.120	4	0.01648
21 : 32983357 : INDEL	d	r	0.1640	0.0072	0.1462	0.1900	-0.0013	0.0120	0.912	-++--	0.0	0.634	4	0.9592
3 : 81850942 : SNP	a	g	0.5512	0.0113	0.5222	0.5631	-0.0050	0.0085	0.5527	+----	0.0	3.740	4	0.4423
5 : 167680554 : SNP	t	c	0.0380	0.0000	0.0380	0.0380	-0.0330	0.0404	0.4144	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 84253821 : SNP	t	c	0.7354	0.0041	0.7179	0.7376	-0.0106	0.0098	0.2799	+--+-	0.0	3.111	4	0.5393
5 : 9876279 : SNP	t	c	0.9341	0.0092	0.9195	0.9404	0.0024	0.0258	0.9245	-??+-	0.0	1.703	2	0.4267
2 : 120805550 : SNP	t	c	0.6956	0.0176	0.6782	0.7187	-0.0056	0.0111	0.6147	+-+--	41.2	6.803	4	0.1467
8 : 135896754 : SNP	t	c	0.5389	0.0116	0.5302	0.5652	-0.0020	0.0086	0.8166	-+-++	0.0	0.953	4	0.9168
1 : 19470662 : SNP	t	c	0.9380	0.0032	0.9257	0.9398	-0.0307	0.0188	0.1032	--?-+	37.9	4.833	3	0.1844
1 : 106640119 : SNP	a	g	0.8776	0.0046	0.8613	0.8809	-0.0164	0.0134	0.2197	---++	15.8	4.753	4	0.3136
8 : 107562416 : SNP	t	c	0.6846	0.0045	0.6706	0.6905	-0.0082	0.0091	0.3703	----+	0.0	1.006	4	0.9089
3 : 52659079 : SNP	t	c	0.9064	0.0066	0.8924	0.9115	-0.0093	0.0146	0.5213	--+++	0.0	2.833	4	0.5862
7 : 18312637 : SNP	t	c	0.7159	0.0126	0.6834	0.7254	-0.0006	0.0099	0.9498	++-+-	0.0	2.296	4	0.6816
5 : 1354022 : INDEL	d	r	0.4332	0.0104	0.4173	0.4558	-0.0078	0.0092	0.3989	-+++-	0.0	1.479	4	0.8304
10 : 82585675 : SNP	t	c	0.0244	0.0000	0.0244	0.0244	-0.0310	0.0435	0.4757	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 21655590 : SNP	a	g	0.1700	0.0046	0.1549	0.1815	0.0201	0.0113	0.0743	++-++	0.0	3.834	4	0.4289
5 : 1709088 : INDEL	d	r	0.0229	0.0000	0.0229	0.0229	0.0710	0.0475	0.1351	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 171687420 : SNP	t	c	0.1315	0.0117	0.1195	0.1438	-0.0189	0.0188	0.3169	+-?--	34.3	4.563	3	0.2067
7 : 57323065 : SNP	c	g	0.2773	0.0086	0.2544	0.2861	-0.0096	0.0094	0.3051	----+	58.5	9.647	4	0.04682
9 : 26745761 : SNP	t	c	0.0188	0.0000	0.0188	0.0188	0.0110	0.0475	0.8169	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 30488370 : SNP	a	g	0.2049	0.0102	0.1973	0.2346	-0.0031	0.0105	0.7654	++---	22.4	5.157	4	0.2716
5 : 121191166 : SNP	a	g	0.0462	0.0029	0.0388	0.0475	0.0074	0.0240	0.7569	+-??+	0.0	0.188	2	0.9103
6 : 31306106 : SNP	t	c	0.3286	0.0070	0.3143	0.3332	0.0256	0.0192	0.1825	??+-+	0.0	1.492	2	0.4742
1 : 34052272 : SNP	t	c	0.0579	0.0086	0.0473	0.0753	0.0240	0.0228	0.2942	-+?++	26.3	4.068	3	0.2542
12 : 26461924 : SNP	t	c	0.4239	0.0026	0.4170	0.4309	-0.0071	0.0085	0.409	0---+	0.0	2.662	4	0.6159
10 : 125749879 : SNP	t	c	0.1998	0.0026	0.1982	0.2083	-0.0040	0.0113	0.7197	---++	0.0	3.615	4	0.4606
2 : 192087094 : SNP	c	g	0.6214	0.0245	0.5647	0.6449	0.0133	0.0102	0.1925	+++--	76.7	17.146	4	0.001811
8 : 140470489 : SNP	t	c	0.9818	0.0000	0.9818	0.9818	-0.1520	0.0576	0.00834	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 83473621 : INDEL	d	r	0.3010	0.0147	0.2915	0.3265	-0.0117	0.0122	0.3377	+-+--	0.0	3.644	4	0.4564
1 : 104661023 : SNP	a	g	0.0211	0.0107	0.0113	0.0328	0.0708	0.0426	0.09613	+???+	0.0	0.297	1	0.5858
8 : 87290649 : SNP	t	c	0.9557	0.0035	0.9505	0.9580	-0.0125	0.0320	0.6964	+???-	0.0	0.840	1	0.3594
9 : 111362161 : SNP	a	t	0.1178	0.0084	0.1125	0.1492	0.0045	0.0134	0.7357	+---+	43.0	7.017	4	0.135
8 : 139068866 : SNP	c	g	0.0176	0.0000	0.0176	0.0176	-0.0600	0.0637	0.3461	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 73807555 : SNP	a	g	0.6721	0.0149	0.6418	0.6866	-0.0033	0.0092	0.7237	-+-+-	0.0	1.416	4	0.8415
2 : 128747023 : SNP	a	g	0.8979	0.0032	0.8893	0.9021	-0.0034	0.0143	0.8142	++-+-	7.0	4.302	4	0.3667
3 : 190982476 : SNP	t	c	0.7819	0.0135	0.7582	0.8149	-0.0039	0.0102	0.703	--+--	0.0	0.483	4	0.9751
15 : 50208667 : SNP	t	c	0.1593	0.0039	0.1475	0.1661	0.0106	0.0118	0.3702	+---+	38.5	6.507	4	0.1644
14 : 22627848 : SNP	a	g	0.3203	0.0067	0.3114	0.3270	-0.0153	0.0091	0.09329	---+-	0.0	2.949	4	0.5664
12 : 42326051 : SNP	t	c	0.6177	0.0111	0.5988	0.6332	0.0110	0.0091	0.2229	+-+-+	39.1	6.568	4	0.1605
2 : 41261992 : SNP	t	c	0.4586	0.0046	0.4520	0.4716	-0.0049	0.0085	0.5667	0---+	0.0	1.528	4	0.8217
5 : 152428904 : SNP	a	c	0.2443	0.0140	0.1977	0.2582	-0.0061	0.0099	0.5351	--+--	0.0	2.031	4	0.7301
11 : 126054854 : SNP	t	c	0.0522	0.0018	0.0477	0.0532	-0.0596	0.0205	0.003676	--??-	0.0	1.981	2	0.3714
16 : 84773460 : SNP	a	g	0.7932	0.0046	0.7901	0.8113	-0.0034	0.0106	0.7448	+--++	36.9	6.336	4	0.1754
8 : 121261289 : SNP	t	c	0.1694	0.0116	0.1463	0.1818	0.0037	0.0119	0.7544	-+-++	0.0	0.994	4	0.9106
2 : 219669488 : SNP	a	t	0.4956	0.0042	0.4911	0.5070	-0.0025	0.0085	0.7722	+-+--	3.5	4.145	4	0.3868
7 : 14278127 : INDEL	d	r	0.0688	0.0039	0.0643	0.0722	0.0160	0.0236	0.4999	-+???	0.0	0.849	1	0.3568
7 : 113471181 : SNP	a	g	0.4447	0.0133	0.4272	0.4571	-0.0019	0.0087	0.8292	--+++	58.7	9.685	4	0.04608
4 : 68907206 : SNP	a	g	0.5544	0.0147	0.5320	0.5767	-0.0087	0.0114	0.4446	--+-+	0.0	1.110	4	0.8926
1 : 113688008 : SNP	a	t	0.8412	0.0078	0.8310	0.8524	-0.0136	0.0115	0.2389	---++	0.0	0.996	4	0.9104
14 : 46388509 : SNP	t	g	0.4636	0.0157	0.4518	0.5004	0.0117	0.0085	0.1695	++-+-	25.3	5.352	4	0.253
13 : 30291893 : SNP	a	g	0.6356	0.0037	0.6304	0.6416	0.0002	0.0086	0.9786	++-+-	0.0	0.400	4	0.9825
5 : 113237185 : SNP	a	t	0.0212	0.0000	0.0212	0.0212	0.0290	0.0516	0.5738	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 50895861 : INDEL	d	r	0.0311	0.0000	0.0311	0.0311	-0.0740	0.0455	0.1038	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 38405375 : SNP	a	g	0.9452	0.0033	0.9362	0.9484	0.0193	0.0190	0.3097	-+?-+	10.8	3.363	3	0.339
1 : 236184931 : SNP	t	c	0.5235	0.0224	0.5025	0.5705	-0.0037	0.0085	0.6631	-+---	21.4	5.091	4	0.2781
18 : 27157104 : SNP	c	g	0.1612	0.0070	0.1500	0.1707	0.0073	0.0114	0.5261	0+-++	22.7	5.177	4	0.2696
7 : 31804088 : SNP	t	c	0.8297	0.0099	0.8212	0.8585	-0.0060	0.0115	0.6002	++---	58.1	9.553	4	0.04867
1 : 214693346 : SNP	a	g	0.8888	0.0104	0.8693	0.9075	0.0075	0.0140	0.5906	-+++-	0.0	2.651	4	0.6179
6 : 20948086 : SNP	t	c	0.0732	0.0045	0.0664	0.0795	-0.0012	0.0169	0.9414	++?--	21.2	3.809	3	0.2829
13 : 84795239 : SNP	a	g	0.9805	0.0000	0.9805	0.9805	-0.0440	0.0445	0.3225	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 62206487 : SNP	t	c	0.1686	0.0124	0.1602	0.1945	-0.0101	0.0119	0.3969	-+--+	0.0	3.494	4	0.4788
7 : 28990851 : SNP	a	g	0.1725	0.0106	0.1625	0.1934	0.0156	0.0114	0.1701	-++++	4.1	4.172	4	0.3832
4 : 84525423 : SNP	t	c	0.3974	0.0304	0.3281	0.4157	-0.0070	0.0086	0.4144	-+--+	0.0	3.256	4	0.5159
12 : 93926684 : SNP	t	c	0.1587	0.0080	0.1326	0.1675	-0.0140	0.0124	0.2576	---+-	23.6	5.237	4	0.2638
3 : 42588598 : SNP	c	g	0.3346	0.0069	0.3218	0.3548	0.0057	0.0091	0.5348	+-+-+	32.9	5.964	4	0.2019
9 : 91562847 : SNP	a	c	0.5437	0.0151	0.5101	0.5625	-0.0082	0.0085	0.3334	+-+--	49.3	7.896	4	0.09547
8 : 3059937 : SNP	t	c	0.0129	0.0000	0.0129	0.0129	-0.0090	0.0546	0.869	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 99275356 : SNP	t	c	0.8393	0.0205	0.7734	0.8560	-0.0140	0.0119	0.2383	-+++-	0.0	2.512	4	0.6426
5 : 164561180 : SNP	t	c	0.0872	0.0028	0.0832	0.0920	-0.0359	0.0150	0.01687	--+--	0.0	3.078	4	0.5449
9 : 24716652 : SNP	a	t	0.9705	0.0000	0.9705	0.9705	0.0740	0.0475	0.1193	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 10221419 : SNP	t	c	0.8947	0.0076	0.8885	0.9122	-0.0031	0.0138	0.8241	+--++	35.7	6.223	4	0.1831
1 : 219497096 : SNP	t	c	0.2207	0.0047	0.2021	0.2249	0.0140	0.0104	0.1785	+-++-	51.6	8.261	4	0.08248
4 : 182370822 : SNP	t	c	0.1134	0.0065	0.1068	0.1295	0.0040	0.0135	0.7668	+-+--	0.0	3.106	4	0.5403
13 : 106847972 : SNP	t	c	0.0491	0.0010	0.0484	0.0506	0.0363	0.0347	0.2962	+???+	0.0	0.168	1	0.682
15 : 31950758 : SNP	t	c	0.2244	0.0083	0.2193	0.2453	0.0233	0.0109	0.03346	+++++	0.0	1.991	4	0.7374
10 : 49709344 : SNP	t	c	0.9815	0.0000	0.9815	0.9815	0.0360	0.0505	0.4763	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 25963422 : SNP	a	c	0.6941	0.0074	0.6887	0.7095	-0.0128	0.0092	0.1657	-+-+-	0.0	3.527	4	0.4738
17 : 5301164 : INDEL	i	r	0.3754	0.0050	0.3707	0.3860	0.0050	0.0087	0.5624	+-++-	0.0	3.000	4	0.5578
13 : 45906094 : INDEL	d	r	0.1021	0.0050	0.0941	0.1066	-0.0026	0.0138	0.8488	+-+-+	72.1	14.327	4	0.006321
8 : 72757463 : SNP	t	c	0.9748	0.0000	0.9748	0.9748	-0.0080	0.0465	0.8634	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 50097890 : SNP	t	c	0.0400	0.0049	0.0334	0.0465	0.0061	0.0233	0.7944	-+??+	68.8	6.420	2	0.04036
2 : 85546615 : SNP	t	c	0.5305	0.0191	0.5134	0.5688	-0.0009	0.0086	0.9184	-+--+	55.8	9.043	4	0.06004
3 : 66795749 : SNP	t	c	0.0369	0.0032	0.0336	0.0403	-0.0294	0.0248	0.2362	--??+	36.9	3.168	2	0.2052
13 : 57679667 : SNP	t	c	0.8373	0.0188	0.8150	0.8909	0.0043	0.0116	0.7109	0++--	20.4	5.023	4	0.2849
2 : 8424214 : SNP	a	g	0.0747	0.0033	0.0700	0.0776	-0.0282	0.0235	0.2305	--?+-	0.0	1.172	3	0.7597
3 : 13127316 : SNP	a	t	0.0871	0.0103	0.0756	0.1176	0.0009	0.0153	0.9513	+++-+	0.0	2.562	4	0.6336
12 : 25663977 : SNP	t	g	0.8327	0.0043	0.8295	0.8427	0.0054	0.0115	0.6387	--+++	0.0	2.228	4	0.6939
6 : 64637615 : SNP	a	g	0.9640	0.0000	0.9640	0.9640	0.0040	0.0414	0.9231	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 25343340 : SNP	c	g	0.9406	0.0024	0.9362	0.9435	-0.0049	0.0192	0.7992	--??+	0.0	1.170	2	0.5572
12 : 40420783 : SNP	a	g	0.3274	0.0071	0.3096	0.3339	0.0255	0.0092	0.005414	+++-+	0.0	2.139	4	0.7101
6 : 100218928 : SNP	t	c	0.2359	0.0056	0.2090	0.2412	0.0011	0.0100	0.911	+-+--	0.0	2.309	4	0.6792
6 : 67076259 : INDEL	i	r	0.2335	0.0064	0.2193	0.2393	0.0024	0.0101	0.8131	+----	2.2	4.089	4	0.3941
4 : 4644995 : SNP	t	c	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	0.0140	0.0516	0.786	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 84580763 : SNP	a	c	0.6509	0.0075	0.6339	0.6578	0.0065	0.0091	0.4745	-++-+	0.0	3.800	4	0.4338
11 : 102112231 : INDEL	d	r	0.3344	0.0101	0.3276	0.3588	-0.0085	0.0097	0.3774	-++--	0.0	2.192	4	0.7006
4 : 179449275 : SNP	a	g	0.2133	0.0099	0.1922	0.2356	0.0000	0.0110	0.9986	-0-++	54.6	8.812	4	0.06599
12 : 125756179 : SNP	t	c	0.8755	0.0090	0.8678	0.8934	-0.0037	0.0131	0.7782	++-+-	55.2	8.923	4	0.06306
3 : 132809066 : SNP	t	g	0.2697	0.0151	0.2373	0.2801	0.0041	0.0098	0.6753	+-++-	37.4	6.388	4	0.172
11 : 9528748 : INDEL	d	r	0.0237	0.0000	0.0237	0.0237	-0.0360	0.0404	0.3733	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 216654264 : SNP	a	g	0.1144	0.0055	0.0994	0.1230	-0.0104	0.0140	0.4548	---++	0.0	0.819	4	0.9358
5 : 81929218 : SNP	a	c	0.2713	0.0084	0.2526	0.2810	-0.0006	0.0098	0.9508	+-+++	0.0	3.009	4	0.5563
10 : 65427013 : SNP	c	g	0.0295	0.0013	0.0277	0.0305	0.0068	0.0285	0.81	-+???	0.0	0.220	1	0.6388
10 : 68143052 : SNP	a	c	0.0219	0.0000	0.0219	0.0219	-0.0610	0.0414	0.1411	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 8011603 : SNP	a	t	0.1963	0.0210	0.1829	0.2412	-0.0193	0.0111	0.08044	--+--	32.8	5.953	4	0.2027
5 : 130414506 : INDEL	d	r	0.1590	0.0056	0.1369	0.1617	-0.0170	0.0119	0.1535	--+-+	8.0	4.348	4	0.361
6 : 33840657 : SNP	a	g	0.4416	0.0094	0.4269	0.4723	-0.0052	0.0085	0.5426	--+++	33.6	6.024	4	0.1974
1 : 92286116 : SNP	a	g	0.0290	0.0000	0.0290	0.0290	0.0600	0.0526	0.2537	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 75441762 : SNP	t	c	0.6542	0.0214	0.6378	0.6989	-0.0026	0.0099	0.7907	+--+-	0.0	2.051	4	0.7263
14 : 40334935 : SNP	a	g	0.8079	0.0049	0.8038	0.8217	0.0107	0.0117	0.3625	0++++	0.0	2.862	4	0.5813
6 : 72016702 : SNP	t	c	0.0146	0.0000	0.0146	0.0146	0.0620	0.0495	0.2107	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 86277086 : SNP	a	g	0.3328	0.0042	0.3150	0.3378	-0.0012	0.0091	0.8987	-++-+	0.0	0.611	4	0.9618
4 : 139698493 : SNP	a	g	0.2189	0.0062	0.1913	0.2281	-0.0055	0.0106	0.6023	0---+	0.0	2.043	4	0.7279
5 : 16651220 : SNP	t	c	0.3707	0.0135	0.3338	0.3830	-0.0085	0.0092	0.3554	--+++	53.9	8.675	4	0.06976
14 : 62213553 : SNP	t	g	0.1463	0.0141	0.1359	0.1743	0.0094	0.0126	0.4566	++-+-	0.0	3.349	4	0.5012
7 : 108866578 : SNP	t	g	0.1449	0.0053	0.1408	0.1561	0.0149	0.0119	0.2106	++-+-	0.0	2.987	4	0.56
1 : 75252327 : SNP	t	c	0.8766	0.0080	0.8724	0.8985	0.0187	0.0130	0.1498	+++++	0.0	1.408	4	0.8429
13 : 31174925 : SNP	t	c	0.5449	0.0329	0.4805	0.5725	-0.0011	0.0089	0.905	0--+-	0.0	3.120	4	0.5379
11 : 32680328 : SNP	a	g	0.2571	0.0113	0.2398	0.2735	-0.0097	0.0099	0.3238	-----	0.0	0.390	4	0.9833
15 : 25168225 : SNP	c	g	0.0907	0.0122	0.0737	0.0997	-0.0033	0.0210	0.876	+-?-+	0.0	2.747	3	0.4323
4 : 111963719 : SNP	t	c	0.2204	0.0151	0.1971	0.2467	-0.0080	0.0141	0.5702	+-+--	52.6	8.437	4	0.07683
5 : 136026751 : SNP	a	g	0.0155	0.0000	0.0155	0.0155	0.0130	0.0526	0.8047	+????	0.0	0.000	0	1
22 : 25660146 : SNP	a	c	0.1273	0.0136	0.1199	0.1522	-0.0081	0.0291	0.7801	??+--	0.0	1.815	2	0.4036
4 : 67895421 : SNP	t	c	0.4326	0.0108	0.4234	0.4580	-0.0234	0.0085	0.006135	--+--	0.0	3.687	4	0.4501
4 : 31424398 : SNP	a	c	0.8108	0.0172	0.7864	0.8293	0.0105	0.0110	0.3387	+-+++	0.0	1.978	4	0.7399
14 : 77139211 : SNP	a	g	0.2967	0.0081	0.2800	0.3015	0.0084	0.0094	0.3673	-+-++	31.3	5.825	4	0.2126
17 : 72411462 : SNP	a	g	0.0486	0.0000	0.0486	0.0486	0.0860	0.0516	0.09529	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 29913817 : SNP	c	g	0.1019	0.0086	0.0903	0.1216	0.0064	0.0142	0.65	+++--	0.0	1.787	4	0.7748
2 : 63892727 : SNP	a	g	0.2795	0.0067	0.2708	0.2914	-0.0037	0.0094	0.6957	+-+--	0.0	3.399	4	0.4934
1 : 81678295 : SNP	t	g	0.2631	0.0057	0.2528	0.2811	0.0010	0.0097	0.9172	+-++-	21.4	5.088	4	0.2784
5 : 123194339 : INDEL	d	r	0.3092	0.0112	0.2885	0.3169	0.0113	0.0128	0.3787	+-+-+	0.0	2.768	4	0.5974
5 : 66593166 : SNP	a	g	0.8714	0.0072	0.8586	0.8836	-0.0109	0.0134	0.4145	--+-+	0.0	2.099	4	0.7176
4 : 86282194 : SNP	a	g	0.9699	0.0024	0.9657	0.9728	-0.0379	0.0265	0.152	--??+	0.0	0.622	2	0.7327
1 : 211943384 : SNP	a	t	0.0577	0.0067	0.0520	0.0720	-0.0009	0.0197	0.963	++?+-	0.0	2.491	3	0.4769
3 : 15130860 : SNP	c	g	0.0430	0.0019	0.0391	0.0451	-0.0255	0.0222	0.2509	--??+	2.9	2.059	2	0.3572
9 : 128445758 : SNP	a	c	0.6032	0.0106	0.5887	0.6284	0.0067	0.0086	0.4306	+++-+	0.0	2.917	4	0.5718
8 : 28365541 : SNP	t	g	0.4363	0.0106	0.4197	0.4589	0.0056	0.0085	0.5076	-++-+	0.0	2.567	4	0.6326
1 : 234030378 : INDEL	d	r	0.1080	0.0074	0.0865	0.1118	0.0115	0.0144	0.4253	++-+-	0.0	3.027	4	0.5534
15 : 79221356 : SNP	c	g	0.0957	0.0004	0.0952	0.0968	-0.0002	0.0162	0.9905	--?+?	0.0	0.162	2	0.9222
22 : 36575026 : SNP	t	c	0.7592	0.0059	0.7549	0.7797	0.0063	0.0100	0.531	+---+	37.8	6.428	4	0.1694
20 : 32549278 : SNP	a	g	0.3465	0.0259	0.3005	0.3694	0.0001	0.0094	0.9921	-+-++	0.0	2.649	4	0.6182
11 : 5963033 : SNP	a	g	0.0273	0.0000	0.0273	0.0273	-0.0260	0.0384	0.4985	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 212677804 : SNP	a	t	0.3246	0.0096	0.2984	0.3330	0.0129	0.0091	0.1594	++-++	0.0	1.336	4	0.8552
2 : 124287183 : SNP	t	g	0.6834	0.0179	0.6425	0.6951	0.0149	0.0096	0.1227	+++++	0.0	3.151	4	0.5329
3 : 6566412 : SNP	c	g	0.9887	0.0000	0.9887	0.9887	0.1120	0.0637	0.07863	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 102664143 : SNP	a	g	0.9770	0.0000	0.9770	0.9770	-0.0250	0.0414	0.5464	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 36946916 : INDEL	d	r	0.0570	0.0045	0.0447	0.0603	0.0105	0.0194	0.5879	++??+	0.0	0.032	2	0.9841
5 : 44126359 : SNP	a	g	0.8604	0.0111	0.8314	0.8789	0.0084	0.0124	0.4969	+-+++	0.0	1.528	4	0.8216
12 : 6505529 : SNP	t	g	0.9430	0.0107	0.9290	0.9511	-0.0677	0.0402	0.09217	-???-	0.0	0.299	1	0.5848
2 : 165698893 : INDEL	i	r	0.1941	0.0082	0.1827	0.2106	-0.0135	0.0107	0.2098	-+-+-	0.0	3.233	4	0.5196
10 : 52958802 : SNP	t	c	0.0215	0.0000	0.0215	0.0215	-0.0290	0.0425	0.4946	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 61409064 : SNP	t	c	0.8212	0.0127	0.8007	0.8602	-0.0138	0.0114	0.227	-----	0.0	0.350	4	0.9864
18 : 43670051 : INDEL	i	r	0.0571	0.0085	0.0511	0.0715	-0.0019	0.0225	0.934	--?++	53.1	6.398	3	0.09377
13 : 70431801 : SNP	t	c	0.7266	0.0033	0.7179	0.7354	-0.0008	0.0098	0.934	++---	32.0	5.883	4	0.208
4 : 189595333 : SNP	a	g	0.8507	0.0053	0.8466	0.8705	0.0005	0.0122	0.9678	+-+--	0.0	3.070	4	0.5461
8 : 14931864 : SNP	c	g	0.0716	0.0064	0.0601	0.0864	0.0114	0.0168	0.4988	+-+-+	0.0	2.104	4	0.7167
6 : 100213247 : SNP	a	c	0.9197	0.0067	0.9129	0.9347	-0.0077	0.0162	0.6358	--?++	23.5	3.923	3	0.2699
19 : 18168380 : SNP	c	g	0.3834	0.0324	0.3121	0.4134	-0.0064	0.0092	0.4824	---++	0.0	3.282	4	0.5118
13 : 70940192 : SNP	a	g	0.3601	0.0127	0.3317	0.3822	-0.0083	0.0103	0.4192	--++-	0.0	2.971	4	0.5627
2 : 181263999 : SNP	a	t	0.2689	0.0069	0.2519	0.2763	0.0026	0.0098	0.7874	+--++	13.6	4.630	4	0.3274
20 : 9658518 : SNP	c	g	0.1818	0.0099	0.1622	0.1888	-0.0008	0.0114	0.9427	--+++	56.9	9.284	4	0.05439
1 : 159557521 : SNP	a	g	0.7967	0.0068	0.7928	0.8112	0.0122	0.0107	0.2537	++--+	0.0	1.635	4	0.8024
9 : 13587830 : SNP	c	g	0.0766	0.0052	0.0712	0.0823	0.0146	0.0167	0.3837	+-?++	0.0	1.115	3	0.7735
20 : 17815796 : SNP	a	g	0.0999	0.0046	0.0929	0.1150	0.0034	0.0143	0.8115	+-++-	0.0	2.160	4	0.7063
16 : 23006790 : SNP	a	g	0.3873	0.0140	0.3549	0.3963	-0.0022	0.0086	0.7981	--+++	25.8	5.387	4	0.2498
1 : 181823417 : SNP	t	c	0.0381	0.0066	0.0269	0.0427	0.0404	0.0242	0.09482	+-??+	31.5	2.920	2	0.2322
15 : 61697639 : SNP	a	g	0.9678	0.0000	0.9678	0.9678	-0.0330	0.0536	0.5379	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 115737534 : SNP	c	g	0.5009	0.0168	0.4898	0.5392	0.0073	0.0101	0.4709	++-+-	0.0	3.913	4	0.4178
8 : 9924517 : SNP	c	g	0.1746	0.0070	0.1657	0.1873	-0.0199	0.0114	0.07953	-+--+	32.4	5.915	4	0.2056
8 : 101860496 : SNP	a	g	0.5318	0.0214	0.5142	0.5765	-0.0023	0.0085	0.7875	-+-+-	0.0	2.296	4	0.6815
3 : 73844649 : SNP	t	c	0.1655	0.0056	0.1472	0.1748	-0.0057	0.0113	0.6124	-+-+-	0.0	3.253	4	0.5165
5 : 106209650 : SNP	t	c	0.0118	0.0000	0.0118	0.0118	0.0110	0.0576	0.8486	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 121412352 : SNP	t	c	0.0179	0.0000	0.0179	0.0179	-0.0280	0.0627	0.655	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 50958027 : SNP	a	c	0.0968	0.0079	0.0890	0.1094	0.0158	0.0143	0.2711	+-+-+	30.8	5.780	4	0.2162
6 : 137633929 : SNP	c	g	0.5665	0.0098	0.5255	0.5779	0.0061	0.0086	0.477	+----	61.5	10.387	4	0.03438
6 : 88516948 : SNP	a	g	0.6178	0.0229	0.5928	0.6687	0.0004	0.0092	0.9639	-+--+	41.2	6.804	4	0.1466
7 : 101902180 : SNP	t	c	0.9315	0.0084	0.9070	0.9384	-0.0149	0.0174	0.3898	--?++	0.0	1.665	3	0.6447
2 : 28866032 : SNP	a	c	0.6925	0.0081	0.6763	0.7023	0.0059	0.0091	0.5208	++-++	55.1	8.916	4	0.06324
8 : 83343555 : SNP	t	c	0.0622	0.0070	0.0528	0.0682	-0.0108	0.0204	0.5965	--??+	0.0	1.422	2	0.4911
10 : 60060001 : INDEL	i	r	0.1004	0.0080	0.0830	0.1077	0.0076	0.0141	0.5891	-+--+	0.0	2.268	4	0.6865
9 : 120364851 : SNP	a	g	0.5608	0.0137	0.5269	0.5729	0.0120	0.0085	0.16	+++--	43.0	7.018	4	0.1349
2 : 36879714 : SNP	a	c	0.6883	0.0115	0.6799	0.7142	-0.0211	0.0092	0.02203	-----	0.0	1.296	4	0.862
13 : 82084083 : SNP	c	g	0.8792	0.0086	0.8653	0.8939	0.0143	0.0132	0.281	+++-+	0.0	1.007	4	0.9088
7 : 63200732 : SNP	t	g	0.4966	0.0056	0.4907	0.5096	-0.0191	0.0215	0.3746	??---	0.0	0.656	2	0.7202
3 : 13409555 : SNP	t	c	0.0192	0.0000	0.0192	0.0192	0.1020	0.0455	0.02494	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 132562290 : SNP	a	g	0.2749	0.0240	0.2304	0.2894	0.0085	0.0116	0.4625	++-++	46.9	7.537	4	0.1101
13 : 98599119 : SNP	t	g	0.9177	0.0045	0.9149	0.9251	0.0162	0.0320	0.6115	-???+	75.5	4.075	1	0.04353
17 : 80893028 : SNP	a	c	0.4808	0.0296	0.4208	0.5063	0.0128	0.0091	0.161	+++--	62.7	10.737	4	0.02968
17 : 41904409 : SNP	a	g	0.8013	0.0093	0.7858	0.8153	-0.0058	0.0111	0.6025	--+++	0.0	3.294	4	0.5098
21 : 20835928 : SNP	c	g	0.1341	0.0049	0.1290	0.1515	0.0284	0.0127	0.02494	++-++	12.3	4.563	4	0.3352
11 : 69580691 : SNP	t	c	0.3165	0.0240	0.2760	0.3442	0.0186	0.0112	0.09721	+++-+	11.1	4.499	4	0.3427
14 : 101460715 : SNP	t	c	0.0127	0.0000	0.0127	0.0127	-0.0470	0.0617	0.4459	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 3982628 : SNP	c	g	0.1797	0.0097	0.1563	0.1980	-0.0003	0.0108	0.9774	--+-+	8.5	4.372	4	0.358
8 : 5490537 : SNP	t	c	0.6988	0.0100	0.6875	0.7179	-0.0023	0.0097	0.8146	----+	0.0	1.185	4	0.8806
10 : 56218783 : SNP	a	g	0.0207	0.0000	0.0207	0.0207	0.0610	0.0425	0.1508	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 179062458 : SNP	c	g	0.2333	0.0042	0.2265	0.2445	0.0153	0.0100	0.1242	+++-+	14.0	4.654	4	0.3247
13 : 89166008 : SNP	t	c	0.0633	0.0020	0.0594	0.0649	-0.0058	0.0188	0.7555	-+??-	0.0	0.174	2	0.9168
8 : 116569127 : SNP	a	g	0.9808	0.0000	0.9808	0.9808	0.0440	0.0485	0.3645	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 191009590 : INDEL	i	r	0.2388	0.0113	0.2135	0.2521	-0.0022	0.0101	0.8289	+0---	0.0	1.865	4	0.7606
3 : 106239222 : SNP	a	c	0.4568	0.0169	0.4391	0.5016	-0.0003	0.0086	0.9723	+-+--	35.3	6.181	4	0.186
9 : 71654044 : SNP	a	c	0.4796	0.0295	0.4213	0.5092	0.0028	0.0091	0.7617	+-+-+	0.0	2.443	4	0.6548
8 : 77889842 : SNP	a	g	0.9541	0.0000	0.9541	0.9541	-0.0190	0.0425	0.6545	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 38051941 : SNP	t	c	0.7819	0.0201	0.7657	0.8283	-0.0056	0.0107	0.6047	-+-+-	0.0	2.317	4	0.6776
11 : 4554848 : INDEL	d	r	0.3167	0.0080	0.3088	0.3310	0.0018	0.0099	0.8527	+--+-	0.0	1.921	4	0.7503
5 : 90337413 : SNP	t	c	0.3786	0.0108	0.3718	0.4018	-0.0096	0.0089	0.2805	---+-	0.0	3.819	4	0.431
1 : 215887398 : SNP	t	c	0.8567	0.0065	0.8462	0.8660	0.0258	0.0121	0.03369	+++++	0.0	0.919	4	0.9218
5 : 55627534 : SNP	c	g	0.5884	0.0226	0.5632	0.6371	0.0033	0.0090	0.7101	+-++-	0.0	2.361	4	0.6697
22 : 37442126 : INDEL	d	r	0.0238	0.0000	0.0238	0.0238	-0.0420	0.0425	0.3225	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 31378949 : SNP	a	g	0.3926	0.0146	0.3735	0.4170	-0.0027	0.0087	0.7521	-+++-	0.0	1.133	4	0.889
10 : 80541125 : SNP	a	g	0.9708	0.0055	0.9623	0.9744	0.0555	0.0338	0.1007	+???+	0.0	0.185	1	0.6668
17 : 53057747 : SNP	t	c	0.2782	0.0102	0.2544	0.2871	0.0125	0.0094	0.1855	+++++	0.0	2.337	4	0.6741
4 : 144293524 : SNP	a	g	0.4454	0.0049	0.4409	0.4580	-0.0033	0.0085	0.6981	++---	51.8	8.304	4	0.08105
9 : 74682100 : SNP	c	g	0.7723	0.0081	0.7645	0.7857	0.0046	0.0101	0.6492	++++-	0.0	3.851	4	0.4265
13 : 48370039 : INDEL	d	r	0.1267	0.0059	0.1125	0.1426	-0.0263	0.0129	0.04037	--+-+	0.0	2.304	4	0.68
14 : 98817301 : SNP	a	g	0.8751	0.0076	0.8688	0.9002	0.0159	0.0146	0.2755	++-++	0.0	1.704	4	0.79
4 : 22606073 : SNP	t	c	0.6976	0.0156	0.6882	0.7434	0.0012	0.0092	0.8945	+-++-	0.0	3.944	4	0.4137
6 : 52843758 : SNP	a	t	0.2044	0.0131	0.1725	0.2248	-0.0073	0.0107	0.4957	--+--	0.0	2.368	4	0.6685
5 : 56211991 : SNP	t	c	0.6203	0.0171	0.5860	0.6345	0.0104	0.0091	0.2512	+++++	0.0	1.769	4	0.7781
16 : 4153524 : SNP	a	g	0.1274	0.0113	0.1154	0.1424	0.0155	0.0129	0.2295	++-+-	0.0	0.938	4	0.919
6 : 30040706 : SNP	c	g	0.1389	0.0072	0.1339	0.1527	0.0016	0.0262	0.9507	??--+	59.8	4.969	2	0.08336
20 : 14321140 : INDEL	i	r	0.0339	0.0016	0.0316	0.0351	-0.0006	0.0270	0.9815	+-???	0.5	1.005	1	0.316
20 : 33720494 : SNP	t	c	0.7703	0.0158	0.7532	0.7870	-0.0081	0.0103	0.4311	-++--	0.0	3.179	4	0.5284
16 : 71278468 : SNP	a	g	0.7426	0.0096	0.7062	0.7615	-0.0189	0.0099	0.05779	---+-	30.0	5.714	4	0.2216
9 : 137882279 : SNP	t	g	0.3536	0.0091	0.3457	0.3746	0.0002	0.0091	0.9846	+-+-+	0.0	2.204	4	0.6984
16 : 24440046 : SNP	a	c	0.5019	0.0097	0.4702	0.5241	0.0113	0.0085	0.186	+-+-+	41.5	6.841	4	0.1446
1 : 247361169 : SNP	a	g	0.8285	0.0085	0.8240	0.8471	-0.0065	0.0114	0.5674	-++--	0.0	3.428	4	0.4889
14 : 105971699 : INDEL	d	r	0.2430	0.0112	0.2329	0.2595	0.0169	0.0107	0.1142	++---	16.5	4.789	4	0.3096
6 : 169229142 : SNP	t	c	0.9649	0.0117	0.9506	0.9745	-0.0357	0.0352	0.3098	-???+	67.1	3.036	1	0.08144
6 : 103118687 : INDEL	d	r	0.2705	0.0145	0.2448	0.2882	0.0014	0.0103	0.8955	+-+-+	32.3	5.907	4	0.2062
6 : 170222391 : SNP	t	c	0.4807	0.0192	0.4624	0.5232	-0.0008	0.0085	0.9294	-+-+-	0.0	1.736	4	0.7841
4 : 29777535 : SNP	t	c	0.2084	0.0236	0.1758	0.2481	-0.0008	0.0126	0.9487	+---+	70.4	13.508	4	0.009041
2 : 232579795 : SNP	t	c	0.7639	0.0071	0.7462	0.7682	-0.0030	0.0098	0.7629	+----	0.0	3.210	4	0.5232
10 : 93397014 : SNP	a	g	0.9394	0.0068	0.9255	0.9463	0.0101	0.0193	0.6004	-+?+-	0.0	2.749	3	0.432
12 : 74049514 : SNP	a	t	0.0709	0.0033	0.0671	0.0819	-0.0055	0.0173	0.7513	++?--	0.0	2.313	3	0.5101
8 : 59369936 : SNP	a	g	0.9726	0.0095	0.9594	0.9794	0.0626	0.0336	0.06259	+???+	0.0	0.049	1	0.8249
11 : 89383738 : INDEL	d	r	0.3606	0.0090	0.3317	0.3674	0.0031	0.0093	0.7359	+++-+	0.0	1.395	4	0.8451
4 : 69159696 : SNP	t	c	0.8200	0.0099	0.8094	0.8377	-0.0048	0.0116	0.6827	--+-+	61.2	10.311	4	0.0355
3 : 184449548 : SNP	t	c	0.4937	0.0032	0.4870	0.4963	0.0044	0.0085	0.6077	+++--	0.0	3.248	4	0.5172
6 : 43958606 : SNP	a	g	0.0366	0.0000	0.0366	0.0366	-0.0200	0.0414	0.6294	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 31045329 : SNP	a	t	0.9613	0.0011	0.9599	0.9621	-0.0050	0.0271	0.8538	-+???	0.0	0.439	1	0.5077
2 : 10170616 : SNP	t	g	0.3452	0.0087	0.3325	0.3645	0.0189	0.0108	0.07959	+++++	0.0	0.461	4	0.9772
4 : 63463020 : SNP	t	g	0.8798	0.0252	0.8367	0.9129	-0.0129	0.0155	0.4059	--+--	0.0	0.539	4	0.9696
13 : 85728203 : SNP	t	c	0.8148	0.0081	0.8051	0.8313	-0.0162	0.0111	0.1434	-----	0.0	1.902	4	0.7537
15 : 58274689 : INDEL	d	r	0.0318	0.0030	0.0276	0.0339	-0.0048	0.0281	0.8636	+-???	0.0	0.492	1	0.4831
3 : 195054032 : SNP	a	g	0.0141	0.0000	0.0141	0.0141	0.0120	0.0536	0.8228	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 104103541 : SNP	a	c	0.8485	0.0051	0.8431	0.8615	-0.0120	0.0120	0.3171	+----	0.0	3.258	4	0.5157
6 : 62052766 : SNP	a	t	0.9538	0.0000	0.9538	0.9538	-0.0190	0.0485	0.6954	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 56476181 : INDEL	i	r	0.3851	0.0219	0.3546	0.4207	0.0009	0.0091	0.9219	-++--	0.0	1.642	4	0.8012
4 : 125746732 : SNP	a	g	0.9590	0.0039	0.9508	0.9611	0.0069	0.0233	0.7665	+-??+	0.0	0.723	2	0.6968
4 : 173357700 : SNP	c	g	0.1230	0.0030	0.1191	0.1298	0.0103	0.0130	0.4275	00-++	26.6	5.452	4	0.2439
7 : 135999560 : SNP	a	t	0.4044	0.0107	0.3855	0.4241	-0.0029	0.0085	0.7372	--+-+	0.0	3.562	4	0.4685
2 : 120456992 : SNP	a	g	0.9680	0.0019	0.9657	0.9696	-0.0261	0.0281	0.3519	-+???	0.0	0.736	1	0.391
16 : 73111661 : SNP	a	c	0.9215	0.0184	0.8849	0.9339	0.0032	0.0218	0.8836	0-?++	0.0	1.285	3	0.7327
1 : 25172643 : INDEL	d	r	0.7011	0.0170	0.6740	0.7246	-0.0058	0.0099	0.5591	-++-+	15.3	4.721	4	0.3171
7 : 95752916 : SNP	a	g	0.0358	0.0013	0.0347	0.0375	0.0276	0.0269	0.3035	++???	0.0	0.404	1	0.5251
8 : 99729835 : SNP	a	t	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	0.0850	0.0637	0.182	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 13317379 : SNP	t	c	0.9563	0.0054	0.9527	0.9657	0.0326	0.0233	0.1606	++??-	38.5	3.254	2	0.1965
7 : 37933640 : SNP	c	g	0.2145	0.0030	0.2060	0.2213	-0.0053	0.0106	0.6208	+----	0.0	2.578	4	0.6307
11 : 8156113 : SNP	a	g	0.0636	0.0035	0.0563	0.0673	-0.0030	0.0178	0.8663	--?++	59.8	7.470	3	0.05834
4 : 86699726 : SNP	a	c	0.6913	0.0060	0.6713	0.6954	-0.0073	0.0092	0.4261	-0+-+	0.0	1.416	4	0.8414
1 : 95557034 : SNP	t	c	0.1852	0.0039	0.1795	0.1897	-0.0034	0.0107	0.7503	-+-+-	30.7	5.768	4	0.2172
12 : 93949146 : INDEL	i	r	0.3280	0.0152	0.3189	0.3703	0.0010	0.0091	0.9122	-+--+	43.0	7.019	4	0.1349
19 : 48981933 : SNP	t	c	0.1268	0.0199	0.0933	0.1432	-0.0100	0.0147	0.4955	--++-	0.0	2.684	4	0.612
4 : 34151493 : SNP	a	t	0.0895	0.0062	0.0843	0.1112	0.0128	0.0153	0.4011	+++--	0.0	1.751	4	0.7814
14 : 57644518 : SNP	a	g	0.0252	0.0000	0.0252	0.0252	-0.0100	0.0435	0.818	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 82456738 : SNP	t	g	0.3573	0.0147	0.3463	0.4061	-0.0137	0.0092	0.1366	--+--	0.0	1.758	4	0.7802
7 : 133836976 : SNP	t	c	0.0980	0.0066	0.0936	0.1121	-0.0008	0.0144	0.9568	+++--	69.7	13.189	4	0.01039
1 : 165239257 : SNP	a	c	0.6044	0.0109	0.5959	0.6217	0.0134	0.0087	0.1219	++-++	0.0	1.235	4	0.8723
7 : 100014711 : SNP	t	c	0.9289	0.0091	0.9184	0.9441	-0.0172	0.0177	0.3311	--?++	37.1	4.772	3	0.1893
10 : 29416538 : SNP	a	g	0.2451	0.0083	0.2261	0.2535	0.0216	0.0099	0.02852	++-+-	0.0	2.519	4	0.6413
3 : 29261257 : SNP	t	c	0.0656	0.0093	0.0550	0.0824	0.0507	0.0178	0.0044	++?++	54.4	6.582	3	0.08648
12 : 131931881 : SNP	t	g	0.9237	0.0107	0.9020	0.9353	0.0172	0.0165	0.2963	++?+-	21.9	3.843	3	0.2789
19 : 29733443 : SNP	t	c	0.0372	0.0072	0.0323	0.0478	-0.0018	0.0335	0.9569	-???+	0.0	0.511	1	0.4747
20 : 3806619 : SNP	c	g	0.0224	0.0000	0.0224	0.0224	-0.0410	0.0475	0.3882	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 40607359 : SNP	a	g	0.8741	0.0183	0.8614	0.9056	0.0082	0.0204	0.687	++-+-	0.0	1.584	4	0.8116
22 : 40732953 : SNP	a	g	0.1780	0.0147	0.1412	0.2025	0.0241	0.0112	0.03156	+++-+	0.0	3.177	4	0.5286
9 : 100306804 : SNP	a	g	0.7364	0.0108	0.7270	0.7679	0.0116	0.0098	0.2377	+++-+	0.0	1.492	4	0.8281
1 : 57905104 : SNP	t	c	0.7906	0.0101	0.7725	0.8185	-0.0104	0.0113	0.3533	-0-+-	0.0	3.880	4	0.4225
7 : 144235438 : SNP	a	g	0.8782	0.0124	0.8690	0.9164	0.0076	0.0134	0.5716	++++-	0.0	1.308	4	0.8601
11 : 114941840 : SNP	a	g	0.8862	0.0047	0.8771	0.8922	-0.0099	0.0135	0.4605	-+++-	0.0	3.470	4	0.4825
4 : 171885580 : SNP	a	g	0.1092	0.0112	0.0992	0.1239	-0.0030	0.0136	0.8277	--+-+	0.0	2.299	4	0.681
10 : 66647680 : SNP	a	g	0.8347	0.0146	0.8093	0.8539	0.0004	0.0115	0.9694	+--+-	33.1	5.975	4	0.201
1 : 9155963 : SNP	a	t	0.8520	0.0096	0.8276	0.8615	0.0212	0.0122	0.08197	++-+-	56.4	9.173	4	0.05691
4 : 175061519 : SNP	t	c	0.0116	0.0000	0.0116	0.0116	0.0960	0.0647	0.1378	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 152877360 : SNP	a	c	0.7088	0.0111	0.6831	0.7188	0.0096	0.0092	0.2975	+-++-	16.1	4.769	4	0.3118
11 : 42478266 : SNP	a	c	0.8530	0.0079	0.8385	0.8646	-0.0162	0.0122	0.185	+----	0.0	3.175	4	0.529
8 : 63723305 : SNP	t	g	0.3337	0.0137	0.3226	0.3616	0.0169	0.0091	0.0639	+++-+	0.0	1.172	4	0.8827
16 : 86908652 : SNP	a	g	0.8575	0.0061	0.8519	0.8838	0.0268	0.0122	0.0283	+++-+	35.1	6.163	4	0.1873
19 : 48775233 : SNP	a	g	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	-0.0180	0.0414	0.6641	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 69736970 : SNP	t	c	0.1131	0.0074	0.0963	0.1286	0.0062	0.0137	0.6519	+---+	9.8	4.435	4	0.3503
7 : 18896011 : SNP	a	g	0.5618	0.0106	0.5356	0.5715	-0.0032	0.0085	0.7101	-+---	0.0	2.589	4	0.6288
6 : 5546673 : SNP	t	c	0.0226	0.0000	0.0226	0.0226	-0.0120	0.0657	0.8551	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 181073640 : SNP	t	c	0.9827	0.0000	0.9827	0.9827	0.0590	0.0495	0.2336	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 58791665 : SNP	t	c	0.0299	0.0000	0.0299	0.0299	0.0200	0.0354	0.5719	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 72038677 : SNP	a	c	0.0327	0.0026	0.0290	0.0345	0.0082	0.0274	0.7656	+-???	0.0	0.129	1	0.7195
15 : 23241176 : SNP	a	g	0.4784	0.0197	0.4693	0.5294	-0.0361	0.0217	0.09714	??+--	73.0	7.420	2	0.02448
7 : 1086521 : SNP	c	g	0.6265	0.0104	0.6122	0.6359	0.0010	0.0091	0.9092	-++-+	0.0	3.212	4	0.5229
7 : 41565065 : INDEL	i	r	0.0147	0.0000	0.0147	0.0147	0.1080	0.0617	0.07987	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 86986609 : SNP	t	g	0.9536	0.0110	0.9335	0.9603	0.0166	0.0214	0.4364	-+?-+	0.0	1.299	3	0.7293
7 : 15835998 : SNP	a	g	0.7251	0.0089	0.7141	0.7422	-0.0125	0.0098	0.2009	-+--+	19.9	4.994	4	0.2879
2 : 80734429 : INDEL	d	r	0.6833	0.0233	0.6349	0.7133	0.0055	0.0093	0.557	+++-+	0.0	2.370	4	0.6681
5 : 733767 : SNP	t	c	0.7977	0.0077	0.7839	0.8124	0.0067	0.0269	0.8041	??+-+	37.8	3.217	2	0.2002
18 : 42104436 : SNP	t	g	0.8190	0.0108	0.7956	0.8520	0.0215	0.0113	0.05806	++-+-	0.1	4.003	4	0.4056
1 : 114422856 : INDEL	i	r	0.0655	0.0068	0.0606	0.0750	-0.0495	0.0336	0.1413	-???-	0.0	0.072	1	0.7889
11 : 17107163 : SNP	a	g	0.3029	0.0160	0.2617	0.3189	0.0317	0.0094	0.0007562	+++++	0.0	0.983	4	0.9123
11 : 106691518 : SNP	a	t	0.7160	0.0044	0.7114	0.7281	0.0078	0.0094	0.4036	++++-	14.6	4.685	4	0.3211
11 : 14224346 : SNP	a	g	0.0528	0.0027	0.0491	0.0551	-0.0393	0.0203	0.05259	--??-	0.0	0.577	2	0.7495
14 : 23933013 : SNP	t	c	0.8272	0.0105	0.7863	0.8407	0.0072	0.0111	0.5185	+-++-	20.4	5.023	4	0.2849
8 : 83378133 : SNP	a	g	0.3264	0.0164	0.2922	0.3536	0.0119	0.0092	0.1956	+-+++	0.0	1.945	4	0.7459
14 : 101644295 : SNP	c	g	0.7173	0.0116	0.7011	0.7358	-0.0011	0.0098	0.9145	-++-+	0.0	3.319	4	0.506
6 : 118850375 : SNP	t	g	0.4755	0.0275	0.4536	0.5336	-0.0047	0.0085	0.5836	-+-++	7.5	4.322	4	0.3641
16 : 56322652 : SNP	c	g	0.4211	0.0240	0.3641	0.4410	0.0187	0.0086	0.03039	++--+	0.0	1.754	4	0.781
11 : 116493738 : SNP	a	g	0.5200	0.0105	0.4988	0.5499	-0.0025	0.0099	0.8049	+-++-	8.9	4.391	4	0.3556
2 : 167795568 : SNP	a	g	0.9603	0.0026	0.9548	0.9618	0.0120	0.0233	0.6067	+-??+	44.7	3.617	2	0.1639
2 : 229948026 : SNP	t	c	0.7466	0.0155	0.7334	0.7802	-0.0165	0.0099	0.09528	---++	0.0	3.416	4	0.4908
3 : 59282232 : SNP	a	c	0.0162	0.0000	0.0162	0.0162	0.0230	0.0485	0.6355	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 156910791 : SNP	t	c	0.9593	0.0018	0.9578	0.9617	-0.0086	0.0229	0.7061	-+??-	58.3	4.794	2	0.091
8 : 1209758 : SNP	a	g	0.4511	0.0102	0.4427	0.4719	0.0126	0.0109	0.2488	+++++	0.0	1.122	4	0.8908
18 : 75469072 : SNP	c	g	0.1445	0.0065	0.1210	0.1569	0.0038	0.0128	0.7681	-+?-+	33.9	4.540	3	0.2088
22 : 37961026 : SNP	t	c	0.0260	0.0000	0.0260	0.0260	-0.0820	0.0657	0.212	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 5960490 : SNP	a	g	0.2645	0.0081	0.2537	0.2793	-0.0020	0.0097	0.8408	+-+-+	0.0	1.149	4	0.8864
4 : 358932 : SNP	a	g	0.2147	0.0091	0.1969	0.2228	0.0073	0.0108	0.4975	+-+--	5.7	4.243	4	0.3741
1 : 104516080 : SNP	a	g	0.9670	0.0017	0.9658	0.9696	-0.0295	0.0255	0.2479	--??+	17.5	2.424	2	0.2976
6 : 2440475 : SNP	a	g	0.7832	0.0040	0.7787	0.7952	0.0059	0.0106	0.5749	+-+++	0.0	2.105	4	0.7164
3 : 25052001 : SNP	t	c	0.2275	0.0102	0.1988	0.2385	-0.0056	0.0101	0.5795	--+--	49.9	7.978	4	0.09239
18 : 5352070 : INDEL	i	r	0.5794	0.0081	0.5586	0.5948	0.0087	0.0089	0.328	+++--	0.0	3.262	4	0.5149
3 : 65426059 : SNP	t	c	0.6764	0.0091	0.6484	0.7085	0.0236	0.0092	0.01007	++++-	64.9	11.402	4	0.0224
4 : 60110360 : SNP	a	g	0.0173	0.0000	0.0173	0.0173	-0.0270	0.0475	0.5698	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 66363482 : SNP	a	g	0.7398	0.0095	0.7295	0.7519	-0.0213	0.0099	0.03104	---+-	10.9	4.491	4	0.3436
21 : 24831066 : SNP	c	g	0.6429	0.0151	0.6116	0.6615	-0.0001	0.0091	0.995	-+--+	0.0	1.031	4	0.905
2 : 8566885 : SNP	a	g	0.4589	0.0305	0.4287	0.4968	-0.0095	0.0102	0.3548	---++	0.0	0.720	4	0.9488
2 : 238503482 : SNP	t	c	0.0903	0.0133	0.0811	0.1317	-0.0231	0.0168	0.1688	-+?--	0.0	1.119	3	0.7724
7 : 26495372 : SNP	a	c	0.8802	0.0072	0.8581	0.8855	0.0073	0.0132	0.581	-+-++	0.0	1.386	4	0.8466
9 : 14782367 : SNP	t	c	0.8389	0.0076	0.8210	0.8486	-0.0079	0.0117	0.5009	----+	48.8	7.816	4	0.09855
18 : 5015908 : SNP	t	c	0.6240	0.0165	0.6080	0.6458	0.0072	0.0105	0.4966	+-++-	0.0	3.053	4	0.549
2 : 68629409 : SNP	t	c	0.1355	0.0106	0.1099	0.1454	-0.0168	0.0123	0.1729	-----	0.0	3.512	4	0.476
14 : 57758539 : SNP	a	c	0.0636	0.0102	0.0530	0.0765	0.0077	0.0187	0.682	++?+-	0.0	1.273	3	0.7356
4 : 46286816 : SNP	a	t	0.0257	0.0000	0.0257	0.0257	-0.0200	0.0617	0.7457	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 91353348 : SNP	t	c	0.1174	0.0112	0.1097	0.1409	0.0228	0.0145	0.116	+-+++	6.9	4.295	4	0.3676
12 : 55794264 : SNP	a	g	0.1719	0.0135	0.1594	0.1990	-0.0106	0.0113	0.3462	--++-	0.0	2.585	4	0.6295
16 : 24081024 : SNP	c	g	0.2985	0.0145	0.2744	0.3277	0.0224	0.0101	0.02621	+++++	0.0	0.163	4	0.9968
5 : 52252196 : SNP	a	g	0.9866	0.0000	0.9866	0.9866	-0.0160	0.0526	0.7608	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 91115615 : SNP	t	c	0.9820	0.0000	0.9820	0.9820	-0.0610	0.0455	0.1799	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 47545281 : SNP	a	g	0.5954	0.0219	0.5759	0.6334	-0.0070	0.0086	0.4186	--+-+	0.0	2.415	4	0.6599
4 : 40643442 : SNP	a	g	0.0700	0.0005	0.0693	0.0703	0.0881	0.0299	0.003263	+???+	55.8	2.261	1	0.1327
21 : 37465641 : SNP	a	g	0.0704	0.0021	0.0691	0.0751	-0.0046	0.0176	0.7925	-+?-+	0.0	2.436	3	0.4869
18 : 40001102 : SNP	c	g	0.9832	0.0000	0.9832	0.9832	-0.0060	0.0475	0.8995	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 17279528 : SNP	a	g	0.0703	0.0115	0.0590	0.0884	-0.0171	0.0182	0.3492	+-?--	24.6	3.976	3	0.264
1 : 93364156 : SNP	t	g	0.3854	0.0126	0.3784	0.4126	-0.0001	0.0087	0.9888	-+++-	0.0	3.878	4	0.4227
6 : 125362193 : SNP	t	c	0.9750	0.0000	0.9750	0.9750	-0.0730	0.0495	0.1405	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 12360024 : INDEL	i	r	0.1682	0.0119	0.1401	0.1737	0.0017	0.0115	0.8844	+-+-+	0.0	3.340	4	0.5027
17 : 1661486 : SNP	t	c	0.0813	0.0049	0.0746	0.0855	0.0168	0.0177	0.3417	+-?--	29.5	4.256	3	0.2352
4 : 12795609 : SNP	a	t	0.6335	0.0229	0.6146	0.6838	0.0042	0.0091	0.6455	+--+-	0.0	0.873	4	0.9284
2 : 130347616 : SNP	a	t	0.9824	0.0000	0.9824	0.9824	-0.0040	0.0465	0.9314	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 26824270 : SNP	a	g	0.0407	0.0000	0.0407	0.0407	0.0370	0.0445	0.4055	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 169648100 : SNP	t	c	0.9036	0.0068	0.8981	0.9320	0.0256	0.0148	0.08449	-+-++	19.3	4.960	4	0.2915
22 : 43832082 : SNP	t	c	0.0324	0.0006	0.0319	0.0332	0.0200	0.0276	0.4677	+-???	0.0	0.983	1	0.3215
12 : 89894103 : SNP	a	c	0.4868	0.0112	0.4802	0.5157	0.0128	0.0085	0.1317	++-+-	17.1	4.824	4	0.3058
9 : 11704163 : SNP	a	g	0.7612	0.0178	0.7139	0.7724	-0.0053	0.0099	0.5947	+--++	0.0	2.932	4	0.5693
15 : 49747287 : INDEL	d	r	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	-0.0130	0.0485	0.7888	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 82430349 : SNP	t	c	0.4055	0.0147	0.3746	0.4246	-0.0069	0.0086	0.4235	--+--	0.0	2.781	4	0.5951
7 : 6445960 : SNP	t	g	0.1107	0.0078	0.0930	0.1177	-0.0075	0.0142	0.5979	--+++	0.0	1.737	4	0.7839
19 : 11433489 : SNP	c	g	0.0576	0.0060	0.0502	0.0702	-0.0065	0.0198	0.7434	-+?-+	0.0	2.330	3	0.5067
8 : 61112814 : SNP	t	c	0.6158	0.0232	0.5681	0.6304	0.0134	0.0091	0.1384	++++-	0.0	3.725	4	0.4445
2 : 26361318 : INDEL	d	r	0.7918	0.0155	0.7535	0.8014	-0.0068	0.0105	0.5176	+--+-	0.0	3.462	4	0.4837
4 : 155895521 : SNP	t	c	0.5348	0.0040	0.5211	0.5394	-0.0025	0.0086	0.773	+-+-+	0.0	3.218	4	0.522
11 : 101519273 : SNP	t	c	0.7311	0.0117	0.7051	0.7389	-0.0030	0.0097	0.7559	0+---	0.0	1.392	4	0.8457
1 : 229107529 : SNP	t	g	0.9663	0.0022	0.9636	0.9681	-0.0464	0.0288	0.1066	--???	30.1	1.430	1	0.2318
14 : 33041185 : SNP	a	t	0.7713	0.0225	0.7279	0.7943	-0.0140	0.0101	0.1645	-+++-	0.0	3.881	4	0.4224
19 : 28316636 : SNP	a	g	0.9884	0.0000	0.9884	0.9884	0.1040	0.0637	0.1025	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 25676015 : SNP	t	g	0.4496	0.0113	0.4215	0.4773	-0.0094	0.0091	0.2998	--++-	26.2	5.418	4	0.247
20 : 18506159 : SNP	t	c	0.2080	0.0213	0.1936	0.2511	0.0025	0.0105	0.8149	--+++	25.8	5.393	4	0.2493
10 : 132779344 : SNP	a	c	0.9687	0.0000	0.9687	0.9687	-0.0130	0.0536	0.8083	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 54297037 : SNP	a	c	0.0582	0.0003	0.0578	0.0585	0.0080	0.0212	0.7057	-+???	17.2	1.207	1	0.2719
9 : 9326805 : SNP	a	c	0.2814	0.0285	0.2522	0.3386	-0.0045	0.0096	0.6437	-++--	26.1	5.412	4	0.2476
13 : 81853642 : SNP	a	g	0.4922	0.0168	0.4767	0.5276	-0.0132	0.0085	0.1192	-+-+-	31.1	5.803	4	0.2144
11 : 84992547 : SNP	a	t	0.1234	0.0112	0.1118	0.1459	-0.0151	0.0131	0.249	-++--	16.7	4.803	4	0.3081
18 : 76823511 : SNP	c	g	0.4620	0.0160	0.4117	0.4723	0.0014	0.0085	0.8668	+0-+-	35.8	6.233	4	0.1824
1 : 232287334 : SNP	c	g	0.2293	0.0160	0.2117	0.2448	0.0061	0.0101	0.5443	++++-	0.0	1.208	4	0.8768
18 : 9339519 : SNP	t	c	0.1376	0.0094	0.1159	0.1523	-0.0032	0.0133	0.811	--+++	0.0	3.948	4	0.4131
18 : 6754352 : SNP	t	c	0.0291	0.0000	0.0291	0.0291	-0.0390	0.0445	0.3806	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 58797583 : INDEL	i	r	0.6224	0.0063	0.6089	0.6290	0.0120	0.0087	0.1674	+++-+	0.0	1.005	4	0.9091
18 : 38500949 : SNP	t	g	0.8463	0.0064	0.8214	0.8489	-0.0078	0.0127	0.5386	+--++	68.7	12.779	4	0.01241
14 : 59992971 : SNP	a	t	0.4085	0.0327	0.3919	0.4795	-0.0007	0.0085	0.9324	+-+--	0.0	3.129	4	0.5365
13 : 29850544 : SNP	a	g	0.9052	0.0112	0.8971	0.9369	-0.0038	0.0155	0.8073	-++--	49.9	7.989	4	0.09199
7 : 34226492 : INDEL	i	r	0.5609	0.0122	0.5332	0.5857	0.0099	0.0091	0.2778	+++-+	0.0	0.981	4	0.9127
12 : 33507209 : SNP	a	c	0.8512	0.0112	0.8383	0.8619	-0.0013	0.0131	0.9178	--+-?	0.0	2.069	3	0.5583
13 : 72007858 : SNP	a	c	0.9733	0.0000	0.9733	0.9733	0.0540	0.0445	0.2247	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 37987572 : SNP	t	c	0.0526	0.0010	0.0518	0.0539	0.0045	0.0215	0.8332	-+???	81.0	5.276	1	0.02162
1 : 35347317 : INDEL	i	r	0.0710	0.0107	0.0662	0.0948	-0.0439	0.0304	0.1492	-??-?	0.0	0.335	1	0.5627
4 : 156092921 : SNP	a	c	0.1091	0.0103	0.0832	0.1203	0.0153	0.0137	0.2648	+-+++	0.0	1.057	4	0.901
2 : 138245780 : SNP	a	g	0.1938	0.0081	0.1868	0.2237	0.0130	0.0106	0.2197	+++-+	0.0	3.094	4	0.5422
3 : 24130263 : SNP	a	c	0.2152	0.0179	0.1760	0.2517	-0.0030	0.0105	0.7781	--++-	0.0	1.974	4	0.7405
5 : 26210611 : SNP	a	g	0.3546	0.0204	0.3113	0.3762	0.0043	0.0092	0.6426	+-+-+	0.0	0.366	4	0.9851
6 : 87354919 : SNP	t	c	0.9834	0.0000	0.9834	0.9834	-0.0630	0.0607	0.2989	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 118372922 : SNP	c	g	0.9824	0.0000	0.9824	0.9824	-0.0060	0.0475	0.8995	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 39233941 : SNP	t	c	0.3999	0.0216	0.3518	0.4203	0.0206	0.0086	0.01642	+++++	0.0	1.633	4	0.8028
11 : 116873121 : INDEL	d	r	0.0162	0.0000	0.0162	0.0162	-0.0040	0.0526	0.9393	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 126448275 : SNP	a	c	0.8508	0.0071	0.8408	0.8640	-0.0015	0.0120	0.8999	+--+-	0.0	1.215	4	0.8757
18 : 76299417 : SNP	a	g	0.0750	0.0034	0.0678	0.0792	0.0016	0.0172	0.9252	++?--	0.0	2.686	3	0.4426
4 : 7021638 : SNP	t	c	0.1152	0.0190	0.0954	0.1347	-0.0112	0.0291	0.6988	?-?++	12.2	2.278	2	0.3201
2 : 32554102 : SNP	c	g	0.1269	0.0092	0.1129	0.1396	0.0130	0.0134	0.329	+-+++	0.0	3.467	4	0.483
5 : 58557090 : SNP	a	g	0.0470	0.0032	0.0428	0.0494	-0.0004	0.0251	0.9888	-+???	0.0	0.265	1	0.6066
6 : 137371390 : INDEL	d	r	0.9765	0.0000	0.9765	0.9765	-0.0130	0.0475	0.7844	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 167452251 : SNP	t	c	0.6874	0.0207	0.6408	0.7035	-0.0150	0.0092	0.1019	-+---	0.0	3.284	4	0.5115
3 : 48179876 : SNP	a	g	0.0337	0.0000	0.0337	0.0337	0.0140	0.0455	0.7583	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 70778498 : SNP	t	c	0.9292	0.0062	0.9080	0.9336	0.0146	0.0170	0.3892	++?+-	0.0	2.578	3	0.4614
15 : 90263801 : SNP	t	c	0.0150	0.0000	0.0150	0.0150	-0.0470	0.0596	0.4307	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 141549263 : SNP	a	c	0.1766	0.0268	0.1393	0.2324	0.0105	0.0112	0.3499	++---	0.0	1.080	4	0.8974
16 : 71719353 : SNP	t	c	0.2977	0.0156	0.2855	0.3403	-0.0019	0.0093	0.8335	-+--+	70.8	13.700	4	0.008316
13 : 35810757 : SNP	a	t	0.0941	0.0122	0.0586	0.0988	0.0070	0.0154	0.6504	+++?-	23.3	3.909	3	0.2715
9 : 4717112 : SNP	c	g	0.0643	0.0076	0.0573	0.0749	0.0088	0.0186	0.6363	++?-+	0.0	2.042	3	0.5637
9 : 110860513 : SNP	t	c	0.9368	0.0040	0.9333	0.9437	-0.0075	0.0176	0.6717	-+?+-	32.2	4.425	3	0.219
11 : 14835219 : SNP	t	g	0.0882	0.0156	0.0664	0.1128	0.0141	0.0155	0.3634	0++--	0.0	3.599	4	0.463
17 : 5754443 : SNP	t	c	0.4665	0.0193	0.4529	0.5192	0.0080	0.0085	0.348	++--+	0.0	2.448	4	0.654
18 : 69515168 : SNP	t	c	0.4065	0.0059	0.3831	0.4176	0.0034	0.0086	0.6879	+++-+	37.0	6.347	4	0.1747
1 : 156548782 : SNP	a	c	0.0326	0.0052	0.0276	0.0380	-0.0276	0.0320	0.3891	--???	0.0	0.250	1	0.6171
7 : 143797781 : INDEL	i	r	0.2042	0.0135	0.1787	0.2208	-0.0136	0.0107	0.2027	0---+	70.8	13.685	4	0.008371
4 : 129968150 : SNP	t	c	0.9842	0.0000	0.9842	0.9842	0.0780	0.0546	0.153	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 99614450 : INDEL	d	r	0.0421	0.0027	0.0385	0.0441	-0.0216	0.0242	0.3726	--???	0.0	0.019	1	0.8891
4 : 107640763 : SNP	a	t	0.9660	0.0004	0.9657	0.9666	-0.0233	0.0266	0.3803	--???	0.0	0.920	1	0.3374
4 : 121199596 : SNP	t	c	0.0400	0.0000	0.0400	0.0400	-0.0210	0.0394	0.5943	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 111006368 : SNP	a	g	0.9808	0.0000	0.9808	0.9808	-0.0260	0.0475	0.5842	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 129882699 : SNP	a	g	0.4632	0.0079	0.4443	0.4674	-0.0050	0.0086	0.5628	+----	0.0	2.063	4	0.7242
14 : 62890570 : SNP	a	t	0.3936	0.0140	0.3801	0.4169	0.0006	0.0091	0.9487	+--++	40.1	6.682	4	0.1536
9 : 106243701 : SNP	a	g	0.8780	0.0101	0.8527	0.8864	0.0037	0.0130	0.7768	+-++-	35.1	6.159	4	0.1876
2 : 31258776 : SNP	c	g	0.7859	0.0050	0.7841	0.8092	-0.0026	0.0105	0.8051	+-+--	0.0	3.398	4	0.4936
8 : 76389764 : SNP	a	g	0.9722	0.0000	0.9722	0.9722	0.0200	0.0374	0.5928	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 127432954 : SNP	a	c	0.1846	0.0079	0.1801	0.2146	0.0052	0.0111	0.6364	+-+++	0.0	0.845	4	0.9323
18 : 11905953 : SNP	t	c	0.4409	0.0133	0.4327	0.4737	-0.0071	0.0103	0.4897	--++-	47.5	7.617	4	0.1066
5 : 175011420 : INDEL	d	r	0.3415	0.0229	0.3203	0.4076	0.0034	0.0107	0.7504	-+-++	0.0	3.064	4	0.5472
15 : 70720034 : SNP	t	c	0.4155	0.0061	0.4016	0.4269	-0.0007	0.0085	0.9319	+----	6.2	4.262	4	0.3717
17 : 1143981 : SNP	t	c	0.0912	0.0046	0.0830	0.0938	0.0773	0.0440	0.07895	???++	0.0	0.032	1	0.8576
22 : 48761420 : SNP	t	c	0.8682	0.0164	0.8535	0.9074	-0.0192	0.0136	0.1577	--+++	8.4	4.367	4	0.3586
17 : 13850669 : SNP	t	c	0.2211	0.0219	0.1789	0.2461	-0.0095	0.0104	0.3593	+-+--	0.0	2.101	4	0.7172
3 : 94507925 : SNP	a	g	0.9851	0.0000	0.9851	0.9851	0.0150	0.0637	0.8138	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 64694991 : SNP	t	c	0.4361	0.0038	0.4294	0.4515	0.0191	0.0085	0.02502	++-+-	0.0	3.093	4	0.5424
12 : 106168286 : SNP	t	c	0.7840	0.0094	0.7727	0.8161	-0.0020	0.0105	0.8521	++--+	0.0	2.966	4	0.5635
3 : 148796402 : SNP	t	c	0.9092	0.0020	0.9043	0.9103	0.0378	0.0157	0.01589	++?++	0.0	1.122	3	0.7716
9 : 15116909 : SNP	c	g	0.6256	0.0142	0.6083	0.6398	0.0075	0.0089	0.4016	+---+	0.0	1.970	4	0.7413
10 : 71771086 : SNP	a	g	0.4000	0.0077	0.3917	0.4262	-0.0055	0.0089	0.5334	--++-	0.0	0.848	4	0.932
15 : 59661404 : SNP	t	c	0.8804	0.0038	0.8739	0.8850	-0.0139	0.0138	0.3166	-++--	0.0	3.884	4	0.4219
1 : 152468938 : SNP	a	g	0.9852	0.0000	0.9852	0.9852	-0.0090	0.0516	0.8614	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 59908346 : SNP	t	c	0.0899	0.0066	0.0867	0.1144	0.0235	0.0151	0.1189	++-+-	0.0	2.624	4	0.6226
6 : 32636289 : SNP	t	c	0.8490	0.0050	0.8386	0.8523	0.0154	0.0261	0.5535	??-++	0.0	0.669	2	0.7156
6 : 20410768 : SNP	a	t	0.9661	0.0000	0.9661	0.9661	0.0350	0.0384	0.3622	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 121067170 : SNP	a	g	0.9277	0.0111	0.9068	0.9366	-0.0278	0.0169	0.1006	--?--	0.0	0.603	3	0.8957
4 : 701608 : SNP	a	g	0.1373	0.0005	0.1365	0.1376	-0.0289	0.0384	0.4511	???+-	0.0	0.542	1	0.4617
15 : 49816213 : SNP	a	c	0.2509	0.0040	0.2477	0.2637	-0.0062	0.0098	0.5292	---+-	20.6	5.040	4	0.2832
5 : 88234746 : SNP	a	g	0.9833	0.0000	0.9833	0.9833	-0.0750	0.0495	0.13	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 143783704 : SNP	t	c	0.2677	0.0079	0.2549	0.2755	-0.0130	0.0097	0.1827	---+-	0.0	3.117	4	0.5385
11 : 3143030 : SNP	t	c	0.1670	0.0217	0.1513	0.2135	0.0254	0.0117	0.03036	++-++	0.0	1.902	4	0.7538
20 : 16325331 : SNP	a	c	0.9857	0.0000	0.9857	0.9857	0.0140	0.0516	0.786	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 8438261 : SNP	c	g	0.5961	0.0239	0.5783	0.6465	-0.0246	0.0086	0.004336	--+--	0.0	1.243	4	0.871
2 : 48594887 : SNP	t	c	0.8791	0.0102	0.8738	0.9069	0.0331	0.0132	0.01234	++++-	0.0	2.992	4	0.5591
12 : 63635398 : SNP	t	c	0.1101	0.0047	0.0885	0.1124	-0.0190	0.0139	0.1716	--?+-	0.0	2.253	3	0.5216
8 : 110372586 : SNP	a	t	0.5283	0.0167	0.5029	0.5450	0.0023	0.0085	0.7921	+-+-+	0.0	2.332	4	0.675
13 : 97980827 : SNP	a	g	0.0588	0.0067	0.0526	0.0739	0.0069	0.0187	0.7133	++?+-	0.0	0.740	3	0.8639
2 : 75562223 : SNP	t	c	0.8506	0.0071	0.8377	0.8627	0.0047	0.0119	0.6954	++--+	0.0	3.032	4	0.5525
4 : 91777618 : SNP	a	g	0.9721	0.0070	0.9621	0.9770	-0.0644	0.0349	0.06485	-???-	0.0	0.005	1	0.9464
14 : 73239331 : INDEL	i	r	0.0467	0.0082	0.0421	0.0619	0.0024	0.0218	0.9126	--?++	56.5	6.890	3	0.07548
4 : 16268007 : SNP	a	c	0.3552	0.0159	0.3183	0.3751	-0.0101	0.0091	0.2668	----+	36.0	6.253	4	0.181
11 : 121685649 : SNP	a	t	0.6585	0.0189	0.6150	0.6693	0.0164	0.0092	0.07609	+++++	0.0	1.671	4	0.7961
12 : 52453481 : SNP	c	g	0.0522	0.0031	0.0481	0.0545	0.0485	0.0266	0.06823	++???	12.3	1.141	1	0.2855
1 : 27303884 : SNP	t	c	0.3759	0.0165	0.3265	0.3973	0.0117	0.0092	0.2012	+--++	0.0	2.985	4	0.5603
4 : 150167397 : SNP	a	g	0.4869	0.0110	0.4707	0.5020	0.0124	0.0085	0.1471	+++--	0.0	3.185	4	0.5273
15 : 88486916 : SNP	t	c	0.7867	0.0040	0.7796	0.8042	0.0076	0.0105	0.4665	++---	54.7	8.833	4	0.0654
12 : 20965842 : SNP	t	g	0.8654	0.0084	0.8494	0.8767	0.0033	0.0134	0.8027	-+-++	37.9	6.444	4	0.1683
4 : 110002523 : SNP	t	c	0.1309	0.0084	0.1118	0.1515	0.0197	0.0127	0.1201	+---+	66.3	11.882	4	0.01825
2 : 37178871 : SNP	t	c	0.8559	0.0071	0.8504	0.8758	0.0099	0.0123	0.4217	+++--	35.6	6.210	4	0.184
1 : 85310173 : SNP	t	c	0.0132	0.0000	0.0132	0.0132	0.0880	0.0546	0.1069	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 245778 : SNP	a	t	0.0655	0.0085	0.0553	0.0910	0.0439	0.0186	0.01845	++?++	0.0	0.253	3	0.9686
14 : 54579994 : SNP	a	c	0.0711	0.0049	0.0679	0.0864	-0.0001	0.0164	0.9928	--+++	29.7	5.688	4	0.2237
5 : 174031302 : SNP	a	g	0.4878	0.0161	0.4434	0.5126	0.0043	0.0087	0.6193	-++-+	0.0	0.621	4	0.9607
6 : 162006836 : SNP	t	c	0.1789	0.0069	0.1703	0.1905	0.0010	0.0114	0.9277	+-++-	0.0	2.385	4	0.6654
3 : 144692300 : SNP	a	g	0.4351	0.0091	0.4146	0.4505	-0.0191	0.0089	0.03113	---+-	0.0	2.530	4	0.6392
5 : 5947115 : SNP	a	g	0.0379	0.0010	0.0371	0.0392	0.0193	0.0261	0.4597	++???	0.0	0.013	1	0.911
1 : 157328007 : SNP	t	g	0.7806	0.0020	0.7760	0.7844	-0.0254	0.0106	0.01691	-----	0.0	1.842	4	0.7648
4 : 173987233 : INDEL	d	r	0.0373	0.0040	0.0348	0.0437	-0.0100	0.0300	0.7398	-???+	43.8	1.778	1	0.1823
1 : 170236719 : SNP	a	g	0.2441	0.0069	0.2346	0.2605	-0.0084	0.0099	0.3961	+----	38.8	6.533	4	0.1627
5 : 11495134 : SNP	t	c	0.5443	0.0032	0.5400	0.5575	0.0007	0.0085	0.9308	+++--	19.3	4.958	4	0.2917
8 : 129234901 : SNP	a	c	0.1508	0.0158	0.1361	0.1800	0.0031	0.0121	0.8	+++-+	0.0	2.117	4	0.7142
3 : 102692008 : SNP	t	c	0.1577	0.0058	0.1415	0.1655	-0.0001	0.0119	0.9916	-+++-	10.1	4.448	4	0.3488
4 : 4689562 : SNP	a	c	0.4713	0.0129	0.4425	0.4951	0.0083	0.0085	0.331	+-+++	16.3	4.779	4	0.3107
1 : 102324578 : SNP	a	t	0.5325	0.0128	0.5032	0.5468	-0.0043	0.0086	0.613	--+++	0.0	2.572	4	0.6317
10 : 132148362 : SNP	t	c	0.3407	0.0116	0.3165	0.3541	-0.0056	0.0092	0.5473	-++--	28.9	5.625	4	0.229
3 : 194612197 : SNP	t	c	0.1193	0.0158	0.0607	0.1262	-0.0177	0.0133	0.181	-+---	0.0	2.670	4	0.6144
20 : 54477177 : SNP	t	g	0.7643	0.0065	0.7448	0.7761	0.0047	0.0104	0.653	-+++-	50.2	8.032	4	0.09041
2 : 129788999 : SNP	a	g	0.7070	0.0081	0.7020	0.7271	-0.0074	0.0097	0.4441	-++--	0.0	1.739	4	0.7836
16 : 3236257 : SNP	a	g	0.7448	0.0225	0.7131	0.7991	-0.0057	0.0106	0.5914	--+-+	0.0	2.178	4	0.703
8 : 22889424 : INDEL	i	r	0.8586	0.0150	0.8231	0.8724	-0.0072	0.0133	0.5895	+--++	77.1	17.463	4	0.001571
7 : 53285161 : SNP	a	g	0.1656	0.0120	0.1563	0.1849	0.0004	0.0117	0.9742	+-+++	0.0	2.712	4	0.6071
8 : 91817397 : SNP	a	g	0.0664	0.0014	0.0635	0.0680	-0.0086	0.0175	0.6227	--?+-	0.0	0.786	3	0.8527
21 : 47468276 : SNP	c	g	0.0589	0.0069	0.0443	0.0647	0.0005	0.0216	0.9824	-+?+-	0.0	1.633	3	0.6519
17 : 57410641 : SNP	a	c	0.7516	0.0115	0.7313	0.7913	0.0008	0.0099	0.9336	+-+-+	31.8	5.861	4	0.2098
3 : 146485211 : SNP	a	t	0.4175	0.0083	0.4079	0.4257	0.0056	0.0086	0.5093	+--++	40.7	6.748	4	0.1498
10 : 135350060 : SNP	c	g	0.2272	0.0257	0.1876	0.2592	-0.0096	0.0113	0.3972	---++	28.5	5.593	4	0.2317
3 : 57036252 : SNP	a	t	0.1145	0.0071	0.1079	0.1320	0.0126	0.0142	0.3776	++-+-	16.3	4.779	4	0.3107
2 : 64330676 : SNP	a	t	0.0227	0.0000	0.0227	0.0227	0.0470	0.0536	0.3803	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 97977576 : SNP	a	g	0.4562	0.0239	0.4311	0.5019	-0.0071	0.0091	0.4329	+----	63.0	10.813	4	0.02875
18 : 1083924 : SNP	a	t	0.8581	0.0193	0.8438	0.9120	0.0056	0.0126	0.6567	++++-	64.1	11.144	4	0.02499
21 : 22239480 : SNP	t	c	0.0262	0.0022	0.0244	0.0290	0.0308	0.0298	0.3006	++???	0.0	0.392	1	0.5315
7 : 114796203 : SNP	a	g	0.0202	0.0000	0.0202	0.0202	0.0450	0.0425	0.2892	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 164787491 : SNP	a	g	0.3431	0.0083	0.3146	0.3511	-0.0114	0.0091	0.2117	-----	0.0	2.004	4	0.735
4 : 57303967 : INDEL	i	r	0.0697	0.0046	0.0631	0.0813	-0.0089	0.0170	0.5999	--?++	13.1	3.451	3	0.3272
4 : 74269523 : SNP	t	c	0.9626	0.0046	0.9549	0.9654	0.0345	0.0295	0.2429	+???+	0.0	0.422	1	0.5161
13 : 79990417 : SNP	t	c	0.9743	0.0000	0.9743	0.9743	0.0180	0.0404	0.6562	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 43758166 : SNP	c	g	0.9671	0.0032	0.9618	0.9714	-0.0158	0.0256	0.5365	-+??-	0.0	1.473	2	0.4788
1 : 247793018 : SNP	a	t	0.5221	0.0023	0.5148	0.5257	-0.0039	0.0092	0.6693	-+-+-	0.0	1.909	4	0.7524
5 : 73537727 : SNP	t	g	0.3799	0.0059	0.3776	0.4056	0.0016	0.0089	0.8557	-+-++	48.3	7.734	4	0.1018
21 : 30472932 : INDEL	d	r	0.1231	0.0046	0.1164	0.1350	0.0023	0.0129	0.8609	++---	24.0	5.266	4	0.2611
14 : 39852933 : SNP	t	c	0.9153	0.0025	0.9086	0.9187	0.0171	0.0158	0.278	++?-+	25.2	4.010	3	0.2604
8 : 37347514 : SNP	c	g	0.1963	0.0068	0.1919	0.2122	0.0024	0.0106	0.8186	++---	6.2	4.265	4	0.3714
4 : 142273942 : SNP	a	g	0.0239	0.0000	0.0239	0.0239	0.0210	0.0475	0.6585	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 67356036 : SNP	t	c	0.3335	0.0048	0.3153	0.3384	0.0123	0.0091	0.1793	+++-+	28.4	5.588	4	0.2321
6 : 139020105 : SNP	t	c	0.5277	0.0190	0.4662	0.5419	0.0022	0.0086	0.7995	-+-++	0.0	2.892	4	0.5761
21 : 18113853 : SNP	a	t	0.0406	0.0015	0.0383	0.0425	-0.0134	0.0233	0.5656	--??+	54.3	4.379	2	0.112
5 : 95870700 : SNP	t	c	0.6250	0.0063	0.5998	0.6325	0.0183	0.0091	0.04317	+++++	0.0	1.957	4	0.7437
9 : 117182478 : SNP	a	g	0.7584	0.0094	0.7429	0.7671	0.0145	0.0100	0.1463	++-++	0.0	1.042	4	0.9034
16 : 54497609 : SNP	t	c	0.7785	0.0155	0.7404	0.7954	-0.0079	0.0105	0.4475	-+++-	0.0	1.804	4	0.7717
20 : 15968952 : INDEL	d	r	0.1311	0.0038	0.1265	0.1436	0.0236	0.0141	0.09375	+++--	20.5	5.032	4	0.284
2 : 108729137 : SNP	t	c	0.0235	0.0000	0.0235	0.0235	0.0070	0.0414	0.8659	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 161863394 : SNP	a	c	0.1618	0.0115	0.1411	0.2009	0.0028	0.0117	0.8129	0-+-+	5.5	4.232	4	0.3755
7 : 55902924 : SNP	c	g	0.6843	0.0205	0.6189	0.7028	-0.0143	0.0101	0.156	----+	14.2	4.662	4	0.3238
8 : 51321622 : SNP	a	g	0.0706	0.0008	0.0689	0.0715	0.0000	0.0170	0.9986	-+?+-	0.0	0.989	3	0.8039
13 : 88090233 : SNP	t	c	0.9821	0.0000	0.9821	0.9821	-0.0210	0.0485	0.6652	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 61173775 : SNP	t	c	0.7822	0.0035	0.7743	0.7845	-0.0098	0.0104	0.3425	--+-+	0.0	2.672	4	0.6141
2 : 216297796 : SNP	c	g	0.7319	0.0119	0.7246	0.7662	-0.0076	0.0099	0.4387	---+-	25.0	5.333	4	0.2548
12 : 87280696 : SNP	t	c	0.2255	0.0119	0.2150	0.2601	0.0067	0.0103	0.5158	+++--	0.0	3.093	4	0.5423
13 : 52408735 : SNP	a	g	0.0413	0.0015	0.0392	0.0424	-0.0190	0.0239	0.4257	--???	0.0	0.000	1	1
15 : 50348917 : SNP	t	c	0.0854	0.0169	0.0701	0.1142	0.0014	0.0162	0.9307	+-?-+	0.0	1.407	3	0.7039
8 : 10420484 : SNP	a	g	0.8227	0.0046	0.8120	0.8265	0.0060	0.0114	0.5993	-++++	0.0	2.168	4	0.7049
16 : 11504145 : SNP	a	c	0.5078	0.0097	0.4807	0.5328	-0.0138	0.0092	0.1354	--+--	0.0	2.508	4	0.6431
5 : 105922870 : SNP	t	c	0.9263	0.0047	0.9217	0.9336	0.0306	0.0181	0.09182	++?++	0.0	0.910	3	0.8231
5 : 123286186 : SNP	a	g	0.8363	0.0056	0.8302	0.8442	-0.0158	0.0126	0.2111	+-+--	28.4	5.589	4	0.2321
8 : 22613045 : SNP	t	c	0.8047	0.0065	0.7705	0.8116	0.0102	0.0114	0.3718	-+++-	37.4	6.393	4	0.1716
4 : 6917983 : SNP	t	c	0.5206	0.0077	0.5074	0.5304	-0.0027	0.0085	0.756	-+---	0.0	2.748	4	0.6008
7 : 100401449 : SNP	a	g	0.0560	0.0060	0.0486	0.0727	0.0445	0.0221	0.04389	++?++	0.0	0.179	3	0.981
11 : 83480484 : SNP	t	c	0.8618	0.0069	0.8502	0.8729	0.0130	0.0124	0.294	-+-++	61.2	10.322	4	0.03533
7 : 72129113 : SNP	t	c	0.0568	0.0000	0.0568	0.0568	-0.0040	0.0425	0.9249	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 66649163 : SNP	c	g	0.0836	0.0103	0.0761	0.0991	0.0292	0.0219	0.1817	+??++	0.0	0.078	2	0.9618
18 : 44973953 : SNP	a	t	0.8663	0.0124	0.8597	0.8952	0.0193	0.0129	0.1334	++-+-	0.0	2.034	4	0.7294
3 : 145256955 : SNP	a	g	0.4986	0.0089	0.4919	0.5196	-0.0013	0.0085	0.8766	+0---	0.0	2.012	4	0.7336
19 : 32899074 : SNP	a	g	0.5346	0.0128	0.4941	0.5573	0.0067	0.0085	0.4324	++-+-	21.0	5.063	4	0.2809
5 : 109855751 : SNP	t	g	0.9062	0.0019	0.9035	0.9075	-0.0130	0.0515	0.8009	???-+	0.0	0.324	1	0.5691
19 : 57990094 : SNP	a	g	0.3562	0.0188	0.3434	0.3947	-0.0017	0.0091	0.8554	+--+-	44.6	7.220	4	0.1247
5 : 134992772 : SNP	a	g	0.0274	0.0000	0.0274	0.0274	-0.0540	0.0354	0.1269	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 29810668 : SNP	t	g	0.0387	0.0023	0.0355	0.0403	0.0293	0.0255	0.2514	++???	0.0	0.099	1	0.7531
3 : 61505973 : SNP	t	c	0.0518	0.0005	0.0514	0.0529	0.0162	0.0203	0.4257	++??+	0.0	0.005	2	0.9976
11 : 21656866 : SNP	a	g	0.4853	0.0124	0.4664	0.5244	-0.0045	0.0085	0.5941	+-++-	52.0	8.328	4	0.08029
6 : 29868392 : SNP	a	g	0.9203	0.0048	0.9121	0.9231	0.0008	0.0388	0.9825	???+-	0.0	0.030	1	0.8617
17 : 79092989 : SNP	t	c	0.8840	0.0205	0.8678	0.9177	-0.0116	0.0202	0.5681	--?--	0.0	0.303	3	0.9595
2 : 52137057 : SNP	a	t	0.2436	0.0017	0.2396	0.2478	-0.0126	0.0100	0.2081	+----	0.0	3.011	4	0.5559
2 : 188087666 : SNP	c	g	0.3308	0.0224	0.3083	0.3747	0.0064	0.0091	0.4843	+++-+	0.0	0.874	4	0.9283
7 : 34563394 : SNP	t	c	0.0451	0.0039	0.0417	0.0528	-0.0200	0.0220	0.3641	--??+	0.0	1.958	2	0.3757
9 : 136847542 : SNP	a	c	0.9008	0.0050	0.8934	0.9085	-0.0216	0.0163	0.1835	--?--	42.3	5.202	3	0.1576
8 : 102450006 : SNP	t	c	0.2362	0.0107	0.2257	0.2516	0.0056	0.0104	0.5888	-+-++	10.9	4.489	4	0.3438
2 : 229800742 : SNP	a	g	0.0595	0.0047	0.0528	0.0631	-0.0072	0.0205	0.7262	--??+	0.0	1.370	2	0.5041
2 : 27615389 : SNP	t	c	0.3733	0.0340	0.3012	0.4041	-0.0100	0.0092	0.2767	-+-+-	4.9	4.205	4	0.3789
15 : 34726556 : SNP	t	c	0.0896	0.0011	0.0889	0.0912	-0.0534	0.0458	0.2438	???--	0.0	0.024	1	0.8761
16 : 76907387 : SNP	t	c	0.3970	0.0068	0.3936	0.4229	-0.0154	0.0089	0.08268	---+-	0.0	3.702	4	0.4478
18 : 25379275 : SNP	a	g	0.7332	0.0151	0.7057	0.7759	0.0048	0.0098	0.6256	--+++	44.7	7.238	4	0.1238
22 : 21080404 : SNP	a	g	0.0709	0.0036	0.0601	0.0739	-0.0191	0.0187	0.3046	--?++	68.6	9.545	3	0.02286
17 : 38974072 : SNP	a	g	0.2348	0.0108	0.2090	0.2415	0.0107	0.0100	0.2851	++-+-	0.0	3.380	4	0.4964
14 : 29011540 : SNP	a	g	0.4343	0.0091	0.4284	0.4548	-0.0097	0.0085	0.2549	--+++	0.0	3.952	4	0.4125
11 : 44819484 : SNP	c	g	0.5321	0.0143	0.4856	0.5398	0.0056	0.0086	0.509	++--+	0.0	2.044	4	0.7276
11 : 134796387 : SNP	t	c	0.9081	0.0050	0.9059	0.9212	-0.0071	0.0151	0.6404	--?+-	0.0	0.406	3	0.939
22 : 43239093 : SNP	a	c	0.0335	0.0007	0.0330	0.0344	-0.0164	0.0271	0.5443	--???	0.0	0.128	1	0.7203
6 : 9892150 : SNP	a	g	0.8338	0.0142	0.8050	0.8473	0.0091	0.0118	0.4386	++---	0.0	1.171	4	0.8828
5 : 77522592 : SNP	a	g	0.3343	0.0111	0.3238	0.3658	0.0111	0.0090	0.2172	+++--	14.2	4.665	4	0.3235
16 : 56881644 : SNP	a	t	0.8264	0.0171	0.8092	0.8660	-0.0004	0.0114	0.9745	-+---	14.7	4.689	4	0.3208
9 : 19021874 : SNP	a	g	0.9742	0.0000	0.9742	0.9742	0.0240	0.0455	0.5978	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 12907335 : SNP	a	c	0.3315	0.0047	0.3248	0.3360	0.0011	0.0092	0.9037	+--+-	0.0	2.955	4	0.5654
16 : 59030917 : SNP	t	c	0.6054	0.0200	0.5761	0.6220	0.0052	0.0106	0.6209	-+-++	0.0	1.363	4	0.8506
5 : 32564547 : SNP	a	c	0.4967	0.0090	0.4795	0.5143	0.0067	0.0085	0.4339	++-+-	0.0	1.493	4	0.8279
5 : 33599761 : SNP	a	g	0.4488	0.0113	0.4234	0.4571	-0.0000	0.0085	0.9962	+-++-	23.0	5.195	4	0.2679
1 : 213112667 : SNP	a	g	0.9448	0.0076	0.9324	0.9542	0.0188	0.0229	0.412	++??+	0.0	0.312	2	0.8558
4 : 61467943 : SNP	t	c	0.9095	0.0037	0.9067	0.9239	0.0215	0.0152	0.1558	+0?++	0.0	2.540	3	0.4682
10 : 89814925 : SNP	a	g	0.5805	0.0030	0.5776	0.5914	0.0133	0.0085	0.1208	++---	56.1	9.109	4	0.05843
19 : 34089932 : SNP	t	c	0.3077	0.0159	0.2922	0.3420	0.0076	0.0091	0.4056	+++++	0.0	0.555	4	0.968
7 : 85485277 : SNP	t	c	0.4103	0.0050	0.4059	0.4213	-0.0015	0.0086	0.8575	-+---	14.6	4.686	4	0.3211
1 : 79282848 : SNP	a	g	0.6422	0.0037	0.6271	0.6440	-0.0056	0.0091	0.5371	-+--+	0.0	1.651	4	0.7996
9 : 25369118 : SNP	a	g	0.8453	0.0104	0.8115	0.8515	-0.0032	0.0119	0.7862	-+-+-	0.0	1.469	4	0.8321
1 : 73630073 : SNP	a	c	0.5079	0.0100	0.4880	0.5428	-0.0051	0.0085	0.5517	-0-++	0.0	2.242	4	0.6914
19 : 9169264 : SNP	a	g	0.2385	0.0101	0.2122	0.2583	-0.0143	0.0104	0.1702	----+	0.0	2.013	4	0.7333
16 : 80550797 : SNP	t	c	0.0700	0.0101	0.0518	0.0813	-0.0118	0.0183	0.5195	+-??-	49.5	3.963	2	0.1379
2 : 160123107 : SNP	t	c	0.0159	0.0000	0.0159	0.0159	-0.0380	0.0505	0.4522	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 113748216 : SNP	t	c	0.7476	0.0047	0.7388	0.7533	0.0246	0.0098	0.01221	+++++	0.0	1.850	4	0.7633
8 : 90685450 : SNP	a	g	0.1387	0.0154	0.1155	0.1598	0.0095	0.0130	0.4618	+-+-+	0.0	0.308	4	0.9893
15 : 100604020 : SNP	a	g	0.1385	0.0068	0.1286	0.1538	-0.0073	0.0127	0.5666	---+-	38.6	6.511	4	0.1641
13 : 74156765 : INDEL	i	r	0.5524	0.0105	0.5142	0.5705	0.0082	0.0086	0.3417	+++++	0.0	1.245	4	0.8706
12 : 71646168 : SNP	a	g	0.4304	0.0179	0.4134	0.4674	0.0004	0.0085	0.9627	+---+	30.5	5.755	4	0.2182
11 : 48798084 : SNP	t	c	0.8995	0.0193	0.8673	0.9144	-0.0017	0.0309	0.9571	??-+-	4.8	2.101	2	0.3497
3 : 173320708 : SNP	a	g	0.9050	0.0052	0.8934	0.9092	0.0047	0.0148	0.7526	+0?--	0.0	1.182	3	0.7573
6 : 67583503 : INDEL	d	r	0.0215	0.0000	0.0215	0.0215	0.0000	0.0526	1	0????	0.0	0.000	0	1
12 : 21139117 : SNP	a	g	0.0569	0.0043	0.0528	0.0674	0.0382	0.0190	0.04404	++?--	6.3	3.200	3	0.3617
20 : 37589987 : SNP	a	g	0.8665	0.0046	0.8565	0.8772	0.0118	0.0125	0.3458	-+-++	25.2	5.347	4	0.2535
1 : 71162456 : SNP	t	c	0.9642	0.0015	0.9627	0.9664	-0.0271	0.0242	0.2619	-+??-	0.0	1.049	2	0.5919
1 : 230310749 : SNP	a	g	0.1043	0.0074	0.0777	0.1085	0.0334	0.0149	0.02481	+++++	0.0	3.888	4	0.4214
1 : 237258172 : SNP	a	t	0.4777	0.0150	0.4534	0.4906	0.0030	0.0091	0.7368	+--+-	0.0	1.099	4	0.8945
6 : 161566034 : SNP	t	g	0.8761	0.0025	0.8730	0.8830	-0.0070	0.0129	0.587	---++	37.4	6.386	4	0.1721
7 : 67636161 : SNP	t	c	0.2081	0.0121	0.1829	0.2172	-0.0066	0.0108	0.5422	----+	0.0	1.961	4	0.7429
2 : 239888961 : INDEL	i	r	0.8267	0.0109	0.8152	0.8480	0.0022	0.0115	0.8469	+-+--	0.0	3.288	4	0.5109
9 : 81120024 : SNP	a	g	0.9431	0.0035	0.9325	0.9459	0.0271	0.0184	0.1411	++?--	21.8	3.837	3	0.2797
12 : 22990142 : SNP	a	g	0.1965	0.0130	0.1864	0.2372	-0.0137	0.0110	0.2106	--+-+	0.0	2.127	4	0.7124
4 : 10724736 : SNP	a	g	0.1046	0.0146	0.0618	0.1186	-0.0387	0.0143	0.006797	-----	64.0	11.110	4	0.02535
15 : 79269226 : SNP	t	g	0.0197	0.0000	0.0197	0.0197	-0.0880	0.0455	0.05305	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 81208191 : SNP	a	g	0.7554	0.0140	0.7459	0.7946	-0.0058	0.0101	0.5642	--+-+	10.1	4.451	4	0.3484
13 : 111225685 : SNP	c	g	0.1091	0.0151	0.0827	0.1205	0.0277	0.0182	0.1284	++?++	0.0	1.146	3	0.7661
22 : 28013122 : SNP	t	c	0.7926	0.0097	0.7854	0.8209	-0.0078	0.0104	0.4514	-+++-	41.6	6.847	4	0.1442
6 : 77839871 : SNP	a	g	0.1343	0.0033	0.1316	0.1443	-0.0100	0.0131	0.4435	--++-	5.9	4.250	4	0.3732
8 : 32540660 : SNP	a	g	0.6051	0.0148	0.5842	0.6261	-0.0036	0.0086	0.6709	+--+-	0.0	2.391	4	0.6642
5 : 107137158 : SNP	t	c	0.6337	0.0110	0.6124	0.6509	-0.0127	0.0093	0.1712	--+--	0.0	3.056	4	0.5485
9 : 115906465 : SNP	a	t	0.6914	0.0183	0.6520	0.7069	-0.0035	0.0095	0.7116	-++++	0.0	3.059	4	0.5479
10 : 11473517 : SNP	c	g	0.2165	0.0157	0.2081	0.2559	-0.0144	0.0105	0.1714	--+--	0.0	2.231	4	0.6933
4 : 108985388 : SNP	a	g	0.0888	0.0113	0.0599	0.0944	0.0033	0.0153	0.8317	-+-+-	0.0	3.319	4	0.5059
1 : 70929756 : SNP	t	c	0.0515	0.0022	0.0494	0.0544	0.0091	0.0214	0.6699	++??-	80.8	10.409	2	0.005491
3 : 97941822 : SNP	a	c	0.4760	0.0135	0.4440	0.4845	-0.0016	0.0085	0.8517	--++-	0.0	1.444	4	0.8365
4 : 101481113 : SNP	t	c	0.2878	0.0116	0.2560	0.3293	-0.0143	0.0099	0.1476	----?	0.0	2.170	3	0.5379
7 : 138412419 : SNP	t	c	0.7483	0.0056	0.7423	0.7552	-0.0054	0.0132	0.6815	+-++-	0.0	1.578	4	0.8127
1 : 240403189 : SNP	a	c	0.7110	0.0140	0.6838	0.7220	-0.0027	0.0095	0.7756	+-+--	0.0	1.062	4	0.9003
13 : 33587717 : SNP	a	g	0.5683	0.0059	0.5497	0.5751	-0.0142	0.0085	0.09631	-+--+	9.9	4.438	4	0.35
2 : 121817632 : SNP	c	g	0.7707	0.0149	0.7387	0.7872	-0.0055	0.0116	0.634	---++	0.0	0.610	4	0.962
9 : 14183860 : SNP	t	c	0.1332	0.0147	0.1113	0.1620	0.0039	0.0127	0.7617	-++-+	0.0	2.550	4	0.6358
4 : 45065871 : SNP	t	c	0.1311	0.0137	0.1244	0.1614	0.0028	0.0126	0.8234	+--+-	35.5	6.201	4	0.1846
15 : 31280001 : SNP	c	g	0.0530	0.0025	0.0491	0.0547	-0.0414	0.0199	0.03749	--??-	0.0	1.627	2	0.4434
7 : 50720271 : SNP	a	c	0.6654	0.0077	0.6368	0.6817	-0.0035	0.0091	0.7018	+---+	43.2	7.048	4	0.1334
13 : 81191819 : SNP	t	c	0.0299	0.0072	0.0242	0.0423	-0.0421	0.0283	0.137	--??-	0.0	1.083	2	0.5818
10 : 2706013 : SNP	a	g	0.6655	0.0162	0.6469	0.7165	-0.0071	0.0092	0.4439	-----	0.0	1.063	4	0.9001
11 : 29261942 : SNP	a	g	0.8449	0.0088	0.8296	0.8532	-0.0067	0.0118	0.5693	---++	0.0	1.950	4	0.745
2 : 194753744 : SNP	a	c	0.0846	0.0070	0.0707	0.0903	-0.0416	0.0157	0.007908	--?--	0.0	1.393	3	0.7072
9 : 74903555 : INDEL	i	r	0.6700	0.0196	0.6480	0.7141	0.0037	0.0093	0.6923	+--+-	0.0	1.323	4	0.8575
9 : 121934289 : SNP	a	g	0.9777	0.0000	0.9777	0.9777	0.0000	0.0526	1	0????	0.0	0.000	0	1
2 : 205995565 : SNP	c	g	0.0541	0.0078	0.0410	0.0638	-0.0001	0.0204	0.9947	--??+	15.4	2.364	2	0.3066
10 : 43310041 : SNP	t	g	0.6898	0.0086	0.6834	0.7085	0.0145	0.0095	0.128	+--++	0.0	2.583	4	0.6298
5 : 178266158 : SNP	t	g	0.8323	0.0069	0.8223	0.8420	-0.0126	0.0150	0.4014	----+	0.0	1.893	4	0.7554
1 : 84724642 : SNP	a	g	0.7148	0.0132	0.6866	0.7313	0.0086	0.0097	0.3749	-++++	0.0	3.800	4	0.4337
9 : 115963016 : SNP	t	g	0.1888	0.0051	0.1832	0.1991	0.0119	0.0110	0.2794	++---	0.0	3.418	4	0.4905
13 : 68372229 : SNP	a	c	0.0151	0.0000	0.0151	0.0151	0.0660	0.0576	0.252	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 144213310 : SNP	a	g	0.0207	0.0000	0.0207	0.0207	-0.0830	0.0526	0.1143	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 162216691 : SNP	t	c	0.0142	0.0000	0.0142	0.0142	0.0370	0.0576	0.5208	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 126176043 : SNP	a	g	0.4448	0.0089	0.4211	0.4589	-0.0090	0.0086	0.2944	-+---	29.6	5.679	4	0.2245
2 : 221980945 : SNP	a	g	0.0496	0.0039	0.0454	0.0533	0.0063	0.0273	0.8187	++???	0.0	0.016	1	0.8983
10 : 56021632 : SNP	a	g	0.0139	0.0000	0.0139	0.0139	-0.0550	0.0637	0.3878	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 32501006 : SNP	t	c	0.9226	0.0071	0.9177	0.9329	-0.0296	0.0183	0.1057	--???	0.0	0.129	1	0.7195
8 : 105300632 : SNP	a	g	0.0328	0.0000	0.0328	0.0328	0.0200	0.0344	0.5606	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 39116825 : SNP	t	g	0.8348	0.0083	0.8274	0.8466	-0.0139	0.0115	0.2263	--+--	35.7	6.216	4	0.1836
2 : 31738219 : SNP	t	c	0.5172	0.0186	0.5037	0.5598	-0.0036	0.0085	0.674	+----	0.0	1.907	4	0.7528
16 : 27853481 : SNP	t	c	0.3479	0.0089	0.3330	0.3564	-0.0077	0.0113	0.4963	-++--	29.8	5.695	4	0.2231
7 : 113005941 : SNP	a	g	0.3553	0.0183	0.3402	0.3890	0.0039	0.0090	0.6645	+-+++	0.0	3.049	4	0.5496
5 : 141740620 : SNP	c	g	0.7548	0.0120	0.7313	0.7650	0.0141	0.0100	0.1558	-++++	0.0	3.794	4	0.4345
9 : 101351305 : SNP	a	g	0.0444	0.0065	0.0387	0.0518	-0.0016	0.0251	0.9505	-+???	70.4	3.380	1	0.066
10 : 26606616 : SNP	t	c	0.1881	0.0038	0.1825	0.1929	-0.0004	0.0110	0.9705	-++++	0.0	2.100	4	0.7173
20 : 20797014 : SNP	a	g	0.1538	0.0059	0.1303	0.1590	-0.0146	0.0120	0.2208	--+-+	0.0	2.338	4	0.6739
19 : 36991917 : SNP	t	c	0.1373	0.0159	0.0997	0.1472	0.0090	0.0128	0.482	+++--	0.0	3.743	4	0.4419
10 : 110256292 : INDEL	i	r	0.0522	0.0048	0.0408	0.0558	0.0234	0.0239	0.3275	++??+	0.0	0.066	2	0.9674
2 : 14827023 : SNP	t	c	0.0469	0.0031	0.0415	0.0489	-0.0244	0.0217	0.2605	-+??-	0.0	1.598	2	0.4498
10 : 102315709 : INDEL	d	r	0.2139	0.0083	0.1981	0.2240	0.0002	0.0105	0.9866	+---+	4.5	4.189	4	0.381
4 : 180669418 : SNP	t	c	0.9192	0.0063	0.9045	0.9233	0.0131	0.0161	0.4175	+++--	0.0	2.680	4	0.6127
5 : 2766767 : SNP	t	c	0.2354	0.0262	0.2154	0.2894	0.0036	0.0108	0.7378	+-++-	48.8	7.820	4	0.0984
8 : 49214425 : SNP	t	c	0.0227	0.0000	0.0227	0.0227	-0.0060	0.0425	0.8876	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 22792360 : INDEL	i	r	0.0175	0.0000	0.0175	0.0175	-0.0160	0.0576	0.7813	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 28713556 : SNP	a	g	0.1209	0.0039	0.1154	0.1288	0.0135	0.0138	0.3272	-+++-	0.0	3.613	4	0.4608
11 : 110002744 : SNP	a	g	0.2970	0.0194	0.2696	0.3273	-0.0069	0.0094	0.4577	-++-+	35.2	6.176	4	0.1864
10 : 115248259 : SNP	a	c	0.9100	0.0074	0.9039	0.9287	-0.0093	0.0151	0.5353	--+-+	27.5	5.517	4	0.2382
13 : 71953215 : SNP	t	c	0.4718	0.0041	0.4675	0.4884	-0.0034	0.0085	0.6931	+--+-	30.2	5.728	4	0.2204
2 : 20738759 : SNP	a	g	0.2727	0.0215	0.2567	0.3178	-0.0042	0.0098	0.6635	-+---	0.0	2.702	4	0.6089
13 : 78820004 : SNP	t	c	0.9128	0.0055	0.9007	0.9185	-0.0028	0.0157	0.8591	-+?++	0.0	2.397	3	0.4942
20 : 14140502 : SNP	t	g	0.0338	0.0003	0.0334	0.0340	-0.0297	0.0270	0.271	-+???	55.3	2.235	1	0.1349
4 : 127028078 : SNP	t	c	0.9400	0.0051	0.9367	0.9538	-0.0060	0.0188	0.7516	--??+	0.0	0.472	2	0.7897
2 : 147587487 : SNP	a	g	0.8032	0.0093	0.7755	0.8152	-0.0011	0.0107	0.9203	-0-++	0.0	0.505	4	0.973
17 : 6035660 : SNP	c	g	0.2323	0.0207	0.2155	0.2733	-0.0057	0.0104	0.5852	+---+	0.0	2.171	4	0.7044
6 : 32187637 : SNP	t	g	0.1211	0.0215	0.0723	0.1316	0.0471	0.0311	0.1299	?+++?	0.0	0.188	2	0.9104
7 : 156224087 : SNP	t	c	0.0176	0.0000	0.0176	0.0176	0.1160	0.0475	0.01462	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 163415855 : SNP	a	c	0.6265	0.0135	0.5984	0.6364	0.0029	0.0087	0.7433	+-+--	0.0	3.454	4	0.4849
3 : 163120551 : SNP	a	g	0.0629	0.0061	0.0544	0.0680	-0.0107	0.0184	0.5603	+-?-+	43.3	5.291	3	0.1517
15 : 47743734 : SNP	t	c	0.6048	0.0063	0.5988	0.6168	-0.0046	0.0085	0.5944	+--++	19.6	4.976	4	0.2897
1 : 198484407 : SNP	a	g	0.1946	0.0170	0.1820	0.2297	0.0164	0.0105	0.1195	++++-	19.1	4.946	4	0.2929
6 : 63976704 : SNP	c	g	0.4919	0.0117	0.4812	0.5084	-0.0030	0.0085	0.7212	-+++-	0.0	2.147	4	0.7088
1 : 58311591 : SNP	t	g	0.5516	0.0161	0.5167	0.5673	0.0010	0.0085	0.9086	-+-+-	0.0	1.652	4	0.7994
15 : 33410543 : INDEL	i	r	0.7249	0.0081	0.7084	0.7383	-0.0041	0.0097	0.6734	-++--	0.0	1.838	4	0.7655
11 : 13614841 : SNP	t	g	0.3617	0.0088	0.3392	0.3719	0.0126	0.0091	0.1673	+--++	0.0	2.986	4	0.5602
3 : 115417773 : SNP	a	g	0.2400	0.0079	0.2340	0.2567	0.0071	0.0104	0.4954	+0++-	0.0	3.259	4	0.5155
10 : 27489925 : INDEL	d	r	0.7626	0.0097	0.7393	0.7675	0.0025	0.0100	0.8012	++-++	0.0	2.376	4	0.667
6 : 19794585 : SNP	a	g	0.4733	0.0119	0.4512	0.4908	-0.0036	0.0086	0.6738	-+-++	0.0	3.063	4	0.5474
2 : 149337431 : SNP	t	c	0.8248	0.0072	0.8186	0.8348	0.0017	0.0112	0.882	----+	0.0	2.999	4	0.5579
6 : 157128282 : SNP	c	g	0.3020	0.0077	0.2828	0.3062	0.0142	0.0101	0.1575	+-+++	0.0	3.924	4	0.4164
14 : 36702832 : INDEL	d	r	0.3105	0.0083	0.2702	0.3181	0.0113	0.0093	0.2247	+++--	0.0	1.573	4	0.8136
2 : 98907475 : SNP	a	c	0.9328	0.0062	0.9297	0.9512	-0.0058	0.0181	0.7471	--??-	0.0	0.014	2	0.993
20 : 55716189 : SNP	t	c	0.0529	0.0083	0.0374	0.0627	-0.0144	0.0205	0.4827	-+??-	19.3	2.478	2	0.2897
4 : 79287631 : SNP	a	g	0.3311	0.0203	0.3143	0.3699	0.0107	0.0090	0.2389	++++-	66.4	11.902	4	0.0181
2 : 22212485 : SNP	a	g	0.5150	0.0115	0.4879	0.5230	-0.0044	0.0118	0.7106	++++-	39.3	6.590	4	0.1592
2 : 184344438 : SNP	a	g	0.9190	0.0088	0.9057	0.9329	-0.0089	0.0213	0.6749	+-?--	0.0	0.672	3	0.8797
2 : 142421345 : SNP	t	c	0.0197	0.0000	0.0197	0.0197	0.0600	0.0435	0.1675	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 3034595 : SNP	t	c	0.2025	0.0057	0.1869	0.2147	0.0049	0.0115	0.6705	+++--	0.0	0.724	4	0.9483
12 : 130890396 : SNP	a	g	0.7844	0.0112	0.7769	0.8186	-0.0119	0.0108	0.2718	----+	0.0	2.228	4	0.6938
11 : 102068240 : INDEL	i	r	0.3557	0.0068	0.3522	0.3730	-0.0058	0.0091	0.5249	-+---	0.0	0.972	4	0.9141
19 : 44109067 : SNP	a	g	0.0618	0.0000	0.0618	0.0618	0.0180	0.0313	0.5657	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 3654431 : SNP	a	g	0.5794	0.0120	0.5500	0.5958	-0.0093	0.0096	0.3288	--+--	32.3	5.912	4	0.2059
1 : 111664885 : SNP	t	c	0.9594	0.0000	0.9594	0.9594	-0.0660	0.0384	0.08576	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 55722648 : SNP	a	g	0.9161	0.0037	0.9054	0.9200	0.0040	0.0156	0.7968	-++-+	0.0	2.332	4	0.6749
20 : 10720229 : SNP	a	g	0.5313	0.0189	0.4865	0.5439	-0.0016	0.0090	0.8636	0+---	52.9	8.495	4	0.07505
2 : 127753697 : SNP	a	g	0.0671	0.0056	0.0522	0.0700	-0.0066	0.0193	0.7328	+-??+	23.8	2.624	2	0.2692
9 : 17421338 : SNP	t	c	0.9893	0.0000	0.9893	0.9893	0.0240	0.0627	0.7018	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 120475992 : SNP	t	g	0.9079	0.0075	0.8972	0.9186	0.0051	0.0146	0.7266	0+---	0.0	2.510	4	0.6428
1 : 41245078 : INDEL	d	r	0.7587	0.0069	0.7462	0.7677	-0.0072	0.0102	0.4791	-++--	0.0	1.937	4	0.7473
17 : 68697662 : SNP	t	c	0.9873	0.0000	0.9873	0.9873	-0.0660	0.0556	0.2352	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 49496316 : SNP	t	g	0.3423	0.0151	0.3005	0.3537	-0.0011	0.0099	0.9093	-+-+-	0.0	0.922	4	0.9214
1 : 51833554 : SNP	a	g	0.0266	0.0072	0.0192	0.0336	0.0477	0.0316	0.132	++???	0.0	0.399	1	0.5275
13 : 100022758 : SNP	t	c	0.2657	0.0239	0.2531	0.3164	0.0020	0.0097	0.8339	+-+-+	31.1	5.806	4	0.2141
9 : 1261774 : SNP	t	g	0.0516	0.0000	0.0516	0.0516	0.0270	0.0364	0.4581	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 102243415 : SNP	t	c	0.7995	0.0002	0.7991	0.7996	-0.0554	0.0358	0.1219	???--	0.0	0.016	1	0.9008
11 : 320836 : SNP	t	c	0.3874	0.0170	0.3631	0.4081	0.0199	0.0170	0.2424	?-+-+	59.5	7.400	3	0.06017
3 : 46455754 : SNP	t	c	0.8503	0.0124	0.8426	0.8764	-0.0027	0.0125	0.8296	++---	31.7	5.858	4	0.21
5 : 28623179 : SNP	t	g	0.0365	0.0020	0.0352	0.0409	0.0263	0.0250	0.2925	+-??+	52.0	4.169	2	0.1244
4 : 62121122 : SNP	a	t	0.7415	0.0095	0.7184	0.7518	0.0086	0.0099	0.3858	+---+	0.0	2.508	4	0.6433
3 : 67419186 : SNP	t	c	0.1461	0.0101	0.1309	0.1661	0.0079	0.0148	0.5958	++-+-	56.9	9.283	4	0.05441
4 : 118903376 : SNP	a	g	0.3202	0.0192	0.2940	0.3515	0.0182	0.0091	0.04628	++-++	50.5	8.076	4	0.08883
13 : 107473887 : SNP	t	c	0.0469	0.0027	0.0426	0.0492	-0.0039	0.0211	0.8536	--??+	0.0	0.008	2	0.9958
8 : 101816646 : SNP	t	c	0.5074	0.0169	0.4853	0.5458	-0.0015	0.0085	0.862	+--++	14.8	4.692	4	0.3204
8 : 84359518 : SNP	a	g	0.0813	0.0131	0.0655	0.1020	0.0088	0.0163	0.5868	++?-+	0.0	1.772	3	0.621
5 : 26251810 : SNP	a	t	0.0630	0.0069	0.0567	0.0841	0.0049	0.0206	0.8125	0-?++	0.0	1.681	3	0.6412
3 : 143596216 : SNP	a	g	0.0256	0.0063	0.0214	0.0349	0.0461	0.0352	0.19	+???+	17.6	1.214	1	0.2706
5 : 100957908 : SNP	t	c	0.9884	0.0000	0.9884	0.9884	0.0690	0.0576	0.2311	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 105657316 : SNP	c	g	0.9012	0.0050	0.8865	0.9133	-0.0240	0.0143	0.0947	---+-	0.0	3.185	4	0.5273
10 : 76658582 : INDEL	i	r	0.1130	0.0045	0.1005	0.1171	0.0163	0.0135	0.229	+++++	0.0	1.604	4	0.808
14 : 22698624 : SNP	a	g	0.7895	0.0116	0.7814	0.8180	0.0151	0.0105	0.1519	+++-+	0.0	1.775	4	0.777
1 : 158589482 : SNP	t	c	0.9778	0.0000	0.9778	0.9778	-0.0610	0.0455	0.1799	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 42020347 : SNP	a	g	0.2204	0.0195	0.2097	0.2604	0.0053	0.0105	0.6107	+--++	20.2	5.010	4	0.2863
13 : 43476748 : SNP	t	c	0.7388	0.0053	0.7232	0.7418	-0.0108	0.0099	0.2777	+----	43.0	7.018	4	0.135
18 : 33814742 : SNP	t	c	0.4152	0.0231	0.3914	0.4640	0.0003	0.0090	0.9761	++---	59.8	9.957	4	0.04115
1 : 170925768 : SNP	a	g	0.0830	0.0058	0.0781	0.0932	0.0062	0.0170	0.7167	+-?-+	10.6	3.354	3	0.3401
6 : 36909620 : SNP	t	c	0.1321	0.0088	0.1189	0.1428	-0.0040	0.0159	0.7997	-+---	0.0	2.861	4	0.5813
1 : 176816410 : SNP	t	c	0.5480	0.0224	0.5165	0.5700	0.0020	0.0085	0.816	-+--+	0.0	3.635	4	0.4576
2 : 28556276 : SNP	a	g	0.9091	0.0144	0.8833	0.9212	0.0074	0.0150	0.6239	++--+	0.0	2.278	4	0.6848
5 : 131471860 : SNP	t	c	0.0891	0.0037	0.0786	0.0928	0.0099	0.0155	0.5236	-+?+-	50.5	6.060	3	0.1087
18 : 11007139 : SNP	t	g	0.9871	0.0000	0.9871	0.9871	-0.1350	0.0566	0.01709	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 13379281 : SNP	a	g	0.0874	0.0000	0.0874	0.0874	0.0135	0.0619	0.8274	????+	0.0	0.000	0	1
8 : 27003454 : SNP	a	g	0.0912	0.0159	0.0800	0.1205	-0.0199	0.0150	0.1841	--++-	0.0	3.572	4	0.467
8 : 6262572 : SNP	t	c	0.8758	0.0110	0.8555	0.8943	-0.0047	0.0142	0.7414	---+-	0.0	1.695	4	0.7917
4 : 42178776 : INDEL	d	r	0.0535	0.0000	0.0535	0.0535	0.0350	0.0374	0.3494	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 7606970 : SNP	a	c	0.0282	0.0000	0.0282	0.0282	-0.0760	0.0505	0.1327	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 177822663 : SNP	a	t	0.0129	0.0000	0.0129	0.0129	0.0250	0.0596	0.6751	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 33871211 : SNP	t	g	0.0111	0.0000	0.0111	0.0111	-0.0030	0.0556	0.957	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 86266000 : SNP	t	c	0.5122	0.0089	0.4883	0.5233	-0.0036	0.0085	0.6704	--+--	0.0	1.396	4	0.8448
10 : 90229789 : SNP	t	g	0.4540	0.0101	0.4412	0.4765	0.0084	0.0085	0.3219	++---	0.0	1.203	4	0.8776
16 : 11519579 : SNP	a	c	0.2497	0.0121	0.2276	0.2702	0.0193	0.0112	0.08536	+++++	0.0	1.664	4	0.7972
4 : 116560690 : SNP	a	c	0.1371	0.0144	0.1287	0.1729	-0.0097	0.0125	0.4348	+--+-	0.0	2.932	4	0.5693
4 : 89059819 : SNP	t	c	0.1753	0.0117	0.1677	0.2059	0.0004	0.0112	0.9708	-+-++	6.2	4.263	4	0.3716
7 : 10180062 : SNP	a	c	0.9852	0.0000	0.9852	0.9852	0.0610	0.0516	0.2367	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 173220426 : SNP	c	g	0.1209	0.0035	0.1145	0.1239	-0.0069	0.0134	0.6065	----+	0.0	1.595	4	0.8098
13 : 87059659 : SNP	a	g	0.2167	0.0034	0.2090	0.2213	-0.0080	0.0101	0.4292	--+--	0.0	1.578	4	0.8127
7 : 22108876 : SNP	c	g	0.4748	0.0152	0.4443	0.4849	-0.0058	0.0086	0.5008	+---+	53.8	8.663	4	0.0701
11 : 128200225 : SNP	a	g	0.2576	0.0181	0.2442	0.2947	-0.0156	0.0097	0.1081	-----	0.0	0.301	4	0.9898
16 : 71574281 : SNP	t	c	0.0380	0.0028	0.0358	0.0415	0.0256	0.0285	0.3696	++???	0.0	0.182	1	0.6701
6 : 128214882 : SNP	a	g	0.4414	0.0063	0.4356	0.4520	-0.0153	0.0085	0.0717	----+	49.3	7.883	4	0.09596
5 : 32705431 : SNP	a	g	0.7480	0.0048	0.7388	0.7533	0.0138	0.0101	0.172	-++-+	44.8	7.247	4	0.1234
11 : 36228771 : SNP	t	c	0.0803	0.0237	0.0574	0.1180	-0.0212	0.0162	0.1911	--+-+	13.8	4.639	4	0.3264
9 : 129082935 : SNP	t	c	0.1963	0.0271	0.1796	0.2536	-0.0003	0.0110	0.9801	-+-++	1.2	4.049	4	0.3994
1 : 15353612 : SNP	c	g	0.5472	0.0125	0.5220	0.5606	0.0173	0.0091	0.05855	++--+	59.4	9.845	4	0.04312
4 : 186079023 : SNP	a	g	0.4684	0.0158	0.4544	0.5032	-0.0162	0.0091	0.07318	----+	2.9	4.121	4	0.3899
10 : 122342079 : INDEL	i	r	0.5701	0.0106	0.5512	0.5837	0.0084	0.0086	0.3238	++---	9.6	4.426	4	0.3514
13 : 108033035 : SNP	t	c	0.1238	0.0129	0.1025	0.1324	-0.0297	0.0195	0.1277	-+?--	0.0	2.247	3	0.5227
16 : 85242361 : SNP	t	c	0.1277	0.0041	0.1114	0.1342	-0.0256	0.0138	0.06249	----+	48.1	7.713	4	0.1027
20 : 58087444 : SNP	a	t	0.9845	0.0000	0.9845	0.9845	0.0180	0.0556	0.7461	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 37210633 : SNP	t	g	0.2938	0.0072	0.2849	0.3160	0.0040	0.0094	0.6711	---++	0.0	3.598	4	0.4631
15 : 48172407 : INDEL	d	r	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	-0.0530	0.0586	0.366	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 154461547 : SNP	a	c	0.2312	0.0134	0.1735	0.2385	0.0090	0.0102	0.3794	+-+-+	42.0	6.896	4	0.1415
1 : 239608402 : SNP	a	g	0.2726	0.0079	0.2654	0.2945	-0.0114	0.0098	0.2408	----+	0.0	1.043	4	0.9033
12 : 18201921 : SNP	a	t	0.0118	0.0000	0.0118	0.0118	-0.0050	0.0546	0.927	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 108118498 : SNP	a	g	0.0627	0.0067	0.0542	0.0803	0.0259	0.0183	0.156	++?++	0.0	2.230	3	0.5261
5 : 13180860 : SNP	t	c	0.9686	0.0000	0.9686	0.9686	0.0130	0.0526	0.8047	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 174746813 : SNP	t	c	0.0721	0.0027	0.0692	0.0814	-0.0088	0.0168	0.5997	-+?--	29.4	4.251	3	0.2356
6 : 7778704 : INDEL	d	r	0.2970	0.0048	0.2896	0.3114	0.0008	0.0094	0.9364	-++++	0.0	3.083	4	0.544
12 : 83394208 : SNP	t	c	0.1102	0.0034	0.1019	0.1129	-0.0124	0.0140	0.3775	-----	0.0	1.836	4	0.7659
7 : 102419304 : SNP	a	c	0.3401	0.0110	0.3314	0.3638	-0.0160	0.0203	0.431	??-+-	6.2	2.132	2	0.3445
11 : 34923321 : SNP	t	c	0.6564	0.0196	0.6396	0.6980	0.0038	0.0090	0.6721	--+-+	31.9	5.875	4	0.2087
12 : 41822202 : SNP	a	t	0.9333	0.0069	0.9100	0.9378	0.0227	0.0177	0.199	++?--	0.9	3.029	3	0.3872
2 : 99454227 : SNP	a	g	0.5765	0.0142	0.5378	0.5913	-0.0194	0.0085	0.0229	----+	0.0	2.100	4	0.7174
14 : 102978272 : SNP	a	t	0.0228	0.0000	0.0228	0.0228	0.0420	0.0425	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 110322709 : INDEL	i	r	0.2742	0.0083	0.2654	0.2977	0.0005	0.0181	0.9797	?+-+-	0.0	1.383	3	0.7096
15 : 55588296 : SNP	a	g	0.0625	0.0066	0.0512	0.0687	-0.0036	0.0180	0.8402	-+?++	71.5	10.529	3	0.01457
15 : 31166132 : SNP	t	g	0.9727	0.0000	0.9727	0.9727	-0.0210	0.0526	0.6895	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 58035765 : SNP	t	g	0.6637	0.0363	0.6456	0.7461	0.0017	0.0091	0.8535	++---	33.2	5.985	4	0.2002
15 : 49065689 : SNP	t	c	0.8719	0.0207	0.8471	0.9066	0.0070	0.0130	0.5891	+---+	65.1	11.475	4	0.02171
20 : 31511578 : SNP	a	g	0.0444	0.0027	0.0384	0.0459	0.0485	0.0241	0.04373	++??+	0.0	0.026	2	0.9872
8 : 11709899 : SNP	c	g	0.0275	0.0072	0.0226	0.0379	0.0065	0.0341	0.8485	+???-	0.0	0.994	1	0.3188
4 : 7482583 : SNP	t	c	0.0923	0.0094	0.0790	0.1048	-0.0002	0.0145	0.9909	+-+--	27.5	5.514	4	0.2385
1 : 227224410 : INDEL	d	r	0.1375	0.0080	0.1279	0.1515	0.0045	0.0127	0.7226	+-+--	0.0	2.509	4	0.643
17 : 33064484 : SNP	a	g	0.7266	0.0026	0.7212	0.7322	0.0106	0.0097	0.2748	+++--	0.0	2.535	4	0.6383
12 : 127434664 : SNP	t	g	0.0459	0.0042	0.0401	0.0489	0.0090	0.0280	0.7468	+-???	0.0	0.998	1	0.3178
15 : 38808168 : SNP	c	g	0.1219	0.0108	0.0987	0.1344	-0.0231	0.0149	0.1212	-0--+	0.0	2.240	4	0.6916
18 : 446290 : SNP	a	g	0.9603	0.0009	0.9593	0.9617	0.0086	0.0229	0.7059	-+??-	0.0	0.753	2	0.6864
8 : 26539540 : SNP	a	g	0.1970	0.0127	0.1721	0.2224	0.0020	0.0109	0.8538	+---+	64.9	11.397	4	0.02244
9 : 17624126 : SNP	a	g	0.1527	0.0106	0.1423	0.1773	0.0137	0.0118	0.2464	++--+	35.7	6.223	4	0.1831
14 : 27418387 : SNP	a	c	0.8658	0.0122	0.8503	0.9074	0.0061	0.0138	0.6599	0+--+	0.0	0.436	4	0.9794
4 : 160181480 : SNP	a	g	0.0345	0.0049	0.0314	0.0421	-0.0431	0.0349	0.2167	-???-	0.0	0.295	1	0.5868
1 : 233245074 : SNP	t	c	0.0208	0.0000	0.0208	0.0208	-0.0080	0.0425	0.8505	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 101839969 : SNP	a	g	0.9519	0.0014	0.9502	0.9532	-0.0031	0.0213	0.8842	++??-	38.8	3.266	2	0.1953
4 : 25778508 : SNP	a	t	0.9269	0.0029	0.9257	0.9382	-0.0121	0.0184	0.5099	-+?--	0.0	2.142	3	0.5435
10 : 104983736 : SNP	c	g	0.0312	0.0024	0.0277	0.0348	-0.0576	0.0261	0.02737	--??-	0.0	1.241	2	0.5377
13 : 22263875 : SNP	t	c	0.6566	0.0093	0.6477	0.6707	0.0017	0.0092	0.8581	+-++-	0.0	1.977	4	0.74
11 : 91085714 : SNP	t	c	0.0643	0.0040	0.0588	0.0676	-0.0011	0.0187	0.9512	+-??+	0.0	1.952	2	0.3767
12 : 70146104 : INDEL	i	r	0.0840	0.0083	0.0634	0.0889	-0.0040	0.0155	0.7942	+-++-	0.0	3.056	4	0.5485
3 : 41055118 : SNP	t	c	0.5217	0.0114	0.5004	0.5660	-0.0166	0.0085	0.05187	-++--	60.4	10.093	4	0.03889
8 : 90468517 : SNP	a	g	0.3669	0.0173	0.3334	0.3885	0.0012	0.0098	0.9	++++-	0.0	3.005	4	0.557
8 : 131494220 : SNP	t	c	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	0.0120	0.0465	0.7964	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 56815075 : SNP	a	g	0.9457	0.0032	0.9435	0.9541	0.0093	0.0209	0.6547	-+??-	0.0	1.490	2	0.4748
7 : 26767430 : SNP	t	c	0.3368	0.0130	0.2778	0.3523	0.0023	0.0091	0.7977	++++-	51.8	8.294	4	0.08139
19 : 13089849 : SNP	t	c	0.0218	0.0000	0.0218	0.0218	-0.0570	0.0546	0.2964	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 23632621 : SNP	c	g	0.2373	0.0128	0.2276	0.2629	0.0076	0.0103	0.4618	+-+--	65.7	11.663	4	0.02004
22 : 29782433 : SNP	a	c	0.4456	0.0242	0.4267	0.4963	-0.0042	0.0085	0.6181	-+-+-	0.0	0.734	4	0.947
2 : 88640955 : SNP	a	g	0.9327	0.0078	0.9274	0.9525	-0.0141	0.0187	0.4514	-+??-	0.0	0.428	2	0.8074
1 : 7376671 : SNP	t	c	0.0805	0.0073	0.0742	0.1043	0.0024	0.0163	0.8817	-+?--	0.0	1.979	3	0.5768
6 : 9299700 : SNP	t	c	0.9478	0.0052	0.9440	0.9598	-0.0220	0.0202	0.275	-+??+	0.0	1.653	2	0.4375
6 : 81204826 : SNP	t	g	0.1003	0.0028	0.0968	0.1059	-0.0160	0.0181	0.3771	--?++	0.0	0.578	3	0.9016
13 : 61339036 : SNP	t	g	0.9093	0.0124	0.8713	0.9165	-0.0060	0.0149	0.6874	-+-++	50.5	8.074	4	0.0889
18 : 4402006 : SNP	t	c	0.0458	0.0006	0.0451	0.0463	-0.0337	0.0225	0.1337	+-???	80.3	5.075	1	0.02427
12 : 97837632 : SNP	t	g	0.0291	0.0001	0.0290	0.0292	0.0512	0.0281	0.06809	+-???	51.1	2.044	1	0.1528
19 : 52037597 : SNP	a	g	0.7682	0.0074	0.7494	0.7809	-0.0178	0.0099	0.07221	--+++	62.9	10.780	4	0.02915
7 : 10487144 : SNP	t	c	0.7401	0.0147	0.7281	0.7719	-0.0043	0.0099	0.66	-+---	45.6	7.353	4	0.1184
4 : 29547830 : SNP	t	c	0.7407	0.0093	0.7218	0.7491	0.0093	0.0098	0.3448	++---	0.0	0.828	4	0.9347
6 : 18346059 : SNP	a	g	0.8328	0.0142	0.8031	0.8638	0.0048	0.0114	0.6739	+-+-+	0.0	1.989	4	0.7379
11 : 25092090 : INDEL	d	r	0.5336	0.0125	0.5012	0.5419	0.0048	0.0085	0.5714	++-++	0.0	0.628	4	0.9599
10 : 80308378 : INDEL	d	r	0.3994	0.0190	0.3859	0.4398	0.0026	0.0091	0.777	++---	10.6	4.475	4	0.3456
7 : 9346632 : SNP	a	t	0.2604	0.0077	0.2469	0.2681	0.0061	0.0104	0.5563	-+++-	0.0	1.570	4	0.8142
19 : 33146414 : SNP	t	c	0.2951	0.0088	0.2776	0.3123	0.0020	0.0092	0.8284	-++--	8.9	4.393	4	0.3554
4 : 65798564 : SNP	t	c	0.2946	0.0043	0.2869	0.2984	-0.0004	0.0092	0.9674	+-++-	0.0	1.440	4	0.8372
15 : 68733612 : SNP	t	g	0.5091	0.0172	0.4944	0.5421	-0.0104	0.0085	0.2235	-+-++	22.5	5.162	4	0.2711
7 : 57402070 : SNP	t	c	0.0656	0.0086	0.0402	0.0721	0.0097	0.0182	0.5938	+-??+	0.0	1.745	2	0.4178
17 : 63986352 : SNP	t	c	0.0435	0.0037	0.0360	0.0475	0.0095	0.0219	0.6643	0+??+	0.0	0.215	2	0.8983
6 : 118123847 : INDEL	d	r	0.4426	0.0118	0.4300	0.4827	-0.0068	0.0089	0.443	--+--	0.0	0.852	4	0.9313
6 : 166722871 : SNP	a	g	0.2247	0.0076	0.2099	0.2414	0.0035	0.0106	0.7406	+-+-+	64.4	11.247	4	0.02392
16 : 86099166 : SNP	t	c	0.3439	0.0185	0.3288	0.3793	-0.0003	0.0092	0.9734	+-++-	37.3	6.383	4	0.1723
13 : 77064844 : SNP	t	g	0.7898	0.0243	0.7664	0.8436	0.0062	0.0106	0.5582	+0--+	0.0	1.838	4	0.7656
10 : 115475627 : INDEL	d	r	0.2094	0.0084	0.1774	0.2159	-0.0049	0.0107	0.6435	-++-+	0.0	1.131	4	0.8894
4 : 172928594 : SNP	a	g	0.0349	0.0025	0.0328	0.0378	-0.0343	0.0268	0.2008	--???	0.0	0.003	1	0.9558
3 : 95852442 : SNP	t	g	0.8569	0.0042	0.8492	0.8608	0.0256	0.0121	0.03457	+-+++	51.5	8.247	4	0.08294
18 : 42074807 : SNP	a	g	0.0551	0.0049	0.0430	0.0592	-0.0132	0.0199	0.5082	--??+	0.0	0.972	2	0.6152
4 : 111274182 : SNP	t	c	0.0727	0.0077	0.0548	0.0776	0.0044	0.0171	0.7958	+-?+-	0.0	0.653	3	0.8841
1 : 247340575 : INDEL	d	r	0.4162	0.0196	0.3966	0.4577	-0.0028	0.0086	0.7474	-0--+	0.0	2.450	4	0.6537
12 : 70572408 : SNP	a	c	0.3250	0.0099	0.3018	0.3392	-0.0028	0.0092	0.7568	---++	58.0	9.518	4	0.04937
12 : 33297568 : SNP	t	c	0.6646	0.0092	0.6534	0.6894	-0.0018	0.0100	0.8602	+-+--	56.6	9.210	4	0.05605
4 : 38788085 : SNP	t	c	0.9505	0.0261	0.9154	0.9783	-0.0174	0.0287	0.544	-??+-	0.0	0.520	2	0.771
8 : 128977151 : SNP	a	c	0.4231	0.0243	0.3542	0.4378	-0.0040	0.0086	0.6385	+-+--	0.0	1.912	4	0.7519
10 : 9987032 : SNP	a	g	0.7791	0.0085	0.7584	0.7869	-0.0078	0.0120	0.5166	-+-+-	4.8	4.200	4	0.3796
7 : 36566515 : SNP	a	g	0.0454	0.0050	0.0397	0.0547	-0.0003	0.0231	0.9904	++??-	49.4	3.954	2	0.1385
4 : 162095656 : SNP	t	c	0.2216	0.0140	0.2101	0.2544	-0.0120	0.0105	0.2517	--+++	41.1	6.792	4	0.1473
1 : 97469304 : SNP	c	g	0.0126	0.0000	0.0126	0.0126	-0.0380	0.0576	0.5096	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 175615639 : SNP	a	c	0.4802	0.0090	0.4680	0.5151	-0.0039	0.0085	0.6435	--++-	0.0	1.551	4	0.8176
3 : 77374340 : INDEL	d	r	0.1252	0.0088	0.1037	0.1419	-0.0231	0.0130	0.07531	---+-	55.7	9.038	4	0.06015
6 : 67637502 : SNP	t	c	0.9862	0.0000	0.9862	0.9862	0.0500	0.0607	0.4097	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 5616112 : SNP	t	c	0.0301	0.0000	0.0301	0.0301	-0.0400	0.0384	0.2977	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 228088482 : SNP	t	g	0.9092	0.0108	0.8988	0.9359	0.0037	0.0149	0.804	-+-+-	0.0	2.070	4	0.723
22 : 22671962 : SNP	t	c	0.6201	0.0115	0.6022	0.6551	0.0017	0.0088	0.8433	0++--	26.5	5.441	4	0.245
12 : 63971651 : SNP	t	c	0.9550	0.0016	0.9528	0.9574	-0.0163	0.0224	0.4672	--??-	0.0	1.755	2	0.4157
22 : 49788075 : SNP	a	g	0.2668	0.0121	0.2541	0.2917	-0.0094	0.0097	0.3325	-+-+-	17.3	4.839	4	0.3042
13 : 59739457 : SNP	a	g	0.0863	0.0122	0.0712	0.1048	0.0083	0.0198	0.6737	-+?++	0.0	1.696	3	0.6379
10 : 53682854 : SNP	a	t	0.5270	0.0093	0.4998	0.5467	-0.0045	0.0085	0.6001	-+---	0.0	2.011	4	0.7338
7 : 90470726 : SNP	t	c	0.1003	0.0053	0.0788	0.1035	-0.0031	0.0143	0.8266	-+--+	8.9	4.392	4	0.3555
4 : 4852903 : SNP	c	g	0.4646	0.0117	0.4534	0.4871	0.0029	0.0091	0.7462	++--+	0.0	2.081	4	0.7208
9 : 34982343 : SNP	a	g	0.4576	0.0149	0.4262	0.4665	-0.0075	0.0086	0.3805	--+--	0.0	1.969	4	0.7415
8 : 95489281 : SNP	t	c	0.7465	0.0184	0.7133	0.7646	-0.0143	0.0100	0.1532	-----	0.0	1.105	4	0.8934
18 : 27005279 : SNP	c	g	0.2034	0.0085	0.1783	0.2105	-0.0049	0.0107	0.6486	---++	0.0	1.985	4	0.7385
14 : 53220929 : SNP	a	g	0.9354	0.0008	0.9350	0.9369	0.0152	0.0278	0.5832	+???-	0.0	0.286	1	0.5928
2 : 149804048 : SNP	a	g	0.9063	0.0118	0.8874	0.9164	-0.0160	0.0151	0.2898	-+---	0.0	2.187	4	0.7014
1 : 195619403 : SNP	a	g	0.0175	0.0000	0.0175	0.0175	0.0090	0.0586	0.878	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 111780644 : SNP	t	c	0.7946	0.0116	0.7706	0.8040	0.0128	0.0104	0.2182	++-++	0.0	0.761	4	0.9435
10 : 134934854 : SNP	a	g	0.3165	0.0329	0.2935	0.3699	-0.0038	0.0118	0.7469	--+++	7.9	4.342	4	0.3617
9 : 85818586 : SNP	t	c	0.0207	0.0000	0.0207	0.0207	-0.0410	0.0495	0.4078	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 53807654 : SNP	t	c	0.3720	0.0378	0.2989	0.4110	0.0097	0.0106	0.3596	++--+	30.7	5.769	4	0.2171
7 : 54554201 : INDEL	d	r	0.3091	0.0133	0.2979	0.3564	-0.0104	0.0092	0.2609	+----	30.7	5.772	4	0.2168
3 : 117755084 : SNP	t	c	0.9585	0.0087	0.9418	0.9645	-0.0516	0.0226	0.02249	--??+	36.8	3.163	2	0.2056
7 : 136456301 : SNP	t	c	0.7957	0.0060	0.7697	0.8080	-0.0171	0.0106	0.1058	-----	0.0	3.363	4	0.499
10 : 5032913 : SNP	a	g	0.1227	0.0136	0.1079	0.1377	0.0095	0.0220	0.6668	-?+-+	48.4	5.810	3	0.1212
12 : 80175897 : SNP	t	c	0.0739	0.0010	0.0719	0.0756	-0.0035	0.0175	0.8398	+-?-+	0.0	0.827	3	0.8429
11 : 75534137 : SNP	t	g	0.0882	0.0039	0.0809	0.0970	-0.0073	0.0153	0.6327	--+-+	0.0	1.593	4	0.81
18 : 52404965 : SNP	t	g	0.9494	0.0025	0.9472	0.9526	-0.0025	0.0205	0.9044	-+??+	32.3	2.953	2	0.2285
5 : 114882421 : INDEL	i	r	0.0856	0.0032	0.0744	0.0908	-0.0143	0.0155	0.3555	-+---	0.0	2.651	4	0.6178
6 : 115282677 : SNP	a	g	0.9737	0.0000	0.9737	0.9737	-0.0340	0.0546	0.5334	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 60630054 : SNP	a	c	0.9672	0.0037	0.9605	0.9714	0.0099	0.0256	0.6987	+-??+	0.0	1.759	2	0.415
13 : 101977216 : SNP	c	g	0.2819	0.0228	0.2414	0.3099	-0.0098	0.0109	0.3711	-++-+	27.5	5.513	4	0.2385
9 : 74022199 : SNP	a	c	0.9776	0.0000	0.9776	0.9776	0.0180	0.0556	0.7461	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 119021751 : INDEL	d	r	0.2670	0.0138	0.2561	0.3163	0.0039	0.0098	0.6917	++++-	26.2	5.422	4	0.2467
10 : 30135842 : SNP	t	g	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	-0.0300	0.0556	0.5895	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 88253276 : SNP	a	g	0.1647	0.0100	0.1431	0.1858	-0.0091	0.0114	0.4265	+----	0.0	3.500	4	0.4779
5 : 78428769 : INDEL	d	r	0.6826	0.0075	0.6721	0.6954	-0.0205	0.0092	0.02598	--+--	16.3	4.777	4	0.311
1 : 107666980 : SNP	t	c	0.8116	0.0079	0.8078	0.8308	-0.0026	0.0111	0.8179	+--+-	0.0	1.036	4	0.9043
15 : 89218097 : SNP	c	g	0.2403	0.0083	0.2338	0.2558	0.0021	0.0106	0.8423	-+++-	41.1	6.792	4	0.1473
3 : 165038927 : SNP	t	c	0.2658	0.0048	0.2619	0.2772	-0.0121	0.0098	0.2159	---+-	37.9	6.442	4	0.1685
7 : 34016773 : SNP	a	g	0.6406	0.0073	0.6275	0.6599	0.0124	0.0089	0.1635	+--++	33.4	6.008	4	0.1986
16 : 58366306 : SNP	t	c	0.1650	0.0093	0.1532	0.1838	0.0070	0.0137	0.6114	+-+++	0.0	1.451	4	0.8352
17 : 71112935 : INDEL	i	r	0.6355	0.0173	0.6209	0.6902	0.0064	0.0094	0.4959	0+-++	0.0	2.598	4	0.6271
9 : 10618114 : SNP	a	t	0.8466	0.0069	0.8364	0.8545	0.0230	0.0129	0.07402	++-++	0.0	3.950	4	0.4128
3 : 69928948 : SNP	a	t	0.9736	0.0000	0.9736	0.9736	-0.0230	0.0445	0.6051	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 33492509 : SNP	t	c	0.1506	0.0024	0.1439	0.1537	-0.0059	0.0137	0.6688	-+---	18.9	4.933	4	0.2943
6 : 76703015 : SNP	c	g	0.9272	0.0026	0.9211	0.9287	-0.0064	0.0167	0.7007	--?++	28.5	4.196	3	0.2411
9 : 4326243 : SNP	a	t	0.8287	0.0102	0.8100	0.8542	-0.0076	0.0120	0.525	-+++-	0.0	4.000	4	0.406
8 : 68829405 : SNP	t	c	0.1412	0.0050	0.1243	0.1460	0.0014	0.0125	0.9103	-+---	0.0	3.528	4	0.4736
3 : 146302786 : SNP	t	c	0.0863	0.0056	0.0827	0.0992	-0.0010	0.0151	0.9497	-+?-+	7.2	3.233	3	0.357
17 : 64610024 : SNP	t	c	0.0629	0.0054	0.0541	0.0688	-0.0085	0.0179	0.6362	-+?+-	0.0	2.029	3	0.5663
1 : 81242052 : SNP	t	c	0.9847	0.0000	0.9847	0.9847	-0.0910	0.0516	0.07754	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 49074614 : SNP	t	c	0.6481	0.0178	0.6011	0.6749	0.0026	0.0094	0.7835	+++--	0.0	0.317	4	0.9887
8 : 80648110 : SNP	t	g	0.8729	0.0112	0.8510	0.8814	-0.0024	0.0130	0.8537	--+-+	67.7	12.393	4	0.01465
7 : 475828 : SNP	c	g	0.2124	0.0013	0.2117	0.2149	0.0011	0.0340	0.9753	???+-	0.0	0.909	1	0.3404
5 : 6153031 : SNP	t	g	0.9288	0.0046	0.9254	0.9416	0.0018	0.0170	0.9171	++?--	57.8	7.113	3	0.06839
5 : 42486803 : SNP	a	g	0.5553	0.0227	0.5086	0.5764	-0.0104	0.0087	0.234	--++-	23.4	5.224	4	0.2651
6 : 150779892 : SNP	a	g	0.3211	0.0249	0.2697	0.3383	0.0022	0.0092	0.8102	+++-+	0.0	1.408	4	0.8429
2 : 129205382 : SNP	a	g	0.8592	0.0123	0.8480	0.8762	-0.0106	0.0130	0.413	-----	0.0	0.642	4	0.9583
1 : 168279917 : SNP	a	t	0.9525	0.0030	0.9506	0.9578	-0.0327	0.0240	0.1726	--??-	0.0	0.955	2	0.6204
7 : 32157711 : SNP	t	c	0.3173	0.0270	0.2925	0.3660	0.0125	0.0091	0.1728	+++++	0.0	1.281	4	0.8646
17 : 76538205 : INDEL	i	r	0.0228	0.0000	0.0228	0.0228	0.0630	0.0465	0.1755	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 7555385 : SNP	t	c	0.4502	0.0093	0.4204	0.4580	-0.0043	0.0085	0.6163	+--+-	0.0	3.184	4	0.5276
1 : 18085290 : SNP	a	g	0.2430	0.0130	0.2133	0.2498	0.0010	0.0100	0.9201	+-+-+	58.0	9.517	4	0.04939
2 : 117703146 : SNP	t	c	0.9674	0.0000	0.9674	0.9674	-0.0040	0.0364	0.9125	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 195174795 : SNP	a	t	0.6214	0.0035	0.6194	0.6343	0.0140	0.0089	0.119	++-++	0.0	1.630	4	0.8034
6 : 90858254 : INDEL	d	r	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	-0.0200	0.0475	0.6738	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 22131125 : SNP	t	g	0.4736	0.0312	0.3871	0.4992	0.0167	0.0085	0.04927	++-++	42.1	6.903	4	0.1411
4 : 95008699 : SNP	a	g	0.2446	0.0140	0.2235	0.2574	-0.0141	0.0133	0.2865	---+-	60.8	10.210	4	0.03703
12 : 108756860 : SNP	a	g	0.0408	0.0100	0.0346	0.0659	0.0158	0.0239	0.5072	+-?+-	0.0	2.908	3	0.406
2 : 151838421 : SNP	a	g	0.7385	0.0028	0.7352	0.7494	0.0214	0.0097	0.02742	+++++	22.6	5.171	4	0.2702
18 : 59330824 : SNP	a	t	0.3063	0.0079	0.3014	0.3250	-0.0048	0.0091	0.5965	----+	0.0	2.012	4	0.7336
10 : 111373271 : SNP	c	g	0.9284	0.0014	0.9275	0.9305	0.0467	0.0343	0.1734	+???+	0.0	0.378	1	0.5386
7 : 53606498 : SNP	t	c	0.0143	0.0000	0.0143	0.0143	-0.0060	0.0526	0.9091	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 174237647 : SNP	t	g	0.1280	0.0028	0.1219	0.1368	0.0068	0.0133	0.6107	-++-+	13.4	4.621	4	0.3285
9 : 35707677 : SNP	a	g	0.0594	0.0021	0.0571	0.0638	-0.0174	0.0194	0.3697	--?--	0.0	1.821	3	0.6103
14 : 99540823 : SNP	a	g	0.1104	0.0186	0.0950	0.1456	0.0170	0.0148	0.2502	+-+++	0.0	3.573	4	0.4669
7 : 145042520 : SNP	t	c	0.4702	0.0108	0.4488	0.4891	-0.0043	0.0085	0.6168	+---+	0.0	3.508	4	0.4766
3 : 150549606 : SNP	t	c	0.1331	0.0138	0.0990	0.1458	-0.0032	0.0130	0.808	---++	60.3	10.081	4	0.03909
2 : 26942256 : SNP	a	g	0.4718	0.0211	0.4186	0.4982	-0.0014	0.0085	0.8697	--+-+	0.0	2.203	4	0.6984
8 : 100435665 : INDEL	i	r	0.0499	0.0009	0.0492	0.0511	-0.0159	0.0225	0.4783	--???	0.0	0.056	1	0.8134
12 : 66177948 : INDEL	d	r	0.0822	0.0087	0.0747	0.1021	0.0034	0.0157	0.8275	+-?+-	70.5	10.158	3	0.01727
22 : 42699042 : SNP	t	c	0.9411	0.0000	0.9411	0.9411	0.0500	0.0313	0.1106	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 44075787 : SNP	c	g	0.1731	0.0151	0.1505	0.1959	0.0137	0.0113	0.2279	++--+	52.7	8.452	4	0.07637
16 : 83280697 : SNP	t	g	0.0482	0.0046	0.0369	0.0514	0.0266	0.0210	0.2038	++??-	0.0	0.602	2	0.7399
12 : 86860596 : SNP	t	c	0.1282	0.0054	0.1203	0.1371	-0.0016	0.0129	0.9035	-++++	39.3	6.591	4	0.1591
7 : 41008540 : SNP	t	c	0.6095	0.0119	0.5863	0.6199	-0.0071	0.0086	0.4068	-+-+-	36.4	6.290	4	0.1785
10 : 71592428 : SNP	t	c	0.8874	0.0113	0.8781	0.9155	0.0097	0.0137	0.4801	++--+	0.0	0.295	4	0.9902
17 : 53561284 : SNP	t	c	0.9129	0.0055	0.8985	0.9208	0.0137	0.0155	0.3774	-++-+	44.3	7.184	4	0.1265
3 : 6194124 : SNP	a	g	0.9693	0.0065	0.9622	0.9752	0.0149	0.0284	0.5993	++???	0.0	0.123	1	0.7254
3 : 68964260 : SNP	t	c	0.7700	0.0095	0.7564	0.7784	-0.0139	0.0100	0.1648	----+	0.0	1.267	4	0.8669
3 : 129678664 : SNP	a	g	0.5847	0.0080	0.5802	0.6255	0.0219	0.0086	0.01099	+++++	0.0	1.255	4	0.8689
9 : 28838651 : SNP	c	g	0.8267	0.0121	0.8163	0.8582	0.0032	0.0116	0.7845	+-++-	0.0	1.304	4	0.8607
1 : 183598988 : SNP	c	g	0.0270	0.0006	0.0262	0.0275	-0.0173	0.0300	0.564	--???	0.0	0.001	1	0.9745
10 : 72491666 : SNP	a	g	0.0359	0.0020	0.0342	0.0383	-0.0171	0.0263	0.5173	--???	0.0	0.009	1	0.9256
10 : 36273474 : SNP	a	c	0.9400	0.0075	0.9234	0.9454	0.0414	0.0328	0.2075	+??++	0.0	1.787	2	0.4093
2 : 169301920 : SNP	a	g	0.9268	0.0093	0.9046	0.9369	0.0165	0.0167	0.3231	+-?++	40.1	5.005	3	0.1714
4 : 138915355 : SNP	t	c	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	0.0160	0.0556	0.7735	+????	0.0	0.000	0	1
22 : 42251810 : SNP	t	g	0.5113	0.0116	0.4948	0.5372	0.0018	0.0085	0.8299	++++-	0.6	4.023	4	0.4029
2 : 120440071 : SNP	t	c	0.8520	0.0127	0.8240	0.8680	0.0068	0.0121	0.5762	+-+++	0.0	1.396	4	0.8449
13 : 47297352 : SNP	a	g	0.8007	0.0147	0.7882	0.8346	-0.0073	0.0108	0.5021	+-+--	0.0	2.105	4	0.7165
3 : 48893780 : SNP	t	c	0.3623	0.0165	0.3368	0.3836	0.0071	0.0090	0.4315	-++-+	10.0	4.443	4	0.3494
12 : 43563541 : SNP	a	g	0.2674	0.0152	0.2523	0.3114	0.0157	0.0097	0.1045	++--+	0.0	3.819	4	0.4311
7 : 7673329 : SNP	a	g	0.8581	0.0052	0.8547	0.8693	-0.0089	0.0123	0.4702	-+-+-	0.0	1.013	4	0.9079
8 : 41580155 : SNP	t	c	0.9412	0.0044	0.9390	0.9531	-0.0170	0.0189	0.3675	--??+	0.0	0.506	2	0.7764
20 : 9298040 : SNP	a	g	0.8058	0.0019	0.8015	0.8115	0.0053	0.0108	0.6224	-+-++	8.3	4.364	4	0.359
20 : 52606265 : SNP	t	c	0.0368	0.0020	0.0357	0.0412	0.0296	0.0239	0.2154	-+??+	77.1	8.733	2	0.01269
6 : 15869998 : SNP	a	g	0.9094	0.0081	0.9037	0.9299	-0.0085	0.0153	0.5776	-+?++	0.0	2.141	3	0.5437
18 : 1700081 : SNP	t	c	0.9000	0.0114	0.8787	0.9133	-0.0047	0.0152	0.7585	-+-+-	0.0	2.898	4	0.575
13 : 86477773 : SNP	t	c	0.9269	0.0033	0.9249	0.9382	-0.0095	0.0171	0.5793	--?++	0.0	1.517	3	0.6784
6 : 9015413 : SNP	t	c	0.3560	0.0279	0.2968	0.3779	0.0082	0.0092	0.3723	---++	65.0	11.426	4	0.02217
7 : 76917637 : SNP	t	g	0.1884	0.0088	0.1694	0.1990	-0.0019	0.0109	0.865	----+	0.0	0.618	4	0.9611
10 : 76921342 : SNP	a	g	0.5809	0.0083	0.5425	0.5947	0.0041	0.0086	0.6338	-++--	6.0	4.256	4	0.3725
2 : 36902093 : SNP	t	c	0.0276	0.0015	0.0263	0.0293	-0.0031	0.0289	0.9143	+-???	34.1	1.518	1	0.2179
11 : 45830636 : SNP	a	g	0.9606	0.0032	0.9584	0.9652	-0.0160	0.0250	0.5218	--???	0.0	0.000	1	1
3 : 117312993 : SNP	t	c	0.3452	0.0214	0.3005	0.3666	-0.0046	0.0092	0.6137	-0--+	0.0	3.139	4	0.5349
4 : 161284622 : SNP	a	g	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	-0.0210	0.0435	0.629	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 20532683 : SNP	t	g	0.5903	0.0040	0.5867	0.6016	0.0008	0.0086	0.9298	+--++	25.8	5.392	4	0.2494
17 : 75673150 : SNP	t	c	0.2880	0.0213	0.2721	0.3500	-0.0066	0.0097	0.4952	+----	0.0	1.924	4	0.7498
16 : 2877632 : SNP	t	c	0.3022	0.0243	0.2555	0.3363	0.0002	0.0100	0.9825	++-+-	17.1	4.823	4	0.3059
1 : 19606421 : INDEL	d	r	0.1442	0.0149	0.1251	0.1698	0.0053	0.0136	0.6948	-+-+-	37.8	6.428	4	0.1694
14 : 67115917 : SNP	t	c	0.9811	0.0000	0.9811	0.9811	-0.0820	0.0445	0.06524	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 19863471 : SNP	a	t	0.1112	0.0086	0.1059	0.1292	0.0027	0.0137	0.8449	++--+	0.0	3.339	4	0.5028
9 : 16783192 : SNP	a	t	0.8563	0.0186	0.8149	0.8693	-0.0026	0.0123	0.8319	-+---	0.0	1.969	4	0.7414
2 : 233297576 : SNP	a	g	0.5958	0.0076	0.5664	0.6154	0.0122	0.0086	0.1529	++--+	54.9	8.869	4	0.06447
16 : 79938996 : SNP	c	g	0.1495	0.0047	0.1393	0.1546	0.0152	0.0118	0.1976	++--+	0.0	1.445	4	0.8363
1 : 110119485 : SNP	a	g	0.4922	0.0201	0.4795	0.5367	-0.0068	0.0086	0.429	-++-+	66.7	12.025	4	0.01717
20 : 22075635 : SNP	a	g	0.9590	0.0006	0.9576	0.9594	0.0221	0.0223	0.3225	+-??+	62.0	5.258	2	0.07216
17 : 37396201 : SNP	t	g	0.7227	0.0248	0.6680	0.7452	-0.0095	0.0097	0.3247	----+	72.8	14.729	4	0.005298
6 : 36692507 : SNP	c	g	0.0377	0.0020	0.0348	0.0391	-0.0045	0.0265	0.8637	+-???	0.0	0.612	1	0.4342
20 : 33584289 : SNP	t	c	0.4357	0.0257	0.4009	0.4777	-0.0095	0.0092	0.2995	-0--?	19.4	3.723	3	0.293
3 : 187300905 : INDEL	i	r	0.0861	0.0079	0.0767	0.1015	0.0082	0.0155	0.5943	+++-+	0.0	3.265	4	0.5146
22 : 28100261 : SNP	a	g	0.1285	0.0095	0.1190	0.1497	-0.0089	0.0125	0.4763	--++-	0.0	2.368	4	0.6684
1 : 73718973 : SNP	a	g	0.0100	0.0000	0.0100	0.0100	-0.0070	0.0637	0.9125	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 73329202 : SNP	a	g	0.5723	0.0216	0.5488	0.6123	0.0009	0.0100	0.9297	--+-+	0.0	2.413	4	0.6603
6 : 45235184 : SNP	t	c	0.9667	0.0017	0.9647	0.9681	0.0174	0.0256	0.4969	++???	0.0	0.000	1	0.9847
4 : 136664481 : SNP	a	c	0.9763	0.0000	0.9763	0.9763	-0.0650	0.0445	0.1439	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 137682954 : SNP	a	g	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	-0.0430	0.0465	0.3551	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 7712132 : SNP	a	g	0.6872	0.0034	0.6818	0.6936	-0.0094	0.0092	0.3039	--+--	0.0	0.634	4	0.9592
4 : 31730060 : INDEL	d	r	0.7210	0.0161	0.6897	0.7373	-0.0051	0.0099	0.6057	--++-	0.0	1.641	4	0.8015
6 : 123626787 : SNP	a	c	0.8881	0.0081	0.8767	0.8983	0.0070	0.0136	0.6088	+-++-	0.0	2.071	4	0.7228
18 : 61219757 : SNP	a	c	0.0289	0.0025	0.0268	0.0318	0.0004	0.0285	0.9899	+-???	0.0	0.158	1	0.6906
10 : 29516516 : SNP	a	g	0.6509	0.0189	0.6248	0.6972	0.0147	0.0090	0.1023	++--+	0.0	1.807	4	0.7712
5 : 35494626 : SNP	c	g	0.0770	0.0057	0.0704	0.0824	-0.0178	0.0162	0.2714	--?--	0.0	0.716	3	0.8694
8 : 57308014 : SNP	a	g	0.9652	0.0000	0.9652	0.9652	0.0020	0.0374	0.9574	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 105277595 : SNP	a	t	0.7949	0.0132	0.7839	0.8335	-0.0092	0.0107	0.391	-+-++	0.0	2.283	4	0.6839
14 : 90955452 : SNP	a	g	0.9751	0.0000	0.9751	0.9751	-0.0050	0.0627	0.9364	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 40355616 : SNP	t	c	0.3726	0.0163	0.3493	0.4045	-0.0021	0.0091	0.8137	-+-+-	0.0	1.131	4	0.8894
10 : 102999019 : SNP	a	g	0.7191	0.0126	0.7039	0.7424	0.0090	0.0097	0.354	-++-+	24.8	5.321	4	0.2559
4 : 164200111 : SNP	a	t	0.9542	0.0028	0.9488	0.9565	-0.0149	0.0219	0.4945	-+??-	68.1	6.266	2	0.04358
13 : 83687359 : SNP	t	c	0.0982	0.0038	0.0872	0.1010	-0.0231	0.0147	0.1162	-----	0.0	2.760	4	0.5987
4 : 42859089 : SNP	a	g	0.9603	0.0048	0.9525	0.9632	0.0545	0.0302	0.07095	+???+	0.0	0.018	1	0.892
11 : 50659429 : SNP	t	c	0.9379	0.0000	0.9379	0.9379	0.0168	0.0486	0.7296	????+	0.0	0.000	0	1
12 : 49835245 : SNP	a	g	0.9489	0.0072	0.9438	0.9590	-0.0180	0.0255	0.4814	--???	0.0	0.028	1	0.8677
15 : 41519817 : SNP	a	g	0.1786	0.0217	0.1587	0.2220	-0.0161	0.0111	0.1465	--+--	0.0	2.049	4	0.7267
12 : 30591715 : SNP	a	g	0.0537	0.0022	0.0515	0.0573	0.0247	0.0196	0.2088	++?--	3.8	3.117	3	0.3739
22 : 19327662 : SNP	c	g	0.0431	0.0068	0.0355	0.0544	-0.0191	0.0217	0.3788	--?--	0.0	1.539	3	0.6734
14 : 36232402 : INDEL	d	r	0.0540	0.0025	0.0514	0.0588	-0.0028	0.0202	0.8893	--??+	0.0	1.631	2	0.4424
19 : 14412648 : SNP	c	g	0.4219	0.0158	0.3944	0.4417	0.0074	0.0096	0.4412	+-+++	5.5	4.232	4	0.3755
2 : 6272536 : SNP	a	g	0.0378	0.0003	0.0375	0.0380	0.0146	0.0259	0.5735	++???	0.0	0.006	1	0.9408
9 : 34782550 : SNP	a	g	0.3420	0.0145	0.3032	0.3543	0.0005	0.0092	0.955	-+++-	18.5	4.906	4	0.2971
10 : 34295167 : SNP	a	c	0.0574	0.0103	0.0479	0.0787	-0.0383	0.0195	0.04971	-0?+-	27.8	4.152	3	0.2455
3 : 172612745 : SNP	a	g	0.0795	0.0053	0.0757	0.1003	0.0304	0.0161	0.05901	++?++	0.0	1.078	3	0.7825
12 : 69835770 : SNP	a	g	0.1778	0.0112	0.1595	0.1938	-0.0170	0.0113	0.1323	--++-	0.0	2.116	4	0.7145
2 : 208606083 : SNP	a	g	0.5987	0.0288	0.5463	0.6208	0.0139	0.0090	0.1219	-++++	0.0	2.963	4	0.5641
3 : 3302387 : SNP	t	c	0.0717	0.0035	0.0643	0.0749	0.0151	0.0171	0.3766	++?++	0.0	1.827	3	0.609
22 : 30962160 : SNP	a	g	0.0547	0.0042	0.0427	0.0572	0.0048	0.0201	0.8122	+-??-	0.0	0.741	2	0.6905
5 : 93948875 : SNP	a	g	0.2100	0.0108	0.1960	0.2250	0.0013	0.0105	0.905	-+--+	44.7	7.232	4	0.1241
8 : 92820168 : SNP	a	t	0.0182	0.0000	0.0182	0.0182	-0.0330	0.0505	0.5138	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 29064422 : SNP	a	g	0.5487	0.0077	0.5378	0.5630	0.0098	0.0086	0.2508	++--+	0.0	2.665	4	0.6153
16 : 3994098 : SNP	t	c	0.0383	0.0021	0.0344	0.0400	0.0005	0.0229	0.981	+-??+	0.0	0.326	2	0.8497
11 : 17383024 : SNP	a	g	0.3469	0.0101	0.3261	0.3556	-0.0130	0.0091	0.1551	---++	0.0	2.154	4	0.7074
14 : 69234312 : SNP	a	g	0.7985	0.0154	0.7640	0.8085	-0.0186	0.0106	0.07788	--++-	0.0	2.796	4	0.5926
5 : 144880346 : SNP	a	g	0.7468	0.0066	0.7398	0.7662	-0.0138	0.0099	0.1626	-----	0.0	0.619	4	0.9609
10 : 5261491 : SNP	t	c	0.1472	0.0135	0.1113	0.1668	0.0243	0.0121	0.04561	++++-	58.5	9.628	4	0.04718
6 : 148502124 : SNP	t	c	0.1427	0.0087	0.1276	0.1506	-0.0004	0.0136	0.9779	-+-++	0.0	2.709	4	0.6076
18 : 33162028 : SNP	c	g	0.0287	0.0068	0.0240	0.0386	0.0554	0.0359	0.1224	+???-	43.2	1.761	1	0.1845
5 : 30910169 : SNP	t	c	0.3521	0.0226	0.3024	0.3721	-0.0056	0.0090	0.5356	---++	0.0	3.684	4	0.4504
10 : 93416225 : SNP	a	g	0.3763	0.0148	0.3241	0.3994	-0.0069	0.0085	0.4186	-++-+	38.3	6.486	4	0.1657
8 : 135786489 : SNP	a	c	0.2985	0.0130	0.2569	0.3371	0.0039	0.0098	0.6907	+-+++	0.0	3.720	4	0.4452
10 : 124020441 : INDEL	d	r	0.5098	0.0069	0.4826	0.5211	0.0073	0.0085	0.3883	+-+++	7.9	4.344	4	0.3614
3 : 123072318 : SNP	t	g	0.5426	0.0197	0.5244	0.5827	0.0134	0.0085	0.1176	++-++	0.0	1.681	4	0.7942
3 : 163258275 : SNP	a	g	0.9192	0.0067	0.9071	0.9262	-0.0186	0.0168	0.2696	-+?+-	67.2	9.136	3	0.02754
6 : 22717394 : SNP	c	g	0.2276	0.0251	0.2016	0.2839	0.0267	0.0104	0.009904	+-+++	25.9	5.395	4	0.2491
16 : 7250926 : SNP	a	g	0.1158	0.0128	0.0972	0.1426	0.0167	0.0135	0.2166	++---	0.0	2.363	4	0.6693
16 : 68734320 : SNP	t	g	0.6118	0.0051	0.6009	0.6157	0.0082	0.0085	0.3357	++-+-	0.0	1.704	4	0.7899
8 : 10571591 : SNP	c	g	0.6869	0.0030	0.6738	0.6883	-0.0006	0.0094	0.9505	-++-+	0.0	2.559	4	0.6342
8 : 36943655 : SNP	a	c	0.0907	0.0061	0.0857	0.1122	-0.0195	0.0149	0.1901	+---+	57.1	9.323	4	0.05351
10 : 122064448 : SNP	t	c	0.8201	0.0102	0.8135	0.8431	0.0111	0.0110	0.3143	+---+	0.0	3.148	4	0.5334
7 : 122600030 : SNP	t	c	0.8076	0.0129	0.7966	0.8473	-0.0128	0.0108	0.2368	-0---	0.0	1.036	4	0.9043
13 : 37303638 : SNP	t	c	0.0341	0.0077	0.0277	0.0435	-0.0280	0.0326	0.3909	--???	0.0	0.110	1	0.7404
5 : 166676216 : SNP	a	g	0.8856	0.0057	0.8816	0.8936	-0.0483	0.0386	0.2103	???--	0.0	0.571	1	0.4501
14 : 99842671 : SNP	a	g	0.7440	0.0101	0.7084	0.7518	0.0116	0.0098	0.238	+++-+	0.0	1.018	4	0.9071
22 : 30089669 : SNP	c	g	0.6864	0.0067	0.6675	0.6961	-0.0263	0.0093	0.0046	---+-	0.0	3.519	4	0.475
6 : 135036003 : SNP	a	g	0.7918	0.0080	0.7825	0.8063	0.0049	0.0105	0.6388	+--++	37.4	6.385	4	0.1721
5 : 144104287 : SNP	a	g	0.9718	0.0000	0.9718	0.9718	-0.0340	0.0414	0.412	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 118067052 : SNP	c	g	0.9893	0.0000	0.9893	0.9893	0.0770	0.0607	0.2042	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 48198430 : SNP	a	g	0.9367	0.0071	0.9325	0.9557	-0.0119	0.0189	0.5301	+-??-	0.0	1.142	2	0.5651
1 : 229272814 : SNP	a	g	0.7429	0.0147	0.7143	0.7650	0.0054	0.0101	0.5916	-+-++	0.0	3.599	4	0.463
5 : 59289598 : SNP	t	c	0.7146	0.0123	0.6875	0.7323	0.0008	0.0093	0.9301	+-+++	0.0	2.525	4	0.6401
2 : 154957902 : SNP	t	c	0.8474	0.0040	0.8404	0.8544	-0.0109	0.0119	0.3582	-+---	0.0	0.673	4	0.9546
12 : 74085595 : SNP	c	g	0.6530	0.0041	0.6501	0.6674	-0.0041	0.0091	0.6511	-+++-	36.6	6.312	4	0.1771
15 : 26715778 : SNP	t	c	0.0458	0.0037	0.0440	0.0547	-0.0341	0.0221	0.1239	--??+	0.0	0.740	2	0.6908
5 : 93192764 : SNP	a	g	0.0685	0.0022	0.0594	0.0697	-0.0123	0.0178	0.4914	--?+-	0.0	1.963	3	0.58
15 : 95711853 : SNP	t	c	0.6953	0.0190	0.6572	0.7056	-0.0049	0.0096	0.6143	+----	0.0	2.369	4	0.6682
11 : 46402749 : SNP	t	g	0.9786	0.0000	0.9786	0.9786	0.0160	0.0627	0.7985	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 150489609 : SNP	c	g	0.5049	0.0115	0.4850	0.5154	0.0010	0.0086	0.9103	+-+-+	2.1	4.086	4	0.3944
9 : 99079062 : INDEL	d	r	0.4682	0.0228	0.4505	0.5039	-0.0116	0.0092	0.2046	-0--+	0.0	1.735	4	0.7844
5 : 148424722 : SNP	a	g	0.9613	0.0000	0.9613	0.9613	0.0080	0.0435	0.854	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 176954850 : SNP	a	g	0.0552	0.0000	0.0552	0.0552	0.0680	0.0445	0.1263	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 35736643 : SNP	t	c	0.7572	0.0073	0.7314	0.7681	0.0033	0.0099	0.7379	-+--+	0.0	2.105	4	0.7165
9 : 11863917 : SNP	a	g	0.9368	0.0041	0.9288	0.9417	-0.0283	0.0207	0.1718	--?++	44.8	5.436	3	0.1425
4 : 7442925 : SNP	a	c	0.1671	0.0104	0.1396	0.1847	-0.0042	0.0114	0.7128	+---+	62.3	10.599	4	0.03145
8 : 113926982 : SNP	a	g	0.0519	0.0030	0.0454	0.0551	-0.0249	0.0205	0.2251	+-??+	47.2	3.791	2	0.1502
18 : 43972063 : SNP	a	g	0.1382	0.0119	0.1194	0.1646	-0.0122	0.0124	0.3243	----+	32.0	5.882	4	0.2082
12 : 52583122 : SNP	a	t	0.1604	0.0057	0.1540	0.1701	-0.0095	0.0121	0.43	----+	34.6	6.116	4	0.1907
6 : 151781363 : SNP	t	c	0.5936	0.0077	0.5844	0.6082	0.0093	0.0086	0.2782	-+-+-	17.5	4.849	4	0.3031
19 : 56718166 : SNP	t	c	0.1167	0.0228	0.0922	0.1410	0.0404	0.0281	0.1502	?-?++	19.8	2.494	2	0.2874
8 : 88293747 : SNP	a	c	0.2426	0.0037	0.2378	0.2495	-0.0014	0.0100	0.8866	--+-+	0.0	2.591	4	0.6284
1 : 152176871 : SNP	t	c	0.1715	0.0124	0.1604	0.2052	-0.0075	0.0115	0.5141	-++--	0.0	2.702	4	0.6089
1 : 8409139 : SNP	t	c	0.4020	0.0041	0.3915	0.4143	0.0011	0.0091	0.9084	-++-+	3.4	4.140	4	0.3874
2 : 8148083 : SNP	t	c	0.0440	0.0027	0.0420	0.0475	0.0045	0.0242	0.8511	-+???	61.6	2.601	1	0.1068
5 : 120896754 : SNP	a	g	0.0521	0.0006	0.0513	0.0526	-0.0027	0.0202	0.894	-+??+	0.0	0.327	2	0.849
2 : 129855975 : SNP	a	g	0.1124	0.0059	0.1042	0.1262	-0.0078	0.0138	0.5728	-+?+-	45.4	5.491	3	0.1392
7 : 24293495 : SNP	c	g	0.1064	0.0077	0.1025	0.1309	-0.0019	0.0139	0.8896	++---	0.0	2.545	4	0.6367
20 : 16657539 : SNP	a	g	0.5465	0.0069	0.5277	0.5527	0.0047	0.0085	0.5831	++---	4.4	4.185	4	0.3815
4 : 84074826 : SNP	a	g	0.2567	0.0141	0.2242	0.2670	0.0132	0.0108	0.2199	+-+++	0.0	1.888	4	0.7564
6 : 167201033 : SNP	a	g	0.8042	0.0034	0.7978	0.8102	-0.0042	0.0107	0.6967	0+---	67.8	12.411	4	0.01455
7 : 94110725 : SNP	t	c	0.2884	0.0076	0.2755	0.3123	0.0091	0.0092	0.3212	-++++	0.0	3.041	4	0.551
9 : 89553867 : SNP	t	c	0.0119	0.0000	0.0119	0.0119	0.0500	0.0607	0.4097	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 45562639 : SNP	a	t	0.0253	0.0000	0.0253	0.0253	0.0210	0.0384	0.5846	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 35646958 : SNP	c	g	0.0277	0.0000	0.0277	0.0277	0.0240	0.0384	0.5321	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 158404129 : SNP	a	g	0.7403	0.0064	0.7144	0.7436	0.0100	0.0098	0.3068	+++--	0.0	2.101	4	0.7172
15 : 57171430 : SNP	a	c	0.2247	0.0226	0.2122	0.2813	0.0128	0.0104	0.2171	-++-+	0.0	2.436	4	0.6561
2 : 9290324 : SNP	a	g	0.9152	0.0067	0.9072	0.9223	0.0003	0.0155	0.9865	++---	38.8	6.534	4	0.1627
4 : 70836464 : SNP	c	g	0.0316	0.0034	0.0281	0.0383	0.0276	0.0258	0.2861	++??-	71.2	6.952	2	0.03094
19 : 53365154 : SNP	a	g	0.4983	0.0126	0.4731	0.5258	-0.0004	0.0086	0.9672	-+++-	0.0	0.286	4	0.9907
5 : 85698520 : SNP	a	g	0.3448	0.0096	0.3317	0.3595	0.0152	0.0092	0.09721	0++++	54.4	8.778	4	0.0669
9 : 103185284 : SNP	a	g	0.8104	0.0036	0.7962	0.8126	0.0147	0.0108	0.1736	+++--	0.0	2.771	4	0.5969
8 : 136943600 : SNP	c	g	0.6770	0.0091	0.6638	0.6851	-0.0133	0.0092	0.1464	--+--	0.0	0.893	4	0.9256
12 : 1003837 : SNP	t	c	0.2468	0.0057	0.2423	0.2574	-0.0017	0.0098	0.8615	-+-+-	4.9	4.208	4	0.3786
15 : 94534591 : SNP	a	g	0.5742	0.0239	0.5135	0.5970	0.0069	0.0085	0.4167	+---+	6.4	4.275	4	0.3701
7 : 147170943 : SNP	a	g	0.6959	0.0147	0.6650	0.7083	-0.0044	0.0097	0.6537	0----	0.0	0.608	4	0.9622
5 : 156401730 : SNP	t	c	0.8047	0.0043	0.7969	0.8107	-0.0058	0.0110	0.5979	-+---	0.0	1.298	4	0.8617
6 : 52161535 : SNP	t	c	0.1092	0.0063	0.1019	0.1178	-0.0136	0.0139	0.3293	--+-+	0.0	2.276	4	0.6851
11 : 32902639 : SNP	a	c	0.2281	0.0156	0.2087	0.2613	-0.0009	0.0105	0.9298	++---	0.0	0.525	4	0.9711
22 : 49003094 : SNP	t	g	0.6027	0.0184	0.5677	0.6252	0.0304	0.0273	0.2658	??+++	0.0	0.294	2	0.8633
7 : 128197749 : SNP	a	g	0.1392	0.0026	0.1308	0.1417	-0.0009	0.0125	0.9455	+-+++	0.0	0.630	4	0.9597
6 : 63248570 : SNP	t	c	0.7338	0.0075	0.7048	0.7452	-0.0007	0.0105	0.947	--++?	44.3	5.387	3	0.1455
9 : 106620552 : INDEL	i	r	0.6517	0.0124	0.6298	0.6941	-0.0153	0.0091	0.09328	--+--	0.0	0.885	4	0.9267
10 : 119660851 : SNP	t	g	0.9457	0.0012	0.9442	0.9467	0.0372	0.0215	0.08418	++???	51.9	2.077	1	0.1495
7 : 134558606 : SNP	a	g	0.0842	0.0051	0.0738	0.0903	0.0075	0.0158	0.6355	+-?++	48.3	5.802	3	0.1216
3 : 165773774 : SNP	a	g	0.0419	0.0037	0.0386	0.0485	0.0194	0.0230	0.3998	+-??+	0.0	0.730	2	0.6942
3 : 20737789 : SNP	a	g	0.3982	0.0138	0.3792	0.4359	0.0057	0.0086	0.5069	++-++	0.0	2.414	4	0.6602
3 : 165171256 : SNP	a	g	0.5588	0.0121	0.5507	0.5868	0.0014	0.0085	0.8715	-+-++	44.1	7.160	4	0.1277
10 : 99866202 : INDEL	i	r	0.6303	0.0071	0.6201	0.6402	0.0053	0.0089	0.5516	+---+	0.0	2.468	4	0.6504
6 : 31206868 : SNP	c	g	0.4059	0.0044	0.4021	0.4109	0.0045	0.0316	0.886	??+-?	0.0	0.784	1	0.3758
22 : 22903465 : SNP	a	g	0.0526	0.0145	0.0433	0.0788	0.0083	0.0207	0.6904	++??-	0.0	0.179	2	0.9146
8 : 39907581 : SNP	a	t	0.9461	0.0118	0.9241	0.9545	-0.0292	0.0205	0.1556	--??-	0.0	0.609	2	0.7376
11 : 90105525 : SNP	a	g	0.7763	0.0057	0.7687	0.7861	0.0064	0.0104	0.5422	+++-+	23.3	5.212	4	0.2662
4 : 168232701 : SNP	t	c	0.9762	0.0000	0.9762	0.9762	-0.0050	0.0445	0.9105	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 7019685 : SNP	a	c	0.0401	0.0000	0.0401	0.0401	-0.0160	0.0394	0.6849	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 1236956 : SNP	a	t	0.0829	0.0120	0.0719	0.1029	-0.0010	0.0162	0.9486	+-++-	51.9	8.316	4	0.08065
5 : 174022174 : SNP	a	g	0.4626	0.0149	0.4134	0.4884	0.0013	0.0086	0.881	-++++	0.0	0.566	4	0.9667
10 : 25728196 : SNP	c	g	0.0515	0.0040	0.0466	0.0586	0.0023	0.0214	0.9159	+-??-	0.0	0.828	2	0.6609
12 : 30996200 : SNP	c	g	0.0576	0.0037	0.0483	0.0596	-0.0442	0.0221	0.0452	--??+	71.7	7.072	2	0.02913
8 : 4390529 : SNP	a	g	0.4804	0.0125	0.4657	0.5092	-0.0008	0.0090	0.929	---++	0.0	2.640	4	0.6198
3 : 11932127 : SNP	a	g	0.2375	0.0198	0.2099	0.2661	0.0010	0.0111	0.9304	+-+-+	0.0	3.651	4	0.4553
7 : 110902715 : SNP	a	t	0.9161	0.0161	0.8868	0.9313	0.0221	0.0158	0.1638	+---+	74.7	15.802	4	0.003296
5 : 23691539 : SNP	t	c	0.0324	0.0000	0.0324	0.0324	0.0570	0.0516	0.2689	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 39918358 : SNP	a	g	0.2118	0.0139	0.2034	0.2388	-0.0106	0.0105	0.312	-+-++	0.2	4.010	4	0.4047
4 : 790757 : SNP	a	c	0.5930	0.0191	0.5579	0.6340	-0.0076	0.0086	0.3777	+-++-	34.2	6.075	4	0.1936
1 : 116879243 : SNP	t	c	0.0828	0.0090	0.0772	0.1024	0.0023	0.0168	0.889	-+?-+	14.3	3.503	3	0.3204
13 : 26823493 : SNP	a	t	0.4053	0.0188	0.3460	0.4189	-0.0034	0.0086	0.6896	+----	46.1	7.421	4	0.1152
6 : 30758664 : SNP	a	c	0.9182	0.0090	0.9013	0.9271	0.0055	0.0334	0.8688	??++-	0.0	0.996	2	0.6077
10 : 113177770 : SNP	t	c	0.0631	0.0009	0.0617	0.0641	0.0050	0.0202	0.803	++??-	66.4	5.948	2	0.05109
19 : 40060533 : SNP	a	t	0.9203	0.0026	0.9125	0.9253	0.0047	0.0163	0.7714	0+?--	0.0	0.785	3	0.8531
4 : 135410848 : INDEL	d	r	0.5735	0.0103	0.5658	0.5948	-0.0026	0.0086	0.7603	0-+++	7.6	4.328	4	0.3635
8 : 135004615 : SNP	t	g	0.0662	0.0110	0.0539	0.0869	0.0133	0.0179	0.4586	+-?+-	9.2	3.302	3	0.3473
3 : 84853779 : SNP	t	g	0.2660	0.0124	0.2587	0.2934	0.0063	0.0097	0.516	-+--+	0.0	3.822	4	0.4306
8 : 1987586 : SNP	a	c	0.9748	0.0000	0.9748	0.9748	-0.0360	0.0445	0.4183	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 95710940 : SNP	t	c	0.9528	0.0065	0.9445	0.9621	-0.0421	0.0210	0.04549	--??+	0.0	1.352	2	0.5086
13 : 107038856 : SNP	a	g	0.9658	0.0000	0.9658	0.9658	0.0030	0.0576	0.9585	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 131670798 : SNP	c	g	0.9837	0.0000	0.9837	0.9837	-0.0310	0.0617	0.6152	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 132288997 : SNP	t	g	0.7599	0.0039	0.7572	0.7717	0.0055	0.0100	0.5807	+-+-+	34.0	6.062	4	0.1945
10 : 10428354 : SNP	c	g	0.9740	0.0048	0.9664	0.9770	0.0087	0.0350	0.8042	-???+	89.3	9.306	1	0.002284
12 : 43597224 : SNP	t	c	0.2815	0.0082	0.2607	0.2963	-0.0075	0.0093	0.4209	-++--	0.0	1.490	4	0.8284
15 : 39367923 : SNP	a	g	0.0510	0.0043	0.0451	0.0611	0.0095	0.0199	0.6341	+-?-+	0.0	2.703	3	0.4397
14 : 77644939 : SNP	t	g	0.9235	0.0091	0.9138	0.9423	0.0188	0.0167	0.262	++?++	0.0	0.622	3	0.8913
17 : 5685485 : SNP	t	c	0.5672	0.0116	0.5263	0.5736	-0.0036	0.0130	0.7824	+--++	4.2	4.174	4	0.383
7 : 133719206 : SNP	a	g	0.8112	0.0049	0.7952	0.8175	-0.0180	0.0111	0.1036	----+	0.0	3.191	4	0.5265
12 : 12803096 : SNP	a	t	0.9142	0.0116	0.9061	0.9407	-0.0014	0.0189	0.9413	+-?-+	0.0	0.544	3	0.9092
5 : 148516648 : SNP	a	c	0.7548	0.0115	0.7272	0.7794	0.0035	0.0100	0.7294	-+++-	0.0	1.489	4	0.8285
4 : 125638823 : SNP	t	g	0.0384	0.0035	0.0351	0.0445	0.0272	0.0246	0.2691	++??-	61.0	5.125	2	0.07713
12 : 123012333 : SNP	t	c	0.8965	0.0133	0.8664	0.9224	0.0090	0.0141	0.5226	+++--	0.0	2.692	4	0.6105
1 : 193441510 : SNP	t	c	0.8574	0.0099	0.8381	0.8846	0.0019	0.0121	0.8729	++++-	20.7	5.043	4	0.2829
7 : 105942433 : SNP	t	c	0.2333	0.0169	0.2067	0.2583	-0.0131	0.0104	0.2095	--+-+	0.0	2.015	4	0.7329
3 : 6036348 : SNP	t	c	0.1376	0.0188	0.0815	0.1461	-0.0099	0.0125	0.4318	---+-	0.0	1.676	4	0.7952
4 : 8026812 : SNP	a	g	0.8552	0.0101	0.8281	0.8770	-0.0035	0.0123	0.7747	-+-+-	60.4	10.110	4	0.03862
12 : 27023986 : SNP	a	g	0.8754	0.0080	0.8693	0.9000	-0.0059	0.0130	0.6496	--+++	0.0	1.554	4	0.817
11 : 86705452 : SNP	t	c	0.1455	0.0067	0.1365	0.1546	0.0110	0.0119	0.3579	+++-+	0.0	2.498	4	0.645
4 : 109547567 : SNP	t	c	0.9720	0.0009	0.9713	0.9731	-0.0130	0.0292	0.6571	--???	0.0	0.053	1	0.8187
1 : 202812403 : SNP	a	g	0.0753	0.0095	0.0674	0.1024	0.0387	0.0196	0.04834	++?++	0.0	0.732	3	0.8657
2 : 18572353 : SNP	a	g	0.0454	0.0030	0.0434	0.0518	-0.0075	0.0219	0.7328	+-??-	59.5	4.939	2	0.08464
2 : 139560221 : SNP	t	c	0.7358	0.0066	0.7231	0.7440	-0.0087	0.0097	0.3701	--++-	31.3	5.826	4	0.2125
12 : 34086735 : SNP	a	g	0.9743	0.0000	0.9743	0.9743	-0.0380	0.0607	0.531	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 49748741 : SNP	a	g	0.8975	0.0075	0.8692	0.9000	0.0157	0.0142	0.2686	+-+++	0.0	2.523	4	0.6404
19 : 52660783 : SNP	a	g	0.8538	0.0041	0.8441	0.8580	-0.0035	0.0122	0.7732	0-+-+	35.0	6.159	4	0.1876
2 : 126196597 : SNP	t	c	0.1096	0.0181	0.0940	0.1433	-0.0127	0.0137	0.3563	---++	71.3	13.938	4	0.007495
6 : 31509779 : SNP	c	g	0.6638	0.0384	0.6318	0.7422	-0.0009	0.0093	0.9211	+--+-	0.0	2.319	4	0.6773
4 : 74302800 : SNP	a	c	0.8675	0.0105	0.8609	0.8918	0.0050	0.0126	0.6885	+-++-	0.0	3.453	4	0.485
5 : 81359709 : SNP	a	g	0.7537	0.0031	0.7439	0.7591	0.0020	0.0098	0.8405	-++-+	65.5	11.602	4	0.02057
1 : 22540117 : SNP	t	c	0.2145	0.0067	0.1974	0.2186	-0.0094	0.0105	0.3706	+-+--	34.0	6.061	4	0.1946
4 : 75103676 : SNP	t	c	0.7780	0.0104	0.7437	0.7876	-0.0088	0.0103	0.3958	-----	0.0	1.251	4	0.8696
5 : 143933116 : SNP	t	g	0.0435	0.0102	0.0353	0.0672	-0.0208	0.0223	0.3491	--?++	0.0	1.904	3	0.5926
17 : 20976220 : SNP	t	c	0.1903	0.0046	0.1859	0.2063	-0.0039	0.0113	0.7293	++---	18.7	4.920	4	0.2956
16 : 12969517 : INDEL	d	r	0.6260	0.0062	0.6140	0.6357	0.0075	0.0095	0.4259	-+-++	0.0	3.779	4	0.4368
7 : 15426956 : SNP	a	g	0.5012	0.0094	0.4808	0.5127	-0.0054	0.0085	0.5264	+-+--	0.0	1.254	4	0.8691
12 : 126825979 : SNP	t	c	0.7682	0.0185	0.7303	0.7795	-0.0039	0.0102	0.7056	--+++	0.0	1.358	4	0.8515
2 : 75588211 : SNP	c	g	0.9035	0.0050	0.8972	0.9085	0.0068	0.0146	0.6398	++++-	0.0	1.878	4	0.7582
14 : 22342001 : SNP	a	g	0.6819	0.0089	0.6651	0.7105	0.0078	0.0091	0.3919	+++-+	0.0	1.593	4	0.81
10 : 112610355 : SNP	t	c	0.9083	0.0068	0.8996	0.9159	-0.0015	0.0156	0.9253	+-?+-	0.0	2.741	3	0.4333
11 : 72155852 : SNP	t	g	0.9780	0.0000	0.9780	0.9780	0.0490	0.0455	0.2814	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 43943690 : SNP	t	c	0.0150	0.0000	0.0150	0.0150	-0.0360	0.0495	0.4674	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 180681059 : INDEL	i	r	0.2673	0.0176	0.2572	0.3030	-0.0031	0.0098	0.7529	+---+	0.0	2.234	4	0.6928
9 : 10934049 : INDEL	i	r	0.0265	0.0000	0.0265	0.0265	-0.0520	0.0495	0.2938	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 124872074 : SNP	t	c	0.9852	0.0000	0.9852	0.9852	0.0150	0.0516	0.7711	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 229394028 : SNP	t	g	0.7476	0.0077	0.7260	0.7592	-0.0083	0.0100	0.4068	+-+--	36.5	6.301	4	0.1778
8 : 57916806 : SNP	t	c	0.0320	0.0000	0.0320	0.0320	0.0040	0.0404	0.9212	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 118260996 : SNP	a	g	0.0723	0.0024	0.0666	0.0747	-0.0070	0.0174	0.685	+-?-+	21.1	3.803	3	0.2835
6 : 19170898 : SNP	t	c	0.9312	0.0053	0.9253	0.9423	0.0300	0.0172	0.08137	++?-+	55.7	6.772	3	0.07953
1 : 213763252 : INDEL	d	r	0.6727	0.0069	0.6598	0.6864	0.0147	0.0093	0.1147	+++-+	0.0	1.080	4	0.8975
1 : 75157402 : INDEL	d	r	0.1446	0.0103	0.1355	0.1747	0.0102	0.0144	0.4793	+-+-+	23.3	5.217	4	0.2658
9 : 88277716 : SNP	t	c	0.1852	0.0091	0.1677	0.1988	-0.0065	0.0113	0.5615	-+--+	0.0	2.988	4	0.5598
18 : 54001748 : INDEL	i	r	0.0417	0.0009	0.0399	0.0426	-0.0504	0.0244	0.03868	--??-	72.7	7.328	2	0.02563
10 : 120953576 : SNP	t	c	0.0609	0.0057	0.0457	0.0639	-0.0260	0.0204	0.2038	--??+	41.0	3.392	2	0.1834
8 : 64207578 : SNP	a	t	0.8935	0.0066	0.8875	0.9037	0.0218	0.0147	0.1388	+-+++	0.0	2.639	4	0.6199
10 : 93361825 : SNP	t	c	0.0994	0.0106	0.0704	0.1058	-0.0150	0.0147	0.3075	---+-	0.0	1.637	4	0.8021
5 : 28506653 : SNP	t	c	0.1887	0.0207	0.1774	0.2281	-0.0083	0.0110	0.4537	---++	0.0	0.893	4	0.9256
3 : 102435510 : SNP	a	g	0.8219	0.0089	0.8036	0.8410	-0.0079	0.0113	0.4874	----+	0.0	1.495	4	0.8275
10 : 36760211 : SNP	t	c	0.0603	0.0047	0.0476	0.0633	0.0173	0.0187	0.3545	-+??+	0.0	1.727	2	0.4216
8 : 794831 : SNP	a	c	0.0436	0.0088	0.0362	0.0613	0.0085	0.0223	0.7042	++?-+	0.0	0.747	3	0.8622
11 : 63587986 : SNP	t	g	0.5387	0.0155	0.5216	0.5629	-0.0010	0.0085	0.9051	-+++-	0.0	2.649	4	0.6182
17 : 60207612 : SNP	a	c	0.8897	0.0108	0.8768	0.9064	-0.0088	0.0173	0.609	--?--	0.0	0.847	3	0.8383
4 : 43556105 : SNP	c	g	0.9121	0.0117	0.8922	0.9200	-0.0077	0.0155	0.6214	--++-	0.0	0.165	4	0.9968
14 : 42210427 : INDEL	i	r	0.1976	0.0211	0.1475	0.2141	0.0007	0.0107	0.9475	+-++-	0.0	1.282	4	0.8645
8 : 78458606 : SNP	c	g	0.8898	0.0033	0.8808	0.9011	-0.0131	0.0135	0.3309	-+--+	12.9	4.592	4	0.3318
10 : 34813908 : SNP	a	c	0.9539	0.0080	0.9392	0.9627	-0.0145	0.0216	0.5001	-+??+	66.6	5.985	2	0.05016
5 : 105028847 : SNP	t	c	0.1861	0.0087	0.1635	0.1922	0.0223	0.0112	0.04555	+++-+	0.0	3.592	4	0.464
6 : 138613363 : SNP	a	g	0.0599	0.0027	0.0569	0.0625	0.0114	0.0184	0.5339	++?++	0.0	0.105	3	0.9912
1 : 208820770 : SNP	t	c	0.8015	0.0080	0.7955	0.8155	0.0137	0.0335	0.6841	??-++	32.7	2.971	2	0.2264
6 : 82251335 : SNP	t	c	0.3948	0.0258	0.3795	0.4515	0.0059	0.0085	0.4894	+-++-	3.6	4.151	4	0.3859
3 : 101616961 : SNP	t	g	0.0596	0.0102	0.0522	0.0799	0.0198	0.0185	0.2865	++?++	0.0	0.051	3	0.997
10 : 2008811 : SNP	a	c	0.0565	0.0027	0.0508	0.0595	-0.0395	0.0197	0.04572	--?--	0.0	0.718	3	0.8689
15 : 98300553 : SNP	a	t	0.0823	0.0021	0.0793	0.0878	0.0097	0.0156	0.5357	+---+	36.4	6.291	4	0.1784
4 : 74460288 : SNP	t	c	0.7048	0.0261	0.6438	0.7223	-0.0194	0.0092	0.0349	--+-+	36.0	6.248	4	0.1814
10 : 123494364 : SNP	t	c	0.5158	0.0221	0.4794	0.5496	-0.0039	0.0093	0.6722	++---	0.0	2.040	4	0.7284
9 : 125016167 : SNP	t	c	0.1351	0.0040	0.1250	0.1373	0.0138	0.0156	0.3762	+--++	26.7	5.458	4	0.2435
2 : 169254708 : SNP	c	g	0.8240	0.0075	0.8062	0.8425	-0.0064	0.0115	0.5782	----+	0.0	1.043	4	0.9032
1 : 82700945 : SNP	a	c	0.5742	0.0055	0.5682	0.5806	-0.0072	0.0085	0.401	-+---	0.0	1.323	4	0.8574
2 : 55785499 : INDEL	d	r	0.1898	0.0118	0.1634	0.1974	-0.0188	0.0108	0.08132	--++-	0.0	3.782	4	0.4363
4 : 107901832 : SNP	a	t	0.0276	0.0000	0.0276	0.0276	0.0390	0.0374	0.2971	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 73504504 : SNP	a	g	0.9609	0.0089	0.9394	0.9666	-0.0172	0.0292	0.5558	+??--	0.0	1.317	2	0.5178
4 : 7405631 : SNP	a	g	0.1916	0.0140	0.1624	0.2002	0.0121	0.0113	0.282	+-++-	41.2	6.805	4	0.1465
14 : 78773749 : SNP	a	g	0.7679	0.0106	0.7495	0.7771	0.0030	0.0103	0.7685	0+--+	27.7	5.530	4	0.2371
7 : 11320295 : SNP	t	c	0.0870	0.0065	0.0785	0.0933	0.0062	0.0163	0.7015	+++--	0.0	1.535	4	0.8204
4 : 98131909 : SNP	a	c	0.3220	0.0049	0.3150	0.3262	0.0162	0.0091	0.07534	++-++	0.0	1.865	4	0.7606
4 : 156301863 : INDEL	i	r	0.0716	0.0023	0.0684	0.0742	-0.0332	0.0233	0.1548	-+??-	0.0	1.894	2	0.3879
4 : 164296736 : SNP	c	g	0.9062	0.0019	0.9021	0.9096	0.0060	0.0150	0.6909	0+?++	0.0	0.540	3	0.9101
13 : 90321823 : SNP	a	g	0.8260	0.0021	0.8229	0.8280	0.0128	0.0111	0.2493	++++-	64.2	11.160	4	0.02482
16 : 58368310 : SNP	a	g	0.2478	0.0068	0.2429	0.2670	0.0128	0.0113	0.2555	+0+++	0.0	2.613	4	0.6245
3 : 162900460 : SNP	t	c	0.2776	0.0059	0.2662	0.3027	-0.0007	0.0093	0.9432	++---	3.1	4.128	4	0.3889
20 : 53800743 : SNP	t	c	0.0503	0.0116	0.0391	0.0777	0.0080	0.0211	0.7032	-+?++	0.0	1.428	3	0.6989
5 : 156629849 : SNP	t	c	0.0858	0.0094	0.0742	0.1011	0.0087	0.0170	0.6094	++?+-	0.0	0.823	3	0.844
1 : 197685827 : SNP	t	c	0.8969	0.0115	0.8604	0.9051	-0.0299	0.0152	0.05015	-----	0.0	0.466	4	0.9767
12 : 5756080 : INDEL	d	r	0.1196	0.0059	0.1125	0.1251	0.0214	0.0131	0.1029	++-+-	0.0	2.061	4	0.7246
2 : 60112995 : SNP	t	c	0.0464	0.0046	0.0412	0.0549	-0.0360	0.0220	0.1018	-+??-	52.4	4.202	2	0.1223
2 : 190526684 : SNP	t	c	0.0475	0.0004	0.0472	0.0481	-0.0098	0.0257	0.7038	-+???	0.0	0.085	1	0.7706
2 : 241193408 : SNP	t	c	0.2493	0.0111	0.2233	0.2803	-0.0070	0.0103	0.495	0-+-+	12.6	4.579	4	0.3333
11 : 66149510 : SNP	t	c	0.0302	0.0000	0.0302	0.0302	-0.0720	0.0445	0.1055	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 73832613 : SNP	t	c	0.0179	0.0000	0.0179	0.0179	0.0720	0.0505	0.1543	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 110470711 : SNP	c	g	0.5106	0.0167	0.4885	0.5274	-0.0027	0.0085	0.7482	+-+--	0.0	1.704	4	0.79
15 : 34429062 : INDEL	d	r	0.0729	0.0000	0.0729	0.0729	0.0942	0.0664	0.156	????+	0.0	0.000	0	1
2 : 176659053 : INDEL	d	r	0.0182	0.0000	0.0182	0.0182	0.0080	0.0455	0.8604	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 104326846 : SNP	a	c	0.0527	0.0036	0.0429	0.0542	-0.0126	0.0202	0.531	--??+	29.1	2.823	2	0.2438
2 : 242483938 : INDEL	d	r	0.5815	0.0276	0.5532	0.6467	-0.0233	0.0092	0.01165	--+--	0.0	3.993	4	0.407
1 : 168805911 : SNP	t	g	0.0130	0.0000	0.0130	0.0130	-0.0140	0.0526	0.79	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 111814717 : SNP	a	g	0.6218	0.0102	0.5831	0.6339	-0.0075	0.0089	0.4007	+--+-	0.0	3.474	4	0.4819
1 : 62394734 : SNP	a	c	0.8414	0.0039	0.8311	0.8465	-0.0015	0.0119	0.8977	--++-	39.7	6.629	4	0.1568
5 : 118179131 : SNP	a	g	0.9737	0.0055	0.9649	0.9771	-0.0005	0.0326	0.9877	+???-	0.0	0.136	1	0.712
19 : 331028 : SNP	a	g	0.7007	0.0036	0.6951	0.7055	-0.0100	0.0092	0.2748	---++	47.7	7.643	4	0.1056
4 : 24168726 : SNP	a	c	0.1007	0.0036	0.0932	0.1125	0.0141	0.0142	0.3199	+--++	0.0	3.111	4	0.5394
15 : 43064763 : SNP	t	c	0.8240	0.0157	0.8134	0.8643	0.0097	0.0115	0.3989	-++-+	0.0	1.338	4	0.8549
6 : 65605287 : SNP	t	c	0.9042	0.0090	0.8768	0.9090	-0.0010	0.0155	0.9471	----+	0.0	2.297	4	0.6813
1 : 222465046 : SNP	a	g	0.0898	0.0071	0.0803	0.0964	-0.0306	0.0242	0.2072	-?---	0.0	0.150	3	0.9852
10 : 61417457 : SNP	a	g	0.0427	0.0036	0.0376	0.0457	-0.0421	0.0224	0.06038	-+??-	0.0	1.696	2	0.4282
15 : 39773218 : SNP	a	t	0.0334	0.0005	0.0326	0.0341	-0.0051	0.0251	0.8394	-+??+	0.0	0.492	2	0.782
2 : 46288591 : SNP	c	g	0.2452	0.0121	0.2350	0.2874	0.0026	0.0100	0.7933	+-+-+	21.1	5.068	4	0.2804
22 : 32698290 : INDEL	d	r	0.4862	0.0302	0.4176	0.5150	-0.0036	0.0088	0.6816	+--?+	28.8	4.213	3	0.2394
3 : 42699367 : SNP	t	g	0.2171	0.0106	0.2081	0.2553	0.0085	0.0105	0.4164	+++-+	0.0	2.299	4	0.681
20 : 46620931 : SNP	a	g	0.5472	0.0095	0.5247	0.5580	-0.0025	0.0085	0.7724	--+++	7.0	4.301	4	0.3668
8 : 78547121 : SNP	a	c	0.4972	0.0275	0.4239	0.5144	-0.0032	0.0085	0.706	+--++	0.0	1.735	4	0.7843
16 : 22726316 : SNP	c	g	0.2586	0.0069	0.2512	0.2831	0.0103	0.0106	0.3289	-++++	0.0	2.733	4	0.6035
12 : 67971683 : SNP	a	g	0.9138	0.0155	0.8818	0.9270	-0.0012	0.0173	0.9433	-++-+	0.0	1.775	4	0.7771
2 : 56985655 : SNP	t	c	0.5325	0.0215	0.4825	0.5494	-0.0073	0.0085	0.3918	+----	0.0	2.523	4	0.6405
7 : 39518490 : SNP	a	g	0.4279	0.0189	0.4009	0.4699	0.0019	0.0091	0.839	-+-++	0.0	3.833	4	0.429
20 : 1832655 : SNP	a	g	0.8193	0.0296	0.7621	0.8376	-0.0021	0.0110	0.8504	-+--+	0.0	3.894	4	0.4205
1 : 197938516 : SNP	t	c	0.8479	0.0193	0.8307	0.8763	0.0144	0.0167	0.3885	-++++	0.0	2.311	4	0.6788
13 : 99311248 : SNP	a	g	0.0406	0.0019	0.0361	0.0416	-0.0171	0.0231	0.4589	--??-	0.0	0.976	2	0.614
20 : 35756930 : SNP	a	c	0.3598	0.0104	0.3511	0.3883	0.0011	0.0091	0.9017	++---	45.7	7.362	4	0.1179
5 : 98430096 : INDEL	d	r	0.2228	0.0161	0.2072	0.2513	0.0070	0.0105	0.5036	+++--	0.0	1.598	4	0.8092
19 : 11189980 : SNP	a	c	0.1268	0.0094	0.1216	0.1450	0.0007	0.0135	0.9565	+-?+-	0.0	0.834	3	0.8413
10 : 12354872 : SNP	a	c	0.5339	0.0129	0.5054	0.5454	-0.0039	0.0091	0.6723	-+-+-	6.3	4.267	4	0.3711
6 : 160912897 : SNP	t	c	0.0180	0.0000	0.0180	0.0180	-0.0270	0.0475	0.5698	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 130277004 : SNP	c	g	0.0610	0.0112	0.0532	0.0794	0.0373	0.0196	0.05729	+-?++	28.9	4.218	3	0.2389
8 : 111581847 : SNP	t	g	0.1219	0.0147	0.0807	0.1302	0.0057	0.0132	0.666	+--+-	77.5	17.772	4	0.001367
14 : 53887949 : SNP	a	g	0.9266	0.0032	0.9234	0.9316	0.0148	0.0196	0.4491	++?--	0.0	1.390	3	0.7078
3 : 174952714 : SNP	t	c	0.8063	0.0052	0.8021	0.8228	-0.0120	0.0109	0.2726	-+++-	44.6	7.222	4	0.1246
5 : 101822548 : SNP	a	g	0.0185	0.0000	0.0185	0.0185	0.0370	0.0465	0.4262	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 111786698 : SNP	a	g	0.1631	0.0156	0.1220	0.1763	0.0000	0.0115	0.9981	+-++-	0.0	1.545	4	0.8187
20 : 36258061 : SNP	t	c	0.6517	0.0158	0.6149	0.6614	0.0010	0.0089	0.9098	+---+	0.0	1.124	4	0.8905
10 : 119089509 : SNP	a	g	0.6977	0.0168	0.6776	0.7156	-0.0061	0.0127	0.6307	-+--+	0.0	3.711	4	0.4466
2 : 110886142 : SNP	a	g	0.3223	0.0055	0.3109	0.3408	0.0046	0.0092	0.6175	++-+-	0.0	3.806	4	0.4329
5 : 6158144 : SNP	a	g	0.0723	0.0056	0.0551	0.0760	-0.0047	0.0170	0.7824	--?++	58.0	7.135	3	0.06773
8 : 5414448 : SNP	t	g	0.8563	0.0162	0.8426	0.8896	-0.0075	0.0146	0.6081	----+	0.0	2.823	4	0.5878
16 : 56802605 : SNP	t	c	0.9741	0.0000	0.9741	0.9741	-0.0170	0.0546	0.7555	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 146166538 : SNP	a	g	0.9820	0.0000	0.9820	0.9820	-0.0260	0.0627	0.6783	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 77936568 : SNP	t	c	0.2783	0.0173	0.2428	0.3072	-0.0038	0.0099	0.6997	-++--	0.0	1.619	4	0.8054
6 : 69168045 : SNP	a	g	0.5100	0.0120	0.4906	0.5247	-0.0065	0.0093	0.488	--+++	0.0	2.869	4	0.58
4 : 45975776 : SNP	a	g	0.9835	0.0000	0.9835	0.9835	0.0700	0.0566	0.2162	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 133542534 : SNP	t	c	0.2102	0.0195	0.1532	0.2218	0.0054	0.0103	0.6011	++-++	0.0	3.051	4	0.5493
8 : 96521988 : SNP	t	c	0.4573	0.0082	0.4419	0.4689	-0.0171	0.0087	0.0483	--+--	4.5	4.187	4	0.3813
6 : 17828187 : SNP	a	c	0.2151	0.0167	0.1871	0.2367	-0.0176	0.0105	0.09477	--++-	0.0	2.422	4	0.6586
8 : 126097473 : SNP	a	g	0.9791	0.0000	0.9791	0.9791	0.0540	0.0425	0.2034	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 14960438 : INDEL	i	r	0.0283	0.0008	0.0276	0.0293	0.0274	0.0293	0.3501	++???	0.0	0.040	1	0.8417
6 : 88134645 : SNP	a	t	0.7149	0.0201	0.6724	0.7300	-0.0193	0.0093	0.0376	-+---	36.3	6.282	4	0.1791
21 : 25091673 : SNP	a	t	0.1403	0.0219	0.1028	0.1575	0.0016	0.0175	0.9253	++-++	0.0	1.269	4	0.8665
6 : 114770239 : INDEL	d	r	0.0303	0.0033	0.0283	0.0357	0.0076	0.0321	0.8138	+???+	0.0	0.034	1	0.853
16 : 54105836 : SNP	c	g	0.0488	0.0050	0.0461	0.0593	-0.0160	0.0210	0.4463	--??-	0.0	0.622	2	0.7326
14 : 100396482 : SNP	a	g	0.2740	0.0063	0.2647	0.2832	-0.0058	0.0099	0.5616	+--++	63.0	10.824	4	0.02861
13 : 62081594 : SNP	a	t	0.1696	0.0260	0.1449	0.2198	-0.0063	0.0114	0.5782	--+-+	69.5	13.135	4	0.01063
3 : 157280843 : SNP	a	g	0.9225	0.0061	0.9178	0.9394	0.0072	0.0162	0.6579	+-?--	0.0	2.287	3	0.5151
10 : 72752244 : SNP	a	g	0.5772	0.0081	0.5647	0.5897	0.0057	0.0086	0.5117	++-++	0.0	1.643	4	0.8011
17 : 66422065 : SNP	a	c	0.0375	0.0050	0.0342	0.0450	-0.0092	0.0328	0.7797	-???-	0.0	0.031	1	0.8611
1 : 178607684 : SNP	a	g	0.6636	0.0232	0.6141	0.6882	0.0077	0.0091	0.3982	-++++	0.0	3.337	4	0.5031
2 : 22595179 : SNP	t	c	0.3665	0.0246	0.3125	0.3883	0.0089	0.0087	0.3041	+-+--	28.2	5.573	4	0.2333
5 : 14604521 : SNP	c	g	0.9530	0.0000	0.9530	0.9530	-0.0890	0.0404	0.02773	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 108833523 : SNP	a	g	0.2302	0.0042	0.2256	0.2410	-0.0015	0.0100	0.8823	+----	62.9	10.789	4	0.02904
11 : 1913377 : SNP	a	g	0.0370	0.0009	0.0364	0.0391	-0.0205	0.0244	0.4021	--??+	0.0	1.377	2	0.5023
8 : 56063021 : SNP	a	c	0.2124	0.0128	0.2058	0.2426	-0.0080	0.0108	0.4582	+----	3.7	4.152	4	0.3859
1 : 242090164 : SNP	a	g	0.0668	0.0183	0.0489	0.0879	-0.0064	0.0296	0.8278	-??++	0.0	0.820	2	0.6636
22 : 28005719 : SNP	c	g	0.7780	0.0046	0.7625	0.7846	-0.0043	0.0113	0.7021	+-+--	0.0	3.903	4	0.4193
11 : 40664430 : SNP	a	t	0.5748	0.0130	0.5610	0.6011	0.0039	0.0086	0.6454	+++-+	39.3	6.586	4	0.1595
1 : 15783081 : SNP	t	c	0.8960	0.0106	0.8736	0.9032	0.0200	0.0152	0.1877	+--+-	24.9	5.323	4	0.2557
1 : 183438002 : SNP	a	g	0.0663	0.0065	0.0634	0.0826	0.0002	0.0198	0.9934	+-??+	0.0	0.991	2	0.6093
8 : 134482999 : SNP	a	g	0.0622	0.0033	0.0571	0.0660	0.0071	0.0180	0.6932	--?++	0.0	2.071	3	0.5579
16 : 20951968 : SNP	c	g	0.2797	0.0069	0.2671	0.2878	-0.0179	0.0098	0.06704	-----	0.0	0.473	4	0.9761
6 : 18770621 : INDEL	d	r	0.4107	0.0343	0.3405	0.4454	-0.0004	0.0104	0.9655	-++++	0.0	1.112	4	0.8924
18 : 65547826 : SNP	a	t	0.7497	0.0160	0.7294	0.7867	-0.0153	0.0110	0.162	+-+--	47.7	7.650	4	0.1053
5 : 167435994 : SNP	a	g	0.8274	0.0141	0.7990	0.8358	-0.0213	0.0112	0.05592	--+-+	0.0	3.717	4	0.4456
8 : 74225149 : SNP	t	c	0.2486	0.0149	0.2260	0.2771	0.0015	0.0099	0.8795	-+--+	0.0	1.248	4	0.8701
2 : 120662739 : SNP	a	t	0.9677	0.0000	0.9677	0.9677	0.0340	0.0394	0.3885	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 21134138 : SNP	a	g	0.6214	0.0365	0.5296	0.6534	-0.0218	0.0092	0.01757	--+-+	57.2	9.346	4	0.05302
11 : 23610152 : SNP	t	g	0.9465	0.0041	0.9412	0.9537	-0.0288	0.0226	0.2019	--?--	0.0	0.975	3	0.8073
2 : 40546253 : SNP	a	t	0.0585	0.0049	0.0451	0.0609	0.0191	0.0197	0.3323	0+??+	0.0	1.226	2	0.5417
14 : 100231703 : SNP	t	c	0.3356	0.0066	0.3140	0.3392	-0.0001	0.0092	0.9896	0++--	5.6	4.237	4	0.3748
16 : 7398452 : SNP	a	g	0.9118	0.0051	0.9063	0.9184	0.0004	0.0153	0.9812	+-+-+	0.0	1.037	4	0.9041
9 : 97958308 : SNP	t	c	0.5868	0.0087	0.5719	0.5973	0.0060	0.0085	0.4804	--+++	15.8	4.752	4	0.3137
13 : 72909612 : INDEL	i	r	0.7412	0.0048	0.7280	0.7481	-0.0087	0.0099	0.3839	-----	0.0	0.390	4	0.9833
13 : 110322783 : INDEL	d	r	0.9506	0.0000	0.9506	0.9506	-0.0300	0.0364	0.4097	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 122777373 : SNP	a	c	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	0.0310	0.0526	0.5554	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 177724776 : SNP	a	g	0.9089	0.0043	0.9013	0.9225	-0.0050	0.0151	0.7381	-++--	0.0	2.104	4	0.7167
2 : 9003380 : SNP	t	c	0.8855	0.0101	0.8710	0.8938	0.0199	0.0135	0.1395	++-+-	49.3	7.883	4	0.09596
2 : 46470109 : SNP	a	g	0.6420	0.0332	0.5676	0.6799	0.0145	0.0107	0.1748	++++-	62.8	10.740	4	0.02965
13 : 58843747 : SNP	t	c	0.9462	0.0022	0.9446	0.9491	0.0095	0.0218	0.6621	+-???	0.0	0.670	1	0.413
3 : 83277946 : SNP	t	c	0.7732	0.0123	0.7666	0.8028	-0.0023	0.0105	0.8283	+-+-+	0.0	3.269	4	0.5139
1 : 69993512 : SNP	a	g	0.6551	0.0129	0.6208	0.6645	0.0042	0.0091	0.6426	+--+-	44.6	7.214	4	0.125
5 : 62650476 : SNP	a	g	0.3178	0.0127	0.2888	0.3248	0.0046	0.0092	0.62	-++++	0.0	1.296	4	0.8621
1 : 226047256 : SNP	a	g	0.9628	0.0021	0.9589	0.9646	0.0341	0.0237	0.1498	++??+	0.0	0.550	2	0.7596
19 : 14857179 : SNP	t	c	0.7363	0.0093	0.7274	0.7516	0.0038	0.0098	0.7001	-+-++	11.2	4.507	4	0.3418
4 : 39810817 : SNP	a	g	0.4469	0.0344	0.4243	0.5187	-0.0234	0.0089	0.00874	--+--	0.0	2.072	4	0.7226
11 : 21749577 : SNP	a	g	0.4363	0.0125	0.3988	0.4498	0.0062	0.0085	0.47	0+-+-	1.8	4.072	4	0.3963
9 : 14777650 : INDEL	d	r	0.6163	0.0331	0.5550	0.6516	-0.0104	0.0091	0.2515	-+-+-	0.0	3.039	4	0.5514
2 : 79734837 : SNP	c	g	0.7051	0.0074	0.6963	0.7216	-0.0038	0.0097	0.6948	-+-+-	40.5	6.719	4	0.1515
16 : 79986815 : SNP	t	g	0.9792	0.0000	0.9792	0.9792	0.0290	0.0435	0.5047	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 74058519 : INDEL	d	r	0.3983	0.0291	0.3698	0.4529	-0.0145	0.0095	0.1291	----+	0.0	2.394	4	0.6637
8 : 6391767 : SNP	t	c	0.2761	0.0025	0.2705	0.2821	-0.0244	0.0094	0.009415	-----	0.0	3.145	4	0.5338
8 : 3221736 : SNP	a	t	0.4540	0.0108	0.4383	0.4663	-0.0125	0.0085	0.1399	-+-+-	41.8	6.868	4	0.143
8 : 114292392 : SNP	c	g	0.1025	0.0098	0.0718	0.1097	-0.0113	0.0138	0.4145	+-+--	0.0	3.650	4	0.4555
13 : 104209729 : SNP	a	t	0.7882	0.0078	0.7632	0.8021	-0.0072	0.0104	0.4922	+++--	47.0	7.553	4	0.1094
11 : 123443681 : SNP	a	g	0.9225	0.0044	0.9154	0.9252	-0.0026	0.0318	0.9342	+???-	0.0	0.082	1	0.7751
6 : 152148098 : SNP	a	g	0.1282	0.0092	0.1186	0.1386	0.0035	0.0130	0.7845	-++-+	0.0	0.553	4	0.9681
5 : 41119509 : SNP	t	g	0.3645	0.0098	0.3437	0.3851	0.0088	0.0090	0.3281	++--+	0.0	1.275	4	0.8655
20 : 19293521 : SNP	a	g	0.5953	0.0266	0.5388	0.6105	-0.0183	0.0085	0.03132	----+	0.0	2.063	4	0.7241
5 : 43807483 : INDEL	d	r	0.0650	0.0045	0.0610	0.0712	0.0157	0.0187	0.4024	++?+-	0.0	2.467	3	0.4813
13 : 27649859 : SNP	a	g	0.4174	0.0172	0.3898	0.4336	-0.0026	0.0086	0.761	-+++-	2.7	4.109	4	0.3914
1 : 212073047 : SNP	a	g	0.9397	0.0034	0.9374	0.9477	-0.0069	0.0190	0.7148	++??-	36.2	3.133	2	0.2088
19 : 54242383 : SNP	a	t	0.9199	0.0049	0.9163	0.9267	0.0129	0.0477	0.787	???+-	0.0	0.919	1	0.3378
4 : 29483294 : SNP	t	c	0.8690	0.0055	0.8583	0.8743	-0.0032	0.0126	0.8024	-+-++	0.0	3.466	4	0.483
13 : 85519450 : SNP	t	c	0.8369	0.0078	0.8096	0.8415	-0.0084	0.0118	0.4759	+--+-	30.9	5.788	4	0.2156
13 : 34552179 : INDEL	i	r	0.0286	0.0000	0.0286	0.0286	-0.0730	0.0465	0.1164	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 75126270 : SNP	t	c	0.3931	0.0110	0.3866	0.4180	0.0083	0.0085	0.3296	+0--+	0.0	3.595	4	0.4636
7 : 28332358 : SNP	a	g	0.3596	0.0157	0.3366	0.3809	0.0096	0.0101	0.3453	-+-++	43.9	7.130	4	0.1292
12 : 7359202 : SNP	t	c	0.0156	0.0000	0.0156	0.0156	-0.0060	0.0607	0.9212	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 48274618 : SNP	a	g	0.0815	0.0060	0.0773	0.0951	0.0473	0.0257	0.06601	+??-+	0.0	0.918	2	0.632
13 : 110981617 : SNP	a	g	0.8623	0.0120	0.8472	0.8897	0.0172	0.0137	0.2105	+++-?	0.0	1.032	3	0.7935
9 : 109315416 : SNP	a	g	0.9033	0.0067	0.8949	0.9153	-0.0051	0.0158	0.7449	--?++	63.3	8.182	3	0.04239
5 : 105408663 : SNP	t	c	0.9609	0.0000	0.9609	0.9609	-0.0570	0.0435	0.1897	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 115934270 : SNP	a	g	0.0426	0.0073	0.0383	0.0618	-0.0193	0.0216	0.3707	--?+-	0.0	1.335	3	0.7208
7 : 95806183 : SNP	t	c	0.6390	0.0168	0.6155	0.6756	-0.0001	0.0086	0.9921	+-+++	11.3	4.510	4	0.3413
20 : 40254735 : SNP	t	c	0.3487	0.0087	0.3445	0.3697	0.0055	0.0091	0.5474	-+++-	0.0	2.547	4	0.6363
14 : 39346618 : SNP	t	c	0.8678	0.0171	0.8344	0.8793	-0.0120	0.0126	0.3374	-+-+-	50.3	8.042	4	0.09006
6 : 61948143 : SNP	a	t	0.8233	0.0052	0.8085	0.8256	0.0037	0.0132	0.7788	+++-?	43.1	5.276	3	0.1527
2 : 41941799 : INDEL	i	r	0.0542	0.0025	0.0522	0.0627	-0.0352	0.0193	0.06791	--?--	0.0	1.957	3	0.5813
1 : 228609434 : SNP	a	t	0.9693	0.0000	0.9693	0.9693	0.0230	0.0394	0.5596	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 11413657 : SNP	a	g	0.1294	0.0070	0.1193	0.1450	0.0095	0.0134	0.4787	+++++	0.0	0.241	4	0.9933
1 : 223273030 : SNP	t	c	0.3526	0.0268	0.3198	0.3931	0.0038	0.0105	0.7168	-++++	11.9	4.540	4	0.3378
3 : 21652009 : SNP	a	t	0.1271	0.0056	0.1235	0.1489	0.0222	0.0136	0.1027	+++--	76.6	17.121	4	0.001831
10 : 14732176 : SNP	t	c	0.5766	0.0162	0.5473	0.6104	0.0140	0.0086	0.1029	+-+++	0.0	3.842	4	0.4278
7 : 31855569 : SNP	a	g	0.2439	0.0267	0.2240	0.2947	-0.0028	0.0098	0.7721	+---+	60.5	10.133	4	0.03824
12 : 11533925 : SNP	t	g	0.7691	0.0155	0.7411	0.7908	0.0006	0.0133	0.9636	+----	0.0	0.727	4	0.948
3 : 69584526 : SNP	t	c	0.0329	0.0013	0.0311	0.0338	-0.0090	0.0278	0.7457	--???	0.0	0.000	1	1
1 : 84791239 : SNP	t	c	0.0846	0.0086	0.0676	0.1041	-0.0152	0.0152	0.318	+----	24.0	5.260	4	0.2616
8 : 17857416 : SNP	c	g	0.1249	0.0063	0.1179	0.1332	0.0006	0.0132	0.9636	+-++-	46.2	7.441	4	0.1143
10 : 11388843 : SNP	t	c	0.4539	0.0103	0.4396	0.4782	0.0067	0.0086	0.4378	++---	18.3	4.894	4	0.2984
7 : 869846 : SNP	a	g	0.5883	0.0064	0.5659	0.5960	-0.0029	0.0085	0.7311	-+---	0.0	3.451	4	0.4854
3 : 5784455 : SNP	a	g	0.0142	0.0000	0.0142	0.0142	0.0700	0.0576	0.2244	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 54888594 : SNP	a	t	0.9827	0.0000	0.9827	0.9827	0.0530	0.0607	0.3822	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 91382031 : SNP	a	g	0.9209	0.0019	0.9185	0.9245	-0.0077	0.0171	0.6516	-+?++	63.6	8.250	3	0.04113
11 : 63050128 : SNP	c	g	0.2536	0.0091	0.2451	0.2974	0.0005	0.0102	0.9601	--+++	76.5	17.012	4	0.001923
16 : 49387390 : SNP	a	g	0.9846	0.0000	0.9846	0.9846	-0.0780	0.0536	0.1454	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 36328652 : SNP	a	c	0.0855	0.0083	0.0649	0.0908	-0.0231	0.0154	0.1338	--?+-	0.0	2.130	3	0.5458
10 : 128603701 : SNP	t	c	0.2380	0.0161	0.2229	0.2743	-0.0053	0.0099	0.5886	-+---	0.7	4.028	4	0.4022
18 : 12805328 : SNP	t	c	0.8559	0.0025	0.8521	0.8670	0.0066	0.0123	0.5888	-+-++	17.5	4.851	4	0.303
19 : 54572479 : SNP	c	g	0.2863	0.0021	0.2853	0.2932	0.0025	0.0099	0.8003	++---	45.8	7.374	4	0.1174
8 : 13547856 : SNP	t	c	0.1512	0.0099	0.1234	0.1662	0.0036	0.0121	0.7662	-++++	0.0	0.539	4	0.9696
6 : 57107322 : SNP	t	c	0.3123	0.0044	0.3092	0.3217	-0.0035	0.0097	0.7205	+0++-	19.6	4.977	4	0.2897
15 : 41764701 : SNP	a	g	0.0295	0.0000	0.0295	0.0295	0.0720	0.0404	0.07497	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 131093057 : SNP	c	g	0.8688	0.0108	0.8388	0.8879	-0.0144	0.0129	0.2642	-----	0.0	2.005	4	0.7349
4 : 185876135 : SNP	t	c	0.4349	0.0199	0.4041	0.4612	0.0094	0.0088	0.2855	++-+-	0.0	0.978	4	0.9132
6 : 30948993 : SNP	c	g	0.7782	0.0288	0.7638	0.8503	-0.0181	0.0223	0.4179	??-+-	0.0	1.847	2	0.3971
5 : 165763314 : SNP	c	g	0.0431	0.0044	0.0367	0.0461	-0.0279	0.0250	0.2648	+-???	70.8	3.429	1	0.06408
13 : 22270468 : SNP	t	c	0.8285	0.0058	0.8252	0.8512	0.0171	0.0115	0.1357	++++-	60.0	10.002	4	0.04039
6 : 41245172 : SNP	t	c	0.4990	0.0059	0.4793	0.5074	0.0012	0.0085	0.8916	+++--	5.8	4.247	4	0.3736
5 : 13562205 : INDEL	d	r	0.2998	0.0164	0.2827	0.3208	-0.0028	0.0095	0.7695	--+++	0.0	3.544	4	0.4712
2 : 226048279 : SNP	c	g	0.3682	0.0127	0.3457	0.3850	0.0148	0.0091	0.1037	+-+++	68.4	12.670	4	0.01301
4 : 100758861 : SNP	a	g	0.2058	0.0235	0.1822	0.2504	-0.0032	0.0114	0.7783	++-+-	73.6	15.177	4	0.004348
3 : 122642166 : SNP	t	c	0.9733	0.0000	0.9733	0.9733	0.0370	0.0384	0.3354	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 32765022 : SNP	a	g	0.2473	0.0222	0.2198	0.3103	-0.0140	0.0099	0.1572	-----	0.0	1.135	4	0.8887
13 : 77909303 : SNP	t	c	0.9803	0.0000	0.9803	0.9803	0.0180	0.0445	0.6857	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 72030079 : SNP	t	c	0.8906	0.0097	0.8822	0.9159	0.0289	0.0141	0.0406	++?++	0.0	0.237	3	0.9714
6 : 111904447 : SNP	a	g	0.1939	0.0123	0.1601	0.2060	0.0038	0.0106	0.7215	++---	0.0	3.353	4	0.5005
13 : 67581461 : SNP	a	g	0.8326	0.0104	0.8251	0.8619	0.0101	0.0114	0.3789	-++++	0.0	3.853	4	0.4262
5 : 40460055 : SNP	a	g	0.9856	0.0000	0.9856	0.9856	-0.0400	0.0546	0.4637	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 71311349 : SNP	t	g	0.7585	0.0066	0.7335	0.7661	-0.0199	0.0109	0.06779	-----	2.7	4.109	4	0.3914
14 : 30407021 : SNP	t	c	0.4114	0.0144	0.4022	0.4460	-0.0057	0.0086	0.5026	+--+-	0.0	1.793	4	0.7738
7 : 38106128 : SNP	t	g	0.5277	0.0096	0.5155	0.5501	0.0053	0.0085	0.5324	-+-+-	13.8	4.640	4	0.3263
5 : 26826368 : SNP	t	c	0.0444	0.0026	0.0377	0.0455	-0.0296	0.0223	0.1843	-+??-	5.5	2.117	2	0.347
13 : 46853201 : SNP	t	c	0.6317	0.0264	0.6090	0.6911	-0.0120	0.0087	0.1652	--++-	2.9	4.118	4	0.3903
4 : 182439381 : SNP	a	g	0.8994	0.0089	0.8839	0.9055	-0.0067	0.0144	0.6429	+----	0.0	2.291	4	0.6825
16 : 86833221 : SNP	a	t	0.8112	0.0061	0.7965	0.8166	0.0032	0.0119	0.7846	-++-+	55.7	9.025	4	0.06047
10 : 67272627 : SNP	t	c	0.3624	0.0159	0.3473	0.3875	0.0023	0.0093	0.803	-++-+	0.0	0.606	4	0.9624
2 : 189790969 : INDEL	d	r	0.1649	0.0131	0.1553	0.1932	0.0194	0.0117	0.0961	++-++	0.0	0.249	4	0.9929
11 : 18524208 : SNP	t	c	0.4597	0.0039	0.4473	0.4636	0.0029	0.0085	0.7293	-+++-	29.1	5.641	4	0.2276
3 : 85698577 : SNP	a	g	0.7970	0.0044	0.7903	0.8133	-0.0024	0.0107	0.8188	-++--	31.7	5.856	4	0.2102
2 : 238828490 : SNP	t	c	0.1875	0.0086	0.1813	0.2117	-0.0061	0.0121	0.6115	-++--	23.4	5.220	4	0.2655
4 : 31034294 : SNP	a	g	0.3496	0.0130	0.3270	0.3695	-0.0142	0.0110	0.1944	----+	0.0	1.185	4	0.8806
6 : 80818438 : SNP	a	g	0.0230	0.0000	0.0230	0.0230	0.0740	0.0526	0.1592	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 177148043 : SNP	a	g	0.2431	0.0052	0.2324	0.2539	0.0042	0.0100	0.6753	-++--	59.5	9.866	4	0.04274
11 : 97170210 : SNP	a	t	0.5842	0.0140	0.5663	0.6058	0.0034	0.0089	0.7033	+--++	0.0	3.428	4	0.489
2 : 170825261 : SNP	t	c	0.8619	0.0098	0.8558	0.8871	0.0174	0.0123	0.1595	+++++	0.0	0.334	4	0.9875
12 : 7373300 : SNP	a	c	0.9588	0.0026	0.9553	0.9608	0.0324	0.0339	0.3394	-???+	68.3	3.153	1	0.07581
8 : 9836818 : SNP	a	g	0.0236	0.0000	0.0236	0.0236	0.0200	0.0425	0.6376	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 38459163 : SNP	t	c	0.0467	0.0056	0.0391	0.0541	-0.0194	0.0212	0.3592	--?+-	0.0	2.444	3	0.4855
4 : 38977659 : SNP	t	c	0.0320	0.0000	0.0320	0.0320	-0.0060	0.0404	0.882	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 90037233 : SNP	t	g	0.6521	0.0110	0.6364	0.6682	0.0161	0.0105	0.1272	++--+	0.0	3.029	4	0.5529
11 : 55071382 : SNP	c	g	0.0617	0.0014	0.0583	0.0628	-0.0015	0.0216	0.945	+-?-?	0.0	0.496	2	0.7804
11 : 116575673 : INDEL	i	r	0.5926	0.0134	0.5783	0.6350	0.0051	0.0086	0.5501	0+-+-	0.0	2.662	4	0.6159
7 : 64696330 : SNP	t	c	0.3766	0.0233	0.3355	0.4069	0.0044	0.0091	0.6265	-0+++	6.7	4.287	4	0.3686
7 : 62546730 : SNP	a	t	0.2353	0.0102	0.2221	0.2462	0.0109	0.0107	0.3106	+-++-	0.0	3.171	4	0.5296
13 : 94234719 : SNP	a	g	0.9217	0.0050	0.9105	0.9249	-0.0108	0.0167	0.5188	--?++	9.2	3.304	3	0.347
20 : 42433468 : SNP	a	g	0.0106	0.0000	0.0106	0.0106	0.1030	0.0607	0.08947	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 50446194 : SNP	a	g	0.9552	0.0089	0.9278	0.9613	0.0747	0.0242	0.002008	++?+?	0.0	1.103	2	0.5762
1 : 1490548 : SNP	a	g	0.9816	0.0000	0.9816	0.9816	-0.0170	0.0485	0.7261	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 94601787 : SNP	t	c	0.0668	0.0054	0.0599	0.0785	-0.0009	0.0205	0.966	+-?--	0.0	2.510	3	0.4735
16 : 79446978 : SNP	a	t	0.5087	0.0143	0.4988	0.5513	0.0045	0.0085	0.5945	++-+-	62.7	10.716	4	0.02995
1 : 7914066 : SNP	c	g	0.1938	0.0076	0.1686	0.1988	-0.0003	0.0109	0.9803	-++++	0.0	3.186	4	0.5272
5 : 31220865 : SNP	a	t	0.0839	0.0117	0.0606	0.0972	-0.0022	0.0159	0.8916	-+?-+	0.0	1.635	3	0.6516
15 : 95404345 : SNP	a	g	0.9215	0.0059	0.9169	0.9337	0.0082	0.0162	0.6116	-+?-+	0.0	1.070	3	0.7843
8 : 60833138 : SNP	t	c	0.9614	0.0027	0.9581	0.9637	-0.0077	0.0249	0.7561	0-???	0.0	0.140	1	0.7078
10 : 6494331 : SNP	t	c	0.1582	0.0035	0.1479	0.1609	-0.0048	0.0155	0.7564	++---	36.3	6.278	4	0.1793
13 : 70987421 : SNP	a	g	0.0234	0.0000	0.0234	0.0234	0.0920	0.0475	0.05282	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 48979343 : SNP	t	c	0.0894	0.0000	0.0894	0.0894	0.0173	0.0882	0.8445	???+?	0.0	0.000	0	1
7 : 128917587 : SNP	t	c	0.7225	0.0097	0.7017	0.7293	0.0243	0.0097	0.01199	++++-	0.0	2.672	4	0.614
15 : 101643523 : SNP	a	g	0.8695	0.0083	0.8633	0.8898	0.0000	0.0176	0.9993	-+?++	0.0	0.821	3	0.8444
10 : 78915353 : SNP	t	c	0.0632	0.0013	0.0603	0.0649	0.0092	0.0188	0.6232	-+?++	0.0	0.376	3	0.9452
16 : 61692588 : SNP	a	g	0.1222	0.0134	0.1110	0.1489	0.0131	0.0132	0.3216	-+++-	0.0	2.104	4	0.7166
2 : 192285254 : SNP	a	g	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	0.0430	0.0617	0.4856	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 56161396 : SNP	t	c	0.1133	0.0062	0.1027	0.1217	0.0112	0.0133	0.4015	+-+-+	16.0	4.760	4	0.3128
16 : 84059859 : SNP	c	g	0.3254	0.0256	0.2440	0.3459	-0.0092	0.0100	0.3555	----+	66.1	11.800	4	0.0189
9 : 1694981 : SNP	a	g	0.6332	0.0110	0.6243	0.6543	0.0068	0.0093	0.4642	++--+	0.0	2.098	4	0.7178
2 : 114597946 : SNP	t	c	0.0832	0.0104	0.0560	0.0913	-0.0031	0.0164	0.8494	--??+	68.9	6.436	2	0.04004
2 : 10404742 : SNP	a	g	0.3123	0.0069	0.2826	0.3170	-0.0094	0.0093	0.3116	+----	14.0	4.650	4	0.3251
10 : 43527170 : SNP	a	g	0.0264	0.0066	0.0217	0.0357	0.0237	0.0354	0.5045	+???-	31.2	1.454	1	0.228
5 : 117871776 : SNP	a	g	0.1839	0.0065	0.1613	0.1873	0.0015	0.0113	0.8954	---++	0.0	2.278	4	0.6847
3 : 116068037 : SNP	t	c	0.9660	0.0031	0.9630	0.9710	-0.0126	0.0250	0.6134	+-??-	29.2	2.823	2	0.2437
11 : 46399538 : SNP	t	c	0.8305	0.0098	0.8243	0.8525	-0.0046	0.0114	0.6844	+----	0.0	2.964	4	0.5639
3 : 8137685 : SNP	a	g	0.0291	0.0000	0.0291	0.0291	-0.0270	0.0374	0.4704	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 40968414 : SNP	a	g	0.0586	0.0038	0.0525	0.0639	-0.0036	0.0190	0.8511	+-?--	0.0	2.309	3	0.5109
5 : 33697661 : SNP	a	g	0.8087	0.0084	0.7996	0.8260	-0.0025	0.0111	0.8246	+-+--	0.0	3.215	4	0.5225
15 : 57109919 : SNP	a	g	0.1027	0.0000	0.1027	0.1027	0.0286	0.0770	0.7103	???+?	0.0	0.000	0	1
14 : 90591730 : SNP	a	g	0.4072	0.0135	0.3773	0.4377	0.0006	0.0091	0.9466	-++-+	54.8	8.856	4	0.06481
8 : 4882988 : SNP	a	t	0.1294	0.0019	0.1213	0.1313	0.0149	0.0134	0.2667	++-++	0.0	2.645	4	0.619
10 : 79366942 : SNP	t	c	0.2016	0.0122	0.1834	0.2122	0.0164	0.0108	0.1299	+++++	0.0	1.107	4	0.8931
12 : 104344873 : SNP	c	g	0.9754	0.0000	0.9754	0.9754	0.0250	0.0556	0.653	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 71184750 : SNP	a	g	0.9391	0.0040	0.9334	0.9419	0.0104	0.0363	0.7756	+???+	0.0	0.017	1	0.8958
13 : 46672921 : SNP	c	g	0.2685	0.0166	0.2351	0.2873	-0.0200	0.0099	0.04269	-----	0.0	3.959	4	0.4115
1 : 85465422 : SNP	t	c	0.4892	0.0145	0.4612	0.5085	-0.0060	0.0085	0.4806	--++-	0.0	2.897	4	0.5752
1 : 116187273 : SNP	a	g	0.9400	0.0065	0.9252	0.9443	-0.0482	0.0188	0.01048	--?-+	17.2	3.623	3	0.3051
17 : 35174186 : SNP	a	g	0.0647	0.0038	0.0629	0.0768	-0.0064	0.0175	0.7152	-+?--	0.0	1.954	3	0.582
11 : 111479713 : SNP	t	c	0.3044	0.0295	0.2807	0.3679	0.0034	0.0093	0.7151	+---+	0.0	3.499	4	0.478
2 : 107685763 : SNP	t	c	0.9357	0.0089	0.9302	0.9590	-0.0021	0.0209	0.9216	-+??-	0.0	0.255	2	0.8801
1 : 156874421 : SNP	c	g	0.8897	0.0037	0.8766	0.8980	0.0071	0.0135	0.5986	-+-++	57.6	9.433	4	0.05115
13 : 23437856 : SNP	a	g	0.2394	0.0130	0.2222	0.2805	0.0038	0.0106	0.7228	+-++-	25.2	5.345	4	0.2537
2 : 159580025 : SNP	t	c	0.0313	0.0007	0.0304	0.0319	-0.0309	0.0290	0.2861	--???	0.0	0.248	1	0.6186
13 : 105488624 : SNP	t	c	0.8220	0.0074	0.8129	0.8373	0.0056	0.0131	0.6686	+++--	0.0	1.900	4	0.7542
6 : 155474060 : SNP	t	c	0.9865	0.0000	0.9865	0.9865	-0.0950	0.0617	0.1234	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 16659515 : SNP	t	c	0.6299	0.0272	0.6095	0.6869	0.0098	0.0090	0.2742	+----	16.0	4.759	4	0.3129
10 : 31966507 : SNP	a	g	0.6385	0.0138	0.6120	0.6523	0.0053	0.0091	0.5598	+--++	14.4	4.671	4	0.3228
12 : 91923144 : SNP	c	g	0.1982	0.0086	0.1863	0.2151	-0.0097	0.0111	0.3841	-+---	3.1	4.130	4	0.3888
18 : 67178899 : SNP	a	t	0.7994	0.0148	0.7910	0.8345	-0.0060	0.0106	0.5722	-----	0.0	0.322	4	0.9884
6 : 25263480 : SNP	a	g	0.4734	0.0161	0.4541	0.5013	-0.0013	0.0103	0.8961	---++	0.0	1.581	4	0.8122
6 : 154578825 : INDEL	d	r	0.1724	0.0106	0.1633	0.1882	0.0109	0.0113	0.3361	+-++-	0.0	3.558	4	0.4692
7 : 63630142 : SNP	a	g	0.7106	0.0107	0.6777	0.7231	0.0096	0.0097	0.3221	++--+	41.3	6.812	4	0.1462
8 : 17836501 : SNP	t	g	0.5805	0.0170	0.5285	0.5924	-0.0065	0.0090	0.4756	----+	0.0	2.139	4	0.7102
19 : 38985384 : SNP	t	c	0.0281	0.0046	0.0238	0.0330	-0.0277	0.0302	0.359	--???	0.0	0.199	1	0.6552
6 : 112341279 : SNP	a	g	0.1766	0.0039	0.1714	0.1916	-0.0137	0.0115	0.2321	---+-	0.0	0.415	4	0.9812
8 : 51215044 : SNP	t	c	0.3106	0.0017	0.3053	0.3158	-0.0080	0.0092	0.3846	-0-+-	0.0	0.659	4	0.9563
2 : 77476344 : SNP	a	t	0.5289	0.0161	0.4958	0.5482	0.0103	0.0086	0.2311	++++-	61.5	10.377	4	0.03454
4 : 116133506 : SNP	a	t	0.2788	0.0181	0.2677	0.3160	0.0124	0.0097	0.1983	++---	0.0	3.015	4	0.5553
3 : 101204870 : SNP	a	g	0.3988	0.0040	0.3897	0.4037	-0.0002	0.0085	0.9808	+----	0.0	2.815	4	0.5892
17 : 48994958 : SNP	a	c	0.2490	0.0158	0.2193	0.2754	0.0204	0.0122	0.09624	++--+	52.1	8.357	4	0.07933
20 : 49249941 : SNP	t	c	0.8725	0.0111	0.8657	0.8959	0.0265	0.0152	0.08047	++?++	8.7	3.285	3	0.3497
6 : 121801632 : SNP	a	c	0.6458	0.0117	0.6396	0.6744	0.0024	0.0090	0.79	-+++-	0.0	1.531	4	0.8212
9 : 5205733 : SNP	a	c	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	-0.1160	0.0586	0.04787	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 72525203 : SNP	t	g	0.2481	0.0101	0.2293	0.2704	-0.0026	0.0099	0.7957	--+--	0.0	1.548	4	0.818
3 : 146186807 : SNP	c	g	0.4573	0.0107	0.4330	0.4640	0.0103	0.0085	0.2273	+++--	44.3	7.185	4	0.1264
5 : 93949670 : SNP	a	c	0.1272	0.0043	0.1178	0.1314	0.0012	0.0127	0.9273	+--++	6.9	4.295	4	0.3676
11 : 103614569 : SNP	t	c	0.1007	0.0079	0.0865	0.1119	0.0046	0.0144	0.747	+++--	0.0	1.866	4	0.7604
1 : 248063509 : SNP	a	g	0.1561	0.0125	0.1281	0.1648	0.0036	0.0123	0.7682	-+-+-	0.0	1.945	4	0.7459
8 : 8356784 : SNP	t	g	0.0535	0.0032	0.0503	0.0595	0.0241	0.0198	0.2236	-+?-+	0.0	2.302	3	0.5121
13 : 102935730 : SNP	a	g	0.4193	0.0293	0.3473	0.4339	-0.0040	0.0086	0.6434	--+--	0.0	3.278	4	0.5125
18 : 70521168 : INDEL	d	r	0.2243	0.0060	0.2166	0.2432	0.0026	0.0110	0.8157	+-++-	0.0	0.954	4	0.9166
4 : 147039584 : SNP	t	c	0.0187	0.0000	0.0187	0.0187	-0.0630	0.0495	0.2034	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 125469657 : SNP	a	g	0.9584	0.0019	0.9564	0.9603	0.0498	0.0229	0.02963	++??+	48.7	3.900	2	0.1423
3 : 112071934 : SNP	a	g	0.2872	0.0076	0.2838	0.3176	-0.0133	0.0093	0.1556	--++-	0.0	2.887	4	0.5769
6 : 41408880 : SNP	a	g	0.0470	0.0022	0.0453	0.0500	0.0106	0.0211	0.6152	++??-	0.0	1.307	2	0.5201
4 : 168913326 : SNP	c	g	0.0382	0.0013	0.0364	0.0391	-0.0009	0.0259	0.9738	-+???	0.0	0.839	1	0.3598
18 : 46180876 : SNP	a	g	0.8129	0.0068	0.8011	0.8226	0.0186	0.0109	0.08833	++--+	22.9	5.188	4	0.2686
16 : 79380886 : SNP	t	g	0.0275	0.0000	0.0275	0.0275	0.0450	0.0485	0.3537	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 71193010 : SNP	a	t	0.3449	0.0122	0.3352	0.3705	0.0009	0.0094	0.9252	+--+-	0.0	2.573	4	0.6315
5 : 73731932 : SNP	t	c	0.9410	0.0032	0.9397	0.9492	-0.0138	0.0203	0.4976	-+??-	0.0	0.363	2	0.8341
22 : 22669748 : SNP	a	g	0.6181	0.0114	0.6022	0.6545	0.0012	0.0088	0.8886	0++--	23.3	5.217	4	0.2657
11 : 786234 : SNP	t	c	0.1260	0.0133	0.1106	0.1601	-0.0276	0.0163	0.09022	--?--	0.0	0.739	3	0.8639
18 : 30741527 : SNP	a	c	0.1058	0.0099	0.0998	0.1293	-0.0060	0.0138	0.6623	+--+-	0.0	2.207	4	0.6978
9 : 13181898 : SNP	a	g	0.2656	0.0090	0.2568	0.2859	-0.0005	0.0100	0.9568	-+++-	37.3	6.380	4	0.1725
19 : 51412315 : SNP	a	g	0.4603	0.0085	0.4225	0.4679	0.0156	0.0087	0.0735	+++--	0.0	1.241	4	0.8713
10 : 15064547 : SNP	t	c	0.1779	0.0157	0.1459	0.1951	-0.0282	0.0127	0.02648	--+++	0.0	2.925	4	0.5704
4 : 69864573 : INDEL	i	r	0.9458	0.0000	0.9458	0.9458	-0.0594	0.0507	0.2414	????-	0.0	0.000	0	1
1 : 91978464 : SNP	t	c	0.0161	0.0000	0.0161	0.0161	0.0470	0.0475	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 78836725 : SNP	a	g	0.4136	0.0100	0.4054	0.4473	-0.0021	0.0085	0.8092	-+-+-	0.0	1.708	4	0.7893
1 : 191682076 : SNP	c	g	0.7521	0.0085	0.7266	0.7597	0.0114	0.0098	0.2444	0++-+	34.4	6.101	4	0.1917
1 : 202184675 : SNP	t	c	0.9439	0.0051	0.9400	0.9518	0.0285	0.0197	0.1486	+-??+	66.5	5.974	2	0.05044
12 : 10492038 : SNP	a	g	0.0334	0.0000	0.0334	0.0334	-0.0330	0.0485	0.4964	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 35025272 : SNP	a	g	0.0240	0.0000	0.0240	0.0240	0.0640	0.0637	0.3149	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 59927593 : SNP	a	c	0.9429	0.0018	0.9413	0.9471	0.0113	0.0193	0.5585	-+??-	0.0	1.606	2	0.4479
19 : 42801887 : SNP	a	g	0.0156	0.0000	0.0156	0.0156	-0.0210	0.0516	0.6838	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 170836916 : SNP	t	c	0.8899	0.0076	0.8662	0.8947	0.0156	0.0141	0.2684	+++--	0.0	2.256	4	0.6888
2 : 148499479 : SNP	t	c	0.6433	0.0144	0.6332	0.6734	0.0176	0.0092	0.05557	++++-	32.9	5.961	4	0.2021
6 : 19752263 : SNP	a	g	0.9349	0.0060	0.9302	0.9467	0.0104	0.0176	0.5576	-+?++	0.0	2.549	3	0.4665
12 : 2761526 : SNP	a	g	0.0485	0.0073	0.0412	0.0715	-0.0127	0.0220	0.5638	--?--	0.0	0.395	3	0.9414
1 : 197308740 : SNP	a	g	0.1821	0.0078	0.1701	0.1970	0.0156	0.0109	0.154	+++++	0.0	0.195	4	0.9955
4 : 184271194 : SNP	t	c	0.0223	0.0000	0.0223	0.0223	0.0070	0.0516	0.892	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 68492700 : SNP	a	c	0.1170	0.0087	0.1092	0.1349	0.0137	0.0134	0.3041	+-++-	0.0	1.830	4	0.767
3 : 112493382 : SNP	t	c	0.1098	0.0058	0.1060	0.1225	-0.0212	0.0141	0.1338	-0-+-	34.0	6.059	4	0.1948
11 : 8351264 : SNP	a	g	0.1402	0.0132	0.1202	0.1846	0.0272	0.0128	0.0334	++++-	0.0	2.992	4	0.5592
19 : 20839841 : SNP	a	g	0.6378	0.0093	0.6322	0.6550	0.0083	0.0092	0.3719	++++-	0.0	2.001	4	0.7356
7 : 50877048 : SNP	a	g	0.7779	0.0022	0.7756	0.7857	-0.0182	0.0101	0.07171	+-+--	27.7	5.536	4	0.2366
9 : 100444951 : SNP	c	g	0.8872	0.0083	0.8769	0.9112	-0.0125	0.0137	0.3617	-+---	0.0	1.464	4	0.8329
2 : 118694839 : SNP	t	c	0.1522	0.0083	0.1310	0.1631	-0.0096	0.0118	0.4153	--+-+	0.0	2.154	4	0.7074
9 : 120759515 : INDEL	i	r	0.3951	0.0069	0.3799	0.4016	-0.0222	0.0091	0.01508	---+-	0.0	2.197	4	0.6997
6 : 81621376 : SNP	a	g	0.2478	0.0065	0.2418	0.2614	0.0054	0.0098	0.583	+++--	0.0	2.105	4	0.7165
22 : 48616185 : INDEL	d	r	0.0974	0.0051	0.0897	0.1127	0.0118	0.0153	0.4402	-++?+	0.0	1.399	3	0.7057
8 : 41043987 : SNP	t	c	0.2125	0.0140	0.2038	0.2423	-0.0137	0.0109	0.2097	+----	0.0	3.051	4	0.5494
1 : 64140881 : SNP	a	g	0.0616	0.0057	0.0556	0.0707	-0.0054	0.0184	0.7681	--?+-	0.0	0.157	3	0.9843
3 : 121933635 : SNP	t	c	0.7647	0.0128	0.7551	0.8059	0.0029	0.0101	0.7739	++++-	0.0	3.867	4	0.4243
12 : 25483653 : INDEL	i	r	0.0435	0.0067	0.0383	0.0521	0.0358	0.0221	0.1051	++??+	0.0	0.498	2	0.7795
5 : 83944435 : INDEL	d	r	0.0892	0.0064	0.0861	0.1124	0.0060	0.0160	0.7049	++?+-	0.0	1.796	3	0.6159
2 : 434728 : INDEL	d	r	0.0444	0.0025	0.0429	0.0497	-0.0469	0.0234	0.04483	--??-	0.0	0.382	2	0.8261
8 : 41268801 : SNP	t	c	0.1334	0.0103	0.1208	0.1522	-0.0035	0.0124	0.7776	--++-	0.0	2.930	4	0.5696
16 : 84836066 : SNP	a	g	0.0628	0.0051	0.0536	0.0695	0.0008	0.0288	0.9789	-??++	0.0	1.036	2	0.5958
19 : 47008616 : INDEL	i	r	0.0536	0.0062	0.0441	0.0587	-0.0172	0.0202	0.3931	+-??-	77.3	8.818	2	0.01217
1 : 224063453 : SNP	a	g	0.7477	0.0115	0.7313	0.7574	0.0075	0.0099	0.4492	-++++	0.0	1.042	4	0.9033
3 : 36805097 : SNP	c	g	0.0487	0.0036	0.0467	0.0552	0.0295	0.0310	0.3407	+???+	0.0	0.146	1	0.7025
14 : 51884679 : SNP	t	c	0.0631	0.0038	0.0581	0.0740	0.0202	0.0177	0.2552	++?+-	59.2	7.349	3	0.06158
16 : 58788393 : SNP	t	c	0.9814	0.0000	0.9814	0.9814	-0.0590	0.0465	0.2045	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 102366495 : SNP	a	t	0.8426	0.0134	0.8231	0.8628	0.0372	0.0177	0.03584	?++++	24.0	3.948	3	0.2671
8 : 55011964 : SNP	a	g	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	-0.1140	0.0637	0.07344	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 16452282 : SNP	t	g	0.0298	0.0000	0.0298	0.0298	0.0050	0.0384	0.8964	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 18545690 : SNP	c	g	0.2669	0.0118	0.2477	0.2771	-0.0135	0.0099	0.173	----+	0.0	0.655	4	0.9568
15 : 96134241 : SNP	t	c	0.9705	0.0000	0.9705	0.9705	-0.0560	0.0374	0.1343	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 98036477 : SNP	a	g	0.7713	0.0084	0.7580	0.7860	-0.0006	0.0100	0.9514	-+-++	0.0	2.672	4	0.6142
12 : 120906619 : SNP	c	g	0.9693	0.0000	0.9693	0.9693	-0.0300	0.0445	0.5	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 19773295 : SNP	a	g	0.1723	0.0042	0.1532	0.1759	0.0161	0.0113	0.1561	-++-+	27.7	5.530	4	0.2371
5 : 104818497 : SNP	a	c	0.0527	0.0032	0.0441	0.0545	0.0084	0.0200	0.6738	++?--	0.0	2.777	3	0.4273
7 : 9072791 : SNP	a	g	0.7938	0.0066	0.7694	0.8035	-0.0061	0.0106	0.5679	-+---	0.0	2.224	4	0.6947
11 : 75205776 : SNP	c	g	0.3500	0.0204	0.3083	0.3808	0.0006	0.0092	0.9471	++---	0.0	2.142	4	0.7097
2 : 121080622 : SNP	a	g	0.6292	0.0159	0.5604	0.6419	0.0017	0.0130	0.8935	++-+-	13.9	4.644	4	0.3258
5 : 30731158 : SNP	a	g	0.0124	0.0000	0.0124	0.0124	-0.0270	0.0556	0.6272	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 160486404 : SNP	t	c	0.9397	0.0025	0.9372	0.9436	0.0045	0.0188	0.8099	++??-	0.0	0.128	2	0.9378
9 : 19870167 : SNP	a	g	0.0450	0.0011	0.0423	0.0458	0.0024	0.0221	0.9122	+-??+	0.0	1.377	2	0.5024
14 : 94368429 : SNP	t	c	0.5414	0.0115	0.5324	0.5736	0.0049	0.0086	0.5671	+++--	17.1	4.823	4	0.3059
15 : 53097797 : INDEL	i	r	0.9398	0.0000	0.9398	0.9398	0.0350	0.0364	0.3362	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 98967537 : SNP	a	t	0.8106	0.0271	0.7852	0.8736	0.0061	0.0114	0.5896	++---	0.0	1.345	4	0.8538
10 : 3327039 : SNP	a	g	0.1234	0.0050	0.1208	0.1382	0.0103	0.0224	0.6462	+?++-	35.9	4.684	3	0.1965
20 : 35539858 : SNP	c	g	0.8329	0.0066	0.8202	0.8415	0.0112	0.0113	0.3198	-++++	50.9	8.155	4	0.08608
15 : 63998759 : SNP	t	c	0.0712	0.0083	0.0565	0.0785	0.0324	0.0174	0.06225	++?-+	0.0	2.138	3	0.5442
3 : 53665019 : SNP	t	c	0.9259	0.0051	0.9230	0.9376	0.0012	0.0168	0.9436	++?--	0.0	1.111	3	0.7744
1 : 43602414 : SNP	a	g	0.0961	0.0063	0.0723	0.1069	0.0014	0.0144	0.9226	+--+-	0.0	0.641	4	0.9584
7 : 153908817 : SNP	t	c	0.1708	0.0048	0.1604	0.1785	-0.0069	0.0115	0.5504	--+-+	0.0	3.625	4	0.4591
2 : 221246974 : SNP	t	c	0.0976	0.0090	0.0764	0.1033	0.0065	0.0151	0.6662	++?-+	0.0	0.427	3	0.9347
7 : 63405586 : SNP	a	g	0.0383	0.0027	0.0346	0.0403	-0.0211	0.0283	0.4555	-+???	0.0	0.559	1	0.4547
4 : 125014218 : SNP	c	g	0.0806	0.0044	0.0711	0.0848	-0.0141	0.0159	0.3756	+-?--	0.0	2.569	3	0.463
14 : 36566351 : SNP	a	g	0.5822	0.0021	0.5773	0.5859	0.0069	0.0085	0.4157	+++--	0.0	2.097	4	0.7178
7 : 55325536 : SNP	a	g	0.2021	0.0090	0.1854	0.2155	-0.0155	0.0112	0.1666	--++-	19.6	4.975	4	0.2899
5 : 118964891 : INDEL	i	r	0.4220	0.0229	0.4022	0.4672	-0.0151	0.0089	0.09125	--+--	12.0	4.544	4	0.3374
14 : 29604016 : SNP	t	c	0.1844	0.0093	0.1758	0.1972	-0.0185	0.0111	0.09534	+---+	39.6	6.622	4	0.1573
8 : 31746629 : SNP	t	c	0.0970	0.0064	0.0817	0.1055	-0.0123	0.0145	0.3935	-+-++	54.4	8.764	4	0.06727
7 : 56290493 : SNP	a	c	0.9440	0.0038	0.9360	0.9465	-0.0226	0.0194	0.2458	--?++	53.8	6.493	3	0.08994
14 : 107198718 : SNP	t	c	0.8609	0.0153	0.8249	0.8736	-0.0070	0.0131	0.5907	-+++-	38.7	6.527	4	0.1631
1 : 244901035 : SNP	a	g	0.1412	0.0280	0.1200	0.1896	-0.0074	0.0144	0.6054	-+---	0.0	1.221	4	0.8747
1 : 246608605 : SNP	t	c	0.7227	0.0069	0.7069	0.7265	-0.0084	0.0103	0.415	---++	0.0	1.526	4	0.822
12 : 26141625 : SNP	c	g	0.9645	0.0028	0.9606	0.9667	0.0286	0.0258	0.2666	++??+	0.0	1.135	2	0.5669
3 : 13331954 : SNP	a	g	0.0481	0.0000	0.0481	0.0481	-0.0250	0.0425	0.556	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 116413232 : SNP	a	g	0.0616	0.0012	0.0607	0.0642	0.0149	0.0184	0.4184	0+?--	0.0	2.203	3	0.5313
1 : 119412317 : SNP	a	g	0.0650	0.0059	0.0526	0.0716	-0.0187	0.0199	0.3468	-+??-	7.1	2.152	2	0.3409
1 : 179485634 : SNP	a	g	0.7769	0.0133	0.7570	0.8085	-0.0198	0.0101	0.04987	--+--	0.0	2.626	4	0.6223
1 : 79348506 : SNP	a	c	0.8088	0.0111	0.7634	0.8153	-0.0126	0.0110	0.2518	---++	0.0	3.134	4	0.5357
4 : 25078993 : SNP	a	c	0.3501	0.0147	0.3181	0.3664	0.0037	0.0094	0.6895	+---+	0.0	2.188	4	0.7013
7 : 146362890 : INDEL	d	r	0.7659	0.0278	0.7161	0.7970	0.0164	0.0110	0.1366	+++-+	0.0	1.565	4	0.8151
12 : 29319639 : SNP	t	c	0.1595	0.0145	0.1380	0.1877	-0.0211	0.0117	0.07159	+-+--	59.8	9.961	4	0.04109
14 : 99268884 : SNP	t	c	0.8247	0.0168	0.8114	0.8603	0.0093	0.0111	0.3996	+-+--	0.0	3.691	4	0.4495
16 : 89364165 : SNP	t	c	0.1502	0.0128	0.1193	0.1601	0.0146	0.0124	0.2372	0++++	0.0	2.324	4	0.6764
1 : 200266682 : INDEL	d	r	0.7246	0.0121	0.6888	0.7401	-0.0037	0.0106	0.7286	----+	36.7	6.317	4	0.1767
10 : 93300878 : SNP	a	g	0.3541	0.0241	0.3388	0.4214	0.0004	0.0092	0.9655	--++-	39.2	6.584	4	0.1596
2 : 137751391 : INDEL	d	r	0.0332	0.0015	0.0317	0.0346	0.0283	0.0261	0.2779	++??-	0.0	0.947	2	0.6227
22 : 49885314 : INDEL	d	r	0.1054	0.0121	0.0871	0.1243	0.0358	0.0171	0.03647	++?++	37.3	4.786	3	0.1882
6 : 69570014 : SNP	a	g	0.9769	0.0000	0.9769	0.9769	-0.0370	0.0445	0.4055	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 79141784 : SNP	t	c	0.5241	0.0215	0.4802	0.5452	-0.0129	0.0089	0.1439	--+++	38.7	6.529	4	0.163
11 : 127132738 : SNP	a	g	0.4512	0.0083	0.4213	0.4712	-0.0015	0.0085	0.8603	-+-+-	0.0	1.693	4	0.792
10 : 22789237 : SNP	t	c	0.0622	0.0000	0.0622	0.0622	0.0456	0.0546	0.4036	????+	0.0	0.000	0	1
11 : 7573493 : SNP	a	g	0.0836	0.0100	0.0714	0.0975	0.0137	0.0154	0.3735	+-+++	0.0	2.161	4	0.7062
7 : 123766135 : SNP	a	g	0.4358	0.0129	0.4246	0.4607	0.0178	0.0085	0.03654	+++++	0.0	2.229	4	0.6936
10 : 110875314 : SNP	t	g	0.1390	0.0112	0.1298	0.1596	-0.0259	0.0123	0.03594	-+---	0.0	3.073	4	0.5457
7 : 67434684 : SNP	t	c	0.9286	0.0123	0.9059	0.9378	0.0271	0.0197	0.1698	++?+-	0.0	1.886	3	0.5963
8 : 59529938 : SNP	a	c	0.0137	0.0000	0.0137	0.0137	-0.0800	0.0516	0.1207	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 25061851 : SNP	a	t	0.1179	0.0111	0.0914	0.1263	0.0099	0.0136	0.4688	+-+-+	0.0	1.998	4	0.7361
7 : 10987368 : SNP	a	g	0.6342	0.0060	0.6272	0.6453	0.0011	0.0088	0.9007	-++++	62.6	10.701	4	0.03013
16 : 19573334 : SNP	a	g	0.0441	0.0053	0.0367	0.0584	-0.0465	0.0213	0.02946	-+?+-	0.0	2.286	3	0.5151
12 : 131527301 : SNP	t	g	0.4102	0.0088	0.4018	0.4342	-0.0054	0.0086	0.5292	--+++	4.6	4.193	4	0.3805
6 : 110944960 : INDEL	d	r	0.1908	0.0071	0.1797	0.1995	-0.0136	0.0108	0.2074	+----	0.0	3.006	4	0.5567
5 : 89450138 : SNP	t	g	0.0231	0.0000	0.0231	0.0231	-0.0940	0.0435	0.03058	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 134663097 : SNP	t	g	0.1327	0.0039	0.1289	0.1383	-0.0109	0.0127	0.3938	--+-+	45.0	7.277	4	0.1219
7 : 120154152 : SNP	a	g	0.9230	0.0078	0.9158	0.9320	-0.0242	0.0164	0.1399	--?+-	0.0	0.450	3	0.9298
1 : 215389768 : INDEL	d	r	0.2036	0.0289	0.1860	0.2582	0.0080	0.0108	0.458	+-+++	0.0	1.758	4	0.7801
20 : 21258053 : SNP	a	g	0.2948	0.0038	0.2866	0.2978	-0.0252	0.0094	0.007264	---+-	0.0	2.686	4	0.6116
9 : 117358718 : SNP	t	c	0.9700	0.0039	0.9656	0.9735	-0.0125	0.0287	0.6635	+-???	58.0	2.381	1	0.1229
13 : 64873383 : SNP	t	c	0.9830	0.0000	0.9830	0.9830	-0.0150	0.0485	0.7572	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 47259205 : SNP	a	g	0.3445	0.0055	0.3376	0.3636	0.0180	0.0094	0.05605	+++--	52.6	8.448	4	0.07649
7 : 64688392 : SNP	t	c	0.1112	0.0141	0.1008	0.1303	0.0204	0.0442	0.6449	???-+	26.6	1.362	1	0.2432
6 : 119902043 : SNP	a	g	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	0.1160	0.0556	0.03694	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 85035313 : SNP	a	g	0.5683	0.0093	0.5471	0.5868	-0.0088	0.0087	0.3123	----+	0.0	0.667	4	0.9553
20 : 35997089 : SNP	a	g	0.0385	0.0000	0.0385	0.0385	-0.0660	0.0536	0.218	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 83659510 : SNP	t	c	0.0497	0.0063	0.0415	0.0600	-0.0141	0.0201	0.4847	-+?+-	0.0	2.279	3	0.5165
19 : 48229746 : INDEL	d	r	0.0421	0.0000	0.0421	0.0421	-0.0420	0.0455	0.3559	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 74885817 : SNP	a	g	0.0214	0.0000	0.0214	0.0214	-0.0160	0.0495	0.7467	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 11396439 : SNP	t	c	0.0723	0.0075	0.0615	0.0786	0.0064	0.0179	0.7204	+-?++	0.0	0.119	3	0.9895
13 : 109030847 : SNP	c	g	0.1801	0.0081	0.1648	0.1874	0.0025	0.0113	0.8232	+--++	0.0	2.001	4	0.7356
22 : 46873011 : SNP	t	c	0.2933	0.0173	0.2776	0.3468	0.0000	0.0092	0.9987	-+--+	0.0	1.685	4	0.7934
21 : 18029108 : INDEL	i	r	0.3734	0.0060	0.3677	0.3836	0.0051	0.0093	0.5828	-+--+	11.3	4.509	4	0.3415
12 : 73455336 : SNP	a	g	0.7950	0.0110	0.7874	0.8196	-0.0123	0.0112	0.2706	----+	59.9	9.979	4	0.04078
12 : 589813 : SNP	a	g	0.1796	0.0190	0.1341	0.1899	-0.0223	0.0116	0.05468	-+-+-	58.2	9.575	4	0.04824
5 : 74756221 : SNP	a	g	0.8895	0.0102	0.8658	0.8991	-0.0070	0.0138	0.612	-++--	30.9	5.789	4	0.2155
21 : 35845485 : SNP	c	g	0.3715	0.0124	0.3267	0.3829	-0.0104	0.0089	0.2449	---+-	0.0	1.238	4	0.8718
10 : 79971526 : INDEL	d	r	0.0567	0.0042	0.0534	0.0659	-0.0297	0.0233	0.2021	+-?-+	47.6	5.724	3	0.1258
1 : 11091031 : SNP	a	g	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	0.0280	0.0485	0.5639	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 34422907 : SNP	t	c	0.0580	0.0000	0.0580	0.0580	0.0258	0.0615	0.6748	????+	0.0	0.000	0	1
1 : 102362302 : SNP	a	c	0.0217	0.0000	0.0217	0.0217	-0.0520	0.0485	0.2839	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 61660035 : SNP	t	g	0.1229	0.0133	0.1110	0.1489	0.0118	0.0135	0.3823	-+++-	0.0	1.890	4	0.756
19 : 22898871 : SNP	t	c	0.1144	0.0044	0.1100	0.1219	0.0229	0.0139	0.09981	++--+	48.8	7.809	4	0.09884
14 : 71170183 : INDEL	i	r	0.1600	0.0079	0.1489	0.1782	0.0071	0.0145	0.6229	+0-+-	0.0	1.960	4	0.743
7 : 88543828 : INDEL	i	r	0.3199	0.0245	0.3048	0.3761	0.0026	0.0091	0.7751	-++-+	53.6	8.626	4	0.07116
9 : 124955028 : SNP	a	g	0.8836	0.0192	0.8346	0.9094	0.0061	0.0156	0.6962	-+?-+	49.2	5.905	3	0.1163
11 : 9421562 : SNP	a	g	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	0.0450	0.0566	0.4267	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 125368997 : SNP	t	c	0.6530	0.0479	0.5774	0.7178	0.0047	0.0110	0.6683	+-+++	0.0	3.062	4	0.5474
15 : 61655698 : SNP	t	c	0.2289	0.0108	0.2047	0.2394	-0.0121	0.0105	0.2518	--++-	0.0	2.646	4	0.6186
16 : 82857597 : SNP	a	g	0.9790	0.0000	0.9790	0.9790	0.0110	0.0546	0.8403	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 707338 : INDEL	i	r	0.4101	0.0084	0.3854	0.4176	-0.0158	0.0097	0.104	--++-	16.2	4.771	4	0.3116
9 : 137163924 : SNP	a	g	0.4582	0.0210	0.4456	0.5032	0.0228	0.0086	0.007973	++-++	29.7	5.689	4	0.2236
4 : 158827364 : SNP	t	g	0.6767	0.0131	0.6456	0.6888	0.0157	0.0092	0.08603	+++-+	0.0	1.663	4	0.7974
19 : 52799034 : SNP	a	c	0.1872	0.0088	0.1802	0.2046	-0.0299	0.0123	0.01534	--+--	48.6	7.789	4	0.09963
12 : 24824889 : SNP	t	c	0.3580	0.0198	0.3401	0.3989	-0.0001	0.0089	0.9889	+-+++	0.0	3.348	4	0.5013
6 : 18634086 : SNP	a	t	0.0129	0.0000	0.0129	0.0129	-0.0620	0.0556	0.2648	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 116056298 : SNP	t	c	0.0642	0.0054	0.0590	0.0726	-0.0065	0.0185	0.7269	-+?+-	0.0	2.786	3	0.4259
2 : 81665889 : SNP	a	g	0.8412	0.0128	0.8085	0.8486	0.0017	0.0118	0.8829	++---	0.0	1.108	4	0.8931
4 : 7534156 : SNP	a	g	0.9124	0.0072	0.9042	0.9293	0.0043	0.0159	0.7892	-+?-+	54.6	6.615	3	0.08523
1 : 30731688 : SNP	a	g	0.8938	0.0100	0.8837	0.9167	0.0055	0.0140	0.6943	+--++	0.0	2.074	4	0.7222
5 : 7967531 : SNP	t	c	0.8404	0.0109	0.8167	0.8481	0.0092	0.0117	0.4347	++++-	0.0	3.590	4	0.4643
20 : 38358965 : SNP	t	c	0.0362	0.0044	0.0325	0.0452	0.0306	0.0245	0.211	++??+	0.0	1.923	2	0.3822
3 : 173949806 : SNP	t	c	0.2131	0.0049	0.2048	0.2239	-0.0046	0.0106	0.6616	-+-+-	0.0	2.217	4	0.6959
7 : 100197871 : SNP	a	g	0.9496	0.0080	0.9350	0.9576	-0.0065	0.0237	0.7849	+-?++	0.0	1.119	3	0.7725
9 : 37740637 : SNP	t	c	0.3636	0.0103	0.3540	0.3815	-0.0037	0.0090	0.6849	+---+	0.0	2.284	4	0.6837
5 : 73214626 : SNP	a	t	0.3060	0.0303	0.2689	0.3616	-0.0064	0.0119	0.5925	---++	19.0	4.941	4	0.2934
2 : 69962901 : SNP	a	g	0.9568	0.0015	0.9540	0.9576	0.0126	0.0302	0.6759	+???+	0.0	0.217	1	0.6413
8 : 116188975 : SNP	t	c	0.9402	0.0088	0.9290	0.9523	-0.0063	0.0187	0.7375	--??+	2.0	2.040	2	0.3606
21 : 41207458 : INDEL	d	r	0.0982	0.0070	0.0871	0.1251	0.0114	0.0148	0.4377	++++-	16.5	4.793	4	0.3092
18 : 77055598 : SNP	t	c	0.9570	0.0042	0.9540	0.9671	0.0038	0.0220	0.8617	+-??+	0.0	0.344	2	0.8422
2 : 36305488 : SNP	t	c	0.9357	0.0057	0.9237	0.9415	0.0098	0.0178	0.5817	+-?--	23.3	3.914	3	0.271
12 : 48140963 : SNP	a	t	0.8925	0.0090	0.8678	0.9053	0.0171	0.0138	0.2172	++-+-	0.0	1.951	4	0.7447
19 : 12260255 : INDEL	d	r	0.1054	0.0044	0.0913	0.1083	0.0340	0.0147	0.02076	++-++	0.0	0.734	4	0.947
16 : 55216172 : SNP	a	g	0.7970	0.0054	0.7771	0.8098	-0.0050	0.0106	0.6379	--+++	0.0	2.992	4	0.5591
3 : 81979878 : SNP	t	c	0.9679	0.0000	0.9679	0.9679	0.0750	0.0445	0.09175	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 123710143 : INDEL	d	r	0.4363	0.0146	0.4104	0.4548	-0.0045	0.0086	0.603	--+++	0.0	2.356	4	0.6706
2 : 129543799 : SNP	a	t	0.7190	0.0063	0.7045	0.7333	-0.0027	0.0105	0.7987	-+-+-	61.7	10.435	4	0.03371
11 : 58767505 : SNP	a	g	0.9884	0.0000	0.9884	0.9884	0.0350	0.0556	0.529	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 90949334 : SNP	t	c	0.4879	0.0073	0.4724	0.5045	-0.0201	0.0085	0.01861	--+--	9.0	4.396	4	0.3551
6 : 79358468 : SNP	a	g	0.9243	0.0066	0.9121	0.9300	0.0037	0.0196	0.8506	-+?-+	21.2	3.806	3	0.2831
3 : 130947115 : SNP	t	c	0.0241	0.0000	0.0241	0.0241	0.0290	0.0414	0.4841	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 30304206 : SNP	t	g	0.6495	0.0118	0.6254	0.6580	0.0193	0.0091	0.03288	++-++	0.0	1.916	4	0.7512
16 : 10045463 : SNP	c	g	0.9721	0.0044	0.9650	0.9749	-0.0075	0.0326	0.8194	-???-	0.0	0.101	1	0.7501
4 : 76142195 : SNP	t	g	0.9611	0.0092	0.9484	0.9678	0.0122	0.0319	0.7013	+???-	0.0	0.085	1	0.7702
6 : 101962940 : SNP	t	c	0.0846	0.0041	0.0807	0.0897	-0.0313	0.0162	0.05358	--?-+	34.1	4.550	3	0.2079
18 : 25245149 : SNP	t	c	0.9160	0.0110	0.8904	0.9220	0.0108	0.0161	0.5005	+-?++	0.0	2.987	3	0.3936
7 : 47054582 : SNP	t	c	0.7903	0.0234	0.7659	0.8404	0.0051	0.0104	0.6243	++---	0.0	3.704	4	0.4476
11 : 79981075 : SNP	a	g	0.6569	0.0089	0.6348	0.6823	0.0072	0.0091	0.4308	++++-	0.0	0.889	4	0.9261
6 : 29866899 : SNP	t	g	0.7095	0.0229	0.6688	0.7425	-0.0328	0.0208	0.1146	??---	0.0	0.354	2	0.8377
14 : 69553420 : SNP	t	c	0.2851	0.0089	0.2795	0.3174	-0.0080	0.0097	0.4108	---+-	33.1	5.976	4	0.2009
1 : 35145886 : SNP	a	c	0.3213	0.0141	0.2894	0.3417	0.0046	0.0092	0.6171	+-+++	64.2	11.189	4	0.02452
7 : 151025947 : SNP	a	g	0.8143	0.0058	0.8051	0.8233	0.0156	0.0113	0.1666	++---	0.0	3.818	4	0.4311
13 : 49831703 : SNP	a	g	0.3096	0.0116	0.2695	0.3166	0.0010	0.0096	0.9162	--+-+	0.0	3.460	4	0.484
4 : 104627685 : INDEL	d	r	0.0498	0.0064	0.0438	0.0576	0.0296	0.0210	0.1586	++??-	0.0	0.477	2	0.7879
2 : 45506220 : SNP	t	c	0.0732	0.0061	0.0609	0.0778	0.0082	0.0173	0.6356	+-?--	0.0	1.499	3	0.6826
7 : 137933825 : SNP	a	g	0.1338	0.0041	0.1283	0.1368	0.0272	0.0377	0.4707	???++	0.0	0.686	1	0.4077
6 : 20302843 : INDEL	d	r	0.6647	0.0065	0.6468	0.6706	0.0096	0.0091	0.2951	++-++	0.0	1.443	4	0.8368
6 : 126214624 : SNP	a	c	0.5891	0.0122	0.5630	0.6152	-0.0028	0.0086	0.7416	++---	0.0	2.113	4	0.715
11 : 126665310 : SNP	c	g	0.2309	0.0094	0.2164	0.2473	0.0049	0.0111	0.6587	0-+++	0.0	3.247	4	0.5174
16 : 1174306 : SNP	a	g	0.9347	0.0008	0.9336	0.9352	0.0161	0.0340	0.6354	+???-	0.0	0.343	1	0.5583
10 : 81162016 : SNP	t	c	0.1863	0.0140	0.1653	0.1994	-0.0076	0.0114	0.5021	-+-+-	7.5	4.325	4	0.3638
2 : 77927631 : SNP	t	c	0.9767	0.0000	0.9767	0.9767	0.0330	0.0425	0.437	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 100030628 : INDEL	i	r	0.2336	0.0098	0.2187	0.2534	-0.0039	0.0104	0.7083	---+-	23.7	5.244	4	0.2631
6 : 143273876 : SNP	a	g	0.0924	0.0161	0.0785	0.1237	0.0116	0.0161	0.4742	++?+-	0.0	1.245	3	0.7422
18 : 41740773 : INDEL	d	r	0.0503	0.0076	0.0383	0.0609	-0.0172	0.0206	0.4024	--?--	0.0	0.356	3	0.9492
8 : 141120489 : SNP	a	g	0.0814	0.0053	0.0756	0.1018	0.0151	0.0183	0.4082	+++?+	0.0	0.387	3	0.9429
6 : 20793991 : INDEL	i	r	0.4297	0.0285	0.3685	0.4553	0.0017	0.0086	0.8419	-++++	0.0	2.021	4	0.7318
3 : 24866380 : SNP	t	g	0.0303	0.0079	0.0232	0.0391	0.0473	0.0430	0.2713	+???0	0.0	0.966	1	0.3257
5 : 99185207 : INDEL	i	r	0.0575	0.0033	0.0538	0.0668	0.0091	0.0193	0.6368	+-?--	0.0	2.097	3	0.5524
3 : 171353121 : SNP	a	g	0.9890	0.0000	0.9890	0.9890	0.0950	0.0607	0.1173	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 53583768 : SNP	a	t	0.9867	0.0000	0.9867	0.9867	0.0710	0.0536	0.1851	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 58190721 : SNP	a	g	0.4666	0.0112	0.4411	0.4847	0.0013	0.0091	0.8883	-+--+	0.0	3.000	4	0.5578
17 : 26323773 : SNP	t	c	0.7178	0.0061	0.6943	0.7207	0.0089	0.0094	0.345	++-+-	0.0	2.022	4	0.7318
6 : 162484507 : SNP	a	g	0.9407	0.0054	0.9345	0.9520	-0.0061	0.0186	0.743	+-?--	0.0	2.966	3	0.3968
16 : 9507601 : SNP	a	t	0.1071	0.0059	0.0927	0.1250	-0.0023	0.0142	0.869	+--++	7.9	4.343	4	0.3616
2 : 132254001 : SNP	a	g	0.7825	0.0196	0.7638	0.8287	0.0184	0.0221	0.4063	??+-+	0.0	1.656	2	0.437
12 : 123840864 : INDEL	d	r	0.9192	0.0008	0.9178	0.9197	-0.0253	0.0379	0.5048	???-+	83.8	6.169	1	0.013
6 : 84017921 : SNP	t	c	0.6212	0.0199	0.5766	0.6378	-0.0011	0.0089	0.9004	+---+	2.3	4.094	4	0.3934
13 : 72621898 : SNP	t	c	0.9713	0.0000	0.9713	0.9713	-0.0140	0.0404	0.7292	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 148684682 : SNP	a	g	0.0763	0.0142	0.0528	0.0917	-0.0283	0.0199	0.1546	--?--	0.0	0.626	3	0.8904
7 : 138631487 : SNP	t	c	0.9700	0.0000	0.9700	0.9700	-0.0090	0.0364	0.8047	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 18845643 : SNP	a	g	0.3055	0.0103	0.2775	0.3176	0.0050	0.0092	0.589	+++--	0.0	2.907	4	0.5735
20 : 12407307 : SNP	t	c	0.4427	0.0313	0.3755	0.4749	-0.0206	0.0085	0.01565	-----	0.0	1.748	4	0.782
13 : 91030435 : SNP	t	c	0.8048	0.0089	0.7634	0.8133	-0.0068	0.0107	0.5235	-+---	0.0	2.370	4	0.6681
22 : 37898451 : SNP	a	g	0.0482	0.0017	0.0442	0.0493	-0.0102	0.0238	0.6667	--??+	0.0	0.182	2	0.9132
1 : 216942488 : SNP	t	c	0.6441	0.0157	0.6122	0.6634	0.0015	0.0122	0.905	--+++	0.0	1.064	4	0.8999
14 : 25295949 : SNP	a	g	0.3505	0.0073	0.3415	0.3578	0.0000	0.0091	0.998	+--++	63.0	10.817	4	0.0287
20 : 9399025 : SNP	a	g	0.9754	0.0000	0.9754	0.9754	-0.0190	0.0394	0.6298	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 109560852 : SNP	t	c	0.9868	0.0000	0.9868	0.9868	-0.0300	0.0556	0.5895	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 51948204 : SNP	a	g	0.6792	0.0193	0.6613	0.7113	-0.0093	0.0094	0.32	-----	0.0	0.232	4	0.9938
8 : 104272408 : SNP	t	c	0.0446	0.0033	0.0396	0.0487	0.0381	0.0217	0.07961	++??+	0.0	0.490	2	0.7826
9 : 90910148 : SNP	t	c	0.0635	0.0063	0.0473	0.0684	-0.0104	0.0186	0.5758	+-??-	79.0	9.516	2	0.008585
11 : 493460 : SNP	a	g	0.1719	0.0091	0.1624	0.1887	-0.0048	0.0118	0.6812	-++--	0.0	3.320	4	0.5058
2 : 159166675 : SNP	a	g	0.9446	0.0165	0.9106	0.9563	0.0287	0.0201	0.1525	++?-+	0.0	1.771	3	0.6212
12 : 131396513 : INDEL	d	r	0.2281	0.0125	0.2080	0.2442	0.0020	0.0115	0.8595	-+-+-	51.1	8.188	4	0.08492
7 : 5807141 : SNP	a	g	0.4766	0.0118	0.4647	0.5045	0.0107	0.0086	0.2129	+-++-	55.9	9.068	4	0.05942
1 : 25190615 : SNP	c	g	0.2870	0.0106	0.2749	0.3092	0.0092	0.0097	0.3434	++-++	0.0	2.302	4	0.6804
20 : 36288210 : SNP	t	c	0.4207	0.0139	0.4080	0.4508	-0.0063	0.0086	0.4641	+---+	37.7	6.418	4	0.17
1 : 164587092 : SNP	t	c	0.4862	0.0039	0.4799	0.5006	0.0090	0.0085	0.2894	+-+++	0.0	3.372	4	0.4976
4 : 5643462 : SNP	t	c	0.6402	0.0147	0.6329	0.6760	0.0078	0.0092	0.3982	-++++	0.0	1.843	4	0.7647
7 : 42215316 : SNP	a	c	0.3147	0.0263	0.2615	0.3451	-0.0006	0.0093	0.9448	+---+	14.0	4.653	4	0.3248
1 : 152603441 : SNP	a	g	0.3810	0.0119	0.3643	0.3923	-0.0045	0.0086	0.5966	----+	0.0	1.512	4	0.8245
4 : 12641417 : SNP	t	c	0.7051	0.0081	0.6984	0.7303	-0.0050	0.0093	0.5923	-+--+	0.0	0.430	4	0.98
1 : 27097515 : SNP	a	g	0.9224	0.0073	0.8972	0.9302	0.0127	0.0173	0.4619	++-+-	0.0	0.346	4	0.9866
12 : 26354457 : INDEL	i	r	0.0412	0.0025	0.0370	0.0433	0.0680	0.0230	0.003071	++??+	0.0	0.565	2	0.7538
3 : 17718529 : SNP	a	t	0.4260	0.0100	0.3981	0.4437	-0.0096	0.0097	0.32	-+--+	72.9	14.758	4	0.00523
5 : 14102401 : SNP	c	g	0.9484	0.0057	0.9345	0.9562	0.0287	0.0219	0.1903	+-?-+	0.0	1.812	3	0.6122
16 : 78597746 : SNP	t	c	0.2813	0.0049	0.2785	0.2947	0.0096	0.0094	0.306	++--+	5.4	4.228	4	0.376
6 : 6134186 : SNP	t	c	0.0548	0.0070	0.0484	0.0777	-0.0129	0.0195	0.5059	+-?--	30.3	4.306	3	0.2303
1 : 4173077 : SNP	a	g	0.9613	0.0025	0.9601	0.9664	-0.0059	0.0290	0.84	-???-	0.0	0.017	1	0.8974
9 : 107809428 : SNP	a	g	0.6926	0.0041	0.6878	0.7006	0.0090	0.0092	0.3273	+-+++	0.0	1.595	4	0.8097
6 : 54301426 : SNP	t	c	0.0641	0.0064	0.0548	0.0696	-0.0341	0.0180	0.05766	--?-+	22.6	3.878	3	0.275
7 : 17714252 : SNP	t	c	0.9850	0.0000	0.9850	0.9850	-0.0220	0.0505	0.6634	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 98826868 : SNP	t	c	0.4023	0.0069	0.3737	0.4066	0.0001	0.0089	0.9939	+--++	34.4	6.100	4	0.1918
1 : 41146062 : SNP	a	g	0.2207	0.0053	0.2138	0.2346	0.0182	0.0106	0.08457	+0+-+	45.7	7.365	4	0.1178
9 : 31284368 : SNP	t	c	0.4151	0.0107	0.3758	0.4224	0.0043	0.0086	0.618	++-+-	0.0	1.558	4	0.8164
8 : 132304508 : SNP	t	c	0.4026	0.0129	0.3912	0.4266	-0.0057	0.0086	0.5092	--+-+	5.8	4.246	4	0.3737
6 : 83859945 : SNP	t	c	0.9814	0.0000	0.9814	0.9814	0.0110	0.0465	0.813	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 31526031 : SNP	t	c	0.2349	0.0131	0.2274	0.2641	-0.0137	0.0103	0.1843	--++-	0.0	1.459	4	0.8339
3 : 162780540 : SNP	a	t	0.3426	0.0327	0.3148	0.4266	-0.0049	0.0091	0.5871	---++	31.2	5.810	4	0.2138
12 : 95790082 : SNP	t	c	0.8479	0.0079	0.8394	0.8630	-0.0034	0.0120	0.7746	-+-++	0.0	2.350	4	0.6716
4 : 133061307 : SNP	a	g	0.6678	0.0229	0.6382	0.7154	-0.0033	0.0092	0.7174	-++--	0.0	0.763	4	0.9433
5 : 106783105 : SNP	t	g	0.9572	0.0036	0.9530	0.9602	-0.0534	0.0254	0.03506	--???	0.0	0.237	1	0.6263
1 : 247386557 : SNP	a	g	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	0.0980	0.0556	0.07796	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 27190152 : INDEL	i	r	0.1757	0.0078	0.1456	0.1825	-0.0091	0.0130	0.485	-+-++	0.0	2.703	4	0.6087
14 : 85048131 : SNP	t	c	0.4824	0.0248	0.4315	0.5001	0.0057	0.0086	0.506	+-+-+	0.0	1.259	4	0.8683
12 : 68341922 : SNP	a	c	0.0663	0.0055	0.0612	0.0751	0.0097	0.0176	0.5811	++?--	0.0	1.781	3	0.6192
7 : 120751399 : SNP	a	c	0.9314	0.0059	0.9197	0.9386	-0.0289	0.0176	0.1007	--?+-	0.0	1.381	3	0.71
12 : 97529985 : SNP	a	g	0.2237	0.0194	0.2101	0.2676	0.0008	0.0104	0.9423	+--+-	0.0	2.701	4	0.609
5 : 157248394 : INDEL	i	r	0.5278	0.0111	0.4933	0.5491	-0.0225	0.0086	0.008605	--+-+	0.0	2.741	4	0.602
13 : 112039771 : SNP	t	c	0.1093	0.0073	0.0917	0.1195	-0.0103	0.0142	0.466	+-+--	0.0	3.170	4	0.5297
1 : 194643852 : SNP	t	c	0.0448	0.0040	0.0397	0.0482	0.0280	0.0215	0.1933	++??+	0.0	0.002	2	0.9992
15 : 99087288 : INDEL	d	r	0.0552	0.0085	0.0475	0.0699	0.0354	0.0242	0.1441	-+?-+	13.0	3.450	3	0.3273
5 : 34544151 : SNP	t	c	0.7668	0.0074	0.7476	0.7875	0.0031	0.0100	0.7585	-+--+	30.2	5.733	4	0.22
14 : 64414520 : SNP	a	c	0.5524	0.0190	0.5071	0.5634	0.0027	0.0085	0.7526	-+--+	2.9	4.118	4	0.3903
8 : 28524270 : SNP	t	g	0.9304	0.0085	0.9025	0.9343	0.0266	0.0195	0.1724	++?+-	15.7	3.561	3	0.313
20 : 43382112 : SNP	a	g	0.5057	0.0076	0.4871	0.5123	-0.0018	0.0085	0.828	++-+-	0.0	2.507	4	0.6434
6 : 32632057 : INDEL	d	r	0.2748	0.0276	0.2279	0.2951	0.0063	0.0244	0.7953	??++-	0.0	0.430	2	0.8067
15 : 62955977 : SNP	c	g	0.9727	0.0000	0.9727	0.9727	-0.0220	0.0445	0.6209	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 34575695 : SNP	t	c	0.0138	0.0000	0.0138	0.0138	0.0330	0.0536	0.5379	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 123119815 : SNP	t	c	0.9481	0.0033	0.9440	0.9535	-0.0035	0.0204	0.8634	+-??-	0.0	0.086	2	0.9579
11 : 16377119 : SNP	t	c	0.3155	0.0059	0.3099	0.3297	0.0069	0.0098	0.4807	-+++-	56.5	9.186	4	0.05661
8 : 75898900 : SNP	t	c	0.1039	0.0093	0.0782	0.1253	0.0056	0.0139	0.6859	0+++-	0.0	1.401	4	0.8439
9 : 131599032 : SNP	a	g	0.0861	0.0079	0.0735	0.0911	-0.0263	0.0325	0.4186	-???-	0.0	0.078	1	0.7799
13 : 62630427 : SNP	t	c	0.6908	0.0178	0.6707	0.7287	0.0037	0.0092	0.6857	+-+--	0.0	1.436	4	0.8378
20 : 52925121 : SNP	a	g	0.4504	0.0095	0.4332	0.4699	0.0025	0.0086	0.7694	0++-+	0.0	2.234	4	0.6928
6 : 166138045 : SNP	t	c	0.3800	0.0143	0.3588	0.3912	-0.0192	0.0091	0.03569	+----	52.2	8.375	4	0.07878
9 : 118121900 : SNP	a	g	0.9875	0.0000	0.9875	0.9875	0.0350	0.0576	0.5436	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 33051327 : SNP	c	g	0.8995	0.0071	0.8932	0.9094	-0.0202	0.0142	0.1554	+--+-	59.0	9.758	4	0.0447
1 : 69776742 : SNP	t	c	0.3342	0.0099	0.3288	0.3645	0.0112	0.0091	0.2193	+++-+	0.0	0.752	4	0.9447
3 : 3782550 : SNP	t	c	0.2171	0.0095	0.2055	0.2400	0.0024	0.0104	0.8167	+-+-+	0.0	2.465	4	0.651
2 : 16939790 : SNP	c	g	0.0261	0.0000	0.0261	0.0261	0.0090	0.0394	0.8194	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 26804802 : SNP	t	c	0.9079	0.0116	0.8782	0.9148	0.0312	0.0149	0.0361	+++++	0.0	2.067	4	0.7235
19 : 55687878 : SNP	a	g	0.9701	0.0036	0.9640	0.9722	0.0070	0.0314	0.8236	-???+	0.0	0.241	1	0.6237
13 : 93605856 : INDEL	i	r	0.0520	0.0122	0.0438	0.0742	-0.0349	0.0204	0.08757	--?--	0.0	1.365	3	0.7138
8 : 136359912 : SNP	a	g	0.8321	0.0084	0.8138	0.8375	0.0064	0.0115	0.5749	-++-+	19.3	4.958	4	0.2916
8 : 13456548 : SNP	c	g	0.4643	0.0072	0.4375	0.4686	-0.0031	0.0085	0.7149	+-+--	0.0	3.251	4	0.5168
9 : 73471752 : SNP	t	c	0.6676	0.0178	0.6567	0.7066	0.0021	0.0092	0.8151	++++-	0.0	3.035	4	0.552
3 : 32546505 : SNP	a	g	0.0235	0.0000	0.0235	0.0235	0.0540	0.0414	0.1926	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 79450206 : SNP	a	c	0.1591	0.0045	0.1515	0.1639	-0.0049	0.0120	0.6838	-+-++	0.0	2.021	4	0.7319
6 : 53457279 : SNP	a	c	0.2944	0.0107	0.2878	0.3263	-0.0062	0.0106	0.5568	+----	0.0	1.938	4	0.7471
8 : 5296752 : SNP	t	c	0.4478	0.0076	0.4257	0.4652	-0.0115	0.0090	0.2036	+----	48.9	7.827	4	0.09812
12 : 72216886 : SNP	t	c	0.0674	0.0021	0.0647	0.0729	-0.0098	0.0183	0.5916	-+?-+	0.0	0.760	3	0.859
1 : 54076130 : SNP	a	g	0.2170	0.0147	0.1813	0.2299	-0.0097	0.0103	0.3451	-+---	19.6	4.977	4	0.2897
1 : 101253309 : SNP	t	c	0.4350	0.0038	0.4304	0.4419	0.0006	0.0085	0.947	+---+	26.8	5.466	4	0.2427
5 : 160570421 : SNP	a	c	0.0425	0.0043	0.0382	0.0494	0.0657	0.0228	0.003858	++??-	66.6	5.987	2	0.05011
2 : 225059743 : SNP	a	g	0.0643	0.0051	0.0587	0.0820	-0.0048	0.0185	0.796	+-?+-	57.7	7.087	3	0.06919
1 : 153126444 : SNP	c	g	0.9193	0.0040	0.9056	0.9240	0.0063	0.0157	0.6869	-+--+	0.0	2.905	4	0.5738
11 : 128118879 : SNP	a	g	0.0709	0.0059	0.0655	0.0885	-0.0224	0.0186	0.2283	--?+-	0.0	0.537	3	0.9107
9 : 80528757 : SNP	t	c	0.2511	0.0143	0.2286	0.2678	-0.0101	0.0099	0.3104	-+-+-	0.0	1.883	4	0.7573
6 : 89722703 : SNP	a	g	0.2520	0.0113	0.2406	0.2750	0.0048	0.0099	0.6292	+-+++	0.0	1.135	4	0.8887
9 : 21303297 : SNP	a	g	0.7960	0.0076	0.7894	0.8121	-0.0061	0.0107	0.569	--+-+	0.0	2.788	4	0.5939
7 : 50567679 : SNP	t	c	0.1206	0.0128	0.0872	0.1313	0.0034	0.0131	0.7964	+-+--	0.0	1.302	4	0.8611
1 : 179495354 : SNP	a	g	0.4891	0.0281	0.4678	0.5494	-0.0051	0.0086	0.5528	----+	0.0	0.326	4	0.9881
5 : 159710015 : SNP	t	c	0.9744	0.0000	0.9744	0.9744	0.0570	0.0576	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 21815011 : INDEL	d	r	0.5845	0.0120	0.5598	0.5955	-0.0162	0.0192	0.3999	??--+	74.9	7.967	2	0.01862
15 : 33505222 : SNP	t	g	0.9848	0.0000	0.9848	0.9848	0.0090	0.0526	0.8641	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 200036326 : SNP	a	g	0.0735	0.0044	0.0655	0.0856	0.0114	0.0171	0.5052	+-?++	0.0	0.449	3	0.9299
6 : 26964601 : SNP	a	c	0.3371	0.0131	0.3159	0.3569	0.0020	0.0091	0.8269	+0+--	0.0	2.519	4	0.6412
8 : 124620126 : SNP	a	g	0.0640	0.0064	0.0465	0.0679	0.0031	0.0183	0.8636	-+??-	73.8	7.632	2	0.02202
2 : 160462035 : SNP	a	g	0.5088	0.0178	0.4926	0.5499	-0.0109	0.0085	0.2018	-+-+-	27.4	5.510	4	0.2388
9 : 99247166 : SNP	t	g	0.8143	0.0108	0.8065	0.8463	-0.0212	0.0112	0.0576	---+-	0.0	1.108	4	0.893
4 : 44878031 : SNP	a	g	0.9736	0.0000	0.9736	0.9736	0.0500	0.0404	0.2162	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 119215722 : SNP	a	g	0.0375	0.0068	0.0279	0.0482	-0.0024	0.0239	0.9207	-+??-	0.0	0.660	2	0.719
13 : 86649820 : INDEL	d	r	0.0321	0.0005	0.0314	0.0324	-0.0107	0.0285	0.7066	--???	0.0	0.063	1	0.8015
12 : 33441246 : SNP	a	g	0.9748	0.0000	0.9748	0.9748	0.0140	0.0394	0.7225	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 7942754 : SNP	t	c	0.3194	0.0394	0.2944	0.4018	-0.0172	0.0091	0.05745	-----	0.0	1.707	4	0.7894
8 : 29439654 : SNP	t	c	0.1083	0.0109	0.1000	0.1298	0.0079	0.0136	0.5615	++--+	0.0	0.639	4	0.9587
5 : 21017784 : INDEL	i	r	0.6986	0.0210	0.6588	0.7244	0.0018	0.0093	0.8455	-++++	0.0	2.377	4	0.6668
21 : 25595567 : SNP	t	c	0.8604	0.0084	0.8439	0.8661	-0.0013	0.0124	0.914	-+-+-	60.8	10.199	4	0.0372
5 : 114395888 : SNP	t	c	0.2394	0.0052	0.2292	0.2435	0.0057	0.0129	0.6602	+++--	33.9	6.056	4	0.195
7 : 134897433 : SNP	t	c	0.0266	0.0000	0.0266	0.0266	-0.0380	0.0617	0.5377	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 122766538 : SNP	a	c	0.2886	0.0144	0.2555	0.3096	-0.0051	0.0093	0.5862	-++--	0.0	2.079	4	0.7212
12 : 52948285 : SNP	a	c	0.2397	0.0089	0.2228	0.2632	-0.0016	0.0100	0.8714	+-+-+	25.9	5.400	4	0.2486
4 : 127464102 : SNP	a	g	0.7941	0.0191	0.7573	0.8131	0.0111	0.0106	0.2959	++-++	0.0	0.373	4	0.9846
5 : 137393698 : SNP	c	g	0.1756	0.0085	0.1478	0.1823	0.0109	0.0113	0.3362	+-+++	21.7	5.111	4	0.2761
1 : 39154742 : SNP	a	g	0.0388	0.0040	0.0327	0.0433	0.0126	0.0241	0.5996	+-??-	0.8	2.017	2	0.3648
14 : 73816768 : INDEL	d	r	0.0514	0.0019	0.0478	0.0524	-0.0175	0.0295	0.5542	-???+	86.7	7.532	1	0.006061
5 : 25634038 : SNP	t	g	0.7754	0.0076	0.7638	0.8086	-0.0007	0.0105	0.9484	---++	0.0	3.162	4	0.5311
5 : 162950024 : SNP	a	g	0.1094	0.0118	0.0792	0.1279	-0.0013	0.0138	0.9275	+----	0.0	4.000	4	0.406
11 : 39211664 : SNP	a	g	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	-0.0100	0.0546	0.8546	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 189498733 : SNP	a	g	0.5350	0.0376	0.4574	0.5590	0.0071	0.0085	0.4051	++--+	0.0	1.263	4	0.8677
12 : 130558804 : SNP	a	g	0.7753	0.0087	0.7657	0.8021	-0.0116	0.0112	0.3001	---+-	0.0	3.647	4	0.4558
1 : 159637021 : SNP	t	c	0.0105	0.0000	0.0105	0.0105	-0.0210	0.0627	0.7376	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 81929054 : SNP	a	g	0.2358	0.0054	0.2155	0.2402	0.0185	0.0113	0.1013	+++++	0.0	0.325	4	0.9881
15 : 46791837 : SNP	a	g	0.4447	0.0246	0.4082	0.4827	0.0181	0.0099	0.06764	+-+++	51.8	8.294	4	0.08139
6 : 80076832 : SNP	t	g	0.8973	0.0089	0.8876	0.9212	-0.0080	0.0149	0.5932	+---+	55.7	9.027	4	0.06043
19 : 6581241 : SNP	t	c	0.6183	0.0177	0.5592	0.6302	0.0037	0.0098	0.7058	-+++-	0.0	3.953	4	0.4124
7 : 78020077 : SNP	t	c	0.5440	0.0191	0.5194	0.5782	-0.0086	0.0085	0.3134	+-+--	0.0	3.922	4	0.4167
10 : 10810060 : INDEL	i	r	0.0413	0.0024	0.0364	0.0438	0.0002	0.0224	0.9938	+-??-	0.0	1.396	2	0.4975
1 : 103126190 : SNP	a	c	0.1544	0.0065	0.1416	0.1647	-0.0007	0.0119	0.9553	-+++-	0.0	2.114	4	0.7148
15 : 47282269 : SNP	t	g	0.6582	0.0051	0.6473	0.6618	0.0097	0.0091	0.2871	+0+-+	0.0	1.010	4	0.9083
19 : 22696166 : SNP	t	c	0.8827	0.0024	0.8789	0.8914	0.0156	0.0133	0.2439	++++-	0.0	2.352	4	0.6713
14 : 91897928 : SNP	t	c	0.6194	0.0074	0.6122	0.6288	-0.0092	0.0111	0.4105	---+-	0.0	3.583	4	0.4654
6 : 168906781 : SNP	a	g	0.4454	0.0217	0.4001	0.4913	-0.0004	0.0085	0.9606	--+++	0.0	3.903	4	0.4193
18 : 55899135 : SNP	t	c	0.9124	0.0135	0.9021	0.9329	0.0329	0.0185	0.07576	++?++	40.0	4.996	3	0.1721
7 : 107209448 : SNP	a	g	0.0524	0.0041	0.0449	0.0627	0.0039	0.0200	0.8456	+-?-+	38.8	4.905	3	0.1789
2 : 173188982 : SNP	t	c	0.5738	0.0116	0.5507	0.5839	-0.0124	0.0085	0.144	-----	0.0	2.488	4	0.6468
13 : 80895102 : SNP	t	c	0.9854	0.0000	0.9854	0.9854	-0.0180	0.0516	0.727	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 157629625 : SNP	a	g	0.9557	0.0000	0.9557	0.9557	0.0080	0.0445	0.8573	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 119884311 : SNP	t	c	0.4960	0.0058	0.4921	0.5149	0.0148	0.0085	0.08208	++--+	54.8	8.849	4	0.06498
17 : 77417217 : SNP	a	g	0.1768	0.0071	0.1686	0.1954	-0.0170	0.0115	0.1392	----+	0.0	0.513	4	0.9722
16 : 6747529 : SNP	a	c	0.0534	0.0044	0.0426	0.0571	0.0249	0.0201	0.2155	++??+	0.0	1.414	2	0.4932
5 : 16048184 : SNP	t	c	0.9900	0.0000	0.9900	0.9900	0.0710	0.0607	0.2418	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 178984575 : SNP	a	g	0.6994	0.0221	0.6423	0.7158	0.0115	0.0093	0.2181	++--+	0.0	2.847	4	0.5837
10 : 118589179 : SNP	a	g	0.4946	0.0109	0.4815	0.5238	0.0112	0.0085	0.1883	+++-+	0.0	0.621	4	0.9607
21 : 27197799 : SNP	t	c	0.5281	0.0219	0.4735	0.5668	0.0049	0.0085	0.5676	+++-+	0.0	2.078	4	0.7215
13 : 91741665 : INDEL	d	r	0.0804	0.0036	0.0791	0.0962	-0.0116	0.0154	0.4488	-+-+-	0.0	1.902	4	0.7538
17 : 77162586 : SNP	t	c	0.0884	0.0062	0.0764	0.0939	0.0269	0.0156	0.08329	++?++	0.0	0.255	3	0.9683
3 : 117827029 : SNP	t	c	0.9657	0.0022	0.9640	0.9689	0.0042	0.0247	0.8641	-+??+	0.0	0.442	2	0.8016
3 : 158841434 : SNP	a	g	0.3981	0.0069	0.3838	0.4081	-0.0051	0.0086	0.5497	++---	48.5	7.766	4	0.1005
2 : 46740524 : SNP	t	c	0.8428	0.0072	0.8364	0.8614	-0.0102	0.0121	0.3994	-+--+	0.0	2.928	4	0.57
5 : 180570050 : SNP	c	g	0.8180	0.0054	0.8116	0.8305	0.0177	0.0124	0.1535	++++-	0.0	2.939	4	0.568
7 : 79874058 : SNP	t	g	0.0849	0.0058	0.0831	0.1080	0.0005	0.0156	0.9741	++-+-	0.0	2.035	4	0.7294
15 : 88422512 : SNP	t	c	0.0682	0.0054	0.0567	0.0726	0.0009	0.0177	0.9616	--?++	9.4	3.310	3	0.3463
21 : 17640303 : SNP	a	g	0.9489	0.0040	0.9460	0.9544	-0.0056	0.0294	0.8484	-+???	0.0	0.819	1	0.3654
3 : 35590434 : INDEL	d	r	0.1357	0.0084	0.1218	0.1468	-0.0099	0.0132	0.4524	----+	4.4	4.185	4	0.3815
4 : 126067228 : SNP	a	t	0.9457	0.0021	0.9428	0.9474	0.0105	0.0200	0.5987	++??-	0.0	0.291	2	0.8645
10 : 106050315 : SNP	t	c	0.6946	0.0073	0.6758	0.7087	0.0051	0.0092	0.5742	++-++	0.0	0.985	4	0.9121
10 : 3440382 : SNP	t	c	0.1479	0.0109	0.1399	0.1711	0.0159	0.0122	0.1924	++-+-	0.0	1.243	4	0.871
3 : 79905029 : SNP	a	g	0.3721	0.0075	0.3647	0.4012	0.0043	0.0086	0.6202	++++-	69.1	12.943	4	0.01156
6 : 23387765 : SNP	a	g	0.8115	0.0128	0.7814	0.8217	-0.0147	0.0111	0.1859	---++	0.0	3.865	4	0.4246
12 : 86524422 : SNP	t	g	0.8911	0.0144	0.8586	0.9074	0.0198	0.0135	0.1443	+++--	0.0	3.546	4	0.4709
12 : 28167619 : SNP	t	c	0.8913	0.0076	0.8858	0.9105	0.0014	0.0140	0.92	-++--	0.0	1.458	4	0.834
12 : 33273472 : SNP	t	c	0.2808	0.0080	0.2772	0.3086	0.0090	0.0097	0.3553	++++-	5.1	4.214	4	0.3779
5 : 14388636 : SNP	a	g	0.9495	0.0030	0.9454	0.9535	-0.0199	0.0206	0.3332	--??-	0.0	0.479	2	0.7869
3 : 15518889 : SNP	t	c	0.5946	0.0177	0.5593	0.6159	0.0116	0.0085	0.1745	++++-	0.0	0.964	4	0.9152
6 : 92623049 : SNP	t	c	0.8556	0.0165	0.8436	0.8960	0.0077	0.0123	0.5301	++++-	50.3	8.046	4	0.08992
2 : 204679190 : SNP	a	t	0.9850	0.0000	0.9850	0.9850	-0.0960	0.0516	0.06259	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 35048583 : SNP	t	c	0.0191	0.0000	0.0191	0.0191	0.0050	0.0435	0.9084	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 10031337 : SNP	t	c	0.9344	0.0054	0.9183	0.9375	-0.0144	0.0176	0.4131	-+?+-	53.4	6.436	3	0.09221
2 : 182454462 : SNP	a	g	0.6338	0.0136	0.6026	0.6477	0.0004	0.0091	0.9608	-+-++	0.0	1.939	4	0.747
9 : 36308826 : SNP	t	c	0.4381	0.0146	0.4177	0.4608	-0.0059	0.0086	0.4886	---++	9.3	4.411	4	0.3532
10 : 50210633 : SNP	t	c	0.6509	0.0238	0.6200	0.7056	-0.0035	0.0092	0.707	-+-+-	0.0	1.261	4	0.8679
4 : 132882978 : SNP	t	g	0.1314	0.0047	0.1216	0.1342	0.0071	0.0287	0.8034	??--+	0.0	0.634	2	0.7284
20 : 16302864 : SNP	t	c	0.3720	0.0176	0.3505	0.4030	0.0040	0.0087	0.6449	--+-+	12.8	4.589	4	0.3321
15 : 61285569 : SNP	a	g	0.0364	0.0023	0.0330	0.0379	0.0372	0.0259	0.1515	++???	0.0	0.026	1	0.8716
19 : 48909671 : SNP	a	g	0.1790	0.0040	0.1718	0.1920	0.0001	0.0113	0.9922	+++--	0.0	1.716	4	0.7877
8 : 5674900 : SNP	a	g	0.1875	0.0041	0.1816	0.1965	-0.0036	0.0106	0.7316	+--+-	0.0	1.029	4	0.9053
9 : 121639769 : SNP	t	c	0.2534	0.0070	0.2271	0.2567	-0.0153	0.0098	0.1205	---+-	0.0	0.633	4	0.9593
4 : 9799287 : SNP	a	g	0.9609	0.0030	0.9574	0.9670	0.0008	0.0237	0.9715	-+??+	0.0	1.439	2	0.4871
10 : 101824954 : SNP	a	g	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	-0.0680	0.0536	0.2044	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 100335735 : SNP	a	g	0.6675	0.0085	0.6604	0.6886	0.0086	0.0092	0.3508	-+++-	71.5	14.022	4	0.007226
16 : 90087555 : SNP	t	c	0.0108	0.0000	0.0108	0.0108	-0.0780	0.0617	0.2059	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 127217639 : SNP	a	c	0.9771	0.0000	0.9771	0.9771	0.0130	0.0414	0.7538	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 117877612 : SNP	a	c	0.5705	0.0113	0.5418	0.5830	-0.0134	0.0085	0.1176	----+	54.0	8.700	4	0.06905
8 : 96753016 : SNP	a	c	0.9705	0.0000	0.9705	0.9705	-0.0020	0.0414	0.9615	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 54051744 : SNP	a	c	0.1774	0.0100	0.1647	0.1862	0.0143	0.0110	0.1954	+-+-+	2.6	4.108	4	0.3916
9 : 23043981 : SNP	a	g	0.0396	0.0012	0.0389	0.0422	0.0339	0.0234	0.1481	++??+	0.0	0.109	2	0.9472
17 : 50343877 : SNP	a	g	0.0163	0.0000	0.0163	0.0163	-0.0070	0.0607	0.9081	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 70636647 : SNP	t	c	0.5767	0.0132	0.5430	0.5917	0.0150	0.0086	0.08068	++-++	0.0	3.956	4	0.412
1 : 201519338 : SNP	t	c	0.2761	0.0065	0.2615	0.2806	0.0083	0.0098	0.3979	+++++	0.0	1.349	4	0.8529
7 : 115474682 : SNP	t	g	0.6603	0.0100	0.6508	0.6774	0.0064	0.0091	0.4859	+++++	0.0	0.196	4	0.9955
8 : 6635343 : SNP	t	c	0.8650	0.0064	0.8497	0.8739	0.0087	0.0127	0.4941	++-+-	0.0	1.089	4	0.896
14 : 96643414 : SNP	a	t	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	-0.0350	0.0495	0.4798	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 42038328 : SNP	a	g	0.8831	0.0220	0.8443	0.8965	-0.0051	0.0135	0.706	+-++-	8.7	4.379	4	0.3571
4 : 133820990 : INDEL	d	r	0.6686	0.0121	0.6230	0.6758	-0.0046	0.0091	0.6114	---+-	0.0	0.245	4	0.9931
9 : 109711110 : SNP	t	c	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	0.0030	0.0526	0.9545	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 117691244 : SNP	t	c	0.9250	0.0055	0.9155	0.9299	0.0238	0.0172	0.1666	++?+-	28.1	4.170	3	0.2437
11 : 132728215 : SNP	a	g	0.0684	0.0076	0.0606	0.0918	0.0169	0.0177	0.34	++?+-	0.0	2.356	3	0.502
5 : 79002443 : SNP	a	g	0.9062	0.0058	0.8991	0.9250	0.0098	0.0147	0.5041	++-+-	0.0	3.914	4	0.4178
3 : 134535422 : SNP	a	g	0.0428	0.0035	0.0380	0.0454	-0.0122	0.0268	0.6481	+-???	0.0	0.589	1	0.4429
1 : 102840004 : SNP	t	g	0.4149	0.0274	0.3829	0.4441	0.0060	0.0095	0.5265	+-++-	40.7	6.745	4	0.15
8 : 60613874 : SNP	t	c	0.9604	0.0031	0.9567	0.9630	-0.0121	0.0249	0.6257	--???	0.0	0.019	1	0.8902
14 : 95361357 : SNP	a	g	0.4179	0.0087	0.4011	0.4391	-0.0029	0.0085	0.7384	---++	0.0	2.482	4	0.6478
11 : 73917884 : INDEL	i	r	0.0161	0.0000	0.0161	0.0161	0.0150	0.0495	0.762	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 55534152 : SNP	a	g	0.8827	0.0071	0.8571	0.8969	-0.0079	0.0134	0.5542	+-++-	39.4	6.601	4	0.1586
17 : 66054370 : INDEL	d	r	0.1217	0.0033	0.1186	0.1296	-0.0210	0.0299	0.4827	??-+-	25.7	2.690	2	0.2605
10 : 10341018 : SNP	a	g	0.8751	0.0171	0.8675	0.9184	-0.0129	0.0137	0.3448	-+?--	13.5	3.468	3	0.3249
1 : 157342326 : SNP	a	g	0.2791	0.0098	0.2707	0.3109	0.0023	0.0096	0.8148	---++	26.4	5.436	4	0.2454
10 : 21199452 : SNP	c	g	0.9544	0.0015	0.9523	0.9556	0.0173	0.0223	0.4374	+-??-	62.6	5.341	2	0.06923
4 : 157669091 : SNP	a	t	0.9029	0.0067	0.8915	0.9090	-0.0129	0.0145	0.373	+-++-	0.0	2.337	4	0.674
5 : 52551511 : SNP	t	c	0.2957	0.0071	0.2735	0.3081	-0.0020	0.0092	0.8252	-++--	0.0	2.526	4	0.64
3 : 157304166 : SNP	t	c	0.0769	0.0064	0.0577	0.0818	-0.0053	0.0166	0.7471	-+?++	0.0	2.205	3	0.5309
11 : 116230506 : SNP	t	c	0.9485	0.0018	0.9463	0.9499	0.0023	0.0220	0.9178	-+???	0.0	0.333	1	0.5637
8 : 100968744 : SNP	t	c	0.8739	0.0128	0.8630	0.8950	-0.0049	0.0135	0.7171	--++-	48.3	7.741	4	0.1015
7 : 23221797 : INDEL	i	r	0.0373	0.0000	0.0373	0.0373	0.0050	0.0485	0.9179	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 34351218 : SNP	c	g	0.7430	0.0150	0.7070	0.7587	0.0037	0.0101	0.7134	+++--	0.0	1.325	4	0.8572
1 : 70261584 : INDEL	d	r	0.2181	0.0181	0.1981	0.2521	-0.0075	0.0127	0.5533	-+---	0.0	2.929	4	0.5697
10 : 59162681 : SNP	t	c	0.0135	0.0000	0.0135	0.0135	-0.0180	0.0617	0.7704	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 144410590 : SNP	t	c	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	-0.0470	0.0617	0.4459	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 26153279 : SNP	a	g	0.2115	0.0060	0.2058	0.2249	-0.0039	0.0104	0.7093	-++--	0.0	1.057	4	0.901
12 : 21273244 : SNP	t	g	0.2047	0.0129	0.1978	0.2398	0.0164	0.0105	0.1194	+-+++	43.5	7.074	4	0.1321
5 : 142535605 : SNP	t	c	0.2522	0.0031	0.2489	0.2579	-0.0176	0.0100	0.07637	--++-	50.2	8.026	4	0.09063
11 : 7754184 : SNP	a	g	0.0454	0.0031	0.0426	0.0489	-0.0417	0.0223	0.06223	--??+	0.0	1.169	2	0.5573
9 : 26212728 : SNP	t	c	0.4353	0.0070	0.4121	0.4518	0.0059	0.0086	0.4895	+++--	0.0	2.990	4	0.5595
11 : 19791204 : SNP	c	g	0.3143	0.0189	0.2635	0.3352	-0.0112	0.0093	0.2269	--+--	0.0	2.191	4	0.7007
12 : 126565356 : SNP	t	g	0.1974	0.0195	0.1620	0.2223	0.0042	0.0106	0.695	-+--+	0.0	1.956	4	0.7438
13 : 64562426 : INDEL	i	r	0.0272	0.0033	0.0252	0.0328	0.0202	0.0330	0.5413	+???+	0.0	0.009	1	0.9259
9 : 4240126 : SNP	a	g	0.4403	0.0116	0.4016	0.4539	-0.0088	0.0091	0.3331	-+---	0.0	3.924	4	0.4163
6 : 84069668 : SNP	t	c	0.3259	0.0291	0.3094	0.3838	0.0067	0.0091	0.4641	-++++	0.0	3.803	4	0.4333
9 : 2582380 : SNP	t	c	0.8042	0.0186	0.7700	0.8223	-0.0050	0.0107	0.639	-+---	22.6	5.166	4	0.2707
7 : 88220259 : SNP	c	g	0.2755	0.0182	0.2377	0.2872	0.0069	0.0094	0.4677	+----	51.6	8.263	4	0.08242
5 : 29921313 : SNP	t	c	0.7836	0.0186	0.7594	0.8245	-0.0029	0.0108	0.7856	-+++-	8.2	4.356	4	0.3599
7 : 68237931 : SNP	a	g	0.5832	0.0134	0.5643	0.6132	-0.0034	0.0086	0.6951	+--+-	48.2	7.716	4	0.1026
5 : 2259459 : SNP	t	g	0.2346	0.0090	0.2233	0.2503	0.0133	0.0105	0.207	-++-+	70.7	13.633	4	0.008564
14 : 56343792 : SNP	a	g	0.1106	0.0175	0.0880	0.1388	-0.0098	0.0144	0.4958	-+?--	0.0	2.568	3	0.4632
4 : 111654124 : SNP	t	c	0.8819	0.0192	0.8337	0.8971	0.0046	0.0134	0.731	-+--+	15.4	4.725	4	0.3167
11 : 49960552 : SNP	t	c	0.4074	0.0251	0.3484	0.4231	-0.0046	0.0086	0.5895	-++-+	0.0	3.938	4	0.4145
7 : 80542697 : SNP	a	g	0.0479	0.0031	0.0438	0.0557	0.0307	0.0232	0.1851	++?++	0.0	1.845	3	0.6052
2 : 153556552 : SNP	a	c	0.1589	0.0112	0.1515	0.1836	-0.0063	0.0118	0.5935	+--+-	62.1	10.545	4	0.03218
14 : 78689274 : SNP	a	g	0.3308	0.0213	0.3118	0.3785	-0.0013	0.0091	0.8853	-+-+-	0.0	0.770	4	0.9424
2 : 203959337 : SNP	a	g	0.7470	0.0218	0.7337	0.8004	-0.0070	0.0099	0.481	0---+	0.0	3.136	4	0.5353
7 : 121147858 : SNP	a	g	0.0972	0.0268	0.0624	0.1394	0.0114	0.0200	0.5683	+-?-+	16.1	3.578	3	0.3108
21 : 41824852 : SNP	a	g	0.6107	0.0199	0.5947	0.6552	0.0174	0.0086	0.04289	+++++	0.0	0.525	4	0.971
7 : 45255991 : SNP	t	c	0.1958	0.0085	0.1718	0.2226	0.0099	0.0106	0.3498	+++++	0.0	0.284	4	0.9908
15 : 96562066 : SNP	a	g	0.0528	0.0005	0.0524	0.0535	-0.0116	0.0218	0.5954	--???	0.0	0.024	1	0.8769
2 : 197135432 : INDEL	d	r	0.2375	0.0055	0.2232	0.2562	-0.0203	0.0106	0.05539	--+--	51.8	8.306	4	0.081
5 : 58527396 : SNP	t	c	0.2930	0.0147	0.2651	0.3136	0.0131	0.0093	0.1586	+++--	12.7	4.582	4	0.3329
10 : 33598319 : SNP	t	c	0.5236	0.0098	0.4960	0.5373	0.0010	0.0086	0.9049	+---+	0.0	3.439	4	0.4872
2 : 179601975 : SNP	a	g	0.9507	0.0009	0.9487	0.9513	0.0108	0.0210	0.6052	+-??-	0.0	0.923	2	0.6303
14 : 85073525 : SNP	t	c	0.0276	0.0094	0.0202	0.0395	-0.0500	0.0357	0.1612	-???-	0.0	0.724	1	0.395
4 : 123425511 : SNP	a	c	0.9200	0.0063	0.9120	0.9252	0.0224	0.0174	0.1971	++?+?	0.0	1.587	2	0.4523
2 : 119143192 : SNP	a	t	0.0635	0.0079	0.0512	0.0718	0.0226	0.0217	0.2985	++?--	4.6	3.145	3	0.3698
19 : 49263307 : SNP	t	c	0.6245	0.0228	0.6064	0.6690	-0.0030	0.0265	0.9098	??+--	0.0	1.380	2	0.5015
1 : 147735751 : SNP	a	g	0.2000	0.0149	0.1901	0.2293	-0.0187	0.0140	0.1806	-+--+	22.0	5.130	4	0.2742
1 : 191953737 : SNP	t	c	0.5227	0.0092	0.5009	0.5286	-0.0024	0.0085	0.7738	-++-+	5.6	4.238	4	0.3748
3 : 98977366 : SNP	t	c	0.3373	0.0088	0.3174	0.3558	-0.0082	0.0091	0.3697	--+--	0.0	0.615	4	0.9614
5 : 28731798 : SNP	a	g	0.9794	0.0000	0.9794	0.9794	-0.0810	0.0637	0.2034	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 156278785 : SNP	a	g	0.3202	0.0102	0.2861	0.3381	0.0123	0.0097	0.2038	+++-+	0.0	3.367	4	0.4984
16 : 10697878 : INDEL	i	r	0.0568	0.0065	0.0377	0.0601	-0.0162	0.0199	0.4159	+-??+	41.2	3.399	2	0.1828
2 : 223745734 : SNP	a	g	0.1946	0.0075	0.1828	0.2048	-0.0157	0.0111	0.1563	---++	0.0	1.351	4	0.8526
6 : 16276729 : SNP	t	c	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	0.0980	0.0445	0.02757	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 29800197 : SNP	t	c	0.1114	0.0060	0.0938	0.1185	0.0078	0.0139	0.5731	-+--+	37.9	6.437	4	0.1688
18 : 64559204 : SNP	t	c	0.0558	0.0033	0.0507	0.0585	-0.0232	0.0196	0.2373	--??+	53.8	4.328	2	0.1148
5 : 55784698 : SNP	a	c	0.1913	0.0206	0.1785	0.2418	0.0070	0.0111	0.5291	+++-+	31.7	5.853	4	0.2104
18 : 74286680 : SNP	t	c	0.7373	0.0254	0.7087	0.7689	0.0127	0.0136	0.352	-++++	53.9	8.670	4	0.06991
8 : 3107344 : SNP	t	c	0.9434	0.0033	0.9421	0.9519	0.0206	0.0205	0.3142	++??+	0.0	0.168	2	0.9194
11 : 55107998 : INDEL	i	r	0.1077	0.0075	0.0922	0.1171	-0.0124	0.0150	0.4097	-+--?	0.0	2.788	3	0.4255
7 : 79676314 : SNP	t	g	0.9810	0.0000	0.9810	0.9810	-0.0490	0.0455	0.2814	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 197174030 : SNP	t	c	0.9179	0.0068	0.9120	0.9276	0.0033	0.0157	0.8347	+-?+-	9.5	3.314	3	0.3457
9 : 118790936 : SNP	a	g	0.7247	0.0163	0.6948	0.7396	-0.0039	0.0101	0.7009	+--+-	0.0	3.600	4	0.4628
6 : 124960029 : INDEL	d	r	0.4822	0.0216	0.4643	0.5143	0.0030	0.0098	0.7553	-++++	0.0	3.240	4	0.5185
1 : 249062593 : SNP	a	t	0.0937	0.0067	0.0718	0.0981	0.0212	0.0149	0.1546	+++++	0.0	0.658	4	0.9564
5 : 37463809 : SNP	t	c	0.0575	0.0047	0.0509	0.0619	-0.0094	0.0241	0.6965	-+??+	40.8	3.378	2	0.1847
5 : 97949430 : SNP	a	t	0.0180	0.0000	0.0180	0.0180	0.0160	0.0475	0.7363	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 122941361 : SNP	t	c	0.9848	0.0000	0.9848	0.9848	-0.0230	0.0566	0.6845	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 7752915 : SNP	a	g	0.5667	0.0121	0.5488	0.5960	0.0116	0.0085	0.1757	+-+++	0.0	1.154	4	0.8856
6 : 49058942 : SNP	a	c	0.9879	0.0000	0.9879	0.9879	0.0440	0.0607	0.4682	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 134235816 : SNP	t	c	0.4376	0.0126	0.4107	0.4479	0.0000	0.0090	0.9986	-0+-+	0.0	1.130	4	0.8895
14 : 23200505 : SNP	t	c	0.1004	0.0079	0.0846	0.1088	-0.0110	0.0147	0.4551	--+++	17.0	4.821	4	0.3061
8 : 22897865 : SNP	t	c	0.0911	0.0000	0.0911	0.0911	-0.0466	0.0617	0.4501	????-	0.0	0.000	0	1
15 : 95402822 : SNP	t	g	0.7418	0.0067	0.7360	0.7700	-0.0068	0.0099	0.4897	-+---	0.0	3.670	4	0.4525
17 : 11773438 : SNP	a	c	0.5285	0.0061	0.5228	0.5389	-0.0162	0.0085	0.0565	---+-	0.0	1.511	4	0.8247
3 : 18409579 : SNP	t	c	0.3764	0.0155	0.3541	0.4184	0.0035	0.0090	0.6957	-+-++	0.0	2.975	4	0.562
18 : 8316993 : SNP	c	g	0.2383	0.0197	0.1932	0.2479	-0.0046	0.0102	0.6476	----+	33.8	6.045	4	0.1958
8 : 28185578 : SNP	t	c	0.5764	0.0078	0.5671	0.5904	-0.0011	0.0097	0.9074	+--++	22.1	5.137	4	0.2735
19 : 5892461 : SNP	a	g	0.0165	0.0000	0.0165	0.0165	0.0560	0.0465	0.2285	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 140157941 : SNP	a	g	0.3009	0.0165	0.2636	0.3145	-0.0071	0.0099	0.4717	----+	0.0	0.999	4	0.9099
2 : 148443683 : SNP	a	g	0.9605	0.0092	0.9446	0.9672	0.0112	0.0228	0.6233	+-?++	34.0	4.548	3	0.2081
2 : 77994100 : SNP	t	c	0.9259	0.0021	0.9243	0.9302	0.0315	0.0180	0.08038	++?-+	35.3	4.635	3	0.2006
10 : 24544276 : INDEL	d	r	0.3434	0.0128	0.3147	0.3510	0.0028	0.0092	0.7621	+++--	0.0	2.639	4	0.6199
12 : 120223984 : SNP	a	g	0.4819	0.0119	0.4634	0.5009	-0.0123	0.0085	0.1486	0----	0.0	2.343	4	0.6729
2 : 38311413 : SNP	a	g	0.5526	0.0108	0.5459	0.5760	0.0018	0.0089	0.8358	0--++	0.0	3.519	4	0.4751
4 : 70105054 : SNP	c	g	0.9654	0.0014	0.9637	0.9665	-0.0108	0.0372	0.7708	-???+	0.0	0.975	1	0.3234
11 : 21975643 : SNP	t	c	0.9368	0.0018	0.9353	0.9406	-0.0257	0.0194	0.1842	--?++	0.0	0.755	3	0.8602
4 : 87985443 : SNP	t	g	0.7872	0.0191	0.7486	0.7988	-0.0236	0.0105	0.02443	-----	0.0	0.742	4	0.9461
6 : 11600131 : SNP	a	g	0.0161	0.0000	0.0161	0.0161	0.0440	0.0495	0.3744	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 41689283 : SNP	a	c	0.4320	0.0068	0.4215	0.4385	-0.0185	0.0086	0.0306	---++	27.4	5.512	4	0.2387
4 : 9185038 : SNP	t	c	0.5909	0.1251	0.3726	0.6627	0.0046	0.0272	0.8645	??-++	0.0	0.995	2	0.6082
2 : 51662858 : SNP	a	t	0.8271	0.0115	0.8087	0.8565	-0.0041	0.0119	0.7329	+----	0.0	3.020	4	0.5545
2 : 212592044 : SNP	t	g	0.6365	0.0221	0.5792	0.6505	-0.0127	0.0089	0.1522	-----	0.0	0.924	4	0.9211
5 : 104976838 : SNP	a	t	0.7683	0.0135	0.7399	0.7799	-0.0024	0.0099	0.8068	0++--	0.0	1.618	4	0.8056
8 : 57856854 : SNP	a	g	0.8769	0.0061	0.8660	0.8820	0.0008	0.0132	0.95	+---+	0.0	3.495	4	0.4786
7 : 140041514 : SNP	t	g	0.8782	0.0081	0.8670	0.8852	0.0002	0.0140	0.9874	+-++-	0.0	2.778	4	0.5957
2 : 154697475 : INDEL	d	r	0.0914	0.0028	0.0867	0.0950	-0.0202	0.0151	0.1807	-+?--	57.1	6.989	3	0.07225
1 : 27704560 : SNP	c	g	0.0915	0.0082	0.0846	0.1059	-0.0108	0.0157	0.4926	---+-	0.0	3.624	4	0.4593
15 : 33398409 : SNP	t	c	0.3582	0.0052	0.3529	0.3659	-0.0003	0.0091	0.9747	+-+-+	0.0	1.075	4	0.8983
9 : 31808177 : SNP	a	c	0.9186	0.0094	0.8907	0.9243	-0.0059	0.0163	0.7166	-+?++	21.8	3.838	3	0.2795
6 : 92340802 : SNP	t	g	0.3902	0.0091	0.3595	0.3974	0.0037	0.0086	0.6678	+-++-	0.0	0.523	4	0.9712
12 : 62255128 : SNP	a	g	0.3464	0.0136	0.3177	0.3604	0.0066	0.0092	0.4723	+++--	49.9	7.989	4	0.09198
1 : 163207342 : SNP	a	g	0.0235	0.0024	0.0214	0.0263	0.0359	0.0328	0.2744	-+???	57.8	2.368	1	0.1238
8 : 33929280 : INDEL	d	r	0.0720	0.0044	0.0612	0.0754	0.0424	0.0171	0.01343	++??+	0.0	0.763	2	0.6827
16 : 5264690 : SNP	a	c	0.0359	0.0013	0.0349	0.0375	-0.0279	0.0259	0.2813	--???	7.6	1.082	1	0.2983
3 : 149741488 : SNP	t	c	0.3532	0.0149	0.3126	0.3626	-0.0100	0.0089	0.2637	--+--	0.0	0.382	4	0.9839
19 : 58113074 : SNP	a	g	0.2086	0.0091	0.2014	0.2332	-0.0023	0.0109	0.8291	+--+-	0.0	1.205	4	0.8773
4 : 135459290 : SNP	t	c	0.2044	0.0106	0.1924	0.2147	-0.0229	0.0107	0.0317	-----	0.0	2.469	4	0.6502
1 : 79663367 : SNP	a	t	0.9662	0.0018	0.9643	0.9681	0.0253	0.0261	0.3331	++??+	0.0	0.249	2	0.8831
5 : 140789158 : SNP	a	g	0.0286	0.0039	0.0250	0.0329	0.0341	0.0298	0.2519	++???	0.0	0.700	1	0.4029
12 : 51088054 : SNP	a	g	0.2800	0.0148	0.2451	0.3038	0.0071	0.0094	0.4539	+--++	0.0	2.634	4	0.6209
14 : 20304910 : SNP	t	g	0.8543	0.0000	0.8543	0.8543	0.0847	0.0893	0.3429	???+?	0.0	0.000	0	1
7 : 86062395 : SNP	t	c	0.1813	0.0092	0.1583	0.2006	0.0071	0.0111	0.5248	+-+-+	0.0	3.736	4	0.4429
8 : 104082307 : SNP	t	c	0.1461	0.0099	0.1243	0.1587	-0.0073	0.0122	0.5475	+-+--	0.0	1.860	4	0.7615
12 : 126575022 : SNP	t	c	0.1411	0.0131	0.1163	0.1567	0.0060	0.0125	0.6297	-+--+	0.0	2.264	4	0.6873
7 : 110586505 : SNP	a	t	0.0415	0.0035	0.0380	0.0485	-0.0091	0.0220	0.6785	-+??+	51.1	4.090	2	0.1294
3 : 149997666 : INDEL	i	r	0.3953	0.0057	0.3852	0.4123	-0.0072	0.0119	0.549	+-+--	5.6	4.236	4	0.375
13 : 30485143 : SNP	t	c	0.0496	0.0015	0.0462	0.0512	-0.0224	0.0208	0.2836	--??+	44.4	3.598	2	0.1655
6 : 89392583 : SNP	t	g	0.1169	0.0035	0.1141	0.1250	0.0018	0.0133	0.8944	++--+	0.0	1.153	4	0.8858
2 : 212706980 : SNP	t	g	0.1887	0.0221	0.1300	0.1999	-0.0092	0.0115	0.4233	-+---	18.0	4.879	4	0.2999
17 : 14682921 : SNP	a	g	0.0274	0.0000	0.0274	0.0274	0.0290	0.0374	0.4381	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 73023703 : INDEL	d	r	0.3423	0.0144	0.3346	0.3770	-0.0005	0.0089	0.9534	+----	0.0	3.199	4	0.5251
9 : 113248936 : INDEL	i	r	0.6509	0.0056	0.6386	0.6587	0.0051	0.0097	0.5988	++---	53.7	8.637	4	0.07083
3 : 137200667 : SNP	t	c	0.0606	0.0089	0.0525	0.0783	0.0093	0.0189	0.6218	++?--	0.0	1.814	3	0.6119
7 : 47918438 : SNP	a	g	0.7213	0.0114	0.6985	0.7310	0.0222	0.0097	0.02196	+-+++	61.6	10.404	4	0.03414
19 : 14370588 : SNP	t	c	0.0835	0.0145	0.0700	0.1124	-0.0074	0.0160	0.6425	+-?--	8.7	3.287	3	0.3494
2 : 165837211 : SNP	a	c	0.0470	0.0000	0.0470	0.0470	-0.0210	0.0374	0.5745	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 83843798 : SNP	a	g	0.9499	0.0021	0.9482	0.9530	-0.0051	0.0205	0.8029	+-??-	0.0	0.471	2	0.79
13 : 101524791 : SNP	a	g	0.2225	0.0150	0.2124	0.2559	-0.0020	0.0106	0.8522	-++--	0.0	1.139	4	0.8881
10 : 12929613 : SNP	a	t	0.1139	0.0074	0.0985	0.1206	0.0122	0.0132	0.3572	+-+++	0.0	2.943	4	0.5674
16 : 55472960 : SNP	t	g	0.1086	0.0077	0.1012	0.1191	0.0039	0.0136	0.7742	+-+-+	0.0	1.206	4	0.8771
18 : 12190717 : INDEL	d	r	0.3098	0.0224	0.2762	0.3325	0.0032	0.0128	0.8035	+-+--	16.2	4.771	4	0.3116
4 : 2374176 : SNP	a	g	0.0374	0.0066	0.0330	0.0473	-0.0228	0.0328	0.4878	+???-	52.7	2.113	1	0.146
19 : 13448466 : SNP	a	g	0.3185	0.0036	0.3151	0.3276	-0.0187	0.0091	0.0398	--++-	0.0	1.539	4	0.8197
8 : 83443788 : SNP	a	c	0.9608	0.0004	0.9605	0.9613	-0.0075	0.0249	0.7625	+-???	0.0	0.434	1	0.5102
6 : 606105 : SNP	a	g	0.0387	0.0034	0.0365	0.0457	0.0047	0.0227	0.8345	-+??+	0.0	1.765	2	0.4137
1 : 20166531 : INDEL	d	r	0.0798	0.0071	0.0696	0.0857	-0.0120	0.0168	0.4765	--?+-	0.0	1.073	3	0.7835
16 : 75560152 : SNP	t	c	0.2064	0.0083	0.2011	0.2245	-0.0139	0.0106	0.1893	-----	0.0	0.816	4	0.9362
11 : 42469756 : SNP	a	c	0.1029	0.0108	0.0944	0.1282	-0.0090	0.0142	0.524	--+-+	56.0	9.094	4	0.05878
18 : 50181615 : SNP	a	c	0.9198	0.0153	0.8890	0.9323	0.0135	0.0164	0.4115	++?+-	20.7	3.781	3	0.2861
22 : 18052063 : SNP	t	c	0.3534	0.0046	0.3414	0.3632	0.0056	0.0093	0.5465	+-+++	0.0	2.849	4	0.5833
3 : 106650224 : SNP	t	c	0.1264	0.0073	0.0976	0.1436	0.0037	0.0132	0.7791	-+---	3.9	4.163	4	0.3844
9 : 76158682 : SNP	a	g	0.1662	0.0086	0.1585	0.1863	0.0007	0.0119	0.9498	0+++-	0.0	0.465	4	0.9768
22 : 30768777 : SNP	a	g	0.4422	0.0073	0.4239	0.4518	-0.0034	0.0086	0.695	--+--	0.0	0.796	4	0.939
5 : 123698467 : SNP	t	g	0.0609	0.0015	0.0586	0.0629	0.0067	0.0183	0.713	-+?++	0.0	0.578	3	0.9015
10 : 125366785 : SNP	t	c	0.9720	0.0022	0.9694	0.9739	-0.0327	0.0289	0.2591	--???	0.0	0.214	1	0.644
13 : 19773379 : SNP	t	c	0.8329	0.0222	0.8165	0.8746	0.0164	0.0145	0.258	-++++	0.0	3.979	4	0.4088
1 : 237392422 : INDEL	d	r	0.3361	0.0183	0.2898	0.3670	-0.0027	0.0092	0.7671	++---	54.6	8.819	4	0.06578
15 : 68351048 : SNP	a	c	0.0295	0.0000	0.0295	0.0295	0.0510	0.0566	0.3676	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 104623596 : SNP	a	c	0.5647	0.0099	0.5584	0.5883	-0.0015	0.0085	0.8615	+---+	23.3	5.214	4	0.266
2 : 147206266 : SNP	t	c	0.5424	0.0148	0.5109	0.5537	-0.0133	0.0085	0.1179	----+	0.0	1.660	4	0.798
14 : 49696997 : SNP	t	c	0.2199	0.0146	0.2095	0.2517	0.0010	0.0104	0.9254	--+-+	0.0	2.406	4	0.6616
14 : 79636394 : SNP	a	g	0.1241	0.0128	0.0935	0.1337	-0.0177	0.0131	0.1778	-+---	0.0	2.789	4	0.5937
2 : 227291380 : SNP	a	c	0.9572	0.0034	0.9547	0.9625	-0.0029	0.0222	0.8953	+-??+	0.0	0.298	2	0.8617
9 : 138471073 : INDEL	d	r	0.0316	0.0039	0.0291	0.0378	0.0015	0.0317	0.9631	+???-	6.0	1.064	1	0.3023
2 : 25056618 : SNP	c	g	0.6549	0.0099	0.6280	0.6720	-0.0085	0.0092	0.3571	-+---	63.3	10.908	4	0.02762
6 : 131832689 : SNP	a	g	0.2189	0.0042	0.2082	0.2275	-0.0031	0.0104	0.7652	+-++-	0.0	0.547	4	0.9688
16 : 26323069 : SNP	t	c	0.3040	0.0077	0.2955	0.3347	0.0047	0.0092	0.6072	++-++	0.0	1.712	4	0.7886
7 : 72013115 : SNP	a	g	0.9183	0.0129	0.8964	0.9266	-0.0010	0.0375	0.9793	??--+	0.0	0.111	2	0.946
3 : 102892570 : SNP	a	g	0.6589	0.0184	0.6457	0.7027	0.0007	0.0092	0.9393	+-+-+	0.0	2.475	4	0.6492
1 : 184316130 : SNP	t	c	0.1344	0.0037	0.1295	0.1409	0.0024	0.0123	0.8436	+--++	0.0	1.219	4	0.875
8 : 88164140 : SNP	t	g	0.4626	0.0148	0.4345	0.4753	-0.0016	0.0086	0.8473	--+++	49.9	7.980	4	0.09231
11 : 7314772 : SNP	t	c	0.0340	0.0050	0.0314	0.0441	-0.0171	0.0245	0.4853	--??-	0.0	0.562	2	0.7549
11 : 96579704 : SNP	a	g	0.0393	0.0000	0.0393	0.0393	-0.0780	0.0455	0.0864	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 56812374 : SNP	a	g	0.0798	0.0096	0.0531	0.0857	0.0133	0.0164	0.4149	++?-+	0.0	1.857	3	0.6026
5 : 4929407 : SNP	a	g	0.6579	0.0199	0.6145	0.6696	0.0046	0.0091	0.6108	+++--	27.8	5.543	4	0.236
20 : 54543041 : SNP	a	t	0.0273	0.0048	0.0228	0.0323	0.0037	0.0309	0.9045	-+???	0.0	0.190	1	0.6627
11 : 16903178 : SNP	a	c	0.1390	0.0121	0.1241	0.1617	0.0114	0.0122	0.3525	++--+	0.0	3.896	4	0.4203
2 : 156915686 : SNP	a	g	0.9089	0.0040	0.9037	0.9152	0.0067	0.0151	0.6589	+-?+-	0.0	1.704	3	0.6361
8 : 90716156 : SNP	a	g	0.1164	0.0168	0.0929	0.1429	0.0161	0.0137	0.2389	+++-+	0.0	0.437	4	0.9794
3 : 111460996 : SNP	t	g	0.0115	0.0000	0.0115	0.0115	-0.0030	0.0576	0.9585	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 9756975 : SNP	a	g	0.5098	0.0216	0.4643	0.5500	-0.0042	0.0104	0.6846	+--++	52.4	8.396	4	0.07809
18 : 72910687 : SNP	t	c	0.5787	0.0094	0.5415	0.5866	0.0164	0.0089	0.06528	+++++	0.0	2.753	4	0.5999
6 : 123864107 : INDEL	i	r	0.5476	0.0159	0.4998	0.5772	-0.0031	0.0086	0.7145	+-+--	0.0	3.003	4	0.5574
5 : 8038200 : SNP	a	t	0.0337	0.0114	0.0251	0.0488	0.0881	0.0323	0.006372	+???+	81.2	5.324	1	0.02104
12 : 97709771 : SNP	t	c	0.0631	0.0067	0.0448	0.0674	0.0118	0.0195	0.5438	-+??+	59.6	4.949	2	0.08421
2 : 151942238 : SNP	t	c	0.3066	0.0187	0.2898	0.3593	0.0297	0.0093	0.001341	++-++	0.0	3.747	4	0.4413
2 : 197300861 : SNP	a	g	0.9666	0.0060	0.9557	0.9731	-0.0468	0.0258	0.06944	--??+	77.0	8.680	2	0.01303
3 : 140381675 : SNP	a	g	0.7206	0.0091	0.7129	0.7341	0.0115	0.0094	0.2204	-++++	37.8	6.435	4	0.169
4 : 181327429 : SNP	t	c	0.0434	0.0088	0.0382	0.0589	-0.0001	0.0218	0.9958	--?++	30.2	4.295	3	0.2313
5 : 60566364 : INDEL	d	r	0.1764	0.0098	0.1671	0.1963	0.0114	0.0114	0.3178	-++-+	0.0	3.784	4	0.436
8 : 51327959 : SNP	c	g	0.2281	0.0124	0.1934	0.2382	0.0009	0.0101	0.9317	-++-+	0.0	2.629	4	0.6216
5 : 113287350 : SNP	t	g	0.1997	0.0079	0.1813	0.2051	-0.0007	0.0107	0.9515	-+-++	17.9	4.873	4	0.3006
20 : 58198325 : SNP	a	g	0.2819	0.0146	0.2356	0.3048	-0.0076	0.0096	0.4311	+-++-	57.9	9.491	4	0.04993
4 : 125771540 : SNP	a	g	0.5492	0.0177	0.5293	0.5835	0.0145	0.0085	0.09022	+++++	0.0	1.470	4	0.8319
5 : 65083865 : SNP	a	g	0.8212	0.0104	0.8010	0.8324	-0.0026	0.0128	0.8381	--+++	0.0	2.506	4	0.6435
15 : 62139993 : SNP	a	t	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	-0.0640	0.0445	0.1502	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 7719269 : SNP	a	g	0.8542	0.0086	0.8311	0.8629	0.0066	0.0153	0.6656	-+-+-	32.3	5.911	4	0.2059
8 : 4938476 : SNP	a	t	0.8881	0.0104	0.8670	0.8961	0.0022	0.0136	0.8731	++---	0.0	2.769	4	0.5972
4 : 30949703 : INDEL	d	r	0.2341	0.0125	0.2171	0.2560	-0.0067	0.0101	0.5098	----+	0.0	2.329	4	0.6756
12 : 22265923 : INDEL	i	r	0.2985	0.0136	0.2781	0.3119	-0.0090	0.0097	0.3557	+----	0.0	3.378	4	0.4967
10 : 92641987 : SNP	t	c	0.0633	0.0045	0.0574	0.0711	0.0046	0.0180	0.7964	--?-+	0.0	1.391	3	0.7077
7 : 18929556 : SNP	a	g	0.2307	0.0142	0.2002	0.2454	0.0006	0.0105	0.9564	--+++	24.8	5.322	4	0.2559
18 : 33309986 : INDEL	d	r	0.0641	0.0030	0.0620	0.0704	-0.0429	0.0188	0.02279	--?--	0.0	1.092	3	0.7789
11 : 117604158 : SNP	a	t	0.9667	0.0093	0.9535	0.9733	-0.0458	0.0314	0.1449	-???+	16.6	1.199	1	0.2735
1 : 238309257 : SNP	t	c	0.3741	0.0128	0.3528	0.3864	-0.0039	0.0089	0.6657	--+--	0.0	0.313	4	0.989
14 : 26507519 : SNP	a	c	0.0557	0.0065	0.0524	0.0753	-0.0182	0.0190	0.3391	--?+-	0.0	0.644	3	0.8863
8 : 129138348 : INDEL	d	r	0.0235	0.0000	0.0235	0.0235	-0.0940	0.0607	0.1212	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 26722645 : SNP	a	g	0.5556	0.0159	0.5131	0.5961	0.0023	0.0086	0.7898	+---+	0.0	2.326	4	0.676
20 : 48732497 : SNP	a	g	0.7799	0.0047	0.7706	0.7905	-0.0108	0.0105	0.3057	-+-+-	0.0	1.251	4	0.8697
11 : 86629256 : SNP	a	t	0.9792	0.0000	0.9792	0.9792	0.0030	0.0586	0.9592	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 53966000 : SNP	t	c	0.0123	0.0000	0.0123	0.0123	-0.0080	0.0576	0.8896	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 48891591 : SNP	a	g	0.9826	0.0000	0.9826	0.9826	0.0040	0.0505	0.9369	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 218756209 : SNP	a	g	0.0427	0.0195	0.0211	0.0603	-0.0015	0.0373	0.968	-???+	17.8	1.216	1	0.2702
15 : 46676855 : SNP	c	g	0.9877	0.0000	0.9877	0.9877	-0.0080	0.0586	0.8915	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 97794647 : SNP	t	c	0.5737	0.0173	0.5389	0.6027	0.0011	0.0087	0.8953	-+-++	26.0	5.404	4	0.2483
12 : 99179081 : SNP	c	g	0.9707	0.0000	0.9707	0.9707	-0.0080	0.0374	0.8306	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 3914308 : SNP	t	c	0.9698	0.0000	0.9698	0.9698	-0.0360	0.0414	0.3851	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 30210434 : SNP	t	g	0.9524	0.0061	0.9393	0.9604	-0.0106	0.0220	0.6313	--?++	76.2	12.601	3	0.005584
10 : 32625331 : SNP	t	c	0.0314	0.0000	0.0314	0.0314	-0.0420	0.0435	0.3339	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 79843765 : SNP	t	c	0.5934	0.0161	0.5817	0.6271	0.0181	0.0092	0.04906	+++++	0.0	0.600	4	0.963
2 : 82928618 : SNP	a	t	0.9348	0.0127	0.9057	0.9435	-0.0083	0.0180	0.6449	--?-+	0.0	1.996	3	0.5732
4 : 85626818 : SNP	a	g	0.5928	0.0156	0.5580	0.6091	0.0052	0.0086	0.541	+---+	38.2	6.468	4	0.1668
6 : 125418649 : SNP	a	t	0.0155	0.0000	0.0155	0.0155	0.0050	0.0627	0.9364	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 172448150 : INDEL	i	r	0.8136	0.0107	0.8044	0.8297	0.0012	0.0122	0.9219	+---+	25.5	5.372	4	0.2512
4 : 36799886 : SNP	t	g	0.1502	0.0070	0.1442	0.1692	0.0052	0.0120	0.6654	+--++	0.0	2.973	4	0.5624
22 : 17210318 : SNP	a	t	0.1976	0.0081	0.1931	0.2196	-0.0084	0.0158	0.5947	---+?	0.0	1.751	3	0.6256
10 : 128462459 : SNP	t	c	0.4272	0.0158	0.4177	0.4586	-0.0059	0.0109	0.5886	-+-++	32.2	5.902	4	0.2066
3 : 41055554 : SNP	t	g	0.4794	0.0112	0.4354	0.5003	0.0172	0.0085	0.04311	+--++	61.7	10.439	4	0.03365
8 : 131449913 : INDEL	d	r	0.0276	0.0000	0.0276	0.0276	0.0350	0.0394	0.3747	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 100472918 : SNP	a	t	0.4778	0.0137	0.4468	0.4893	-0.0010	0.0096	0.9171	--+-+	0.0	1.532	4	0.8209
19 : 49406680 : SNP	t	c	0.8899	0.0193	0.8757	0.9233	0.0226	0.0199	0.2576	+-?++	0.0	2.530	3	0.4698
19 : 23749225 : SNP	a	g	0.1728	0.0064	0.1569	0.1757	-0.0124	0.0114	0.2748	--++-	83.4	24.069	4	7.738e-05
3 : 70494304 : SNP	t	c	0.0502	0.0020	0.0465	0.0513	0.0126	0.0303	0.6763	+???-	0.0	0.153	1	0.6962
4 : 156223999 : SNP	t	g	0.9016	0.0059	0.8899	0.9151	0.0057	0.0144	0.6905	-++--	0.0	3.900	4	0.4197
17 : 71840971 : SNP	a	g	0.4236	0.0149	0.3911	0.4452	0.0097	0.0086	0.2596	+++--	27.8	5.537	4	0.2365
1 : 42729673 : SNP	a	g	0.7559	0.0074	0.7370	0.7846	0.0154	0.0100	0.1225	+--++	27.3	5.501	4	0.2397
4 : 36117251 : SNP	a	g	0.6504	0.0100	0.6398	0.6692	0.0004	0.0090	0.9642	0-+-+	0.0	2.187	4	0.7015
10 : 69914664 : SNP	t	c	0.5830	0.0218	0.5417	0.6092	-0.0059	0.0085	0.4873	-0--+	29.3	5.658	4	0.2262
7 : 141658065 : SNP	a	t	0.9766	0.0000	0.9766	0.9766	-0.0150	0.0414	0.7174	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 48327897 : SNP	a	g	0.0122	0.0000	0.0122	0.0122	-0.0720	0.0596	0.2273	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 76467984 : SNP	a	g	0.1436	0.0056	0.1316	0.1617	-0.0032	0.0121	0.7922	-+++-	43.8	7.115	4	0.1299
12 : 404455 : INDEL	d	r	0.1936	0.0131	0.1583	0.2049	-0.0126	0.0114	0.2652	+-+--	1.9	4.079	4	0.3954
5 : 54635826 : INDEL	i	r	0.0953	0.0038	0.0892	0.1089	0.0173	0.0146	0.2344	++-++	0.0	1.634	4	0.8026
6 : 104967428 : SNP	t	c	0.2755	0.0101	0.2539	0.2839	-0.0024	0.0096	0.8064	---++	60.8	10.197	4	0.03723
1 : 4904740 : SNP	c	g	0.9421	0.0045	0.9389	0.9524	0.0097	0.0197	0.6222	+-??-	66.7	6.012	2	0.04948
16 : 50289434 : SNP	t	c	0.1965	0.0091	0.1698	0.2023	-0.0163	0.0111	0.1442	--+--	0.0	0.982	4	0.9125
1 : 175335659 : SNP	t	c	0.0920	0.0022	0.0856	0.0952	-0.0201	0.0149	0.1767	--++-	0.0	2.230	4	0.6936
1 : 4522376 : SNP	a	g	0.3541	0.0064	0.3288	0.3582	-0.0228	0.0091	0.0126	-----	0.0	0.607	4	0.9623
3 : 1013132 : SNP	a	g	0.9168	0.0091	0.9060	0.9432	0.0094	0.0155	0.5472	-+-++	59.1	9.790	4	0.04411
12 : 118073489 : SNP	t	g	0.0796	0.0046	0.0750	0.0861	0.0032	0.0163	0.8422	-+?++	55.4	6.723	3	0.08128
5 : 86345039 : SNP	t	c	0.8608	0.0099	0.8315	0.8797	-0.0128	0.0122	0.2944	-++--	0.0	1.130	4	0.8895
14 : 29781178 : SNP	t	c	0.0532	0.0099	0.0392	0.0689	-0.0092	0.0209	0.6591	-+?-+	42.5	5.218	3	0.1565
14 : 77655487 : SNP	t	c	0.5319	0.0056	0.5293	0.5574	0.0042	0.0085	0.6234	+-+++	0.0	3.045	4	0.5503
8 : 101230523 : SNP	a	g	0.3940	0.0246	0.3557	0.4201	-0.0045	0.0090	0.6216	-+-++	27.1	5.485	4	0.2411
6 : 23281167 : SNP	t	c	0.8904	0.0144	0.8459	0.9014	-0.0354	0.0138	0.01024	-----	11.9	4.543	4	0.3375
12 : 32673756 : SNP	a	g	0.2470	0.0072	0.2361	0.2542	0.0029	0.0098	0.7638	++-+-	0.0	0.408	4	0.9818
7 : 143616177 : SNP	a	t	0.9376	0.0025	0.9355	0.9412	-0.0013	0.0179	0.9412	++?--	0.0	1.368	3	0.713
11 : 116077063 : SNP	t	c	0.9149	0.0093	0.9117	0.9496	-0.0031	0.0167	0.8532	-+??-	0.0	0.714	2	0.6999
12 : 124877186 : SNP	a	g	0.4247	0.0176	0.3680	0.4367	0.0094	0.0096	0.3264	+-+++	0.0	3.194	4	0.5259
11 : 23552342 : SNP	a	c	0.0141	0.0000	0.0141	0.0141	0.0330	0.0516	0.5221	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 145560876 : SNP	a	g	0.2882	0.0168	0.2528	0.3042	-0.0062	0.0093	0.5061	-++--	12.5	4.569	4	0.3344
12 : 76104325 : INDEL	d	r	0.0934	0.0074	0.0858	0.1042	0.0062	0.0146	0.6713	+---+	1.6	4.065	4	0.3973
3 : 120222610 : SNP	t	c	0.9707	0.0000	0.9707	0.9707	-0.0800	0.0404	0.04787	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 21222728 : SNP	a	g	0.0300	0.0083	0.0218	0.0383	0.0201	0.0309	0.516	++???	0.0	0.051	1	0.821
8 : 17202871 : SNP	a	g	0.9561	0.0122	0.9357	0.9654	-0.0000	0.0223	0.9985	+-?+-	32.7	4.460	3	0.2159
12 : 9127107 : INDEL	i	r	0.4376	0.0171	0.3870	0.4514	-0.0025	0.0089	0.7819	+-+--	0.0	1.788	4	0.7747
3 : 43053576 : SNP	a	g	0.4157	0.0114	0.3995	0.4387	0.0113	0.0087	0.1921	+-+++	0.0	2.567	4	0.6326
3 : 183084532 : SNP	c	g	0.1518	0.0251	0.1233	0.1936	-0.0260	0.0122	0.03227	--+--	23.1	5.203	4	0.2671
19 : 34354489 : SNP	a	c	0.0312	0.0064	0.0253	0.0382	-0.0156	0.0291	0.5915	-+???	32.4	1.480	1	0.2238
17 : 60841079 : SNP	a	c	0.5952	0.0163	0.5833	0.6313	0.0043	0.0091	0.6332	+---+	16.0	4.759	4	0.3129
7 : 155980986 : SNP	t	c	0.4557	0.0079	0.4269	0.4598	0.0053	0.0088	0.545	-++-+	0.0	1.934	4	0.7479
2 : 126693912 : INDEL	d	r	0.1648	0.0046	0.1439	0.1708	-0.0115	0.0118	0.3298	-+-+-	37.3	6.375	4	0.1729
5 : 2017255 : SNP	a	g	0.2824	0.0282	0.2633	0.3397	0.0039	0.0096	0.6836	+-+++	32.8	5.957	4	0.2024
8 : 6242915 : SNP	a	g	0.1126	0.0078	0.1049	0.1292	-0.0151	0.0146	0.2988	-----	0.0	0.320	4	0.9885
8 : 27671965 : SNP	t	c	0.9022	0.0101	0.8729	0.9080	0.0024	0.0147	0.8697	+-?-+	0.0	0.101	3	0.9917
4 : 100476060 : SNP	t	c	0.4759	0.0335	0.4443	0.5535	-0.0092	0.0085	0.2808	--+-+	49.9	7.977	4	0.09242
3 : 29446968 : INDEL	i	r	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	0.0180	0.0475	0.7048	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 24733124 : SNP	a	g	0.9714	0.0000	0.9714	0.9714	0.0284	0.0295	0.3351	+-???	30.4	1.438	1	0.2305
7 : 132433476 : INDEL	i	r	0.0430	0.0054	0.0384	0.0589	0.0009	0.0225	0.9678	-+?--	0.0	0.959	3	0.8111
9 : 72600133 : SNP	a	g	0.7185	0.0095	0.7055	0.7274	-0.0070	0.0095	0.4648	----+	0.0	2.330	4	0.6754
6 : 49345867 : SNP	a	c	0.1163	0.0072	0.1103	0.1381	0.0168	0.0136	0.2146	-+-++	0.0	3.020	4	0.5546
10 : 38419520 : SNP	t	c	0.4242	0.0046	0.4030	0.4253	0.0009	0.0092	0.9257	-+++?	0.0	1.577	3	0.6646
5 : 134109602 : SNP	a	g	0.8424	0.0126	0.8313	0.8742	0.0033	0.0119	0.7843	+++--	0.0	2.459	4	0.6521
8 : 140965237 : SNP	t	c	0.4785	0.0197	0.4303	0.4965	-0.0159	0.0085	0.06238	----+	10.0	4.445	4	0.3491
4 : 91405355 : INDEL	i	r	0.0729	0.0046	0.0605	0.0765	0.0016	0.0175	0.9292	+-?+-	0.0	2.503	3	0.4748
17 : 6355201 : INDEL	i	r	0.0397	0.0000	0.0397	0.0397	-0.0280	0.0344	0.4153	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 30302164 : SNP	a	g	0.8315	0.0221	0.8071	0.8821	0.0184	0.0114	0.1055	+++-+	0.0	1.291	4	0.8628
15 : 90875171 : INDEL	i	r	0.4748	0.0103	0.4525	0.4885	-0.0151	0.0087	0.08294	---+-	0.0	1.966	4	0.742
17 : 32910058 : SNP	a	g	0.0723	0.0048	0.0593	0.0814	0.0079	0.0171	0.6431	-+?+-	0.0	2.660	3	0.447
4 : 128485155 : SNP	a	c	0.9252	0.0082	0.9196	0.9478	0.0027	0.0171	0.8763	-+??-	0.0	1.850	2	0.3965
12 : 107409484 : SNP	a	g	0.0262	0.0000	0.0262	0.0262	-0.0200	0.0384	0.6026	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 6035291 : SNP	a	g	0.2512	0.0146	0.2394	0.2888	-0.0139	0.0099	0.1579	----+	0.0	3.934	4	0.415
2 : 109278547 : SNP	a	g	0.0166	0.0000	0.0166	0.0166	0.0390	0.0505	0.4403	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 69578606 : SNP	t	c	0.1265	0.0005	0.1256	0.1268	-0.0044	0.0303	0.8852	???+-	0.0	0.247	1	0.619
14 : 88935651 : SNP	a	g	0.7458	0.0193	0.7315	0.7867	-0.0032	0.0101	0.7488	-++--	0.0	2.384	4	0.6654
16 : 65355689 : INDEL	d	r	0.0194	0.0000	0.0194	0.0194	-0.0370	0.0627	0.5549	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 140250301 : SNP	t	c	0.9361	0.0012	0.9356	0.9391	-0.0125	0.0185	0.5012	-+??+	16.2	2.388	2	0.303
2 : 208471178 : SNP	t	c	0.8120	0.0086	0.7790	0.8180	0.0033	0.0110	0.7667	+-+++	45.1	7.282	4	0.1217
9 : 104034641 : SNP	t	c	0.6122	0.0074	0.6032	0.6352	-0.0095	0.0086	0.2667	--++-	0.0	3.649	4	0.4556
21 : 27835446 : SNP	a	c	0.5919	0.0053	0.5803	0.5951	0.0026	0.0085	0.7639	-+++-	0.0	0.855	4	0.9309
7 : 106456453 : SNP	t	g	0.0262	0.0000	0.0262	0.0262	0.0810	0.0556	0.1451	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 135540384 : SNP	t	c	0.4934	0.0123	0.4526	0.5254	-0.0121	0.0087	0.1626	---+-	0.0	0.914	4	0.9225
10 : 123363588 : SNP	a	g	0.9766	0.0000	0.9766	0.9766	-0.0500	0.0435	0.25	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 61083318 : SNP	a	g	0.0355	0.0023	0.0323	0.0372	-0.0101	0.0268	0.7077	-+???	63.7	2.754	1	0.09703
1 : 181917627 : SNP	t	c	0.0647	0.0059	0.0482	0.0682	-0.0001	0.0183	0.996	+-??-	0.0	0.606	2	0.7386
19 : 50828773 : INDEL	i	r	0.1094	0.0113	0.0888	0.1188	0.0008	0.0186	0.9662	-+?+-	40.8	5.071	3	0.1667
9 : 125532952 : INDEL	i	r	0.6598	0.0119	0.6501	0.6828	-0.0310	0.0283	0.2721	??-+-	0.0	1.900	2	0.3868
4 : 148379516 : SNP	a	g	0.7135	0.0077	0.7081	0.7432	0.0026	0.0093	0.7778	+---+	36.2	6.271	4	0.1798
12 : 44043499 : SNP	c	g	0.0836	0.0031	0.0806	0.0871	0.0056	0.0156	0.7178	+-?--	0.0	1.962	3	0.5804
1 : 113914419 : SNP	a	g	0.9019	0.0031	0.8995	0.9098	-0.0130	0.0143	0.3637	-+--+	0.0	1.918	4	0.7508
13 : 87055330 : SNP	a	g	0.0594	0.0045	0.0469	0.0612	-0.0077	0.0191	0.687	--??+	9.7	2.215	2	0.3304
18 : 45536694 : SNP	t	c	0.7739	0.0045	0.7637	0.7770	-0.0012	0.0100	0.9029	-++-+	14.2	4.660	4	0.3241
9 : 87182088 : SNP	a	g	0.9414	0.0062	0.9366	0.9514	0.0233	0.0188	0.2154	++?-+	60.4	7.571	3	0.05577
12 : 12124358 : SNP	t	c	0.3611	0.0084	0.3410	0.3728	0.0095	0.0091	0.2995	+-+++	0.0	3.513	4	0.4759
7 : 92919004 : SNP	t	c	0.0403	0.0035	0.0353	0.0428	-0.0267	0.0248	0.2823	--???	0.0	0.044	1	0.8345
7 : 68655016 : SNP	a	c	0.8277	0.0134	0.8180	0.8558	-0.0005	0.0117	0.9669	++---	43.7	7.107	4	0.1303
5 : 50654438 : SNP	a	g	0.7796	0.0092	0.7693	0.8052	0.0023	0.0110	0.8335	+--+?	0.0	1.833	3	0.6077
6 : 11899618 : SNP	a	g	0.9315	0.0044	0.9211	0.9359	-0.0050	0.0176	0.7781	-+?++	0.0	0.654	3	0.8839
14 : 48082709 : SNP	t	c	0.0373	0.0014	0.0362	0.0391	0.0267	0.0278	0.338	++???	0.0	0.060	1	0.8069
18 : 45374275 : SNP	t	c	0.4504	0.0121	0.4321	0.4865	-0.0033	0.0085	0.6977	---++	38.2	6.475	4	0.1664
8 : 127707114 : INDEL	d	r	0.2222	0.0122	0.2150	0.2480	-0.0101	0.0111	0.3606	--+-+	69.3	13.031	4	0.01112
3 : 58196639 : SNP	t	c	0.3257	0.0159	0.2914	0.3367	0.0007	0.0092	0.9367	++++-	0.0	2.300	4	0.6808
6 : 7508531 : SNP	t	c	0.6352	0.0046	0.6310	0.6415	0.0096	0.0091	0.289	++++-	0.0	2.546	4	0.6365
13 : 36404740 : SNP	a	t	0.7879	0.0030	0.7774	0.7967	-0.0140	0.0107	0.1914	+-++-	74.1	15.468	4	0.003822
11 : 111340577 : SNP	t	c	0.1256	0.0045	0.1191	0.1292	0.0006	0.0128	0.9625	-+-++	0.0	2.708	4	0.6078
2 : 107887581 : SNP	a	g	0.1533	0.0102	0.1278	0.1602	0.0132	0.0120	0.2745	+-+-+	9.1	4.399	4	0.3547
14 : 31800208 : SNP	t	c	0.5134	0.0056	0.5084	0.5254	0.0104	0.0089	0.2382	+++++	0.0	2.926	4	0.5702
13 : 78920011 : SNP	t	c	0.6533	0.0206	0.6200	0.6910	0.0084	0.0091	0.3574	+-+++	0.0	1.879	4	0.758
1 : 165362428 : SNP	a	g	0.0275	0.0000	0.0275	0.0275	-0.0320	0.0435	0.4616	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 19821573 : SNP	t	c	0.2653	0.0167	0.2343	0.2780	0.0063	0.0098	0.522	+++++	0.0	0.279	4	0.9911
8 : 68498215 : SNP	c	g	0.0362	0.0022	0.0332	0.0378	0.0052	0.0263	0.8435	-+???	43.9	1.781	1	0.182
3 : 157783965 : SNP	a	g	0.5301	0.0168	0.5148	0.5652	-0.0002	0.0086	0.9802	+++--	0.0	3.056	4	0.5486
18 : 60191428 : SNP	a	g	0.7656	0.0092	0.7441	0.7744	0.0131	0.0104	0.2075	-++-+	14.1	4.659	4	0.3241
3 : 126180705 : SNP	a	g	0.0434	0.0047	0.0392	0.0517	-0.0077	0.0229	0.7382	+-??-	0.0	0.936	2	0.6261
20 : 50475700 : SNP	c	g	0.6511	0.0215	0.6307	0.7052	-0.0160	0.0092	0.08187	--+++	2.2	4.092	4	0.3938
1 : 39324285 : SNP	a	g	0.0351	0.0000	0.0351	0.0351	0.0150	0.0354	0.6716	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 22352463 : SNP	t	c	0.9473	0.0062	0.9392	0.9574	-0.0247	0.0213	0.2455	-+?--	0.0	1.010	3	0.7988
3 : 17170585 : SNP	a	g	0.0729	0.0019	0.0716	0.0804	0.0118	0.0178	0.5067	++?--	0.0	2.165	3	0.5389
7 : 107721121 : SNP	a	g	0.5125	0.0090	0.4942	0.5222	-0.0074	0.0091	0.4153	+-+--	42.8	6.989	4	0.1365
2 : 40201657 : SNP	c	g	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	-0.0500	0.0556	0.3685	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 133577201 : SNP	a	g	0.9800	0.0000	0.9800	0.9800	-0.0910	0.0576	0.1143	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 63181009 : SNP	t	g	0.6015	0.0115	0.5913	0.6335	-0.0099	0.0087	0.2543	+----	37.7	6.425	4	0.1696
14 : 101843962 : SNP	a	g	0.8600	0.0052	0.8558	0.8760	-0.0050	0.0123	0.6823	----+	0.0	1.060	4	0.9005
1 : 101772965 : SNP	a	g	0.5157	0.0093	0.4824	0.5223	-0.0033	0.0089	0.7151	+----	0.3	4.011	4	0.4045
5 : 121258277 : SNP	t	c	0.2535	0.0121	0.2415	0.2842	-0.0124	0.0103	0.229	---++	0.0	1.035	4	0.9045
9 : 13879957 : SNP	t	g	0.1613	0.0140	0.1535	0.1923	0.0106	0.0117	0.366	+-+++	27.9	5.548	4	0.2355
2 : 42294595 : SNP	a	c	0.0571	0.0032	0.0533	0.0639	-0.0223	0.0192	0.2465	--?--	0.0	1.087	3	0.7802
2 : 86536468 : SNP	c	g	0.0379	0.0011	0.0367	0.0389	-0.0011	0.0231	0.9608	-+??-	57.4	4.697	2	0.09553
6 : 147368934 : SNP	t	c	0.0812	0.0091	0.0582	0.0912	-0.0044	0.0155	0.7778	+-+++	0.0	2.250	4	0.69
2 : 81751124 : SNP	a	c	0.1714	0.0125	0.1425	0.1784	0.0089	0.0114	0.4356	++-+-	0.0	2.813	4	0.5896
2 : 202754528 : SNP	t	c	0.5610	0.0122	0.5368	0.6002	0.0023	0.0087	0.791	++---	0.0	1.943	4	0.7463
9 : 85712057 : SNP	a	g	0.6254	0.0086	0.5934	0.6398	0.0029	0.0091	0.7497	+-+-+	0.0	3.648	4	0.4558
3 : 156707577 : SNP	t	c	0.0861	0.0052	0.0737	0.0899	-0.0150	0.0156	0.3363	--+?-	0.0	0.387	3	0.943
2 : 154814186 : SNP	a	g	0.9767	0.0000	0.9767	0.9767	0.0750	0.0465	0.1068	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 32505058 : SNP	t	c	0.4692	0.0133	0.4402	0.4804	-0.0024	0.0089	0.7838	-+---	0.0	1.057	4	0.901
2 : 171409100 : SNP	t	c	0.7652	0.0075	0.7558	0.7728	-0.0125	0.0103	0.226	--+--	0.0	0.939	4	0.9188
7 : 104363 : SNP	t	c	0.7896	0.0286	0.7440	0.8212	0.0005	0.0119	0.9673	++++-	0.0	1.398	4	0.8445
5 : 169486789 : SNP	t	c	0.0189	0.0000	0.0189	0.0189	0.0230	0.0475	0.6283	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 64102622 : SNP	t	g	0.9815	0.0000	0.9815	0.9815	-0.0540	0.0495	0.2756	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 129379037 : SNP	a	g	0.3673	0.0077	0.3558	0.3817	0.0045	0.0088	0.6114	+++--	66.2	11.851	4	0.01849
2 : 181371792 : SNP	a	g	0.1511	0.0091	0.1334	0.1618	-0.0016	0.0121	0.8954	+---+	16.7	4.803	4	0.3082
7 : 43539932 : SNP	t	c	0.2001	0.0156	0.1611	0.2123	-0.0145	0.0108	0.1789	-+---	59.0	9.764	4	0.0446
19 : 44406291 : SNP	t	c	0.4951	0.0097	0.4717	0.5062	-0.0163	0.0085	0.05536	---+-	0.0	1.197	4	0.8786
3 : 80130936 : SNP	a	g	0.9784	0.0000	0.9784	0.9784	-0.0130	0.0435	0.7649	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 51288209 : INDEL	d	r	0.0842	0.0114	0.0753	0.1139	-0.0025	0.0174	0.8879	+-?-+	52.0	6.246	3	0.1002
4 : 109927028 : SNP	c	g	0.2863	0.0197	0.2694	0.3219	0.0008	0.0105	0.9402	+-+-+	0.0	2.568	4	0.6325
7 : 7958915 : SNP	a	t	0.2559	0.0133	0.2461	0.2937	-0.0048	0.0105	0.6472	-+-++	27.7	5.532	4	0.237
3 : 7623331 : SNP	c	g	0.5682	0.0055	0.5588	0.5897	0.0031	0.0086	0.7198	-+-++	51.2	8.202	4	0.08446
4 : 12122858 : SNP	a	g	0.3636	0.0103	0.3440	0.3732	0.0084	0.0091	0.356	-+++-	53.7	8.641	4	0.07074
11 : 27057108 : SNP	a	g	0.0733	0.0069	0.0595	0.0809	-0.0086	0.0173	0.6179	+-?++	0.0	2.248	3	0.5226
1 : 210619089 : SNP	a	g	0.7773	0.0070	0.7640	0.7834	-0.0061	0.0103	0.5537	---++	0.0	0.551	4	0.9684
11 : 5881694 : SNP	t	c	0.4144	0.0273	0.3904	0.4564	-0.0005	0.0091	0.9567	+--++	0.0	1.037	4	0.9041
3 : 145238933 : SNP	t	c	0.4953	0.0088	0.4765	0.5044	0.0006	0.0085	0.9417	-++++	0.0	2.260	4	0.688
7 : 97772658 : SNP	t	c	0.2194	0.0182	0.1543	0.2294	-0.0055	0.0102	0.5895	-++--	0.0	1.736	4	0.7842
16 : 9781736 : SNP	c	g	0.9631	0.0026	0.9575	0.9644	0.0090	0.0242	0.7088	-+??+	0.0	0.461	2	0.7941
17 : 64284659 : SNP	c	g	0.1183	0.0037	0.1103	0.1208	0.0093	0.0131	0.4772	+++--	8.9	4.389	4	0.3559
9 : 118061922 : SNP	t	g	0.0851	0.0050	0.0785	0.0939	0.0087	0.0161	0.5869	-+?++	0.0	1.868	3	0.6001
7 : 130394857 : SNP	t	g	0.3330	0.0183	0.2902	0.3438	-0.0041	0.0090	0.6475	--+-+	0.0	1.732	4	0.7849
4 : 181367233 : SNP	t	c	0.7766	0.0083	0.7708	0.7963	0.0010	0.0101	0.9183	+--+-	46.6	7.485	4	0.1124
18 : 4682128 : SNP	t	c	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	0.0000	0.0526	1	0????	0.0	0.000	0	1
10 : 18262041 : SNP	a	c	0.8985	0.0138	0.8605	0.9155	0.0051	0.0148	0.7317	+-?+-	54.0	6.516	3	0.08904
15 : 90251929 : SNP	t	c	0.5422	0.0183	0.5205	0.5748	0.0106	0.0085	0.2113	++-++	0.0	0.848	4	0.9319
17 : 72643056 : SNP	a	g	0.3563	0.0109	0.3463	0.3853	-0.0018	0.0089	0.8441	-++++	0.0	2.160	4	0.7064
1 : 214186284 : SNP	a	g	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	-0.0070	0.0435	0.8721	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 19769975 : SNP	a	c	0.1111	0.0086	0.1007	0.1299	0.0069	0.0135	0.6102	++--+	0.0	1.408	4	0.8427
2 : 36321022 : SNP	t	c	0.1423	0.0116	0.1033	0.1544	0.0070	0.0125	0.5791	+-++-	53.2	8.549	4	0.07342
12 : 52613685 : SNP	t	c	0.2137	0.0103	0.1914	0.2460	0.0028	0.0105	0.792	++--+	0.0	2.034	4	0.7294
3 : 184926099 : SNP	c	g	0.2062	0.0063	0.1968	0.2116	-0.0030	0.0106	0.7785	+----	0.0	0.772	4	0.9422
4 : 143006535 : SNP	a	t	0.7469	0.0206	0.7054	0.7580	-0.0031	0.0097	0.7466	-++--	21.7	5.108	4	0.2764
3 : 37698312 : SNP	a	g	0.0258	0.0000	0.0258	0.0258	0.0820	0.0455	0.07145	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 138332611 : INDEL	d	r	0.0860	0.0087	0.0708	0.0914	-0.0231	0.0209	0.2683	-+?--	67.7	9.297	3	0.02559
7 : 141475161 : SNP	a	g	0.4127	0.0088	0.4081	0.4309	0.0120	0.0086	0.1632	+-+++	0.0	3.238	4	0.5189
2 : 39326835 : SNP	c	g	0.0695	0.0087	0.0632	0.0843	-0.0138	0.0174	0.426	-+?--	0.0	1.135	3	0.7685
4 : 91971560 : SNP	t	c	0.0937	0.0011	0.0895	0.0951	0.0520	0.0152	0.0006436	++?++	0.0	1.239	3	0.7437
1 : 68977159 : SNP	a	g	0.1662	0.0076	0.1526	0.1825	0.0119	0.0113	0.2907	++--+	30.6	5.766	4	0.2173
18 : 70956022 : SNP	c	g	0.0287	0.0104	0.0210	0.0427	0.0526	0.0340	0.1227	+???+	0.0	0.722	1	0.3954
5 : 58195308 : SNP	a	g	0.0653	0.0031	0.0578	0.0671	-0.0037	0.0182	0.8393	+-?-+	0.0	0.880	3	0.8303
8 : 122671687 : SNP	c	g	0.9302	0.0020	0.9245	0.9328	0.0033	0.0173	0.847	-+?--	55.9	6.798	3	0.07862
8 : 75173375 : SNP	a	g	0.2741	0.0161	0.2415	0.2877	-0.0056	0.0095	0.5545	---+-	0.0	0.571	4	0.9662
7 : 65484074 : SNP	a	t	0.1050	0.0192	0.0924	0.1369	-0.0070	0.0142	0.6221	00-+-	0.0	3.183	4	0.5276
4 : 171915011 : SNP	a	c	0.7039	0.0111	0.6755	0.7134	0.0009	0.0092	0.9193	+-+--	0.0	2.970	4	0.5629
2 : 13410092 : SNP	a	g	0.8880	0.0044	0.8836	0.9019	-0.0122	0.0136	0.3703	---+-	0.0	0.955	4	0.9165
11 : 118156414 : SNP	a	g	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	0.0670	0.0586	0.2531	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 23785356 : SNP	t	g	0.1182	0.0074	0.1101	0.1336	0.0220	0.0140	0.116	++++-	0.0	2.553	4	0.6352
18 : 28713843 : SNP	a	c	0.9363	0.0079	0.9199	0.9488	-0.0223	0.0205	0.2767	-+?++	34.0	4.548	3	0.2081
3 : 80084680 : SNP	t	c	0.1942	0.0081	0.1836	0.2033	0.0032	0.0108	0.7691	++++-	56.6	9.224	4	0.05575
4 : 97763558 : SNP	t	g	0.9141	0.0052	0.8973	0.9192	0.0004	0.0158	0.9807	+-+--	0.0	3.960	4	0.4115
2 : 190546300 : SNP	a	g	0.2638	0.0083	0.2510	0.2938	0.0056	0.0102	0.5874	+++-+	0.0	2.655	4	0.6171
8 : 2495859 : INDEL	d	r	0.0857	0.0091	0.0786	0.1125	0.0224	0.0156	0.1506	+-?++	0.0	1.921	3	0.5889
8 : 79263229 : SNP	t	c	0.8174	0.0117	0.8022	0.8342	0.0135	0.0120	0.2573	-++-+	20.5	5.034	4	0.2838
4 : 45084066 : SNP	c	g	0.2017	0.0098	0.1841	0.2245	-0.0048	0.0107	0.6546	-+++-	0.0	3.894	4	0.4205
5 : 17020636 : SNP	t	c	0.8263	0.0045	0.8190	0.8327	-0.0158	0.0126	0.2082	---++	42.8	6.988	4	0.1365
17 : 14154851 : SNP	a	g	0.5208	0.0083	0.4885	0.5334	0.0005	0.0085	0.9538	-++-+	0.0	3.676	4	0.4516
16 : 51700342 : SNP	a	c	0.9449	0.0064	0.9365	0.9548	0.0095	0.0211	0.6533	++??-	0.0	0.992	2	0.6091
2 : 1277084 : INDEL	d	r	0.1464	0.0148	0.1249	0.1692	-0.0022	0.0127	0.8647	+---+	30.5	5.756	4	0.2182
1 : 108906908 : SNP	t	c	0.0494	0.0071	0.0421	0.0625	0.0031	0.0221	0.8899	-+??+	0.0	1.960	2	0.3753
1 : 238525693 : SNP	a	c	0.6239	0.0170	0.6069	0.6833	0.0059	0.0092	0.5162	+++--	60.7	10.179	4	0.03752
3 : 118851977 : SNP	a	g	0.0535	0.0027	0.0512	0.0567	0.0121	0.0218	0.5783	+-???	0.0	0.590	1	0.4424
4 : 134297088 : SNP	a	c	0.0471	0.0026	0.0405	0.0488	0.0044	0.0215	0.8361	++??-	0.0	0.426	2	0.8082
1 : 162847718 : SNP	a	g	0.8554	0.0074	0.8401	0.8733	0.0081	0.0120	0.502	+-++-	54.8	8.847	4	0.06503
1 : 9021053 : SNP	a	g	0.7780	0.0157	0.7650	0.8123	0.0164	0.0103	0.109	+++++	0.0	3.060	4	0.5478
3 : 34183463 : SNP	t	c	0.0211	0.0000	0.0211	0.0211	0.0650	0.0556	0.2424	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 150808836 : SNP	t	c	0.1488	0.0077	0.1447	0.1657	0.0160	0.0120	0.1812	+-+-+	0.0	1.902	4	0.7537
6 : 119465587 : SNP	a	c	0.9017	0.0077	0.8808	0.9063	0.0014	0.0149	0.9272	-+-++	0.0	1.959	4	0.7434
13 : 88357815 : SNP	a	t	0.6605	0.0028	0.6483	0.6622	0.0118	0.0093	0.2058	-++-+	9.8	4.436	4	0.3502
7 : 108341233 : SNP	a	g	0.0797	0.0023	0.0779	0.0876	0.0078	0.0159	0.624	+--+-	0.0	1.907	4	0.7528
12 : 51966668 : SNP	t	c	0.8768	0.0045	0.8689	0.8808	-0.0020	0.0129	0.8781	+---+	0.0	2.919	4	0.5715
17 : 74257847 : SNP	a	g	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	-0.0020	0.0495	0.9678	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 7030306 : SNP	t	c	0.2277	0.0121	0.2110	0.2482	-0.1033	0.0335	0.002041	??---	0.0	0.805	2	0.6685
5 : 25933389 : SNP	t	c	0.8772	0.0148	0.8663	0.9144	0.0019	0.0131	0.8873	-+++-	6.9	4.298	4	0.3672
6 : 162015091 : SNP	a	g	0.6213	0.0103	0.6141	0.6428	-0.0060	0.0091	0.5129	--+--	0.0	3.217	4	0.5222
1 : 244232305 : SNP	t	c	0.8746	0.0180	0.8558	0.8952	-0.0006	0.0150	0.9666	+-++-	0.0	3.707	4	0.447
6 : 79443529 : SNP	t	c	0.0163	0.0000	0.0163	0.0163	0.0140	0.0526	0.79	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 16466204 : INDEL	i	r	0.2375	0.0070	0.2101	0.2418	-0.0111	0.0099	0.2655	-+---	0.0	1.450	4	0.8354
3 : 42220472 : SNP	t	c	0.7991	0.0174	0.7854	0.8416	-0.0029	0.0108	0.7896	-+--+	22.6	5.165	4	0.2708
22 : 33814687 : INDEL	d	r	0.0812	0.0057	0.0678	0.0851	0.0314	0.0167	0.05981	++??+	0.0	1.588	2	0.452
11 : 21947253 : SNP	a	g	0.9780	0.0000	0.9780	0.9780	-0.0080	0.0425	0.8505	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 72114723 : SNP	c	g	0.0152	0.0000	0.0152	0.0152	-0.0190	0.0526	0.7178	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 25557017 : SNP	c	g	0.9537	0.0051	0.9501	0.9608	0.0379	0.0239	0.1119	++???	0.0	0.127	1	0.7211
16 : 6363324 : SNP	a	g	0.3894	0.0271	0.3690	0.4427	0.0037	0.0090	0.6773	-++-+	0.0	0.565	4	0.9669
7 : 66876404 : SNP	a	g	0.1072	0.0066	0.0989	0.1193	0.0010	0.0140	0.9435	+-++-	0.0	3.012	4	0.5558
4 : 15082485 : SNP	t	c	0.0287	0.0009	0.0280	0.0299	0.0219	0.0293	0.4536	++???	0.0	0.007	1	0.9337
4 : 37089631 : SNP	a	t	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	-0.0010	0.0455	0.9825	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 43095462 : SNP	t	c	0.9858	0.0000	0.9858	0.9858	0.0370	0.0536	0.4898	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 80941867 : INDEL	d	r	0.0334	0.0061	0.0268	0.0434	-0.0237	0.0300	0.4296	--??-	0.0	1.009	2	0.6039
9 : 9845480 : SNP	a	g	0.0439	0.0000	0.0439	0.0439	0.0400	0.0364	0.2717	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 24417017 : SNP	a	g	0.1069	0.0076	0.0933	0.1170	0.0178	0.0154	0.2457	-+-++	70.1	13.385	4	0.009541
4 : 90929621 : SNP	a	g	0.3882	0.0204	0.3466	0.4108	-0.0088	0.0086	0.3069	----+	0.0	0.879	4	0.9276
3 : 197169372 : SNP	a	c	0.9830	0.0000	0.9830	0.9830	-0.0710	0.0546	0.1934	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 161008736 : SNP	a	t	0.9182	0.0128	0.8946	0.9348	-0.0077	0.0173	0.6546	--?-+	17.8	3.651	3	0.3017
10 : 27508758 : SNP	t	c	0.4789	0.0183	0.4645	0.5226	0.0065	0.0086	0.4451	+-+++	0.0	3.896	4	0.4202
4 : 17373377 : SNP	t	c	0.0572	0.0059	0.0491	0.0615	0.0379	0.0253	0.1342	++???	6.3	1.067	1	0.3015
8 : 121796228 : SNP	t	g	0.3267	0.0098	0.3190	0.3475	-0.0090	0.0093	0.3323	-----	0.0	0.683	4	0.9534
2 : 166925277 : INDEL	d	r	0.1946	0.0160	0.1581	0.2057	0.0002	0.0108	0.9864	+-++-	0.0	1.750	4	0.7815
6 : 77614282 : SNP	t	c	0.3724	0.0203	0.3266	0.3977	0.0138	0.0092	0.1329	++++-	14.9	4.698	4	0.3197
2 : 2789945 : SNP	a	g	0.0641	0.0059	0.0478	0.0693	-0.0170	0.0188	0.3656	--??-	13.3	2.308	2	0.3154
6 : 114581745 : SNP	a	g	0.3447	0.0084	0.3257	0.3699	0.0010	0.0090	0.9091	-+-++	0.0	2.253	4	0.6893
3 : 15127643 : SNP	a	g	0.3137	0.0192	0.2952	0.3643	-0.0068	0.0091	0.455	+--++	27.0	5.478	4	0.2417
16 : 76150928 : SNP	a	g	0.7855	0.0060	0.7746	0.7977	-0.0021	0.0104	0.8374	---++	7.9	4.344	4	0.3615
17 : 55475978 : SNP	t	c	0.1313	0.0091	0.1225	0.1604	-0.0231	0.0128	0.07134	--++-	4.1	4.170	4	0.3834
4 : 54575056 : SNP	t	c	0.0665	0.0027	0.0543	0.0689	0.0153	0.0174	0.38	+-?--	41.2	5.100	3	0.1646
7 : 146732634 : SNP	t	c	0.9539	0.0030	0.9512	0.9612	0.0011	0.0222	0.9587	0-??+	0.0	0.110	2	0.9463
13 : 66726226 : SNP	t	c	0.8179	0.0045	0.8102	0.8281	0.0225	0.0119	0.05851	+++-+	0.0	1.127	4	0.8899
5 : 2065946 : SNP	t	c	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	0.0390	0.0475	0.4117	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 26594318 : INDEL	d	r	0.1391	0.0118	0.1212	0.1558	0.0067	0.0140	0.6345	-++++	0.0	2.033	4	0.7297
7 : 146673884 : SNP	a	g	0.6019	0.0079	0.5886	0.6082	0.0008	0.0085	0.9284	-+-+-	0.0	1.551	4	0.8176
14 : 84515691 : SNP	t	c	0.4389	0.0189	0.4057	0.4894	-0.0032	0.0086	0.71	-+---	0.0	1.385	4	0.8467
8 : 15169007 : SNP	a	g	0.8516	0.0112	0.8277	0.8602	0.0139	0.0119	0.2448	+0--+	58.6	9.651	4	0.04673
2 : 209873544 : SNP	t	c	0.9777	0.0000	0.9777	0.9777	0.0050	0.0505	0.9212	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 59496860 : SNP	a	t	0.0560	0.0079	0.0444	0.0692	0.0007	0.0201	0.9735	+-?--	0.0	2.736	3	0.4341
4 : 12843182 : SNP	c	g	0.8167	0.0121	0.8000	0.8374	0.0195	0.0115	0.09168	++-++	0.0	0.580	4	0.9653
4 : 76330828 : SNP	a	g	0.0719	0.0087	0.0524	0.0809	-0.0282	0.0194	0.1463	+-??-	37.5	3.200	2	0.2019
3 : 173001387 : SNP	t	g	0.7627	0.0177	0.7335	0.8099	0.0288	0.0101	0.004321	+++++	0.0	1.088	4	0.8961
12 : 40690944 : SNP	a	g	0.0692	0.0063	0.0672	0.0948	-0.0218	0.0169	0.1971	--++-	0.0	1.518	4	0.8235
4 : 2546805 : SNP	t	c	0.0466	0.0035	0.0441	0.0516	-0.0170	0.0379	0.6539	-???+	0.0	0.138	1	0.7104
4 : 59657387 : SNP	t	c	0.0353	0.0033	0.0325	0.0392	-0.0196	0.0263	0.4579	-+???	0.0	0.944	1	0.3313
14 : 62422223 : SNP	a	g	0.9661	0.0007	0.9656	0.9670	0.0142	0.0273	0.6035	++???	0.0	0.001	1	0.9714
2 : 32733646 : SNP	a	g	0.9817	0.0000	0.9817	0.9817	-0.0180	0.0516	0.727	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 78022017 : SNP	t	c	0.6598	0.0178	0.6249	0.6777	-0.0071	0.0091	0.4336	-+---	0.0	3.358	4	0.4997
17 : 50923559 : SNP	t	c	0.8792	0.0025	0.8723	0.8868	-0.0143	0.0133	0.2826	---++	40.7	6.747	4	0.1499
7 : 90472294 : SNP	a	g	0.3240	0.0089	0.3083	0.3339	-0.0100	0.0092	0.2806	-++--	0.0	2.457	4	0.6524
10 : 64797643 : INDEL	i	r	0.0786	0.0070	0.0701	0.0850	-0.0287	0.0178	0.1069	--?-+	0.0	2.297	3	0.5131
15 : 57600102 : SNP	t	c	0.5099	0.0217	0.4697	0.5346	0.0078	0.0085	0.3588	++-++	0.0	0.685	4	0.9532
21 : 30154862 : SNP	t	c	0.9636	0.0040	0.9573	0.9693	-0.0183	0.0239	0.4449	--??+	37.4	3.195	2	0.2024
13 : 51286083 : SNP	t	c	0.0920	0.0068	0.0782	0.0977	0.0102	0.0150	0.497	-+-++	0.0	1.524	4	0.8224
10 : 11766783 : SNP	a	g	0.9501	0.0033	0.9479	0.9570	0.0161	0.0271	0.5519	++??-	0.0	1.113	2	0.5733
16 : 64937662 : SNP	a	c	0.9740	0.0000	0.9740	0.9740	0.0320	0.0404	0.4287	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 46421641 : SNP	t	c	0.5074	0.0122	0.4762	0.5184	-0.0103	0.0085	0.2245	--+-+	33.1	5.979	4	0.2007
1 : 228911862 : SNP	a	c	0.0800	0.0182	0.0627	0.1163	0.0000	0.0183	0.9988	++?+-	20.1	3.755	3	0.2892
5 : 19583251 : SNP	a	g	0.9142	0.0072	0.8899	0.9203	0.0110	0.0156	0.4788	++?--	0.0	1.401	3	0.7054
11 : 123384038 : SNP	t	g	0.1129	0.0109	0.0835	0.1251	0.0113	0.0167	0.4992	-++-?	0.0	2.927	3	0.4029
11 : 23033211 : SNP	a	t	0.7866	0.0208	0.7447	0.8092	-0.0269	0.0111	0.01514	----+	7.0	4.302	4	0.3667
2 : 167976692 : SNP	a	g	0.0861	0.0042	0.0837	0.1000	0.0220	0.0153	0.1513	+--++	22.4	5.152	4	0.272
4 : 11535802 : SNP	t	g	0.8122	0.0154	0.7813	0.8332	0.0056	0.0113	0.621	+++-+	57.1	9.319	4	0.05359
1 : 118690614 : SNP	t	g	0.0564	0.0091	0.0424	0.0640	-0.0174	0.0216	0.4207	+-??-	0.0	1.240	2	0.538
14 : 96616571 : SNP	a	g	0.7583	0.0083	0.7528	0.7783	0.0046	0.0100	0.6489	+--+-	0.0	2.840	4	0.585
6 : 25651602 : SNP	c	g	0.1452	0.0086	0.1389	0.1729	-0.0083	0.0122	0.4988	--+--	6.4	4.274	4	0.3702
3 : 140726592 : SNP	t	c	0.8825	0.0095	0.8642	0.8888	-0.0089	0.0136	0.5151	++---	31.5	5.843	4	0.2112
12 : 103243355 : SNP	t	c	0.5627	0.0030	0.5599	0.5677	-0.0060	0.0085	0.4857	----+	0.0	2.381	4	0.6661
3 : 21804864 : SNP	a	g	0.2167	0.0175	0.1759	0.2328	0.0049	0.0105	0.6406	0+++-	31.0	5.797	4	0.2148
9 : 1513074 : SNP	t	c	0.2110	0.0099	0.1851	0.2174	-0.0081	0.0104	0.4386	---++	0.0	1.103	4	0.8938
14 : 57424661 : SNP	a	g	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	-0.0570	0.0617	0.3553	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 5271022 : SNP	a	g	0.9643	0.0014	0.9624	0.9661	0.0295	0.0240	0.218	++??+	0.0	0.886	2	0.6421
11 : 78737856 : SNP	t	c	0.2504	0.0122	0.2127	0.2608	0.0234	0.0100	0.01983	+++++	0.0	1.307	4	0.8601
2 : 231296697 : SNP	t	g	0.2938	0.0085	0.2814	0.3155	0.0009	0.0094	0.9246	-+--+	0.0	2.747	4	0.601
11 : 44485604 : SNP	t	c	0.1509	0.0127	0.1378	0.1743	0.0018	0.0122	0.8795	--+++	0.0	0.981	4	0.9127
16 : 16063723 : SNP	c	g	0.6952	0.0040	0.6905	0.7064	-0.0057	0.0096	0.5481	-+++-	56.6	9.212	4	0.05602
3 : 164439867 : SNP	t	c	0.2917	0.0053	0.2797	0.2975	-0.0129	0.0092	0.1599	--+--	0.0	2.074	4	0.7222
4 : 60628592 : INDEL	d	r	0.0825	0.0035	0.0781	0.0929	0.0208	0.0160	0.1928	++?+-	57.6	7.082	3	0.06932
4 : 155487221 : SNP	c	g	0.2036	0.0071	0.1970	0.2205	0.0099	0.0104	0.339	+++--	0.0	3.519	4	0.475
22 : 28686621 : SNP	c	g	0.9699	0.0025	0.9682	0.9735	0.0131	0.0283	0.6434	++???	0.0	0.022	1	0.8821
5 : 39679403 : SNP	c	g	0.0504	0.0033	0.0429	0.0539	0.0208	0.0209	0.3185	-+??+	21.9	2.562	2	0.2778
14 : 61903223 : SNP	t	c	0.0929	0.0099	0.0683	0.1008	-0.0219	0.0158	0.1661	+-?--	37.4	4.790	3	0.1878
1 : 227103985 : SNP	a	t	0.7035	0.0077	0.6951	0.7244	0.0097	0.0094	0.3029	+++++	0.0	2.154	4	0.7075
16 : 14445933 : SNP	t	c	0.8740	0.0122	0.8511	0.8834	0.0030	0.0168	0.8598	+-+-+	0.0	1.005	4	0.909
20 : 31616793 : SNP	a	t	0.5408	0.0166	0.4992	0.5559	0.0031	0.0085	0.7189	-+-++	0.0	2.004	4	0.7351
18 : 20264143 : SNP	a	g	0.0119	0.0000	0.0119	0.0119	-0.0500	0.0546	0.3597	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 180042344 : SNP	t	c	0.0236	0.0000	0.0236	0.0236	-0.1060	0.0596	0.07552	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 99909958 : SNP	a	g	0.7654	0.0106	0.7383	0.7735	-0.0182	0.0099	0.0671	---+-	0.0	2.503	4	0.644
17 : 47318565 : SNP	t	c	0.7760	0.0117	0.7636	0.8116	-0.0073	0.0113	0.5167	-++--	0.0	2.991	4	0.5594
2 : 194678283 : SNP	c	g	0.2744	0.0093	0.2693	0.3046	0.0246	0.0097	0.01163	++-++	0.0	2.282	4	0.684
5 : 108831951 : SNP	a	c	0.2296	0.0041	0.2256	0.2418	-0.0012	0.0100	0.9068	+----	60.9	10.237	4	0.03662
13 : 75203217 : SNP	a	g	0.3740	0.0139	0.3583	0.4009	0.0179	0.0091	0.04833	++-+-	0.0	2.726	4	0.6046
19 : 4857778 : SNP	a	g	0.0824	0.0038	0.0756	0.0869	-0.0396	0.0219	0.07055	--?+-	0.0	2.484	3	0.4781
6 : 75814620 : SNP	a	g	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	0.0150	0.0536	0.7795	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 21727788 : SNP	t	c	0.4301	0.0129	0.3953	0.4449	0.0059	0.0086	0.494	++---	7.1	4.304	4	0.3665
4 : 166325280 : SNP	c	g	0.9835	0.0000	0.9835	0.9835	0.0180	0.0485	0.7107	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 15278854 : SNP	a	g	0.1187	0.0102	0.0945	0.1323	0.0106	0.0144	0.4612	+-?++	0.0	2.533	3	0.4694
8 : 32605797 : SNP	c	g	0.0436	0.0062	0.0380	0.0603	-0.0149	0.0218	0.495	--?-+	31.2	4.358	3	0.2253
4 : 184622304 : SNP	t	c	0.9821	0.0000	0.9821	0.9821	-0.0400	0.0465	0.3897	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 97778365 : SNP	t	g	0.0472	0.0010	0.0459	0.0480	-0.0358	0.0254	0.1589	--???	0.0	0.044	1	0.8333
10 : 127817846 : SNP	a	g	0.4110	0.0034	0.4017	0.4152	0.0168	0.0086	0.04998	+++-+	0.0	3.457	4	0.4844
18 : 56494822 : SNP	a	g	0.0737	0.0038	0.0677	0.0767	-0.0029	0.0188	0.876	--?+-	0.0	0.624	3	0.8908
9 : 28937505 : SNP	a	g	0.2253	0.0055	0.2064	0.2309	0.0056	0.0100	0.5729	+-++-	38.7	6.528	4	0.163
2 : 159594889 : INDEL	d	r	0.6056	0.0240	0.5933	0.6754	0.0006	0.0086	0.9489	-+---	32.5	5.929	4	0.2045
4 : 26528320 : SNP	a	g	0.2476	0.0176	0.2269	0.2693	0.0064	0.0129	0.6165	+-+-+	0.0	3.489	4	0.4795
4 : 105376726 : SNP	t	c	0.0170	0.0000	0.0170	0.0170	0.0080	0.0455	0.8604	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 103096165 : SNP	a	g	0.1886	0.0117	0.1588	0.1986	0.0030	0.0108	0.7849	++++-	42.0	6.898	4	0.1414
4 : 95892324 : SNP	a	g	0.8914	0.0062	0.8849	0.9130	0.0037	0.0146	0.8015	+-+++	0.0	1.571	4	0.8141
2 : 142986944 : SNP	a	t	0.0280	0.0011	0.0272	0.0295	-0.0081	0.0297	0.7843	-+???	0.0	0.767	1	0.3813
5 : 105726339 : SNP	t	c	0.4313	0.0137	0.3991	0.4401	-0.0032	0.0085	0.7092	-++--	0.0	3.503	4	0.4774
13 : 70582180 : SNP	t	c	0.1075	0.0057	0.0940	0.1163	-0.0179	0.0138	0.1946	--+-+	0.0	2.513	4	0.6423
5 : 160561821 : SNP	t	c	0.8025	0.0175	0.7717	0.8186	-0.0131	0.0109	0.2298	+--+-	49.7	7.947	4	0.09355
7 : 12691132 : SNP	c	g	0.8768	0.0193	0.8535	0.9064	-0.0160	0.0185	0.3868	+-+--	3.0	4.123	4	0.3897
14 : 88171203 : SNP	a	t	0.9590	0.0086	0.9442	0.9701	-0.0144	0.0230	0.5324	-+?--	0.0	0.557	3	0.9061
17 : 39964032 : SNP	a	g	0.0903	0.0114	0.0626	0.1019	-0.0008	0.0153	0.9582	-+--+	0.0	2.336	4	0.6741
2 : 223410344 : SNP	a	g	0.9221	0.0054	0.9103	0.9253	0.0051	0.0163	0.7563	++?--	0.0	2.644	3	0.4498
12 : 58433859 : SNP	t	c	0.2844	0.0197	0.2282	0.2987	-0.0030	0.0093	0.743	-+-+-	0.0	2.390	4	0.6645
18 : 10687102 : SNP	t	g	0.5247	0.0160	0.4918	0.5369	0.0119	0.0085	0.1639	++++-	0.0	2.189	4	0.701
6 : 16569183 : SNP	a	c	0.4189	0.0061	0.3996	0.4271	0.0041	0.0089	0.6466	+--++	16.2	4.775	4	0.3111
3 : 6993642 : SNP	c	g	0.9569	0.0043	0.9484	0.9609	-0.0021	0.0224	0.9238	++??-	51.2	4.100	2	0.1288
5 : 179408174 : INDEL	i	r	0.2108	0.0099	0.2015	0.2233	0.0022	0.0104	0.8324	--+++	0.0	3.456	4	0.4846
3 : 178772745 : SNP	a	c	0.4290	0.0250	0.3603	0.4479	0.0077	0.0089	0.388	++--+	0.0	3.699	4	0.4483
11 : 47961566 : SNP	c	g	0.1956	0.0157	0.1610	0.2092	0.0064	0.0112	0.5645	+-+-+	15.2	4.715	4	0.3178
11 : 80620927 : SNP	a	g	0.6813	0.0164	0.6697	0.7284	0.0001	0.0092	0.9879	-++--	0.0	3.754	4	0.4404
2 : 159058760 : SNP	t	c	0.0623	0.0058	0.0504	0.0715	-0.0303	0.0182	0.09576	-0?--	0.0	1.107	3	0.7754
5 : 112864239 : SNP	a	c	0.2095	0.0130	0.1719	0.2389	0.0106	0.0105	0.313	++-+-	31.3	5.818	4	0.2131
9 : 96265558 : SNP	t	c	0.0142	0.0000	0.0142	0.0142	-0.0750	0.0546	0.1695	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 29765291 : SNP	a	g	0.7330	0.0170	0.7155	0.7495	-0.0159	0.0333	0.6333	??+-?	49.1	1.965	1	0.161
7 : 116557939 : SNP	t	c	0.2386	0.0112	0.2027	0.2591	-0.0054	0.0100	0.5904	--+++	0.0	0.707	4	0.9505
12 : 113545610 : SNP	t	c	0.1524	0.0127	0.1304	0.1652	-0.0172	0.0117	0.143	-----	0.0	0.417	4	0.9811
2 : 34913437 : INDEL	i	r	0.8978	0.0056	0.8894	0.9104	0.0177	0.0145	0.2214	+-+++	36.1	6.263	4	0.1803
1 : 5426587 : SNP	t	c	0.6445	0.0142	0.6256	0.6581	-0.0025	0.0098	0.7969	-+--+	0.0	0.743	4	0.9459
8 : 41316609 : SNP	a	g	0.8711	0.0217	0.8333	0.8922	0.0025	0.0129	0.8451	++--+	33.0	5.972	4	0.2012
1 : 31184763 : SNP	a	g	0.4658	0.0139	0.4411	0.4784	-0.0011	0.0085	0.9006	-+++-	0.0	2.101	4	0.7172
10 : 90627569 : INDEL	d	r	0.0773	0.0106	0.0700	0.0941	-0.0252	0.0249	0.311	-??-+	0.0	0.819	2	0.664
6 : 32535422 : SNP	t	c	0.6739	0.0393	0.6529	0.7740	0.0125	0.0236	0.5957	??+++	0.0	0.744	2	0.6893
5 : 180501193 : SNP	t	g	0.7983	0.0065	0.7862	0.8037	-0.0040	0.0233	0.8631	??+--	59.3	4.908	2	0.08595
6 : 119427429 : SNP	t	c	0.3867	0.0179	0.3685	0.4136	-0.0043	0.0098	0.6617	-+---	0.0	0.494	4	0.9741
7 : 46010714 : SNP	t	c	0.2672	0.0197	0.2232	0.2862	-0.0010	0.0099	0.9231	++--+	38.0	6.457	4	0.1675
14 : 27771418 : SNP	t	c	0.7118	0.0088	0.6994	0.7257	-0.0015	0.0092	0.8697	+-+-+	0.0	2.058	4	0.7252
9 : 3303876 : SNP	t	c	0.1153	0.0082	0.1095	0.1379	-0.0012	0.0132	0.9293	-++--	0.0	0.538	4	0.9697
15 : 98550547 : SNP	t	c	0.5913	0.0290	0.5401	0.6155	-0.0155	0.0105	0.1397	-++--	44.4	7.193	4	0.126
7 : 6962461 : SNP	a	g	0.2062	0.0041	0.2034	0.2154	-0.0123	0.0253	0.6275	??++-	0.0	0.244	2	0.885
6 : 130456162 : INDEL	d	r	0.0480	0.0010	0.0471	0.0498	-0.0126	0.0211	0.5507	--??+	51.9	4.159	2	0.125
4 : 23572850 : SNP	a	t	0.9588	0.0084	0.9429	0.9645	-0.0022	0.0227	0.9239	-+??-	0.0	1.621	2	0.4446
1 : 1935509 : SNP	t	c	0.8576	0.0050	0.8492	0.8606	-0.0578	0.0311	0.06358	???--	0.2	1.002	1	0.3169
1 : 233035762 : SNP	t	g	0.0763	0.0067	0.0600	0.0813	-0.0156	0.0168	0.356	-+?++	0.0	2.579	3	0.4612
2 : 120221321 : SNP	a	t	0.3059	0.0112	0.2919	0.3272	0.0050	0.0092	0.5857	-++-+	0.0	3.133	4	0.5358
5 : 84688524 : SNP	c	g	0.0285	0.0043	0.0245	0.0332	0.0322	0.0298	0.2801	+-???	62.8	2.687	1	0.1012
18 : 6674194 : SNP	a	g	0.6407	0.0179	0.6155	0.6679	0.0047	0.0101	0.6451	-+---	54.2	8.742	4	0.06787
12 : 104925469 : SNP	t	c	0.0905	0.0074	0.0831	0.1028	-0.0031	0.0171	0.8546	-+?++	62.7	8.045	3	0.0451
10 : 15052583 : INDEL	i	r	0.2695	0.0163	0.2380	0.2822	0.0024	0.0115	0.8351	+---+	36.5	6.297	4	0.178
10 : 64839647 : SNP	a	c	0.8892	0.0050	0.8830	0.8965	0.0104	0.0150	0.4908	++?++	0.0	0.646	3	0.8857
18 : 71015858 : SNP	a	g	0.9856	0.0000	0.9856	0.9856	-0.0290	0.0505	0.5661	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 31294964 : SNP	t	c	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	-0.0170	0.0526	0.7464	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 43713442 : SNP	a	g	0.0130	0.0000	0.0130	0.0130	-0.0450	0.0617	0.4655	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 130387174 : SNP	t	c	0.1860	0.0196	0.1234	0.1956	-0.0031	0.0109	0.7778	-+-++	1.9	4.078	4	0.3956
16 : 80554802 : SNP	t	c	0.9659	0.0009	0.9648	0.9666	-0.0221	0.0285	0.4387	-0???	0.0	0.433	1	0.5107
12 : 25085730 : SNP	c	g	0.9138	0.0062	0.9093	0.9238	-0.0024	0.0155	0.8749	+-?-+	0.0	0.178	3	0.9811
10 : 18672145 : SNP	t	g	0.8639	0.0052	0.8509	0.8678	-0.0253	0.0126	0.04372	---+-	69.1	12.932	4	0.01161
2 : 144465886 : SNP	t	c	0.9763	0.0025	0.9733	0.9784	-0.0053	0.0317	0.8682	+-???	0.0	0.963	1	0.3265
8 : 97699518 : SNP	a	g	0.7587	0.0058	0.7558	0.7804	-0.0041	0.0100	0.6801	+----	0.0	2.106	4	0.7162
6 : 10894268 : SNP	a	g	0.5606	0.0068	0.5555	0.5927	-0.0073	0.0086	0.3972	--+-+	0.0	0.947	4	0.9177
5 : 116575407 : SNP	t	c	0.9454	0.0144	0.9042	0.9551	-0.0545	0.0196	0.005535	--?--	0.0	0.659	3	0.8827
11 : 64927391 : SNP	t	g	0.2317	0.0059	0.2016	0.2340	0.0036	0.0101	0.719	0++--	0.0	0.611	4	0.9618
14 : 94776994 : SNP	a	g	0.0851	0.0104	0.0723	0.0944	0.0190	0.0158	0.2295	++?+0	0.0	2.465	3	0.4817
2 : 51536155 : SNP	a	g	0.7416	0.0072	0.7322	0.7591	-0.0040	0.0098	0.6808	--+-+	0.0	0.697	4	0.9517
15 : 70139250 : SNP	a	g	0.6864	0.0075	0.6690	0.6935	-0.0032	0.0092	0.7278	---++	27.9	5.551	4	0.2353
6 : 68046210 : SNP	a	g	0.6478	0.0104	0.6196	0.6681	0.0076	0.0091	0.4046	++--+	0.0	0.895	4	0.9253
2 : 137835092 : SNP	c	g	0.9525	0.0033	0.9406	0.9551	0.0131	0.0216	0.5445	-+?++	0.0	1.355	3	0.7161
1 : 171755597 : SNP	a	g	0.5468	0.0039	0.5356	0.5559	-0.0045	0.0085	0.5949	-++--	53.3	8.559	4	0.07313
8 : 6260753 : SNP	t	g	0.2144	0.0099	0.2076	0.2389	-0.0176	0.0115	0.1272	-----	0.0	2.659	4	0.6165
1 : 34716130 : SNP	t	c	0.1986	0.0082	0.1700	0.2072	0.0004	0.0107	0.9723	0++--	10.7	4.479	4	0.3451
4 : 36863543 : SNP	a	g	0.8475	0.0067	0.8257	0.8544	-0.0003	0.0120	0.9796	-++--	0.0	1.854	4	0.7626
2 : 126900241 : INDEL	d	r	0.0974	0.0028	0.0940	0.1019	-0.0028	0.0155	0.8568	++--+	46.4	7.461	4	0.1135
3 : 20321872 : INDEL	i	r	0.0299	0.0015	0.0286	0.0316	0.0246	0.0285	0.3885	++???	0.0	0.000	1	0.9862
5 : 96716051 : SNP	a	g	0.4991	0.0187	0.4510	0.5155	0.0011	0.0085	0.9001	+-++-	0.0	2.460	4	0.6519
13 : 87709360 : SNP	t	c	0.5607	0.0160	0.5487	0.6069	-0.0023	0.0085	0.7871	+--+-	25.6	5.376	4	0.2509
20 : 52735468 : SNP	a	t	0.0230	0.0000	0.0230	0.0230	0.0020	0.0414	0.9615	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 126239570 : SNP	t	c	0.9400	0.0071	0.9272	0.9500	0.0180	0.0188	0.338	++?+-	14.6	3.514	3	0.319
10 : 66846972 : SNP	t	c	0.8181	0.0160	0.7903	0.8385	0.0057	0.0113	0.6135	+--++	2.7	4.112	4	0.3911
4 : 71595862 : SNP	t	g	0.0837	0.0034	0.0766	0.0866	-0.0252	0.0178	0.158	--?-+	9.4	3.311	3	0.3461
11 : 121859248 : SNP	a	g	0.2833	0.0082	0.2747	0.2984	0.0007	0.0148	0.9631	+-+++	0.0	2.227	4	0.6941
14 : 91263565 : SNP	a	g	0.9093	0.0057	0.9059	0.9190	-0.0250	0.0304	0.4108	-???+	0.0	0.247	1	0.6191
18 : 61467629 : SNP	a	g	0.0527	0.0037	0.0468	0.0555	-0.0083	0.0196	0.6717	+-?--	0.0	2.441	3	0.486
19 : 21092887 : SNP	a	c	0.8943	0.0113	0.8651	0.9036	0.0067	0.0140	0.6347	-+-++	0.0	3.505	4	0.4771
2 : 173419805 : SNP	a	g	0.7994	0.0075	0.7862	0.8245	0.0045	0.0107	0.6756	-+-++	17.5	4.848	4	0.3033
10 : 91908610 : SNP	a	g	0.5557	0.0286	0.4913	0.5751	0.0049	0.0085	0.5612	-+--+	24.3	5.282	4	0.2596
5 : 137758545 : SNP	c	g	0.5661	0.0272	0.5009	0.6000	-0.0063	0.0091	0.485	--+--	0.0	3.618	4	0.4602
3 : 81127127 : SNP	t	c	0.4447	0.0198	0.4064	0.4742	-0.0091	0.0097	0.3453	----+	14.6	4.683	4	0.3214
18 : 36946848 : INDEL	d	r	0.4381	0.0133	0.4101	0.4565	-0.0079	0.0090	0.3799	+----	0.0	2.684	4	0.612
5 : 28656147 : SNP	a	g	0.5645	0.0110	0.5411	0.5814	0.0164	0.0085	0.05388	++-++	0.0	2.155	4	0.7074
8 : 19445170 : SNP	t	g	0.9083	0.0058	0.9019	0.9142	0.0183	0.0153	0.2313	++?--	0.0	2.814	3	0.4213
14 : 100128985 : SNP	t	g	0.7919	0.0118	0.7821	0.8122	-0.0010	0.0106	0.9281	-+---	0.0	2.603	4	0.6263
1 : 59244543 : SNP	t	c	0.9418	0.0058	0.9242	0.9464	0.0140	0.0191	0.4645	+-?-+	66.2	8.863	3	0.03117
15 : 28221982 : SNP	t	c	0.7062	0.0427	0.6266	0.7541	-0.0059	0.0094	0.5311	-+--+	0.0	1.856	4	0.7622
3 : 164202045 : SNP	t	c	0.5759	0.0100	0.5568	0.5848	-0.0165	0.0086	0.05378	---+-	0.0	0.542	4	0.9693
13 : 75515240 : SNP	a	g	0.2687	0.0175	0.2337	0.3019	-0.0050	0.0098	0.6113	--+-+	22.0	5.125	4	0.2747
2 : 169867318 : INDEL	i	r	0.0356	0.0002	0.0353	0.0357	0.0030	0.0266	0.9088	-+???	0.0	0.634	1	0.4257
12 : 82853607 : SNP	c	g	0.9344	0.0092	0.9091	0.9447	-0.0132	0.0233	0.5718	-+?--	0.0	0.909	3	0.8233
14 : 20858463 : SNP	a	t	0.1589	0.0044	0.1528	0.1663	-0.0025	0.0122	0.8389	+--+-	48.4	7.746	4	0.1013
13 : 111706656 : SNP	t	c	0.6768	0.0105	0.6473	0.7043	0.0118	0.0092	0.199	++-++	0.0	1.380	4	0.8477
8 : 61954484 : SNP	t	g	0.6289	0.0197	0.5989	0.6553	-0.0024	0.0095	0.7986	-++++	33.8	6.038	4	0.1963
1 : 182632089 : INDEL	d	r	0.0121	0.0000	0.0121	0.0121	0.0030	0.0586	0.9592	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 82573313 : SNP	c	g	0.9402	0.0082	0.9339	0.9550	0.0074	0.0191	0.6975	-+??-	47.0	3.774	2	0.1515
8 : 12539716 : SNP	t	c	0.3728	0.0089	0.3579	0.3881	-0.0023	0.0212	0.9133	??+-+	49.8	3.986	2	0.1363
7 : 52935504 : SNP	t	g	0.9353	0.0055	0.9266	0.9399	0.0013	0.0176	0.9426	-+?++	11.6	3.393	3	0.3349
10 : 13915176 : INDEL	i	r	0.5489	0.0136	0.5293	0.5639	0.0132	0.0097	0.1728	+++--	0.0	3.817	4	0.4313
3 : 156004525 : SNP	a	g	0.0169	0.0000	0.0169	0.0169	-0.0490	0.0526	0.3512	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 70422682 : SNP	a	g	0.2944	0.0092	0.2718	0.3026	-0.0173	0.0093	0.06321	---+-	0.0	0.697	4	0.9517
8 : 63360591 : SNP	a	g	0.9784	0.0000	0.9784	0.9784	0.0760	0.0445	0.08751	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 135661747 : SNP	t	c	0.4511	0.0794	0.4044	0.6229	0.0116	0.0086	0.1772	+--++	0.0	2.417	4	0.6595
4 : 79366655 : SNP	c	g	0.3748	0.0196	0.3237	0.3970	0.0060	0.0089	0.5008	+++-+	0.0	2.833	4	0.5862
7 : 92073073 : SNP	a	g	0.8173	0.0159	0.7730	0.8306	0.0263	0.0115	0.02205	++++-	44.6	7.222	4	0.1246
12 : 20924842 : SNP	a	g	0.3794	0.0493	0.3228	0.4676	-0.0163	0.0092	0.07727	-----	7.9	4.341	4	0.3618
5 : 139367518 : SNP	t	c	0.0120	0.0000	0.0120	0.0120	-0.0190	0.0637	0.7654	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 3887090 : SNP	t	g	0.0386	0.0000	0.0386	0.0386	-0.0230	0.0445	0.6051	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 52080379 : SNP	a	c	0.5992	0.0094	0.5774	0.6104	-0.0052	0.0085	0.5409	---++	20.3	5.020	4	0.2852
1 : 223929170 : SNP	a	t	0.1935	0.0251	0.1610	0.2182	0.0097	0.0141	0.4915	+---+	0.0	1.253	4	0.8692
6 : 68853839 : SNP	t	c	0.9572	0.0045	0.9424	0.9595	-0.0025	0.0218	0.908	+-?-+	0.0	0.481	3	0.9231
15 : 98522548 : INDEL	d	r	0.0738	0.0083	0.0569	0.0790	-0.0087	0.0196	0.6579	-+?-+	0.0	0.496	3	0.9198
4 : 47054594 : SNP	t	g	0.6867	0.0198	0.6448	0.6992	0.0019	0.0091	0.8385	+--+-	0.0	0.895	4	0.9253
8 : 78906008 : SNP	t	c	0.0805	0.0038	0.0658	0.0828	-0.0015	0.0162	0.9267	++?--	0.0	1.174	3	0.7592
5 : 80522530 : SNP	c	g	0.7973	0.0057	0.7857	0.8004	-0.0066	0.0107	0.5386	-+---	0.0	0.688	4	0.9528
6 : 104768387 : SNP	a	g	0.1273	0.0087	0.1218	0.1506	-0.0051	0.0125	0.6822	+--++	61.6	10.407	4	0.0341
15 : 45092777 : INDEL	d	r	0.6075	0.0010	0.6069	0.6090	-0.0502	0.0299	0.09357	???+-	17.5	1.211	1	0.271
2 : 12524053 : SNP	a	g	0.9644	0.0017	0.9632	0.9668	0.0021	0.0278	0.9386	-+???	0.0	0.302	1	0.5828
7 : 6891151 : SNP	t	g	0.8310	0.0054	0.8274	0.8391	-0.0051	0.0374	0.8913	???+-	0.0	0.531	1	0.4663
6 : 55846761 : INDEL	d	r	0.0562	0.0059	0.0508	0.0727	-0.0187	0.0187	0.3157	-+?+-	0.0	1.861	3	0.6018
18 : 50346818 : INDEL	d	r	0.0953	0.0143	0.0582	0.1078	0.0105	0.0145	0.4688	+++-+	48.4	7.759	4	0.1008
5 : 122503033 : SNP	a	g	0.7167	0.0133	0.6800	0.7327	-0.0013	0.0093	0.8906	+-++-	13.2	4.609	4	0.3298
7 : 68529329 : SNP	t	c	0.8593	0.0116	0.8469	0.8836	-0.0033	0.0125	0.7938	+----	0.0	1.768	4	0.7784
8 : 23528659 : SNP	a	g	0.7478	0.0099	0.7367	0.7577	-0.0037	0.0098	0.7037	-+-+-	66.6	11.971	4	0.01756
16 : 20212723 : SNP	a	t	0.8754	0.0122	0.8492	0.8878	-0.0129	0.0137	0.3446	-++--	0.0	1.600	4	0.8087
7 : 13976833 : SNP	t	g	0.6725	0.0273	0.6195	0.6940	0.0113	0.0096	0.2428	+++++	0.0	1.445	4	0.8363
18 : 62385862 : SNP	a	c	0.9469	0.0016	0.9452	0.9485	0.0049	0.0204	0.8096	+-??-	23.1	2.601	2	0.2724
19 : 58464003 : SNP	a	c	0.4604	0.0089	0.4376	0.4654	-0.0071	0.0086	0.4082	--++-	0.0	2.074	4	0.7221
6 : 158638090 : SNP	t	c	0.0436	0.0000	0.0436	0.0436	-0.0510	0.0364	0.1611	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 19034362 : SNP	a	g	0.0598	0.0076	0.0535	0.0862	0.0068	0.0187	0.7167	+-?+-	0.0	2.692	3	0.4416
17 : 51995362 : SNP	a	c	0.3921	0.0073	0.3873	0.4085	-0.0171	0.0097	0.08024	--++-	0.0	3.367	4	0.4983
1 : 197626823 : SNP	t	c	0.2153	0.0045	0.1995	0.2179	0.0003	0.0105	0.9756	+---+	14.3	4.668	4	0.3231
3 : 139280984 : INDEL	i	r	0.4166	0.0151	0.3980	0.4358	-0.0148	0.0091	0.1017	--+++	0.0	3.333	4	0.5037
9 : 76187528 : SNP	t	c	0.8280	0.0110	0.8138	0.8557	-0.0021	0.0114	0.8568	-+-++	0.0	1.910	4	0.7524
14 : 22616834 : SNP	c	g	0.7870	0.0106	0.7814	0.8101	0.0150	0.0107	0.1617	+++--	0.0	3.096	4	0.5419
8 : 27768567 : SNP	t	g	0.3500	0.0084	0.3302	0.3777	-0.0059	0.0091	0.5147	+----	17.9	4.870	4	0.3009
4 : 68598549 : SNP	t	g	0.7357	0.0140	0.7212	0.7674	-0.0107	0.0095	0.2577	-++--	0.0	1.020	4	0.9068
17 : 17059574 : SNP	t	g	0.0192	0.0000	0.0192	0.0192	0.0470	0.0445	0.2906	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 44399135 : SNP	t	c	0.9160	0.0091	0.8999	0.9306	0.0154	0.0156	0.3233	-++--	73.3	14.982	4	0.00474
6 : 138896707 : INDEL	d	r	0.0414	0.0012	0.0405	0.0429	0.0205	0.0249	0.4098	++???	0.0	0.084	1	0.7714
11 : 15243815 : SNP	c	g	0.7883	0.0183	0.7521	0.8067	-0.0124	0.0105	0.2371	---+-	0.0	3.831	4	0.4293
21 : 41670422 : SNP	a	g	0.0596	0.0058	0.0555	0.0699	0.0004	0.0187	0.9816	++?--	0.0	1.480	3	0.6869
14 : 21525084 : SNP	a	g	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	0.0900	0.0647	0.1642	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 21950297 : SNP	t	g	0.9780	0.0000	0.9780	0.9780	-0.0080	0.0425	0.8505	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 24249261 : SNP	a	g	0.0356	0.0004	0.0350	0.0359	0.0420	0.0271	0.1212	++???	28.4	1.396	1	0.2374
3 : 195573202 : SNP	a	g	0.7829	0.0145	0.7544	0.8228	0.0195	0.0108	0.07156	+++--	0.0	2.173	4	0.7039
6 : 46771238 : SNP	a	g	0.3723	0.0022	0.3691	0.3808	0.0076	0.0089	0.395	++---	16.4	4.784	4	0.3102
13 : 49461997 : SNP	a	t	0.6013	0.0103	0.5757	0.6066	-0.0104	0.0085	0.224	--++-	26.1	5.410	4	0.2477
14 : 55208397 : SNP	a	c	0.1718	0.0027	0.1665	0.1815	0.0061	0.0113	0.5887	-++-+	0.0	3.283	4	0.5116
7 : 88906575 : SNP	t	c	0.6074	0.0049	0.5899	0.6094	-0.0036	0.0085	0.6754	--+-+	38.9	6.551	4	0.1616
11 : 34489252 : SNP	t	c	0.3082	0.0161	0.2935	0.3403	-0.0069	0.0091	0.4506	--+-+	0.0	1.602	4	0.8085
14 : 33364789 : SNP	a	t	0.9074	0.0072	0.9023	0.9332	-0.0353	0.0180	0.04961	--?--	0.0	0.312	3	0.9577
2 : 165110858 : SNP	t	c	0.2301	0.0084	0.2097	0.2419	0.0036	0.0099	0.7125	-++++	0.0	3.718	4	0.4455
4 : 104109829 : SNP	t	c	0.3410	0.0167	0.3142	0.3659	-0.0021	0.0098	0.8302	+-+-+	0.0	2.328	4	0.6756
3 : 120499725 : SNP	t	g	0.2625	0.0134	0.2334	0.2699	-0.0109	0.0099	0.2673	+-+--	30.2	5.729	4	0.2203
18 : 68057146 : SNP	a	g	0.0326	0.0000	0.0326	0.0326	-0.0350	0.0495	0.4798	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 75388592 : INDEL	i	r	0.5858	0.0098	0.5596	0.6118	0.0040	0.0085	0.6407	+-+--	0.0	2.932	4	0.5692
13 : 73261054 : SNP	a	t	0.4453	0.0167	0.4323	0.4818	-0.0105	0.0085	0.2191	---+-	0.0	1.359	4	0.8512
3 : 32826228 : SNP	t	g	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	0.0060	0.0495	0.9036	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 79907476 : INDEL	d	r	0.0360	0.0005	0.0356	0.0368	-0.0147	0.0241	0.5425	--??-	0.0	0.457	2	0.7956
2 : 188331890 : SNP	a	c	0.0154	0.0000	0.0154	0.0154	-0.0630	0.0637	0.3225	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 20499607 : SNP	a	c	0.7567	0.0177	0.7054	0.7705	-0.0007	0.0100	0.943	+--+-	11.2	4.505	4	0.3419
20 : 24417661 : SNP	a	g	0.6548	0.0086	0.6369	0.6744	0.0032	0.0089	0.7232	-+--+	28.2	5.571	4	0.2336
5 : 123596603 : SNP	t	c	0.6495	0.0156	0.6261	0.6861	-0.0079	0.0094	0.3981	----+	0.0	2.945	4	0.5671
12 : 83612485 : SNP	t	c	0.0338	0.0030	0.0297	0.0387	0.0201	0.0248	0.4175	+-??+	0.0	1.512	2	0.4696
1 : 80415403 : SNP	t	c	0.0678	0.0067	0.0538	0.0730	-0.0010	0.0174	0.9532	+-?--	0.0	2.460	3	0.4825
17 : 231838 : SNP	a	t	0.9361	0.0051	0.9323	0.9434	0.0448	0.0320	0.1615	+??++	0.0	0.210	2	0.9002
8 : 8470292 : SNP	a	c	0.8763	0.0099	0.8678	0.8901	-0.0198	0.0151	0.1887	--+-+	0.0	2.780	4	0.5952
1 : 96888490 : SNP	c	g	0.1142	0.0136	0.0795	0.1242	-0.0076	0.0138	0.5822	---++	0.0	3.098	4	0.5415
5 : 68329064 : SNP	t	c	0.1478	0.0041	0.1417	0.1536	-0.0095	0.0120	0.4289	--+-+	33.0	5.967	4	0.2016
20 : 23711882 : SNP	a	g	0.3027	0.0127	0.2660	0.3446	0.0027	0.0092	0.768	-+-++	14.8	4.694	4	0.3201
1 : 89307475 : SNP	t	c	0.9471	0.0080	0.9401	0.9569	0.0158	0.0213	0.4574	+-??-	0.0	1.691	2	0.4294
9 : 112011731 : INDEL	d	r	0.6002	0.0128	0.5817	0.6145	0.0075	0.0101	0.4575	-++++	0.0	2.209	4	0.6973
2 : 158005419 : SNP	a	g	0.1492	0.0171	0.1304	0.1835	0.0161	0.0120	0.1795	-+-++	48.2	7.729	4	0.102
5 : 159708071 : INDEL	d	r	0.2494	0.0203	0.2343	0.2867	0.0178	0.0102	0.08234	++---	53.7	8.644	4	0.07065
14 : 51792726 : SNP	a	g	0.9293	0.0024	0.9239	0.9307	-0.0108	0.0169	0.5237	--?-+	42.1	5.178	3	0.1592
3 : 151503678 : SNP	t	c	0.8534	0.0047	0.8362	0.8564	-0.0157	0.0119	0.1875	-----	0.0	1.015	4	0.9075
13 : 89776490 : SNP	t	c	0.2417	0.0061	0.2259	0.2451	-0.0022	0.0099	0.8269	+-+++	10.8	4.483	4	0.3446
6 : 11144641 : SNP	a	g	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	-0.0670	0.0647	0.3004	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 11516705 : SNP	a	t	0.1684	0.0098	0.1571	0.1904	0.0298	0.0122	0.01475	+++-+	21.9	5.123	4	0.275
2 : 184410992 : SNP	c	g	0.8210	0.0053	0.8073	0.8293	-0.0148	0.0115	0.1975	-+---	0.0	3.668	4	0.4528
13 : 65029198 : SNP	t	g	0.1790	0.0070	0.1682	0.1854	-0.0104	0.0111	0.3459	---++	0.0	2.385	4	0.6653
1 : 190330335 : SNP	a	g	0.5476	0.0266	0.4855	0.5723	-0.0081	0.0085	0.3422	-+---	0.0	2.503	4	0.6441
6 : 39298891 : SNP	t	c	0.0218	0.0000	0.0218	0.0218	0.0170	0.0435	0.6957	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 162795882 : SNP	t	c	0.9772	0.0000	0.9772	0.9772	-0.0520	0.0404	0.1984	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 144890055 : SNP	a	t	0.2648	0.0104	0.2484	0.2770	-0.0055	0.0141	0.6948	+----	2.4	4.097	4	0.393
13 : 48569893 : SNP	a	c	0.1230	0.0054	0.1143	0.1286	-0.0210	0.0131	0.1091	---++	0.0	2.682	4	0.6124
13 : 75068021 : SNP	a	c	0.4236	0.0054	0.4184	0.4310	-0.0038	0.0091	0.674	----+	55.9	9.070	4	0.05936
16 : 60446435 : SNP	a	g	0.8267	0.0050	0.8084	0.8295	-0.0182	0.0112	0.1052	---++	62.0	10.534	4	0.03233
4 : 66763492 : SNP	a	c	0.9163	0.0034	0.9129	0.9255	-0.0079	0.0152	0.6062	+--+-	41.8	6.870	4	0.1429
6 : 48351396 : INDEL	d	r	0.0408	0.0020	0.0375	0.0421	0.0141	0.0221	0.5227	++??+	0.0	0.253	2	0.8814
1 : 182022938 : SNP	a	g	0.8435	0.0046	0.8375	0.8486	-0.0266	0.0120	0.02628	-----	0.0	2.937	4	0.5683
7 : 61769299 : SNP	t	c	0.1939	0.0056	0.1821	0.2025	-0.0160	0.0267	0.5478	??---	0.0	0.206	2	0.9021
6 : 74599993 : SNP	a	c	0.5654	0.0175	0.5485	0.5934	-0.0061	0.0098	0.5286	++---	38.0	6.451	4	0.1679
21 : 19456970 : SNP	a	t	0.5446	0.0142	0.5302	0.5882	0.0133	0.0096	0.169	++--+	20.9	5.058	4	0.2814
6 : 24070358 : SNP	t	c	0.9751	0.0000	0.9751	0.9751	-0.0200	0.0414	0.6294	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 81309455 : SNP	t	c	0.9835	0.0000	0.9835	0.9835	-0.0460	0.0516	0.3723	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 105010435 : SNP	t	c	0.4689	0.0257	0.4410	0.5481	0.0051	0.0085	0.5493	++---	0.0	2.359	4	0.67
7 : 63268606 : SNP	c	g	0.5881	0.0137	0.5808	0.6222	0.0163	0.0207	0.4306	??+++	0.0	1.297	2	0.5229
4 : 147021790 : SNP	a	g	0.0664	0.0092	0.0575	0.0809	-0.0001	0.0204	0.9966	+-?++	0.0	2.172	3	0.5375
12 : 18465216 : SNP	a	g	0.5383	0.0107	0.5300	0.5653	-0.0065	0.0085	0.4426	----+	0.0	0.917	4	0.9222
14 : 100533130 : SNP	a	g	0.0437	0.0007	0.0431	0.0450	0.0047	0.0221	0.8324	+-??-	0.0	1.002	2	0.606
3 : 159782134 : SNP	a	g	0.7030	0.0158	0.6889	0.7460	-0.0102	0.0097	0.2942	0----	0.0	2.647	4	0.6186
19 : 47899477 : SNP	a	g	0.9417	0.0000	0.9416	0.9417	-0.0039	0.0334	0.9073	-???+	18.3	1.224	1	0.2687
8 : 58402678 : INDEL	i	r	0.0361	0.0004	0.0352	0.0363	0.0207	0.0305	0.4981	+???+	0.0	0.113	1	0.7364
9 : 30391076 : SNP	t	c	0.9893	0.0000	0.9893	0.9893	-0.0420	0.0576	0.466	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 115293318 : SNP	a	t	0.0271	0.0140	0.0145	0.0427	-0.0035	0.0413	0.9316	-???+	29.9	1.427	1	0.2323
9 : 94949905 : SNP	t	g	0.6637	0.0133	0.6451	0.6739	0.0082	0.0091	0.3693	+++-+	26.3	5.430	4	0.2459
1 : 204411063 : SNP	t	c	0.8497	0.0144	0.8224	0.8813	0.0007	0.0121	0.9541	+-+-+	61.2	10.302	4	0.03563
2 : 201500074 : SNP	a	g	0.1633	0.0175	0.1544	0.2012	0.0180	0.0117	0.1239	++-++	30.0	5.717	4	0.2213
20 : 44822371 : SNP	t	c	0.9365	0.0048	0.9246	0.9438	-0.0052	0.0230	0.822	-??++	0.0	0.278	2	0.8701
8 : 31439376 : INDEL	d	r	0.4753	0.0124	0.4643	0.5041	0.0057	0.0085	0.5045	++++-	25.2	5.350	4	0.2533
19 : 45326217 : SNP	t	c	0.6752	0.0188	0.6465	0.6894	-0.0025	0.0092	0.7863	----+	0.0	2.960	4	0.5646
9 : 115790227 : SNP	a	g	0.0469	0.0048	0.0444	0.0565	-0.0285	0.0221	0.1975	--??-	0.0	0.547	2	0.7608
12 : 63760475 : SNP	t	c	0.2102	0.0090	0.2027	0.2283	0.0041	0.0106	0.697	+-+++	3.2	4.131	4	0.3886
14 : 79525941 : SNP	c	g	0.3801	0.0090	0.3621	0.3901	0.0029	0.0086	0.7315	-+-++	0.0	2.971	4	0.5627
12 : 129330325 : SNP	c	g	0.9000	0.0059	0.8965	0.9101	0.0187	0.0442	0.673	???-+	0.0	0.997	1	0.318
12 : 101375698 : SNP	a	g	0.1844	0.0087	0.1648	0.1887	0.0087	0.0111	0.4337	+---+	75.8	16.550	4	0.002364
3 : 192293647 : SNP	c	g	0.2014	0.0096	0.1768	0.2094	0.0314	0.0168	0.06208	+++++	0.0	2.065	4	0.7238
12 : 62977767 : SNP	a	c	0.9738	0.0000	0.9738	0.9738	0.0470	0.0485	0.3327	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 113332895 : SNP	a	c	0.6918	0.0049	0.6871	0.7096	0.0064	0.0093	0.4943	+-++-	0.0	2.795	4	0.5927
6 : 163854580 : SNP	t	c	0.0810	0.0054	0.0724	0.0872	0.0153	0.0159	0.3369	+-?-+	0.0	1.617	3	0.6555
7 : 120747385 : INDEL	i	r	0.1008	0.0135	0.0889	0.1435	0.0273	0.0150	0.06926	++-++	4.9	4.207	4	0.3787
9 : 118373854 : SNP	t	g	0.2522	0.0082	0.2419	0.2713	0.0233	0.0099	0.01901	++---	40.1	6.682	4	0.1537
1 : 234711098 : SNP	t	g	0.2964	0.0177	0.2607	0.3336	0.0295	0.0098	0.002702	+++-+	0.0	3.642	4	0.4566
3 : 62810364 : SNP	a	t	0.8008	0.0154	0.7868	0.8345	-0.0081	0.0109	0.4601	---++	33.1	5.982	4	0.2005
14 : 101301038 : SNP	c	g	0.8660	0.0113	0.8550	0.8849	0.0285	0.0155	0.06529	+0+++	0.0	1.608	4	0.8074
13 : 110856085 : SNP	a	g	0.3529	0.0106	0.3308	0.3613	0.0095	0.0091	0.2975	+-+++	0.0	1.493	4	0.828
19 : 56954809 : SNP	a	c	0.0108	0.0000	0.0108	0.0108	0.0090	0.0596	0.8801	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 40990438 : SNP	a	c	0.0216	0.0000	0.0216	0.0216	0.0520	0.0536	0.3318	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 104193281 : INDEL	d	r	0.1410	0.0039	0.1234	0.1450	-0.0014	0.0120	0.9078	--++-	0.0	0.412	4	0.9815
1 : 217861358 : SNP	a	g	0.0525	0.0046	0.0475	0.0585	-0.0076	0.0200	0.705	+-??-	0.0	0.460	2	0.7947
21 : 41356039 : SNP	t	c	0.2891	0.0097	0.2757	0.3256	-0.0017	0.0098	0.8637	+---+	12.9	4.590	4	0.332
10 : 8516779 : SNP	t	c	0.6934	0.0234	0.6483	0.7089	0.0121	0.0097	0.2093	++--+	16.9	4.815	4	0.3068
9 : 97782332 : SNP	t	c	0.0754	0.0072	0.0661	0.0899	-0.0022	0.0190	0.9074	--?++	36.4	4.721	3	0.1934
20 : 25294872 : SNP	t	g	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	0.0550	0.0526	0.2954	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 49981625 : SNP	t	g	0.5326	0.0107	0.5001	0.5426	0.0056	0.0087	0.5152	0+-++	0.0	1.011	4	0.9081
13 : 58417572 : SNP	t	g	0.5567	0.0368	0.4721	0.5875	-0.0127	0.0085	0.1387	---+-	0.0	3.784	4	0.436
8 : 99047188 : SNP	a	g	0.8868	0.0053	0.8751	0.8908	-0.0101	0.0138	0.4653	--?--	0.0	0.022	3	0.9991
1 : 104753824 : SNP	c	g	0.4463	0.0130	0.4399	0.4946	-0.0219	0.0086	0.01054	-----	0.0	1.964	4	0.7424
13 : 30064014 : SNP	a	c	0.3200	0.0111	0.2697	0.3244	0.0119	0.0095	0.2111	+++++	0.0	0.836	4	0.9335
1 : 66656913 : SNP	t	c	0.0352	0.0049	0.0324	0.0436	0.0279	0.0332	0.4006	+???-	56.0	2.271	1	0.1318
3 : 179647221 : SNP	a	g	0.7595	0.0166	0.7224	0.7754	-0.0039	0.0098	0.6927	---++	50.5	8.073	4	0.08895
14 : 64834942 : SNP	a	t	0.4130	0.0122	0.4003	0.4438	-0.0034	0.0086	0.6872	---++	0.0	2.711	4	0.6073
2 : 23886149 : SNP	t	c	0.3128	0.0077	0.2826	0.3255	0.0123	0.0092	0.1789	+-+++	51.3	8.221	4	0.0838
14 : 53883534 : SNP	t	c	0.4727	0.0051	0.4576	0.4788	-0.0150	0.0085	0.07716	----+	8.2	4.358	4	0.3597
2 : 234711363 : SNP	c	g	0.0578	0.0090	0.0451	0.0650	0.0287	0.0226	0.2031	+-??+	0.0	1.754	2	0.416
7 : 34931226 : SNP	a	g	0.5595	0.0177	0.5502	0.6024	-0.0084	0.0092	0.3576	----+	0.0	3.799	4	0.4338
6 : 133076896 : SNP	a	g	0.8598	0.0117	0.8335	0.8700	-0.0014	0.0127	0.9141	+--++	21.7	5.111	4	0.2761
4 : 158847232 : SNP	t	c	0.2545	0.0069	0.2504	0.2761	0.0060	0.0098	0.5427	-+++-	13.8	4.639	4	0.3263
1 : 189093459 : SNP	a	g	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	-0.1030	0.0617	0.09485	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 53222891 : SNP	t	g	0.9648	0.0029	0.9622	0.9680	-0.0246	0.0315	0.4359	-+???	81.7	5.456	1	0.0195
11 : 83865794 : SNP	t	c	0.9898	0.0000	0.9898	0.9898	-0.0030	0.0647	0.963	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 6892623 : INDEL	d	r	0.9071	0.0026	0.9036	0.9090	0.0029	0.0443	0.9477	???+-	52.3	2.096	1	0.1477
1 : 162864623 : SNP	t	c	0.3951	0.0112	0.3809	0.4326	-0.0008	0.0086	0.9262	++-+-	20.9	5.060	4	0.2812
9 : 77971932 : SNP	t	c	0.0163	0.0000	0.0163	0.0163	0.0100	0.0505	0.8432	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 68134239 : SNP	t	g	0.4407	0.0136	0.4152	0.4574	-0.0016	0.0092	0.8582	---++	0.0	3.142	4	0.5343
5 : 30083569 : INDEL	d	r	0.6824	0.0082	0.6658	0.7000	-0.0014	0.0111	0.9011	-+-+-	0.0	0.806	4	0.9376
15 : 66864473 : SNP	t	c	0.6533	0.0104	0.6240	0.6596	0.0232	0.0093	0.01266	+++++	0.0	0.502	4	0.9733
3 : 12589685 : SNP	t	c	0.1070	0.0136	0.0836	0.1184	0.0327	0.0174	0.0594	+++++	0.0	1.200	4	0.8781
4 : 110143771 : SNP	t	c	0.0310	0.0015	0.0288	0.0320	0.0054	0.0276	0.8436	-+???	0.0	0.310	1	0.5779
14 : 86406505 : SNP	t	g	0.4723	0.0201	0.4582	0.5159	0.0043	0.0085	0.6152	+----	0.0	1.871	4	0.7595
11 : 132219179 : SNP	a	c	0.1370	0.0153	0.1115	0.1890	-0.0262	0.0129	0.04178	---+-	52.3	8.385	4	0.07845
13 : 22437742 : SNP	t	g	0.0922	0.0068	0.0744	0.0972	0.0017	0.0156	0.9105	+-?-+	0.0	0.910	3	0.8231
12 : 132890164 : SNP	a	g	0.1491	0.0117	0.1290	0.1559	0.0533	0.0383	0.164	???++	0.0	0.542	1	0.4615
4 : 1310963 : SNP	t	c	0.5539	0.0190	0.5200	0.5826	-0.0077	0.0107	0.4733	++---	0.0	3.040	4	0.5512
4 : 172545513 : SNP	a	g	0.9233	0.0045	0.9122	0.9283	-0.0120	0.0167	0.4732	--?+-	0.0	1.795	3	0.616
5 : 29493875 : SNP	a	g	0.3269	0.0050	0.3177	0.3385	0.0127	0.0091	0.1622	+++++	0.0	3.372	4	0.4977
19 : 20756342 : SNP	a	g	0.5719	0.0241	0.5519	0.6031	0.0075	0.0143	0.6003	?++--	0.0	1.585	3	0.6627
12 : 42016711 : SNP	a	g	0.1677	0.0104	0.1463	0.1755	0.0031	0.0114	0.7875	-+-+-	0.0	3.480	4	0.481
5 : 159319537 : SNP	t	c	0.3907	0.0157	0.3803	0.4269	0.0060	0.0086	0.4866	+++--	35.2	6.170	4	0.1868
9 : 24684335 : SNP	t	c	0.1339	0.0051	0.1211	0.1380	0.0137	0.0128	0.287	+++++	0.0	0.751	4	0.9449
13 : 88175773 : INDEL	i	r	0.0931	0.0051	0.0851	0.1120	-0.0052	0.0148	0.7265	+-++-	37.1	6.355	4	0.1742
13 : 60299755 : SNP	c	g	0.0126	0.0000	0.0126	0.0126	0.1600	0.0556	0.004004	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 239016640 : SNP	t	g	0.1740	0.0192	0.1215	0.1867	-0.0000	0.0116	0.9971	+-++-	21.6	5.102	4	0.277
15 : 33206975 : SNP	a	g	0.4034	0.0162	0.3938	0.4535	-0.0012	0.0085	0.8915	+-++-	0.0	1.606	4	0.8077
17 : 13559143 : SNP	t	c	0.7854	0.0107	0.7594	0.8104	-0.0116	0.0105	0.2659	+-+--	57.9	9.493	4	0.04988
5 : 82821908 : INDEL	i	r	0.1617	0.0162	0.1463	0.1996	-0.0006	0.0119	0.9597	+--++	0.0	2.414	4	0.66
4 : 103331291 : SNP	a	t	0.4947	0.0127	0.4832	0.5293	0.0051	0.0097	0.597	+++--	0.0	1.530	4	0.8213
9 : 137688305 : SNP	t	g	0.0231	0.0000	0.0231	0.0231	-0.1020	0.0536	0.05693	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 10997125 : SNP	c	g	0.1261	0.0038	0.1177	0.1332	-0.0181	0.0127	0.1539	--+-+	38.5	6.508	4	0.1643
16 : 12806472 : SNP	t	c	0.0170	0.0000	0.0170	0.0170	-0.0730	0.0505	0.1487	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 5128482 : SNP	a	g	0.2923	0.0047	0.2867	0.3098	0.0009	0.0092	0.9182	++--+	0.0	1.488	4	0.8287
16 : 75496163 : SNP	t	g	0.6255	0.0048	0.6155	0.6362	-0.0026	0.0086	0.7659	--++-	0.0	2.475	4	0.6491
1 : 179468149 : SNP	a	c	0.9023	0.0073	0.8851	0.9078	-0.0034	0.0144	0.8139	+-++-	0.0	1.976	4	0.7401
9 : 1704995 : SNP	t	c	0.1777	0.0140	0.1686	0.2052	-0.0129	0.0117	0.2685	-++--	0.0	1.908	4	0.7527
7 : 14151697 : SNP	t	g	0.6573	0.0070	0.6293	0.6622	0.0032	0.0093	0.7262	+----	60.1	10.014	4	0.0402
6 : 152416625 : SNP	a	g	0.9304	0.0082	0.9249	0.9522	0.0080	0.0176	0.649	-+?-+	0.0	2.163	3	0.5392
12 : 78441036 : SNP	c	g	0.0176	0.0000	0.0176	0.0176	0.0870	0.0526	0.09791	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 87998788 : SNP	t	c	0.1259	0.0101	0.1093	0.1539	-0.0101	0.0130	0.4369	-+--+	55.9	9.078	4	0.05918
12 : 5956733 : INDEL	d	r	0.0569	0.0077	0.0484	0.0759	0.0211	0.0205	0.3029	+-?-+	0.0	2.535	3	0.4689
9 : 103205677 : SNP	a	g	0.0527	0.0000	0.0527	0.0527	-0.0370	0.0384	0.3354	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 172179533 : SNP	t	c	0.8207	0.0105	0.7802	0.8257	-0.0195	0.0118	0.0971	-+-+-	52.3	8.378	4	0.07867
1 : 178523947 : SNP	t	c	0.4822	0.0118	0.4741	0.5090	-0.0060	0.0085	0.4805	---+-	0.0	3.515	4	0.4757
6 : 98165021 : SNP	a	g	0.1797	0.0085	0.1716	0.1984	-0.0041	0.0114	0.7195	--+--	0.0	3.422	4	0.4899
8 : 69781646 : SNP	a	g	0.0489	0.0109	0.0367	0.0792	-0.0010	0.0223	0.9644	-+?--	3.2	3.100	3	0.3764
3 : 174340310 : SNP	a	c	0.4780	0.0087	0.4612	0.5082	0.0037	0.0085	0.6637	+--+-	0.0	3.346	4	0.5017
16 : 84702683 : SNP	t	c	0.3268	0.0120	0.3121	0.3550	0.0028	0.0091	0.7577	+-+-+	0.0	1.464	4	0.833
2 : 156439437 : SNP	a	c	0.7144	0.0150	0.6804	0.7252	0.0035	0.0097	0.7173	-++--	0.0	2.796	4	0.5926
9 : 71665175 : SNP	c	g	0.0485	0.0014	0.0466	0.0495	0.0240	0.0227	0.2901	++???	0.0	0.349	1	0.5548
1 : 46455423 : INDEL	i	r	0.7352	0.0064	0.7212	0.7492	-0.0034	0.0098	0.7247	++---	0.0	1.471	4	0.8317
19 : 16017617 : SNP	a	g	0.6990	0.0245	0.6628	0.7223	0.0162	0.0095	0.08821	+++++	0.0	0.260	4	0.9922
6 : 66593480 : SNP	a	g	0.5147	0.0098	0.4956	0.5204	-0.0067	0.0085	0.4322	-+---	0.0	1.924	4	0.7498
4 : 103037625 : SNP	a	c	0.8081	0.0195	0.7616	0.8202	0.0019	0.0111	0.8628	--+++	0.0	2.038	4	0.7287
1 : 192230023 : SNP	a	g	0.9899	0.0000	0.9899	0.9899	-0.1300	0.0596	0.02928	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 109308190 : SNP	t	c	0.2474	0.0213	0.2334	0.3021	0.0060	0.0099	0.5459	++-+-	65.5	11.610	4	0.0205
6 : 31077614 : SNP	c	g	0.1049	0.0212	0.0769	0.1233	0.0254	0.0144	0.07847	++-++	0.0	2.043	4	0.7278
7 : 113368817 : INDEL	i	r	0.0202	0.0000	0.0202	0.0202	0.0290	0.0445	0.5144	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 1154645 : SNP	t	g	0.9556	0.0036	0.9503	0.9581	0.0262	0.0308	0.395	+???+	0.0	0.011	1	0.9168
13 : 80937859 : SNP	t	c	0.0527	0.0012	0.0518	0.0542	-0.0332	0.0215	0.123	--???	62.0	2.629	1	0.1049
12 : 18221688 : SNP	c	g	0.9890	0.0000	0.9890	0.9890	-0.0020	0.0556	0.9713	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 14263201 : SNP	a	g	0.6454	0.0191	0.6100	0.6602	0.0172	0.0090	0.05647	++-++	20.5	5.033	4	0.2839
4 : 162141567 : SNP	t	g	0.6216	0.0187	0.5772	0.6332	-0.0010	0.0090	0.9145	+----	0.3	4.011	4	0.4046
12 : 29537294 : SNP	a	g	0.5657	0.0126	0.5534	0.5918	-0.0078	0.0085	0.3613	---+-	0.0	1.035	4	0.9045
6 : 32544266 : SNP	t	c	0.7447	0.0319	0.7252	0.8178	0.0209	0.0225	0.3519	??-++	0.0	0.727	2	0.6954
8 : 953611 : SNP	t	c	0.2235	0.0169	0.1789	0.2353	0.0091	0.0102	0.3701	+--+-	0.0	3.238	4	0.5187
15 : 94365844 : SNP	t	c	0.5515	0.0166	0.5416	0.5916	0.0097	0.0086	0.2574	++++-	0.0	2.935	4	0.5688
9 : 29867516 : SNP	t	c	0.6604	0.0050	0.6519	0.6671	-0.0085	0.0091	0.3477	--+++	24.9	5.323	4	0.2557
18 : 34261559 : SNP	a	t	0.4686	0.0132	0.4589	0.4934	0.0104	0.0085	0.2207	++-+-	0.0	1.256	4	0.8689
10 : 126970151 : INDEL	i	r	0.8017	0.0102	0.7736	0.8093	-0.0032	0.0106	0.7645	-++-+	33.7	6.029	4	0.197
5 : 242453 : SNP	c	g	0.8785	0.0128	0.8635	0.8998	-0.0095	0.0163	0.5627	--+-+	0.0	2.165	4	0.7054
18 : 67313613 : SNP	a	c	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	0.0270	0.0485	0.5779	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 30121992 : SNP	t	c	0.3502	0.0091	0.3389	0.3784	-0.0053	0.0091	0.5631	0+---	15.3	4.723	4	0.3169
3 : 163861603 : SNP	t	c	0.1814	0.0068	0.1617	0.1898	-0.0113	0.0113	0.3144	---+-	0.0	1.773	4	0.7774
4 : 9735093 : SNP	a	g	0.0502	0.0040	0.0424	0.0536	0.0132	0.0237	0.5791	++??-	0.0	1.589	2	0.4519
11 : 22375981 : SNP	t	c	0.8790	0.0093	0.8567	0.9043	-0.0026	0.0136	0.8463	-++--	71.2	13.883	4	0.007679
13 : 35803654 : SNP	t	g	0.9387	0.0061	0.9361	0.9553	-0.0002	0.0186	0.99	-+??+	60.8	5.097	2	0.07821
22 : 42232291 : SNP	a	g	0.7060	0.0101	0.6719	0.7264	-0.0024	0.0092	0.7973	+--+-	16.5	4.792	4	0.3093
17 : 28583053 : SNP	t	c	0.1098	0.0081	0.0931	0.1283	0.0026	0.0139	0.8535	+-+--	0.0	3.376	4	0.497
4 : 133224190 : SNP	t	c	0.5169	0.0079	0.5008	0.5281	-0.0061	0.0085	0.4687	---+-	0.0	1.594	4	0.8098
2 : 118540085 : SNP	a	c	0.7045	0.0102	0.6779	0.7137	-0.0110	0.0106	0.2988	-0--+	0.0	1.653	4	0.7993
20 : 17889080 : INDEL	i	r	0.5184	0.0191	0.4911	0.5368	0.0105	0.0086	0.2252	+++--	19.8	4.988	4	0.2885
9 : 9891410 : SNP	t	c	0.1279	0.0074	0.1107	0.1355	-0.0053	0.0128	0.6771	+-++-	0.0	0.611	4	0.9619
10 : 98180061 : SNP	a	c	0.6393	0.0149	0.6254	0.6745	-0.0026	0.0086	0.7631	+-+--	11.1	4.501	4	0.3424
22 : 46490012 : SNP	t	c	0.0502	0.0025	0.0482	0.0534	0.0023	0.0244	0.9238	+-???	0.0	0.115	1	0.7341
14 : 95945720 : SNP	a	t	0.9667	0.0000	0.9667	0.9667	0.0130	0.0596	0.8275	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 83671165 : SNP	t	g	0.9759	0.0000	0.9759	0.9759	-0.0120	0.0404	0.7666	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 7425930 : SNP	a	t	0.8983	0.0033	0.8935	0.9033	-0.0048	0.0141	0.7323	+--++	33.9	6.051	4	0.1954
7 : 90272834 : SNP	t	g	0.9705	0.0000	0.9705	0.9705	-0.0890	0.0394	0.02398	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 108298581 : SNP	a	g	0.7902	0.0205	0.7427	0.8161	0.0168	0.0135	0.2138	+++-+	0.0	3.518	4	0.4751
20 : 60560726 : SNP	t	g	0.8981	0.0087	0.8890	0.9169	0.0122	0.0164	0.4584	+-+--	0.0	2.969	4	0.563
3 : 16533288 : INDEL	i	r	0.3943	0.0193	0.3349	0.4140	-0.0119	0.0099	0.2309	-+---	46.1	7.419	4	0.1154
8 : 51919683 : SNP	a	g	0.2493	0.0058	0.2385	0.2604	0.0058	0.0098	0.5511	+++++	0.0	2.449	4	0.6538
14 : 70995884 : SNP	t	c	0.8368	0.0234	0.7946	0.8520	-0.0032	0.0116	0.7833	--+++	4.7	4.198	4	0.3799
12 : 5937338 : SNP	c	g	0.0206	0.0000	0.0206	0.0206	0.0630	0.0475	0.1848	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 36271799 : SNP	a	g	0.0136	0.0000	0.0136	0.0136	0.0160	0.0546	0.7694	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 83035840 : SNP	t	g	0.7393	0.0155	0.7179	0.7532	0.0043	0.0117	0.7111	+++-+	0.0	1.978	4	0.7397
21 : 23583805 : SNP	t	c	0.7089	0.0099	0.7016	0.7239	-0.0048	0.0093	0.607	---+-	0.9	4.037	4	0.401
17 : 1870386 : SNP	t	c	0.7283	0.0085	0.7127	0.7391	0.0027	0.0098	0.7853	++-+-	24.9	5.325	4	0.2556
3 : 61594700 : SNP	t	c	0.0923	0.0034	0.0888	0.0972	-0.0111	0.0146	0.4485	-+---	0.0	2.420	4	0.659
5 : 108710224 : INDEL	d	r	0.6032	0.0036	0.5920	0.6072	-0.0041	0.0086	0.6348	--++-	38.2	6.469	4	0.1667
1 : 167015261 : SNP	a	t	0.1899	0.0070	0.1834	0.2064	-0.0054	0.0111	0.6277	+---+	0.0	1.670	4	0.7961
7 : 7146258 : SNP	a	t	0.1261	0.0056	0.1093	0.1346	-0.0287	0.0141	0.0419	-----	0.0	2.317	4	0.6777
12 : 81118053 : SNP	a	g	0.9038	0.0119	0.8808	0.9164	0.0048	0.0146	0.7437	++--+	0.0	1.326	4	0.857
8 : 69817047 : SNP	t	g	0.9615	0.0000	0.9615	0.9615	0.0120	0.0414	0.7722	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 193533703 : SNP	a	g	0.6661	0.0060	0.6623	0.6780	0.0087	0.0099	0.3828	+++--	22.9	5.190	4	0.2683
16 : 78850500 : SNP	c	g	0.0735	0.0052	0.0700	0.0867	0.0070	0.0171	0.684	--?-+	33.5	4.513	3	0.2111
14 : 76799249 : SNP	t	c	0.1047	0.0237	0.0758	0.1415	0.0006	0.0204	0.9772	0+?-+	0.0	1.073	3	0.7835
8 : 1264225 : SNP	a	g	0.2049	0.0114	0.1785	0.2150	0.0067	0.0108	0.5343	+-++-	0.0	3.103	4	0.5408
20 : 51402502 : SNP	a	g	0.8832	0.0086	0.8763	0.9016	0.0286	0.0135	0.03475	+++-+	0.0	1.814	4	0.7699
11 : 43262590 : SNP	t	c	0.0346	0.0037	0.0322	0.0404	-0.0318	0.0324	0.327	-???-	0.0	0.033	1	0.8557
16 : 51605142 : SNP	a	g	0.7019	0.0059	0.6910	0.7148	-0.0118	0.0092	0.2002	---+-	0.0	2.761	4	0.5986
11 : 13293248 : SNP	a	c	0.7303	0.0119	0.7180	0.7612	0.0114	0.0098	0.2443	+-+++	0.0	2.725	4	0.6048
7 : 63523869 : INDEL	d	r	0.1372	0.0098	0.1189	0.1440	-0.0113	0.0326	0.7275	??---	0.0	0.021	2	0.9894
10 : 135414020 : SNP	c	g	0.9129	0.0074	0.8913	0.9175	0.0052	0.0155	0.7355	-+++-	54.5	8.783	4	0.06677
5 : 36847221 : SNP	a	t	0.8968	0.0110	0.8732	0.9072	-0.0069	0.0140	0.62	--+-+	0.0	0.709	4	0.9502
4 : 4887454 : SNP	a	g	0.7465	0.0157	0.7360	0.7893	-0.0075	0.0105	0.4737	-+-+-	0.0	3.345	4	0.5018
17 : 5837527 : SNP	a	g	0.2610	0.0034	0.2555	0.2705	-0.0157	0.0098	0.1094	-----	0.0	3.107	4	0.54
5 : 133625422 : SNP	t	g	0.0851	0.0145	0.0762	0.1124	0.0054	0.0155	0.7285	-++++	0.0	1.617	4	0.8058
6 : 55886574 : SNP	t	c	0.9394	0.0057	0.9282	0.9450	0.0157	0.0181	0.3846	+-?-+	0.0	1.571	3	0.666
19 : 17425976 : SNP	a	g	0.2454	0.0032	0.2361	0.2508	-0.0006	0.0126	0.9611	-+--+	32.1	5.895	4	0.2071
21 : 30242437 : SNP	t	g	0.8228	0.0232	0.7774	0.8390	-0.0149	0.0112	0.1814	--+++	32.7	5.948	4	0.2031
4 : 30620961 : SNP	c	g	0.0119	0.0000	0.0119	0.0119	-0.0200	0.0607	0.7416	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 122290930 : SNP	a	g	0.4756	0.0106	0.4493	0.4978	0.0011	0.0085	0.8989	+--+-	8.5	4.372	4	0.358
7 : 103251161 : SNP	c	g	0.1134	0.0060	0.1056	0.1277	-0.0113	0.0138	0.4118	---+-	0.0	2.168	4	0.7049
5 : 21827452 : INDEL	i	r	0.1534	0.0072	0.1336	0.1748	-0.0085	0.0121	0.4835	-0-++	0.0	1.853	4	0.7627
2 : 199751617 : SNP	c	g	0.0253	0.0000	0.0253	0.0253	0.0290	0.0384	0.4503	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 16031754 : SNP	t	g	0.4520	0.0191	0.4158	0.4793	-0.0017	0.0091	0.8507	----+	36.1	6.261	4	0.1805
6 : 32620136 : SNP	a	g	0.8425	0.0161	0.8346	0.8754	0.0446	0.0287	0.1198	???++	0.0	0.580	1	0.4461
16 : 20080771 : SNP	a	c	0.7108	0.0178	0.6790	0.7451	0.0099	0.0094	0.2911	+++--	24.5	5.296	4	0.2582
8 : 82803565 : SNP	t	c	0.9487	0.0006	0.9483	0.9500	0.0316	0.0223	0.1567	++??+	0.0	1.069	2	0.586
8 : 17194868 : INDEL	i	r	0.1608	0.0085	0.1393	0.1719	0.0181	0.0120	0.1294	+++-+	0.0	1.615	4	0.806
1 : 59661558 : INDEL	d	r	0.0148	0.0000	0.0148	0.0148	0.0860	0.0596	0.1493	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 66144492 : SNP	a	g	0.9712	0.0000	0.9712	0.9712	-0.0840	0.0364	0.02099	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 2350020 : SNP	c	g	0.4949	0.0215	0.4743	0.5514	-0.0026	0.0085	0.759	0--++	0.0	2.371	4	0.6679
9 : 130221532 : SNP	a	g	0.1011	0.0086	0.0954	0.1298	-0.0147	0.0143	0.301	---++	34.0	6.057	4	0.1949
17 : 68230544 : SNP	a	g	0.6871	0.0198	0.6756	0.7318	0.0041	0.0092	0.655	++---	0.0	3.328	4	0.5046
4 : 171883476 : SNP	t	c	0.0208	0.0000	0.0208	0.0208	0.0030	0.0536	0.9553	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 2084228 : SNP	t	c	0.0327	0.0012	0.0317	0.0341	-0.0158	0.0322	0.6223	--???	0.0	0.075	1	0.7843
17 : 64384218 : SNP	a	g	0.8430	0.0143	0.8320	0.8773	-0.0046	0.0116	0.6911	--+--	0.0	0.685	4	0.9531
16 : 78268706 : INDEL	i	r	0.0478	0.0000	0.0478	0.0478	-0.0510	0.0414	0.2185	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 58208751 : INDEL	d	r	0.0447	0.0070	0.0384	0.0627	0.0417	0.0228	0.06765	++?++	0.0	0.218	3	0.9746
20 : 47762700 : SNP	a	g	0.4147	0.0059	0.3977	0.4261	-0.0167	0.0085	0.04996	----+	3.9	4.161	4	0.3846
2 : 234898867 : SNP	a	t	0.9789	0.0000	0.9789	0.9789	-0.0280	0.0445	0.529	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 29681243 : SNP	a	g	0.8111	0.0138	0.7811	0.8314	0.0144	0.0108	0.1802	+++-+	0.0	1.403	4	0.8437
4 : 107756697 : SNP	a	t	0.0340	0.0004	0.0334	0.0343	0.0229	0.0266	0.3898	++???	0.0	0.787	1	0.3751
4 : 77030714 : INDEL	d	r	0.1536	0.0035	0.1487	0.1613	-0.0148	0.0119	0.2132	--+--	0.0	2.179	4	0.7029
14 : 52511328 : INDEL	d	r	0.7519	0.0032	0.7429	0.7555	-0.0227	0.0099	0.02244	---+-	0.0	3.650	4	0.4555
4 : 79320823 : SNP	a	g	0.1000	0.0149	0.0633	0.1173	0.0305	0.0143	0.03287	+++--	0.0	3.856	4	0.4259
1 : 64750171 : SNP	t	g	0.0687	0.0053	0.0569	0.0831	-0.0306	0.0169	0.07087	--++-	6.3	4.271	4	0.3706
13 : 65176466 : SNP	a	g	0.6825	0.0145	0.6724	0.7143	-0.0002	0.0092	0.9844	+---+	0.0	3.232	4	0.5197
11 : 46890197 : SNP	a	g	0.1298	0.0218	0.0757	0.1491	0.0087	0.0128	0.5005	+0++-	21.6	5.102	4	0.277
18 : 52310263 : SNP	a	g	0.4263	0.0249	0.3744	0.4444	0.0000	0.0086	0.9955	-++-+	0.0	3.857	4	0.4257
16 : 75230037 : SNP	a	g	0.3703	0.0022	0.3676	0.3763	0.0063	0.0090	0.4804	+++-+	0.0	0.610	4	0.962
15 : 50661788 : SNP	c	g	0.1982	0.0177	0.1823	0.2395	-0.0012	0.0107	0.9074	-+--+	23.0	5.193	4	0.2681
12 : 51460917 : SNP	t	c	0.0129	0.0000	0.0129	0.0129	0.0360	0.0556	0.5173	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 76712218 : SNP	t	g	0.8968	0.0087	0.8908	0.9200	-0.0080	0.0146	0.5858	--?-+	0.0	0.706	3	0.8719
7 : 73201957 : SNP	t	g	0.2263	0.0146	0.1824	0.2673	0.0009	0.0104	0.9343	+-++-	0.0	1.093	4	0.8953
6 : 22034664 : SNP	t	c	0.3659	0.0092	0.3596	0.3844	0.0015	0.0091	0.8712	-+-++	0.0	3.464	4	0.4833
17 : 59269257 : SNP	a	g	0.7819	0.0128	0.7328	0.7908	0.0071	0.0107	0.5032	++--+	0.0	0.828	4	0.9347
12 : 7790686 : SNP	t	c	0.0447	0.0039	0.0389	0.0473	0.0515	0.0252	0.04077	++???	43.1	1.759	1	0.1848
3 : 103352581 : SNP	a	c	0.2955	0.0310	0.2631	0.3576	-0.0208	0.0093	0.02471	-----	0.0	1.126	4	0.8902
6 : 8456423 : SNP	t	c	0.4021	0.0222	0.3552	0.4183	0.0250	0.0086	0.003766	+++++	0.0	1.086	4	0.8965
13 : 85094208 : SNP	a	g	0.8197	0.0043	0.8159	0.8258	0.0155	0.0111	0.1625	++--+	0.0	1.056	4	0.9012
17 : 11027570 : SNP	c	g	0.9798	0.0000	0.9798	0.9798	-0.0540	0.0465	0.2455	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 107440930 : SNP	t	c	0.9799	0.0000	0.9799	0.9799	-0.0200	0.0445	0.653	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 97227084 : SNP	t	c	0.0381	0.0064	0.0331	0.0503	-0.0191	0.0233	0.4107	--??+	0.0	0.409	2	0.8153
20 : 50493629 : INDEL	d	r	0.0255	0.0000	0.0255	0.0255	0.0020	0.0516	0.9691	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 119382351 : SNP	t	c	0.4481	0.0105	0.4341	0.4762	0.0008	0.0085	0.9247	0+++-	0.0	0.724	4	0.9483
11 : 4537244 : SNP	a	g	0.7620	0.0078	0.7368	0.7679	-0.0035	0.0100	0.727	-0--+	32.5	5.923	4	0.205
2 : 215796302 : INDEL	i	r	0.4020	0.0105	0.3701	0.4170	-0.0027	0.0090	0.7636	--+--	25.5	5.372	4	0.2512
20 : 7072555 : SNP	a	g	0.6769	0.0129	0.6468	0.6864	-0.0038	0.0092	0.6782	-+--+	5.7	4.242	4	0.3742
2 : 31954819 : SNP	a	g	0.9842	0.0000	0.9842	0.9842	0.0820	0.0485	0.09103	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 76421308 : SNP	t	g	0.4083	0.0266	0.3544	0.4337	0.0121	0.0097	0.2136	+++++	0.0	0.841	4	0.9329
5 : 4579185 : SNP	t	c	0.2236	0.0120	0.1907	0.2308	-0.0167	0.0107	0.1196	----+	0.0	0.974	4	0.9137
12 : 39633608 : SNP	c	g	0.1150	0.0037	0.1113	0.1229	0.0024	0.0132	0.8538	+----	48.1	7.710	4	0.1028
12 : 1514027 : SNP	a	g	0.0150	0.0000	0.0150	0.0150	0.0560	0.0536	0.2959	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 112121635 : SNP	a	t	0.0837	0.0084	0.0607	0.0960	0.0088	0.0160	0.5836	++---	34.6	6.113	4	0.1909
7 : 93247388 : SNP	a	t	0.5662	0.0105	0.5567	0.5811	0.0097	0.0086	0.2575	+-+++	0.0	1.866	4	0.7603
2 : 44360611 : SNP	t	c	0.0188	0.0000	0.0188	0.0188	-0.0090	0.0505	0.8587	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 55411151 : INDEL	d	r	0.1560	0.0051	0.1417	0.1608	-0.0103	0.0115	0.3708	-+---	0.0	2.873	4	0.5793
11 : 36310897 : INDEL	i	r	0.0186	0.0000	0.0186	0.0186	-0.0360	0.0475	0.4486	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 401109 : INDEL	i	r	0.4553	0.0069	0.4412	0.4661	0.0042	0.0098	0.6703	++--+	53.2	8.548	4	0.07344
4 : 73406996 : SNP	t	c	0.6911	0.0146	0.6607	0.7134	-0.0021	0.0092	0.8235	-+--+	0.0	1.292	4	0.8627
5 : 60903646 : SNP	a	t	0.8470	0.0158	0.7952	0.8622	-0.0178	0.0138	0.1983	-+---	0.0	3.493	4	0.479
1 : 4658538 : SNP	t	c	0.3929	0.0070	0.3857	0.4027	0.0023	0.0087	0.7941	++---	0.0	3.889	4	0.4212
5 : 58013548 : SNP	a	t	0.3005	0.0183	0.2576	0.3152	0.0053	0.0093	0.5673	++-+-	0.0	0.696	4	0.9518
6 : 73138417 : SNP	t	c	0.7040	0.0209	0.6727	0.7530	-0.0002	0.0095	0.9807	+-++-	0.0	2.825	4	0.5874
4 : 27783847 : SNP	t	c	0.6552	0.0105	0.6353	0.6647	-0.0093	0.0092	0.311	--+--	0.0	3.525	4	0.4741
12 : 118832835 : SNP	a	g	0.8332	0.0148	0.8017	0.8479	0.0086	0.0115	0.4543	++-+-	0.0	3.595	4	0.4636
14 : 22579314 : SNP	a	c	0.7403	0.0123	0.7088	0.7514	-0.0007	0.0100	0.9419	-+-+-	0.0	0.558	4	0.9676
22 : 41499971 : INDEL	i	r	0.6279	0.0116	0.5881	0.6498	-0.0082	0.0088	0.3481	---?-	0.0	2.249	3	0.5223
1 : 182255927 : SNP	c	g	0.9734	0.0000	0.9734	0.9734	0.0440	0.0404	0.2765	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 110010506 : SNP	a	g	0.9152	0.0137	0.9034	0.9533	-0.0201	0.0161	0.2123	+-??-	13.7	2.317	2	0.3139
7 : 32926260 : SNP	t	g	0.7433	0.0089	0.7205	0.7698	0.0127	0.0099	0.2013	+++++	0.0	2.555	4	0.6348
2 : 204771687 : SNP	a	g	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	-0.0050	0.0627	0.9364	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 88160556 : SNP	t	g	0.1196	0.0056	0.1043	0.1233	0.0081	0.0150	0.5905	+++--	57.5	9.412	4	0.05159
8 : 140168867 : INDEL	i	r	0.5848	0.0128	0.5638	0.6162	-0.0029	0.0086	0.7387	--+++	0.0	2.600	4	0.6269
11 : 100539475 : SNP	t	c	0.9861	0.0000	0.9861	0.9861	-0.0450	0.0566	0.4267	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 25951979 : INDEL	d	r	0.1166	0.0099	0.1069	0.1412	-0.0022	0.0139	0.8755	-+-+-	0.0	0.440	4	0.979
16 : 84483348 : SNP	a	g	0.2818	0.0241	0.2261	0.3019	-0.0038	0.0094	0.6845	--+-+	0.0	3.760	4	0.4395
21 : 30289799 : SNP	a	g	0.9136	0.0039	0.9091	0.9185	-0.0041	0.0152	0.7881	--+++	0.0	2.344	4	0.6727
11 : 108321052 : SNP	a	g	0.0249	0.0000	0.0249	0.0249	0.0610	0.0495	0.2181	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 172561800 : INDEL	d	r	0.1453	0.0133	0.1018	0.1544	-0.0045	0.0124	0.7188	++-+-	0.0	1.523	4	0.8226
1 : 19175381 : SNP	a	g	0.5781	0.0161	0.5657	0.6201	0.0049	0.0089	0.5818	++-+-	0.0	3.023	4	0.554
1 : 162413093 : SNP	a	c	0.8845	0.0085	0.8693	0.9052	-0.0013	0.0139	0.9249	--+-+	28.0	5.556	4	0.2348
10 : 91638658 : SNP	t	c	0.4562	0.0077	0.4370	0.4835	0.0043	0.0086	0.6129	-+-++	29.7	5.687	4	0.2238
13 : 73967561 : SNP	a	c	0.9637	0.0000	0.9637	0.9637	-0.0360	0.0495	0.4674	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 24278595 : SNP	a	g	0.5728	0.0259	0.5217	0.6185	0.0062	0.0089	0.4814	+++--	43.7	7.106	4	0.1304
11 : 3245008 : SNP	a	t	0.3301	0.0136	0.3228	0.3573	0.0009	0.0099	0.9307	-+--+	0.0	2.975	4	0.5619
20 : 36220359 : SNP	a	g	0.8915	0.0061	0.8724	0.8963	-0.0035	0.0178	0.8443	-+-++	0.0	2.041	4	0.7282
3 : 2902945 : SNP	t	c	0.8573	0.0128	0.8316	0.8684	0.0134	0.0121	0.2668	+-+++	0.0	1.536	4	0.8203
18 : 76807781 : SNP	a	g	0.6630	0.0083	0.6569	0.6957	-0.0078	0.0090	0.3882	--+-+	18.1	4.887	4	0.2991
1 : 81747439 : SNP	a	g	0.9183	0.0047	0.9005	0.9207	0.0107	0.0160	0.5024	++?+-	0.0	1.799	3	0.6151
4 : 172098124 : SNP	c	g	0.0717	0.0018	0.0664	0.0741	-0.0224	0.0178	0.2068	--?--	0.0	0.122	3	0.9891
4 : 43013940 : SNP	t	c	0.0331	0.0025	0.0309	0.0360	-0.0239	0.0289	0.4096	+-???	50.4	2.018	1	0.1555
7 : 82496254 : SNP	t	c	0.5077	0.0161	0.4986	0.5514	-0.0028	0.0085	0.7458	-+--+	0.0	3.056	4	0.5485
2 : 11239618 : SNP	t	c	0.4404	0.0271	0.3903	0.4856	0.0006	0.0097	0.9538	0+--+	0.0	3.613	4	0.461
4 : 87935876 : SNP	t	c	0.0287	0.0068	0.0223	0.0399	-0.0314	0.0273	0.2513	--??-	0.0	0.584	2	0.7467
11 : 81393198 : SNP	t	c	0.6923	0.0103	0.6546	0.7208	-0.0048	0.0092	0.5989	-+--+	0.0	1.467	4	0.8324
9 : 6061661 : SNP	a	c	0.5907	0.0208	0.5396	0.6064	0.0050	0.0097	0.6096	++--+	0.0	1.883	4	0.7573
12 : 128391155 : SNP	a	g	0.1054	0.0076	0.0928	0.1166	0.0034	0.0147	0.8186	++++-	53.9	8.681	4	0.0696
7 : 39207093 : SNP	a	g	0.0601	0.0016	0.0587	0.0622	-0.0348	0.0188	0.06461	--??-	42.4	3.473	2	0.1761
1 : 89845362 : SNP	t	c	0.1538	0.0066	0.1437	0.1647	-0.0091	0.0117	0.4375	---+-	18.6	4.914	4	0.2963
2 : 178479479 : SNP	a	g	0.9347	0.0062	0.9171	0.9397	-0.0120	0.0168	0.4769	----+	0.0	0.414	4	0.9813
6 : 47457461 : SNP	c	g	0.6963	0.0091	0.6912	0.7251	-0.0016	0.0097	0.8669	+++-+	43.4	7.062	4	0.1327
1 : 43537620 : SNP	t	c	0.0540	0.0000	0.0540	0.0540	0.0290	0.0374	0.4381	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 149311610 : SNP	c	g	0.9592	0.0106	0.9447	0.9679	0.0050	0.0288	0.8627	+??-+	0.0	0.400	2	0.8186
17 : 76670749 : SNP	a	g	0.4550	0.0113	0.4331	0.4766	-0.0108	0.0086	0.2066	--+-+	55.4	8.966	4	0.06195
4 : 167057219 : SNP	t	g	0.9510	0.0022	0.9491	0.9562	0.0325	0.0207	0.1165	++??-	0.0	0.707	2	0.7023
2 : 39964419 : INDEL	i	r	0.4961	0.0122	0.4553	0.5289	0.0115	0.0086	0.1776	+++-+	44.5	7.210	4	0.1252
19 : 21315094 : SNP	t	c	0.0831	0.0101	0.0561	0.0885	0.0052	0.0156	0.7391	+--++	28.0	5.552	4	0.2352
9 : 71320168 : SNP	c	g	0.5492	0.0070	0.5372	0.5599	0.0008	0.0085	0.9249	-+++-	20.7	5.046	4	0.2826
22 : 33122215 : SNP	a	g	0.7767	0.0177	0.7444	0.8012	-0.0151	0.0115	0.1879	+----	21.4	5.090	4	0.2782
1 : 115701599 : SNP	a	c	0.0589	0.0088	0.0366	0.0650	0.0065	0.0195	0.7391	+-??+	0.0	1.136	2	0.5668
17 : 42373952 : SNP	t	c	0.0235	0.0000	0.0235	0.0235	0.0200	0.0576	0.7285	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 58085038 : SNP	t	g	0.0151	0.0000	0.0151	0.0151	0.0390	0.0495	0.4311	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 61381528 : SNP	a	g	0.9634	0.0025	0.9615	0.9668	-0.0650	0.0268	0.0153	--???	49.7	1.987	1	0.1587
11 : 111197324 : SNP	c	g	0.0631	0.0057	0.0577	0.0731	0.0260	0.0180	0.1491	++?++	0.0	2.513	3	0.473
10 : 36813298 : SNP	a	g	0.5133	0.0157	0.4836	0.5348	-0.0152	0.0092	0.09733	--++-	2.1	4.088	4	0.3943
7 : 103925897 : SNP	t	c	0.8918	0.0052	0.8751	0.8977	-0.0063	0.0139	0.6518	+--+-	0.0	2.342	4	0.6731
2 : 47516458 : SNP	t	c	0.1012	0.0097	0.0903	0.1199	0.0007	0.0151	0.962	-+?+-	0.0	0.589	3	0.899
7 : 79876193 : SNP	a	t	0.3240	0.0143	0.2687	0.3329	0.0045	0.0101	0.6585	+-++-	43.4	7.073	4	0.1321
16 : 75998454 : SNP	t	c	0.5927	0.0113	0.5787	0.6160	-0.0121	0.0085	0.1549	---++	45.0	7.278	4	0.1219
8 : 104672367 : SNP	a	g	0.8361	0.0127	0.8117	0.8654	0.0155	0.0114	0.176	++--+	0.0	2.437	4	0.656
9 : 19106773 : SNP	t	c	0.0520	0.0028	0.0502	0.0564	0.0469	0.0348	0.1776	+???+	0.0	0.008	1	0.927
10 : 132169589 : SNP	a	c	0.0833	0.0004	0.0830	0.0844	0.0009	0.0157	0.9548	--?++	31.7	4.390	3	0.2223
2 : 229865212 : SNP	a	t	0.9423	0.0070	0.9297	0.9512	-0.0361	0.0219	0.09961	--??+	64.3	5.598	2	0.06086
11 : 4570898 : INDEL	i	r	0.1293	0.0091	0.1182	0.1447	0.0059	0.0133	0.657	-++++	41.7	6.859	4	0.1435
2 : 152216048 : SNP	a	g	0.8499	0.0100	0.8320	0.8588	-0.0190	0.0123	0.1216	-----	0.0	0.855	4	0.931
7 : 149042051 : SNP	t	c	0.7934	0.0061	0.7693	0.8038	-0.0030	0.0107	0.7783	+--+-	0.0	2.224	4	0.6947
5 : 127515898 : SNP	a	g	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	0.0550	0.0485	0.257	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 38836861 : SNP	t	c	0.8528	0.0039	0.8460	0.8586	0.0024	0.0121	0.8431	-++++	0.0	2.757	4	0.5994
5 : 81736062 : SNP	t	c	0.7322	0.0097	0.7230	0.7590	-0.0035	0.0097	0.7229	+++--	0.0	2.056	4	0.7255
1 : 46586340 : SNP	a	g	0.9392	0.0038	0.9372	0.9498	-0.0234	0.0191	0.2203	--??-	0.0	0.843	2	0.6562
7 : 11904138 : SNP	a	c	0.3080	0.0035	0.3030	0.3108	-0.0043	0.0092	0.6382	+---+	0.0	2.767	4	0.5976
9 : 139621843 : SNP	a	c	0.1048	0.0153	0.0860	0.1292	-0.0214	0.0157	0.1734	--?+-	0.0	0.903	3	0.8247
16 : 80523377 : SNP	t	c	0.9619	0.0033	0.9579	0.9646	0.0068	0.0256	0.7921	-+???	0.0	0.477	1	0.4896
4 : 17443829 : SNP	t	c	0.0472	0.0025	0.0440	0.0494	-0.0342	0.0213	0.1083	--??-	0.0	0.420	2	0.8107
5 : 153992798 : SNP	t	c	0.3532	0.0177	0.3142	0.3670	-0.0048	0.0091	0.5978	--+-+	38.5	6.505	4	0.1645
6 : 160552803 : SNP	t	c	0.0694	0.0033	0.0653	0.0766	-0.0255	0.0171	0.1356	-+?--	0.0	1.917	3	0.5897
2 : 242893595 : SNP	a	g	0.3776	0.0113	0.3562	0.3923	-0.0043	0.0181	0.8114	??-+-	0.0	0.129	2	0.9377
13 : 48846614 : SNP	a	c	0.7172	0.0039	0.7089	0.7202	-0.0045	0.0097	0.6418	-+-+-	53.4	8.580	4	0.07251
10 : 10974436 : SNP	c	g	0.6882	0.0130	0.6625	0.6988	-0.0116	0.0112	0.2995	----+	36.6	6.310	4	0.1771
6 : 53680668 : SNP	a	g	0.1441	0.0088	0.1363	0.1608	-0.0022	0.0122	0.8588	-+++-	0.0	3.911	4	0.4182
6 : 131411341 : SNP	a	g	0.9894	0.0000	0.9894	0.9894	0.0680	0.0596	0.2542	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 74055498 : SNP	a	g	0.4255	0.0133	0.3906	0.4402	-0.0050	0.0091	0.5796	+-+--	0.0	2.417	4	0.6595
10 : 63624452 : SNP	t	c	0.0352	0.0000	0.0352	0.0352	-0.0320	0.0384	0.4048	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 99981753 : SNP	c	g	0.0985	0.0082	0.0887	0.1082	-0.0164	0.0182	0.3678	-+---	0.0	0.999	4	0.91
3 : 109260193 : INDEL	d	r	0.3919	0.0081	0.3581	0.4091	-0.0164	0.0088	0.06077	--+--	0.0	1.009	4	0.9085
20 : 6918462 : SNP	t	c	0.6769	0.0197	0.6625	0.7327	0.0109	0.0092	0.2371	+++-+	31.5	5.839	4	0.2115
18 : 37248434 : SNP	a	g	0.0321	0.0000	0.0321	0.0321	-0.0480	0.0475	0.3124	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 91812028 : SNP	t	c	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	0.0190	0.0586	0.7459	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 48216709 : SNP	t	g	0.6994	0.0140	0.6674	0.7199	-0.0128	0.0093	0.1699	-++--	0.0	2.021	4	0.7319
2 : 50381383 : SNP	a	g	0.1512	0.0033	0.1423	0.1562	-0.0101	0.0119	0.3952	--+++	55.2	8.921	4	0.06312
12 : 46834967 : SNP	t	c	0.0470	0.0000	0.0470	0.0470	-0.0550	0.0455	0.2266	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 228621772 : SNP	a	g	0.9024	0.0084	0.8959	0.9220	-0.0248	0.0144	0.08469	-----	0.0	2.533	4	0.6387
11 : 55647259 : SNP	a	g	0.9173	0.0027	0.9079	0.9200	-0.0037	0.0169	0.8248	-++-?	0.0	1.680	3	0.6413
1 : 34464511 : SNP	a	g	0.0461	0.0051	0.0410	0.0524	0.0342	0.0212	0.1065	++??+	29.8	2.847	2	0.2408
9 : 96605352 : SNP	c	g	0.8313	0.0047	0.8222	0.8426	0.0123	0.0114	0.2828	+++++	0.0	1.899	4	0.7544
15 : 29365973 : SNP	t	c	0.0224	0.0000	0.0224	0.0224	-0.0400	0.0475	0.3998	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 65423140 : INDEL	i	r	0.0285	0.0007	0.0276	0.0290	0.0058	0.0297	0.8462	-+???	0.0	0.269	1	0.6039
8 : 91197371 : SNP	a	g	0.0288	0.0007	0.0282	0.0297	-0.0367	0.0293	0.2104	--???	0.0	0.379	1	0.5381
10 : 66969893 : SNP	t	g	0.0827	0.0094	0.0769	0.0988	-0.0229	0.0156	0.1435	-+-+-	25.8	5.394	4	0.2492
2 : 34927836 : SNP	t	g	0.9128	0.0060	0.9075	0.9201	-0.0154	0.0165	0.3489	-+?+-	11.3	3.380	3	0.3366
4 : 14451846 : SNP	a	g	0.7359	0.0052	0.7197	0.7434	0.0179	0.0098	0.06691	++---	13.6	4.628	4	0.3277
4 : 189897132 : SNP	t	c	0.7001	0.0098	0.6781	0.7113	0.0011	0.0111	0.9199	-++--	11.8	4.534	4	0.3385
17 : 5773602 : SNP	a	c	0.3697	0.0186	0.3104	0.3823	-0.0085	0.0088	0.3313	--++-	0.0	1.848	4	0.7638
15 : 65951797 : SNP	a	c	0.1678	0.0103	0.1366	0.1948	-0.0038	0.0114	0.7388	-++--	0.0	0.994	4	0.9108
4 : 127540218 : SNP	t	c	0.3028	0.0083	0.2906	0.3129	-0.0196	0.0092	0.03291	--+-+	7.7	4.333	4	0.3628
7 : 24442130 : SNP	a	g	0.1648	0.0096	0.1592	0.1846	-0.0083	0.0112	0.457	+--+-	16.9	4.813	4	0.3071
7 : 157805146 : SNP	a	c	0.1825	0.0076	0.1709	0.1894	0.0222	0.0113	0.05049	++---	0.0	3.418	4	0.4904
19 : 34243316 : INDEL	i	r	0.1124	0.0069	0.0969	0.1170	-0.0067	0.0145	0.6434	----+	27.6	5.523	4	0.2377
4 : 99896046 : SNP	a	c	0.0362	0.0001	0.0361	0.0364	-0.0321	0.0261	0.219	--???	0.0	0.153	1	0.6955
22 : 27430963 : INDEL	d	r	0.7795	0.0080	0.7724	0.8029	-0.0192	0.0107	0.07399	--++-	54.2	8.742	4	0.06789
20 : 34153855 : INDEL	d	r	0.2295	0.0156	0.2161	0.2597	0.0084	0.0100	0.3997	0+-++	0.0	2.911	4	0.5729
1 : 242867432 : SNP	a	g	0.4810	0.0209	0.4680	0.5281	0.0098	0.0085	0.2481	+-+++	0.0	3.301	4	0.5088
4 : 187519898 : INDEL	d	r	0.0327	0.0004	0.0322	0.0330	-0.0182	0.0275	0.5092	-+???	0.0	0.669	1	0.4133
13 : 24359030 : SNP	t	c	0.7043	0.0049	0.7001	0.7163	-0.0004	0.0098	0.97	-++++	0.0	2.311	4	0.6788
8 : 40640331 : SNP	t	c	0.5319	0.0146	0.4862	0.5442	-0.0038	0.0085	0.6589	0--++	0.0	0.850	4	0.9316
2 : 37872139 : SNP	a	g	0.2128	0.0051	0.1984	0.2237	0.0009	0.0106	0.9328	-+--+	0.0	3.722	4	0.4449
16 : 54860249 : SNP	t	c	0.4346	0.0072	0.4033	0.4392	0.0205	0.0095	0.03136	+++++	0.0	1.949	4	0.745
4 : 163724470 : SNP	t	c	0.2812	0.0177	0.2356	0.2917	0.0135	0.0093	0.1455	++-++	0.0	0.755	4	0.9443
8 : 106233373 : INDEL	i	r	0.2473	0.0086	0.2081	0.2654	-0.0157	0.0098	0.1108	+----	46.2	7.441	4	0.1143
10 : 35565655 : SNP	t	g	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	0.0990	0.0475	0.03718	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 161800592 : SNP	a	t	0.9163	0.0049	0.9042	0.9196	0.0197	0.0160	0.2179	++?--	0.0	2.791	3	0.425
9 : 107738327 : SNP	c	g	0.4250	0.0178	0.3912	0.4452	-0.0130	0.0086	0.1282	---+-	16.3	4.778	4	0.3108
18 : 10888992 : SNP	t	c	0.4235	0.0130	0.3925	0.4331	-0.0002	0.0086	0.9824	++--+	0.0	1.209	4	0.8766
6 : 79954685 : SNP	a	g	0.0800	0.0114	0.0588	0.0933	-0.0243	0.0166	0.1439	--??+	39.6	3.309	2	0.1912
11 : 51417001 : SNP	c	g	0.4630	0.0200	0.4172	0.4776	0.0001	0.0091	0.994	-++-+	7.4	4.318	4	0.3647
7 : 148107958 : SNP	a	c	0.5566	0.0203	0.5003	0.5698	-0.0012	0.0086	0.8859	-++--	0.0	3.981	4	0.4086
7 : 29630731 : SNP	a	c	0.7628	0.0031	0.7555	0.7677	-0.0044	0.0098	0.655	-+---	0.0	2.430	4	0.6572
3 : 56471047 : SNP	t	c	0.0269	0.0039	0.0235	0.0313	-0.0232	0.0318	0.4649	--???	0.0	0.004	1	0.9502
9 : 110751151 : SNP	a	g	0.8872	0.0080	0.8795	0.9038	-0.0106	0.0136	0.4359	-+---	0.0	1.985	4	0.7384
18 : 42769518 : SNP	t	g	0.1063	0.0025	0.1015	0.1097	-0.0123	0.0138	0.3736	--+--	0.0	1.244	4	0.8708
21 : 31428765 : SNP	a	g	0.9480	0.0019	0.9437	0.9492	0.0072	0.0202	0.7208	-+??+	0.0	0.380	2	0.8269
18 : 69127228 : SNP	a	g	0.5026	0.0214	0.4588	0.5228	-0.0067	0.0085	0.4283	+---+	0.0	3.567	4	0.4677
19 : 10524548 : SNP	a	g	0.6828	0.0129	0.6698	0.6991	-0.0046	0.0092	0.6178	--+-+	67.3	12.229	4	0.01573
16 : 89750733 : SNP	t	c	0.9738	0.0000	0.9738	0.9738	0.0610	0.0485	0.2087	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 73523023 : SNP	t	c	0.1263	0.0055	0.1164	0.1403	0.0184	0.0128	0.1513	++-++	17.4	4.845	4	0.3035
15 : 76427660 : SNP	t	c	0.1154	0.0066	0.0907	0.1202	-0.0122	0.0131	0.3521	-----	0.0	0.960	4	0.9159
8 : 18584215 : SNP	a	g	0.0595	0.0012	0.0553	0.0606	-0.0143	0.0188	0.4467	--?-+	0.0	2.608	3	0.4562
12 : 73323264 : SNP	a	g	0.8127	0.0033	0.8001	0.8164	-0.0001	0.0108	0.9933	-++++	34.1	6.067	4	0.1942
9 : 117182605 : SNP	c	g	0.7043	0.0176	0.6880	0.7454	-0.0055	0.0093	0.5531	0-+-+	0.0	1.737	4	0.784
5 : 104672869 : INDEL	i	r	0.0945	0.0101	0.0807	0.1039	0.0013	0.0192	0.948	-+?--	0.0	1.741	3	0.6278
11 : 21950479 : SNP	a	g	0.0220	0.0000	0.0220	0.0220	0.0080	0.0425	0.8505	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 30657327 : SNP	a	t	0.3799	0.0006	0.3793	0.3806	0.0381	0.0375	0.3103	??++?	0.0	0.519	1	0.4714
5 : 51183533 : SNP	t	c	0.3336	0.0198	0.2916	0.3577	0.0273	0.0092	0.003032	++--+	0.0	2.330	4	0.6752
10 : 3888368 : SNP	a	g	0.2420	0.0014	0.2380	0.2462	0.0031	0.0098	0.7491	+0--+	0.0	1.820	4	0.7688
15 : 98782667 : SNP	a	g	0.8621	0.0130	0.8482	0.8963	0.0097	0.0125	0.4395	+-+++	26.2	5.418	4	0.247
6 : 100172899 : SNP	t	c	0.6557	0.0051	0.6493	0.6605	-0.0049	0.0091	0.5922	----+	0.0	1.538	4	0.8199
14 : 99495670 : SNP	a	g	0.0466	0.0000	0.0466	0.0466	0.0510	0.0404	0.2072	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 19998925 : SNP	t	c	0.0126	0.0000	0.0126	0.0126	-0.0300	0.0617	0.6266	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 88063500 : SNP	a	t	0.9263	0.0029	0.9226	0.9286	0.0057	0.0191	0.7646	++???	0.0	0.023	1	0.8789
19 : 20088478 : SNP	a	g	0.3899	0.0042	0.3839	0.3931	-0.0066	0.0085	0.4405	+----	52.2	8.367	4	0.07903
7 : 16532383 : SNP	c	g	0.4992	0.0219	0.4674	0.5225	0.0026	0.0085	0.7646	+-+-+	41.8	6.874	4	0.1427
2 : 166210421 : INDEL	d	r	0.0493	0.0003	0.0491	0.0499	0.0059	0.0237	0.8037	+-??+	0.0	0.470	2	0.7906
20 : 19951660 : SNP	t	c	0.1724	0.0112	0.1535	0.1835	-0.0090	0.0129	0.4891	-++--	9.2	4.408	4	0.3536
12 : 114487635 : SNP	t	c	0.1288	0.0110	0.1087	0.1380	-0.0122	0.0131	0.3499	-----	0.0	0.929	4	0.9204
16 : 6965298 : SNP	c	g	0.7748	0.0075	0.7589	0.7804	0.0093	0.0105	0.3763	++-++	0.0	2.059	4	0.7248
15 : 25425281 : SNP	a	g	0.8782	0.0116	0.8580	0.8948	0.0083	0.0138	0.5458	-+-+-	0.0	2.121	4	0.7134
4 : 133453029 : INDEL	i	r	0.3862	0.0163	0.3402	0.3939	0.0029	0.0086	0.735	++---	42.1	6.911	4	0.1406
6 : 20694594 : SNP	a	g	0.0753	0.0061	0.0708	0.0873	-0.0212	0.0173	0.2192	+-?--	0.0	2.988	3	0.3934
3 : 170944167 : SNP	a	g	0.9282	0.0071	0.9121	0.9348	0.0193	0.0166	0.2459	+++++	0.0	3.473	4	0.4821
6 : 110773230 : SNP	c	g	0.9319	0.0055	0.9258	0.9432	-0.0037	0.0183	0.8403	+-??-	0.0	0.601	2	0.7405
18 : 57646309 : SNP	a	g	0.7792	0.0150	0.7654	0.7981	0.0049	0.0103	0.6347	+---+	0.0	3.840	4	0.4281
2 : 95776956 : SNP	a	g	0.0518	0.0049	0.0447	0.0552	0.0064	0.0224	0.7732	+-???	0.0	0.233	1	0.6291
3 : 134410944 : SNP	a	t	0.6238	0.0121	0.6054	0.6419	-0.0143	0.0103	0.1653	--+--	32.0	5.884	4	0.208
10 : 124323604 : SNP	a	c	0.6683	0.0027	0.6633	0.6707	-0.0201	0.0197	0.3093	??+--	0.0	0.533	2	0.7662
2 : 158958679 : SNP	a	t	0.0297	0.0120	0.0204	0.0451	-0.0204	0.0335	0.5433	-???+	0.0	0.822	1	0.3647
5 : 2383969 : SNP	a	c	0.0741	0.0015	0.0730	0.0787	0.0059	0.0170	0.7293	-+?++	0.0	2.047	3	0.5628
7 : 115719266 : SNP	t	c	0.5584	0.0112	0.5341	0.5672	0.0005	0.0085	0.9517	+--+-	61.8	10.458	4	0.03338
2 : 116013831 : INDEL	d	r	0.0735	0.0062	0.0625	0.0809	-0.0001	0.0169	0.9961	-+?-+	0.0	1.363	3	0.7142
8 : 83148021 : SNP	a	c	0.9218	0.0055	0.9008	0.9242	0.0030	0.0164	0.8522	+-?++	0.0	1.647	3	0.6487
6 : 109601900 : INDEL	i	r	0.3037	0.0066	0.2882	0.3070	-0.0114	0.0092	0.2139	-+---	22.7	5.172	4	0.2701
4 : 159651049 : INDEL	d	r	0.2277	0.0139	0.2022	0.2440	-0.0016	0.0113	0.8869	--++-	0.0	3.954	4	0.4122
17 : 20638263 : SNP	a	g	0.0724	0.0046	0.0629	0.0754	-0.0077	0.0198	0.6963	-+??+	59.3	4.919	2	0.0855
11 : 76351906 : SNP	a	c	0.4392	0.0062	0.4283	0.4448	0.0090	0.0086	0.2912	+++++	0.0	0.947	4	0.9177
4 : 76062905 : SNP	t	c	0.1008	0.0036	0.0915	0.1074	0.0084	0.0140	0.548	0+++-	0.0	2.936	4	0.5686
6 : 32572278 : SNP	a	c	0.1160	0.0083	0.1081	0.1312	-0.0165	0.0282	0.5594	??++-	0.0	0.960	2	0.6187
18 : 49285742 : INDEL	i	r	0.0358	0.0065	0.0320	0.0482	-0.0192	0.0250	0.4425	--??+	0.0	1.329	2	0.5145
1 : 37559925 : SNP	a	c	0.2319	0.0102	0.2097	0.2504	-0.0090	0.0106	0.3944	--+-+	0.0	2.425	4	0.6582
6 : 137504476 : SNP	a	t	0.9766	0.0000	0.9766	0.9766	0.0100	0.0404	0.8047	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 154136046 : SNP	a	g	0.0494	0.0094	0.0414	0.0608	-0.0039	0.0293	0.8948	-??+-	16.5	2.395	2	0.3019
1 : 46675692 : SNP	a	c	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	-0.0620	0.0445	0.1633	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 69088072 : SNP	a	g	0.9588	0.0062	0.9464	0.9638	0.0128	0.0252	0.6116	+-??+	0.0	1.008	2	0.6042
18 : 74904328 : SNP	c	g	0.0116	0.0000	0.0116	0.0116	0.0400	0.0596	0.5024	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 42026294 : SNP	c	g	0.3233	0.0105	0.3133	0.3394	0.0011	0.0092	0.9012	--+-+	44.3	7.182	4	0.1266
5 : 18421209 : SNP	a	g	0.1387	0.0045	0.1355	0.1511	-0.0026	0.0124	0.8345	--+--	0.0	0.484	4	0.975
4 : 82863839 : SNP	a	c	0.9633	0.0088	0.9415	0.9693	0.0225	0.0239	0.347	++?-+	0.0	1.316	3	0.7253
1 : 186606640 : SNP	t	g	0.9731	0.0000	0.9731	0.9731	0.0190	0.0556	0.7325	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 40924632 : SNP	a	g	0.5648	0.0081	0.5394	0.5742	-0.0038	0.0088	0.6644	-+---	0.0	0.181	4	0.9961
5 : 173869835 : SNP	a	g	0.7709	0.0036	0.7558	0.7733	-0.0016	0.0104	0.8785	-+-++	0.0	2.515	4	0.6419
1 : 181740924 : SNP	a	g	0.7449	0.0064	0.7339	0.7537	-0.0049	0.0099	0.6228	--+++	0.0	1.439	4	0.8374
12 : 114672508 : SNP	a	c	0.2433	0.0183	0.2143	0.2690	-0.0004	0.0100	0.9716	+---+	28.8	5.615	4	0.2298
9 : 468026 : SNP	a	g	0.1305	0.0049	0.1231	0.1444	0.0046	0.0135	0.7346	--+-+	49.3	7.890	4	0.09571
13 : 50139950 : SNP	a	g	0.0403	0.0006	0.0396	0.0408	0.0575	0.0271	0.03395	++???	0.0	0.046	1	0.8299
5 : 116411270 : SNP	a	t	0.6200	0.0124	0.5919	0.6304	-0.0013	0.0098	0.8954	++-++	64.8	11.361	4	0.02279
5 : 45725597 : SNP	t	c	0.4211	0.0204	0.3660	0.4360	-0.0010	0.0086	0.904	--+++	34.9	6.141	4	0.1888
10 : 123499185 : SNP	a	c	0.1092	0.0123	0.0881	0.1275	-0.0028	0.0138	0.8396	0-++-	0.0	1.429	4	0.8392
9 : 92486032 : SNP	a	g	0.5734	0.0211	0.5300	0.6106	-0.0006	0.0085	0.9478	+--+-	7.7	4.333	4	0.3628
5 : 129675541 : SNP	a	g	0.0802	0.0112	0.0510	0.0968	-0.0155	0.0168	0.3552	-++?-	55.3	6.709	3	0.08177
2 : 24093500 : INDEL	d	r	0.4393	0.0061	0.4299	0.4614	-0.0226	0.0085	0.008177	-----	0.0	2.394	4	0.6636
7 : 84048018 : SNP	t	c	0.7888	0.0057	0.7712	0.7938	0.0085	0.0106	0.4199	+0++-	72.1	14.320	4	0.00634
7 : 49063995 : SNP	t	c	0.9554	0.0033	0.9489	0.9587	-0.0532	0.0218	0.0145	--??-	0.0	1.953	2	0.3767
1 : 228469870 : SNP	t	c	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	-0.0430	0.0455	0.3445	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 109455522 : SNP	t	c	0.3630	0.0139	0.3300	0.3781	0.0037	0.0090	0.6769	--+++	0.0	2.172	4	0.7041
19 : 16771037 : SNP	a	g	0.0779	0.0059	0.0722	0.0867	0.0009	0.0169	0.9592	-+?+-	0.0	1.114	3	0.7737
4 : 7066351 : SNP	a	c	0.0161	0.0000	0.0161	0.0161	-0.0450	0.0485	0.3537	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 164386836 : SNP	t	c	0.0375	0.0006	0.0364	0.0378	0.0337	0.0311	0.2783	+???-	64.5	2.815	1	0.09341
6 : 122025943 : SNP	t	c	0.1527	0.0087	0.1338	0.1604	-0.0011	0.0118	0.9244	0-+-+	0.0	1.427	4	0.8395
11 : 13233200 : SNP	t	g	0.7473	0.0137	0.7346	0.7898	0.0084	0.0099	0.3987	++-++	0.0	1.704	4	0.79
6 : 11834552 : SNP	a	g	0.8200	0.0156	0.8069	0.8574	0.0155	0.0142	0.2722	-+--+	47.0	7.550	4	0.1095
2 : 181541003 : SNP	a	g	0.0871	0.0043	0.0794	0.0926	-0.0196	0.0153	0.1996	----+	0.0	2.420	4	0.6591
12 : 50968330 : SNP	t	c	0.8178	0.0102	0.8097	0.8345	-0.0109	0.0126	0.3894	--++?	54.6	6.603	3	0.08568
4 : 27746079 : SNP	a	g	0.4860	0.0047	0.4836	0.5045	0.0131	0.0086	0.125	++-++	31.3	5.824	4	0.2127
6 : 55367858 : SNP	t	c	0.3568	0.0121	0.3419	0.3684	0.0010	0.0091	0.9162	-+++-	24.5	5.295	4	0.2583
16 : 77199560 : SNP	a	t	0.9685	0.0029	0.9663	0.9724	-0.0124	0.0283	0.6622	-+???	0.0	0.354	1	0.5521
22 : 40883928 : SNP	c	g	0.9753	0.0000	0.9753	0.9753	0.0080	0.0435	0.854	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 82259844 : SNP	t	c	0.0192	0.0000	0.0192	0.0192	-0.0110	0.0455	0.8089	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 105078633 : SNP	t	c	0.6031	0.0247	0.5527	0.6366	0.0121	0.0089	0.1766	++++-	0.0	2.207	4	0.6978
7 : 51940270 : SNP	t	c	0.9791	0.0000	0.9791	0.9791	-0.0300	0.0627	0.6322	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 103310410 : SNP	c	g	0.9619	0.0109	0.9442	0.9731	0.0220	0.0235	0.3493	++?+-	0.0	2.015	3	0.5693
7 : 18202748 : SNP	a	g	0.9421	0.0023	0.9400	0.9453	0.0160	0.0194	0.4087	++??+	0.0	0.154	2	0.9257
6 : 20424844 : SNP	a	g	0.9033	0.0042	0.9000	0.9155	0.0345	0.0179	0.05453	+-?-+	34.7	4.591	3	0.2043
5 : 7440084 : SNP	a	g	0.8061	0.0039	0.8045	0.8232	0.0219	0.0109	0.04327	++--+	0.0	3.418	4	0.4905
15 : 79582658 : SNP	t	c	0.4483	0.0291	0.4249	0.5076	-0.0030	0.0088	0.7313	-++--	0.0	2.516	4	0.6417
8 : 127750514 : SNP	a	g	0.5363	0.0242	0.4845	0.5521	0.0037	0.0085	0.6604	++-+-	0.0	3.010	4	0.5562
19 : 33550111 : SNP	a	c	0.2571	0.0122	0.2466	0.3016	-0.0035	0.0107	0.7475	-+-+?	0.0	2.419	3	0.4901
3 : 106778046 : SNP	a	t	0.0288	0.0007	0.0282	0.0297	0.0504	0.0298	0.09022	++???	0.9	1.009	1	0.3151
17 : 11622460 : SNP	t	c	0.9831	0.0000	0.9831	0.9831	-0.0640	0.0516	0.2145	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 151729821 : INDEL	d	r	0.0802	0.0127	0.0647	0.0926	-0.0224	0.0229	0.3269	--?++	0.0	1.701	3	0.6367
1 : 86462722 : INDEL	d	r	0.2023	0.0324	0.1731	0.2672	-0.0118	0.0118	0.3169	-++--	68.7	12.778	4	0.01242
11 : 98933983 : SNP	a	g	0.5128	0.0070	0.5031	0.5235	0.0036	0.0085	0.6754	+++-+	0.0	1.722	4	0.7868
1 : 25051225 : SNP	t	c	0.2481	0.0064	0.2297	0.2536	0.0009	0.0099	0.9253	+-++-	8.4	4.368	4	0.3585
4 : 110463936 : SNP	a	g	0.9562	0.0096	0.9424	0.9629	-0.0264	0.0307	0.3904	-???+	10.8	1.121	1	0.2896
18 : 25773016 : SNP	t	c	0.6028	0.0187	0.5806	0.6417	0.0034	0.0090	0.7056	+---+	0.0	3.953	4	0.4124
4 : 71559014 : SNP	t	c	0.9846	0.0000	0.9846	0.9846	0.0040	0.0495	0.9356	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 128683460 : SNP	t	c	0.0391	0.0011	0.0383	0.0406	0.0234	0.0275	0.3947	++???	0.0	0.098	1	0.754
11 : 46183635 : INDEL	d	r	0.9498	0.0070	0.9438	0.9594	0.0245	0.0220	0.2648	++??-	0.0	0.910	2	0.6346
1 : 3762815 : SNP	t	c	0.7581	0.0081	0.7523	0.7868	-0.0103	0.0100	0.3052	--+++	0.0	2.258	4	0.6884
3 : 162497721 : SNP	t	c	0.3511	0.0072	0.3359	0.3582	-0.0053	0.0089	0.5512	-++--	0.0	2.715	4	0.6065
17 : 21847464 : SNP	c	g	0.7105	0.0127	0.6908	0.7359	-0.0024	0.0102	0.8134	-+-+-	0.0	0.615	4	0.9614
5 : 99146860 : SNP	a	g	0.4425	0.0134	0.4104	0.4530	-0.0065	0.0085	0.4495	+-++-	0.0	1.940	4	0.7469
3 : 7543757 : SNP	a	g	0.6340	0.0100	0.5923	0.6399	0.0025	0.0091	0.7826	++---	2.0	4.084	4	0.3948
11 : 21035127 : SNP	t	c	0.9078	0.0139	0.8804	0.9184	-0.0304	0.0152	0.0449	-----	0.0	3.993	4	0.4069
1 : 58864379 : SNP	a	g	0.6473	0.0070	0.6306	0.6520	-0.0042	0.0093	0.6493	--++-	0.0	1.553	4	0.8172
14 : 52668265 : SNP	t	c	0.4725	0.0131	0.4628	0.5027	0.0129	0.0090	0.1508	++-+-	0.0	3.037	4	0.5517
10 : 47620990 : SNP	t	c	0.8970	0.0000	0.8970	0.8970	-0.0975	0.0504	0.05305	????-	0.0	0.000	0	1
8 : 138379427 : SNP	a	c	0.8372	0.0077	0.8208	0.8430	0.0043	0.0118	0.7132	+---+	0.0	3.342	4	0.5023
14 : 38597124 : SNP	t	c	0.0246	0.0000	0.0246	0.0246	0.0190	0.0404	0.6384	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 26740825 : SNP	a	g	0.0349	0.0061	0.0313	0.0473	0.0203	0.0248	0.4116	-+??+	74.6	7.873	2	0.01951
22 : 45254717 : SNP	c	g	0.7787	0.0084	0.7680	0.7906	0.0017	0.0112	0.8785	---++	8.2	4.357	4	0.3599
5 : 139684364 : SNP	t	c	0.1549	0.0041	0.1491	0.1638	0.0314	0.0119	0.008494	+++++	0.0	3.053	4	0.549
20 : 51153941 : SNP	a	c	0.1050	0.0105	0.0962	0.1196	-0.0015	0.0152	0.9197	+-?++	51.8	6.229	3	0.101
12 : 65309295 : SNP	t	c	0.3793	0.0140	0.3710	0.4258	-0.0069	0.0090	0.4455	-0+--	0.0	2.715	4	0.6065
12 : 6114644 : SNP	t	c	0.4697	0.0090	0.4516	0.4790	-0.0152	0.0091	0.09561	----+	0.0	1.682	4	0.7941
9 : 32490675 : SNP	t	g	0.5692	0.0114	0.5603	0.6066	-0.0023	0.0086	0.7854	-+-+-	32.0	5.879	4	0.2084
21 : 41372572 : SNP	t	g	0.4627	0.0152	0.4357	0.4804	0.0118	0.0089	0.1867	++-++	0.0	3.117	4	0.5384
12 : 74184030 : SNP	c	g	0.9541	0.0018	0.9528	0.9567	0.0314	0.0239	0.1877	+-???	6.0	1.063	1	0.3025
8 : 146290665 : SNP	a	c	0.8087	0.0078	0.7870	0.8196	0.0097	0.0123	0.4282	+-+++	31.8	5.866	4	0.2094
3 : 70391895 : SNP	a	g	0.8534	0.0055	0.8307	0.8572	-0.0016	0.0131	0.8998	+++--	51.7	8.277	4	0.08196
11 : 65630698 : SNP	t	g	0.3341	0.0058	0.3234	0.3454	0.0007	0.0091	0.9399	++-+-	11.9	4.542	4	0.3376
11 : 110019352 : SNP	t	c	0.2563	0.0122	0.2405	0.2737	0.0089	0.0098	0.3615	++-+-	0.0	2.650	4	0.618
7 : 21892683 : SNP	t	c	0.6948	0.0094	0.6742	0.7019	-0.0047	0.0092	0.6107	-++-+	74.1	15.440	4	0.003871
14 : 93775028 : SNP	a	c	0.8341	0.0031	0.8227	0.8362	-0.0247	0.0118	0.03683	---+-	0.0	1.133	4	0.889
22 : 35381546 : SNP	a	g	0.0833	0.0095	0.0725	0.1050	0.0275	0.0157	0.0811	++-+-	0.0	2.877	4	0.5786
2 : 45817566 : SNP	t	c	0.7377	0.0107	0.7120	0.7621	0.0270	0.0097	0.005535	++++-	45.3	7.309	4	0.1204
6 : 156915443 : SNP	t	c	0.7292	0.0055	0.7122	0.7342	-0.0019	0.0110	0.8622	-+--+	0.0	2.077	4	0.7216
11 : 69200525 : SNP	t	c	0.9499	0.0086	0.9330	0.9585	-0.0231	0.0207	0.2648	+-?--	26.7	4.091	3	0.2518
14 : 30101299 : SNP	t	g	0.2228	0.0066	0.2143	0.2505	-0.0054	0.0104	0.6059	-+-+-	0.0	3.246	4	0.5175
6 : 113731925 : SNP	c	g	0.5410	0.0255	0.4853	0.5693	-0.0086	0.0089	0.3341	---++	4.4	4.184	4	0.3816
2 : 159190069 : SNP	a	t	0.7461	0.0172	0.7085	0.7659	0.0054	0.0099	0.5877	++--+	32.4	5.920	4	0.2052
5 : 60500649 : SNP	t	c	0.0549	0.0046	0.0506	0.0608	-0.0063	0.0195	0.7484	--?+-	0.0	0.442	3	0.9315
1 : 4957385 : SNP	t	c	0.2553	0.0077	0.2373	0.2675	-0.0042	0.0098	0.6685	-++-+	0.0	1.879	4	0.7579
2 : 14432852 : SNP	a	c	0.9162	0.0041	0.9093	0.9214	-0.0196	0.0156	0.21	-----	0.0	0.117	4	0.9984
2 : 22417510 : SNP	a	t	0.9717	0.0000	0.9717	0.9717	-0.0130	0.0445	0.7701	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 44016153 : SNP	t	c	0.6477	0.0086	0.6371	0.6649	0.0051	0.0101	0.6162	++++-	13.4	4.617	4	0.3289
1 : 204180540 : SNP	t	c	0.8884	0.0046	0.8739	0.8978	0.0115	0.0150	0.4426	+-+++	0.0	3.983	4	0.4083
17 : 27091153 : SNP	a	g	0.8059	0.0059	0.8011	0.8201	0.0021	0.0107	0.8471	-+-++	42.2	6.922	4	0.1401
17 : 68873752 : SNP	t	g	0.9514	0.0000	0.9514	0.9514	0.0040	0.0414	0.9231	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 21248449 : SNP	t	c	0.8377	0.0111	0.8320	0.8708	-0.0089	0.0115	0.437	--+--	0.0	2.519	4	0.6413
6 : 47743967 : SNP	a	t	0.2450	0.0058	0.2264	0.2537	0.0059	0.0100	0.5558	+---+	28.5	5.594	4	0.2316
9 : 107270237 : SNP	c	g	0.0691	0.0029	0.0650	0.0757	0.0151	0.0175	0.3893	++?++	0.0	0.195	3	0.9784
21 : 25791665 : SNP	t	g	0.1942	0.0029	0.1908	0.2035	-0.0160	0.0109	0.1425	-+---	38.9	6.547	4	0.1619
6 : 151042442 : SNP	t	g	0.0165	0.0000	0.0165	0.0165	-0.0240	0.0485	0.6209	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 194094142 : SNP	a	g	0.8058	0.0128	0.7828	0.8217	0.0104	0.0123	0.3998	++-+-	52.2	8.372	4	0.07885
2 : 20298169 : INDEL	d	r	0.1789	0.0234	0.1250	0.1993	-0.0090	0.0129	0.4841	---+-	0.0	0.781	4	0.9409
17 : 13701580 : INDEL	i	r	0.0409	0.0004	0.0405	0.0412	0.0185	0.0251	0.4615	++???	0.0	0.018	1	0.8938
21 : 46707897 : SNP	c	g	0.7413	0.0075	0.7338	0.7577	0.0176	0.0098	0.07179	+++++	0.0	1.320	4	0.858
3 : 13740916 : SNP	t	c	0.1494	0.0088	0.1410	0.1662	-0.0101	0.0124	0.4123	-0-+-	0.0	0.644	4	0.9581
13 : 48063193 : SNP	a	g	0.9764	0.0000	0.9764	0.9764	-0.0060	0.0394	0.879	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 39955957 : SNP	a	g	0.0494	0.0050	0.0452	0.0590	0.0257	0.0206	0.2128	-+??+	11.6	2.261	2	0.3228
1 : 210093794 : SNP	t	c	0.0192	0.0000	0.0192	0.0192	0.0030	0.0546	0.9562	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 35947565 : SNP	a	g	0.3397	0.0110	0.3054	0.3504	-0.0002	0.0090	0.984	+-+-+	0.0	2.474	4	0.6493
14 : 48012522 : SNP	a	t	0.9802	0.0000	0.9802	0.9802	-0.0370	0.0495	0.4551	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 35106327 : SNP	a	g	0.9216	0.0114	0.8990	0.9291	0.0237	0.0168	0.1581	+-?++	0.0	2.112	3	0.5495
3 : 109499670 : INDEL	d	r	0.2691	0.0094	0.2398	0.2740	-0.0181	0.0095	0.05606	---++	0.0	3.302	4	0.5087
21 : 24513451 : SNP	a	g	0.0214	0.0000	0.0214	0.0214	-0.0790	0.0566	0.1628	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 25590764 : INDEL	d	r	0.3199	0.0092	0.2766	0.3260	-0.0152	0.0094	0.1053	---?-	0.0	2.364	3	0.5004
4 : 155760069 : SNP	t	c	0.2483	0.0076	0.2339	0.2594	0.0085	0.0104	0.4125	+--++	69.1	12.962	4	0.01146
2 : 14017309 : SNP	t	c	0.8496	0.0110	0.8411	0.8771	-0.0036	0.0123	0.7681	-++-+	0.0	3.838	4	0.4283
9 : 95570578 : SNP	t	c	0.7678	0.0130	0.7550	0.7869	-0.0238	0.0105	0.0238	-----	0.0	2.967	4	0.5633
4 : 34112191 : SNP	c	g	0.9111	0.0064	0.8888	0.9164	-0.0145	0.0153	0.3411	---++	0.0	1.742	4	0.7832
16 : 9385706 : SNP	a	t	0.2933	0.0115	0.2806	0.3272	-0.0033	0.0099	0.7407	---++	36.3	6.276	4	0.1795
17 : 64151738 : SNP	a	c	0.7371	0.0189	0.7038	0.7569	-0.0060	0.0097	0.5352	--++-	24.4	5.293	4	0.2586
1 : 151686240 : SNP	t	g	0.1849	0.0254	0.1657	0.2537	0.0136	0.0111	0.2218	++-++	0.0	1.936	4	0.7475
4 : 171743036 : SNP	t	c	0.0222	0.0053	0.0172	0.0279	-0.0136	0.0341	0.6905	--???	0.0	0.031	1	0.8605
6 : 162131914 : INDEL	d	r	0.2284	0.0216	0.2028	0.2690	-0.0135	0.0124	0.2769	+--+-	38.8	6.531	4	0.1628
2 : 137949224 : SNP	a	g	0.0727	0.0107	0.0415	0.0806	0.0043	0.0175	0.8079	+-??+	37.9	3.221	2	0.1998
12 : 126475672 : SNP	t	c	0.0642	0.0043	0.0622	0.0777	0.0003	0.0182	0.9853	+-?++	0.0	0.489	3	0.9214
7 : 152951327 : SNP	t	c	0.0622	0.0043	0.0589	0.0729	-0.0186	0.0182	0.3053	--?-+	40.1	5.005	3	0.1714
7 : 64022268 : SNP	t	g	0.2079	0.0224	0.1534	0.2357	-0.0059	0.0119	0.619	+-+--	49.3	7.889	4	0.09572
4 : 149956085 : SNP	t	c	0.7553	0.0086	0.7366	0.7713	0.0098	0.0100	0.3305	+---+	0.0	2.256	4	0.6889
13 : 109401737 : SNP	a	g	0.4328	0.0084	0.4099	0.4434	-0.0088	0.0085	0.2996	---+-	0.0	2.436	4	0.6562
9 : 1602052 : SNP	a	g	0.4632	0.0142	0.4401	0.4930	-0.0214	0.0085	0.01188	----+	0.0	1.565	4	0.815
19 : 50059718 : SNP	a	g	0.1276	0.0058	0.1157	0.1356	0.0268	0.0141	0.05767	++?++	0.0	1.573	3	0.6655
4 : 172235767 : SNP	a	g	0.1986	0.0103	0.1924	0.2328	-0.0018	0.0112	0.8739	---++	45.7	7.369	4	0.1176
3 : 157440283 : SNP	t	c	0.9741	0.0040	0.9670	0.9777	-0.0068	0.0285	0.811	-+??+	0.0	0.226	2	0.8931
5 : 180538233 : SNP	a	g	0.4609	0.0192	0.3926	0.4783	-0.0018	0.0092	0.8417	0-+++	0.0	2.539	4	0.6376
2 : 14467319 : SNP	a	t	0.0607	0.0000	0.0607	0.0607	0.0550	0.0425	0.1952	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 36484773 : INDEL	i	r	0.5854	0.0145	0.5775	0.6202	0.0108	0.0097	0.2664	-++++	43.1	7.033	4	0.1342
5 : 62993060 : SNP	t	c	0.0409	0.0009	0.0396	0.0417	0.0026	0.0224	0.9074	-+??+	0.0	1.524	2	0.4667
3 : 54238401 : INDEL	d	r	0.2228	0.0210	0.1821	0.2425	0.0086	0.0102	0.4	-+-++	0.0	1.398	4	0.8445
2 : 71461788 : SNP	c	g	0.9561	0.0053	0.9451	0.9588	-0.0069	0.0218	0.7513	-+??-	47.5	3.812	2	0.1487
5 : 154252309 : SNP	a	t	0.9847	0.0000	0.9847	0.9847	-0.0380	0.0505	0.4522	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 2545352 : SNP	a	g	0.9736	0.0000	0.9736	0.9736	-0.0160	0.0526	0.7608	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 16501680 : SNP	t	c	0.4380	0.0306	0.3705	0.4585	0.0049	0.0086	0.565	--+++	17.6	4.852	4	0.3028
2 : 46383523 : SNP	t	c	0.0219	0.0000	0.0219	0.0219	0.0000	0.0495	1	0????	0.0	0.000	0	1
21 : 46329415 : SNP	c	g	0.6774	0.0229	0.6623	0.7355	0.0007	0.0094	0.9399	-++++	0.0	1.104	4	0.8936
6 : 72010963 : SNP	a	g	0.4312	0.0103	0.4120	0.4584	0.0069	0.0085	0.4154	++++-	59.9	9.976	4	0.04084
11 : 28365948 : SNP	a	g	0.9609	0.0086	0.9490	0.9671	-0.0422	0.0319	0.186	-???-	0.0	0.557	1	0.4555
12 : 21237090 : SNP	t	c	0.8142	0.0132	0.7805	0.8250	-0.0168	0.0117	0.1499	-+---	38.8	6.534	4	0.1627
4 : 152149881 : SNP	t	g	0.9590	0.0059	0.9448	0.9629	-0.0177	0.0224	0.4277	-+?+-	0.0	1.255	3	0.7398
11 : 62602137 : SNP	t	c	0.9523	0.0058	0.9415	0.9558	-0.0011	0.0204	0.9588	-+?+-	0.0	0.827	3	0.843
2 : 178890459 : SNP	t	c	0.0966	0.0050	0.0889	0.1077	0.0068	0.0147	0.6433	+-+++	24.3	5.286	4	0.2592
15 : 56206607 : SNP	t	c	0.0975	0.0021	0.0920	0.1018	0.0005	0.0142	0.9697	+-++-	29.9	5.706	4	0.2222
6 : 159089715 : SNP	a	g	0.9715	0.0108	0.9575	0.9798	0.0101	0.0353	0.7756	+???-	12.4	1.141	1	0.2854
6 : 127452935 : SNP	t	c	0.5226	0.0170	0.4796	0.5375	0.0030	0.0085	0.7262	+++-+	0.0	2.622	4	0.6229
1 : 154776422 : SNP	a	g	0.9233	0.0074	0.9174	0.9392	-0.0137	0.0169	0.4174	--?-+	0.0	2.787	3	0.4257
10 : 21132587 : SNP	a	c	0.7345	0.0167	0.7024	0.7441	0.0022	0.0097	0.8223	+---+	28.8	5.614	4	0.2299
10 : 36439485 : SNP	t	c	0.0717	0.0056	0.0640	0.0765	-0.0161	0.0173	0.3527	--?--	0.0	0.347	3	0.9509
5 : 128199702 : SNP	a	c	0.0163	0.0000	0.0163	0.0163	0.1220	0.0546	0.02542	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 20568980 : INDEL	d	r	0.7329	0.0114	0.7222	0.7465	-0.0024	0.0101	0.8135	+---+	0.0	1.788	4	0.7747
13 : 78660356 : SNP	t	c	0.5776	0.0121	0.5550	0.5924	0.0021	0.0085	0.8098	+++-+	37.0	6.346	4	0.1748
7 : 72190917 : SNP	c	g	0.7631	0.0061	0.7543	0.7745	0.0091	0.0110	0.4044	-+-+-	48.9	7.824	4	0.09824
6 : 115166452 : SNP	a	g	0.0228	0.0000	0.0228	0.0228	0.0070	0.0475	0.8829	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 63323055 : SNP	a	g	0.9899	0.0000	0.9899	0.9899	0.0680	0.0617	0.2701	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 66175834 : SNP	a	g	0.6693	0.0054	0.6652	0.6876	-0.0055	0.0091	0.55	--+--	0.0	0.334	4	0.9875
19 : 35884904 : SNP	a	g	0.8008	0.0114	0.7648	0.8136	0.0076	0.0107	0.4794	++---	48.6	7.786	4	0.09976
3 : 41882357 : SNP	t	c	0.8251	0.0213	0.7830	0.8491	-0.0057	0.0117	0.6255	-+++-	0.0	1.712	4	0.7885
2 : 6329962 : SNP	t	c	0.5559	0.0149	0.5436	0.5900	-0.0024	0.0085	0.7816	+-+--	0.0	2.268	4	0.6867
8 : 101983186 : SNP	t	c	0.0591	0.0039	0.0505	0.0620	0.0198	0.0190	0.2962	++??-	13.1	2.302	2	0.3163
20 : 33600540 : SNP	t	c	0.0297	0.0000	0.0297	0.0297	-0.0300	0.0586	0.6089	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 146017039 : SNP	a	g	0.0737	0.0099	0.0691	0.0953	-0.0480	0.0303	0.1133	-??+?	1.0	1.010	1	0.3148
1 : 224060606 : SNP	t	c	0.7479	0.0115	0.7314	0.7575	0.0070	0.0099	0.4769	-++++	0.0	1.004	4	0.9092
14 : 92797558 : SNP	a	c	0.0946	0.0112	0.0869	0.1267	0.0062	0.0150	0.6809	+-?-+	0.0	0.544	3	0.9091
9 : 25723263 : SNP	a	t	0.5043	0.0058	0.4786	0.5076	0.0038	0.0091	0.6737	+--++	30.3	5.735	4	0.2198
6 : 67780679 : SNP	a	g	0.4455	0.0331	0.3687	0.4629	-0.0078	0.0086	0.3627	--+++	50.8	8.137	4	0.08667
1 : 54456041 : SNP	a	g	0.9576	0.0003	0.9572	0.9578	0.0206	0.0242	0.3952	++???	0.0	0.019	1	0.8891
1 : 235799823 : SNP	t	c	0.6130	0.0116	0.6023	0.6392	-0.0056	0.0089	0.5302	-+-++	0.0	3.253	4	0.5164
1 : 99033744 : SNP	t	c	0.9881	0.0000	0.9881	0.9881	-0.0110	0.0566	0.8459	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 147001264 : SNP	a	t	0.0557	0.0099	0.0351	0.0663	0.0166	0.0198	0.4029	++??-	0.0	0.718	2	0.6984
16 : 59073951 : SNP	t	g	0.8923	0.0107	0.8740	0.9049	0.0006	0.0142	0.966	+-++-	26.1	5.416	4	0.2472
11 : 96226824 : SNP	a	g	0.2264	0.0171	0.1771	0.2429	0.0006	0.0107	0.9586	-+-+-	41.5	6.835	4	0.1449
10 : 4347234 : SNP	t	c	0.7450	0.0080	0.7391	0.7765	-0.0023	0.0100	0.8137	+-+--	49.4	7.898	4	0.09541
9 : 25463521 : SNP	a	g	0.6156	0.0116	0.6080	0.6413	0.0125	0.0087	0.152	+++-+	0.0	2.095	4	0.7182
15 : 41476875 : SNP	t	c	0.2657	0.0034	0.2590	0.2688	0.0027	0.0098	0.7837	++-+-	0.0	2.292	4	0.6823
2 : 17517887 : INDEL	d	r	0.4783	0.0187	0.4618	0.5105	0.0173	0.0085	0.04171	+-+++	50.8	8.125	4	0.0871
8 : 123615998 : SNP	c	g	0.0977	0.0039	0.0944	0.1044	-0.0077	0.0152	0.6135	-+-+-	8.2	4.356	4	0.36
11 : 69669094 : SNP	a	g	0.3706	0.0088	0.3636	0.4054	0.0072	0.0089	0.4212	+-+++	24.1	5.271	4	0.2606
8 : 101214189 : SNP	a	g	0.4337	0.0171	0.4069	0.4464	-0.0118	0.0085	0.1643	-+-++	51.1	8.187	4	0.08495
8 : 3318660 : SNP	a	g	0.2680	0.0133	0.2425	0.2816	0.0095	0.0099	0.3333	+-+-+	0.0	1.034	4	0.9046
7 : 149389338 : SNP	a	t	0.9265	0.0077	0.9219	0.9394	-0.0109	0.0339	0.7468	-???-	0.0	0.087	1	0.7678
1 : 114234145 : SNP	a	t	0.8765	0.0022	0.8700	0.8788	0.0030	0.0142	0.8343	+-++?	0.0	2.344	3	0.5042
9 : 137413333 : SNP	a	t	0.3088	0.0141	0.2922	0.3277	-0.0025	0.0111	0.8238	++--+	0.0	2.552	4	0.6354
2 : 28858069 : SNP	t	g	0.3611	0.0062	0.3355	0.3662	-0.0045	0.0089	0.6161	--+--	33.0	5.973	4	0.2011
15 : 27847048 : SNP	t	g	0.1128	0.0044	0.0985	0.1173	-0.0101	0.0139	0.4694	--+++	10.6	4.472	4	0.3458
1 : 221719862 : SNP	t	c	0.9624	0.0090	0.9458	0.9689	0.0041	0.0237	0.864	+-?+-	0.0	2.108	3	0.5502
7 : 121270106 : SNP	a	g	0.8501	0.0130	0.8168	0.8742	-0.0201	0.0124	0.1034	---+-	30.0	5.717	4	0.2213
18 : 64542552 : SNP	t	g	0.3899	0.0117	0.3640	0.4118	-0.0083	0.0089	0.3514	----+	44.3	7.183	4	0.1265
3 : 32110397 : SNP	a	g	0.7615	0.0123	0.7364	0.7728	-0.0011	0.0109	0.9169	-+++-	0.0	3.242	4	0.5181
7 : 5868513 : SNP	c	g	0.8713	0.0166	0.8458	0.8881	0.0452	0.0147	0.002163	+++-+	0.0	1.400	4	0.8442
5 : 14518829 : SNP	t	c	0.0121	0.0000	0.0121	0.0121	-0.0490	0.0576	0.3951	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 27770333 : INDEL	d	r	0.5152	0.0207	0.4947	0.5811	-0.0079	0.0085	0.354	----+	56.0	9.099	4	0.05867
14 : 82316366 : SNP	a	t	0.0654	0.0039	0.0581	0.0686	0.0127	0.0173	0.4612	-+?-+	62.1	7.909	3	0.04793
6 : 106181089 : SNP	t	c	0.0318	0.0030	0.0293	0.0353	0.0028	0.0281	0.9214	+-???	0.0	0.490	1	0.4838
9 : 134804093 : SNP	c	g	0.0213	0.0000	0.0213	0.0213	0.0880	0.0455	0.05305	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 15730179 : SNP	a	g	0.9848	0.0000	0.9848	0.9848	-0.0360	0.0495	0.4674	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 26991871 : SNP	t	c	0.2094	0.0053	0.2080	0.2329	-0.0052	0.0104	0.6181	--++-	0.0	2.164	4	0.7057
20 : 1662999 : SNP	t	g	0.8317	0.0145	0.7995	0.8440	0.0006	0.0115	0.9606	+--+-	0.0	0.782	4	0.9409
3 : 5925765 : SNP	t	g	0.0545	0.0069	0.0502	0.0675	0.0091	0.0194	0.6405	++?+-	0.0	1.704	3	0.6361
18 : 23451584 : SNP	a	g	0.0139	0.0000	0.0139	0.0139	-0.0800	0.0526	0.128	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 52433946 : SNP	a	t	0.0485	0.0042	0.0444	0.0584	0.0077	0.0208	0.7103	+-?-+	0.0	1.790	3	0.6171
15 : 57046107 : SNP	a	g	0.8210	0.0147	0.7889	0.8304	-0.0124	0.0111	0.2664	+----	32.0	5.883	4	0.2081
11 : 78724207 : SNP	a	c	0.9189	0.0053	0.9151	0.9314	-0.0210	0.0175	0.2308	--??-	0.0	0.196	2	0.9066
2 : 55994276 : SNP	c	g	0.7854	0.0133	0.7523	0.8154	-0.0049	0.0105	0.6373	-+-++	0.0	1.839	4	0.7653
12 : 109333321 : SNP	a	g	0.1044	0.0045	0.0952	0.1145	0.0033	0.0141	0.8148	+++--	74.9	15.936	4	0.003106
18 : 43982589 : SNP	t	c	0.1438	0.0032	0.1408	0.1520	0.0031	0.0124	0.8036	-+--+	0.0	1.784	4	0.7754
21 : 14752420 : SNP	t	c	0.4408	0.0299	0.4205	0.5003	0.0120	0.0199	0.5441	??++-	0.0	1.289	2	0.525
1 : 181131808 : SNP	t	c	0.0785	0.0076	0.0628	0.0873	-0.0216	0.0179	0.2271	--?+?	0.0	1.836	2	0.3993
7 : 129490197 : INDEL	i	r	0.1147	0.0075	0.1080	0.1419	0.0164	0.0140	0.2404	++--+	0.0	3.663	4	0.4535
1 : 61045537 : SNP	c	g	0.4795	0.0100	0.4727	0.5032	0.0020	0.0085	0.8158	+-+-+	9.5	4.419	4	0.3523
16 : 28608746 : SNP	a	c	0.6465	0.0277	0.6295	0.7048	0.0023	0.0097	0.8134	++---	16.2	4.775	4	0.3112
3 : 56505270 : SNP	t	c	0.9595	0.0061	0.9483	0.9661	0.0125	0.0234	0.5932	+-??+	0.0	0.658	2	0.7197
7 : 122939573 : SNP	a	c	0.8615	0.0049	0.8557	0.8684	-0.0203	0.0125	0.1053	---+-	0.0	1.128	4	0.8898
19 : 57256110 : SNP	a	g	0.9063	0.0111	0.8965	0.9266	0.0126	0.0187	0.4984	++?--	0.0	1.010	3	0.7988
16 : 52752312 : SNP	t	c	0.8991	0.0094	0.8899	0.9271	0.0169	0.0146	0.2491	++++-	27.2	5.492	4	0.2404
5 : 66214867 : SNP	a	g	0.0127	0.0000	0.0127	0.0127	0.0060	0.0536	0.9108	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 17215412 : SNP	c	g	0.6497	0.0020	0.6477	0.6576	0.0077	0.0089	0.3901	-+-++	68.1	12.536	4	0.01378
2 : 137616430 : SNP	a	g	0.0291	0.0000	0.0291	0.0291	0.0050	0.0435	0.9084	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 79367398 : SNP	a	g	0.1140	0.0045	0.1100	0.1230	0.0009	0.0138	0.9461	+--+-	0.0	3.029	4	0.5531
16 : 84972110 : SNP	t	g	0.0213	0.0000	0.0213	0.0213	0.0110	0.0455	0.8089	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 532632 : SNP	a	g	0.1695	0.0097	0.1431	0.1901	-0.0016	0.0140	0.9066	-+++-	51.6	8.262	4	0.08243
3 : 194709655 : SNP	t	c	0.3562	0.0300	0.3362	0.4168	0.0221	0.0090	0.01449	+++++	0.0	0.960	4	0.9158
11 : 24637870 : SNP	a	g	0.8345	0.0081	0.8190	0.8533	0.0076	0.0114	0.5036	+--+-	0.0	3.336	4	0.5033
6 : 3402435 : SNP	c	g	0.2807	0.0110	0.2721	0.3089	-0.0136	0.0106	0.1993	+-++-	50.6	8.100	4	0.08799
4 : 172544520 : SNP	a	g	0.0463	0.0047	0.0404	0.0503	-0.0093	0.0216	0.6665	-+??-	0.0	0.565	2	0.7538
12 : 109895228 : SNP	t	c	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	-0.0100	0.0596	0.8668	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 94722893 : SNP	a	g	0.5259	0.0162	0.4861	0.5351	0.0162	0.0085	0.05763	+-+-+	8.3	4.361	4	0.3594
21 : 25178702 : SNP	t	c	0.7854	0.0168	0.7553	0.8062	0.0002	0.0106	0.9877	---+-	24.0	5.263	4	0.2613
3 : 13443516 : SNP	a	g	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	0.1070	0.0465	0.02139	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 71618523 : INDEL	d	r	0.9336	0.0035	0.9241	0.9357	-0.0046	0.0235	0.8457	-??++	0.0	0.983	2	0.6116
22 : 34070266 : SNP	a	c	0.5402	0.0032	0.5331	0.5452	-0.0040	0.0087	0.6461	----+	57.3	9.378	4	0.05231
15 : 93457961 : SNP	a	t	0.7722	0.0129	0.7300	0.7967	-0.0073	0.0101	0.4679	-+--+	60.8	10.216	4	0.03695
15 : 26438502 : SNP	t	g	0.0410	0.0009	0.0397	0.0417	-0.0022	0.0275	0.9366	-+???	0.0	0.330	1	0.5657
7 : 13656136 : SNP	t	c	0.2685	0.0073	0.2618	0.2781	0.0098	0.0097	0.3146	-++-+	59.0	9.759	4	0.04469
2 : 181808128 : SNP	a	g	0.7331	0.0051	0.7267	0.7526	0.0065	0.0104	0.53	++---	0.0	3.784	4	0.436
4 : 164014608 : INDEL	d	r	0.3092	0.0145	0.2829	0.3265	-0.0097	0.0143	0.4981	-+--+	0.0	1.702	4	0.7904
4 : 8242216 : SNP	a	g	0.1864	0.0115	0.1524	0.1966	-0.0294	0.0120	0.01383	---+-	0.0	2.361	4	0.6697
7 : 18601283 : INDEL	d	r	0.5511	0.0062	0.5296	0.5597	-0.0069	0.0098	0.4806	-++-+	0.0	1.532	4	0.8209
10 : 37216536 : SNP	t	c	0.9311	0.0046	0.9144	0.9336	-0.0020	0.0173	0.9067	-+?++	0.0	2.755	3	0.431
19 : 32979877 : SNP	c	g	0.3808	0.0167	0.3613	0.4324	-0.0113	0.0091	0.2152	--+-+	0.0	3.714	4	0.4461
16 : 26454742 : SNP	t	c	0.5946	0.0049	0.5839	0.6094	-0.0045	0.0085	0.601	0-+--	0.0	2.733	4	0.6035
6 : 91059358 : SNP	t	c	0.5144	0.0144	0.4686	0.5397	0.0016	0.0086	0.8502	--++-	61.1	10.278	4	0.03599
9 : 130344739 : SNP	t	c	0.0240	0.0000	0.0240	0.0240	-0.0320	0.0394	0.417	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 42608442 : SNP	t	c	0.9125	0.0119	0.8918	0.9250	-0.0057	0.0279	0.8373	-??-+	0.0	0.473	2	0.7892
19 : 24224668 : SNP	a	g	0.1686	0.0109	0.1517	0.1798	-0.0082	0.0129	0.5231	-+---	20.7	5.045	4	0.2828
4 : 137206602 : SNP	t	c	0.3681	0.0196	0.3454	0.4074	-0.0073	0.0087	0.3982	-++--	46.3	7.452	4	0.1138
1 : 30191649 : SNP	t	c	0.5985	0.0173	0.5761	0.6320	-0.0041	0.0089	0.6492	-+---	0.0	0.207	4	0.995
1 : 205582251 : SNP	a	g	0.0674	0.0024	0.0619	0.0693	-0.0538	0.0178	0.002495	--?--	0.0	0.769	3	0.857
18 : 25808191 : SNP	c	g	0.6884	0.0129	0.6661	0.7137	-0.0019	0.0092	0.8404	+-+--	0.0	2.778	4	0.5956
13 : 38823634 : SNP	a	g	0.3494	0.0244	0.3186	0.3906	0.0018	0.0103	0.8573	-+--+	0.0	1.899	4	0.7543
16 : 13897896 : SNP	t	g	0.8190	0.0115	0.7997	0.8327	0.0042	0.0136	0.7573	-+-++	0.0	2.099	4	0.7176
1 : 44037124 : SNP	t	c	0.0859	0.0062	0.0809	0.0942	-0.0012	0.0155	0.9377	--?++	0.0	1.323	3	0.7236
7 : 108724908 : SNP	t	c	0.7544	0.0132	0.7307	0.7744	0.0027	0.0107	0.8007	+----	36.8	6.331	4	0.1758
6 : 159591261 : SNP	a	c	0.5125	0.0091	0.4963	0.5244	0.0088	0.0087	0.3095	++-++	2.5	4.103	4	0.3923
7 : 8867945 : SNP	a	t	0.0393	0.0018	0.0380	0.0434	0.0113	0.0231	0.6265	-+??-	52.0	4.167	2	0.1245
14 : 47766421 : SNP	t	c	0.2909	0.0093	0.2839	0.3245	0.0020	0.0093	0.8276	+-+--	0.0	2.117	4	0.7143
14 : 25188345 : SNP	c	g	0.2481	0.0054	0.2360	0.2590	0.0092	0.0099	0.3522	-+-++	43.9	7.125	4	0.1294
4 : 3016928 : SNP	a	t	0.9753	0.0000	0.9753	0.9753	0.0730	0.0394	0.06407	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 116639441 : SNP	a	g	0.0157	0.0000	0.0157	0.0157	-0.0400	0.0607	0.5096	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 12392539 : SNP	t	c	0.5254	0.0135	0.5133	0.5601	-0.0010	0.0085	0.9106	++---	24.9	5.325	4	0.2556
2 : 40272368 : SNP	t	g	0.8443	0.0063	0.8283	0.8551	-0.0005	0.0119	0.966	0-+-+	0.0	1.601	4	0.8086
2 : 124542082 : SNP	t	c	0.0469	0.0124	0.0375	0.0669	-0.0148	0.0240	0.5369	-+?+-	0.0	1.602	3	0.6589
12 : 19995503 : SNP	a	g	0.7004	0.0065	0.6771	0.7118	-0.0000	0.0092	0.9963	-+-+-	0.0	0.698	4	0.9515
7 : 70282094 : SNP	c	g	0.1926	0.0142	0.1790	0.2280	0.0095	0.0110	0.3871	++++-	0.0	0.839	4	0.9331
6 : 55227593 : SNP	t	c	0.0924	0.0149	0.0576	0.1074	-0.0067	0.0150	0.6526	--+-+	0.0	3.946	4	0.4134
9 : 18299019 : INDEL	i	r	0.0638	0.0059	0.0553	0.0687	-0.0088	0.0202	0.6642	-+??-	42.6	3.483	2	0.1753
2 : 21625719 : SNP	a	c	0.3261	0.0126	0.3137	0.3461	-0.0153	0.0091	0.0919	--+--	0.0	3.935	4	0.4149
11 : 25659086 : INDEL	d	r	0.1598	0.0101	0.1368	0.1647	-0.0230	0.0122	0.05865	--++-	0.0	2.534	4	0.6386
19 : 6343084 : SNP	a	g	0.8652	0.0044	0.8474	0.8680	0.0108	0.0131	0.4094	+++--	0.0	3.636	4	0.4575
19 : 13645456 : INDEL	i	r	0.0248	0.0000	0.0248	0.0248	0.0110	0.0435	0.8002	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 35495734 : SNP	a	t	0.6867	0.0025	0.6841	0.6919	-0.0084	0.0092	0.3585	-0-++	0.0	2.482	4	0.6478
3 : 153296129 : SNP	t	c	0.5797	0.0082	0.5727	0.6052	0.0102	0.0086	0.2349	+++++	0.0	0.488	4	0.9746
20 : 41923171 : SNP	a	c	0.6541	0.0021	0.6518	0.6623	-0.0016	0.0091	0.8649	+--+-	5.4	4.226	4	0.3762
20 : 19512941 : SNP	t	c	0.6673	0.0140	0.6393	0.6921	0.0096	0.0091	0.2944	+--++	10.0	4.446	4	0.3491
3 : 86893593 : INDEL	i	r	0.6285	0.0058	0.6076	0.6352	-0.0033	0.0089	0.7073	-+++-	0.0	2.648	4	0.6184
2 : 174814364 : SNP	t	c	0.1859	0.0113	0.1588	0.2000	-0.0101	0.0112	0.3646	---+-	0.0	2.939	4	0.568
5 : 103696430 : SNP	a	c	0.6528	0.0082	0.6391	0.6705	-0.0028	0.0092	0.7606	-++-+	0.0	1.679	4	0.7946
11 : 130675632 : SNP	t	c	0.1344	0.0127	0.0942	0.1560	-0.0135	0.0132	0.308	---+-	0.0	0.845	4	0.9323
18 : 46901599 : SNP	t	c	0.6364	0.0223	0.5748	0.6581	0.0050	0.0091	0.5828	++--+	48.3	7.730	4	0.102
7 : 26747064 : SNP	t	c	0.5497	0.0203	0.5117	0.6020	0.0035	0.0085	0.6807	+-+++	38.6	6.513	4	0.1639
7 : 117858732 : SNP	a	g	0.9348	0.0037	0.9288	0.9405	0.0199	0.0175	0.2571	+-?++	0.0	1.566	3	0.6672
2 : 21116850 : SNP	a	g	0.1536	0.0242	0.1369	0.2138	-0.0055	0.0127	0.6661	+-++-	0.0	1.499	4	0.8269
1 : 202799173 : SNP	t	c	0.9794	0.0000	0.9794	0.9794	-0.0210	0.0445	0.6368	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 74589604 : INDEL	i	r	0.1496	0.0177	0.1024	0.1613	-0.0104	0.0123	0.3969	--+++	0.0	2.816	4	0.5891
6 : 31518707 : SNP	a	g	0.0286	0.0045	0.0254	0.0349	-0.0464	0.0379	0.221	-???-	61.4	2.592	1	0.1074
4 : 65520423 : SNP	t	c	0.5275	0.0205	0.4995	0.5676	0.0020	0.0085	0.8099	+-+--	16.9	4.812	4	0.3072
2 : 200454560 : SNP	a	g	0.1733	0.0037	0.1678	0.1801	-0.0001	0.0113	0.9952	+--+-	66.2	11.824	4	0.01871
11 : 6401598 : SNP	c	g	0.9248	0.0094	0.9065	0.9371	-0.0091	0.0187	0.6258	0+?--	0.0	0.811	3	0.8468
16 : 85843825 : SNP	a	g	0.1377	0.0085	0.1296	0.1584	0.0139	0.0124	0.2623	+++-+	0.0	2.303	4	0.6803
8 : 30254151 : INDEL	d	r	0.2859	0.0043	0.2770	0.2931	-0.0080	0.0105	0.447	-++-+	0.0	3.705	4	0.4474
5 : 156861599 : SNP	a	c	0.1347	0.0170	0.0961	0.1514	-0.0088	0.0128	0.4925	--+++	0.0	0.934	4	0.9196
8 : 133162392 : SNP	c	g	0.4612	0.0169	0.4454	0.4952	0.0060	0.0085	0.4852	++--+	0.0	3.877	4	0.4229
12 : 117272047 : SNP	a	g	0.9542	0.0040	0.9467	0.9590	0.0023	0.0226	0.9199	--??+	0.0	0.314	2	0.8549
21 : 17148103 : SNP	t	c	0.1338	0.0124	0.0872	0.1393	0.0097	0.0131	0.4573	++?+-	0.0	1.887	3	0.5962
2 : 192657268 : SNP	a	g	0.1204	0.0053	0.1125	0.1306	-0.0020	0.0134	0.8824	---++	8.3	4.362	4	0.3593
1 : 6015949 : SNP	c	g	0.1792	0.0103	0.1735	0.2106	-0.0109	0.0112	0.3266	--+-+	0.0	1.746	4	0.7824
2 : 235083516 : SNP	t	c	0.1557	0.0163	0.1153	0.1631	0.0054	0.0118	0.6467	+++--	9.2	4.406	4	0.3538
5 : 101666948 : SNP	a	g	0.0189	0.0000	0.0189	0.0189	0.0310	0.0465	0.505	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 82094954 : SNP	t	c	0.0391	0.0011	0.0367	0.0401	-0.0035	0.0228	0.8791	-+??+	21.4	2.545	2	0.2801
12 : 3607689 : SNP	a	g	0.9052	0.0146	0.8778	0.9251	0.0235	0.0185	0.2038	-+++-	28.0	5.556	4	0.2348
1 : 82824231 : SNP	a	g	0.3827	0.0156	0.3550	0.4161	0.0058	0.0091	0.5225	++-+-	0.0	1.880	4	0.7579
13 : 87233655 : SNP	a	g	0.9881	0.0000	0.9881	0.9881	0.0320	0.0627	0.6096	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 36656310 : SNP	t	c	0.1188	0.0067	0.1120	0.1267	0.0247	0.0140	0.0774	++?-+	0.0	1.591	3	0.6615
9 : 88162715 : SNP	a	t	0.0199	0.0000	0.0199	0.0199	-0.0170	0.0516	0.7416	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 86966103 : SNP	a	g	0.4457	0.0113	0.4120	0.4514	0.0017	0.0085	0.8401	-++-+	0.0	0.695	4	0.952
12 : 95744249 : SNP	c	g	0.5158	0.0236	0.4917	0.5629	0.0003	0.0089	0.9702	0+-+-	0.0	1.779	4	0.7762
3 : 64754838 : SNP	a	g	0.0379	0.0054	0.0331	0.0472	0.0045	0.0237	0.8485	-+??+	45.5	3.669	2	0.1597
3 : 190976302 : SNP	a	g	0.4591	0.0082	0.4436	0.4658	-0.0046	0.0093	0.6235	---0+	0.0	3.589	4	0.4645
16 : 78342142 : SNP	a	g	0.1204	0.0056	0.1148	0.1300	-0.0007	0.0132	0.9549	+-++-	73.5	15.107	4	0.004485
17 : 25495380 : SNP	t	c	0.0421	0.0019	0.0405	0.0444	-0.0347	0.0242	0.1515	--???	0.0	0.149	1	0.6998
6 : 37593018 : SNP	t	c	0.7408	0.0131	0.7194	0.7592	-0.0001	0.0101	0.9947	--++-	0.0	1.327	4	0.8568
20 : 22131531 : SNP	t	g	0.0385	0.0005	0.0381	0.0391	-0.0005	0.0249	0.9828	-+???	69.6	3.294	1	0.06954
5 : 115344826 : SNP	c	g	0.0495	0.0046	0.0382	0.0524	0.0146	0.0210	0.4869	-+??+	5.9	2.125	2	0.3456
3 : 74814530 : SNP	t	c	0.1690	0.0084	0.1486	0.1800	-0.0063	0.0118	0.5915	-+--+	0.0	0.864	4	0.9297
16 : 74927058 : SNP	a	g	0.7646	0.0190	0.7247	0.7811	-0.0044	0.0104	0.6728	+-++-	22.0	5.129	4	0.2743
2 : 141893729 : SNP	a	g	0.0365	0.0000	0.0365	0.0365	-0.0120	0.0556	0.8291	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 57143728 : SNP	t	c	0.7171	0.0128	0.6771	0.7239	0.0006	0.0123	0.9581	--+-+	0.0	3.515	4	0.4756
1 : 7001240 : SNP	a	c	0.3721	0.0087	0.3550	0.3843	0.0077	0.0092	0.398	++++-	0.0	1.801	4	0.7722
13 : 114059507 : SNP	a	c	0.0999	0.0134	0.0632	0.1084	-0.0244	0.0164	0.1364	--+--	11.3	4.508	4	0.3416
5 : 49572352 : SNP	a	g	0.3470	0.0168	0.2840	0.3545	-0.0048	0.0113	0.6725	+--+?	0.0	0.948	3	0.8137
17 : 60762523 : INDEL	d	r	0.9728	0.0000	0.9728	0.9728	0.0510	0.0505	0.313	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 8617982 : SNP	a	g	0.8113	0.0047	0.7974	0.8168	-0.0197	0.0108	0.06955	--+-+	62.8	10.763	4	0.02937
7 : 24641278 : SNP	t	g	0.0618	0.0049	0.0536	0.0684	-0.0303	0.0180	0.09313	--?--	4.3	3.134	3	0.3714
9 : 25348660 : SNP	a	g	0.7268	0.0145	0.7203	0.7609	0.0098	0.0095	0.3002	+-+++	0.0	1.104	4	0.8937
3 : 35553658 : SNP	a	c	0.0263	0.0007	0.0258	0.0272	-0.0213	0.0300	0.4763	--???	0.0	0.410	1	0.522
5 : 479746 : SNP	c	g	0.2091	0.0270	0.1818	0.2854	-0.0040	0.0111	0.722	++---	0.0	1.852	4	0.763
3 : 193959351 : SNP	a	g	0.8715	0.0233	0.8245	0.8995	-0.0835	0.0316	0.008312	??-+-	32.0	2.941	2	0.2298
11 : 115102758 : SNP	t	c	0.4849	0.0067	0.4717	0.4992	-0.0156	0.0086	0.06853	--++-	60.3	10.081	4	0.03908
10 : 54306700 : SNP	a	g	0.8399	0.0061	0.8212	0.8450	-0.0004	0.0119	0.9745	--+++	44.1	7.160	4	0.1277
1 : 193184051 : SNP	c	g	0.9899	0.0000	0.9899	0.9899	-0.0810	0.0607	0.1817	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 69280338 : SNP	c	g	0.7085	0.0115	0.6947	0.7279	-0.0043	0.0095	0.6483	+--++	0.0	1.202	4	0.8777
15 : 66359605 : SNP	t	c	0.4677	0.0186	0.4279	0.4923	0.0085	0.0106	0.4241	++-+-	33.5	6.016	4	0.1979
6 : 105004233 : SNP	a	g	0.0675	0.0098	0.0544	0.0832	-0.0160	0.0179	0.3711	--?-+	54.6	6.612	3	0.08534
14 : 44507296 : SNP	a	t	0.8851	0.0081	0.8749	0.9014	-0.0192	0.0135	0.1559	-+---	0.0	3.259	4	0.5154
1 : 172803005 : SNP	a	g	0.4780	0.0201	0.4311	0.4929	0.0072	0.0093	0.4428	-++++	0.0	3.500	4	0.4779
6 : 117083720 : SNP	a	g	0.5766	0.0157	0.5412	0.5858	-0.0035	0.0085	0.6782	+----	25.1	5.337	4	0.2544
17 : 68403919 : SNP	a	g	0.1386	0.0227	0.1216	0.1815	-0.0114	0.0126	0.3649	--+++	33.3	5.996	4	0.1995
4 : 13221390 : SNP	t	c	0.1323	0.0079	0.1266	0.1498	0.0005	0.0126	0.9653	---++	71.2	13.904	4	0.007608
20 : 6302328 : SNP	t	c	0.2530	0.0139	0.2443	0.2966	0.0033	0.0116	0.7777	+--++	45.3	7.314	4	0.1202
13 : 64769713 : SNP	t	c	0.5095	0.0064	0.5009	0.5303	0.0233	0.0086	0.00648	+++++	0.0	0.706	4	0.9506
18 : 55139007 : SNP	c	g	0.7692	0.0050	0.7543	0.7744	-0.0081	0.0100	0.4182	-0-++	48.4	7.745	4	0.1014
6 : 150170444 : SNP	t	c	0.6604	0.0091	0.6217	0.6675	0.0086	0.0091	0.3466	+++++	0.0	2.990	4	0.5595
7 : 31030833 : SNP	a	c	0.7686	0.0079	0.7532	0.7833	0.0084	0.0105	0.4223	+++-+	0.0	1.716	4	0.7878
2 : 14393315 : SNP	a	g	0.9844	0.0000	0.9844	0.9844	0.0130	0.0505	0.797	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 30558257 : SNP	t	c	0.7915	0.0075	0.7826	0.8061	0.0097	0.0107	0.3659	+-+++	0.0	1.232	4	0.8728
11 : 17441228 : SNP	a	g	0.8400	0.0039	0.8303	0.8524	-0.0017	0.0113	0.8839	+++--	28.7	5.611	4	0.2302
10 : 50563608 : SNP	a	g	0.8997	0.0073	0.8913	0.9112	-0.0112	0.0144	0.4351	--+--	0.0	0.972	4	0.9139
19 : 17496141 : SNP	a	g	0.9574	0.0076	0.9437	0.9624	0.0063	0.0236	0.7894	++?-+	0.0	0.245	3	0.9701
4 : 109340315 : SNP	a	g	0.9627	0.0004	0.9622	0.9633	-0.0061	0.0239	0.8	-+??-	0.0	0.376	2	0.8287
10 : 38335947 : SNP	a	g	0.7595	0.0062	0.7532	0.7788	-0.0066	0.0106	0.535	---+?	0.0	0.649	3	0.8852
8 : 34559226 : INDEL	d	r	0.0124	0.0000	0.0124	0.0124	-0.0880	0.0556	0.1135	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 33885892 : SNP	a	t	0.8282	0.0128	0.8010	0.8462	0.0069	0.0134	0.6041	-+++-	36.6	6.309	4	0.1772
18 : 77679862 : SNP	t	c	0.1026	0.0000	0.1026	0.1026	0.0950	0.0549	0.08356	????+	0.0	0.000	0	1
11 : 60269240 : SNP	t	c	0.6543	0.0128	0.6292	0.6777	0.0064	0.0092	0.4862	-++++	0.0	2.652	4	0.6177
22 : 34441255 : SNP	t	c	0.9127	0.0060	0.8990	0.9213	0.0108	0.0159	0.4979	-+?++	16.9	3.610	3	0.3067
11 : 258542 : SNP	c	g	0.7865	0.0105	0.7625	0.7978	0.0111	0.0104	0.2858	+++++	0.0	0.743	4	0.9459
21 : 23381124 : INDEL	d	r	0.0352	0.0014	0.0341	0.0369	-0.0333	0.0281	0.2353	--???	0.0	0.766	1	0.3814
2 : 86360916 : SNP	c	g	0.9551	0.0110	0.9340	0.9633	0.0450	0.0216	0.03745	++?+-	0.0	2.697	3	0.4407
2 : 219978586 : INDEL	i	r	0.1045	0.0076	0.0987	0.1198	-0.0206	0.0138	0.1368	-+---	0.0	2.670	4	0.6144
9 : 91675655 : SNP	a	g	0.9293	0.0073	0.9212	0.9371	-0.0138	0.0172	0.4233	--?+-	26.3	4.070	3	0.254
2 : 33017179 : SNP	a	g	0.9551	0.0026	0.9501	0.9572	-0.0439	0.0229	0.05478	--??-	60.7	5.092	2	0.07841
20 : 40826611 : SNP	a	g	0.3756	0.0149	0.3662	0.4103	-0.0034	0.0087	0.6963	-++--	0.0	0.799	4	0.9386
7 : 92581255 : INDEL	i	r	0.0764	0.0064	0.0595	0.0800	0.0219	0.0192	0.2538	++?-+	0.0	0.756	3	0.86
1 : 118965254 : SNP	a	c	0.8338	0.0068	0.8185	0.8401	0.0085	0.0118	0.4709	0--++	48.7	7.796	4	0.09936
13 : 38317781 : SNP	t	c	0.5099	0.0101	0.5004	0.5219	-0.0038	0.0086	0.6582	-++-+	0.0	3.550	4	0.4703
13 : 23964095 : SNP	a	g	0.5172	0.0064	0.5030	0.5306	0.0044	0.0085	0.6054	+--0-	0.0	3.147	4	0.5336
18 : 4458933 : SNP	a	g	0.1319	0.0042	0.1276	0.1459	-0.0132	0.0131	0.3123	-+++-	52.0	8.327	4	0.08031
7 : 16989848 : SNP	a	g	0.7996	0.0214	0.7560	0.8166	-0.0044	0.0105	0.6761	+---+	38.3	6.485	4	0.1657
20 : 52687027 : SNP	t	c	0.0330	0.0042	0.0294	0.0378	0.0637	0.0275	0.02058	++???	0.0	0.685	1	0.408
6 : 103693934 : SNP	t	c	0.0330	0.0002	0.0328	0.0335	-0.0074	0.0249	0.7653	--??+	0.0	0.457	2	0.7959
2 : 38956947 : SNP	a	g	0.4176	0.0192	0.3760	0.4304	0.0015	0.0092	0.8658	-+++-	0.0	1.022	4	0.9064
3 : 185057751 : SNP	t	g	0.1569	0.0041	0.1478	0.1590	0.0031	0.0116	0.7917	+----	30.2	5.729	4	0.2203
17 : 48490945 : SNP	t	c	0.3059	0.0259	0.2754	0.3566	-0.0071	0.0097	0.4658	-+---	0.0	2.671	4	0.6144
8 : 77468003 : SNP	a	g	0.8609	0.0245	0.8123	0.8797	0.0173	0.0124	0.1616	+++-+	61.0	10.250	4	0.03641
8 : 108218482 : SNP	a	g	0.1639	0.0051	0.1423	0.1771	0.0055	0.0113	0.63	+--++	9.3	4.412	4	0.3532
6 : 83157254 : SNP	t	c	0.5027	0.0178	0.4672	0.5237	-0.0029	0.0085	0.7341	+----	0.0	1.895	4	0.755
2 : 31935144 : SNP	a	g	0.0147	0.0000	0.0147	0.0147	-0.0460	0.0516	0.3723	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 51348572 : SNP	t	g	0.4891	0.0051	0.4846	0.5060	0.0051	0.0091	0.5744	+0---	0.0	1.294	4	0.8623
7 : 22417214 : SNP	a	g	0.3903	0.0190	0.3523	0.4045	0.0197	0.0086	0.02161	+-+++	0.0	3.491	4	0.4792
2 : 128314484 : SNP	t	c	0.8650	0.0049	0.8500	0.8700	0.0114	0.0128	0.3753	++++-	29.2	5.649	4	0.227
7 : 150043222 : INDEL	i	r	0.0470	0.0021	0.0442	0.0486	-0.0130	0.0283	0.6465	-+???	0.0	0.180	1	0.671
4 : 66950272 : SNP	a	g	0.9574	0.0003	0.9572	0.9578	-0.0240	0.0259	0.3527	-+???	0.0	0.762	1	0.3826
14 : 72829979 : SNP	a	g	0.8837	0.0045	0.8792	0.8957	-0.0205	0.0135	0.1277	---++	42.7	6.985	4	0.1367
11 : 22753749 : SNP	a	g	0.8396	0.0067	0.8322	0.8546	0.0041	0.0114	0.7166	--+-+	59.8	9.940	4	0.04145
7 : 13577494 : SNP	a	g	0.7462	0.0135	0.7153	0.7631	0.0080	0.0099	0.4206	+++-+	0.0	0.605	4	0.9625
8 : 82569849 : SNP	t	c	0.9763	0.0000	0.9763	0.9763	0.0250	0.0414	0.5464	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 8215475 : SNP	a	g	0.2824	0.0211	0.2512	0.2997	-0.0149	0.0116	0.201	--+--	0.0	2.295	4	0.6817
2 : 103589097 : SNP	a	g	0.2092	0.0156	0.1706	0.2175	0.0019	0.0114	0.8686	-++-+	0.0	1.580	4	0.8124
2 : 101302144 : SNP	t	c	0.1612	0.0117	0.1316	0.1684	0.0033	0.0115	0.7706	+-++-	19.8	4.990	4	0.2883
9 : 113297928 : SNP	t	g	0.7287	0.0071	0.7214	0.7533	-0.0113	0.0098	0.2478	-+---	0.0	1.847	4	0.7639
4 : 109020690 : SNP	a	g	0.2960	0.0087	0.2836	0.3098	-0.0021	0.0129	0.8688	-+-++	0.0	3.677	4	0.4515
3 : 105348346 : SNP	a	g	0.4901	0.0066	0.4757	0.4996	-0.0157	0.0086	0.06639	---+-	0.0	1.857	4	0.762
13 : 63991316 : SNP	t	g	0.4024	0.0067	0.3869	0.4087	-0.0073	0.0086	0.3968	--++-	9.0	4.394	4	0.3553
20 : 16475552 : SNP	t	c	0.7117	0.0102	0.7064	0.7361	-0.0053	0.0093	0.5638	---++	29.6	5.679	4	0.2245
6 : 11715430 : INDEL	d	r	0.1494	0.0116	0.1325	0.1686	0.0073	0.0122	0.5533	+-+-+	0.0	3.438	4	0.4873
6 : 5634657 : SNP	t	c	0.5426	0.0209	0.4975	0.5543	0.0007	0.0086	0.9331	+-+-+	0.0	3.562	4	0.4685
14 : 50769868 : SNP	a	g	0.4214	0.0115	0.3937	0.4437	0.0074	0.0091	0.4122	++--+	0.0	1.443	4	0.8366
4 : 168707666 : SNP	a	g	0.8451	0.0109	0.8216	0.8534	0.0071	0.0119	0.5532	++++-	41.9	6.883	4	0.1422
14 : 32766733 : SNP	t	c	0.0643	0.0013	0.0618	0.0654	0.0371	0.0225	0.09904	+-??-	64.8	5.689	2	0.05817
13 : 56281271 : SNP	a	c	0.8094	0.0147	0.7996	0.8505	0.0116	0.0108	0.2848	-++-+	0.0	3.417	4	0.4907
11 : 43827251 : SNP	t	c	0.0147	0.0000	0.0147	0.0147	0.0780	0.0546	0.153	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 131429452 : SNP	t	c	0.3182	0.0045	0.3104	0.3278	0.0006	0.0092	0.9482	++---	75.5	16.354	4	0.002579
4 : 151307398 : SNP	a	c	0.4261	0.0150	0.4024	0.4646	-0.0122	0.0085	0.1519	--+-+	72.2	14.369	4	0.006206
6 : 73092252 : SNP	a	c	0.2288	0.0072	0.2117	0.2339	0.0064	0.0101	0.5243	++++-	0.0	0.924	4	0.9211
20 : 39740098 : SNP	a	c	0.1551	0.0052	0.1382	0.1594	-0.0020	0.0115	0.8615	+-++-	68.4	12.656	4	0.01309
2 : 112550800 : SNP	t	c	0.9449	0.0000	0.9449	0.9449	0.0271	0.0582	0.6415	????+	0.0	0.000	0	1
5 : 119975772 : SNP	a	g	0.9154	0.0035	0.9087	0.9196	-0.0054	0.0158	0.7348	-+?-+	46.0	5.556	3	0.1353
4 : 10072221 : SNP	t	g	0.0747	0.0072	0.0539	0.0799	-0.0142	0.0199	0.4758	--?+-	0.0	0.556	3	0.9065
10 : 84995832 : SNP	t	c	0.6600	0.0096	0.6354	0.6712	0.0035	0.0092	0.7058	++-+-	0.0	0.826	4	0.9349
11 : 55477937 : SNP	t	g	0.9157	0.0043	0.9106	0.9257	0.0207	0.0168	0.2173	++?+?	34.6	3.060	2	0.2165
6 : 70902273 : SNP	a	g	0.9874	0.0000	0.9874	0.9874	0.0540	0.0607	0.3733	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 139825002 : SNP	t	c	0.0386	0.0097	0.0344	0.0611	-0.1062	0.0325	0.001082	-??-?	30.6	1.441	1	0.23
11 : 79968111 : SNP	a	t	0.9329	0.0042	0.9303	0.9440	-0.0046	0.0178	0.7948	--?++	38.9	4.911	3	0.1784
11 : 97124297 : SNP	a	c	0.0727	0.0092	0.0561	0.0879	0.0018	0.0167	0.9128	+-++-	59.0	9.767	4	0.04454
5 : 33451144 : SNP	a	g	0.0433	0.0020	0.0417	0.0474	-0.0070	0.0220	0.7499	--??-	0.0	0.086	2	0.9578
9 : 125623626 : SNP	a	g	0.0425	0.0067	0.0366	0.0560	-0.0232	0.0232	0.3169	--??+	0.0	1.871	2	0.3924
10 : 7571265 : INDEL	i	r	0.2990	0.0271	0.2789	0.3424	0.0030	0.0116	0.7924	+-+-+	0.0	3.918	4	0.4173
1 : 236315377 : SNP	t	c	0.1473	0.0147	0.1131	0.1805	-0.0181	0.0122	0.1394	----+	0.0	3.434	4	0.4879
15 : 95314489 : SNP	a	t	0.5832	0.0117	0.5666	0.6069	0.0106	0.0085	0.2135	++-+-	21.6	5.105	4	0.2767
13 : 83404375 : SNP	c	g	0.9621	0.0000	0.9621	0.9621	-0.0060	0.0354	0.8653	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 103042298 : SNP	a	g	0.2959	0.0095	0.2653	0.3071	0.0025	0.0092	0.7822	+-+-+	0.0	3.472	4	0.4821
5 : 11204656 : SNP	a	g	0.9005	0.0068	0.8906	0.9176	-0.0204	0.0145	0.1594	--+-0	0.0	3.321	4	0.5056
13 : 107949576 : SNP	a	g	0.9489	0.0194	0.9188	0.9657	0.0108	0.0222	0.6284	+0?--	0.0	0.578	3	0.9014
3 : 46944699 : SNP	a	g	0.0203	0.0000	0.0203	0.0203	-0.0790	0.0505	0.118	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 130068280 : SNP	a	g	0.1377	0.0061	0.1215	0.1508	0.0011	0.0134	0.9343	-++--	12.4	4.565	4	0.3349
17 : 77411010 : SNP	c	g	0.9617	0.0000	0.9617	0.9617	-0.0290	0.0526	0.5812	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 30270833 : SNP	t	g	0.9588	0.0024	0.9566	0.9617	-0.0212	0.0232	0.3611	--??-	0.0	0.792	2	0.6731
21 : 38331792 : SNP	t	c	0.1686	0.0131	0.1554	0.1992	-0.0188	0.0116	0.105	---+-	25.9	5.400	4	0.2487
5 : 172271848 : SNP	c	g	0.8561	0.0084	0.8397	0.8624	-0.0194	0.0126	0.1226	---+-	0.0	0.629	4	0.9598
14 : 65907179 : INDEL	i	r	0.0380	0.0000	0.0380	0.0380	-0.0040	0.0435	0.9267	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 23802400 : SNP	t	c	0.1885	0.0178	0.1594	0.2058	-0.0091	0.0166	0.5851	+---+	66.5	11.936	4	0.01783
1 : 4309034 : SNP	a	t	0.6878	0.0126	0.6690	0.7002	0.0101	0.0092	0.2681	+++-+	0.0	2.663	4	0.6157
9 : 111062515 : SNP	a	g	0.7737	0.0035	0.7623	0.7765	-0.0012	0.0103	0.9098	-+++-	0.0	3.523	4	0.4744
2 : 237751641 : SNP	t	c	0.9251	0.0111	0.9149	0.9380	-0.0133	0.0208	0.5229	--?+-	58.4	7.214	3	0.06539
5 : 10248005 : SNP	a	g	0.8562	0.0114	0.8495	0.8830	-0.0126	0.0128	0.3263	--+--	0.0	1.325	4	0.857
6 : 58731118 : SNP	t	c	0.1454	0.0058	0.1337	0.1489	0.0484	0.0237	0.04084	?+++?	0.0	1.525	2	0.4664
7 : 3144777 : SNP	t	c	0.0472	0.0005	0.0468	0.0483	0.0316	0.0213	0.138	++??+	0.0	0.402	2	0.818
8 : 95856905 : SNP	a	g	0.9594	0.0004	0.9585	0.9597	0.0308	0.0228	0.1762	++??+	0.0	0.311	2	0.8559
11 : 27249688 : SNP	t	c	0.9344	0.0016	0.9287	0.9371	-0.0027	0.0175	0.8768	+-?-+	0.0	1.206	3	0.7517
13 : 53203211 : INDEL	i	r	0.0234	0.0000	0.0234	0.0234	-0.0320	0.0475	0.5006	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 42071474 : SNP	t	c	0.6813	0.0111	0.6552	0.7187	0.0132	0.0092	0.151	++-+-	32.7	5.945	4	0.2033
5 : 173903211 : INDEL	d	r	0.0201	0.0000	0.0201	0.0201	0.0410	0.0445	0.3566	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 9282466 : SNP	t	c	0.9542	0.0030	0.9518	0.9606	0.0136	0.0214	0.5263	++??+	0.0	0.173	2	0.9174
3 : 160642031 : INDEL	i	r	0.2500	0.0056	0.2367	0.2682	0.0015	0.0098	0.8755	-+-+-	0.0	0.657	4	0.9566
2 : 133840542 : SNP	a	g	0.6653	0.0153	0.6535	0.6953	0.0051	0.0092	0.5764	+-+-+	0.0	3.637	4	0.4574
11 : 127801343 : SNP	a	g	0.2799	0.0100	0.2567	0.2890	0.0152	0.0098	0.12	++-++	0.0	2.944	4	0.5672
8 : 132365256 : SNP	t	g	0.7761	0.0201	0.7659	0.8279	-0.0029	0.0106	0.7884	-++++	15.5	4.736	4	0.3154
2 : 67555446 : SNP	t	c	0.6047	0.0076	0.5795	0.6092	0.0033	0.0086	0.6978	0++--	22.4	5.155	4	0.2717
20 : 42679568 : SNP	t	c	0.0322	0.0000	0.0322	0.0322	-0.0160	0.0495	0.7467	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 32835049 : INDEL	i	r	0.5028	0.0155	0.4876	0.5253	-0.0004	0.0105	0.9731	-+-++	0.0	1.643	4	0.801
4 : 22545295 : SNP	a	c	0.6478	0.0060	0.6262	0.6567	-0.0147	0.0091	0.1066	---+-	16.7	4.801	4	0.3083
7 : 52307512 : SNP	t	c	0.9660	0.0008	0.9654	0.9670	0.0290	0.0266	0.2756	++???	0.0	0.040	1	0.8422
10 : 119297830 : SNP	a	g	0.0305	0.0001	0.0304	0.0306	-0.0215	0.0283	0.4478	+-???	40.0	1.667	1	0.1966
3 : 43840903 : SNP	t	c	0.0848	0.0075	0.0622	0.0933	-0.0069	0.0158	0.6648	+-?--	17.7	3.646	3	0.3023
4 : 108262817 : SNP	t	c	0.1571	0.0132	0.1259	0.1644	-0.0106	0.0117	0.3679	-+++-	65.1	11.464	4	0.02182
6 : 95150970 : SNP	t	c	0.8861	0.0094	0.8586	0.8969	0.0173	0.0138	0.2103	++---	12.2	4.554	4	0.3362
2 : 33045155 : SNP	t	g	0.9262	0.0059	0.9162	0.9320	-0.0062	0.0169	0.7135	+-?+-	53.7	6.474	3	0.09069
7 : 45620286 : SNP	a	g	0.0244	0.0000	0.0244	0.0244	-0.0480	0.0435	0.2695	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 138427475 : SNP	t	c	0.2642	0.0317	0.2397	0.3253	0.0135	0.0112	0.2262	+--++	0.0	2.492	4	0.6461
2 : 122707978 : SNP	t	c	0.1139	0.0066	0.1071	0.1300	0.0005	0.0160	0.9727	+-+-+	18.6	4.912	4	0.2964
1 : 66930150 : SNP	a	c	0.0666	0.0070	0.0466	0.0698	-0.0061	0.0182	0.7389	+-??-	0.0	0.306	2	0.8582
14 : 34628468 : SNP	a	c	0.0230	0.0000	0.0230	0.0230	0.0430	0.0414	0.2995	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 53504560 : SNP	a	g	0.3245	0.0200	0.2928	0.3720	-0.0017	0.0092	0.8505	0++--	0.0	1.257	4	0.8686
8 : 131368334 : INDEL	d	r	0.2904	0.0096	0.2729	0.3240	-0.0018	0.0094	0.8476	-+++-	2.3	4.096	4	0.3932
4 : 39706362 : SNP	a	g	0.9426	0.0054	0.9392	0.9570	0.0150	0.0191	0.4312	++??-	82.5	11.401	2	0.003344
7 : 2709471 : SNP	t	c	0.1201	0.0115	0.1088	0.1402	0.0097	0.0136	0.4757	+--++	53.6	8.616	4	0.07145
1 : 245965136 : SNP	a	c	0.9638	0.0000	0.9638	0.9638	0.1170	0.0546	0.03208	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 10318112 : SNP	a	t	0.9890	0.0000	0.9890	0.9890	-0.0490	0.0596	0.4113	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 21136610 : SNP	t	c	0.6003	0.0212	0.5551	0.6153	-0.0113	0.0090	0.2082	+----	0.0	3.600	4	0.4629
3 : 134657852 : SNP	t	c	0.0971	0.0075	0.0825	0.1064	-0.0140	0.0145	0.3371	--+++	53.5	8.610	4	0.07162
1 : 108743514 : SNP	c	g	0.9306	0.0036	0.9239	0.9341	-0.0009	0.0188	0.9609	--?+-	0.0	2.057	3	0.5606
2 : 237840437 : SNP	a	g	0.0981	0.0159	0.0876	0.1399	0.0039	0.0143	0.7842	+---+	0.0	1.886	4	0.7567
15 : 46220005 : SNP	t	c	0.9752	0.0025	0.9721	0.9772	0.0046	0.0314	0.8848	++???	0.0	0.020	1	0.8887
5 : 64786168 : SNP	c	g	0.3810	0.0293	0.3610	0.4408	0.0119	0.0090	0.1877	++++-	4.6	4.191	4	0.3807
1 : 58336349 : SNP	t	c	0.4157	0.0220	0.4034	0.4643	-0.0007	0.0087	0.9386	-0+-+	0.0	2.224	4	0.6946
21 : 26144507 : SNP	a	g	0.0134	0.0000	0.0134	0.0134	0.0450	0.0556	0.4183	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 147476745 : SNP	a	g	0.9676	0.0038	0.9650	0.9733	0.0523	0.0278	0.05949	++???	0.0	0.000	1	0.9867
20 : 9694433 : SNP	a	g	0.6191	0.0121	0.6078	0.6431	0.0078	0.0086	0.3614	++--+	55.6	9.002	4	0.06105
12 : 93392494 : SNP	a	g	0.0262	0.0000	0.0262	0.0262	0.0320	0.0394	0.417	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 158838342 : SNP	a	c	0.3459	0.0084	0.3286	0.3529	0.0063	0.0100	0.5288	+-+++	72.1	14.354	4	0.006246
4 : 23461108 : SNP	t	c	0.6181	0.0102	0.5841	0.6342	0.0089	0.0091	0.3297	+-+-+	2.3	4.095	4	0.3933
2 : 69992546 : SNP	a	g	0.7722	0.0114	0.7634	0.7899	-0.0125	0.0106	0.2402	--+++	1.7	4.068	4	0.3969
8 : 58601077 : SNP	t	c	0.0434	0.0040	0.0376	0.0538	-0.0107	0.0213	0.6151	-+?++	0.0	1.452	3	0.6935
13 : 57986844 : SNP	a	g	0.9799	0.0000	0.9799	0.9799	-0.0150	0.0465	0.747	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 20481452 : SNP	a	c	0.2986	0.0018	0.2956	0.2998	-0.0503	0.0203	0.01334	??+--	45.4	3.665	2	0.16
12 : 27610570 : SNP	a	g	0.2538	0.0133	0.2090	0.2602	0.0035	0.0098	0.7247	+-+-+	0.0	1.546	4	0.8184
5 : 119936128 : SNP	t	c	0.1103	0.0030	0.1027	0.1143	0.0057	0.0135	0.6716	+--+-	53.4	8.576	4	0.07261
9 : 110887338 : SNP	t	c	0.0832	0.0036	0.0771	0.0929	-0.0164	0.0156	0.2932	+----	53.3	8.562	4	0.07304
17 : 9130640 : INDEL	d	r	0.2382	0.0027	0.2288	0.2424	0.0095	0.0101	0.3467	-++++	0.0	2.202	4	0.6987
7 : 121010898 : SNP	t	c	0.1953	0.0178	0.1580	0.2294	-0.0055	0.0109	0.6165	--++-	0.0	0.830	4	0.9343
13 : 25994801 : SNP	a	g	0.7238	0.0235	0.6774	0.7459	0.0061	0.0098	0.5342	++--+	12.0	4.545	4	0.3373
21 : 45176908 : SNP	t	c	0.9734	0.0000	0.9734	0.9734	0.0230	0.0435	0.5967	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 119578788 : SNP	a	t	0.2112	0.0099	0.2020	0.2303	-0.0051	0.0104	0.6247	-+++-	44.5	7.207	4	0.1253
16 : 81286472 : SNP	a	g	0.7714	0.0243	0.7246	0.7903	-0.0136	0.0105	0.1926	--++-	0.0	3.491	4	0.4792
9 : 75184233 : SNP	a	c	0.4841	0.0176	0.4730	0.5383	-0.0051	0.0085	0.5456	+-+--	49.6	7.936	4	0.09394
1 : 149869466 : SNP	a	g	0.0696	0.0056	0.0560	0.0746	0.0097	0.0183	0.5955	+-??+	43.7	3.551	2	0.1694
8 : 47581622 : SNP	a	g	0.9668	0.0000	0.9668	0.9668	-0.0060	0.0344	0.8614	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 69851683 : SNP	t	g	0.8266	0.0076	0.8084	0.8314	-0.0186	0.0112	0.09764	-----	0.0	2.512	4	0.6425
1 : 232320293 : SNP	t	c	0.2984	0.0074	0.2734	0.3040	0.0053	0.0094	0.5739	++--+	0.0	0.401	4	0.9824
13 : 81361666 : SNP	t	c	0.9533	0.0055	0.9410	0.9618	-0.0066	0.0207	0.7502	--?++	18.8	3.695	3	0.2963
11 : 79515007 : INDEL	d	r	0.4259	0.0068	0.4129	0.4379	0.0053	0.0091	0.5581	+++++	0.0	0.308	4	0.9893
3 : 128207423 : SNP	t	c	0.0267	0.0044	0.0227	0.0316	0.0165	0.0308	0.5913	+-???	0.0	0.396	1	0.5289
16 : 82481845 : SNP	c	g	0.9804	0.0000	0.9804	0.9804	0.0340	0.0435	0.4341	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 195601969 : SNP	t	g	0.9059	0.0040	0.8984	0.9104	-0.0009	0.0152	0.952	-+?++	15.6	3.557	3	0.3135
13 : 40273065 : SNP	c	g	0.1085	0.0068	0.0988	0.1230	-0.0301	0.0140	0.03211	-----	0.0	1.417	4	0.8413
6 : 55206187 : SNP	t	c	0.3740	0.0322	0.3466	0.4500	-0.0085	0.0090	0.3453	0----	0.0	1.003	4	0.9093
6 : 158193698 : SNP	a	g	0.7050	0.0188	0.6801	0.7346	-0.0114	0.0132	0.3875	--++-	0.0	1.102	4	0.894
1 : 96763525 : SNP	a	g	0.1245	0.0081	0.1154	0.1407	-0.0009	0.0131	0.9481	+--+-	0.0	2.133	4	0.7114
8 : 103604227 : SNP	a	c	0.9779	0.0000	0.9779	0.9779	0.0640	0.0536	0.2323	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 43677514 : INDEL	i	r	0.0332	0.0000	0.0332	0.0332	-0.0400	0.0516	0.4378	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 159391114 : INDEL	d	r	0.0991	0.0063	0.0847	0.1110	0.0355	0.0145	0.01462	+++++	0.0	1.090	4	0.8958
3 : 24265758 : SNP	a	g	0.1281	0.0086	0.0965	0.1408	-0.0108	0.0129	0.4044	-+---	29.1	5.641	4	0.2276
8 : 73043969 : SNP	t	g	0.5138	0.0093	0.5066	0.5375	0.0006	0.0085	0.9449	++-+-	0.0	1.839	4	0.7653
12 : 12912476 : SNP	t	c	0.9724	0.0000	0.9724	0.9724	0.0630	0.0607	0.2989	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 105469071 : SNP	t	c	0.7215	0.0198	0.7039	0.7777	-0.0008	0.0094	0.9344	+---+	0.0	3.961	4	0.4114
11 : 39676837 : INDEL	d	r	0.1840	0.0171	0.1576	0.2082	0.0095	0.0164	0.5599	+-+++	0.0	2.514	4	0.6422
2 : 53930621 : SNP	a	g	0.1739	0.0096	0.1585	0.1824	0.0123	0.0114	0.281	+-+-+	15.8	4.750	4	0.314
15 : 73704897 : SNP	a	g	0.9497	0.0047	0.9450	0.9611	0.0022	0.0208	0.9171	0+??-	0.0	1.439	2	0.4869
2 : 15041515 : SNP	t	g	0.7351	0.0120	0.7242	0.7624	-0.0070	0.0095	0.4597	-++--	63.1	10.829	4	0.02856
6 : 69108802 : SNP	t	c	0.6702	0.0146	0.6466	0.6903	-0.0009	0.0098	0.9253	--+-+	0.0	1.261	4	0.868
4 : 9684095 : SNP	t	c	0.8570	0.0051	0.8504	0.8684	-0.0242	0.0279	0.3868	??-+-	0.0	0.606	2	0.7387
7 : 20767815 : SNP	t	c	0.3808	0.0143	0.3699	0.4207	-0.0111	0.0086	0.1966	-0-+-	27.3	5.501	4	0.2396
8 : 62673676 : SNP	a	g	0.2188	0.0067	0.2057	0.2288	0.0189	0.0112	0.09041	+++++	0.0	2.216	4	0.6961
1 : 170832682 : SNP	a	g	0.4942	0.0243	0.4442	0.5180	-0.0062	0.0085	0.4686	-----	0.0	1.073	4	0.8986
8 : 75655195 : SNP	a	g	0.7755	0.0105	0.7484	0.7888	0.0101	0.0104	0.3322	+-++-	30.7	5.770	4	0.217
7 : 49518099 : SNP	a	c	0.1822	0.0048	0.1778	0.1952	-0.0032	0.0112	0.7761	---++	0.0	1.877	4	0.7584
2 : 202726656 : SNP	a	g	0.9828	0.0000	0.9828	0.9828	0.0200	0.0495	0.6864	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 43866923 : SNP	t	c	0.9455	0.0076	0.9396	0.9579	0.0218	0.0205	0.286	-+?++	0.0	2.460	3	0.4825
5 : 80544049 : SNP	a	g	0.4055	0.0156	0.3943	0.4400	0.0089	0.0087	0.3044	+++++	0.0	0.786	4	0.9403
10 : 82351068 : SNP	t	c	0.9119	0.0022	0.9068	0.9142	-0.0195	0.0151	0.1976	+----	17.7	4.857	4	0.3022
1 : 174767759 : INDEL	d	r	0.7011	0.0086	0.6925	0.7131	-0.0085	0.0098	0.3835	---+-	0.0	0.869	4	0.9289
19 : 46906404 : SNP	a	g	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	0.0450	0.0596	0.4505	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 124430700 : INDEL	i	r	0.2586	0.0223	0.2117	0.2814	-0.0095	0.0100	0.3407	-----	0.0	1.972	4	0.7409
3 : 50088943 : SNP	a	g	0.4389	0.0110	0.4171	0.4611	0.0094	0.0085	0.2714	++-++	0.0	0.410	4	0.9816
1 : 230843239 : SNP	t	g	0.0206	0.0000	0.0206	0.0206	0.0100	0.0485	0.8367	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 10638895 : SNP	t	c	0.0125	0.0000	0.0125	0.0125	0.0670	0.0576	0.2449	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 108495098 : SNP	a	t	0.0403	0.0042	0.0373	0.0486	0.0181	0.0230	0.4312	-+??+	0.0	1.461	2	0.4815
13 : 70649823 : SNP	a	g	0.6748	0.0113	0.6513	0.7115	-0.0076	0.0092	0.412	-++--	42.0	6.901	4	0.1412
7 : 47405231 : SNP	a	g	0.1695	0.0055	0.1591	0.1858	-0.0094	0.0114	0.4093	+----	45.3	7.313	4	0.1203
6 : 93671010 : SNP	t	c	0.0301	0.0131	0.0188	0.0452	-0.0160	0.0366	0.6624	-???-	0.0	0.000	1	1
12 : 85933925 : SNP	t	c	0.9494	0.0021	0.9458	0.9542	-0.0358	0.0200	0.07388	--?--	31.2	4.359	3	0.2252
6 : 148656105 : SNP	a	g	0.5564	0.0063	0.5417	0.5631	-0.0066	0.0091	0.466	--+-+	0.0	2.243	4	0.6912
14 : 75123026 : SNP	a	g	0.9277	0.0067	0.9125	0.9327	-0.0108	0.0177	0.5407	-+?--	0.0	2.095	3	0.553
1 : 57861091 : SNP	a	g	0.5664	0.0156	0.5435	0.5812	0.0069	0.0086	0.4198	+++-+	0.0	1.185	4	0.8806
14 : 92586975 : SNP	a	t	0.0644	0.0032	0.0575	0.0668	-0.0158	0.0227	0.4867	--??+	0.0	1.358	2	0.507
12 : 129989308 : SNP	a	g	0.5215	0.0076	0.5086	0.5491	0.0034	0.0086	0.6869	+--+-	41.1	6.790	4	0.1474
4 : 186885374 : SNP	t	c	0.4748	0.0292	0.4219	0.4952	0.0050	0.0105	0.637	-+-++	0.0	1.597	4	0.8093
11 : 80462334 : SNP	t	c	0.9832	0.0000	0.9832	0.9832	0.0380	0.0485	0.4335	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 183004547 : SNP	t	c	0.5364	0.0195	0.4959	0.5546	0.0023	0.0085	0.7887	+--++	0.0	2.496	4	0.6453
15 : 90261957 : SNP	t	c	0.4464	0.0175	0.4138	0.4687	-0.0106	0.0085	0.2146	--+--	0.0	1.217	4	0.8753
14 : 39896457 : SNP	a	g	0.9850	0.0000	0.9850	0.9850	0.0690	0.0637	0.2786	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 72240654 : SNP	a	t	0.8550	0.0084	0.8492	0.8764	-0.0062	0.0122	0.6136	-0---	0.0	0.193	4	0.9956
3 : 82496779 : SNP	t	c	0.1428	0.0049	0.1364	0.1524	0.0118	0.0122	0.3343	-++++	0.0	3.835	4	0.4287
14 : 81827064 : SNP	a	g	0.0348	0.0075	0.0287	0.0557	-0.0165	0.0255	0.5169	--?+-	0.0	1.759	3	0.6238
5 : 53222767 : SNP	t	g	0.0386	0.0031	0.0343	0.0409	0.0275	0.0263	0.2948	++???	45.3	1.830	1	0.1762
1 : 234218925 : SNP	a	c	0.9710	0.0000	0.9710	0.9710	-0.0640	0.0516	0.2145	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 84288034 : SNP	t	c	0.7046	0.0173	0.6952	0.7618	0.0161	0.0094	0.08585	+-+++	0.0	2.356	4	0.6707
1 : 229841139 : SNP	t	c	0.3787	0.0130	0.3606	0.4018	-0.0084	0.0086	0.3286	-+-+-	17.1	4.827	4	0.3056
3 : 100376440 : SNP	t	c	0.4053	0.0160	0.3877	0.4451	-0.0095	0.0085	0.2633	-+-+-	5.2	4.218	4	0.3773
13 : 58680332 : SNP	a	g	0.9430	0.0045	0.9265	0.9465	-0.0122	0.0187	0.5123	-+?--	0.0	0.402	3	0.9399
2 : 232431589 : SNP	t	g	0.0240	0.0000	0.0240	0.0240	0.0170	0.0566	0.7639	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 22595428 : SNP	t	c	0.2644	0.0104	0.2505	0.2856	0.0177	0.0097	0.06862	++-+-	38.0	6.456	4	0.1676
9 : 6935367 : SNP	c	g	0.6887	0.0183	0.6772	0.7292	0.0193	0.0092	0.03637	++++-	27.1	5.489	4	0.2407
7 : 154481039 : SNP	t	g	0.0457	0.0058	0.0413	0.0601	-0.0215	0.0212	0.3104	++?--	26.4	4.076	3	0.2534
2 : 99921574 : SNP	a	c	0.7667	0.0085	0.7428	0.7736	-0.0187	0.0103	0.07088	---+-	0.0	2.055	4	0.7257
10 : 56055382 : SNP	a	g	0.0368	0.0008	0.0357	0.0373	-0.0157	0.0263	0.5495	--???	0.0	0.021	1	0.8853
4 : 156771507 : SNP	t	c	0.0358	0.0032	0.0324	0.0389	0.0214	0.0248	0.3876	++??-	0.0	0.982	2	0.612
1 : 27846112 : SNP	c	g	0.3758	0.0120	0.3502	0.3862	-0.0059	0.0101	0.5606	+---+	38.8	6.537	4	0.1625
5 : 133617580 : INDEL	i	r	0.0844	0.0143	0.0753	0.1103	0.0047	0.0156	0.763	-++++	0.0	1.761	4	0.7796
8 : 78240876 : SNP	t	c	0.7249	0.0142	0.7134	0.7582	0.0018	0.0098	0.8505	++-+-	0.0	1.003	4	0.9093
15 : 65778364 : SNP	a	g	0.1045	0.0245	0.0648	0.1261	-0.0127	0.0174	0.4645	--?+-	0.0	0.402	3	0.9397
5 : 1584948 : SNP	a	g	0.0446	0.0040	0.0414	0.0496	0.0426	0.0293	0.1453	++???	2.9	1.030	1	0.3101
2 : 166144370 : SNP	a	g	0.0601	0.0082	0.0435	0.0664	0.0075	0.0195	0.699	++??-	0.0	0.203	2	0.9036
9 : 114341968 : SNP	a	g	0.0157	0.0000	0.0157	0.0157	-0.0210	0.0505	0.6778	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 139597515 : SNP	a	g	0.0941	0.0117	0.0677	0.1106	0.0034	0.0153	0.8242	-0++-	0.0	2.970	4	0.5629
10 : 89394895 : SNP	a	g	0.9583	0.0012	0.9574	0.9599	0.0271	0.0239	0.2583	++???	0.0	0.943	1	0.3315
4 : 11160718 : SNP	a	c	0.1112	0.0109	0.0937	0.1212	0.0036	0.0139	0.7953	++-+-	1.2	4.050	4	0.3993
7 : 10667744 : SNP	a	g	0.6865	0.0171	0.6539	0.7115	0.0048	0.0092	0.6033	++-+-	0.0	1.142	4	0.8876
14 : 54963553 : SNP	c	g	0.0504	0.0076	0.0456	0.0647	0.0303	0.0207	0.1428	+-?-+	0.0	2.609	3	0.456
6 : 170250122 : SNP	t	c	0.2074	0.0216	0.1896	0.2523	0.0140	0.0107	0.1923	+++--	0.0	2.600	4	0.6268
7 : 152241479 : SNP	t	c	0.4816	0.0154	0.4513	0.4951	-0.0081	0.0103	0.4335	--++-	0.0	3.344	4	0.5019
11 : 100508599 : SNP	a	g	0.0944	0.0067	0.0899	0.1071	-0.0009	0.0147	0.9529	0-+++	0.0	0.154	4	0.9972
3 : 191108484 : SNP	c	g	0.5352	0.0084	0.5117	0.5420	0.0051	0.0085	0.5528	++++-	0.0	0.180	4	0.9962
1 : 81800625 : SNP	t	g	0.1255	0.0046	0.1101	0.1307	0.0151	0.0127	0.2367	+++++	0.0	1.002	4	0.9094
8 : 18390023 : SNP	c	g	0.9103	0.0130	0.8798	0.9233	0.0082	0.0150	0.5865	+--++	0.0	3.914	4	0.4177
8 : 12882634 : SNP	a	g	0.1560	0.0057	0.1379	0.1594	0.0047	0.0122	0.6988	++---	0.0	2.075	4	0.722
5 : 84152972 : SNP	t	c	0.2120	0.0020	0.2093	0.2207	-0.0055	0.0105	0.5989	--+--	0.0	0.722	4	0.9485
2 : 177543433 : SNP	a	g	0.9516	0.0052	0.9390	0.9555	-0.0385	0.0204	0.05894	--?-+	63.6	8.233	3	0.04143
5 : 180160092 : SNP	t	c	0.0186	0.0000	0.0186	0.0186	-0.0580	0.0475	0.2222	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 112031608 : SNP	t	c	0.7837	0.0066	0.7691	0.7990	0.0161	0.0113	0.1542	++-++	0.0	2.746	4	0.6011
18 : 67146157 : SNP	t	c	0.7507	0.0081	0.7320	0.7561	-0.0019	0.0099	0.8452	+++--	11.7	4.532	4	0.3387
5 : 41021669 : SNP	t	c	0.3474	0.0093	0.3231	0.3556	-0.0015	0.0092	0.8714	++---	0.0	2.173	4	0.704
17 : 25446237 : INDEL	d	r	0.0446	0.0025	0.0424	0.0475	-0.0323	0.0236	0.1716	--???	0.0	0.127	1	0.7218
4 : 150994728 : SNP	t	g	0.8040	0.0114	0.7796	0.8173	-0.0093	0.0110	0.3963	-----	0.0	2.570	4	0.6321
16 : 13397881 : SNP	a	t	0.3717	0.0070	0.3652	0.3920	0.0025	0.0091	0.788	0-++-	0.0	1.726	4	0.786
9 : 135123700 : SNP	t	c	0.3624	0.0090	0.3431	0.3802	0.0155	0.0093	0.09648	++--+	0.0	1.693	4	0.7921
5 : 160324875 : SNP	a	g	0.1194	0.0083	0.0920	0.1231	0.0073	0.0136	0.5906	-+--+	40.4	6.714	4	0.1518
6 : 68162154 : SNP	t	c	0.9710	0.0022	0.9666	0.9727	0.0291	0.0269	0.2791	++??-	9.2	2.204	2	0.3323
10 : 110209378 : SNP	t	c	0.0940	0.0100	0.0682	0.0997	0.0072	0.0146	0.6236	++--+	0.0	1.489	4	0.8286
3 : 157703587 : INDEL	i	r	0.6673	0.0135	0.6479	0.6852	0.0036	0.0100	0.7221	-++--	15.5	4.736	4	0.3154
9 : 72499771 : INDEL	i	r	0.4847	0.0090	0.4643	0.5129	0.0021	0.0086	0.8048	+0+--	26.2	5.422	4	0.2467
20 : 41194654 : SNP	a	c	0.0110	0.0000	0.0110	0.0110	0.0300	0.0566	0.5961	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 24504600 : SNP	t	c	0.9296	0.0000	0.9296	0.9296	-0.0595	0.0520	0.2525	????-	0.0	0.000	0	1
5 : 128990706 : SNP	a	g	0.6668	0.0120	0.6558	0.6895	0.0068	0.0091	0.4597	++-+-	47.7	7.648	4	0.1054
8 : 120705393 : SNP	t	c	0.9826	0.0000	0.9826	0.9826	-0.0670	0.0536	0.2111	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 90635606 : SNP	t	c	0.6048	0.0026	0.6018	0.6128	-0.0175	0.0092	0.05767	-----	0.0	3.200	4	0.5249
7 : 38949201 : SNP	t	c	0.4942	0.0173	0.4585	0.5166	0.0064	0.0085	0.449	+--++	0.0	2.360	4	0.6699
8 : 17439220 : SNP	c	g	0.6528	0.0253	0.6293	0.7082	0.0108	0.0090	0.2314	+++-+	37.4	6.392	4	0.1717
4 : 9384846 : SNP	c	g	0.2602	0.0349	0.1949	0.2876	0.0078	0.0138	0.5717	-++++	3.8	4.157	4	0.3852
3 : 140357870 : SNP	a	g	0.0328	0.0000	0.0328	0.0328	-0.0730	0.0465	0.1164	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 13664358 : SNP	a	g	0.9335	0.0064	0.9133	0.9378	0.0211	0.0178	0.237	++?-+	29.2	4.237	3	0.237
10 : 82408327 : SNP	a	g	0.2148	0.0071	0.2007	0.2321	-0.0060	0.0104	0.5662	+---+	61.6	10.419	4	0.03394
19 : 52696482 : SNP	t	c	0.0230	0.0000	0.0230	0.0230	0.0180	0.0546	0.7416	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 91672965 : SNP	t	c	0.2195	0.0044	0.2132	0.2254	0.0118	0.0110	0.2864	+-+++	0.0	1.072	4	0.8987
14 : 31707594 : SNP	a	g	0.0227	0.0000	0.0227	0.0227	0.0760	0.0536	0.156	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 140192880 : SNP	a	g	0.1290	0.0191	0.1115	0.1658	-0.0033	0.0125	0.795	--+++	0.0	3.845	4	0.4274
4 : 133092775 : SNP	a	g	0.0586	0.0140	0.0428	0.0769	0.0557	0.0349	0.1105	+??++	0.0	0.198	2	0.9055
1 : 65518427 : SNP	a	g	0.0325	0.0016	0.0304	0.0338	-0.0516	0.0281	0.06572	--???	0.0	0.343	1	0.5581
22 : 24560685 : SNP	t	c	0.0193	0.0000	0.0193	0.0193	-0.0660	0.0455	0.1468	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 75232846 : INDEL	d	r	0.5966	0.0146	0.5651	0.6319	0.0069	0.0086	0.4212	-++++	36.0	6.253	4	0.181
12 : 52045407 : SNP	a	g	0.0258	0.0000	0.0258	0.0258	0.0000	0.0384	1	0????	0.0	0.000	0	1
4 : 46119629 : SNP	a	c	0.8066	0.0265	0.7762	0.8498	-0.0018	0.0161	0.9125	++---	15.1	4.710	4	0.3183
5 : 3143209 : SNP	t	c	0.0504	0.0037	0.0421	0.0539	-0.0127	0.0205	0.5358	0-??+	47.7	3.822	2	0.1479
18 : 40499029 : SNP	t	c	0.9047	0.0090	0.8768	0.9147	-0.0171	0.0148	0.2489	-0---	0.0	1.259	4	0.8682
3 : 134621500 : SNP	a	t	0.8883	0.0060	0.8809	0.9009	0.0015	0.0136	0.9138	-+--+	26.9	5.468	4	0.2425
8 : 68677749 : SNP	c	g	0.2980	0.0124	0.2749	0.3069	0.0174	0.0284	0.541	??+++	0.0	0.277	2	0.8705
13 : 32746221 : SNP	a	g	0.8087	0.0056	0.7924	0.8155	0.0017	0.0108	0.8753	+-+--	0.0	2.736	4	0.6029
16 : 20269815 : SNP	a	g	0.0348	0.0000	0.0348	0.0348	-0.0130	0.0526	0.8047	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 34643546 : SNP	t	c	0.1312	0.0046	0.1231	0.1464	0.0041	0.0127	0.7466	--+++	9.2	4.405	4	0.3539
20 : 34817545 : SNP	t	c	0.9645	0.0011	0.9618	0.9651	-0.0586	0.0242	0.01531	--??-	0.0	0.831	2	0.6599
4 : 37709597 : SNP	t	c	0.8469	0.0020	0.8416	0.8523	-0.0165	0.0121	0.1729	-----	0.0	1.825	4	0.7679
12 : 81365647 : SNP	t	c	0.0346	0.0000	0.0346	0.0346	0.0200	0.0414	0.6294	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 172049350 : SNP	t	c	0.2328	0.0104	0.2068	0.2468	-0.0193	0.0104	0.06252	-----	0.0	0.425	4	0.9804
12 : 32217505 : SNP	a	g	0.6902	0.0149	0.6756	0.7087	0.0193	0.0107	0.07111	+++++	30.3	5.737	4	0.2197
15 : 80900344 : SNP	a	g	0.9773	0.0000	0.9773	0.9773	0.0430	0.0455	0.3445	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 30830485 : SNP	a	g	0.7242	0.0074	0.7151	0.7341	-0.0059	0.0098	0.5448	+-+--	0.0	0.756	4	0.9442
1 : 100835546 : SNP	a	t	0.0822	0.0115	0.0655	0.0920	0.0053	0.0216	0.8051	+-?--	0.0	2.203	3	0.5313
9 : 107415828 : SNP	t	c	0.2607	0.0099	0.2293	0.2690	-0.0027	0.0095	0.7765	-+---	8.6	4.374	4	0.3577
20 : 4073589 : SNP	t	g	0.0488	0.0041	0.0368	0.0504	0.0167	0.0208	0.4222	++??+	0.0	0.885	2	0.6425
16 : 14361815 : SNP	t	c	0.9763	0.0000	0.9763	0.9763	0.0610	0.0445	0.1702	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 74301234 : SNP	t	c	0.7304	0.0079	0.7102	0.7350	-0.0031	0.0097	0.7527	+---+	54.1	8.720	4	0.0685
10 : 126616820 : SNP	t	c	0.0741	0.0079	0.0593	0.0829	0.0168	0.0219	0.4439	-+??-	53.4	4.294	2	0.1169
4 : 95684520 : SNP	a	g	0.9346	0.0050	0.9304	0.9472	-0.0197	0.0184	0.2852	--??-	0.0	0.553	2	0.7585
5 : 27599956 : SNP	a	g	0.9214	0.0102	0.9159	0.9538	-0.0100	0.0169	0.5548	+-??+	68.3	6.301	2	0.04284
2 : 51826565 : SNP	a	g	0.7384	0.0043	0.7231	0.7416	0.0108	0.0098	0.2674	+++++	0.0	0.791	4	0.9396
7 : 70211000 : SNP	a	g	0.9888	0.0000	0.9888	0.9888	-0.0140	0.0596	0.8144	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 176522977 : SNP	a	t	0.5992	0.0108	0.5834	0.6147	0.0197	0.0091	0.03093	++--+	29.1	5.645	4	0.2273
12 : 49079470 : SNP	t	c	0.5824	0.0211	0.5351	0.5934	0.0011	0.0085	0.9015	++--+	0.0	1.736	4	0.7842
2 : 197990909 : SNP	a	g	0.9673	0.0064	0.9576	0.9715	-0.0027	0.0313	0.9317	-???+	0.0	0.026	1	0.8711
12 : 113420007 : SNP	a	g	0.7077	0.0043	0.6987	0.7177	0.0027	0.0092	0.7658	0+--+	0.0	3.447	4	0.486
14 : 70760760 : SNP	a	g	0.0958	0.0097	0.0883	0.1196	-0.0170	0.0146	0.2462	--+--	0.0	2.771	4	0.5969
8 : 126352836 : SNP	a	g	0.0845	0.0050	0.0765	0.0892	-0.0222	0.0158	0.1601	-----	0.0	3.253	4	0.5164
5 : 33777811 : SNP	a	g	0.1273	0.0072	0.1163	0.1333	-0.0033	0.0127	0.7969	++-+-	0.0	2.733	4	0.6035
12 : 127184541 : SNP	t	c	0.1371	0.0161	0.1133	0.1511	-0.0310	0.0158	0.05061	-----	25.3	5.353	4	0.253
1 : 15133064 : SNP	a	g	0.0788	0.0088	0.0677	0.0869	0.0218	0.0176	0.2151	0+?+-	38.2	4.853	3	0.1829
4 : 13712711 : SNP	a	g	0.3357	0.0058	0.3310	0.3478	-0.0129	0.0091	0.1588	--+--	0.0	3.365	4	0.4987
4 : 32161344 : SNP	a	g	0.0323	0.0022	0.0309	0.0358	-0.0376	0.0335	0.2608	-???-	53.9	2.167	1	0.141
9 : 28471251 : SNP	a	g	0.0698	0.0150	0.0589	0.0987	-0.0189	0.0172	0.271	-+?+-	55.6	6.755	3	0.08013
6 : 8584971 : SNP	a	g	0.2534	0.0164	0.2178	0.2630	0.0109	0.0099	0.2714	++-++	0.0	0.665	4	0.9556
4 : 56397977 : SNP	t	c	0.3675	0.0056	0.3636	0.3796	-0.0078	0.0090	0.3858	--++-	0.0	1.320	4	0.858
2 : 212866883 : SNP	t	c	0.0322	0.0000	0.0322	0.0322	0.0060	0.0344	0.8614	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 110305699 : SNP	c	g	0.2268	0.0090	0.2209	0.2470	0.0021	0.0104	0.8432	+++--	0.0	0.854	4	0.931
4 : 190370266 : SNP	t	c	0.2160	0.0083	0.2051	0.2394	0.0216	0.0104	0.03763	++-++	0.0	0.869	4	0.9289
3 : 131656156 : SNP	a	c	0.7058	0.0093	0.6974	0.7316	0.0018	0.0094	0.852	++++-	26.1	5.412	4	0.2476
11 : 102453640 : SNP	t	c	0.0335	0.0000	0.0335	0.0335	0.0200	0.0384	0.6026	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 5835126 : SNP	a	g	0.3139	0.0235	0.2536	0.3291	0.0154	0.0093	0.09597	++-+-	17.5	4.851	4	0.3029
15 : 24188395 : SNP	a	g	0.0164	0.0000	0.0164	0.0164	0.0670	0.0596	0.2613	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 35925590 : SNP	a	g	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	0.0950	0.0546	0.0818	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 21013196 : SNP	t	c	0.7735	0.0161	0.7445	0.7901	0.0062	0.0114	0.5843	++--+	0.0	1.606	4	0.8078
5 : 155958813 : INDEL	d	r	0.0135	0.0000	0.0135	0.0135	-0.0810	0.0546	0.1378	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 1901930 : SNP	a	g	0.1249	0.0080	0.1062	0.1296	0.0034	0.0132	0.7947	++-+-	66.3	11.871	4	0.01834
17 : 2253085 : INDEL	d	r	0.4355	0.0139	0.4026	0.4459	-0.0046	0.0091	0.6151	+----	65.8	11.680	4	0.0199
3 : 8421255 : SNP	a	g	0.1046	0.0063	0.1002	0.1272	-0.0157	0.0138	0.2553	+--+-	0.0	3.036	4	0.5517
22 : 19575811 : INDEL	d	r	0.0208	0.0000	0.0208	0.0208	-0.0220	0.0465	0.6361	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 46710279 : SNP	a	g	0.8043	0.0055	0.7928	0.8167	0.0037	0.0107	0.7275	-+++-	4.0	4.165	4	0.3841
10 : 18463196 : INDEL	d	r	0.0346	0.0035	0.0316	0.0419	0.0231	0.0249	0.3537	++??-	0.0	1.109	2	0.5744
8 : 101890138 : SNP	t	c	0.0363	0.0041	0.0324	0.0430	-0.0314	0.0272	0.2472	--??+	0.0	0.881	2	0.6437
22 : 32764098 : SNP	a	g	0.0522	0.0050	0.0442	0.0584	-0.0330	0.0205	0.1077	--??+	0.0	1.138	2	0.566
8 : 59084983 : SNP	t	c	0.0152	0.0000	0.0152	0.0152	-0.0190	0.0556	0.7325	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 99204145 : SNP	a	g	0.7364	0.0119	0.7095	0.7440	-0.0176	0.0097	0.07096	---++	0.2	4.009	4	0.4049
5 : 12427449 : SNP	t	c	0.6166	0.0102	0.5944	0.6259	-0.0007	0.0094	0.943	+-+++	57.4	9.382	4	0.05224
6 : 103813726 : SNP	t	c	0.6678	0.0083	0.6494	0.6744	0.0043	0.0091	0.6368	+-+++	0.0	0.647	4	0.9577
1 : 41219563 : SNP	c	g	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	0.0910	0.0556	0.1017	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 95122268 : SNP	t	g	0.1346	0.0173	0.1226	0.1696	-0.0156	0.0128	0.225	+----	0.0	2.880	4	0.5781
7 : 856320 : SNP	t	c	0.3488	0.0161	0.3093	0.3646	0.0087	0.0108	0.4186	-++++	43.0	7.016	4	0.1351
10 : 133034684 : SNP	t	c	0.4012	0.0153	0.3933	0.4476	0.0048	0.0086	0.5728	-++++	0.0	2.728	4	0.6043
12 : 120084116 : SNP	a	g	0.8067	0.0122	0.7969	0.8361	-0.0033	0.0108	0.7587	+----	0.0	2.648	4	0.6184
1 : 58801396 : SNP	c	g	0.8978	0.0087	0.8882	0.9247	0.0163	0.0151	0.2809	+++--	31.6	5.849	4	0.2107
9 : 135549036 : SNP	a	g	0.3797	0.0085	0.3630	0.3979	0.0008	0.0087	0.9276	-+-++	46.9	7.534	4	0.1102
11 : 127430337 : SNP	t	c	0.8180	0.0077	0.7875	0.8222	-0.0050	0.0111	0.6519	-+---	0.0	1.207	4	0.8769
13 : 49188428 : SNP	a	g	0.7081	0.0122	0.6903	0.7184	-0.0051	0.0098	0.6027	-+-+-	40.9	6.766	4	0.1488
5 : 134400973 : SNP	a	g	0.0345	0.0041	0.0284	0.0372	0.0119	0.0268	0.6586	+-???	55.7	2.257	1	0.133
17 : 45789316 : SNP	a	g	0.0573	0.0036	0.0542	0.0649	-0.0008	0.0210	0.9685	-+?-?	0.0	0.825	2	0.6618
20 : 42192595 : SNP	a	g	0.6066	0.0126	0.5746	0.6201	-0.0100	0.0101	0.3202	---++	26.9	5.472	4	0.2422
3 : 191883761 : SNP	t	g	0.5288	0.0055	0.5168	0.5378	-0.0012	0.0091	0.8959	-+-++	50.1	8.023	4	0.09073
8 : 54868806 : SNP	a	g	0.8410	0.0199	0.8056	0.8604	0.0322	0.0123	0.008825	++-++	13.1	4.601	4	0.3308
9 : 3442114 : SNP	t	c	0.0936	0.0159	0.0747	0.1301	-0.0056	0.0154	0.7171	0-?-+	32.7	4.460	3	0.2159
16 : 85034278 : SNP	a	t	0.0957	0.0029	0.0836	0.0975	-0.0275	0.0144	0.05536	--++-	0.0	2.685	4	0.6118
3 : 25402449 : SNP	t	g	0.2423	0.0029	0.2326	0.2522	0.0110	0.0100	0.2705	++++-	0.0	0.998	4	0.9101
9 : 88699557 : SNP	a	g	0.0982	0.0116	0.0918	0.1219	0.0139	0.0144	0.3343	-+-++	45.5	7.346	4	0.1187
15 : 40099769 : SNP	t	c	0.9591	0.0053	0.9556	0.9671	-0.0005	0.0253	0.9842	+-???	0.0	0.475	1	0.4906
4 : 52949991 : SNP	c	g	0.8528	0.0067	0.8359	0.8660	0.0055	0.0125	0.6583	+++--	0.8	4.031	4	0.4018
2 : 161746863 : SNP	a	g	0.4495	0.0315	0.4306	0.5369	0.0087	0.0085	0.3048	++-+-	11.5	4.518	4	0.3404
6 : 25776290 : SNP	t	c	0.7324	0.0144	0.7210	0.7604	0.0018	0.0095	0.8472	+++--	0.0	0.970	4	0.9144
13 : 49587848 : SNP	t	g	0.0471	0.0000	0.0471	0.0471	-0.0150	0.0344	0.6625	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 53931929 : SNP	t	g	0.9797	0.0000	0.9797	0.9797	0.0420	0.0435	0.3339	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 55302183 : SNP	t	g	0.9666	0.0020	0.9630	0.9677	-0.0412	0.0300	0.17	-???+	20.7	1.260	1	0.2616
20 : 14183895 : INDEL	d	r	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	-0.0100	0.0485	0.8367	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 50754936 : INDEL	d	r	0.1885	0.0051	0.1818	0.1976	0.0060	0.0108	0.5784	+-++-	0.0	3.758	4	0.4397
6 : 32822244 : SNP	t	g	0.0242	0.0089	0.0175	0.0361	-0.0150	0.0372	0.6865	+???-	0.0	0.741	1	0.3894
5 : 96594078 : SNP	t	c	0.3532	0.0164	0.3119	0.3661	0.0040	0.0090	0.657	+-+++	4.9	4.208	4	0.3786
4 : 155808735 : SNP	a	c	0.4011	0.0160	0.3698	0.4170	0.0018	0.0093	0.8424	+--++	0.0	2.604	4	0.6262
5 : 90478113 : SNP	t	g	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	-0.0360	0.0607	0.5528	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 14310843 : SNP	c	g	0.7876	0.0247	0.7316	0.8059	0.0171	0.0103	0.09709	++-++	0.0	2.047	4	0.7271
21 : 42463386 : SNP	t	g	0.0916	0.0087	0.0754	0.1035	-0.0058	0.0154	0.7063	+--+-	0.0	0.974	4	0.9137
16 : 78499885 : INDEL	d	r	0.1461	0.0041	0.1374	0.1484	0.0102	0.0123	0.4069	+---+	22.4	5.155	4	0.2717
4 : 4845811 : SNP	a	g	0.5961	0.0046	0.5873	0.6077	0.0142	0.0091	0.1195	-+-++	44.2	7.162	4	0.1275
20 : 46387204 : SNP	t	c	0.8315	0.0033	0.8261	0.8414	0.0007	0.0114	0.9476	-+++-	32.6	5.933	4	0.2042
1 : 64813620 : SNP	t	c	0.3957	0.0146	0.3845	0.4251	0.0089	0.0085	0.2956	++--+	0.0	1.875	4	0.7588
12 : 28173195 : SNP	c	g	0.1110	0.0074	0.0939	0.1168	-0.0032	0.0138	0.8166	+--+-	0.0	1.570	4	0.8141
1 : 208893382 : SNP	a	t	0.0287	0.0058	0.0235	0.0352	-0.0055	0.0315	0.8617	+-???	0.0	0.867	1	0.3518
13 : 111098876 : SNP	a	c	0.0673	0.0056	0.0597	0.0721	-0.0127	0.0191	0.5055	-+?--	0.0	2.191	3	0.5337
7 : 7804178 : SNP	a	t	0.9298	0.0056	0.9121	0.9326	-0.0239	0.0186	0.1991	--?+-	0.0	1.768	3	0.6219
4 : 104063381 : SNP	a	t	0.9467	0.0053	0.9321	0.9507	-0.0131	0.0238	0.5823	+-?+-	0.0	1.903	3	0.5928
5 : 28598486 : SNP	a	g	0.8841	0.0115	0.8580	0.8905	0.0085	0.0133	0.5218	++---	0.0	0.708	4	0.9504
2 : 179910000 : SNP	t	c	0.3602	0.0097	0.3532	0.3797	-0.0139	0.0120	0.2482	-+---	0.0	2.439	4	0.6557
11 : 80454048 : SNP	t	c	0.9859	0.0000	0.9859	0.9859	-0.0460	0.0596	0.4405	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 149782667 : SNP	a	g	0.9369	0.0015	0.9349	0.9380	-0.0489	0.0309	0.1129	-???-	0.0	0.125	1	0.7237
16 : 28564081 : SNP	c	g	0.0121	0.0000	0.0121	0.0121	0.0260	0.0556	0.64	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 63218184 : SNP	a	c	0.9156	0.0059	0.9071	0.9220	0.0055	0.0163	0.7379	++?-+	0.0	0.186	3	0.9798
6 : 37592964 : SNP	a	g	0.4608	0.0095	0.4258	0.4672	-0.0012	0.0092	0.899	-+-++	0.0	2.331	4	0.6751
1 : 177940514 : SNP	t	c	0.1267	0.0131	0.0953	0.1337	0.0146	0.0130	0.2626	-++--	29.4	5.667	4	0.2254
8 : 97394818 : SNP	t	g	0.9456	0.0026	0.9422	0.9498	0.0190	0.0221	0.39	++??-	0.0	0.681	2	0.7113
3 : 117062692 : INDEL	d	r	0.0153	0.0000	0.0153	0.0153	0.0380	0.0596	0.524	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 113174183 : SNP	a	g	0.4613	0.0203	0.4190	0.4730	0.0118	0.0086	0.1665	++-++	16.1	4.770	4	0.3117
15 : 65529051 : SNP	a	c	0.2669	0.0173	0.2268	0.2995	-0.0032	0.0098	0.7429	+-+-+	0.0	0.671	4	0.9548
5 : 28984470 : SNP	a	g	0.9798	0.0000	0.9798	0.9798	0.0170	0.0435	0.6957	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 188234070 : SNP	a	t	0.9748	0.0000	0.9748	0.9748	-0.0080	0.0445	0.8573	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 61244164 : SNP	a	g	0.8326	0.0201	0.7937	0.8542	0.0070	0.0114	0.5432	++-++	16.9	4.811	4	0.3072
14 : 32107196 : SNP	a	g	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	0.0350	0.0505	0.4886	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 45775995 : SNP	t	c	0.3536	0.0077	0.3389	0.3673	0.0201	0.0089	0.02458	++++-	23.7	5.242	4	0.2633
3 : 137382243 : SNP	a	c	0.1137	0.0035	0.1122	0.1276	0.0065	0.0146	0.6568	++?--	0.0	1.030	3	0.794
10 : 113435893 : SNP	t	c	0.0370	0.0017	0.0356	0.0391	-0.0020	0.0263	0.9382	-+???	0.0	0.294	1	0.5879
13 : 28867563 : SNP	a	g	0.0536	0.0046	0.0504	0.0692	-0.0202	0.0208	0.3317	-+?-+	65.8	8.780	3	0.03236
4 : 116263336 : SNP	a	g	0.2386	0.0161	0.2037	0.2499	0.0142	0.0101	0.1586	+-+++	0.0	3.453	4	0.4851
10 : 104736855 : SNP	a	g	0.9469	0.0027	0.9422	0.9500	-0.0023	0.0195	0.9051	--?++	40.1	5.005	3	0.1714
11 : 23131166 : SNP	t	c	0.4685	0.0357	0.3905	0.4947	-0.0073	0.0086	0.3938	+-+-+	2.1	4.084	4	0.3948
5 : 110733077 : SNP	t	c	0.8849	0.0116	0.8630	0.9047	0.0193	0.0137	0.159	++-+-	0.0	2.479	4	0.6485
6 : 98835635 : INDEL	d	r	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	0.0260	0.0617	0.6733	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 66811983 : SNP	a	g	0.4492	0.0080	0.4348	0.4794	0.0188	0.0085	0.02675	+++++	0.0	2.052	4	0.7262
3 : 146306564 : INDEL	d	r	0.0539	0.0042	0.0482	0.0576	0.0031	0.0200	0.8768	+-??-	0.0	1.805	2	0.4055
3 : 14085762 : SNP	a	g	0.6660	0.0213	0.6496	0.7243	-0.0025	0.0092	0.7849	--++-	0.0	0.596	4	0.9635
11 : 77161404 : SNP	a	g	0.9867	0.0000	0.9867	0.9867	-0.0310	0.0586	0.597	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 164340363 : SNP	a	g	0.2572	0.0174	0.2444	0.2941	0.0010	0.0097	0.9188	-+--+	0.0	3.934	4	0.415
1 : 233938865 : SNP	c	g	0.2808	0.0195	0.2537	0.3153	-0.0015	0.0093	0.8703	-++++	0.0	2.077	4	0.7216
3 : 19121787 : SNP	a	g	0.1555	0.0104	0.1493	0.1755	-0.0013	0.0122	0.9178	+-++-	12.6	4.577	4	0.3335
4 : 14500968 : SNP	a	g	0.9797	0.0000	0.9797	0.9797	0.0510	0.0445	0.2515	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 117983054 : SNP	a	g	0.0376	0.0075	0.0316	0.0517	-0.0081	0.0241	0.7375	+-??-	0.0	0.794	2	0.6723
22 : 46874420 : SNP	a	g	0.7053	0.0176	0.6520	0.7221	0.0007	0.0093	0.9437	+-++-	0.0	1.776	4	0.7769
14 : 33593051 : INDEL	d	r	0.3809	0.0133	0.3485	0.4065	-0.0092	0.0118	0.4379	-+-+-	9.8	4.434	4	0.3504
12 : 52128702 : SNP	a	g	0.8730	0.0085	0.8557	0.8790	0.0045	0.0130	0.7299	+0---	37.2	6.368	4	0.1733
4 : 53656077 : SNP	t	c	0.9173	0.0030	0.9150	0.9251	-0.0007	0.0168	0.9656	-+?+-	15.2	3.539	3	0.3157
9 : 107916362 : INDEL	d	r	0.0382	0.0024	0.0365	0.0431	0.0019	0.0254	0.9412	+-??+	0.0	0.295	2	0.863
4 : 90513701 : SNP	a	g	0.0649	0.0029	0.0583	0.0671	0.0028	0.0220	0.8994	+-??-	50.3	4.025	2	0.1336
2 : 112787805 : SNP	a	t	0.9233	0.0033	0.9120	0.9272	0.0033	0.0162	0.8385	-0+-+	0.0	0.527	4	0.9708
11 : 84181855 : SNP	c	g	0.3034	0.0069	0.2905	0.3254	0.0077	0.0092	0.3988	+0+++	0.0	1.851	4	0.7631
20 : 58943439 : SNP	a	g	0.0917	0.0044	0.0887	0.1072	-0.0023	0.0163	0.8879	--+++	0.0	2.145	4	0.7092
9 : 89543767 : SNP	t	c	0.0323	0.0007	0.0314	0.0328	0.0153	0.0288	0.5955	+-???	0.0	0.951	1	0.3294
3 : 23603955 : SNP	a	g	0.2103	0.0058	0.2003	0.2217	0.0103	0.0112	0.3591	+-+++	0.0	1.684	4	0.7937
2 : 140104667 : SNP	t	c	0.0892	0.0090	0.0843	0.1171	0.0051	0.0154	0.7402	0+-++	0.0	2.905	4	0.5738
12 : 19531205 : SNP	t	c	0.7693	0.0189	0.7226	0.7809	-0.0290	0.0103	0.004787	--+-+	32.1	5.889	4	0.2076
8 : 33628231 : SNP	t	c	0.9601	0.0040	0.9555	0.9640	0.0118	0.0230	0.6067	0+??+	0.0	0.278	2	0.8703
4 : 84806165 : SNP	a	c	0.4033	0.0215	0.3896	0.4582	0.0140	0.0087	0.1084	+++++	0.0	3.653	4	0.455
2 : 18232174 : SNP	t	g	0.7418	0.0093	0.7216	0.7488	-0.0098	0.0097	0.3147	+----	16.8	4.809	4	0.3075
4 : 3779161 : SNP	t	c	0.5071	0.0202	0.4722	0.5530	-0.0102	0.0090	0.2582	-----	0.0	1.937	4	0.7474
4 : 46955190 : SNP	t	c	0.9708	0.0000	0.9708	0.9708	-0.0110	0.0445	0.8047	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 53580131 : SNP	t	c	0.9269	0.0058	0.9122	0.9352	-0.0251	0.0179	0.1596	--?++	27.1	4.115	3	0.2493
7 : 128001851 : SNP	a	g	0.0543	0.0080	0.0476	0.0645	-0.0010	0.0310	0.9742	+??+-	0.0	0.510	2	0.7749
11 : 119899910 : SNP	a	g	0.3590	0.0066	0.3516	0.3735	0.0042	0.0091	0.6456	-+--+	63.0	10.797	4	0.02895
1 : 175799413 : SNP	a	c	0.0151	0.0000	0.0151	0.0151	-0.0650	0.0505	0.1984	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 55174753 : SNP	a	t	0.8318	0.0071	0.8281	0.8504	0.0031	0.0112	0.7841	+++--	0.0	2.395	4	0.6634
7 : 96493854 : SNP	t	c	0.1082	0.0063	0.0938	0.1176	-0.0100	0.0136	0.4607	----+	33.1	5.982	4	0.2005
18 : 34436532 : INDEL	i	r	0.2890	0.0091	0.2772	0.3051	-0.0113	0.0097	0.2433	--+++	57.3	9.378	4	0.05231
18 : 2427117 : SNP	a	g	0.1421	0.0116	0.1138	0.1530	-0.0026	0.0122	0.8319	+-+-+	5.9	4.249	4	0.3733
5 : 44531232 : SNP	t	c	0.0763	0.0023	0.0728	0.0797	0.0051	0.0165	0.76	++?--	0.0	1.721	3	0.6322
1 : 111429888 : SNP	a	g	0.0254	0.0000	0.0254	0.0254	-0.0030	0.0445	0.9462	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 12552736 : SNP	a	g	0.3805	0.0327	0.3270	0.4061	0.0107	0.0124	0.3881	-++++	0.0	1.271	4	0.8663
1 : 34783550 : SNP	a	g	0.6324	0.0194	0.6090	0.6703	0.0134	0.0086	0.1198	+++++	0.0	1.254	4	0.8692
12 : 127213822 : SNP	t	c	0.1513	0.0200	0.1201	0.1675	0.0197	0.0150	0.1889	++++-	55.3	8.943	4	0.06255
10 : 17259642 : SNP	c	g	0.5768	0.0173	0.5391	0.5926	-0.0099	0.0085	0.2457	----+	0.0	2.997	4	0.5583
3 : 188331371 : SNP	a	t	0.2013	0.0181	0.1919	0.2390	0.0033	0.0108	0.7629	-+-++	0.0	1.613	4	0.8064
5 : 85236016 : SNP	a	t	0.4742	0.0237	0.4615	0.5250	-0.0055	0.0085	0.5222	+----	0.0	1.851	4	0.7632
20 : 15322562 : SNP	t	c	0.6111	0.0067	0.6050	0.6307	0.0204	0.0086	0.01779	+++-+	0.0	3.301	4	0.5088
20 : 59473649 : SNP	a	g	0.3081	0.0114	0.2702	0.3186	0.0060	0.0095	0.5277	-+--+	38.5	6.500	4	0.1648
13 : 72738783 : SNP	t	c	0.1019	0.0033	0.0942	0.1134	0.0233	0.0143	0.1031	-+++-	49.9	7.983	4	0.09219
16 : 939962 : SNP	t	g	0.2820	0.0183	0.2625	0.3080	0.0142	0.0113	0.2079	++-+-	0.0	2.951	4	0.5661
6 : 130925647 : SNP	c	g	0.1671	0.0105	0.1620	0.2059	-0.0065	0.0114	0.5705	+--+-	20.6	5.037	4	0.2835
3 : 95479305 : SNP	t	c	0.6356	0.0070	0.6232	0.6475	0.0058	0.0089	0.5141	-++++	29.4	5.665	4	0.2256
5 : 180168265 : SNP	t	c	0.8498	0.0071	0.8362	0.8555	0.0139	0.0124	0.265	++-+-	54.6	8.811	4	0.06599
12 : 67799893 : SNP	a	c	0.0611	0.0046	0.0487	0.0630	-0.0176	0.0188	0.3509	-+??-	55.4	4.487	2	0.1061
2 : 67002761 : SNP	a	g	0.4087	0.0075	0.3981	0.4194	0.0150	0.0130	0.2495	++--+	39.6	6.627	4	0.1569
2 : 238343049 : SNP	a	g	0.8931	0.0130	0.8721	0.9120	-0.0163	0.0145	0.2617	--+--	0.0	1.811	4	0.7704
6 : 34172114 : SNP	a	g	0.0748	0.0071	0.0588	0.0795	-0.0147	0.0175	0.4013	--?++	0.0	0.592	3	0.8984
15 : 51052138 : SNP	t	c	0.3030	0.0069	0.2964	0.3202	0.0047	0.0092	0.6105	-+--+	0.0	1.288	4	0.8635
14 : 101700041 : INDEL	d	r	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	-0.0370	0.0607	0.5418	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 209747273 : SNP	a	g	0.3678	0.0072	0.3496	0.3867	-0.0025	0.0089	0.7794	--+++	0.0	1.145	4	0.8871
4 : 83971663 : SNP	a	g	0.8242	0.0101	0.7957	0.8364	-0.0096	0.0140	0.494	+-+--	23.5	5.228	4	0.2647
6 : 63104681 : SNP	a	g	0.4192	0.0082	0.3949	0.4279	-0.0076	0.0092	0.4057	---+?	52.9	6.369	3	0.09497
5 : 56836470 : SNP	a	c	0.8662	0.0099	0.8544	0.8897	0.0065	0.0127	0.6113	-++++	0.0	3.699	4	0.4483
9 : 108270750 : SNP	a	g	0.3148	0.0047	0.3053	0.3216	0.0106	0.0092	0.2464	+-+-+	65.5	11.611	4	0.02049
17 : 8627057 : INDEL	i	r	0.7727	0.0040	0.7584	0.7751	0.0063	0.0104	0.5482	-+++-	0.0	2.197	4	0.6996
11 : 5036189 : SNP	t	c	0.0272	0.0000	0.0272	0.0272	0.0200	0.0394	0.6119	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 133214118 : SNP	t	c	0.6217	0.0280	0.5635	0.6366	-0.0070	0.0089	0.4261	+--+-	0.0	3.837	4	0.4285
5 : 17280669 : SNP	a	c	0.0310	0.0006	0.0302	0.0315	0.0100	0.0288	0.7271	+-???	44.7	1.810	1	0.1786
4 : 4370510 : SNP	t	c	0.9416	0.0024	0.9399	0.9471	-0.0212	0.0217	0.3277	--??-	0.0	0.261	2	0.8776
4 : 177003957 : INDEL	i	r	0.2471	0.0136	0.2350	0.2853	-0.0285	0.0099	0.004003	-----	0.0	3.196	4	0.5257
18 : 42236863 : SNP	t	c	0.8446	0.0025	0.8342	0.8462	-0.0125	0.0119	0.2949	---++	0.0	0.839	4	0.9332
8 : 75656086 : SNP	a	g	0.0295	0.0000	0.0295	0.0295	0.0240	0.0374	0.5211	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 24249247 : SNP	c	g	0.6440	0.0040	0.6274	0.6455	-0.0053	0.0091	0.5625	---++	0.0	1.767	4	0.7786
16 : 87322986 : SNP	c	g	0.1940	0.0114	0.1672	0.2039	-0.0218	0.0109	0.04626	--+--	0.0	1.142	4	0.8875
10 : 26657528 : SNP	a	c	0.9447	0.0061	0.9278	0.9512	-0.0035	0.0191	0.8548	-+?+-	0.0	0.782	3	0.8537
14 : 70795320 : INDEL	d	r	0.1488	0.0222	0.1320	0.1904	0.0146	0.0120	0.2261	++--+	0.0	2.356	4	0.6705
9 : 13705973 : SNP	t	c	0.6707	0.0201	0.6589	0.7183	0.0114	0.0092	0.2138	+-+--	37.2	6.367	4	0.1734
9 : 125283068 : SNP	a	g	0.0555	0.0018	0.0537	0.0577	-0.0108	0.0190	0.5697	--?++	72.7	10.972	3	0.01188
22 : 19453275 : SNP	a	g	0.5270	0.0109	0.5141	0.5575	-0.0168	0.0085	0.04807	-----	0.0	0.177	4	0.9963
3 : 152338849 : SNP	a	t	0.3412	0.0121	0.3230	0.3787	0.0063	0.0091	0.4892	+++--	6.5	4.276	4	0.3699
6 : 213042 : SNP	c	g	0.1281	0.0161	0.1183	0.1627	0.0176	0.0127	0.1667	++-++	29.0	5.632	4	0.2284
8 : 93644497 : SNP	a	g	0.1637	0.0065	0.1416	0.1678	0.0081	0.0120	0.4974	++-+-	0.0	2.939	4	0.5682
12 : 37883014 : SNP	a	c	0.6412	0.0120	0.6323	0.6749	-0.0002	0.0120	0.9889	+--+?	0.0	1.421	3	0.7007
5 : 34862360 : SNP	a	t	0.6224	0.0119	0.6108	0.6398	0.0049	0.0091	0.5939	-++++	6.3	4.267	4	0.3711
1 : 159456645 : SNP	a	g	0.0527	0.0077	0.0465	0.0678	0.0063	0.0196	0.7503	-+?++	0.0	2.365	3	0.5003
11 : 11242337 : SNP	t	c	0.1544	0.0101	0.1403	0.1687	0.0025	0.0118	0.8292	+-+-+	0.0	3.862	4	0.4249
3 : 6147445 : SNP	t	c	0.0907	0.0054	0.0836	0.0974	0.0418	0.0165	0.01136	++?+-	63.7	8.273	3	0.0407
16 : 25990139 : SNP	a	g	0.0625	0.0053	0.0553	0.0698	-0.0333	0.0194	0.08569	--?--	0.0	0.913	3	0.8224
4 : 132121146 : SNP	a	g	0.4717	0.0079	0.4343	0.4739	-0.0083	0.0085	0.3292	-+---	21.2	5.074	4	0.2798
2 : 42303937 : SNP	a	g	0.2479	0.0060	0.2444	0.2730	-0.0092	0.0098	0.3494	+-+--	6.3	4.271	4	0.3706
10 : 65796140 : SNP	a	g	0.2311	0.0097	0.2053	0.2457	-0.0114	0.0110	0.2992	+----	33.2	5.991	4	0.1998
12 : 53049579 : SNP	t	g	0.2056	0.0075	0.1968	0.2255	0.0116	0.0106	0.2726	+-+-+	0.0	3.533	4	0.4729
2 : 171183832 : SNP	t	c	0.4526	0.0118	0.4442	0.4784	0.0042	0.0092	0.6447	+-+++	26.7	5.460	4	0.2433
6 : 151408364 : SNP	a	g	0.2711	0.0054	0.2493	0.2750	0.0053	0.0098	0.5893	++-+-	2.5	4.101	4	0.3925
4 : 39079344 : INDEL	d	r	0.7244	0.0070	0.7129	0.7330	-0.0146	0.0098	0.1386	-----	0.0	1.988	4	0.7381
14 : 24308236 : SNP	a	c	0.0402	0.0036	0.0350	0.0454	-0.0104	0.0236	0.6596	+-??-	9.4	2.206	2	0.3318
5 : 127887453 : SNP	t	c	0.0852	0.0019	0.0838	0.0910	-0.0167	0.0156	0.2823	-+?-+	63.4	8.192	3	0.04221
4 : 163214458 : SNP	a	g	0.7946	0.0088	0.7822	0.8185	-0.0036	0.0114	0.7525	-+---	52.1	8.356	4	0.07938
14 : 37345562 : SNP	a	t	0.7815	0.0076	0.7707	0.7937	0.0358	0.0108	0.0009179	++-++	0.0	2.100	4	0.7173
6 : 130778955 : SNP	a	c	0.0830	0.0035	0.0718	0.0848	-0.0226	0.0156	0.1476	--?--	0.0	1.183	3	0.757
2 : 104832469 : SNP	a	g	0.1421	0.0083	0.1184	0.1544	-0.0229	0.0128	0.07263	-+-+-	0.0	3.921	4	0.4168
15 : 52528303 : SNP	c	g	0.8374	0.0053	0.8293	0.8458	-0.0044	0.0116	0.7043	--+--	0.0	0.099	4	0.9988
12 : 104313861 : SNP	a	g	0.0633	0.0024	0.0557	0.0661	0.0072	0.0177	0.683	++?-+	0.0	1.638	3	0.6508
1 : 228436514 : SNP	a	g	0.6735	0.0220	0.6180	0.7014	0.0106	0.0092	0.2505	+++-+	0.0	3.031	4	0.5526
10 : 44739594 : SNP	t	c	0.1031	0.0078	0.0846	0.1143	-0.0011	0.0143	0.9362	-++--	0.0	2.585	4	0.6294
18 : 62630553 : SNP	t	c	0.9731	0.0020	0.9708	0.9748	-0.0496	0.0307	0.1058	--???	0.0	0.266	1	0.6059
11 : 36229292 : SNP	c	g	0.8703	0.0037	0.8670	0.8776	-0.0107	0.0127	0.3959	0-+--	0.0	3.943	4	0.4137
18 : 39891215 : SNP	a	g	0.0961	0.0034	0.0934	0.1024	0.0069	0.0151	0.6464	+0?+-	48.2	5.793	3	0.1221
8 : 36947945 : SNP	t	c	0.8895	0.0100	0.8633	0.9016	0.0120	0.0142	0.3947	-+++-	67.9	12.444	4	0.01433
12 : 44150982 : INDEL	i	r	0.0302	0.0000	0.0302	0.0302	0.0040	0.0495	0.9356	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 228099424 : SNP	t	c	0.6175	0.0052	0.6095	0.6265	-0.0066	0.0086	0.4409	---++	0.0	2.011	4	0.7337
2 : 185756725 : SNP	t	g	0.1535	0.0134	0.1397	0.1815	-0.0029	0.0121	0.8113	-+--+	0.0	1.680	4	0.7944
10 : 94435956 : SNP	t	c	0.0253	0.0000	0.0253	0.0253	-0.0260	0.0404	0.5202	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 142729834 : SNP	a	g	0.9396	0.0000	0.9396	0.9396	-0.0110	0.0334	0.7416	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 868656 : SNP	a	t	0.0428	0.0079	0.0307	0.0607	0.0077	0.0222	0.7287	--?++	49.6	5.948	3	0.1142
19 : 20168073 : SNP	a	g	0.5670	0.0283	0.5489	0.6281	-0.0049	0.0094	0.6043	-+--+	0.0	3.232	4	0.5197
20 : 19147602 : SNP	c	g	0.9559	0.0082	0.9408	0.9625	0.0248	0.0222	0.263	++??+	0.0	0.146	2	0.9298
1 : 86373381 : SNP	a	c	0.7006	0.0231	0.6818	0.7517	-0.0011	0.0092	0.9085	+---+	17.8	4.864	4	0.3016
15 : 62582940 : INDEL	i	r	0.0553	0.0042	0.0432	0.0568	0.0344	0.0203	0.09073	++??+	0.0	0.703	2	0.7037
10 : 67505640 : SNP	a	g	0.0295	0.0038	0.0262	0.0339	0.0180	0.0321	0.5751	-+???	0.0	0.943	1	0.3314
3 : 145391100 : SNP	t	c	0.6672	0.0083	0.6636	0.7125	0.0063	0.0092	0.4972	++-+-	29.6	5.682	4	0.2242
15 : 70486077 : SNP	a	c	0.9634	0.0000	0.9634	0.9634	-0.0980	0.0465	0.03507	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 97176634 : SNP	t	c	0.3416	0.0314	0.2674	0.3659	0.0029	0.0087	0.74	+-+--	0.0	2.120	4	0.7137
4 : 54836294 : SNP	a	g	0.0305	0.0084	0.0245	0.0421	0.1270	0.0377	0.0007516	+???+	55.8	2.263	1	0.1325
2 : 197104208 : SNP	t	c	0.9126	0.0134	0.8867	0.9252	-0.0016	0.0153	0.9145	++---	58.1	9.556	4	0.04861
2 : 138497914 : INDEL	d	r	0.1845	0.0258	0.1668	0.2333	0.0097	0.0110	0.3787	++++-	0.0	1.557	4	0.8165
6 : 34132878 : SNP	a	g	0.9800	0.0107	0.9681	0.9897	-0.0003	0.0436	0.9941	-???+	80.0	5.002	1	0.02532
7 : 117825297 : SNP	c	g	0.4073	0.0207	0.3831	0.4490	-0.0076	0.0085	0.3767	----+	0.0	1.839	4	0.7654
4 : 158582107 : SNP	a	g	0.9826	0.0000	0.9826	0.9826	0.0370	0.0485	0.4457	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 35443300 : SNP	a	t	0.2907	0.0077	0.2733	0.2961	0.0097	0.0094	0.3005	+++++	0.0	0.727	4	0.9479
2 : 104787092 : SNP	a	t	0.7521	0.0120	0.7195	0.7703	0.0007	0.0102	0.9415	+--++	40.7	6.750	4	0.1497
11 : 43173007 : SNP	t	c	0.1596	0.0095	0.1506	0.1719	0.0027	0.0117	0.8188	-++-+	3.9	4.164	4	0.3842
5 : 67415027 : SNP	c	g	0.6275	0.0269	0.6070	0.6775	0.0007	0.0091	0.9395	+---+	34.5	6.108	4	0.1912
8 : 113509245 : SNP	a	g	0.4642	0.0143	0.4300	0.4719	0.0144	0.0086	0.09455	+-+-+	0.0	3.866	4	0.4245
11 : 85739982 : SNP	t	c	0.2289	0.0052	0.2038	0.2307	-0.0093	0.0099	0.3451	--+--	0.0	0.476	4	0.9758
4 : 7699600 : INDEL	i	r	0.1692	0.0112	0.1476	0.1783	-0.0307	0.0149	0.03977	---+-	0.0	2.686	4	0.6117
2 : 106725087 : SNP	a	g	0.0251	0.0000	0.0251	0.0251	0.0300	0.0414	0.4692	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 35268816 : SNP	t	c	0.8986	0.0012	0.8952	0.9000	-0.0219	0.0142	0.1245	---+-	9.5	4.421	4	0.352
5 : 81717561 : SNP	a	g	0.9310	0.0060	0.9140	0.9357	0.0327	0.0169	0.05322	+-+-+	58.1	9.545	4	0.04882
11 : 122051699 : SNP	a	g	0.4626	0.0090	0.4405	0.4926	-0.0166	0.0085	0.05226	-----	0.0	0.738	4	0.9465
18 : 75298885 : SNP	c	g	0.7505	0.0034	0.7466	0.7582	-0.0024	0.0098	0.8028	-+-+-	0.0	0.895	4	0.9253
18 : 8739979 : SNP	t	c	0.7120	0.0058	0.6987	0.7208	-0.0061	0.0099	0.5386	-++--	36.9	6.341	4	0.1751
7 : 122012043 : INDEL	d	r	0.2903	0.0075	0.2802	0.3171	0.0070	0.0094	0.4534	++++-	46.0	7.408	4	0.1159
7 : 52520577 : SNP	t	c	0.6601	0.0111	0.6508	0.6828	-0.0236	0.0091	0.009884	--+--	0.0	3.594	4	0.4637
12 : 88808147 : SNP	a	g	0.1541	0.0153	0.1164	0.1633	-0.0127	0.0118	0.282	--++-	21.5	5.095	4	0.2777
2 : 150199468 : SNP	a	g	0.6473	0.0057	0.6283	0.6504	-0.0197	0.0091	0.03103	--+-+	0.0	3.090	4	0.5429
2 : 222872562 : SNP	a	g	0.4898	0.0118	0.4813	0.5266	-0.0182	0.0103	0.07593	----+	14.5	4.676	4	0.3222
4 : 19919632 : SNP	t	c	0.0559	0.0022	0.0526	0.0588	-0.0157	0.0198	0.4287	--??-	0.0	0.233	2	0.89
13 : 105115490 : SNP	t	c	0.9757	0.0069	0.9661	0.9806	0.0165	0.0369	0.6558	-???+	0.0	0.594	1	0.4407
14 : 25980454 : SNP	c	g	0.7811	0.0271	0.7080	0.7955	0.0054	0.0105	0.6056	++++-	0.0	1.214	4	0.8758
2 : 134489459 : SNP	a	g	0.8894	0.0192	0.8772	0.9443	-0.0281	0.0159	0.07757	-----	0.0	1.890	4	0.756
2 : 228185607 : SNP	a	g	0.9624	0.0029	0.9583	0.9664	-0.0287	0.0243	0.2375	--??-	0.0	0.525	2	0.769
3 : 174219031 : SNP	a	g	0.2306	0.0118	0.1968	0.2603	0.0086	0.0103	0.4045	+++-+	0.0	1.375	4	0.8485
4 : 54638699 : SNP	a	g	0.8794	0.0029	0.8737	0.8846	-0.0134	0.0131	0.3091	-----	0.0	1.581	4	0.8122
1 : 95659685 : INDEL	d	r	0.0309	0.0082	0.0254	0.0433	0.0072	0.0312	0.8171	+???+	0.0	0.024	1	0.8767
1 : 19852127 : SNP	a	c	0.2768	0.0203	0.2419	0.3039	-0.0061	0.0096	0.5259	--+++	0.1	4.002	4	0.4057
10 : 99042277 : INDEL	i	r	0.0644	0.0043	0.0535	0.0671	-0.0103	0.0185	0.5766	--??-	0.0	0.303	2	0.8592
2 : 128165641 : SNP	a	c	0.8887	0.0178	0.8737	0.9200	-0.0059	0.0168	0.7262	++---	20.0	5.002	4	0.2871
4 : 122665185 : SNP	a	g	0.4057	0.0156	0.3904	0.4400	0.0011	0.0085	0.8966	--+++	33.1	5.981	4	0.2005
16 : 48682834 : SNP	t	c	0.3234	0.0122	0.3141	0.3419	0.0147	0.0092	0.1081	+++-+	4.0	4.166	4	0.384
2 : 201840567 : INDEL	d	r	0.0169	0.0000	0.0169	0.0169	-0.0370	0.0495	0.4551	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 21660297 : INDEL	d	r	0.0485	0.0053	0.0433	0.0550	-0.0098	0.0201	0.6267	--?++	0.0	2.159	3	0.5401
7 : 86529436 : SNP	a	c	0.9871	0.0000	0.9871	0.9871	0.0040	0.0607	0.9474	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 134021967 : SNP	a	g	0.1779	0.0047	0.1743	0.1984	0.0143	0.0112	0.2019	++++-	0.0	2.885	4	0.5772
11 : 23531046 : SNP	a	g	0.7987	0.0114	0.7843	0.8180	-0.0187	0.0138	0.1762	--++-	0.0	3.513	4	0.4759
7 : 1023191 : SNP	a	g	0.4811	0.0161	0.4689	0.5157	-0.0026	0.0085	0.7605	--+--	0.0	0.518	4	0.9717
2 : 25959816 : SNP	t	c	0.0295	0.0024	0.0262	0.0312	-0.0058	0.0287	0.8385	+-???	78.7	4.693	1	0.03028
4 : 180272157 : SNP	t	c	0.7944	0.0083	0.7883	0.8308	-0.0010	0.0107	0.923	+--+-	0.0	2.227	4	0.6941
12 : 87453766 : SNP	a	t	0.0397	0.0002	0.0396	0.0399	-0.0020	0.0242	0.9328	-+???	6.7	1.072	1	0.3005
6 : 115512307 : SNP	t	g	0.9605	0.0017	0.9585	0.9619	-0.0145	0.0278	0.6013	+-???	27.1	1.371	1	0.2416
7 : 90062249 : SNP	a	g	0.9667	0.0016	0.9632	0.9675	-0.0272	0.0252	0.2807	--??+	37.2	3.183	2	0.2036
18 : 23148976 : SNP	a	g	0.4263	0.0111	0.4064	0.4401	0.0076	0.0085	0.3712	+--+-	64.6	11.313	4	0.02326
10 : 107015914 : SNP	t	c	0.1022	0.0082	0.0794	0.1066	0.0109	0.0138	0.4272	++++-	0.0	1.326	4	0.8569
1 : 20112903 : SNP	t	c	0.0358	0.0000	0.0358	0.0358	-0.0270	0.0475	0.5698	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 159363996 : SNP	a	c	0.9601	0.0017	0.9588	0.9624	-0.0185	0.0256	0.4705	+-???	58.2	2.390	1	0.1221
1 : 210964678 : SNP	a	c	0.2703	0.0059	0.2604	0.2779	0.0074	0.0096	0.4418	+-+-+	0.0	2.945	4	0.5671
4 : 184469849 : SNP	a	t	0.9163	0.0063	0.9124	0.9322	-0.0262	0.0160	0.1029	-+??-	23.6	2.617	2	0.2703
5 : 161022069 : SNP	a	c	0.3705	0.0173	0.3457	0.3959	-0.0047	0.0091	0.603	-+---	0.0	2.147	4	0.7088
14 : 34575688 : SNP	t	g	0.4740	0.0096	0.4568	0.5027	0.0013	0.0086	0.8755	-++++	64.0	11.118	4	0.02527
14 : 51508950 : SNP	a	g	0.8114	0.0071	0.7980	0.8226	0.0057	0.0109	0.6023	+++-+	0.0	0.650	4	0.9574
10 : 20332417 : SNP	a	c	0.9845	0.0000	0.9845	0.9845	-0.0090	0.0536	0.8666	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 83196116 : SNP	c	g	0.1290	0.0063	0.1196	0.1359	0.0261	0.0151	0.08475	+++-+	0.0	2.264	4	0.6874
14 : 89732558 : SNP	c	g	0.1710	0.0105	0.1538	0.1930	0.0136	0.0119	0.2518	+--+-	17.2	4.831	4	0.3051
8 : 131487029 : SNP	a	g	0.1481	0.0059	0.1408	0.1562	0.0040	0.0126	0.7528	+--++	0.0	3.470	4	0.4825
18 : 67573810 : SNP	a	g	0.9524	0.0074	0.9430	0.9582	0.0168	0.0374	0.6546	-???+	55.3	2.237	1	0.1348
4 : 189973305 : SNP	a	g	0.8972	0.0150	0.8840	0.9191	0.0236	0.0215	0.2708	++?-+	0.0	0.695	3	0.8743
9 : 123205912 : SNP	c	g	0.9734	0.0000	0.9734	0.9735	-0.0155	0.0300	0.6055	--???	0.0	0.113	1	0.7368
22 : 31838518 : SNP	t	c	0.2074	0.0156	0.1716	0.2187	0.0024	0.0108	0.8215	++++-	0.0	2.010	4	0.734
6 : 65095820 : SNP	a	g	0.2873	0.0057	0.2765	0.2922	0.0205	0.0094	0.02885	+++++	0.0	0.956	4	0.9164
8 : 14148220 : SNP	a	t	0.7942	0.0216	0.7460	0.8064	0.0032	0.0105	0.7574	-++++	16.9	4.813	4	0.3071
5 : 171860077 : SNP	a	g	0.5364	0.0089	0.5085	0.5486	-0.0051	0.0085	0.5473	-++-+	0.0	3.483	4	0.4805
20 : 7389771 : SNP	a	g	0.1838	0.0182	0.1726	0.2205	-0.0048	0.0111	0.6677	---+-	0.0	1.926	4	0.7494
2 : 233297573 : SNP	t	c	0.0869	0.0033	0.0816	0.0980	-0.0125	0.0154	0.4154	--++-	0.0	2.293	4	0.682
2 : 163741101 : SNP	t	c	0.9697	0.0036	0.9642	0.9720	-0.0159	0.0340	0.6396	-???-	0.0	0.002	1	0.9669
8 : 3801441 : SNP	a	g	0.1010	0.0049	0.0935	0.1073	-0.0080	0.0147	0.586	--?-+	0.0	1.043	3	0.7909
3 : 63289257 : SNP	t	c	0.1747	0.0131	0.1580	0.1983	0.0044	0.0113	0.6983	-+--+	0.0	2.728	4	0.6043
6 : 45739550 : SNP	a	g	0.2550	0.0069	0.2443	0.2623	-0.0118	0.0100	0.2351	---++	23.6	5.234	4	0.2641
19 : 11053375 : SNP	t	c	0.2712	0.0111	0.2571	0.2896	-0.0156	0.0098	0.1099	--++-	61.6	10.427	4	0.03381
11 : 48794706 : SNP	t	c	0.6272	0.0033	0.6207	0.6307	-0.0122	0.0192	0.5276	??-++	65.3	5.763	2	0.05605
19 : 12707978 : SNP	a	g	0.6627	0.0087	0.6497	0.6756	0.0089	0.0093	0.3369	-+++-	9.2	4.407	4	0.3538
4 : 147451635 : SNP	a	g	0.2158	0.0120	0.2051	0.2483	-0.0016	0.0103	0.8778	++-+-	58.7	9.677	4	0.04623
16 : 50058418 : SNP	t	g	0.0640	0.0071	0.0541	0.0750	0.0106	0.0191	0.5801	+-?-+	6.7	3.214	3	0.3598
6 : 94032507 : SNP	t	c	0.2076	0.0164	0.1951	0.2447	0.0139	0.0105	0.1855	+++++	0.0	0.402	4	0.9823
10 : 72287284 : SNP	a	g	0.9832	0.0000	0.9832	0.9832	0.0020	0.0617	0.9741	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 36176858 : SNP	t	g	0.2952	0.0072	0.2869	0.3161	0.0021	0.0093	0.8197	+-++-	0.0	2.923	4	0.5708
5 : 66338562 : SNP	a	c	0.9859	0.0000	0.9859	0.9859	0.0100	0.0566	0.8598	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 25565579 : SNP	c	g	0.9869	0.0000	0.9869	0.9869	0.0010	0.0556	0.9856	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 145155414 : SNP	a	g	0.1070	0.0054	0.1014	0.1179	0.0220	0.0149	0.1407	++?-+	39.8	4.982	3	0.1731
4 : 117530403 : SNP	a	g	0.5661	0.0278	0.5498	0.6358	-0.0022	0.0086	0.8019	-+--+	0.0	3.477	4	0.4813
11 : 26464562 : SNP	t	c	0.0192	0.0000	0.0192	0.0192	0.0170	0.0445	0.7023	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 106482185 : SNP	c	g	0.3695	0.0127	0.3645	0.4192	0.0032	0.0101	0.7486	--+++	54.5	8.800	4	0.06629
3 : 176225642 : SNP	t	c	0.3763	0.0181	0.3514	0.4028	-0.0075	0.0097	0.4389	0-+-+	0.0	2.822	4	0.5881
12 : 51606837 : SNP	t	c	0.0153	0.0000	0.0153	0.0153	-0.0510	0.0607	0.4004	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 22068662 : SNP	c	g	0.9484	0.0030	0.9413	0.9504	0.0031	0.0204	0.8808	+-?++	0.5	3.014	3	0.3894
11 : 105319056 : SNP	t	c	0.0647	0.0062	0.0567	0.0703	0.0007	0.0230	0.9766	-+??+	82.6	11.515	2	0.003159
6 : 157394300 : SNP	a	g	0.5217	0.0050	0.5104	0.5318	-0.0126	0.0086	0.1402	--+--	0.0	2.234	4	0.6929
16 : 47146244 : SNP	a	g	0.9628	0.0004	0.9624	0.9631	-0.0247	0.0302	0.4135	+-???	27.3	1.376	1	0.2407
2 : 228460164 : SNP	c	g	0.0964	0.0132	0.0876	0.1226	0.0094	0.0162	0.5621	-+?-+	33.2	4.490	3	0.2132
22 : 25219783 : SNP	a	g	0.1919	0.0236	0.1735	0.2376	0.0256	0.0111	0.0208	+-+++	34.2	6.075	4	0.1936
4 : 125188900 : INDEL	d	r	0.0117	0.0000	0.0117	0.0117	0.0350	0.0586	0.5505	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 148835606 : SNP	t	c	0.9426	0.0023	0.9412	0.9492	-0.0109	0.0195	0.5764	+-??-	0.0	0.967	2	0.6165
6 : 40534189 : SNP	t	c	0.0352	0.0025	0.0316	0.0370	0.0078	0.0263	0.7669	+-???	0.0	0.293	1	0.5885
4 : 41230528 : SNP	a	g	0.6378	0.0133	0.6182	0.6851	-0.0099	0.0092	0.281	---+-	35.3	6.183	4	0.1859
9 : 87018682 : SNP	a	g	0.0538	0.0075	0.0401	0.0597	0.0109	0.0203	0.5916	0+??+	0.0	0.606	2	0.7386
2 : 188199871 : SNP	t	c	0.5052	0.0204	0.4776	0.5258	-0.0019	0.0085	0.8198	---++	0.0	2.692	4	0.6106
21 : 46315907 : SNP	t	c	0.2638	0.0304	0.2439	0.3245	-0.0033	0.0098	0.7348	-++--	0.0	0.401	4	0.9824
8 : 87025937 : SNP	t	c	0.1136	0.0050	0.1016	0.1194	0.0114	0.0134	0.3925	++++-	0.0	1.758	4	0.7801
16 : 10167604 : INDEL	d	r	0.0878	0.0042	0.0692	0.0902	-0.0028	0.0164	0.8621	-+?+-	61.9	7.884	3	0.04848
3 : 75526478 : SNP	a	g	0.6742	0.0253	0.6364	0.7008	-0.0145	0.0236	0.539	??---	0.0	0.050	2	0.9751
6 : 130953452 : INDEL	d	r	0.1687	0.0058	0.1526	0.1763	-0.0032	0.0119	0.7857	-+++-	53.6	8.628	4	0.07111
22 : 35894347 : SNP	c	g	0.8566	0.0094	0.8240	0.8617	-0.0145	0.0127	0.2556	----+	25.6	5.376	4	0.2508
12 : 102078834 : SNP	a	g	0.7304	0.0158	0.7149	0.7527	-0.0051	0.0100	0.6077	-+---	0.0	3.708	4	0.4469
9 : 118568823 : SNP	t	c	0.0887	0.0098	0.0758	0.1048	-0.0037	0.0154	0.8122	-+?--	35.6	4.661	3	0.1984
16 : 74179074 : SNP	c	g	0.0761	0.0104	0.0620	0.0888	0.0166	0.0205	0.4179	++?-+	0.0	1.034	3	0.7931
3 : 111511944 : SNP	t	g	0.1108	0.0113	0.0751	0.1231	-0.0159	0.0142	0.2618	---++	44.2	7.168	4	0.1273
9 : 89045679 : SNP	a	t	0.4610	0.0168	0.4304	0.4764	-0.0012	0.0085	0.8858	+--++	71.7	14.134	4	0.00688
5 : 83660822 : INDEL	d	r	0.1036	0.0095	0.0969	0.1219	0.0271	0.0139	0.05064	++++-	0.0	1.239	4	0.8716
6 : 110330596 : INDEL	i	r	0.3977	0.0039	0.3915	0.4043	0.0053	0.0087	0.5394	++++-	0.0	2.058	4	0.7252
5 : 36273546 : SNP	t	c	0.4254	0.0099	0.4068	0.4527	0.0021	0.0086	0.8039	+-+-+	1.5	4.061	4	0.3979
6 : 32424981 : SNP	a	g	0.8654	0.0113	0.8449	0.8731	0.0414	0.0268	0.1221	??+++	0.0	1.116	2	0.5724
1 : 84217282 : SNP	t	c	0.1937	0.0121	0.1753	0.2097	0.0131	0.0109	0.228	+++++	0.0	3.237	4	0.519
18 : 13168621 : SNP	a	t	0.0107	0.0000	0.0107	0.0107	0.0420	0.0637	0.5096	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 171004185 : SNP	a	g	0.5176	0.0163	0.4842	0.5349	0.0073	0.0085	0.3899	++++-	0.0	2.112	4	0.7152
4 : 116461659 : SNP	t	g	0.2684	0.0213	0.2536	0.3095	0.0076	0.0102	0.458	+++-+	0.0	1.876	4	0.7586
15 : 40268426 : SNP	c	g	0.0606	0.0067	0.0493	0.0684	-0.0162	0.0186	0.3835	--?-+	0.0	2.735	3	0.4343
8 : 3815273 : SNP	c	g	0.1249	0.0072	0.1178	0.1369	0.0166	0.0130	0.2035	+++-+	0.0	1.594	4	0.8098
1 : 211898473 : SNP	a	g	0.1439	0.0076	0.1350	0.1616	0.0158	0.0128	0.2145	+--++	22.0	5.128	4	0.2744
6 : 121473010 : SNP	a	g	0.0183	0.0000	0.0183	0.0183	-0.0900	0.0465	0.05293	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 58489467 : SNP	a	g	0.0170	0.0000	0.0170	0.0170	0.1280	0.0526	0.01489	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 176537330 : SNP	a	g	0.9238	0.0208	0.8915	0.9458	-0.0012	0.0174	0.9427	--?++	0.0	2.434	3	0.4873
1 : 21934667 : SNP	a	g	0.5299	0.0148	0.4902	0.5458	-0.0022	0.0086	0.7967	+-+-+	0.0	2.911	4	0.5729
1 : 83112557 : SNP	a	c	0.3537	0.0246	0.3307	0.4038	0.0142	0.0091	0.1184	++-++	0.0	1.798	4	0.7729
22 : 47899925 : SNP	a	c	0.2853	0.0092	0.2765	0.3016	0.0075	0.0092	0.4137	++-++	24.3	5.284	4	0.2594
18 : 40231528 : SNP	a	g	0.7996	0.0063	0.7847	0.8060	0.0052	0.0106	0.6242	-+--+	8.9	4.393	4	0.3555
3 : 69738186 : SNP	t	c	0.1739	0.0171	0.1329	0.1883	-0.0293	0.0115	0.01067	-+---	35.2	6.176	4	0.1864
12 : 30118220 : SNP	t	c	0.8763	0.0195	0.8430	0.8966	0.0041	0.0136	0.7653	-+-+-	7.0	4.301	4	0.3668
16 : 4996075 : SNP	a	c	0.9258	0.0017	0.9228	0.9268	0.0192	0.0273	0.482	+???+	0.0	0.042	1	0.8369
7 : 4465763 : SNP	t	c	0.9577	0.0049	0.9535	0.9644	0.0132	0.0231	0.5671	-+??+	28.7	2.807	2	0.2457
16 : 50788953 : INDEL	d	r	0.1065	0.0032	0.0957	0.1108	0.0039	0.0141	0.7801	+++--	13.2	4.610	4	0.3297
20 : 58067318 : SNP	t	c	0.0756	0.0134	0.0578	0.0927	0.0227	0.0224	0.3126	-+?++	40.7	5.058	3	0.1676
14 : 73429888 : SNP	a	c	0.3083	0.0127	0.2789	0.3366	0.0001	0.0092	0.9899	++-+-	0.0	3.472	4	0.4822
6 : 169948682 : SNP	c	g	0.0675	0.0080	0.0626	0.0823	-0.0063	0.0176	0.7221	--?-+	0.0	0.586	3	0.8996
13 : 27917761 : SNP	c	g	0.4044	0.0086	0.3746	0.4104	-0.0026	0.0086	0.7654	-+-+-	0.0	2.056	4	0.7255
12 : 83992643 : SNP	a	g	0.0137	0.0000	0.0137	0.0137	0.0340	0.0566	0.5481	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 81574989 : SNP	t	g	0.1326	0.0084	0.1158	0.1392	-0.0138	0.0128	0.2843	-+--+	25.9	5.399	4	0.2488
1 : 111559157 : SNP	a	g	0.0322	0.0052	0.0289	0.0402	-0.0114	0.0322	0.7226	-???-	0.0	0.000	1	0.9831
1 : 89322127 : INDEL	i	r	0.8516	0.0135	0.8317	0.8698	0.0293	0.0145	0.04278	+++++	0.0	0.531	4	0.9705
20 : 15837100 : SNP	t	g	0.8201	0.0097	0.8133	0.8485	-0.0171	0.0112	0.1252	--+--	0.0	2.152	4	0.7079
18 : 76786923 : SNP	a	c	0.8386	0.0126	0.8150	0.8539	-0.0067	0.0121	0.5782	--+-+	4.9	4.205	4	0.379
4 : 34361090 : SNP	a	g	0.8367	0.0053	0.8239	0.8518	-0.0053	0.0116	0.6469	-+-++	0.0	3.701	4	0.448
1 : 17783558 : SNP	t	c	0.6464	0.0152	0.6377	0.6957	-0.0062	0.0092	0.4962	+-+++	0.0	3.906	4	0.4188
3 : 182767175 : SNP	t	c	0.0682	0.0044	0.0609	0.0712	-0.0058	0.0171	0.7342	-+?+-	0.0	1.822	3	0.6102
5 : 125733043 : SNP	t	c	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	0.0000	0.0495	1	0????	0.0	0.000	0	1
1 : 101960142 : SNP	t	c	0.8516	0.0172	0.8433	0.8931	-0.0137	0.0122	0.2612	--+++	0.0	1.642	4	0.8013
12 : 32345572 : SNP	a	g	0.2800	0.0154	0.2486	0.2889	-0.0086	0.0098	0.3799	--++-	0.0	0.897	4	0.925
10 : 108244457 : SNP	c	g	0.0140	0.0000	0.0140	0.0140	-0.0130	0.0556	0.8151	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 20110189 : SNP	a	g	0.0517	0.0048	0.0481	0.0613	0.0154	0.0200	0.4433	++?++	0.0	0.273	3	0.9649
6 : 50738125 : INDEL	d	r	0.3105	0.0129	0.2838	0.3203	0.0062	0.0092	0.5036	+++--	0.0	2.066	4	0.7236
7 : 31272537 : SNP	a	g	0.2401	0.0135	0.2237	0.2630	-0.0082	0.0100	0.4074	+---+	64.5	11.253	4	0.02387
5 : 79807425 : INDEL	i	r	0.2785	0.0176	0.2409	0.2917	-0.0040	0.0100	0.6909	+---+	0.0	1.686	4	0.7933
5 : 26124704 : SNP	c	g	0.0898	0.0188	0.0785	0.1419	-0.0067	0.0170	0.6911	-+?-+	0.0	1.040	3	0.7916
20 : 34757500 : SNP	t	c	0.0404	0.0043	0.0383	0.0550	0.0452	0.0222	0.04169	++?++	0.0	0.604	3	0.8956
2 : 155353711 : SNP	t	c	0.5104	0.0121	0.4834	0.5246	-0.0093	0.0085	0.2747	--++-	40.4	6.711	4	0.152
3 : 189931067 : SNP	t	c	0.8742	0.0109	0.8683	0.8994	-0.0016	0.0130	0.9023	-+-++	36.0	6.254	4	0.181
2 : 197983394 : SNP	a	g	0.8284	0.0166	0.7801	0.8438	0.0115	0.0153	0.4504	+-+++	0.0	3.073	4	0.5457
11 : 4988607 : SNP	c	g	0.4215	0.0192	0.3793	0.4381	-0.0131	0.0085	0.1248	---+-	0.0	2.023	4	0.7315
1 : 240320866 : INDEL	d	r	0.0636	0.0026	0.0572	0.0652	-0.0123	0.0180	0.4948	--?--	0.0	1.887	3	0.5962
6 : 49944535 : SNP	c	g	0.4987	0.0225	0.4795	0.5468	-0.0050	0.0084	0.5477	--+-+	28.1	5.561	4	0.2345
18 : 731545 : SNP	t	c	0.8716	0.0072	0.8608	0.8929	0.0039	0.0128	0.7574	+-+++	0.0	2.762	4	0.5985
14 : 43089445 : INDEL	i	r	0.3302	0.0098	0.2987	0.3394	0.0007	0.0092	0.936	++-+-	0.0	2.427	4	0.6578
5 : 74431631 : SNP	t	c	0.3492	0.0139	0.3385	0.3974	-0.0033	0.0091	0.7194	--++-	53.0	8.512	4	0.07453
7 : 104106350 : SNP	a	g	0.0150	0.0000	0.0150	0.0150	0.0640	0.0617	0.2993	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 84049204 : SNP	t	c	0.3235	0.0101	0.3155	0.3654	0.0010	0.0091	0.9098	-++++	0.0	3.166	4	0.5305
5 : 16661843 : SNP	c	g	0.9304	0.0053	0.9266	0.9378	-0.0409	0.0222	0.06483	--???	37.1	1.589	1	0.2075
10 : 106747354 : SNP	a	t	0.2268	0.0231	0.2074	0.2688	-0.0056	0.0102	0.5851	--++-	0.0	1.002	4	0.9095
15 : 46419244 : SNP	a	g	0.4125	0.0226	0.3939	0.4600	0.0005	0.0085	0.9511	+0--+	44.4	7.200	4	0.1257
8 : 52080649 : SNP	a	g	0.0290	0.0000	0.0290	0.0290	-0.0160	0.0414	0.6995	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 9555624 : SNP	t	g	0.1896	0.0188	0.1453	0.2028	0.0141	0.0295	0.6316	??++-	47.1	3.778	2	0.1512
15 : 41691818 : SNP	c	g	0.0322	0.0128	0.0206	0.0464	-0.0165	0.0367	0.6532	-???+	0.0	0.277	1	0.5985
18 : 74955281 : SNP	t	c	0.4376	0.0115	0.4197	0.4640	-0.0137	0.0086	0.1089	--+++	0.0	3.679	4	0.4512
11 : 34048422 : SNP	t	c	0.7506	0.0083	0.7454	0.7697	-0.0041	0.0100	0.6821	---++	0.0	3.764	4	0.4389
12 : 33635898 : SNP	t	g	0.9792	0.0000	0.9792	0.9792	0.0090	0.0425	0.8321	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 44433504 : SNP	a	c	0.2081	0.0178	0.1940	0.2471	-0.0191	0.0105	0.06998	-----	2.1	4.086	4	0.3945
1 : 48969217 : SNP	t	g	0.0387	0.0023	0.0371	0.0421	-0.0401	0.0359	0.2633	-???-	0.0	0.169	1	0.681
2 : 18443497 : SNP	t	c	0.8953	0.0058	0.8830	0.9097	-0.0004	0.0141	0.9759	---++	78.9	18.961	4	0.0007998
17 : 3422353 : SNP	a	g	0.4741	0.0306	0.4079	0.4928	0.0058	0.0086	0.4974	++-++	46.8	7.521	4	0.1108
17 : 58831295 : SNP	a	c	0.1241	0.0085	0.1108	0.1307	-0.0068	0.0188	0.7164	-?++-	18.2	3.668	3	0.2997
8 : 134919255 : SNP	t	c	0.0434	0.0011	0.0426	0.0449	-0.0149	0.0244	0.5422	-+???	19.9	1.248	1	0.2639
1 : 80368592 : SNP	t	g	0.9776	0.0000	0.9776	0.9776	-0.0510	0.0556	0.359	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 125958104 : SNP	c	g	0.0622	0.0150	0.0530	0.0937	-0.0039	0.0186	0.8327	+-?-+	0.0	2.292	3	0.514
5 : 172508979 : SNP	t	c	0.9690	0.0000	0.9690	0.9690	-0.0160	0.0647	0.8047	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 150669976 : SNP	c	g	0.8344	0.0071	0.8278	0.8483	-0.0111	0.0117	0.3439	--++-	0.0	0.719	4	0.949
17 : 52342648 : SNP	a	t	0.5624	0.0148	0.5229	0.5935	0.0049	0.0085	0.566	-++++	0.0	0.703	4	0.9509
1 : 231052941 : SNP	a	c	0.1567	0.0080	0.1315	0.1830	-0.0153	0.0118	0.1951	--++-	0.0	3.274	4	0.5131
18 : 70640622 : SNP	a	g	0.2288	0.0055	0.2171	0.2392	-0.0036	0.0101	0.7231	+-++-	0.0	3.898	4	0.42
14 : 78392012 : SNP	a	t	0.9073	0.0071	0.8959	0.9131	0.0131	0.0150	0.3829	-+?++	42.4	5.208	3	0.1572
5 : 30015946 : SNP	a	g	0.6597	0.0087	0.6386	0.6659	-0.0035	0.0091	0.6962	--++-	0.0	0.975	4	0.9135
4 : 189432029 : SNP	t	c	0.1907	0.0045	0.1839	0.1981	-0.0183	0.0112	0.103	---+-	0.0	3.281	4	0.5119
9 : 130123425 : SNP	a	g	0.4408	0.0209	0.4292	0.4856	-0.0218	0.0085	0.0106	---+-	13.4	4.620	4	0.3285
3 : 103115204 : SNP	a	g	0.3188	0.0117	0.2835	0.3252	0.0012	0.0092	0.8955	-+-++	0.0	3.263	4	0.5148
14 : 40911581 : SNP	c	g	0.6057	0.0139	0.5954	0.6335	-0.0040	0.0090	0.6577	-++--	59.5	9.868	4	0.04271
3 : 7921226 : SNP	a	g	0.0267	0.0004	0.0262	0.0270	-0.0092	0.0302	0.7594	+-???	87.8	8.182	1	0.00423
10 : 112776201 : SNP	t	g	0.0795	0.0058	0.0753	0.0882	-0.0178	0.0287	0.5358	-??-+	0.0	1.431	2	0.4889
2 : 131085954 : SNP	a	g	0.8851	0.0073	0.8678	0.9006	-0.0157	0.0148	0.2894	--+-+	49.1	7.855	4	0.09703
8 : 82411803 : SNP	t	g	0.7592	0.0054	0.7516	0.7812	-0.0072	0.0106	0.5004	---+-	0.0	1.280	4	0.8647
10 : 29855695 : SNP	a	g	0.0784	0.0059	0.0673	0.0834	-0.0099	0.0164	0.5459	-+?--	40.3	5.026	3	0.1699
5 : 168634031 : SNP	t	c	0.9695	0.0000	0.9695	0.9695	0.0490	0.0414	0.2371	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 106785055 : SNP	a	g	0.2777	0.0451	0.2337	0.3594	0.0140	0.0103	0.1743	+-+++	0.0	1.422	4	0.8404
1 : 163106580 : SNP	t	c	0.6330	0.0087	0.6035	0.6413	0.0000	0.0087	0.9999	-++--	0.0	0.240	4	0.9933
1 : 164211600 : SNP	t	c	0.0912	0.0022	0.0894	0.0951	-0.0188	0.0149	0.2054	----+	0.0	0.892	4	0.9257
18 : 40103183 : SNP	a	g	0.8591	0.0151	0.8391	0.8746	0.0025	0.0121	0.8378	++---	0.0	3.229	4	0.5203
1 : 163315858 : SNP	a	c	0.8602	0.0036	0.8572	0.8708	0.0113	0.0126	0.3695	+0--+	55.1	8.909	4	0.06342
1 : 41421720 : SNP	t	c	0.3067	0.0058	0.2802	0.3188	-0.0136	0.0094	0.1469	-0--+	31.5	5.839	4	0.2115
12 : 77572973 : SNP	a	t	0.8925	0.0078	0.8827	0.9076	-0.0040	0.0142	0.7772	-+---	7.7	4.332	4	0.3629
2 : 108885748 : SNP	a	t	0.8093	0.0024	0.7996	0.8109	-0.0135	0.0107	0.2045	-----	0.0	0.307	4	0.9893
1 : 65594014 : SNP	t	c	0.0704	0.0106	0.0617	0.0900	-0.0181	0.0184	0.3246	+-?--	19.1	3.707	3	0.2949
16 : 13357304 : SNP	t	g	0.6235	0.0101	0.5898	0.6359	0.0006	0.0086	0.9459	++---	0.0	1.242	4	0.8711
2 : 95974982 : SNP	t	c	0.0381	0.0000	0.0381	0.0381	0.0230	0.0354	0.5156	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 130994380 : SNP	t	c	0.4784	0.0303	0.4574	0.5394	-0.0134	0.0085	0.1167	--++-	0.0	0.943	4	0.9183
15 : 48740072 : SNP	t	c	0.9834	0.0000	0.9834	0.9834	-0.0080	0.0485	0.869	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 43394331 : SNP	a	c	0.8027	0.0090	0.7793	0.8177	0.0005	0.0119	0.9695	+-++-	0.0	1.039	4	0.9038
8 : 9108365 : SNP	t	c	0.0610	0.0080	0.0539	0.0893	-0.0034	0.0178	0.8504	--+-+	0.0	3.113	4	0.5392
9 : 15906885 : SNP	a	g	0.8358	0.0171	0.7955	0.8539	0.0059	0.0119	0.6175	+-+--	0.0	2.108	4	0.716
2 : 196283310 : SNP	t	c	0.9407	0.0037	0.9315	0.9458	-0.0221	0.0188	0.2395	--?-+	31.6	4.388	3	0.2225
6 : 104860014 : SNP	a	c	0.1689	0.0128	0.1215	0.1784	0.0057	0.0114	0.6192	-++++	0.0	3.793	4	0.4347
10 : 17600048 : INDEL	d	r	0.5135	0.0155	0.4798	0.5357	-0.0167	0.0091	0.06641	-----	54.1	8.722	4	0.06842
13 : 108437463 : SNP	t	c	0.9535	0.0016	0.9514	0.9548	-0.0005	0.0230	0.9815	-+???	0.0	0.036	1	0.8489
15 : 72041134 : SNP	a	c	0.2623	0.0085	0.2548	0.2744	0.0079	0.0098	0.4221	+0+--	55.0	8.885	4	0.06404
14 : 64685212 : SNP	a	g	0.9864	0.0000	0.9864	0.9864	-0.0080	0.0566	0.8876	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 47116128 : INDEL	d	r	0.2528	0.0166	0.2392	0.2859	-0.0112	0.0099	0.2572	--+-+	43.8	7.117	4	0.1298
7 : 62979566 : SNP	t	c	0.8575	0.0000	0.8575	0.8575	0.0291	0.0828	0.7253	???+?	0.0	0.000	0	1
21 : 20178394 : SNP	t	c	0.9853	0.0000	0.9853	0.9853	-0.0340	0.0505	0.5011	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 137814741 : SNP	t	g	0.0246	0.0000	0.0246	0.0246	-0.0250	0.0485	0.6064	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 81186812 : SNP	c	g	0.1487	0.0168	0.1269	0.1968	0.0040	0.0152	0.7906	+-++-	44.1	7.154	4	0.128
9 : 114882327 : SNP	t	c	0.1846	0.0139	0.1754	0.2126	-0.0093	0.0111	0.4014	--+-+	0.0	0.455	4	0.9778
12 : 95737369 : SNP	a	g	0.3755	0.0249	0.3105	0.3876	-0.0041	0.0090	0.6507	--++-	0.0	2.343	4	0.6729
4 : 17553209 : SNP	c	g	0.5676	0.0071	0.5618	0.5874	-0.0120	0.0094	0.2036	---++	0.0	1.936	4	0.7476
3 : 191317188 : SNP	a	g	0.0334	0.0018	0.0324	0.0365	0.0226	0.0307	0.4619	+???+	0.0	0.142	1	0.7063
5 : 126720415 : SNP	t	c	0.9823	0.0000	0.9823	0.9823	-0.0730	0.0475	0.1244	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 189051006 : SNP	t	g	0.0605	0.0120	0.0486	0.0842	0.0132	0.0210	0.5278	--?++	48.4	5.817	3	0.1208
13 : 25269328 : SNP	a	g	0.0667	0.0038	0.0578	0.0705	-0.0087	0.0186	0.6402	--??+	48.3	3.871	2	0.1444
19 : 53251866 : INDEL	i	r	0.2975	0.0165	0.2620	0.3090	-0.0066	0.0105	0.5309	-+-+-	0.0	2.483	4	0.6477
12 : 44250946 : SNP	a	g	0.0329	0.0011	0.0324	0.0355	0.0063	0.0250	0.8012	-+??+	0.0	0.429	2	0.8067
8 : 144515799 : SNP	t	c	0.0166	0.0000	0.0166	0.0166	-0.0290	0.0586	0.6209	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 25007399 : SNP	a	c	0.9671	0.0000	0.9671	0.9671	0.0540	0.0354	0.1269	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 49344684 : SNP	a	c	0.8288	0.0180	0.7888	0.8416	0.0046	0.0116	0.6928	-++--	42.1	6.912	4	0.1406
22 : 31024193 : SNP	t	c	0.9701	0.0022	0.9673	0.9719	-0.0306	0.0285	0.2835	--???	0.0	0.000	1	0.9864
9 : 6998578 : SNP	c	g	0.8207	0.0167	0.7772	0.8301	-0.0008	0.0111	0.9406	++---	0.0	2.824	4	0.5878
3 : 27595519 : SNP	t	c	0.1456	0.0173	0.1231	0.1752	0.0068	0.0125	0.5881	+-+--	0.0	1.567	4	0.8147
4 : 175485318 : SNP	t	c	0.6368	0.0196	0.6258	0.6802	-0.0145	0.0088	0.09947	-----	0.0	3.788	4	0.4354
12 : 16124948 : SNP	t	c	0.6064	0.0117	0.5978	0.6406	-0.0062	0.0086	0.4695	-++--	67.4	12.275	4	0.01542
6 : 99775983 : SNP	a	g	0.9788	0.0000	0.9788	0.9788	0.0240	0.0475	0.6135	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 22920835 : INDEL	d	r	0.0137	0.0000	0.0137	0.0137	-0.0110	0.0637	0.8629	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 46226588 : SNP	a	c	0.0873	0.0039	0.0781	0.0900	0.0034	0.0152	0.8238	+---+	60.1	10.014	4	0.04019
11 : 38439066 : SNP	c	g	0.5009	0.0045	0.4975	0.5198	0.0084	0.0085	0.3249	+---+	0.0	2.675	4	0.6136
10 : 34144112 : INDEL	d	r	0.3071	0.0118	0.2761	0.3200	0.0088	0.0106	0.4057	+---+	0.0	0.745	4	0.9456
7 : 75135243 : SNP	t	c	0.5410	0.0144	0.4807	0.5768	-0.0021	0.0094	0.8222	-+-+-	0.0	3.299	4	0.5092
2 : 191214728 : SNP	a	g	0.0338	0.0022	0.0309	0.0377	-0.0399	0.0252	0.1129	--??-	0.0	1.132	2	0.5678
14 : 95944091 : INDEL	d	r	0.1592	0.0175	0.1306	0.1726	0.0264	0.0166	0.1119	+--++	0.0	2.872	4	0.5795
5 : 5114547 : SNP	t	c	0.5360	0.0067	0.5319	0.5576	0.0056	0.0135	0.677	++-++	0.0	0.225	4	0.9941
11 : 26805374 : SNP	a	g	0.4060	0.0157	0.3590	0.4180	-0.0076	0.0086	0.3735	-+++-	0.0	2.921	4	0.5711
20 : 49229750 : SNP	t	c	0.0178	0.0000	0.0178	0.0178	0.0400	0.0485	0.4097	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 217202672 : SNP	t	c	0.7780	0.0136	0.7496	0.7949	0.0031	0.0104	0.7634	-+--+	0.0	3.037	4	0.5517
7 : 28474561 : INDEL	d	r	0.3611	0.0117	0.3436	0.3701	-0.0066	0.0088	0.4507	---+-	0.0	0.167	4	0.9967
4 : 11341682 : SNP	a	g	0.6482	0.0316	0.5786	0.6650	0.0011	0.0091	0.9006	-+--+	0.0	3.759	4	0.4397
4 : 20033948 : SNP	a	c	0.7978	0.0038	0.7814	0.8019	-0.0153	0.0105	0.1433	+----	16.2	4.771	4	0.3116
2 : 98892107 : SNP	a	g	0.5419	0.0283	0.5033	0.6032	0.0008	0.0085	0.9295	+0-+-	0.0	0.493	4	0.9742
7 : 81335460 : SNP	t	c	0.3099	0.0146	0.2871	0.3236	0.0004	0.0094	0.9681	+-+--	64.1	11.140	4	0.02504
3 : 191719040 : INDEL	d	r	0.2864	0.0105	0.2473	0.3089	0.0020	0.0094	0.8298	+--++	0.0	2.624	4	0.6226
6 : 88046449 : SNP	c	g	0.5929	0.0070	0.5825	0.6049	-0.0108	0.0086	0.2071	+---+	57.4	9.387	4	0.05212
8 : 89790568 : INDEL	d	r	0.8594	0.0211	0.8223	0.8809	0.0134	0.0126	0.2896	+-+++	67.0	12.108	4	0.01657
14 : 85744304 : SNP	a	t	0.9350	0.0014	0.9339	0.9369	0.0208	0.0196	0.288	++???	17.1	1.206	1	0.2721
19 : 56687106 : SNP	t	c	0.5466	0.0251	0.5119	0.5823	0.0040	0.0108	0.7139	-+--+	4.8	4.200	4	0.3796
11 : 128730876 : SNP	c	g	0.0757	0.0084	0.0636	0.0825	0.0117	0.0167	0.4819	+-?+-	19.5	3.728	3	0.2924
19 : 43619003 : SNP	t	c	0.9281	0.0077	0.9118	0.9349	-0.0330	0.0290	0.255	?-+--	0.0	0.795	3	0.8507
6 : 32547015 : SNP	c	g	0.2687	0.0156	0.2318	0.2830	-0.0265	0.0217	0.2225	??+--	0.0	1.469	2	0.4798
12 : 114054086 : SNP	t	c	0.0179	0.0000	0.0179	0.0179	0.0610	0.0445	0.1702	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 145933328 : SNP	a	g	0.3022	0.0265	0.2661	0.3430	0.0218	0.0139	0.1162	++++?	21.3	3.811	3	0.2826
16 : 1362559 : SNP	c	g	0.8484	0.0056	0.8465	0.8670	-0.0237	0.0132	0.07162	----?	0.0	1.068	3	0.7848
20 : 46331720 : SNP	t	g	0.4371	0.0227	0.3973	0.4656	-0.0005	0.0086	0.9569	-+-++	4.0	4.167	4	0.3838
5 : 81576965 : SNP	a	c	0.6950	0.0053	0.6893	0.7061	0.0045	0.0092	0.626	-++-+	0.0	3.728	4	0.4441
18 : 69876968 : SNP	t	c	0.1276	0.0331	0.1145	0.2578	0.0179	0.0138	0.1944	+-+++	27.8	5.541	4	0.2362
18 : 14556015 : SNP	t	c	0.9375	0.0000	0.9375	0.9375	0.0509	0.0518	0.3258	????+	0.0	0.000	0	1
4 : 128297851 : SNP	a	g	0.3456	0.0060	0.3424	0.3725	-0.0034	0.0089	0.7045	--+-+	41.4	6.821	4	0.1457
9 : 122808220 : SNP	a	g	0.0963	0.0043	0.0915	0.1027	-0.0283	0.0148	0.05677	---+-	0.0	3.235	4	0.5192
1 : 2506861 : SNP	t	c	0.0248	0.0000	0.0248	0.0248	0.0610	0.0445	0.1702	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 112842762 : SNP	a	g	0.5631	0.0102	0.5415	0.5717	0.0037	0.0085	0.6605	+0-+-	0.0	2.958	4	0.5648
1 : 69558080 : SNP	t	c	0.2714	0.0022	0.2703	0.2806	-0.0056	0.0098	0.5685	+-+--	68.3	12.614	4	0.01333
2 : 60900351 : SNP	t	g	0.1705	0.0074	0.1650	0.1933	0.0000	0.0113	0.9983	+-++-	0.0	0.692	4	0.9523
2 : 123872922 : INDEL	d	r	0.0236	0.0000	0.0236	0.0236	0.0420	0.0647	0.5162	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 43189257 : SNP	a	g	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	0.0400	0.0475	0.3998	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 59123814 : SNP	a	g	0.6896	0.0122	0.6820	0.7177	-0.0130	0.0092	0.1587	---+-	33.0	5.968	4	0.2016
5 : 8665746 : SNP	t	g	0.8349	0.0095	0.8242	0.8484	0.0139	0.0115	0.2288	+++-+	26.9	5.474	4	0.242
6 : 102239388 : SNP	t	c	0.0202	0.0000	0.0202	0.0202	-0.0850	0.0435	0.05052	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 72907723 : SNP	t	c	0.0242	0.0000	0.0242	0.0242	0.0350	0.0465	0.4516	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 25919996 : SNP	t	c	0.9517	0.0073	0.9407	0.9606	0.0176	0.0220	0.4223	++?-+	0.0	0.816	3	0.8457
1 : 81265427 : SNP	t	c	0.0332	0.0060	0.0273	0.0392	0.0330	0.0331	0.3185	++???	0.0	0.001	1	0.9759
7 : 104413768 : SNP	t	c	0.1359	0.0018	0.1339	0.1413	-0.0051	0.0127	0.6901	+----	0.0	2.931	4	0.5694
5 : 74520003 : SNP	t	c	0.9589	0.0000	0.9589	0.9589	-0.0340	0.0495	0.4924	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 67260106 : SNP	a	g	0.6594	0.0064	0.6467	0.6668	0.0005	0.0091	0.9602	---++	0.0	3.120	4	0.538
3 : 46781769 : SNP	a	g	0.0316	0.0023	0.0295	0.0363	0.0246	0.0253	0.3315	+-??+	0.0	0.702	2	0.7041
14 : 94687041 : SNP	a	c	0.8293	0.0150	0.8094	0.8644	-0.0070	0.0112	0.5353	-+--+	19.1	4.941	4	0.2934
3 : 168848765 : SNP	t	c	0.0370	0.0044	0.0314	0.0444	-0.0083	0.0242	0.7305	+-??+	48.1	3.852	2	0.1458
3 : 143052694 : SNP	t	c	0.4797	0.0138	0.4670	0.5143	-0.0069	0.0085	0.4155	--+--	0.0	2.179	4	0.7029
11 : 97116016 : SNP	a	g	0.6513	0.0127	0.6230	0.6626	-0.0108	0.0091	0.2394	--+-+	55.1	8.910	4	0.06338
20 : 39550490 : SNP	t	g	0.9530	0.0024	0.9486	0.9550	0.0202	0.0216	0.3484	++??-	0.0	0.427	2	0.8078
2 : 34715802 : SNP	a	t	0.9775	0.0000	0.9775	0.9775	0.0070	0.0617	0.9096	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 8263241 : SNP	c	g	0.9846	0.0000	0.9846	0.9846	0.0670	0.0536	0.2111	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 144255252 : SNP	a	g	0.5775	0.0070	0.5524	0.5821	-0.0137	0.0085	0.1065	-++--	46.5	7.479	4	0.1126
7 : 155834569 : SNP	t	c	0.3120	0.0203	0.2757	0.3483	-0.0064	0.0091	0.4805	-++--	57.1	9.317	4	0.05364
7 : 147197245 : INDEL	d	r	0.2460	0.0157	0.2263	0.2741	0.0010	0.0101	0.9218	++---	0.0	3.790	4	0.4352
11 : 122565038 : SNP	a	g	0.0758	0.0054	0.0694	0.0886	0.0089	0.0165	0.5879	-+?++	21.8	3.835	3	0.2798
15 : 60259770 : SNP	t	c	0.7378	0.0140	0.7298	0.7685	0.0058	0.0099	0.5614	+++-+	0.0	1.024	4	0.9062
7 : 105700198 : SNP	t	c	0.0922	0.0112	0.0744	0.1095	-0.0098	0.0197	0.6181	-+?-+	70.9	10.323	3	0.01601
8 : 95727741 : SNP	c	g	0.5711	0.0088	0.5399	0.5785	0.0021	0.0089	0.8105	--+-+	0.0	1.907	4	0.7528
18 : 40326905 : SNP	a	g	0.1405	0.0059	0.1261	0.1463	-0.0103	0.0124	0.4066	+---+	14.8	4.694	4	0.3202
6 : 54541935 : SNP	t	c	0.9260	0.0039	0.9218	0.9323	-0.0139	0.0168	0.4057	--?-+	0.0	2.613	3	0.4553
11 : 127853210 : SNP	a	g	0.6205	0.0156	0.5695	0.6339	0.0029	0.0087	0.7352	-++++	0.0	2.352	4	0.6713
5 : 55654145 : SNP	a	g	0.8420	0.0070	0.8268	0.8495	-0.0051	0.0120	0.6687	-+--+	28.7	5.609	4	0.2303
16 : 7477742 : SNP	t	c	0.0364	0.0000	0.0364	0.0364	-0.0410	0.0364	0.2599	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 237107048 : SNP	a	g	0.9836	0.0000	0.9836	0.9836	0.0390	0.0546	0.4749	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 17439443 : SNP	t	c	0.2413	0.0093	0.2250	0.2528	-0.0070	0.0099	0.4785	-+--+	0.0	2.919	4	0.5714
11 : 50391523 : SNP	a	t	0.9365	0.0022	0.9329	0.9394	0.0142	0.0181	0.433	++?++	0.0	0.316	3	0.9571
10 : 68258542 : SNP	t	c	0.0117	0.0000	0.0117	0.0117	0.0240	0.0576	0.677	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 111042078 : SNP	t	c	0.0150	0.0000	0.0150	0.0150	-0.0130	0.0516	0.8009	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 56312538 : SNP	a	g	0.7441	0.0114	0.7300	0.7645	-0.0030	0.0098	0.7601	+--+-	2.5	4.102	4	0.3924
2 : 213296058 : SNP	t	c	0.7846	0.0109	0.7451	0.8070	0.0068	0.0106	0.5195	+--++	66.7	12.024	4	0.01718
8 : 123409894 : SNP	t	g	0.8907	0.0134	0.8661	0.9032	0.0084	0.0139	0.5428	+++-+	69.0	12.914	4	0.0117
7 : 157818754 : SNP	t	c	0.1451	0.0096	0.1395	0.1656	-0.0103	0.0126	0.415	-+?+-	46.0	5.556	3	0.1353
18 : 61887881 : SNP	a	g	0.4177	0.0127	0.3854	0.4330	0.0050	0.0096	0.6021	-+--+	0.0	2.363	4	0.6692
3 : 20579175 : SNP	c	g	0.0576	0.0083	0.0524	0.0731	0.0122	0.0193	0.5273	-+?+-	76.5	12.747	3	0.005216
4 : 70930555 : SNP	c	g	0.0125	0.0000	0.0125	0.0125	-0.0510	0.0566	0.3676	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 26744135 : INDEL	d	r	0.1838	0.0128	0.1713	0.2135	-0.0012	0.0111	0.9126	+-+--	0.0	0.511	4	0.9725
2 : 8562032 : SNP	a	g	0.0979	0.0114	0.0811	0.1219	0.0021	0.0163	0.8959	+-?--	30.1	4.293	3	0.2315
1 : 232114728 : SNP	a	g	0.9470	0.0082	0.9325	0.9538	-0.0030	0.0199	0.8814	+-?--	8.1	3.265	3	0.3525
2 : 61313503 : SNP	a	g	0.9598	0.0010	0.9590	0.9613	-0.0025	0.0228	0.9119	-+??+	0.0	0.969	2	0.6159
3 : 36741155 : SNP	a	c	0.8634	0.0107	0.8345	0.8701	0.0148	0.0124	0.231	++++-	0.0	0.571	4	0.9662
13 : 101112219 : SNP	a	g	0.9441	0.0073	0.9396	0.9655	-0.0034	0.0195	0.8625	+-??-	4.3	2.091	2	0.3516
2 : 176382229 : SNP	t	c	0.9834	0.0000	0.9834	0.9834	-0.0010	0.0505	0.9842	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 18736877 : SNP	a	g	0.2559	0.0070	0.2364	0.2617	-0.0060	0.0099	0.5441	-+++-	0.0	1.672	4	0.7958
6 : 117032510 : SNP	a	c	0.0384	0.0018	0.0374	0.0415	-0.0721	0.0289	0.01261	-???-	0.0	0.427	1	0.5137
16 : 79570069 : SNP	t	c	0.1287	0.0102	0.1208	0.1574	0.0395	0.0139	0.004369	+-+-+	43.5	7.077	4	0.1319
2 : 67932298 : SNP	a	g	0.3747	0.0236	0.3191	0.4042	0.0047	0.0086	0.5889	+--++	57.6	9.427	4	0.05126
1 : 41999873 : SNP	t	c	0.4033	0.0068	0.3984	0.4269	0.0062	0.0085	0.4659	++++-	21.4	5.089	4	0.2783
8 : 60165107 : SNP	a	t	0.4211	0.0199	0.4056	0.4628	0.0008	0.0085	0.9213	+-+-+	0.0	3.272	4	0.5133
1 : 113468001 : INDEL	d	r	0.5668	0.0068	0.5611	0.5811	0.0001	0.0085	0.9886	++++-	0.0	3.030	4	0.5528
13 : 81175427 : SNP	a	g	0.9754	0.0092	0.9639	0.9827	-0.0025	0.0379	0.9479	-???+	0.0	0.555	1	0.4564
2 : 33557183 : SNP	a	g	0.9763	0.0000	0.9763	0.9763	0.0290	0.0414	0.4841	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 63545838 : SNP	a	t	0.5286	0.0253	0.5163	0.5868	-0.0020	0.0085	0.8154	-++--	0.0	3.087	4	0.5433
2 : 233854241 : SNP	a	g	0.4241	0.0139	0.4137	0.4532	0.0061	0.0085	0.4752	+-+-+	6.1	4.259	4	0.372
1 : 188412333 : INDEL	d	r	0.2822	0.0140	0.2707	0.3083	0.0024	0.0111	0.8273	-+--+	0.0	1.275	4	0.8656
7 : 137515993 : SNP	a	g	0.9342	0.0087	0.9154	0.9424	0.0331	0.0183	0.06997	-+?-+	68.4	9.487	3	0.02347
1 : 106823089 : SNP	t	c	0.5041	0.0103	0.4891	0.5144	0.0138	0.0085	0.1048	+-+++	8.4	4.366	4	0.3587
1 : 55189223 : SNP	a	g	0.9495	0.0030	0.9430	0.9541	-0.0161	0.0202	0.4271	--?+-	36.5	4.724	3	0.1932
1 : 158673079 : SNP	a	c	0.3684	0.0110	0.3518	0.3961	-0.0039	0.0097	0.6883	-+-+-	0.0	2.565	4	0.633
5 : 154144192 : SNP	t	c	0.9239	0.0087	0.8965	0.9298	0.0043	0.0166	0.7949	+-?-+	0.0	1.651	3	0.6479
16 : 88185033 : SNP	a	g	0.2049	0.0237	0.1476	0.2286	0.0057	0.0127	0.6533	+--+-	18.2	4.888	4	0.299
7 : 8867783 : SNP	a	g	0.1081	0.0112	0.0806	0.1145	0.0040	0.0138	0.7741	+++--	0.0	3.223	4	0.5212
4 : 7634465 : SNP	a	g	0.2561	0.0160	0.2201	0.2671	-0.0120	0.0100	0.2275	-0---	0.0	1.791	4	0.7742
20 : 33522869 : SNP	t	c	0.3853	0.0326	0.3431	0.4482	-0.0039	0.0087	0.6504	++---	0.0	1.989	4	0.7378
12 : 133051301 : SNP	a	g	0.0843	0.0063	0.0801	0.0936	0.0035	0.0497	0.9441	???+-	15.7	1.186	1	0.2762
1 : 193455331 : SNP	a	g	0.7072	0.0118	0.6588	0.7205	-0.0039	0.0092	0.6721	+---+	3.5	4.146	4	0.3866
8 : 84312452 : SNP	t	c	0.4008	0.0084	0.3883	0.4190	-0.0131	0.0086	0.1254	----+	9.8	4.436	4	0.3502
15 : 26088407 : SNP	a	g	0.0356	0.0007	0.0350	0.0364	0.0273	0.0271	0.3129	++???	0.0	0.021	1	0.8842
13 : 83495577 : SNP	a	g	0.8994	0.0080	0.8847	0.9071	0.0115	0.0145	0.4286	+--++	31.3	5.824	4	0.2127
10 : 113952031 : SNP	a	g	0.0921	0.0071	0.0870	0.1021	-0.0667	0.0488	0.1722	???+-	56.7	2.311	1	0.1285
2 : 16146710 : INDEL	d	r	0.1453	0.0192	0.1142	0.1705	0.0093	0.0139	0.5033	++-++	0.0	2.199	4	0.6991
22 : 42217000 : SNP	a	g	0.9862	0.0000	0.9862	0.9862	-0.0330	0.0526	0.5301	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 102128509 : SNP	t	c	0.2388	0.0050	0.2341	0.2468	0.0149	0.0099	0.1302	+++++	0.0	0.736	4	0.9469
15 : 36407395 : SNP	a	g	0.2963	0.0086	0.2672	0.3030	0.0007	0.0094	0.9401	+-+--	0.0	3.490	4	0.4794
6 : 122934283 : SNP	a	g	0.2873	0.0094	0.2634	0.2925	-0.0083	0.0093	0.3698	--+--	0.0	1.717	4	0.7876
12 : 38357455 : SNP	t	c	0.6275	0.0228	0.6086	0.6750	-0.0083	0.0091	0.3632	+--+-	24.5	5.295	4	0.2583
1 : 201439942 : SNP	a	g	0.6335	0.0249	0.5833	0.6810	-0.0019	0.0091	0.837	+-+-+	0.0	2.345	4	0.6726
20 : 5868786 : SNP	t	c	0.4796	0.0048	0.4572	0.4856	-0.0054	0.0086	0.5298	---++	0.0	1.854	4	0.7625
1 : 64514026 : SNP	t	c	0.1733	0.0099	0.1673	0.2062	-0.0054	0.0120	0.6499	---++	0.0	1.164	4	0.8839
18 : 77986114 : SNP	a	g	0.1250	0.0045	0.1171	0.1314	-0.0034	0.0128	0.7932	+--++	0.0	1.842	4	0.7648
5 : 96246601 : SNP	a	t	0.4868	0.0138	0.4577	0.4967	-0.0047	0.0085	0.5796	+-++-	59.1	9.786	4	0.0442
18 : 9692808 : SNP	a	g	0.7378	0.0103	0.7185	0.7620	0.0114	0.0099	0.253	+-+-+	0.0	2.197	4	0.6995
5 : 110513445 : SNP	t	g	0.0845	0.0086	0.0710	0.0964	0.0013	0.0156	0.9358	+-?-+	0.0	1.213	3	0.75
4 : 44986496 : SNP	t	c	0.1028	0.0109	0.0756	0.1088	-0.0157	0.0143	0.2735	----+	0.0	2.278	4	0.6848
4 : 40941071 : SNP	a	c	0.7792	0.0154	0.7686	0.8193	-0.0008	0.0105	0.936	-+++-	14.0	4.651	4	0.325
10 : 59430701 : SNP	a	c	0.6445	0.0079	0.6366	0.6697	-0.0159	0.0095	0.09399	+-++-	29.3	5.660	4	0.226
11 : 76873620 : SNP	t	c	0.4252	0.0100	0.3903	0.4327	-0.0004	0.0087	0.9622	+-+-+	0.0	2.058	4	0.7251
9 : 28084472 : SNP	c	g	0.5784	0.0166	0.5544	0.6096	0.0046	0.0085	0.5865	++---	69.2	12.988	4	0.01134
3 : 112451607 : SNP	a	g	0.9221	0.0000	0.9221	0.9221	0.0550	0.0590	0.3512	????+	0.0	0.000	0	1
21 : 47262364 : SNP	a	g	0.8504	0.0095	0.8396	0.8718	0.0154	0.0121	0.202	+--++	0.0	2.520	4	0.6411
7 : 102113841 : SNP	t	c	0.0697	0.0039	0.0638	0.0733	0.0158	0.0174	0.3617	++?++	4.0	3.126	3	0.3727
2 : 163910090 : SNP	t	g	0.2447	0.0144	0.2221	0.2798	-0.0012	0.0099	0.9004	+--++	69.3	13.045	4	0.01106
16 : 75904514 : SNP	t	c	0.1046	0.0038	0.0950	0.1120	-0.0055	0.0142	0.6983	--++-	0.0	2.821	4	0.5882
6 : 63873866 : SNP	a	g	0.0273	0.0000	0.0273	0.0273	-0.0130	0.0546	0.8118	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 55333026 : SNP	t	c	0.9586	0.0043	0.9558	0.9657	0.0014	0.0228	0.9513	++??-	16.9	2.407	2	0.3001
7 : 38550840 : SNP	t	g	0.3791	0.0042	0.3755	0.3920	0.0086	0.0089	0.335	-++-+	39.7	6.636	4	0.1564
6 : 98140008 : SNP	t	c	0.8114	0.0091	0.7905	0.8171	0.0028	0.0112	0.7989	++-++	0.0	1.498	4	0.8269
9 : 16106250 : SNP	a	t	0.0982	0.0102	0.0805	0.1094	0.0239	0.0161	0.1365	+++--	0.0	2.909	4	0.5732
1 : 114725906 : SNP	a	t	0.9605	0.0031	0.9583	0.9648	-0.0127	0.0255	0.618	--???	0.0	0.181	1	0.6704
11 : 99867237 : SNP	t	c	0.6954	0.0105	0.6677	0.7038	0.0019	0.0092	0.8354	+-+-+	22.4	5.152	4	0.2721
7 : 153335449 : SNP	a	g	0.0639	0.0053	0.0553	0.0685	-0.0146	0.0196	0.4551	--??+	0.5	2.011	2	0.3659
1 : 151106823 : SNP	a	g	0.9739	0.0000	0.9739	0.9739	0.0490	0.0435	0.2596	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 77219310 : SNP	a	g	0.9233	0.0114	0.9027	0.9343	-0.0447	0.0174	0.01005	--?+-	5.1	3.160	3	0.3676
16 : 86623034 : SNP	c	g	0.0581	0.0022	0.0544	0.0601	0.0276	0.0218	0.2069	+0??+	44.4	3.597	2	0.1655
7 : 155218772 : SNP	c	g	0.7404	0.0123	0.7182	0.7500	0.0065	0.0106	0.5427	--+++	22.2	5.138	4	0.2734
12 : 114020489 : SNP	c	g	0.9103	0.0075	0.9037	0.9234	-0.0053	0.0149	0.7195	-++--	12.3	4.558	4	0.3357
17 : 45902512 : SNP	t	c	0.9804	0.0000	0.9804	0.9804	0.0090	0.0526	0.8641	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 46580494 : SNP	c	g	0.9795	0.0000	0.9795	0.9795	0.0620	0.0536	0.2472	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 43891637 : SNP	a	c	0.0639	0.0033	0.0591	0.0667	-0.0156	0.0181	0.3895	+-?--	16.3	3.583	3	0.3102
9 : 36596811 : SNP	c	g	0.1052	0.0095	0.0977	0.1238	-0.0015	0.0139	0.9138	+++--	8.1	4.353	4	0.3603
2 : 76188485 : SNP	a	g	0.0921	0.0118	0.0631	0.0975	-0.0101	0.0151	0.5013	-++--	34.2	6.080	4	0.1933
8 : 66573584 : SNP	t	c	0.2362	0.0056	0.2271	0.2492	-0.0159	0.0099	0.107	--+--	52.3	8.379	4	0.07863
8 : 40806796 : SNP	a	t	0.2257	0.0081	0.2097	0.2348	0.0211	0.0101	0.03726	++++-	34.4	6.102	4	0.1917
14 : 23586018 : SNP	a	c	0.2653	0.0043	0.2610	0.2796	0.0000	0.0098	0.9976	---++	0.0	1.725	4	0.7861
11 : 18862976 : SNP	t	c	0.4947	0.0134	0.4822	0.5175	0.0140	0.0085	0.1006	+++-+	23.6	5.238	4	0.2637
2 : 183267420 : SNP	a	g	0.9826	0.0000	0.9826	0.9826	0.0990	0.0455	0.02953	+????	0.0	0.000	0	1
22 : 25744472 : SNP	t	c	0.0429	0.0000	0.0429	0.0429	-0.0110	0.0475	0.8169	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 5526478 : SNP	a	g	0.4578	0.0192	0.4043	0.4772	-0.0063	0.0097	0.5165	+---+	0.0	2.948	4	0.5665
11 : 101713431 : SNP	a	t	0.8180	0.0092	0.7908	0.8333	-0.0042	0.0121	0.73	+-+--	9.9	4.438	4	0.35
10 : 18571411 : SNP	a	g	0.5211	0.0216	0.4913	0.5574	-0.0026	0.0086	0.7575	+-++-	0.0	2.265	4	0.6872
11 : 2835780 : SNP	a	g	0.2922	0.0115	0.2742	0.3180	0.0209	0.0100	0.03551	+++++	0.0	1.133	4	0.889
4 : 186292509 : SNP	t	c	0.9853	0.0000	0.9853	0.9853	-0.0800	0.0607	0.1872	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 118969992 : INDEL	i	r	0.0278	0.0000	0.0278	0.0278	0.0690	0.0404	0.08792	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 11826815 : SNP	a	g	0.1535	0.0071	0.1387	0.1621	0.0024	0.0120	0.8424	-++-+	0.0	2.103	4	0.7169
17 : 72304921 : SNP	a	g	0.2936	0.0141	0.2698	0.3106	-0.0044	0.0101	0.6636	-+-+-	21.6	5.099	4	0.2773
9 : 6230072 : SNP	a	g	0.2218	0.0174	0.1825	0.2311	-0.0040	0.0102	0.6957	++--+	47.7	7.642	4	0.1056
2 : 3985392 : INDEL	i	r	0.1840	0.0120	0.1751	0.2044	0.0518	0.0299	0.08284	??+++	0.0	1.489	2	0.4751
9 : 31481257 : SNP	a	t	0.8101	0.0120	0.7965	0.8522	0.0327	0.0107	0.002257	+++-+	0.0	1.914	4	0.7516
4 : 125996813 : SNP	a	g	0.0411	0.0028	0.0334	0.0421	-0.0049	0.0223	0.825	+-??+	0.0	0.284	2	0.8675
3 : 24716353 : SNP	t	c	0.9659	0.0000	0.9659	0.9659	-0.0200	0.0414	0.6294	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 48073931 : SNP	a	g	0.0324	0.0011	0.0309	0.0333	0.0088	0.0266	0.7421	0+???	0.0	0.189	1	0.664
3 : 83017021 : SNP	t	g	0.0637	0.0022	0.0545	0.0651	-0.0128	0.0176	0.4683	--?+-	0.0	1.044	3	0.7907
3 : 12168656 : SNP	a	g	0.7395	0.0073	0.7307	0.7583	-0.0134	0.0098	0.1723	--+-+	1.4	4.058	4	0.3982
9 : 87777947 : SNP	t	c	0.5006	0.0101	0.4907	0.5177	0.0101	0.0085	0.2345	+++--	54.1	8.707	4	0.06885
12 : 12184184 : SNP	a	g	0.0182	0.0000	0.0182	0.0182	0.0400	0.0637	0.5299	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 94810384 : SNP	a	g	0.9675	0.0023	0.9658	0.9707	-0.0247	0.0285	0.3861	--???	0.0	0.344	1	0.5574
14 : 47694932 : SNP	a	g	0.0662	0.0004	0.0654	0.0666	0.0023	0.0199	0.9094	+-??+	0.0	0.662	2	0.7183
1 : 23971216 : SNP	a	t	0.0211	0.0000	0.0211	0.0211	-0.0530	0.0495	0.2846	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 63153808 : SNP	a	g	0.9849	0.0000	0.9849	0.9849	0.0750	0.0516	0.1457	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 26035575 : SNP	t	c	0.9630	0.0027	0.9592	0.9653	-0.0103	0.0253	0.6849	-+??-	42.4	3.475	2	0.176
1 : 210585013 : SNP	t	c	0.6846	0.0173	0.6518	0.7058	0.0093	0.0099	0.3486	+-+++	0.0	2.362	4	0.6695
10 : 19635129 : SNP	a	c	0.5711	0.0240	0.5498	0.6278	0.0012	0.0086	0.888	+-++-	0.0	3.069	4	0.5464
12 : 32076095 : SNP	a	t	0.6259	0.0050	0.6177	0.6456	0.0014	0.0086	0.8672	++---	64.9	11.410	4	0.02232
22 : 24068888 : SNP	t	c	0.6373	0.0101	0.6258	0.6527	0.0079	0.0091	0.386	++-+-	0.0	0.824	4	0.9352
11 : 102349158 : SNP	a	g	0.8918	0.0059	0.8783	0.8955	-0.0114	0.0138	0.4088	--+-+	75.8	16.542	4	0.002372
2 : 229022909 : SNP	a	g	0.1281	0.0104	0.1195	0.1483	0.0002	0.0129	0.9849	+++--	0.0	3.602	4	0.4626
4 : 89759700 : SNP	t	c	0.7028	0.0199	0.6672	0.7341	0.0082	0.0099	0.4072	+-+++	39.7	6.630	4	0.1568
5 : 137006841 : SNP	t	c	0.1812	0.0086	0.1517	0.1862	0.0096	0.0113	0.3974	+-+++	17.6	4.853	4	0.3027
1 : 246713240 : SNP	c	g	0.2817	0.0292	0.2482	0.3472	0.0032	0.0101	0.752	++---	58.6	9.668	4	0.04642
10 : 89640021 : SNP	t	g	0.9514	0.0066	0.9468	0.9609	-0.0130	0.0250	0.602	-+???	0.0	0.336	1	0.562
1 : 4392846 : SNP	c	g	0.9201	0.0066	0.9148	0.9335	-0.0010	0.0280	0.9723	-??-+	0.0	0.964	2	0.6176
6 : 58033648 : SNP	a	t	0.5139	0.0130	0.4985	0.5339	-0.0062	0.0096	0.5207	--+-+	0.0	2.666	4	0.6151
11 : 128788354 : SNP	t	c	0.7148	0.0210	0.6990	0.7699	-0.0065	0.0099	0.5098	----+	0.0	1.772	4	0.7777
10 : 128144155 : SNP	c	g	0.7693	0.0174	0.7512	0.8135	-0.0007	0.0137	0.96	-+--+	8.8	4.384	4	0.3566
4 : 67918593 : INDEL	d	r	0.1416	0.0152	0.1053	0.1646	-0.0005	0.0122	0.9649	-++-+	0.0	2.638	4	0.6201
11 : 12180514 : SNP	c	g	0.2684	0.0109	0.2471	0.2783	-0.0117	0.0098	0.2361	+---+	47.9	7.678	4	0.1041
1 : 160322312 : SNP	a	g	0.0317	0.0000	0.0317	0.0318	-0.0054	0.0281	0.848	-+???	29.2	1.412	1	0.2347
4 : 61818372 : SNP	a	t	0.9522	0.0024	0.9474	0.9541	0.0243	0.0238	0.3073	++??-	0.0	1.522	2	0.4673
6 : 19187071 : INDEL	d	r	0.0708	0.0070	0.0582	0.0797	-0.0289	0.0172	0.09363	--?+-	57.4	7.046	3	0.07045
20 : 57158772 : SNP	a	g	0.8882	0.0032	0.8851	0.8987	-0.0023	0.0134	0.8665	+0---	0.0	3.676	4	0.4517
14 : 74812528 : SNP	t	g	0.6969	0.0038	0.6865	0.7003	0.0016	0.0108	0.8793	+----	0.0	1.156	4	0.8853
16 : 5820245 : SNP	a	g	0.5940	0.0046	0.5803	0.6073	0.0024	0.0086	0.7836	+-+-+	0.0	2.316	4	0.6779
8 : 28082893 : SNP	a	c	0.6430	0.0131	0.6350	0.6688	-0.0031	0.0091	0.735	+--+-	64.1	11.137	4	0.02507
1 : 80428453 : INDEL	i	r	0.0239	0.0080	0.0180	0.0348	0.0182	0.0366	0.618	+???+	0.0	0.014	1	0.9044
4 : 96467377 : SNP	t	c	0.0557	0.0078	0.0503	0.0729	0.0202	0.0292	0.4895	+??+-	35.7	3.108	2	0.2114
15 : 76830218 : SNP	a	c	0.4849	0.0151	0.4537	0.4986	-0.0009	0.0085	0.9122	+-++-	48.9	7.834	4	0.09785
16 : 20662769 : SNP	a	g	0.7702	0.0156	0.7422	0.7898	0.0100	0.0101	0.3211	++-++	0.0	0.872	4	0.9285
3 : 194537312 : SNP	t	g	0.2637	0.0171	0.2422	0.2972	-0.0144	0.0110	0.1878	-+-+-	76.3	16.907	4	0.002015
14 : 29006941 : SNP	t	c	0.4343	0.0091	0.4285	0.4548	-0.0097	0.0085	0.2549	--+++	0.0	3.952	4	0.4125
3 : 116999611 : SNP	t	g	0.4928	0.0212	0.4269	0.5044	0.0069	0.0085	0.4162	+++--	45.3	7.314	4	0.1202
6 : 1442491 : SNP	c	g	0.0445	0.0026	0.0421	0.0483	-0.0162	0.0219	0.4602	--??+	0.0	1.141	2	0.5654
6 : 167256652 : SNP	a	g	0.1863	0.0076	0.1797	0.2074	0.0069	0.0117	0.5557	---++	55.5	8.983	4	0.06153
4 : 175322831 : SNP	a	g	0.0219	0.0000	0.0219	0.0219	0.0320	0.0465	0.4913	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 99065326 : INDEL	i	r	0.2589	0.0052	0.2422	0.2627	0.0187	0.0098	0.05674	++-++	0.0	1.637	4	0.8021
2 : 197923199 : SNP	t	c	0.0145	0.0000	0.0145	0.0145	0.0160	0.0536	0.7652	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 47137459 : SNP	t	c	0.3156	0.0149	0.2936	0.3590	0.0052	0.0115	0.6518	+--++	58.2	9.561	4	0.04851
4 : 146247602 : SNP	t	c	0.7003	0.0038	0.6849	0.7124	-0.0013	0.0094	0.8875	-++++	58.9	9.729	4	0.04524
2 : 209682244 : SNP	c	g	0.2448	0.0076	0.2261	0.2539	-0.0072	0.0106	0.4996	-+-+-	76.1	16.727	4	0.002184
2 : 17778288 : SNP	a	g	0.3294	0.0192	0.2824	0.3471	-0.0114	0.0092	0.2158	-----	0.0	0.627	4	0.96
7 : 8845290 : SNP	a	g	0.8893	0.0082	0.8738	0.8980	0.0121	0.0137	0.3745	-++++	0.0	3.413	4	0.4912
1 : 190866218 : SNP	t	c	0.3656	0.0207	0.3499	0.4115	-0.0110	0.0091	0.2258	-----	0.0	0.571	4	0.9662
6 : 170379286 : SNP	a	g	0.2662	0.0064	0.2559	0.2723	0.0001	0.0167	0.9939	+?-+-	7.2	3.233	3	0.3571
8 : 113381319 : SNP	a	g	0.4726	0.0092	0.4636	0.5082	-0.0034	0.0085	0.6866	-++++	0.0	3.154	4	0.5324
7 : 32560554 : SNP	a	g	0.1602	0.0062	0.1502	0.1841	0.0026	0.0117	0.8235	-+-++	0.0	1.553	4	0.8172
7 : 102401132 : SNP	a	c	0.2568	0.0063	0.2533	0.2703	-0.0282	0.0229	0.2171	??-+-	23.1	2.600	2	0.2725
21 : 31735765 : SNP	a	g	0.8562	0.0084	0.8489	0.8787	0.0118	0.0125	0.3455	+++++	0.0	0.900	4	0.9245
21 : 46412170 : SNP	t	c	0.2010	0.0130	0.1814	0.2203	-0.0140	0.0134	0.2966	---+-	0.0	0.990	4	0.9113
18 : 68702961 : SNP	t	g	0.1113	0.0074	0.0930	0.1288	-0.0202	0.0136	0.1366	-+--+	57.2	9.345	4	0.05303
4 : 9630041 : SNP	a	g	0.0425	0.0000	0.0425	0.0425	0.0172	0.0583	0.768	????+	0.0	0.000	0	1
9 : 10360223 : SNP	c	g	0.8366	0.0047	0.8328	0.8440	-0.0079	0.0138	0.5662	----+	0.0	1.075	4	0.8983
3 : 41924333 : SNP	a	g	0.1717	0.0219	0.1525	0.2161	0.0079	0.0122	0.5181	+---+	0.0	1.266	4	0.8672
5 : 141765802 : SNP	t	c	0.9688	0.0000	0.9688	0.9688	-0.0180	0.0384	0.6394	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 88174982 : SNP	t	c	0.6960	0.0053	0.6846	0.7085	0.0026	0.0092	0.7799	+-+-+	30.1	5.718	4	0.2212
9 : 11930746 : SNP	a	g	0.5972	0.0128	0.5743	0.6377	0.0083	0.0086	0.3344	+-+++	37.1	6.357	4	0.174
19 : 33917811 : SNP	a	g	0.1694	0.0167	0.1297	0.1845	-0.0057	0.0115	0.6181	+----	0.0	1.760	4	0.7797
4 : 186690954 : SNP	a	g	0.4954	0.0098	0.4811	0.5134	-0.0061	0.0087	0.4838	--++-	34.7	6.127	4	0.1898
1 : 232468213 : SNP	a	g	0.6270	0.0133	0.5989	0.6410	-0.0109	0.0094	0.2442	+----	0.0	3.492	4	0.479
9 : 25197907 : SNP	t	c	0.4175	0.0159	0.4051	0.4707	0.0098	0.0092	0.2855	+++++	35.9	6.241	4	0.1819
20 : 43949446 : SNP	a	t	0.2550	0.0152	0.2206	0.2698	0.0059	0.0099	0.5488	+-+-+	14.7	4.688	4	0.3209
6 : 81744579 : SNP	t	g	0.0489	0.0015	0.0467	0.0502	-0.0211	0.0205	0.3031	+-??+	78.6	9.352	2	0.009315
11 : 26845001 : SNP	a	g	0.0831	0.0076	0.0777	0.0974	0.0043	0.0160	0.7851	++?-+	0.0	1.004	3	0.8003
5 : 16697916 : SNP	a	t	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	0.1270	0.0607	0.03627	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 61946113 : SNP	a	c	0.8148	0.0101	0.7856	0.8236	-0.0015	0.0112	0.8966	+--+-	42.4	6.944	4	0.1389
8 : 9366606 : SNP	a	g	0.5050	0.0140	0.4916	0.5292	-0.0055	0.0085	0.5169	+-+--	0.0	3.383	4	0.4959
6 : 17047221 : SNP	c	g	0.1406	0.0120	0.1149	0.1488	-0.0012	0.0123	0.9193	+-+--	66.8	12.035	4	0.01709
3 : 188429782 : SNP	t	c	0.1356	0.0050	0.1207	0.1399	-0.0198	0.0122	0.1062	--+-+	17.2	4.833	4	0.3049
1 : 46882894 : SNP	t	c	0.1076	0.0029	0.1037	0.1101	0.0134	0.0138	0.3335	++---	0.0	2.387	4	0.6649
1 : 184202453 : SNP	a	g	0.3846	0.0136	0.3764	0.4173	-0.0068	0.0091	0.4578	++-+-	26.9	5.472	4	0.2422
1 : 193871478 : SNP	t	c	0.1750	0.0094	0.1538	0.1813	0.0068	0.0112	0.5435	+--++	6.5	4.278	4	0.3696
1 : 215846086 : SNP	a	c	0.4301	0.0099	0.4096	0.4484	-0.0027	0.0087	0.7609	+-+--	0.0	1.720	4	0.787
1 : 227443941 : SNP	a	g	0.0107	0.0000	0.0107	0.0107	0.0370	0.0596	0.535	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 185784516 : INDEL	i	r	0.1543	0.0141	0.1424	0.1864	-0.0332	0.0144	0.02145	-+---	25.8	5.390	4	0.2496
13 : 73546953 : SNP	a	g	0.2136	0.0120	0.2000	0.2364	0.0058	0.0105	0.5817	+-+-+	0.0	1.068	4	0.8993
4 : 154055958 : SNP	a	g	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	-0.1180	0.0617	0.05567	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 144650343 : SNP	t	c	0.0375	0.0000	0.0375	0.0375	-0.0390	0.0475	0.4117	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 183950636 : SNP	a	c	0.2780	0.0168	0.2542	0.2933	0.0061	0.0103	0.5527	+-++-	0.0	1.457	4	0.8342
13 : 57391396 : SNP	a	c	0.1389	0.0048	0.1319	0.1488	0.0040	0.0125	0.7492	-+-+-	0.0	2.164	4	0.7057
2 : 12396722 : SNP	a	g	0.0889	0.0041	0.0834	0.0957	-0.0081	0.0150	0.5895	--+-+	0.0	1.408	4	0.8427
1 : 68891616 : INDEL	i	r	0.1716	0.0074	0.1641	0.1823	-0.0027	0.0113	0.8089	+----	59.8	9.952	4	0.04124
5 : 157556909 : SNP	t	g	0.3730	0.0151	0.3609	0.4035	0.0027	0.0087	0.757	-+-+-	29.6	5.679	4	0.2244
10 : 128205290 : SNP	t	g	0.1025	0.0070	0.0984	0.1215	0.0404	0.0244	0.0971	+??++	0.0	0.604	2	0.7394
7 : 5217757 : SNP	a	g	0.3669	0.0117	0.3508	0.3834	-0.0099	0.0104	0.339	0---+	28.8	5.614	4	0.2299
2 : 173157649 : INDEL	d	r	0.0163	0.0000	0.0163	0.0163	-0.0630	0.0516	0.2217	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 189918565 : SNP	t	g	0.9266	0.0131	0.9084	0.9436	0.0250	0.0224	0.2635	++??+	0.0	0.332	2	0.8469
21 : 39182957 : SNP	a	g	0.9773	0.0000	0.9773	0.9773	-0.1080	0.0445	0.01518	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 88157913 : SNP	a	c	0.8211	0.0083	0.7991	0.8265	0.0319	0.0112	0.004267	+++++	0.0	0.277	4	0.9913
13 : 92930472 : SNP	a	t	0.2118	0.0079	0.2011	0.2266	-0.0136	0.0105	0.1987	--+--	0.0	3.188	4	0.5269
18 : 71213300 : SNP	a	g	0.3791	0.0231	0.3253	0.4006	0.0208	0.0086	0.01582	+-+++	51.6	8.273	4	0.08209
8 : 99197259 : INDEL	i	r	0.3178	0.0028	0.3154	0.3286	-0.0241	0.0097	0.01323	--+-+	24.2	5.280	4	0.2598
6 : 43157020 : SNP	t	c	0.0924	0.0086	0.0705	0.0981	-0.0112	0.0152	0.462	--?++	0.0	1.701	3	0.6366
10 : 32267820 : SNP	t	c	0.5626	0.0104	0.5473	0.5780	0.0021	0.0097	0.8278	+++-+	0.0	1.925	4	0.7496
11 : 63612706 : SNP	t	c	0.0595	0.0049	0.0548	0.0700	0.0170	0.0188	0.3658	+-?++	0.0	1.672	3	0.6432
19 : 35158756 : SNP	c	g	0.6462	0.0204	0.6230	0.6753	0.0018	0.0103	0.8639	++--+	0.0	2.256	4	0.6889
5 : 26816780 : SNP	a	c	0.4116	0.0130	0.3803	0.4337	-0.0038	0.0085	0.659	-+-+-	14.5	4.680	4	0.3217
1 : 100580608 : SNP	t	g	0.9786	0.0000	0.9786	0.9786	-0.0130	0.0445	0.7701	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 8832197 : SNP	t	g	0.9830	0.0000	0.9830	0.9830	-0.0910	0.0465	0.05035	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 1822881 : SNP	t	g	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	0.1580	0.0617	0.0104	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 85307358 : SNP	t	c	0.4910	0.0156	0.4673	0.5257	0.0055	0.0101	0.5882	-++++	24.7	5.310	4	0.257
3 : 32889968 : SNP	a	g	0.9868	0.0000	0.9868	0.9868	0.0000	0.0596	1	0????	0.0	0.000	0	1
1 : 43310978 : INDEL	d	r	0.0164	0.0000	0.0164	0.0164	-0.0280	0.0566	0.6209	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 74556226 : SNP	c	g	0.0445	0.0040	0.0387	0.0473	-0.0373	0.0233	0.1097	-0???	17.9	1.217	1	0.2699
18 : 54196077 : SNP	a	g	0.7278	0.0161	0.7134	0.7558	-0.0178	0.0101	0.07726	---++	37.5	6.396	4	0.1715
9 : 13846660 : SNP	a	t	0.0323	0.0000	0.0323	0.0323	-0.0910	0.0455	0.04545	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 60441783 : SNP	t	c	0.7743	0.0056	0.7549	0.7885	0.0049	0.0105	0.6421	-++--	42.3	6.930	4	0.1396
3 : 84695695 : SNP	a	c	0.0123	0.0000	0.0123	0.0123	0.1460	0.0617	0.0179	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 126039495 : SNP	a	g	0.7335	0.0166	0.7012	0.7477	0.0107	0.0097	0.2709	++++-	0.0	1.092	4	0.8956
6 : 4287653 : SNP	t	c	0.1159	0.0101	0.1059	0.1392	-0.0072	0.0134	0.5931	--++-	0.0	0.862	4	0.9299
4 : 14690162 : SNP	t	c	0.0285	0.0000	0.0285	0.0285	-0.0590	0.0384	0.1246	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 208599389 : SNP	a	c	0.0574	0.0055	0.0514	0.0713	-0.0114	0.0189	0.5464	-+?--	9.0	3.296	3	0.3482
5 : 8943334 : SNP	a	g	0.0236	0.0024	0.0216	0.0265	0.0052	0.0317	0.8683	+-???	13.4	1.155	1	0.2825
8 : 6330580 : SNP	a	g	0.1400	0.0161	0.1246	0.1696	0.0157	0.0124	0.2052	++++-	0.0	2.712	4	0.6071
20 : 53701848 : SNP	t	c	0.9804	0.0000	0.9804	0.9804	-0.0080	0.0445	0.8573	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 8821100 : SNP	a	t	0.3181	0.0174	0.3068	0.3548	0.0110	0.0091	0.2272	++-+-	0.0	1.609	4	0.8072
21 : 27852724 : SNP	a	g	0.5600	0.0121	0.5436	0.5882	-0.0040	0.0085	0.6382	-+--+	66.6	11.978	4	0.01751
13 : 85535223 : SNP	c	g	0.0612	0.0076	0.0498	0.0675	0.0479	0.0185	0.009748	++??+	0.0	0.664	2	0.7174
16 : 31558681 : SNP	a	g	0.4616	0.0183	0.4161	0.4786	0.0130	0.0087	0.1354	+++-+	40.4	6.711	4	0.152
12 : 122690784 : SNP	a	g	0.0667	0.0035	0.0632	0.0707	-0.0471	0.0176	0.007484	--?--	0.0	0.181	3	0.9807
18 : 9458544 : SNP	a	g	0.3993	0.0189	0.3875	0.4387	-0.0066	0.0091	0.4645	-+--+	0.0	2.491	4	0.6463
5 : 141488792 : SNP	t	c	0.2151	0.0143	0.1691	0.2232	-0.0002	0.0106	0.9882	-+--+	0.0	2.165	4	0.7054
3 : 190910351 : SNP	c	g	0.3405	0.0210	0.3155	0.3971	-0.0028	0.0091	0.7597	+--++	0.0	2.842	4	0.5846
8 : 87017693 : SNP	t	c	0.7303	0.0151	0.7088	0.7535	0.0173	0.0094	0.06397	+++-+	45.1	7.284	4	0.1216
10 : 70221194 : SNP	a	g	0.0865	0.0025	0.0824	0.0927	-0.0002	0.0153	0.9919	-+-++	56.1	9.113	4	0.05835
7 : 86612220 : INDEL	i	r	0.2311	0.0156	0.1913	0.2477	-0.0165	0.0107	0.1244	-----	0.0	1.175	4	0.8822
17 : 56609525 : SNP	a	g	0.3790	0.0056	0.3758	0.4007	0.0181	0.0091	0.04736	++-++	0.0	0.980	4	0.9128
3 : 57481378 : SNP	t	c	0.9651	0.0079	0.9508	0.9703	-0.0107	0.0258	0.6776	-+??-	0.0	0.707	2	0.7023
3 : 27074732 : SNP	c	g	0.7364	0.0064	0.7317	0.7620	0.0088	0.0094	0.3522	+-+-+	57.4	9.386	4	0.05215
2 : 23370706 : SNP	t	g	0.2170	0.0100	0.1943	0.2262	0.0031	0.0106	0.7705	---++	36.5	6.304	4	0.1776
8 : 77432121 : SNP	a	g	0.6620	0.0200	0.6204	0.6739	0.0105	0.0091	0.2472	+++-+	24.6	5.307	4	0.2572
6 : 117301833 : SNP	c	g	0.9344	0.0071	0.9305	0.9537	-0.0024	0.0212	0.911	-+??+	0.0	0.573	2	0.7508
7 : 81568750 : SNP	t	g	0.2840	0.0083	0.2733	0.3003	-0.0016	0.0097	0.8721	---++	0.0	0.774	4	0.9419
6 : 97209803 : SNP	c	g	0.8791	0.0054	0.8703	0.8910	-0.0120	0.0130	0.3577	+----	45.5	7.335	4	0.1192
1 : 32876267 : SNP	a	g	0.8731	0.0130	0.8468	0.8893	0.0004	0.0132	0.9743	+---+	25.5	5.368	4	0.2516
19 : 33852667 : SNP	a	c	0.0727	0.0022	0.0699	0.0805	-0.0173	0.0193	0.3709	+-?--	42.3	5.203	3	0.1575
5 : 153699515 : SNP	t	g	0.0821	0.0034	0.0793	0.0899	0.0028	0.0159	0.8608	-+++-	0.0	3.831	4	0.4293
14 : 82941269 : SNP	t	c	0.3493	0.0062	0.3451	0.3784	0.0196	0.0091	0.03132	++-++	44.9	7.260	4	0.1228
7 : 104246719 : SNP	t	c	0.2338	0.0149	0.2039	0.2507	0.0057	0.0099	0.5668	+++-+	65.5	11.608	4	0.02052
7 : 46408264 : SNP	a	g	0.0850	0.0046	0.0790	0.0929	-0.0101	0.0157	0.5187	-+?-+	69.3	9.775	3	0.02058
17 : 15688159 : SNP	t	c	0.7560	0.0086	0.7482	0.7720	0.0281	0.0111	0.01126	++-++	0.0	2.433	4	0.6567
12 : 42921215 : SNP	a	g	0.4344	0.0067	0.4185	0.4412	0.0076	0.0085	0.3761	0++++	0.0	2.048	4	0.727
14 : 42479541 : SNP	a	t	0.2866	0.0239	0.2567	0.3303	0.0039	0.0093	0.6784	+----	0.0	1.226	4	0.8738
8 : 20036827 : SNP	c	g	0.8135	0.0125	0.7903	0.8553	-0.0174	0.0108	0.1068	---++	35.1	6.159	4	0.1876
16 : 7000601 : SNP	a	g	0.7759	0.0133	0.7624	0.8070	0.0012	0.0113	0.9168	+-+--	0.0	1.679	4	0.7946
19 : 5426186 : SNP	a	g	0.2172	0.0188	0.1998	0.2433	0.0044	0.0128	0.7284	+--+-	48.8	7.808	4	0.09887
1 : 196525471 : SNP	a	t	0.0765	0.0054	0.0655	0.0892	0.0360	0.0163	0.02712	+-+++	56.7	9.239	4	0.05539
21 : 40132084 : SNP	a	c	0.3820	0.0045	0.3774	0.3983	0.0125	0.0088	0.1539	++++-	0.0	2.504	4	0.6439
6 : 13268158 : SNP	a	t	0.1347	0.0058	0.1224	0.1414	-0.0005	0.0126	0.966	-+-+-	43.4	7.070	4	0.1323
11 : 95692078 : SNP	a	t	0.9668	0.0109	0.9479	0.9734	-0.0001	0.0264	0.9963	-+??+	51.0	4.085	2	0.1297
16 : 3456371 : SNP	a	g	0.2709	0.0119	0.2411	0.2823	-0.0054	0.0097	0.5786	--+++	46.8	7.523	4	0.1107
14 : 52649921 : SNP	a	g	0.7362	0.0032	0.7323	0.7438	-0.0129	0.0098	0.1877	--+-+	0.0	3.203	4	0.5244
6 : 91883292 : SNP	a	c	0.7162	0.0082	0.7078	0.7416	-0.0002	0.0094	0.9871	-+++-	30.5	5.758	4	0.218
16 : 78886189 : SNP	t	c	0.0655	0.0066	0.0548	0.0759	-0.0464	0.0183	0.01134	--?--	0.0	1.967	3	0.5792
1 : 88784828 : SNP	a	g	0.7039	0.0260	0.6788	0.7762	-0.0023	0.0093	0.8005	-++++	0.0	3.748	4	0.4412
5 : 60141988 : INDEL	d	r	0.4181	0.0173	0.3804	0.4430	-0.0174	0.0089	0.05102	---+-	0.0	3.174	4	0.5292
20 : 56690280 : SNP	a	g	0.3863	0.0152	0.3528	0.4067	-0.0084	0.0104	0.4198	+-+--	0.0	1.944	4	0.746
4 : 166937734 : SNP	t	c	0.9458	0.0074	0.9326	0.9514	0.0075	0.0265	0.7777	+??--	0.0	1.731	2	0.4208
20 : 1609355 : SNP	c	g	0.1101	0.0098	0.0966	0.1297	0.0133	0.0170	0.4336	-+?++	27.1	4.115	3	0.2493
1 : 85483669 : SNP	a	g	0.0285	0.0000	0.0285	0.0285	0.0880	0.0475	0.06399	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 8756236 : SNP	t	g	0.6266	0.0108	0.6143	0.6490	-0.0140	0.0092	0.1259	-----	0.0	0.573	4	0.966
6 : 150755619 : SNP	a	g	0.0901	0.0131	0.0515	0.0948	0.0055	0.0165	0.7384	+-??+	0.0	0.260	2	0.878
11 : 90281212 : SNP	a	g	0.8454	0.0036	0.8304	0.8511	0.0079	0.0120	0.5103	+-+-+	23.1	5.201	4	0.2673
5 : 5417982 : SNP	c	g	0.0516	0.0071	0.0482	0.0754	0.0086	0.0202	0.6693	+-?++	14.1	3.493	3	0.3217
11 : 134831507 : SNP	t	c	0.1332	0.0100	0.1033	0.1528	-0.0002	0.0146	0.9903	++---	0.0	2.143	4	0.7095
10 : 17008284 : SNP	a	g	0.6312	0.0285	0.5660	0.6514	0.0002	0.0090	0.9822	+-+-+	67.4	12.261	4	0.01551
14 : 106283353 : SNP	a	g	0.4160	0.0013	0.4148	0.4175	-0.0389	0.0451	0.3886	??+-?	55.7	2.257	1	0.133
13 : 80084177 : SNP	a	c	0.4261	0.0022	0.4219	0.4360	0.0058	0.0086	0.4955	+-++-	31.6	5.845	4	0.211
7 : 106277016 : INDEL	d	r	0.0392	0.0003	0.0389	0.0394	0.0105	0.0261	0.6867	0+???	0.0	0.301	1	0.583
15 : 47261058 : INDEL	d	r	0.2793	0.0066	0.2730	0.2908	-0.0067	0.0095	0.4807	+--+-	0.0	1.211	4	0.8763
5 : 100604370 : SNP	t	c	0.7480	0.0142	0.7196	0.7587	-0.0082	0.0099	0.409	-+---	0.0	2.590	4	0.6285
3 : 100115065 : SNP	a	t	0.0463	0.0077	0.0421	0.0689	0.0013	0.0209	0.9519	+-?-+	34.8	4.600	3	0.2035
6 : 122806701 : SNP	t	c	0.1507	0.0054	0.1443	0.1562	-0.0236	0.0119	0.04786	---+-	30.4	5.749	4	0.2187
16 : 83628046 : INDEL	d	r	0.1950	0.0047	0.1915	0.2052	0.0054	0.0110	0.6256	+-++-	0.0	2.003	4	0.7352
2 : 40210876 : SNP	t	c	0.9873	0.0000	0.9873	0.9873	-0.0740	0.0566	0.1911	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 37772112 : SNP	t	c	0.9662	0.0000	0.9662	0.9662	0.0230	0.0354	0.5156	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 61926580 : SNP	t	c	0.1425	0.0032	0.1286	0.1465	-0.0244	0.0125	0.05114	--+--	0.0	1.943	4	0.7462
4 : 153113117 : SNP	t	c	0.8399	0.0051	0.8281	0.8470	0.0075	0.0116	0.5166	++---	55.0	8.888	4	0.06397
7 : 95601294 : SNP	a	t	0.7475	0.0139	0.7339	0.7785	-0.0186	0.0100	0.0637	--+-+	54.9	8.877	4	0.06425
16 : 74417441 : SNP	a	g	0.0547	0.0000	0.0547	0.0547	-0.0368	0.0627	0.5573	????-	0.0	0.000	0	1
7 : 149709132 : SNP	a	g	0.4447	0.0186	0.3970	0.4712	0.0204	0.0197	0.2987	??++-	70.6	6.796	2	0.03344
13 : 20904980 : SNP	t	c	0.2531	0.0231	0.2279	0.3054	-0.0130	0.0098	0.1846	--++-	0.0	2.411	4	0.6607
14 : 51983355 : SNP	a	g	0.3700	0.0091	0.3585	0.3834	-0.0115	0.0091	0.2082	--+--	0.0	2.262	4	0.6876
10 : 43126722 : SNP	t	c	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	0.0520	0.0414	0.2096	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 81700419 : SNP	t	c	0.0644	0.0027	0.0594	0.0670	0.0200	0.0194	0.3037	++?-+	0.0	2.655	3	0.448
12 : 121557261 : SNP	a	g	0.1612	0.0081	0.1346	0.1708	-0.0358	0.0118	0.002412	---+-	0.0	3.381	4	0.4963
11 : 79003631 : SNP	t	c	0.2297	0.0095	0.2058	0.2359	-0.0086	0.0101	0.3944	--+-+	35.4	6.190	4	0.1854
6 : 112623051 : SNP	t	c	0.9706	0.0105	0.9565	0.9784	0.0148	0.0365	0.6851	-???+	51.2	2.050	1	0.1522
7 : 81886249 : SNP	a	t	0.0415	0.0000	0.0415	0.0415	-0.0430	0.0354	0.2242	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 33713407 : SNP	a	g	0.2179	0.0069	0.1935	0.2228	0.0152	0.0101	0.1336	-++++	62.8	10.745	4	0.02959
15 : 34298032 : SNP	a	c	0.0945	0.0064	0.0756	0.1072	0.0064	0.0148	0.6642	0+-++	0.0	3.160	4	0.5314
5 : 102922487 : SNP	a	g	0.6184	0.0059	0.6130	0.6285	-0.0073	0.0088	0.4082	0-++-	28.7	5.606	4	0.2305
12 : 96971077 : SNP	t	g	0.1352	0.0058	0.1302	0.1469	-0.0069	0.0126	0.5822	+-+--	0.0	1.777	4	0.7768
19 : 4781471 : SNP	a	g	0.8560	0.0091	0.8365	0.8648	-0.0150	0.0123	0.2229	0-?--	0.0	1.717	3	0.6331
12 : 67413187 : SNP	a	g	0.8778	0.0060	0.8574	0.8834	-0.0044	0.0132	0.7375	+++--	23.7	5.244	4	0.2632
8 : 39924262 : SNP	t	c	0.0469	0.0068	0.0430	0.0605	0.0316	0.0212	0.1371	++??+	0.0	1.159	2	0.5601
19 : 12528116 : SNP	t	c	0.7450	0.0097	0.7307	0.7592	0.0022	0.0100	0.8251	0-+-+	0.0	1.732	4	0.7848
18 : 48677721 : SNP	c	g	0.9670	0.0000	0.9670	0.9670	0.0190	0.0586	0.7459	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 74294932 : SNP	t	c	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	0.0110	0.0485	0.8207	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 43417874 : SNP	a	c	0.0321	0.0000	0.0321	0.0321	0.0010	0.0344	0.9768	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 101345106 : SNP	t	c	0.0371	0.0006	0.0366	0.0378	0.0069	0.0285	0.8076	+-???	0.0	0.173	1	0.6778
6 : 127882063 : SNP	t	c	0.5552	0.0104	0.5454	0.5811	-0.0002	0.0086	0.9809	-++-+	0.0	2.346	4	0.6723
12 : 9342890 : SNP	t	c	0.5459	0.0106	0.5368	0.5729	0.0089	0.0085	0.2989	++-+-	0.0	3.821	4	0.4308
18 : 2115680 : SNP	a	t	0.2729	0.0094	0.2434	0.2804	-0.0135	0.0100	0.1771	-----	0.0	1.427	4	0.8395
13 : 63216961 : INDEL	i	r	0.0712	0.0020	0.0652	0.0730	-0.0082	0.0173	0.6348	+-?++	0.0	2.772	3	0.4282
17 : 17183438 : SNP	a	c	0.0971	0.0089	0.0895	0.1156	-0.0240	0.0147	0.1027	--?+-	56.3	6.866	3	0.07629
5 : 149767083 : SNP	t	c	0.3971	0.0100	0.3778	0.4101	-0.0131	0.0087	0.1326	--+--	0.0	1.757	4	0.7804
12 : 126305022 : SNP	a	g	0.1541	0.0126	0.1459	0.1882	-0.0000	0.0119	0.9985	++-+-	30.9	5.786	4	0.2157
11 : 134936853 : SNP	t	c	0.5033	0.0203	0.4800	0.5482	-0.0055	0.0085	0.5151	0----	0.0	1.506	4	0.8256
20 : 19423293 : SNP	a	g	0.3965	0.0082	0.3832	0.4176	0.0169	0.0086	0.04809	+++++	0.0	2.700	4	0.6093
1 : 44740244 : SNP	a	g	0.3832	0.0243	0.3558	0.4360	0.0041	0.0091	0.6493	+-+++	0.0	1.508	4	0.8252
4 : 100363942 : SNP	t	g	0.0201	0.0000	0.0201	0.0201	-0.0030	0.0475	0.9497	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 134780932 : SNP	t	c	0.5895	0.0223	0.5480	0.6344	0.0012	0.0085	0.8916	-++-+	27.7	5.530	4	0.2371
15 : 102356497 : SNP	t	c	0.3729	0.0134	0.3657	0.4165	0.0006	0.0089	0.9471	-+++-	3.8	4.158	4	0.385
9 : 131676550 : SNP	a	g	0.0633	0.0004	0.0627	0.0636	0.0109	0.0201	0.5869	+-???	28.0	1.388	1	0.2387
6 : 31286545 : SNP	a	g	0.5206	0.0102	0.5029	0.5347	-0.0012	0.0195	0.9499	??+-+	33.7	3.016	2	0.2213
5 : 10909996 : SNP	a	g	0.8977	0.0120	0.8751	0.9064	0.0128	0.0148	0.3843	++-++	24.3	5.284	4	0.2593
8 : 4609890 : SNP	t	c	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	-0.0610	0.0495	0.2181	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 3183435 : SNP	a	g	0.0553	0.0060	0.0484	0.0676	0.0224	0.0232	0.3353	++?+-	0.0	1.274	3	0.7354
6 : 29969513 : SNP	t	c	0.9378	0.0048	0.9298	0.9407	-0.0378	0.0413	0.3598	???--	0.0	0.992	1	0.3194
12 : 133433491 : SNP	a	g	0.3028	0.0228	0.2802	0.3639	-0.0088	0.0093	0.3408	-+---	15.1	4.712	4	0.3182
13 : 80738608 : SNP	t	c	0.9792	0.0000	0.9792	0.9792	0.0090	0.0556	0.8714	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 88112281 : INDEL	d	r	0.2397	0.0166	0.2258	0.2702	0.0276	0.0110	0.01216	+-+++	33.4	6.004	4	0.1989
17 : 64978389 : SNP	a	g	0.9111	0.0126	0.8845	0.9270	-0.0066	0.0171	0.6993	--?+-	0.0	1.721	3	0.6323
11 : 56731226 : SNP	t	c	0.0797	0.0093	0.0541	0.0857	0.0150	0.0163	0.359	++?-+	0.0	1.308	3	0.7273
4 : 15257880 : INDEL	i	r	0.5109	0.0231	0.4509	0.5307	-0.0104	0.0086	0.2238	---+-	0.0	1.138	4	0.8882
18 : 342081 : SNP	t	g	0.2141	0.0148	0.2006	0.2373	0.0001	0.0131	0.9967	+----	73.4	15.026	4	0.004647
8 : 117478611 : SNP	a	t	0.8178	0.0083	0.8147	0.8527	0.0029	0.0114	0.7999	-++++	31.7	5.855	4	0.2102
1 : 113888494 : SNP	t	c	0.0291	0.0000	0.0291	0.0291	-0.1270	0.0455	0.00524	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 112526578 : SNP	t	g	0.0810	0.0179	0.0649	0.1093	0.0272	0.0302	0.3683	+??-+	0.0	0.354	2	0.8379
4 : 125227442 : SNP	a	c	0.9553	0.0032	0.9526	0.9631	0.0061	0.0213	0.7761	+-??-	13.1	2.302	2	0.3163
2 : 155254734 : SNP	a	c	0.4877	0.0228	0.4324	0.5125	-0.0099	0.0085	0.2467	-+++-	70.5	13.548	4	0.008886
17 : 61264907 : INDEL	i	r	0.2393	0.0113	0.2142	0.2593	0.0032	0.0101	0.7496	-++-+	0.0	2.966	4	0.5636
14 : 71242706 : SNP	a	g	0.0119	0.0000	0.0119	0.0119	0.0520	0.0586	0.3751	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 139488103 : SNP	a	c	0.5660	0.0067	0.5565	0.5752	-0.0079	0.0089	0.3744	+----	34.0	6.062	4	0.1946
9 : 117987447 : SNP	c	g	0.8195	0.0080	0.8095	0.8332	-0.0194	0.0111	0.0813	-----	0.0	3.760	4	0.4395
8 : 142732235 : SNP	a	g	0.0154	0.0000	0.0154	0.0154	-0.0260	0.0576	0.6518	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 179988283 : SNP	t	c	0.8891	0.0102	0.8783	0.9112	-0.0132	0.0141	0.3495	0---+	31.3	5.820	4	0.213
9 : 116236890 : SNP	t	c	0.1530	0.0130	0.1114	0.1654	-0.0037	0.0120	0.7596	---++	0.0	1.995	4	0.7368
13 : 25594317 : SNP	a	c	0.0340	0.0000	0.0340	0.0340	-0.0250	0.0404	0.5364	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 45408939 : SNP	t	c	0.6148	0.0077	0.5987	0.6315	-0.0132	0.0089	0.1395	-++--	0.0	3.905	4	0.4191
20 : 15610309 : SNP	a	g	0.4030	0.0087	0.3903	0.4165	0.0021	0.0086	0.8025	+0--+	0.0	1.845	4	0.7642
2 : 42361108 : SNP	a	g	0.5910	0.0063	0.5848	0.6071	-0.0108	0.0089	0.2234	-----	0.0	3.074	4	0.5454
7 : 147594647 : SNP	t	c	0.3430	0.0198	0.2955	0.3528	0.0040	0.0092	0.6637	0++-+	0.0	1.463	4	0.8332
6 : 111284781 : INDEL	d	r	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	-0.0240	0.0425	0.5719	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 83767733 : SNP	t	g	0.9487	0.0032	0.9460	0.9530	-0.0416	0.0204	0.0421	--??-	0.0	0.273	2	0.8722
7 : 88825421 : SNP	a	g	0.9884	0.0000	0.9884	0.9884	0.0320	0.0667	0.6315	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 27134925 : SNP	t	c	0.3888	0.0165	0.3760	0.4217	-0.0018	0.0087	0.8343	+----	0.0	2.094	4	0.7185
14 : 25598747 : SNP	t	c	0.0105	0.0000	0.0105	0.0105	0.0860	0.0607	0.1562	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 185329121 : INDEL	i	r	0.1020	0.0043	0.0979	0.1106	-0.0399	0.0166	0.01644	--?--	0.0	0.198	3	0.9779
2 : 155760381 : SNP	t	c	0.3023	0.0133	0.2830	0.3191	-0.0000	0.0096	0.9989	-++-+	57.2	9.355	4	0.05282
7 : 134745691 : SNP	t	c	0.8555	0.0122	0.8419	0.8834	0.0144	0.0121	0.2337	-++++	0.0	2.811	4	0.59
6 : 121232224 : SNP	a	g	0.0320	0.0000	0.0320	0.0320	0.0570	0.0546	0.2964	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 59593034 : INDEL	d	r	0.1501	0.0211	0.1120	0.1625	0.0093	0.0179	0.6046	+--+-	0.0	3.170	4	0.5298
12 : 121583828 : SNP	a	g	0.0948	0.0091	0.0723	0.1053	-0.0176	0.0147	0.2324	-+---	37.6	6.413	4	0.1704
4 : 86175276 : SNP	a	g	0.7199	0.0126	0.6952	0.7355	0.0038	0.0093	0.687	0+-++	0.0	1.311	4	0.8595
13 : 100071641 : SNP	c	g	0.8199	0.0074	0.8136	0.8423	0.0054	0.0112	0.6286	+--++	0.0	1.113	4	0.8923
10 : 66617469 : INDEL	d	r	0.0122	0.0000	0.0122	0.0122	0.0070	0.0617	0.9096	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 67112244 : SNP	a	g	0.1015	0.0058	0.0922	0.1054	-0.0006	0.0148	0.9658	+-?+-	0.0	1.701	3	0.6367
11 : 23166355 : SNP	a	t	0.0260	0.0015	0.0247	0.0277	0.0075	0.0302	0.8051	-+???	0.0	0.718	1	0.3968
7 : 107626994 : SNP	a	g	0.3958	0.0146	0.3599	0.4076	-0.0154	0.0091	0.09173	-++--	14.1	4.655	4	0.3246
18 : 34428362 : SNP	a	t	0.8718	0.0065	0.8536	0.8855	-0.0035	0.0128	0.7849	++---	2.0	4.082	4	0.395
13 : 109870908 : SNP	t	g	0.1035	0.0107	0.0894	0.1134	0.0002	0.0185	0.9921	-+?-+	0.0	0.369	3	0.9465
2 : 207966850 : SNP	a	t	0.3698	0.0270	0.3116	0.4019	-0.0029	0.0090	0.7446	-++--	40.2	6.691	4	0.1531
5 : 158755475 : SNP	a	g	0.1642	0.0058	0.1413	0.1668	0.0085	0.0116	0.4622	+-++-	31.5	5.836	4	0.2118
7 : 83067470 : SNP	t	g	0.2418	0.0107	0.2339	0.2658	0.0128	0.0099	0.1988	++-++	0.0	1.832	4	0.7667
1 : 179520844 : SNP	a	g	0.2067	0.0027	0.1967	0.2154	-0.0118	0.0105	0.2582	-+-+-	0.0	2.055	4	0.7256
13 : 111374224 : SNP	t	c	0.0504	0.0059	0.0457	0.0578	0.0442	0.0387	0.254	+???+	0.0	0.001	1	0.9699
3 : 64444619 : SNP	a	g	0.6276	0.0130	0.6097	0.6405	-0.0129	0.0091	0.1591	-+-+-	20.7	5.047	4	0.2825
4 : 1519145 : SNP	c	g	0.3906	0.0243	0.3644	0.4380	0.0014	0.0089	0.8737	+-+--	16.7	4.802	4	0.3083
8 : 33779748 : SNP	c	g	0.4013	0.0225	0.3867	0.4511	-0.0045	0.0090	0.6214	--+-+	0.0	0.549	4	0.9685
3 : 11214450 : SNP	t	c	0.0516	0.0023	0.0460	0.0526	-0.0044	0.0210	0.8359	+-??-	0.0	1.471	2	0.4792
5 : 59975064 : SNP	t	c	0.5723	0.0160	0.5400	0.6138	0.0078	0.0085	0.3612	0+--+	3.2	4.130	4	0.3887
1 : 171169192 : SNP	t	g	0.3152	0.0067	0.2915	0.3193	0.0045	0.0092	0.6261	+++-+	9.2	4.406	4	0.3538
2 : 156441432 : SNP	a	g	0.4076	0.0093	0.3988	0.4289	-0.0011	0.0089	0.9045	+--++	0.0	3.003	4	0.5574
4 : 136157150 : SNP	a	g	0.0290	0.0000	0.0290	0.0290	-0.0810	0.0435	0.0624	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 107670369 : SNP	a	t	0.9857	0.0000	0.9857	0.9857	0.0200	0.0526	0.7036	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 59830731 : SNP	a	g	0.1773	0.0143	0.1551	0.1931	0.0021	0.0160	0.8931	+--++	0.0	1.076	4	0.8981
8 : 125649900 : SNP	t	c	0.1280	0.0171	0.1120	0.1612	-0.0221	0.0146	0.1312	-+?+-	25.2	4.010	3	0.2604
10 : 123347184 : SNP	t	c	0.8069	0.0070	0.7968	0.8124	-0.0129	0.0108	0.2326	++---	58.6	9.655	4	0.04666
17 : 25954820 : SNP	t	c	0.7701	0.0043	0.7623	0.7799	-0.0082	0.0100	0.4135	-+-+-	0.0	2.723	4	0.6052
1 : 241159848 : SNP	a	g	0.8880	0.0062	0.8831	0.8977	0.0128	0.0146	0.3813	+-?-+	71.4	10.489	3	0.01484
10 : 109529416 : SNP	a	c	0.9050	0.0054	0.8988	0.9160	-0.0024	0.0171	0.8889	-+?+-	0.0	0.700	3	0.8731
2 : 82956517 : SNP	a	g	0.3389	0.0174	0.2989	0.3553	0.0130	0.0111	0.2428	+++-+	25.5	5.367	4	0.2516
12 : 10311122 : SNP	a	g	0.9870	0.0000	0.9870	0.9870	0.0190	0.0536	0.7229	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 31621069 : SNP	c	g	0.0126	0.0000	0.0126	0.0126	-0.0350	0.0576	0.5436	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 22591827 : SNP	a	g	0.1172	0.0009	0.1168	0.1207	-0.0048	0.0140	0.733	--?++	0.0	2.587	3	0.4597
21 : 40513215 : INDEL	d	r	0.0753	0.0037	0.0721	0.0859	-0.0144	0.0174	0.407	-+?+-	0.0	2.737	3	0.434
10 : 53229114 : SNP	t	c	0.9337	0.0063	0.9108	0.9369	-0.0063	0.0181	0.7256	-+?+-	0.0	1.284	3	0.7329
8 : 56255466 : SNP	c	g	0.7747	0.0126	0.7392	0.7834	0.0122	0.0103	0.2381	++--+	18.3	4.895	4	0.2982
10 : 25232683 : SNP	t	g	0.1792	0.0070	0.1679	0.1899	0.0035	0.0111	0.7564	+++--	0.0	2.320	4	0.6771
10 : 88433317 : SNP	t	c	0.5120	0.0128	0.4672	0.5338	-0.0020	0.0085	0.8136	-+++-	0.0	1.326	4	0.8569
10 : 115775432 : SNP	t	c	0.6374	0.0205	0.6110	0.6764	0.0032	0.0086	0.7093	-+-+-	16.4	4.785	4	0.3101
5 : 111087619 : SNP	c	g	0.9070	0.0069	0.8927	0.9115	0.0178	0.0148	0.2299	-++++	53.0	8.508	4	0.07465
3 : 36719585 : INDEL	d	r	0.0545	0.0000	0.0545	0.0545	0.0510	0.0414	0.2185	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 12598715 : SNP	c	g	0.2531	0.0066	0.2310	0.2597	-0.0037	0.0099	0.7091	---+-	0.0	1.884	4	0.7571
8 : 129211415 : SNP	a	g	0.1952	0.0159	0.1749	0.2281	0.0030	0.0107	0.7799	0+++-	0.0	3.264	4	0.5147
4 : 25320474 : SNP	a	g	0.9718	0.0000	0.9718	0.9718	0.0250	0.0374	0.5039	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 30948306 : SNP	t	g	0.9377	0.0081	0.9237	0.9486	-0.0059	0.0181	0.7443	-+?--	0.0	2.089	3	0.5542
5 : 41138291 : SNP	a	t	0.7893	0.0102	0.7770	0.8117	0.0170	0.0105	0.107	++--+	0.0	3.418	4	0.4905
11 : 119302650 : INDEL	d	r	0.1248	0.0224	0.0960	0.1422	-0.0049	0.0223	0.8261	+??+-	0.0	1.617	2	0.4455
13 : 98387925 : SNP	t	g	0.6308	0.0079	0.6138	0.6498	-0.0048	0.0089	0.5913	0-+++	31.4	5.831	4	0.2121
4 : 48678387 : SNP	t	g	0.4803	0.0132	0.4730	0.5336	0.0026	0.0092	0.776	-++-?	33.2	4.491	3	0.2131
13 : 94293537 : INDEL	i	r	0.7304	0.0260	0.6905	0.7723	-0.0058	0.0133	0.661	0-++-	0.0	3.029	4	0.553
6 : 52407159 : SNP	a	g	0.1109	0.0074	0.0929	0.1192	0.0133	0.0134	0.3226	+----	0.0	3.346	4	0.5016
3 : 180520486 : SNP	a	g	0.7962	0.0040	0.7909	0.8124	-0.0014	0.0106	0.8937	+-++-	0.0	2.652	4	0.6176
11 : 55787575 : SNP	t	c	0.9160	0.0037	0.9054	0.9198	0.0045	0.0156	0.7741	-++-+	0.0	2.366	4	0.6688
1 : 57495236 : INDEL	d	r	0.3934	0.0214	0.3398	0.4171	-0.0240	0.0088	0.006325	--++-	0.0	2.291	4	0.6824
2 : 154971188 : SNP	a	t	0.7727	0.0106	0.7442	0.7910	0.0049	0.0101	0.6275	+++--	0.0	2.025	4	0.7312
7 : 24375264 : SNP	a	g	0.2956	0.0156	0.2866	0.3281	-0.0051	0.0093	0.5828	---+-	0.0	2.868	4	0.5801
3 : 38306724 : SNP	c	g	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	0.0370	0.0566	0.5134	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 43785603 : SNP	c	g	0.0740	0.0140	0.0544	0.0910	0.0183	0.0217	0.4005	++?+-	0.0	1.395	3	0.7068
1 : 101689913 : SNP	a	g	0.3367	0.0095	0.3040	0.3459	-0.0054	0.0092	0.5568	++---	20.4	5.027	4	0.2845
1 : 225335608 : SNP	t	g	0.9001	0.0101	0.8805	0.9101	-0.0052	0.0146	0.7189	--++-	26.0	5.403	4	0.2484
13 : 43314512 : SNP	t	g	0.2647	0.0170	0.2086	0.2896	0.0062	0.0101	0.5379	++--+	0.0	2.088	4	0.7196
4 : 125007288 : SNP	a	t	0.8159	0.0070	0.7990	0.8222	-0.0205	0.0123	0.09554	---+-	0.0	1.155	4	0.8854
7 : 4173613 : SNP	a	g	0.5839	0.0167	0.5606	0.6089	0.0089	0.0085	0.2961	+++-+	0.0	1.605	4	0.8078
13 : 61502050 : SNP	a	g	0.1212	0.0090	0.1004	0.1349	-0.0011	0.0130	0.9309	+---+	43.1	7.025	4	0.1346
11 : 35437497 : SNP	t	c	0.9675	0.0000	0.9675	0.9675	-0.0550	0.0374	0.1414	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 134961347 : SNP	t	c	0.4326	0.0051	0.4180	0.4364	-0.0016	0.0085	0.8514	0-++-	0.0	3.845	4	0.4274
4 : 163136335 : SNP	t	c	0.0456	0.0037	0.0382	0.0498	-0.0005	0.0229	0.9819	+-??-	0.0	0.513	2	0.7736
11 : 33167784 : SNP	a	g	0.6856	0.0054	0.6753	0.6893	-0.0003	0.0091	0.9753	+-++-	0.0	1.441	4	0.8371
16 : 83801814 : SNP	t	c	0.9725	0.0000	0.9725	0.9725	0.0120	0.0384	0.7547	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 120365901 : SNP	t	c	0.1617	0.0110	0.1436	0.1702	-0.0057	0.0119	0.6326	---+-	0.0	1.452	4	0.8351
4 : 116386176 : SNP	t	c	0.7780	0.0154	0.7622	0.8063	-0.0089	0.0112	0.4263	-+---	0.0	1.473	4	0.8314
8 : 14320467 : SNP	t	g	0.5910	0.0234	0.5233	0.6267	0.0130	0.0085	0.1279	0-+++	59.5	9.878	4	0.04253
4 : 182484803 : SNP	a	c	0.8520	0.0140	0.8229	0.8638	0.0010	0.0125	0.9349	-+-++	0.0	2.220	4	0.6954
1 : 159002778 : SNP	a	g	0.1752	0.0100	0.1559	0.1871	0.0080	0.0113	0.4794	-+++-	0.0	2.364	4	0.6691
14 : 49661754 : SNP	t	g	0.0447	0.0024	0.0415	0.0479	-0.0112	0.0237	0.6353	+-??-	0.0	0.856	2	0.6518
4 : 88954247 : SNP	c	g	0.3161	0.0030	0.3111	0.3231	0.0003	0.0092	0.976	-++--	31.3	5.818	4	0.2131
2 : 137333591 : SNP	t	c	0.1167	0.0131	0.1078	0.1445	0.0050	0.0139	0.7176	++++-	0.0	1.001	4	0.9097
3 : 125418973 : SNP	a	g	0.2078	0.0177	0.1958	0.2411	-0.0006	0.0118	0.9621	++---	0.0	2.925	4	0.5705
3 : 189875289 : SNP	a	g	0.1078	0.0111	0.0856	0.1308	-0.0355	0.0137	0.009309	-----	24.8	5.320	4	0.256
7 : 49116608 : SNP	a	g	0.9816	0.0000	0.9816	0.9816	-0.0370	0.0566	0.5134	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 81365735 : SNP	a	g	0.2109	0.0191	0.1510	0.2346	0.0072	0.0106	0.4956	+-+++	0.0	2.671	4	0.6143
7 : 106744569 : SNP	t	c	0.9017	0.0046	0.8837	0.9064	0.0133	0.0142	0.3491	++++-	29.2	5.648	4	0.227
6 : 169802869 : SNP	t	c	0.9816	0.0000	0.9816	0.9816	-0.0130	0.0455	0.775	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 10883693 : SNP	a	c	0.1895	0.0058	0.1720	0.1933	-0.0115	0.0107	0.2837	-0---	0.0	1.033	4	0.9047
10 : 76931305 : SNP	a	c	0.2115	0.0078	0.1956	0.2261	-0.0126	0.0106	0.2355	--+++	0.0	1.022	4	0.9065
2 : 7037068 : SNP	t	c	0.6365	0.0082	0.6286	0.6456	0.0172	0.0097	0.07645	++-++	0.0	2.614	4	0.6243
8 : 142284825 : SNP	t	c	0.1792	0.0056	0.1694	0.1843	-0.0080	0.0121	0.5086	----+	0.0	2.118	4	0.7141
11 : 80371767 : SNP	a	g	0.0217	0.0000	0.0217	0.0217	-0.0070	0.0526	0.8941	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 36594553 : SNP	t	g	0.2239	0.0142	0.2017	0.2519	0.0114	0.0103	0.2678	+++++	0.0	0.561	4	0.9673
18 : 74227108 : SNP	a	g	0.8352	0.0092	0.8148	0.8479	-0.0152	0.0126	0.2251	-+-++	6.9	4.295	4	0.3676
18 : 7627956 : SNP	a	g	0.1285	0.0099	0.1225	0.1479	-0.0093	0.0126	0.4599	-+--+	0.0	0.970	4	0.9144
6 : 107089419 : SNP	a	t	0.9531	0.0099	0.9341	0.9606	0.0116	0.0213	0.5869	+-??-	51.1	4.093	2	0.1292
3 : 24535101 : SNP	a	g	0.9458	0.0051	0.9417	0.9592	0.0616	0.0205	0.002654	++??+	2.7	2.055	2	0.3579
13 : 82563927 : SNP	c	g	0.0709	0.0055	0.0573	0.0734	-0.0196	0.0169	0.2458	--?--	0.0	1.455	3	0.6927
8 : 2767691 : SNP	a	c	0.8825	0.0176	0.8492	0.8932	-0.0006	0.0137	0.9672	--+++	0.0	1.935	4	0.7477
8 : 143731748 : SNP	a	g	0.3230	0.0118	0.3131	0.3548	-0.0000	0.0091	0.9992	-++-+	0.0	1.397	4	0.8447
22 : 48607847 : SNP	a	g	0.0434	0.0000	0.0434	0.0434	-0.0170	0.0414	0.6817	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 192555860 : SNP	a	g	0.8940	0.0042	0.8807	0.8996	0.0088	0.0138	0.5241	-++++	2.2	4.090	4	0.3939
1 : 226303673 : SNP	c	g	0.2926	0.0132	0.2760	0.3172	0.0013	0.0094	0.8919	++-+-	1.1	4.044	4	0.4001
10 : 20585370 : SNP	a	g	0.1098	0.0144	0.0882	0.1310	-0.0021	0.0141	0.8839	+----	0.0	2.942	4	0.5675
2 : 14357189 : SNP	a	g	0.9309	0.0072	0.9276	0.9529	-0.0429	0.0182	0.0182	--??+	42.6	3.483	2	0.1753
3 : 153974390 : SNP	a	c	0.1050	0.0121	0.0985	0.1309	-0.0067	0.0138	0.6293	--+-+	0.0	2.520	4	0.641
6 : 69060344 : SNP	a	g	0.9869	0.0000	0.9869	0.9869	0.0400	0.0546	0.4637	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 8016499 : SNP	t	c	0.1927	0.0116	0.1734	0.2087	0.0120	0.0106	0.2579	++---	0.0	2.739	4	0.6023
13 : 91929736 : SNP	a	c	0.8672	0.0049	0.8473	0.8696	-0.0014	0.0127	0.9127	--+++	43.2	7.040	4	0.1338
1 : 231595555 : SNP	t	c	0.7313	0.0186	0.7092	0.7574	0.0116	0.0097	0.2337	++++-	0.0	0.727	4	0.948
22 : 17437500 : SNP	t	c	0.2695	0.0083	0.2411	0.2772	0.0084	0.0106	0.4245	+++-?	0.0	2.663	3	0.4466
2 : 12433534 : SNP	t	c	0.0242	0.0000	0.0242	0.0242	0.0300	0.0404	0.4581	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 94008753 : SNP	a	g	0.1279	0.0103	0.1095	0.1342	0.0079	0.0126	0.5296	+-++-	52.8	8.469	4	0.07584
19 : 55060629 : SNP	t	g	0.5226	0.0124	0.4856	0.5401	-0.0231	0.0100	0.02102	---+-	19.7	4.984	4	0.289
20 : 62775523 : INDEL	i	r	0.2807	0.0149	0.2435	0.2959	-0.0177	0.0100	0.07471	---+-	0.0	1.876	4	0.7586
11 : 109414301 : SNP	a	g	0.5279	0.0154	0.5108	0.5611	-0.0203	0.0097	0.03605	--+--	0.0	1.105	4	0.8935
4 : 140414272 : SNP	a	g	0.0270	0.0000	0.0270	0.0270	0.0210	0.0556	0.7056	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 243690034 : SNP	t	c	0.1440	0.0094	0.1220	0.1532	0.0024	0.0127	0.8478	-++++	16.4	4.786	4	0.31
4 : 136949937 : INDEL	d	r	0.4226	0.0058	0.4193	0.4456	-0.0059	0.0085	0.4857	-0---	0.0	0.934	4	0.9197
4 : 173068264 : SNP	a	g	0.6535	0.0184	0.6306	0.6727	-0.0172	0.0096	0.07394	--++-	0.0	1.140	4	0.8878
1 : 39303614 : SNP	t	g	0.9378	0.0058	0.9333	0.9496	0.0143	0.0193	0.459	+-?-+	57.6	7.082	3	0.06932
4 : 184370648 : SNP	a	g	0.8928	0.0094	0.8630	0.9000	0.0122	0.0146	0.4022	++?++	0.0	0.784	3	0.8532
2 : 65032759 : SNP	a	c	0.0583	0.0017	0.0543	0.0590	0.0229	0.0186	0.2181	+-?-+	0.0	2.293	3	0.5138
2 : 201644232 : SNP	t	c	0.7842	0.0119	0.7467	0.7942	0.0148	0.0104	0.1543	+++-+	2.9	4.120	4	0.39
13 : 21767886 : INDEL	d	r	0.0793	0.0026	0.0763	0.0843	-0.0011	0.0162	0.9475	-+?+-	0.0	1.774	3	0.6207
19 : 39147510 : SNP	a	g	0.0632	0.0082	0.0488	0.0702	-0.0133	0.0251	0.5965	0-??-	0.0	0.881	2	0.6438
10 : 56003084 : SNP	t	c	0.0226	0.0000	0.0226	0.0226	-0.0140	0.0455	0.7583	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 51110357 : SNP	a	g	0.1351	0.0108	0.1116	0.1532	0.0103	0.0125	0.4096	+-+-+	0.0	3.389	4	0.495
4 : 102045336 : SNP	a	g	0.1239	0.0075	0.1130	0.1299	-0.0113	0.0130	0.386	----+	0.0	1.681	4	0.7941
8 : 15943361 : SNP	t	c	0.9739	0.0000	0.9739	0.9739	0.0340	0.0414	0.412	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 23404966 : SNP	a	g	0.8102	0.0094	0.7748	0.8196	-0.0031	0.0108	0.7718	+----	0.0	2.973	4	0.5623
5 : 76789265 : SNP	t	g	0.5254	0.0082	0.5121	0.5446	-0.0038	0.0084	0.6493	+-+--	59.2	9.805	4	0.04385
4 : 170601955 : SNP	t	c	0.0752	0.0048	0.0628	0.0781	-0.0005	0.0165	0.977	-+?+-	55.3	6.713	3	0.08163
1 : 54507000 : SNP	a	g	0.0554	0.0081	0.0349	0.0633	0.0175	0.0205	0.3924	++??+	0.0	0.044	2	0.9781
18 : 66683004 : SNP	a	g	0.9817	0.0000	0.9817	0.9817	-0.0030	0.0445	0.9462	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 134274064 : SNP	t	c	0.4784	0.0290	0.4111	0.4921	-0.0048	0.0085	0.5738	---+-	0.0	1.415	4	0.8415
7 : 1690695 : SNP	a	c	0.5183	0.0137	0.4930	0.5364	-0.0083	0.0086	0.3338	--+++	0.0	1.849	4	0.7636
11 : 3528151 : SNP	c	g	0.3079	0.0266	0.2897	0.3503	0.0008	0.0248	0.9732	??++-	22.0	2.564	2	0.2774
5 : 18318297 : SNP	a	t	0.7731	0.0073	0.7517	0.7812	0.0156	0.0104	0.1336	++-++	43.0	7.018	4	0.1349
6 : 35120225 : SNP	t	g	0.0119	0.0000	0.0119	0.0119	0.0120	0.0576	0.835	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 224165395 : SNP	a	g	0.3997	0.0101	0.3896	0.4148	-0.0011	0.0086	0.9006	+-+--	56.0	9.085	4	0.059
8 : 91533524 : SNP	a	g	0.9654	0.0017	0.9633	0.9667	0.0205	0.0264	0.4363	-+???	17.7	1.214	1	0.2705
9 : 900199 : SNP	a	g	0.6309	0.0275	0.5913	0.6746	0.0064	0.0117	0.5843	+--++	0.0	0.625	4	0.9603
10 : 30656782 : SNP	t	g	0.9069	0.0040	0.9016	0.9172	-0.0247	0.0168	0.1411	--?++	0.0	2.720	3	0.4369
3 : 173902815 : SNP	t	g	0.4213	0.0157	0.3861	0.4306	0.0095	0.0086	0.2697	+++++	0.0	0.885	4	0.9267
13 : 73179593 : SNP	a	g	0.3192	0.0070	0.3150	0.3479	0.0034	0.0091	0.712	-+-++	10.0	4.445	4	0.3492
1 : 163675883 : SNP	t	c	0.5076	0.0254	0.4932	0.5665	0.0124	0.0085	0.146	+++-+	0.0	1.606	4	0.8077
11 : 1401227 : SNP	a	g	0.9486	0.0057	0.9439	0.9596	0.0022	0.0213	0.9168	-+??-	64.3	5.609	2	0.06054
8 : 76235486 : INDEL	i	r	0.0193	0.0000	0.0193	0.0193	-0.0120	0.0556	0.8291	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 10977931 : SNP	a	g	0.3074	0.0232	0.2889	0.3560	-0.0006	0.0093	0.9493	0-+++	3.0	4.124	4	0.3895
7 : 15203121 : SNP	t	c	0.0488	0.0003	0.0484	0.0491	0.0183	0.0225	0.4165	++???	0.0	0.133	1	0.7153
16 : 24869749 : INDEL	i	r	0.1960	0.0081	0.1746	0.2021	0.0047	0.0115	0.6794	+-+++	2.7	4.109	4	0.3914
8 : 112678991 : SNP	a	g	0.0404	0.0104	0.0320	0.0532	-0.0012	0.0400	0.9768	-???+	55.6	2.255	1	0.1332
2 : 134564137 : SNP	a	g	0.9764	0.0000	0.9764	0.9764	0.0170	0.0425	0.6889	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 21367077 : SNP	c	g	0.8299	0.0164	0.7969	0.8422	-0.0073	0.0113	0.5176	0-++-	18.5	4.908	4	0.2969
18 : 19043704 : SNP	a	c	0.1591	0.0148	0.1360	0.1885	-0.0113	0.0119	0.3413	-+---	0.0	0.881	4	0.9273
12 : 113615237 : SNP	a	t	0.0157	0.0000	0.0157	0.0157	-0.0220	0.0556	0.6923	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 82236828 : SNP	t	c	0.5371	0.0084	0.5195	0.5440	-0.0023	0.0085	0.7843	--+--	0.0	1.329	4	0.8564
6 : 85435550 : SNP	a	g	0.4587	0.0159	0.4403	0.4904	-0.0063	0.0085	0.4615	+----	0.0	1.222	4	0.8745
6 : 30042209 : SNP	t	g	0.1284	0.0097	0.1213	0.1480	-0.0007	0.0268	0.9799	??++-	0.0	1.316	2	0.518
22 : 31262501 : SNP	t	c	0.3393	0.0159	0.3050	0.3665	-0.0001	0.0092	0.9931	+-+-+	24.6	5.302	4	0.2577
5 : 161741820 : SNP	a	c	0.8653	0.0061	0.8525	0.8691	0.0085	0.0131	0.5178	++++-	0.0	3.313	4	0.5069
2 : 36674996 : SNP	t	c	0.3052	0.0086	0.2920	0.3117	-0.0003	0.0092	0.9741	-++++	55.0	8.881	4	0.06415
6 : 159133817 : SNP	a	g	0.1458	0.0088	0.1147	0.1567	0.0095	0.0132	0.4709	+++-+	53.8	8.657	4	0.07027
20 : 50384777 : SNP	a	c	0.0382	0.0000	0.0382	0.0382	0.0550	0.0344	0.1095	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 34433775 : SNP	a	g	0.3685	0.0184	0.3279	0.3823	-0.0005	0.0089	0.9517	--++-	0.0	1.131	4	0.8893
17 : 70907941 : SNP	t	c	0.5650	0.0212	0.5346	0.5906	0.0069	0.0099	0.4841	++---	27.8	5.541	4	0.2361
8 : 129114742 : SNP	a	g	0.8908	0.0131	0.8711	0.9036	-0.0204	0.0147	0.1644	--++-	37.9	6.444	4	0.1683
2 : 231360489 : SNP	a	g	0.2263	0.0180	0.1875	0.2394	-0.0068	0.0107	0.5253	0--+-	0.0	0.867	4	0.9293
1 : 229828899 : INDEL	i	r	0.2608	0.0107	0.2540	0.2850	-0.0075	0.0097	0.4415	-0++-	0.0	2.101	4	0.7171
6 : 30426765 : SNP	t	c	0.1894	0.0108	0.1653	0.1984	0.0100	0.0232	0.6662	??-++	20.7	2.522	2	0.2834
3 : 94863368 : INDEL	d	r	0.0320	0.0084	0.0274	0.0473	0.0155	0.0257	0.547	++??-	11.5	2.261	2	0.3229
13 : 41996469 : SNP	a	g	0.9712	0.0000	0.9712	0.9712	-0.0150	0.0627	0.8108	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 242613760 : SNP	t	c	0.3430	0.0107	0.3278	0.3522	0.0032	0.0224	0.8859	??+++	0.0	0.020	2	0.9902
11 : 117581353 : SNP	a	t	0.0291	0.0000	0.0291	0.0291	0.0180	0.0556	0.7461	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 22044940 : SNP	t	c	0.8000	0.0107	0.7889	0.8235	-0.0076	0.0107	0.4816	+---+	0.0	1.523	4	0.8225
2 : 242625413 : SNP	a	t	0.5582	0.0139	0.5352	0.5692	0.0022	0.0201	0.9127	??--+	0.0	0.039	2	0.9806
12 : 49377479 : SNP	t	c	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	0.0990	0.0526	0.05965	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 84594167 : SNP	t	c	0.6986	0.0026	0.6966	0.7072	0.0095	0.0092	0.301	+-+++	0.0	1.384	4	0.847
5 : 137216416 : SNP	a	g	0.0164	0.0000	0.0164	0.0164	-0.0310	0.0526	0.5554	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 57764770 : SNP	a	g	0.5236	0.0076	0.5133	0.5457	0.0085	0.0085	0.3203	++++-	0.0	2.867	4	0.5804
5 : 171503453 : SNP	a	g	0.8844	0.0155	0.8638	0.9063	0.0225	0.0156	0.1493	+-+++	4.9	4.205	4	0.379
1 : 187044374 : SNP	t	g	0.1443	0.0057	0.1386	0.1677	0.0169	0.0121	0.1652	++++-	0.0	3.264	4	0.5147
6 : 162001439 : SNP	t	c	0.0238	0.0000	0.0238	0.0238	0.0140	0.0485	0.7729	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 24814144 : SNP	a	t	0.1327	0.0090	0.1110	0.1398	-0.0003	0.0134	0.9846	+++--	0.0	2.091	4	0.7189
22 : 33175786 : SNP	a	g	0.5094	0.0202	0.4636	0.5373	-0.0078	0.0085	0.3618	----+	0.0	1.902	4	0.7538
13 : 48068252 : SNP	t	c	0.6309	0.0107	0.6082	0.6480	-0.0180	0.0087	0.03953	--+-+	26.8	5.464	4	0.2429
6 : 71141321 : SNP	t	c	0.9826	0.0000	0.9826	0.9826	0.1080	0.0536	0.04382	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 62873938 : SNP	a	g	0.1209	0.0059	0.1057	0.1399	-0.0086	0.0129	0.5053	-++-+	2.3	4.096	4	0.3931
5 : 43474221 : SNP	a	g	0.9610	0.0148	0.9451	0.9748	-0.0320	0.0414	0.4388	-???+	72.0	3.566	1	0.05897
21 : 34556797 : SNP	t	c	0.8272	0.0084	0.8216	0.8449	0.0060	0.0124	0.6267	+0-+-	0.0	2.512	4	0.6425
18 : 70653404 : SNP	t	g	0.3348	0.0115	0.3216	0.3659	0.0018	0.0091	0.8422	-+--+	0.2	4.008	4	0.4049
9 : 6925459 : SNP	c	g	0.9497	0.0023	0.9458	0.9510	-0.0408	0.0331	0.2174	-???+	15.2	1.180	1	0.2774
13 : 43123032 : SNP	t	c	0.0157	0.0000	0.0157	0.0157	0.0670	0.0516	0.1937	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 64227320 : SNP	c	g	0.7123	0.0115	0.6800	0.7217	0.0051	0.0106	0.6294	-++++	0.0	2.929	4	0.5698
10 : 52339780 : SNP	a	g	0.2004	0.0088	0.1734	0.2099	0.0129	0.0107	0.2272	+-+++	0.0	3.685	4	0.4503
3 : 64056677 : SNP	t	g	0.8292	0.0090	0.8214	0.8512	-0.0082	0.0114	0.4696	--+--	0.0	0.989	4	0.9115
7 : 84030138 : SNP	t	c	0.9870	0.0000	0.9870	0.9870	0.0240	0.0607	0.6923	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 131275124 : INDEL	d	r	0.6946	0.0220	0.6535	0.7177	0.0116	0.0097	0.2289	++---	18.0	4.877	4	0.3002
11 : 25834971 : INDEL	i	r	0.8584	0.0149	0.8346	0.8862	-0.0161	0.0129	0.2116	-+-+-	48.3	7.741	4	0.1015
11 : 20983410 : SNP	a	g	0.2314	0.0096	0.2254	0.2622	0.0060	0.0100	0.5466	-++++	44.9	7.261	4	0.1227
8 : 32169437 : SNP	a	g	0.7205	0.0109	0.6882	0.7276	-0.0206	0.0097	0.03367	--++-	0.0	1.926	4	0.7495
4 : 47372739 : SNP	a	t	0.4410	0.0106	0.4160	0.4466	0.0107	0.0085	0.2097	++++-	0.0	2.040	4	0.7284
2 : 55617158 : SNP	a	c	0.0123	0.0000	0.0123	0.0123	0.0100	0.0586	0.8646	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 40191866 : SNP	a	g	0.2506	0.0131	0.2293	0.2635	-0.0102	0.0105	0.332	---++	0.0	1.929	4	0.7488
8 : 1846907 : SNP	t	c	0.1271	0.0135	0.0952	0.1385	-0.0222	0.0134	0.0972	+--+-	60.6	10.162	4	0.03779
15 : 38297252 : SNP	t	c	0.0467	0.0047	0.0435	0.0536	-0.0034	0.0326	0.9177	-???+	84.7	6.529	1	0.01061
6 : 109661930 : SNP	t	c	0.1173	0.0074	0.1053	0.1272	-0.0075	0.0137	0.582	-+?--	0.0	2.225	3	0.527
6 : 78531689 : SNP	a	g	0.7229	0.0085	0.7176	0.7424	0.0027	0.0094	0.7721	+-+--	0.0	1.476	4	0.831
15 : 47324526 : INDEL	d	r	0.0963	0.0081	0.0885	0.1241	-0.0228	0.0160	0.1534	--+-+	0.0	2.808	4	0.5905
3 : 117072094 : SNP	a	c	0.1657	0.0049	0.1588	0.1777	-0.0067	0.0114	0.5581	-----	0.0	0.695	4	0.9519
6 : 97301121 : SNP	t	c	0.9656	0.0014	0.9636	0.9671	-0.0238	0.0242	0.3263	--??-	0.0	0.371	2	0.8305
15 : 22791795 : SNP	a	t	0.6944	0.0084	0.6869	0.7161	0.0047	0.0093	0.6098	+++--	0.0	1.661	4	0.7977
1 : 93052685 : SNP	c	g	0.8944	0.0076	0.8836	0.9004	-0.0093	0.0139	0.502	+-+-+	58.4	9.620	4	0.04735
5 : 1494764 : SNP	t	c	0.1797	0.0079	0.1693	0.1866	-0.0178	0.0112	0.113	--+++	0.0	2.823	4	0.5878
3 : 159323378 : SNP	a	g	0.9806	0.0000	0.9806	0.9806	-0.0390	0.0425	0.3583	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 6640556 : SNP	t	c	0.4724	0.0271	0.4133	0.4926	-0.0153	0.0085	0.07314	--+++	0.0	2.239	4	0.6919
11 : 105458477 : SNP	t	c	0.0689	0.0087	0.0542	0.0846	0.0174	0.0172	0.3116	-+?++	0.0	2.338	3	0.5052
1 : 70942465 : SNP	t	g	0.0125	0.0000	0.0125	0.0125	0.0180	0.0596	0.7628	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 49922959 : SNP	t	g	0.1003	0.0064	0.0813	0.1060	-0.0211	0.0150	0.1606	-----	36.5	6.301	4	0.1778
7 : 85746274 : SNP	t	c	0.9675	0.0051	0.9618	0.9721	0.0101	0.0337	0.7642	++???	0.0	0.001	1	0.9764
13 : 22360374 : INDEL	i	r	0.0261	0.0000	0.0261	0.0261	0.0410	0.0394	0.2983	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 78749352 : SNP	t	c	0.9782	0.0000	0.9782	0.9782	0.0310	0.0546	0.5701	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 8572447 : SNP	t	c	0.2538	0.0163	0.2184	0.2632	0.0103	0.0099	0.3016	++-++	0.0	0.987	4	0.9118
3 : 76809927 : SNP	a	g	0.8944	0.0069	0.8746	0.8988	-0.0100	0.0152	0.5107	-++--	63.2	10.863	4	0.02815
3 : 11718484 : SNP	t	c	0.6423	0.0046	0.6328	0.6537	-0.0102	0.0092	0.2683	+----	36.6	6.314	4	0.1769
19 : 10748850 : SNP	c	g	0.9406	0.0050	0.9355	0.9455	-0.0604	0.0281	0.03144	--???	0.0	0.026	1	0.8727
11 : 128658642 : SNP	a	g	0.6752	0.0164	0.6634	0.7126	-0.0017	0.0092	0.851	++---	17.4	4.845	4	0.3036
3 : 163725074 : SNP	t	c	0.8196	0.0092	0.7854	0.8240	0.0010	0.0112	0.9312	+-+-+	0.0	2.547	4	0.6363
5 : 119343103 : SNP	t	c	0.6478	0.0122	0.6336	0.6771	-0.0104	0.0092	0.2569	0----	0.0	2.109	4	0.7158
14 : 43358111 : SNP	t	c	0.9689	0.0000	0.9689	0.9689	0.0150	0.0596	0.8014	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 11110718 : SNP	t	c	0.7366	0.0076	0.7220	0.7512	-0.0090	0.0097	0.3535	--++-	5.2	4.221	4	0.3769
6 : 163713283 : SNP	a	g	0.0575	0.0098	0.0512	0.0760	-0.0322	0.0185	0.08231	--?--	44.3	5.383	3	0.1458
6 : 63906418 : SNP	t	c	0.7160	0.0190	0.6683	0.7301	0.0049	0.0097	0.6121	+-+-+	5.4	4.229	4	0.3759
17 : 14392264 : SNP	a	g	0.4003	0.0046	0.3907	0.4072	0.0006	0.0097	0.9524	+--+-	5.6	4.237	4	0.3749
3 : 191660666 : SNP	t	c	0.5578	0.0123	0.5412	0.5868	-0.0043	0.0086	0.6184	-----	0.0	0.398	4	0.9827
1 : 62469398 : SNP	a	g	0.2189	0.0192	0.1755	0.2417	0.0087	0.0103	0.4013	++---	0.0	3.406	4	0.4922
14 : 26858262 : SNP	a	g	0.9704	0.0000	0.9704	0.9704	0.1780	0.0637	0.00519	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 176641594 : SNP	c	g	0.0329	0.0054	0.0295	0.0435	-0.0467	0.0254	0.066	--??+	0.0	1.273	2	0.5292
10 : 106117728 : INDEL	i	r	0.2969	0.0061	0.2828	0.3028	0.0104	0.0099	0.2942	++++-	0.0	2.112	4	0.7152
12 : 43863812 : SNP	t	g	0.6695	0.0122	0.6619	0.7037	-0.0085	0.0092	0.3533	----+	0.0	2.779	4	0.5954
14 : 43931198 : INDEL	d	r	0.0705	0.0018	0.0662	0.0723	0.0268	0.0174	0.1233	++?++	0.0	0.352	3	0.95
8 : 122417574 : SNP	a	g	0.1036	0.0024	0.1003	0.1125	-0.0042	0.0140	0.7642	-+++-	0.0	1.820	4	0.7688
6 : 26262063 : SNP	t	g	0.3095	0.0130	0.2665	0.3413	-0.0132	0.0092	0.1501	----+	0.0	2.750	4	0.6005
6 : 166035905 : SNP	t	c	0.8881	0.0066	0.8745	0.8960	0.0037	0.0137	0.7868	--+++	37.8	6.427	4	0.1694
4 : 90818216 : SNP	c	g	0.4912	0.0193	0.4677	0.5269	0.0178	0.0085	0.03608	+-+++	6.3	4.267	4	0.3711
13 : 54592679 : SNP	a	g	0.2276	0.0229	0.2007	0.2727	0.0188	0.0104	0.07271	+++++	0.0	1.539	4	0.8197
2 : 5374174 : SNP	a	t	0.6188	0.0059	0.6053	0.6223	0.0011	0.0086	0.8975	++---	0.0	3.127	4	0.5368
18 : 53533923 : SNP	a	g	0.1406	0.0094	0.1299	0.1600	0.0223	0.0122	0.06737	+++-+	0.0	2.285	4	0.6834
7 : 77569559 : SNP	t	c	0.0346	0.0056	0.0290	0.0448	-0.0263	0.0261	0.3134	--??-	0.0	0.206	2	0.9021
11 : 129259286 : SNP	a	g	0.9376	0.0064	0.9295	0.9465	-0.0114	0.0188	0.5433	--??+	80.3	10.143	2	0.006273
16 : 88377040 : SNP	a	g	0.9488	0.0008	0.9483	0.9502	0.0047	0.0301	0.8763	-???+	65.8	2.922	1	0.0874
2 : 33045015 : SNP	c	g	0.8074	0.0114	0.7967	0.8227	-0.0095	0.0108	0.3779	-----	0.0	1.477	4	0.8308
21 : 47145962 : SNP	t	c	0.8231	0.0198	0.7828	0.8370	0.0093	0.0111	0.4049	++++-	0.0	0.882	4	0.9271
5 : 100890582 : SNP	a	g	0.0464	0.0092	0.0391	0.0581	0.0929	0.0349	0.00778	+???+	0.0	0.022	1	0.8815
6 : 142556312 : SNP	a	g	0.2403	0.0157	0.2256	0.2813	0.0042	0.0099	0.6683	-++-+	0.0	1.330	4	0.8563
1 : 109080968 : SNP	t	g	0.7830	0.0037	0.7812	0.8013	-0.0195	0.0112	0.08121	---+-	0.0	1.391	4	0.8457
14 : 59554409 : SNP	c	g	0.0867	0.0035	0.0806	0.0993	-0.0079	0.0155	0.6108	+-+--	34.2	6.080	4	0.1932
14 : 39821696 : SNP	t	c	0.9300	0.0076	0.9234	0.9428	-0.0021	0.0173	0.9024	++?+-	0.0	0.531	3	0.9121
1 : 199996685 : SNP	c	g	0.8777	0.0081	0.8500	0.8820	0.0065	0.0132	0.6232	-++++	0.0	1.934	4	0.748
13 : 77870657 : INDEL	d	r	0.0124	0.0000	0.0124	0.0124	0.0470	0.0556	0.3979	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 78364260 : SNP	a	g	0.1186	0.0023	0.1175	0.1275	-0.0152	0.0134	0.2582	----+	0.0	3.838	4	0.4284
3 : 114114959 : SNP	t	c	0.9702	0.0000	0.9702	0.9702	-0.0570	0.0465	0.2203	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 74872475 : SNP	a	g	0.9330	0.0060	0.9254	0.9461	-0.0282	0.0176	0.1088	--?--	0.0	1.009	3	0.7991
6 : 4502859 : SNP	a	g	0.8408	0.0083	0.8314	0.8544	0.0050	0.0122	0.6794	+-+++	0.0	0.557	4	0.9677
10 : 32398712 : SNP	t	c	0.2380	0.0089	0.2242	0.2498	0.0094	0.0100	0.3468	++++-	24.3	5.283	4	0.2594
18 : 21544131 : SNP	t	g	0.0353	0.0017	0.0343	0.0383	-0.0130	0.0306	0.6722	-???+	13.5	1.156	1	0.2823
19 : 3121908 : SNP	c	g	0.5145	0.0149	0.5040	0.5468	0.0066	0.0086	0.4392	+--++	0.0	3.229	4	0.5202
13 : 25979674 : SNP	t	c	0.7602	0.0152	0.7504	0.8014	-0.0029	0.0099	0.7674	-+++-	44.4	7.195	4	0.1259
5 : 95308617 : SNP	a	g	0.0109	0.0000	0.0109	0.0109	-0.0810	0.0596	0.1744	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 8402016 : SNP	a	c	0.2126	0.0202	0.1667	0.2242	-0.0133	0.0108	0.2162	-+---	71.6	14.107	4	0.00696
20 : 52135466 : INDEL	d	r	0.1431	0.0130	0.1132	0.1525	-0.0066	0.0129	0.6104	+++--	59.0	9.754	4	0.04478
11 : 105220807 : SNP	a	g	0.9524	0.0076	0.9359	0.9633	-0.0005	0.0211	0.9822	+-?-+	0.0	1.221	3	0.748
4 : 19013414 : SNP	t	c	0.9595	0.0063	0.9461	0.9641	0.0100	0.0243	0.6799	+-??-	7.7	2.166	2	0.3385
16 : 73827057 : SNP	a	t	0.4421	0.0102	0.4144	0.4486	-0.0006	0.0086	0.9406	0+-+-	0.0	0.154	4	0.9972
22 : 38246737 : SNP	c	g	0.0230	0.0000	0.0230	0.0230	-0.0240	0.0425	0.5719	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 134660094 : SNP	a	g	0.0174	0.0000	0.0174	0.0174	-0.1210	0.0485	0.01264	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 78398926 : SNP	t	c	0.0109	0.0000	0.0109	0.0109	0.0430	0.0637	0.4995	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 3925630 : SNP	a	c	0.2065	0.0005	0.2062	0.2073	-0.0039	0.0289	0.8941	???-+	22.1	1.284	1	0.2571
1 : 110649214 : SNP	a	g	0.0141	0.0000	0.0141	0.0141	0.0810	0.0617	0.189	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 25015303 : SNP	a	g	0.0779	0.0127	0.0668	0.1080	-0.0197	0.0164	0.2288	--?+-	32.3	4.431	3	0.2186
4 : 10052528 : SNP	a	c	0.0337	0.0024	0.0300	0.0365	-0.0243	0.0243	0.3174	--??+	0.0	1.616	2	0.4458
2 : 171043139 : SNP	a	g	0.3986	0.0172	0.3813	0.4329	-0.0045	0.0087	0.6085	+-+--	0.0	3.865	4	0.4245
4 : 43347158 : SNP	a	t	0.9684	0.0006	0.9674	0.9687	0.0426	0.0318	0.1812	+???+	0.0	0.008	1	0.9299
10 : 131491318 : SNP	c	g	0.5575	0.0313	0.5164	0.6175	-0.0044	0.0085	0.6095	-+-++	0.0	1.122	4	0.8908
6 : 122854940 : SNP	c	g	0.1510	0.0051	0.1447	0.1561	-0.0248	0.0119	0.03799	---+-	26.5	5.445	4	0.2446
5 : 16556881 : SNP	t	c	0.9445	0.0034	0.9403	0.9472	-0.0310	0.0220	0.1586	--???	0.0	0.537	1	0.4637
1 : 55087248 : SNP	t	c	0.9857	0.0000	0.9857	0.9857	0.0290	0.0526	0.5812	+????	0.0	0.000	0	1
22 : 46474200 : SNP	a	c	0.5814	0.0124	0.5447	0.5926	0.0158	0.0115	0.1689	-++-+	43.1	7.025	4	0.1346
3 : 195739419 : SNP	a	g	0.0375	0.0000	0.0375	0.0375	-0.0203	0.0612	0.7401	????-	0.0	0.000	0	1
1 : 74086841 : SNP	t	c	0.8433	0.0247	0.7760	0.8629	-0.0303	0.0118	0.01016	-----	0.0	1.858	4	0.7619
14 : 74938320 : SNP	t	c	0.9657	0.0000	0.9657	0.9657	-0.0880	0.0556	0.1135	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 85614802 : SNP	a	t	0.9000	0.0124	0.8940	0.9367	-0.0259	0.0144	0.072	-+-+-	36.2	6.269	4	0.1799
8 : 73008249 : SNP	t	c	0.0891	0.0100	0.0640	0.0935	-0.0270	0.0157	0.08407	--?--	0.0	2.784	3	0.4262
15 : 86563001 : SNP	t	g	0.7518	0.0122	0.7262	0.7613	0.0182	0.0097	0.06099	+-+++	42.5	6.960	4	0.138
5 : 16843006 : INDEL	i	r	0.0310	0.0000	0.0310	0.0310	-0.1060	0.0344	0.002041	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 46963207 : SNP	t	g	0.4029	0.0206	0.3733	0.4282	0.0058	0.0119	0.6256	+++-+	0.0	0.699	4	0.9514
1 : 197777147 : SNP	t	c	0.4070	0.0083	0.3859	0.4140	0.0028	0.0086	0.7445	++--+	0.0	2.173	4	0.704
6 : 28762999 : SNP	a	g	0.9532	0.0064	0.9432	0.9573	0.0111	0.0484	0.819	???-+	0.0	0.195	1	0.6586
16 : 82932108 : SNP	a	c	0.2620	0.0129	0.2533	0.2899	-0.0043	0.0098	0.6588	-+-+-	0.0	2.168	4	0.705
2 : 104387855 : SNP	a	g	0.5643	0.0176	0.5027	0.5725	0.0001	0.0085	0.9919	++---	0.0	3.336	4	0.5033
3 : 110311451 : SNP	c	g	0.9882	0.0000	0.9882	0.9882	0.1000	0.0607	0.0992	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 71655000 : SNP	a	g	0.9776	0.0044	0.9726	0.9814	-0.0056	0.0328	0.8637	+-???	0.0	0.383	1	0.5362
16 : 27262507 : INDEL	d	r	0.3231	0.0141	0.2924	0.3304	0.0029	0.0100	0.7732	-++-+	0.0	1.515	4	0.8239
16 : 77414514 : SNP	t	c	0.5524	0.0082	0.5429	0.5713	-0.0011	0.0085	0.897	-+-++	30.5	5.757	4	0.218
17 : 1147897 : SNP	a	g	0.6163	0.0086	0.6112	0.6308	0.0404	0.0236	0.08684	???-+	56.0	2.275	1	0.1315
6 : 2536831 : SNP	t	c	0.3317	0.0069	0.3257	0.3415	0.0130	0.0091	0.1535	++--+	0.0	0.963	4	0.9154
4 : 76018205 : SNP	a	t	0.1309	0.0024	0.1290	0.1365	0.0075	0.0125	0.5473	+-+++	8.1	4.352	4	0.3604
19 : 55057838 : SNP	t	c	0.0636	0.0057	0.0560	0.0733	-0.0456	0.0223	0.04081	--?-+	0.0	1.827	3	0.609
14 : 31886677 : SNP	a	g	0.0621	0.0039	0.0571	0.0656	-0.0165	0.0185	0.3704	--?+-	0.0	2.036	3	0.5649
3 : 158081243 : SNP	a	g	0.2895	0.0131	0.2618	0.3012	-0.0042	0.0092	0.6466	+-+--	23.7	5.240	4	0.2636
9 : 95372674 : INDEL	i	r	0.1672	0.0104	0.1569	0.1952	0.0282	0.0117	0.01599	+++++	0.0	0.744	4	0.9458
9 : 31164753 : SNP	a	g	0.4336	0.0248	0.4140	0.4834	-0.0059	0.0089	0.5065	--+--	53.5	8.603	4	0.07183
8 : 52726476 : SNP	a	c	0.0989	0.0074	0.0932	0.1181	0.0333	0.0146	0.02202	+++++	0.0	3.959	4	0.4116
13 : 48008422 : SNP	a	g	0.0586	0.0028	0.0556	0.0680	-0.0127	0.0186	0.4955	--?-+	0.0	0.844	3	0.8389
12 : 867023 : SNP	a	g	0.6721	0.0192	0.6453	0.6963	0.0073	0.0105	0.4835	+---+	0.0	3.841	4	0.4279
19 : 4304855 : SNP	a	g	0.5067	0.0105	0.4978	0.5262	0.0021	0.0092	0.8171	+-++-	0.0	1.533	4	0.8208
20 : 54841008 : SNP	t	c	0.3557	0.0061	0.3387	0.3646	-0.0034	0.0091	0.7054	+---+	8.7	4.381	4	0.3569
13 : 99058842 : INDEL	i	r	0.7233	0.0115	0.7017	0.7627	0.0043	0.0100	0.6649	++++-	0.0	2.996	4	0.5584
16 : 84441989 : SNP	t	c	0.2031	0.0042	0.1975	0.2127	0.0040	0.0110	0.714	-++--	0.4	4.016	4	0.4039
14 : 76901485 : SNP	a	g	0.1379	0.0161	0.1004	0.1537	-0.0025	0.0163	0.8778	-+++-	0.0	3.342	4	0.5022
14 : 90572484 : SNP	t	c	0.6963	0.0105	0.6739	0.7040	-0.0053	0.0092	0.567	-+---	42.1	6.909	4	0.1408
14 : 33492574 : INDEL	d	r	0.0211	0.0000	0.0211	0.0211	-0.0610	0.0607	0.3145	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 53219986 : SNP	t	c	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	-0.0180	0.0526	0.732	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 162703536 : SNP	c	g	0.4746	0.0093	0.4636	0.5034	-0.0176	0.0085	0.03934	--+--	0.0	2.126	4	0.7126
5 : 30886452 : SNP	t	c	0.0177	0.0000	0.0177	0.0177	-0.0020	0.0455	0.9649	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 134695063 : SNP	t	g	0.0223	0.0000	0.0223	0.0223	0.0260	0.0617	0.6733	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 83253432 : SNP	t	c	0.9048	0.0012	0.9038	0.9071	-0.0146	0.0150	0.3316	--?+-	0.0	1.697	3	0.6375
21 : 41814049 : SNP	t	g	0.2757	0.0163	0.2318	0.2899	0.0074	0.0094	0.4322	+-+++	0.0	2.302	4	0.6803
3 : 134789204 : SNP	a	g	0.9443	0.0021	0.9407	0.9462	0.0148	0.0194	0.4439	+-?++	0.0	2.112	3	0.5495
5 : 96572396 : SNP	c	g	0.9213	0.0046	0.9182	0.9282	0.0156	0.0311	0.6164	-???+	0.0	0.716	1	0.3973
10 : 107270764 : SNP	t	c	0.0761	0.0060	0.0559	0.0831	-0.0162	0.0161	0.3168	-+-+-	62.7	10.717	4	0.02993
3 : 156960592 : SNP	t	c	0.0317	0.0020	0.0302	0.0343	-0.0498	0.0295	0.0913	--???	0.0	0.312	1	0.5765
22 : 19320557 : SNP	a	g	0.0342	0.0026	0.0304	0.0381	-0.0079	0.0255	0.7567	+-??+	43.1	3.512	2	0.1727
10 : 20382111 : SNP	a	g	0.0752	0.0049	0.0622	0.0781	0.0088	0.0181	0.6267	+-?+-	0.0	2.531	3	0.4697
15 : 31588134 : SNP	a	c	0.8180	0.0314	0.7974	0.8786	0.0079	0.0152	0.6015	0++-+	0.0	2.433	4	0.6568
5 : 5906110 : SNP	a	g	0.3448	0.0096	0.3210	0.3686	-0.0173	0.0091	0.05736	-----	0.0	0.397	4	0.9827
3 : 145508096 : SNP	t	c	0.4350	0.0062	0.4075	0.4382	-0.0027	0.0086	0.7488	-0-++	0.0	0.850	4	0.9316
12 : 97402652 : SNP	a	t	0.9852	0.0000	0.9852	0.9852	0.0160	0.0526	0.7608	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 105289940 : INDEL	i	r	0.2287	0.0130	0.2008	0.2608	0.0225	0.0105	0.03135	++++-	0.0	3.934	4	0.415
11 : 127279714 : SNP	c	g	0.8235	0.0104	0.7995	0.8364	0.0175	0.0116	0.1317	+++++	0.0	2.825	4	0.5876
7 : 43472729 : SNP	a	g	0.8142	0.0151	0.7839	0.8261	-0.0253	0.0120	0.03498	-----	8.7	4.383	4	0.3567
3 : 102049028 : SNP	c	g	0.2780	0.0048	0.2681	0.2881	0.0017	0.0093	0.8584	+-+--	30.5	5.754	4	0.2183
4 : 174300453 : INDEL	d	r	0.8897	0.0375	0.8495	0.9277	0.0769	0.0274	0.005001	?+?++	0.0	0.638	2	0.7268
3 : 85144149 : SNP	t	c	0.2974	0.0172	0.2544	0.3112	-0.0054	0.0092	0.5622	--+++	0.0	2.232	4	0.6932
2 : 20544725 : SNP	t	c	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	0.0050	0.0495	0.9196	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 236151508 : SNP	t	c	0.2202	0.0069	0.2092	0.2295	-0.0016	0.0105	0.879	-+-+-	0.0	1.117	4	0.8916
6 : 32456190 : SNP	c	g	0.5814	0.0135	0.5653	0.6069	-0.0278	0.0210	0.1856	??---	0.0	1.048	2	0.5921
2 : 64392593 : SNP	c	g	0.4751	0.0087	0.4560	0.4942	0.0001	0.0085	0.986	--+-+	11.0	4.495	4	0.3431
8 : 10222123 : SNP	a	c	0.0367	0.0000	0.0367	0.0367	-0.0490	0.0394	0.2139	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 42029143 : SNP	t	c	0.1199	0.0112	0.1110	0.1489	-0.0048	0.0135	0.723	-+-++	0.0	3.972	4	0.4099
16 : 66464679 : SNP	a	g	0.1498	0.0085	0.1272	0.1561	0.0143	0.0123	0.2468	-++++	0.0	3.018	4	0.5549
2 : 238960572 : SNP	a	g	0.8238	0.0191	0.8090	0.8703	0.0011	0.0114	0.9258	-++-+	15.0	4.704	4	0.3191
8 : 83270263 : INDEL	d	r	0.0783	0.0077	0.0715	0.0963	-0.0054	0.0163	0.7379	--?+-	0.0	0.238	3	0.9713
8 : 29575071 : SNP	a	t	0.7790	0.0041	0.7648	0.7863	-0.0006	0.0101	0.9519	0-+-+	0.0	1.830	4	0.767
1 : 200141072 : SNP	a	g	0.6234	0.0186	0.5909	0.6461	-0.0038	0.0091	0.675	-++--	0.0	3.459	4	0.4842
2 : 159071260 : SNP	t	c	0.2251	0.0129	0.2149	0.2504	0.0087	0.0104	0.4008	++-+-	7.7	4.333	4	0.3628
5 : 162314049 : SNP	a	g	0.0226	0.0000	0.0226	0.0226	0.0440	0.0607	0.4682	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 113334488 : SNP	a	t	0.6534	0.0158	0.6332	0.6905	-0.0118	0.0090	0.1878	0----	36.7	6.314	4	0.1769
4 : 36680963 : SNP	c	g	0.1770	0.0085	0.1684	0.1874	-0.0154	0.0116	0.1863	--+--	0.0	3.656	4	0.4546
13 : 93351790 : SNP	a	t	0.0584	0.0128	0.0509	0.0831	0.0068	0.0188	0.7162	-+?+-	54.6	6.610	3	0.08543
15 : 50492955 : INDEL	i	r	0.0670	0.0110	0.0574	0.0897	-0.0046	0.0180	0.7996	+-?--	0.0	0.907	3	0.8237
7 : 81584902 : SNP	t	c	0.5905	0.0075	0.5827	0.6178	0.0042	0.0085	0.6259	+-+++	29.2	5.649	4	0.227
1 : 21141275 : SNP	t	c	0.1347	0.0103	0.1193	0.1436	-0.0120	0.0152	0.4325	--+-+	0.0	3.213	4	0.5228
8 : 119329257 : SNP	a	g	0.3641	0.0152	0.3286	0.3814	0.0062	0.0087	0.4746	-++--	59.9	9.972	4	0.0409
1 : 6375814 : SNP	a	c	0.7561	0.0119	0.7474	0.7756	0.0037	0.0134	0.7814	++++-	0.0	2.650	4	0.618
11 : 46751401 : SNP	t	c	0.8630	0.0161	0.8456	0.9230	-0.0138	0.0129	0.2833	----+	0.0	1.768	4	0.7783
5 : 25794024 : SNP	t	c	0.3245	0.0136	0.3103	0.3459	0.0160	0.0103	0.1201	+++--	0.0	2.860	4	0.5816
1 : 11796927 : INDEL	d	r	0.1511	0.0052	0.1423	0.1542	-0.0228	0.0395	0.5635	???-+	83.5	6.059	1	0.01383
13 : 86754452 : SNP	t	g	0.0180	0.0000	0.0180	0.0180	-0.0480	0.0576	0.4048	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 72484883 : SNP	a	g	0.8531	0.0145	0.8433	0.8851	0.0032	0.0122	0.7911	+--++	76.6	17.075	4	0.001869
3 : 135405534 : SNP	t	g	0.9196	0.0134	0.8972	0.9312	0.0552	0.0300	0.06611	+??-+	45.7	3.680	2	0.1588
7 : 148013749 : INDEL	d	r	0.0773	0.0036	0.0646	0.0795	0.0073	0.0169	0.6644	++?--	0.0	0.917	3	0.8214
9 : 136470631 : INDEL	d	r	0.0631	0.0043	0.0608	0.0761	0.0205	0.0186	0.2698	++?++	0.0	2.926	3	0.4032
6 : 66254840 : SNP	a	t	0.9144	0.0098	0.8894	0.9230	-0.0135	0.0156	0.3859	----+	0.0	2.440	4	0.6555
22 : 25910191 : SNP	a	g	0.4237	0.0042	0.4107	0.4271	-0.0154	0.0086	0.07265	-----	0.0	0.638	4	0.9587
1 : 11536010 : SNP	a	c	0.2028	0.0154	0.1690	0.2115	-0.0024	0.0108	0.824	+-++-	34.6	6.121	4	0.1903
5 : 63962177 : SNP	a	g	0.6450	0.0081	0.6343	0.6621	0.0027	0.0093	0.7741	-+-++	0.0	2.696	4	0.61
13 : 30268094 : SNP	t	c	0.1544	0.0097	0.1451	0.1758	-0.0053	0.0115	0.6411	--+-+	24.6	5.304	4	0.2575
8 : 57388082 : SNP	t	g	0.7210	0.0058	0.6992	0.7303	0.0156	0.0094	0.09696	++-++	16.1	4.770	4	0.3118
6 : 47723069 : SNP	a	c	0.6181	0.0129	0.5892	0.6326	0.0056	0.0091	0.5389	+-+-+	42.5	6.955	4	0.1383
1 : 40391153 : SNP	a	g	0.3456	0.0055	0.3404	0.3551	-0.0019	0.0092	0.8369	0-+-+	0.0	2.213	4	0.6966
2 : 104382755 : SNP	t	c	0.9895	0.0000	0.9895	0.9895	-0.0100	0.0627	0.8732	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 110473334 : SNP	a	g	0.7319	0.0106	0.6892	0.7454	0.0104	0.0098	0.2859	+-+++	6.5	4.276	4	0.3699
6 : 99877491 : SNP	a	g	0.8133	0.0059	0.8002	0.8314	0.0126	0.0108	0.2424	+++++	0.0	0.573	4	0.966
4 : 67875087 : SNP	t	c	0.0212	0.0000	0.0212	0.0212	0.0470	0.0546	0.3892	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 17984067 : SNP	t	c	0.5362	0.0243	0.5230	0.6111	0.0042	0.0086	0.6282	+--++	28.7	5.613	4	0.23
16 : 74526175 : SNP	t	c	0.9675	0.0030	0.9643	0.9703	-0.0026	0.0288	0.9282	+-???	0.0	0.583	1	0.4451
4 : 128650998 : SNP	a	g	0.9841	0.0000	0.9841	0.9841	0.0220	0.0546	0.6869	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 64951807 : SNP	t	c	0.1272	0.0068	0.1175	0.1331	-0.0198	0.0174	0.2564	0-?--	0.0	2.380	3	0.4974
9 : 2721249 : SNP	a	g	0.5740	0.0141	0.5444	0.5903	-0.0117	0.0086	0.173	+-+--	15.3	4.723	4	0.3169
2 : 218433524 : SNP	t	c	0.8710	0.0019	0.8672	0.8731	0.0210	0.0128	0.1008	++-++	19.3	4.959	4	0.2915
9 : 38586885 : SNP	a	g	0.3377	0.0115	0.3196	0.3560	-0.0102	0.0263	0.697	??-+-	0.0	1.392	2	0.4986
13 : 80656803 : SNP	a	g	0.0857	0.0056	0.0759	0.0954	0.0201	0.0151	0.1854	++++-	0.0	2.563	4	0.6334
8 : 144355788 : INDEL	d	r	0.4451	0.0066	0.4381	0.4589	0.0196	0.0091	0.03133	++++-	0.0	2.137	4	0.7106
2 : 24827303 : SNP	t	c	0.9118	0.0057	0.9052	0.9207	0.0129	0.0154	0.4002	-+?+-	25.8	4.044	3	0.2568
10 : 11905543 : INDEL	i	r	0.1286	0.0208	0.1078	0.1669	-0.0112	0.0131	0.3923	----+	46.9	7.533	4	0.1102
5 : 40106763 : SNP	t	c	0.7320	0.0061	0.7076	0.7444	0.0010	0.0098	0.9221	+--+-	0.0	3.890	4	0.4211
13 : 32611971 : SNP	a	g	0.7568	0.0055	0.7480	0.7771	-0.0045	0.0100	0.6513	-+++-	46.7	7.506	4	0.1114
16 : 85901236 : SNP	a	g	0.9506	0.0000	0.9506	0.9506	-0.0410	0.0495	0.4078	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 77732622 : INDEL	d	r	0.0265	0.0083	0.0208	0.0385	0.0108	0.0350	0.7583	+???-	58.5	2.408	1	0.1207
3 : 36147255 : SNP	a	g	0.6285	0.0061	0.6148	0.6336	-0.0034	0.0087	0.6978	++---	0.0	2.761	4	0.5985
4 : 101143376 : SNP	a	t	0.2499	0.0131	0.2318	0.2798	-0.0033	0.0099	0.7391	+----	0.0	1.890	4	0.756
3 : 176469699 : INDEL	d	r	0.0382	0.0000	0.0382	0.0382	-0.0420	0.0425	0.3225	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 23471096 : SNP	t	g	0.1566	0.0054	0.1519	0.1746	0.0136	0.0118	0.2495	++--+	0.0	3.953	4	0.4123
4 : 111379719 : SNP	a	g	0.1145	0.0033	0.1071	0.1174	-0.0016	0.0131	0.9057	-+-+-	0.0	0.659	4	0.9563
2 : 58936757 : SNP	a	g	0.1501	0.0121	0.1220	0.1566	0.0116	0.0122	0.342	++-++	0.0	1.158	4	0.885
12 : 96208270 : SNP	t	c	0.0568	0.0002	0.0566	0.0571	-0.0232	0.0256	0.3662	--???	0.0	0.060	1	0.8064
2 : 214192212 : SNP	t	c	0.2898	0.0092	0.2839	0.3094	0.0151	0.0093	0.1064	+++++	0.0	2.344	4	0.6728
9 : 76857355 : SNP	t	c	0.1895	0.0123	0.1766	0.2060	0.0079	0.0110	0.4728	--+-+	74.0	15.387	4	0.003962
6 : 137495707 : SNP	t	g	0.3871	0.0258	0.3663	0.4372	0.0259	0.0090	0.004123	+++++	2.8	4.113	4	0.3909
2 : 67724128 : SNP	a	g	0.7075	0.0080	0.6974	0.7219	0.0119	0.0093	0.2037	+++++	0.0	0.468	4	0.9765
4 : 67646969 : SNP	a	g	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	-0.0510	0.0465	0.2727	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 26747288 : SNP	a	t	0.8123	0.0056	0.8035	0.8212	-0.0211	0.0114	0.06441	-----	0.0	0.463	4	0.977
13 : 90271338 : SNP	a	t	0.8456	0.0061	0.8390	0.8568	0.0082	0.0118	0.4877	++-+-	51.3	8.205	4	0.08434
1 : 199845279 : SNP	c	g	0.0765	0.0051	0.0696	0.0857	-0.0058	0.0162	0.7188	-+?+-	0.0	2.690	3	0.442
7 : 15055234 : INDEL	d	r	0.0205	0.0000	0.0205	0.0205	-0.0600	0.0607	0.3225	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 43777108 : SNP	a	g	0.7977	0.0121	0.7530	0.8147	-0.0033	0.0106	0.7573	---++	0.0	1.055	4	0.9014
3 : 14842065 : INDEL	d	r	0.0293	0.0081	0.0240	0.0417	-0.0023	0.0338	0.9449	+???-	0.0	0.177	1	0.674
4 : 33148211 : INDEL	d	r	0.0865	0.0188	0.0686	0.1247	0.0361	0.0178	0.04256	++--+	17.6	4.854	4	0.3026
1 : 92072958 : SNP	a	g	0.7926	0.0032	0.7874	0.8053	0.0140	0.0107	0.1895	-+++-	31.9	5.870	4	0.2091
2 : 121468689 : SNP	a	g	0.8451	0.0170	0.8091	0.8617	-0.0110	0.0119	0.3529	+----	56.4	9.165	4	0.0571
7 : 152957313 : SNP	a	g	0.0415	0.0000	0.0415	0.0415	-0.0960	0.0526	0.0678	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 78732557 : SNP	a	c	0.8673	0.0057	0.8560	0.8738	-0.0089	0.0128	0.4833	+-+-+	0.0	2.152	4	0.7077
14 : 44030684 : SNP	t	g	0.8815	0.0079	0.8562	0.8862	-0.0049	0.0133	0.7127	--++-	0.0	1.799	4	0.7727
1 : 40083819 : SNP	a	c	0.0922	0.0027	0.0904	0.0987	-0.0181	0.0149	0.2247	-+-+-	0.0	3.151	4	0.533
10 : 30222071 : SNP	a	g	0.1293	0.0208	0.1153	0.1746	-0.0294	0.0128	0.02185	-----	0.0	3.449	4	0.4857
2 : 210125239 : SNP	t	c	0.3186	0.0100	0.2747	0.3249	-0.0035	0.0092	0.7042	-+++-	33.3	5.999	4	0.1992
16 : 5404050 : SNP	t	c	0.0242	0.0000	0.0242	0.0242	0.0120	0.0475	0.8006	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 59545000 : SNP	t	g	0.9391	0.0025	0.9373	0.9448	-0.0301	0.0184	0.1021	--?-+	0.0	1.402	3	0.7052
5 : 151758452 : SNP	t	c	0.1810	0.0158	0.1522	0.1961	0.0073	0.0115	0.5244	--+++	12.8	4.589	4	0.3321
11 : 42950761 : SNP	t	g	0.4003	0.0137	0.3619	0.4115	-0.0275	0.0086	0.001325	-----	13.9	4.645	4	0.3257
6 : 141957307 : SNP	a	t	0.2675	0.0055	0.2502	0.2783	-0.0030	0.0094	0.7495	-0---	0.0	0.173	4	0.9965
2 : 88739134 : SNP	c	g	0.7093	0.0124	0.6849	0.7190	0.0010	0.0097	0.9191	+---+	0.0	3.046	4	0.5501
7 : 62616056 : SNP	t	c	0.4006	0.0098	0.3908	0.4136	0.0134	0.0092	0.1451	++--+	10.5	4.472	4	0.3459
2 : 51532564 : SNP	t	c	0.7418	0.0072	0.7322	0.7594	-0.0040	0.0098	0.6796	--+-+	0.0	0.674	4	0.9545
6 : 32601718 : SNP	t	c	0.2691	0.0182	0.2367	0.2974	0.0053	0.0204	0.7934	??++-	0.0	1.906	2	0.3855
9 : 33453638 : SNP	t	c	0.1396	0.0142	0.1047	0.1494	-0.0018	0.0125	0.8834	++---	0.0	3.330	4	0.5042
7 : 88417757 : SNP	t	g	0.7760	0.0261	0.7282	0.8021	-0.0066	0.0104	0.5257	+--+-	58.4	9.604	4	0.04764
12 : 19858160 : SNP	a	t	0.5674	0.0153	0.5298	0.5843	0.0122	0.0085	0.152	++-+-	16.6	4.796	4	0.3088
1 : 174901014 : SNP	t	g	0.0349	0.0107	0.0273	0.0499	0.0111	0.0321	0.7301	+???-	8.5	1.093	1	0.2958
15 : 80467964 : SNP	a	g	0.9192	0.0058	0.9134	0.9325	0.0058	0.0158	0.7145	+-?-+	0.0	2.724	3	0.4361
5 : 97168284 : SNP	t	c	0.1588	0.0038	0.1530	0.1741	-0.0158	0.0115	0.1702	-----	0.0	0.283	4	0.9909
13 : 80147402 : SNP	a	g	0.9752	0.0000	0.9752	0.9752	-0.0130	0.0404	0.7478	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 23551341 : SNP	a	g	0.4651	0.0111	0.4500	0.4843	0.0083	0.0085	0.3311	-++-+	41.4	6.831	4	0.1451
1 : 89803882 : SNP	a	g	0.4773	0.0126	0.4608	0.5095	-0.0069	0.0085	0.4227	--+--	0.0	2.411	4	0.6607
11 : 37149137 : SNP	a	g	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	-0.0480	0.0465	0.3019	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 30059805 : SNP	a	g	0.4023	0.0223	0.3872	0.4451	0.0133	0.0085	0.118	+++--	0.0	2.128	4	0.7123
3 : 135060057 : SNP	t	c	0.7087	0.0306	0.6930	0.7934	-0.0191	0.0093	0.04135	-+-+-	36.8	6.328	4	0.176
7 : 17098777 : SNP	a	t	0.5694	0.0175	0.5541	0.6143	0.0014	0.0086	0.8733	+++-+	39.7	6.636	4	0.1564
8 : 144729639 : SNP	a	c	0.1352	0.0168	0.1219	0.1745	0.0188	0.0125	0.1333	+++-+	0.0	1.547	4	0.8183
12 : 60708231 : INDEL	i	r	0.4632	0.0104	0.4563	0.4876	0.0099	0.0085	0.2468	+++--	41.1	6.796	4	0.147
3 : 177188228 : SNP	t	c	0.2329	0.0142	0.2232	0.2650	-0.0027	0.0103	0.7932	--+-+	0.0	0.570	4	0.9664
20 : 24430287 : SNP	t	c	0.0327	0.0010	0.0318	0.0339	-0.0048	0.0288	0.8675	+-???	35.7	1.555	1	0.2124
14 : 74498836 : SNP	a	t	0.0525	0.0041	0.0474	0.0557	-0.0209	0.0254	0.4114	--???	0.0	0.094	1	0.7594
19 : 55697795 : SNP	c	g	0.0963	0.0040	0.0916	0.1061	-0.0058	0.0165	0.7267	+-?--	3.3	3.103	3	0.376
17 : 33759685 : SNP	t	g	0.5064	0.0249	0.4836	0.5642	0.0046	0.0091	0.618	+-++-	0.0	2.673	4	0.614
18 : 52422269 : SNP	a	t	0.9497	0.0024	0.9477	0.9528	-0.0020	0.0206	0.9224	-+??+	24.9	2.662	2	0.2642
2 : 101589067 : SNP	a	g	0.6268	0.0184	0.5553	0.6327	0.0215	0.0098	0.02837	++++?	0.0	1.765	3	0.6226
1 : 28732220 : SNP	a	g	0.2802	0.0088	0.2678	0.2948	-0.0131	0.0093	0.1611	---+-	0.0	2.997	4	0.5583
10 : 59841220 : SNP	a	g	0.8603	0.0080	0.8362	0.8671	0.0307	0.0122	0.01194	+++++	0.0	3.120	4	0.5379
5 : 155748904 : SNP	a	c	0.7140	0.0101	0.6938	0.7202	-0.0342	0.0097	0.0004012	-----	0.0	3.545	4	0.4711
14 : 37409395 : SNP	a	t	0.0433	0.0101	0.0357	0.0615	0.0023	0.0226	0.9188	++??-	0.0	0.661	2	0.7185
8 : 11784861 : SNP	t	c	0.5942	0.0298	0.5530	0.6189	0.0036	0.0115	0.7554	+++--	6.8	4.293	4	0.3679
13 : 90618955 : SNP	t	g	0.4515	0.0058	0.4461	0.4587	-0.0067	0.0085	0.4339	-++--	16.3	4.781	4	0.3105
9 : 28299438 : SNP	t	c	0.6944	0.0148	0.6844	0.7358	-0.0054	0.0092	0.5546	+--+-	57.6	9.430	4	0.05121
5 : 123008702 : SNP	a	t	0.2103	0.0246	0.1949	0.2622	-0.0048	0.0105	0.6444	-+++-	0.0	0.381	4	0.984
2 : 202738225 : SNP	a	g	0.0116	0.0000	0.0116	0.0116	-0.0950	0.0586	0.1052	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 196250988 : SNP	a	g	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	0.0030	0.0495	0.9517	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 242609554 : SNP	t	c	0.2111	0.0095	0.1948	0.2189	0.0206	0.0281	0.4643	??++-	0.0	0.921	2	0.6309
12 : 6294210 : SNP	t	c	0.5203	0.0404	0.4823	0.6062	-0.0098	0.0086	0.2512	-0---	0.0	0.921	4	0.9215
14 : 99287705 : SNP	a	g	0.1114	0.0065	0.0965	0.1163	-0.0044	0.0138	0.7513	----+	0.0	1.421	4	0.8406
8 : 99089275 : SNP	c	g	0.0936	0.0082	0.0857	0.1127	0.0172	0.0157	0.2736	++++-	16.2	4.775	4	0.3111
14 : 93825169 : SNP	t	g	0.5812	0.0161	0.5677	0.6134	-0.0135	0.0086	0.1159	---+-	0.6	4.023	4	0.403
19 : 45314975 : SNP	c	g	0.9849	0.0000	0.9849	0.9849	-0.0150	0.0607	0.8047	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 57132238 : SNP	a	c	0.0792	0.0045	0.0749	0.0906	-0.0038	0.0175	0.827	+-?+-	0.8	3.025	3	0.3878
6 : 87179323 : INDEL	i	r	0.3875	0.0084	0.3679	0.3972	0.0002	0.0089	0.9826	-+--+	1.6	4.065	4	0.3973
14 : 78987930 : SNP	a	g	0.5722	0.0370	0.5429	0.6644	-0.0007	0.0086	0.9351	-+--+	0.0	2.685	4	0.6118
4 : 114848776 : SNP	t	c	0.0777	0.0080	0.0564	0.0811	-0.0178	0.0169	0.2911	--?-+	0.0	2.111	3	0.5497
17 : 70159837 : SNP	t	c	0.9865	0.0000	0.9865	0.9865	0.0310	0.0607	0.6093	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 55958364 : SNP	t	c	0.8527	0.0057	0.8372	0.8594	0.0011	0.0120	0.9295	+-+--	0.0	3.032	4	0.5525
14 : 24147787 : SNP	a	g	0.4111	0.0026	0.4040	0.4172	-0.0030	0.0086	0.7237	--+-+	0.0	3.735	4	0.443
5 : 118000350 : SNP	t	c	0.2032	0.0044	0.1963	0.2155	0.0026	0.0107	0.8055	+++-+	0.0	2.927	4	0.5701
6 : 161565967 : SNP	t	c	0.0662	0.0048	0.0533	0.0691	0.0089	0.0183	0.6288	++??-	24.8	2.659	2	0.2646
13 : 40783527 : SNP	a	c	0.6798	0.0212	0.6476	0.7270	-0.0086	0.0093	0.3561	--++-	48.2	7.728	4	0.1021
17 : 66912101 : SNP	a	c	0.3897	0.0072	0.3691	0.3940	-0.0145	0.0093	0.1189	--+-+	41.4	6.822	4	0.1456
2 : 236111449 : SNP	t	c	0.9780	0.0000	0.9780	0.9780	-0.0390	0.0414	0.3467	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 120126906 : SNP	a	g	0.9781	0.0000	0.9781	0.9781	-0.0110	0.0425	0.7956	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 75957906 : SNP	t	c	0.0246	0.0000	0.0246	0.0246	0.0310	0.0414	0.4545	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 16899577 : SNP	t	g	0.6210	0.0032	0.6149	0.6341	-0.0141	0.0088	0.107	----+	2.6	4.105	4	0.392
15 : 68314919 : SNP	t	c	0.4906	0.0082	0.4644	0.4954	-0.0014	0.0085	0.8681	-+--+	24.6	5.306	4	0.2573
11 : 109015188 : INDEL	d	r	0.2409	0.0222	0.2267	0.3135	-0.0019	0.0111	0.8635	+-+++	0.0	0.876	4	0.928
15 : 32365883 : SNP	t	g	0.0406	0.0042	0.0387	0.0507	0.0155	0.0233	0.5054	++??-	0.0	0.721	2	0.6973
10 : 101062818 : SNP	a	g	0.6515	0.0058	0.6431	0.6578	0.0194	0.0091	0.03264	++++-	0.0	1.592	4	0.8103
11 : 8504174 : SNP	c	g	0.6057	0.0230	0.5565	0.6267	-0.0025	0.0085	0.7708	--+-+	0.0	3.723	4	0.4447
2 : 175579463 : INDEL	i	r	0.1459	0.0096	0.1385	0.1768	-0.0044	0.0132	0.7369	-+--+	0.0	1.533	4	0.8208
17 : 80146185 : SNP	t	c	0.9730	0.0000	0.9730	0.9730	-0.0210	0.0435	0.629	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 93325278 : SNP	t	c	0.2787	0.0128	0.2507	0.2910	-0.0098	0.0098	0.3164	--+--	0.0	0.308	4	0.9893
10 : 26647146 : SNP	t	c	0.2866	0.0123	0.2656	0.3039	-0.0043	0.0095	0.6505	-+-+-	53.0	8.508	4	0.07463
11 : 59135700 : SNP	c	g	0.6929	0.0134	0.6841	0.7221	-0.0134	0.0092	0.1448	-+-+-	34.3	6.091	4	0.1925
2 : 124244200 : SNP	t	g	0.6489	0.0080	0.6410	0.6669	-0.0084	0.0089	0.3492	-+++-	0.0	2.001	4	0.7355
9 : 120540304 : SNP	a	g	0.2121	0.0093	0.1905	0.2294	-0.0043	0.0107	0.6853	+--++	0.0	1.014	4	0.9077
1 : 70430436 : SNP	a	g	0.9452	0.0040	0.9367	0.9482	-0.0047	0.0193	0.809	+-?--	0.0	0.349	3	0.9507
2 : 235268632 : SNP	a	g	0.5566	0.0105	0.5410	0.5668	0.0073	0.0086	0.398	++--+	0.0	1.084	4	0.8967
20 : 61815873 : SNP	a	c	0.3627	0.0056	0.3536	0.3725	0.0118	0.0091	0.1944	++++-	0.0	3.022	4	0.5542
7 : 24283553 : SNP	a	g	0.2094	0.0076	0.1943	0.2257	-0.0034	0.0107	0.7531	-+++-	0.0	1.804	4	0.7717
12 : 94715066 : SNP	a	t	0.8770	0.0059	0.8739	0.8988	0.0031	0.0129	0.808	+-++-	0.0	2.401	4	0.6625
12 : 7532968 : SNP	t	c	0.9532	0.0000	0.9532	0.9532	-0.0270	0.0465	0.5615	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 49291429 : SNP	t	c	0.0272	0.0000	0.0272	0.0272	-0.0070	0.0384	0.8554	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 16947295 : SNP	a	g	0.7653	0.0070	0.7426	0.7692	-0.0053	0.0100	0.5973	--++-	0.0	0.873	4	0.9283
5 : 101065048 : SNP	a	g	0.0278	0.0000	0.0278	0.0278	0.0000	0.0384	1	0????	0.0	0.000	0	1
15 : 60644377 : SNP	a	t	0.6530	0.0119	0.6364	0.6928	0.0043	0.0091	0.6349	0+-+-	0.0	2.172	4	0.7041
10 : 86562296 : SNP	a	g	0.4926	0.0292	0.4465	0.5639	-0.0024	0.0085	0.7808	-+--+	0.0	2.797	4	0.5924
22 : 19720478 : SNP	a	g	0.6701	0.0248	0.6511	0.7209	-0.0081	0.0112	0.4683	+-++-	66.6	11.965	4	0.01761
3 : 46284496 : SNP	a	g	0.6868	0.0071	0.6703	0.7054	-0.0011	0.0092	0.9025	+---+	24.1	5.272	4	0.2606
8 : 85235169 : SNP	c	g	0.0271	0.0022	0.0253	0.0297	0.0097	0.0317	0.7601	+-???	0.0	0.097	1	0.7554
6 : 134828161 : SNP	t	c	0.5686	0.0262	0.5482	0.6446	0.0056	0.0087	0.519	+--++	0.0	2.155	4	0.7072
2 : 140395351 : SNP	t	c	0.9689	0.0033	0.9620	0.9709	-0.0168	0.0254	0.5095	--??-	0.0	0.174	2	0.9168
13 : 68366517 : SNP	t	g	0.0661	0.0122	0.0592	0.0902	0.0057	0.0177	0.746	-+?++	0.0	2.553	3	0.4657
1 : 214476254 : SNP	a	c	0.0723	0.0030	0.0655	0.0738	0.0039	0.0167	0.8128	++?+-	0.0	0.455	3	0.9287
4 : 84125785 : SNP	a	c	0.0856	0.0061	0.0787	0.1045	-0.0233	0.0196	0.2329	-?+++	44.7	5.427	3	0.1431
4 : 98072704 : SNP	t	c	0.0833	0.0022	0.0807	0.0870	0.0224	0.0154	0.1455	+-+++	0.0	2.877	4	0.5786
8 : 18338743 : SNP	t	c	0.8012	0.0085	0.7928	0.8257	-0.0081	0.0106	0.4469	+-+--	0.0	3.455	4	0.4848
7 : 6972763 : SNP	t	g	0.4853	0.0095	0.4685	0.4971	-0.0020	0.0274	0.9412	??--+	0.0	0.583	2	0.7472
6 : 105796077 : INDEL	i	r	0.0571	0.0043	0.0519	0.0632	-0.0181	0.0200	0.3654	--?++	21.4	3.815	3	0.2822
13 : 20892214 : SNP	t	c	0.2487	0.0180	0.2332	0.2811	0.0171	0.0098	0.07943	+++-+	0.7	4.028	4	0.4022
14 : 48262936 : SNP	c	g	0.3023	0.0153	0.2543	0.3195	-0.0006	0.0092	0.9464	-0-++	0.0	3.782	4	0.4363
6 : 28241332 : SNP	a	c	0.0608	0.0137	0.0421	0.0794	-0.0208	0.0213	0.3275	-+?--	36.2	4.700	3	0.1951
16 : 13599794 : SNP	a	g	0.0898	0.0075	0.0850	0.1048	-0.0046	0.0152	0.7618	-+-+-	0.0	2.273	4	0.6857
2 : 80811931 : SNP	t	c	0.9639	0.0002	0.9638	0.9641	0.0187	0.0268	0.4852	++???	0.0	0.001	1	0.9715
17 : 12585990 : SNP	a	g	0.9505	0.0030	0.9424	0.9546	-0.0043	0.0204	0.8345	-+?+-	0.0	0.296	3	0.9608
18 : 37246340 : SNP	t	c	0.1004	0.0163	0.0763	0.1299	0.0140	0.0151	0.3538	+-+++	0.0	1.343	4	0.854
12 : 130112393 : SNP	a	g	0.2688	0.0124	0.2192	0.2769	-0.0111	0.0098	0.2597	++---	64.1	11.149	4	0.02494
5 : 10898153 : SNP	t	c	0.4832	0.0062	0.4700	0.4901	0.0048	0.0085	0.5718	++-+-	24.6	5.307	4	0.2573
19 : 29694949 : SNP	t	c	0.0873	0.0123	0.0807	0.1121	-0.0209	0.0158	0.1862	--?++	0.0	1.692	3	0.6386
2 : 201010225 : SNP	t	c	0.9852	0.0000	0.9852	0.9852	0.0300	0.0576	0.6026	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 105428095 : SNP	a	t	0.7403	0.0232	0.6853	0.7595	0.0020	0.0098	0.8366	-+--+	0.0	3.248	4	0.5172
15 : 64877245 : SNP	t	c	0.0146	0.0000	0.0146	0.0146	0.0070	0.0536	0.896	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 67710998 : SNP	t	g	0.5332	0.0074	0.5211	0.5578	0.0092	0.0085	0.2776	+-++-	37.7	6.423	4	0.1697
10 : 28034791 : SNP	t	g	0.0319	0.0027	0.0296	0.0352	0.0023	0.0309	0.9402	-+???	0.0	0.609	1	0.4352
6 : 31941629 : SNP	t	c	0.0247	0.0077	0.0174	0.0329	-0.0473	0.0352	0.179	--???	0.0	0.484	1	0.4866
10 : 21949913 : SNP	a	t	0.1547	0.0086	0.1247	0.1697	-0.0080	0.0119	0.5026	-++--	0.0	1.423	4	0.8402
14 : 32419032 : INDEL	i	r	0.7684	0.0071	0.7591	0.7840	-0.0086	0.0101	0.3942	-+--+	66.8	12.048	4	0.017
6 : 126923877 : SNP	a	c	0.4977	0.0053	0.4766	0.4998	-0.0060	0.0092	0.5137	----?	0.0	0.468	3	0.9259
8 : 142209142 : SNP	a	g	0.5476	0.0175	0.5107	0.5647	0.0069	0.0092	0.4538	-+++-	0.0	3.344	4	0.502
4 : 9397976 : SNP	a	g	0.1869	0.0077	0.1657	0.2032	-0.0185	0.0121	0.1244	--+++	0.0	2.187	4	0.7014
10 : 63944188 : SNP	a	g	0.7289	0.0097	0.7226	0.7521	0.0033	0.0098	0.7398	+-+++	0.0	0.703	4	0.951
22 : 19874756 : SNP	t	c	0.0634	0.0032	0.0603	0.0682	0.0404	0.0190	0.03366	++?++	0.0	2.336	3	0.5056
2 : 109018514 : SNP	a	g	0.9109	0.0051	0.9000	0.9171	0.0033	0.0150	0.824	-++++	47.0	7.542	4	0.1099
8 : 104599690 : INDEL	d	r	0.0885	0.0055	0.0815	0.0929	-0.0260	0.0198	0.189	--?--	0.0	1.242	3	0.7429
21 : 17992375 : SNP	t	c	0.9114	0.0000	0.9114	0.9114	-0.0013	0.0522	0.9801	????-	0.0	0.000	0	1
7 : 12826272 : SNP	t	c	0.7433	0.0126	0.7212	0.7725	-0.0048	0.0099	0.626	-0+--	0.0	0.977	4	0.9133
4 : 146216161 : SNP	c	g	0.6282	0.0095	0.6189	0.6408	-0.0120	0.0124	0.3352	-----	0.0	0.606	4	0.9624
14 : 77371029 : SNP	t	c	0.8425	0.0123	0.8189	0.8530	0.0123	0.0119	0.3017	+---+	4.2	4.176	4	0.3827
5 : 140141779 : SNP	t	g	0.4681	0.0076	0.4611	0.4861	-0.0044	0.0085	0.6027	+---+	0.0	2.009	4	0.7342
1 : 10275222 : INDEL	d	r	0.1751	0.0247	0.1322	0.2015	-0.0105	0.0164	0.5218	--+-+	0.0	3.815	4	0.4317
19 : 58092035 : INDEL	d	r	0.0889	0.0075	0.0783	0.1005	0.0013	0.0154	0.9329	-+?++	21.5	3.824	3	0.2811
2 : 154684070 : SNP	t	c	0.0670	0.0044	0.0564	0.0699	-0.0183	0.0177	0.3008	-+?--	25.6	4.030	3	0.2583
5 : 64068712 : SNP	t	c	0.4951	0.0261	0.4375	0.5105	-0.0041	0.0086	0.6301	--+-+	4.4	4.182	4	0.3819
6 : 65363527 : SNP	a	g	0.1395	0.0037	0.1250	0.1416	0.0095	0.0122	0.438	-++-+	0.0	1.811	4	0.7705
4 : 121506369 : SNP	a	g	0.6274	0.0129	0.6015	0.6419	0.0136	0.0090	0.1312	+---+	40.8	6.752	4	0.1496
3 : 115337101 : SNP	a	g	0.9805	0.0000	0.9805	0.9805	-0.0260	0.0576	0.6518	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 54010777 : SNP	c	g	0.6124	0.0146	0.5977	0.6442	-0.0062	0.0089	0.4889	-+---	0.0	2.331	4	0.6751
3 : 139234184 : SNP	a	g	0.7523	0.0080	0.7439	0.7853	0.0004	0.0100	0.9721	--+++	0.0	1.958	4	0.7435
1 : 153848208 : SNP	t	c	0.3000	0.0070	0.2882	0.3065	-0.0082	0.0092	0.3746	--+-+	0.0	2.037	4	0.7289
1 : 173116667 : SNP	c	g	0.9325	0.0132	0.9041	0.9435	-0.0232	0.0192	0.227	--?-+	0.0	1.512	3	0.6796
5 : 178653102 : SNP	a	c	0.5928	0.0135	0.5734	0.6199	-0.0007	0.0096	0.939	-+--+	3.0	4.122	4	0.3898
4 : 188933194 : SNP	c	g	0.5354	0.0183	0.5192	0.5825	-0.0077	0.0085	0.3688	---+-	0.0	1.531	4	0.8211
1 : 247615669 : SNP	a	g	0.1741	0.0086	0.1680	0.1921	0.0027	0.0121	0.8213	+-+++	0.0	0.517	4	0.9718
12 : 7767536 : SNP	a	g	0.0260	0.0000	0.0260	0.0260	-0.0250	0.0546	0.647	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 102946088 : SNP	t	g	0.0799	0.0070	0.0689	0.0861	-0.0205	0.0158	0.1927	--?+-	0.0	1.824	3	0.6098
3 : 142150737 : SNP	a	g	0.8871	0.0160	0.8689	0.9115	-0.0153	0.0197	0.4372	--?-+	0.0	1.492	3	0.6842
2 : 23145998 : SNP	c	g	0.1720	0.0125	0.1584	0.1887	-0.0017	0.0116	0.8836	-++--	0.0	1.788	4	0.7748
21 : 21564537 : SNP	a	t	0.2163	0.0128	0.2085	0.2500	-0.0019	0.0105	0.8595	--+-+	0.0	1.950	4	0.745
6 : 119260855 : SNP	t	c	0.6003	0.0071	0.5897	0.6196	-0.0080	0.0087	0.3572	--++-	0.0	1.970	4	0.7413
17 : 45662340 : SNP	t	c	0.0577	0.0051	0.0520	0.0667	-0.0045	0.0199	0.8203	-+?--	0.0	0.625	3	0.8906
20 : 13732631 : SNP	t	g	0.3322	0.0138	0.2836	0.3503	0.0092	0.0092	0.3145	+++++	0.0	0.392	4	0.9831
10 : 4466614 : SNP	t	c	0.9101	0.0105	0.8849	0.9187	-0.0030	0.0153	0.8461	+-+--	0.0	2.287	4	0.6831
12 : 62389287 : SNP	a	g	0.1034	0.0068	0.0947	0.1168	0.0077	0.0141	0.5853	-+--+	0.0	2.135	4	0.711
18 : 9091069 : SNP	t	c	0.9873	0.0000	0.9873	0.9873	-0.0730	0.0536	0.173	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 33175253 : SNP	a	g	0.9092	0.0118	0.8821	0.9262	0.0157	0.0179	0.3822	+++-+	0.0	1.684	4	0.7936
5 : 179028296 : SNP	a	g	0.3048	0.0130	0.2960	0.3409	-0.0128	0.0097	0.186	+----	13.4	4.621	4	0.3285
10 : 116179592 : SNP	a	g	0.4070	0.0061	0.3841	0.4240	-0.0014	0.0086	0.8696	--+++	0.0	2.065	4	0.7238
11 : 11466465 : SNP	a	t	0.1797	0.0070	0.1554	0.1852	-0.0080	0.0114	0.4846	---++	0.0	2.220	4	0.6955
12 : 38694655 : INDEL	i	r	0.5064	0.0279	0.4357	0.5274	0.0039	0.0086	0.653	-++++	57.6	9.437	4	0.05107
2 : 191181527 : SNP	t	c	0.3943	0.0144	0.3660	0.4133	0.0081	0.0085	0.3403	+++-+	0.0	2.121	4	0.7136
7 : 142228129 : INDEL	i	r	0.1421	0.0042	0.1319	0.1573	0.0037	0.0125	0.7686	-+-++	0.0	1.128	4	0.8898
1 : 103003442 : SNP	c	g	0.9098	0.0074	0.9031	0.9207	-0.0100	0.0150	0.5063	--+-+	0.0	2.643	4	0.6192
22 : 46625340 : SNP	t	c	0.0102	0.0000	0.0102	0.0102	-0.0400	0.0607	0.5096	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 197129767 : SNP	t	c	0.8917	0.0099	0.8686	0.9069	-0.0257	0.0141	0.06887	--++-	5.1	4.217	4	0.3775
7 : 81602966 : SNP	c	g	0.8533	0.0094	0.8399	0.8671	0.0037	0.0121	0.7621	++++-	9.1	4.399	4	0.3546
7 : 16370043 : SNP	c	g	0.8778	0.0110	0.8676	0.9051	-0.0099	0.0130	0.448	+-+--	0.0	3.533	4	0.4728
1 : 198674564 : INDEL	i	r	0.0800	0.0047	0.0641	0.0839	0.0135	0.0168	0.4243	++?+-	0.0	0.427	3	0.9347
3 : 106785422 : SNP	a	c	0.9199	0.0075	0.9075	0.9411	-0.0242	0.0161	0.1322	+----	57.1	9.320	4	0.05358
8 : 71812353 : INDEL	d	r	0.0936	0.0067	0.0873	0.1123	0.0071	0.0146	0.6244	+-+-+	0.0	3.512	4	0.4761
16 : 7732152 : SNP	c	g	0.9743	0.0000	0.9743	0.9743	-0.0080	0.0516	0.8767	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 46358425 : SNP	a	g	0.6551	0.0095	0.6327	0.6663	0.0080	0.0091	0.3797	-++-+	0.0	1.296	4	0.8621
16 : 25422397 : SNP	a	g	0.4623	0.0077	0.4516	0.4700	0.0049	0.0085	0.5689	+-+-+	0.0	2.642	4	0.6194
1 : 46825774 : SNP	a	g	0.2390	0.0179	0.2143	0.2638	0.0062	0.0117	0.596	+-+++	0.0	1.457	4	0.8343
1 : 180881148 : SNP	t	c	0.4197	0.0091	0.4112	0.4340	0.0102	0.0087	0.2408	++---	0.0	2.227	4	0.694
5 : 22722716 : SNP	a	c	0.5120	0.0120	0.4725	0.5428	0.0009	0.0085	0.9164	0-+-+	0.0	2.526	4	0.6399
15 : 87109429 : SNP	a	c	0.5520	0.0251	0.4878	0.5844	-0.0008	0.0085	0.9237	--+++	48.7	7.792	4	0.09948
13 : 19709744 : SNP	a	g	0.0915	0.0187	0.0786	0.1247	-0.0007	0.0152	0.9616	+-?++	0.0	2.381	3	0.4971
16 : 11789472 : SNP	t	c	0.0322	0.0186	0.0116	0.0490	0.0143	0.0413	0.7289	+???+	0.0	0.085	1	0.7709
17 : 64382575 : SNP	t	g	0.6540	0.0159	0.6333	0.6876	0.0106	0.0092	0.248	-++++	32.7	5.941	4	0.2036
1 : 201912417 : SNP	t	c	0.0918	0.0122	0.0836	0.1286	0.0008	0.0156	0.9609	-+?--	23.2	3.906	3	0.2718
22 : 25627503 : SNP	a	g	0.0582	0.0000	0.0582	0.0582	0.0230	0.0384	0.5493	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 27763726 : SNP	a	c	0.8923	0.0139	0.8468	0.9005	-0.0109	0.0139	0.4336	+----	0.0	1.433	4	0.8384
3 : 78768020 : SNP	c	g	0.4781	0.0063	0.4744	0.4951	0.0011	0.0086	0.898	--+-+	7.5	4.322	4	0.3641
8 : 54317205 : SNP	t	c	0.5233	0.0056	0.5190	0.5490	0.0047	0.0085	0.5813	+-++-	8.3	4.363	4	0.3592
19 : 22621434 : SNP	a	g	0.2772	0.0064	0.2684	0.2918	0.0029	0.0098	0.7698	-++-+	48.1	7.701	4	0.1032
13 : 99533649 : SNP	a	g	0.1241	0.0114	0.1155	0.1458	0.0251	0.0131	0.05555	+++-+	0.0	1.815	4	0.7697
15 : 102099979 : SNP	t	c	0.4327	0.0199	0.3723	0.4470	0.0057	0.0097	0.5578	+---+	46.4	7.459	4	0.1135
10 : 70223581 : SNP	t	c	0.0866	0.0025	0.0824	0.0927	-0.0001	0.0153	0.9965	-+-++	56.8	9.262	4	0.05486
16 : 81306264 : SNP	a	c	0.2626	0.0255	0.2438	0.3105	0.0120	0.0104	0.2482	++--+	3.9	4.162	4	0.3845
18 : 74837656 : SNP	a	g	0.4518	0.0093	0.4382	0.4618	0.0147	0.0087	0.08928	+-+-+	42.0	6.891	4	0.1418
6 : 30869714 : SNP	t	c	0.1939	0.0176	0.1761	0.2113	0.0198	0.0373	0.5961	??++?	0.0	0.120	1	0.7294
3 : 18550149 : SNP	t	c	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	-0.0340	0.0546	0.5334	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 47974281 : SNP	t	c	0.2884	0.0057	0.2829	0.2987	0.0066	0.0112	0.5558	+---+	0.0	3.528	4	0.4737
3 : 137430950 : INDEL	d	r	0.1247	0.0049	0.1144	0.1341	-0.0072	0.0132	0.5845	--++-	69.5	13.126	4	0.01067
7 : 135957000 : SNP	t	c	0.0921	0.0087	0.0793	0.1057	0.0067	0.0146	0.6435	-+++-	26.3	5.425	4	0.2464
14 : 64977739 : SNP	a	c	0.6568	0.0070	0.6464	0.6681	0.0117	0.0089	0.1921	+++--	0.0	1.949	4	0.7451
8 : 70881268 : SNP	a	g	0.2618	0.0145	0.2392	0.2814	-0.0021	0.0099	0.835	----+	66.0	11.775	4	0.0191
16 : 8947197 : INDEL	i	r	0.3979	0.0107	0.3876	0.4313	-0.0036	0.0086	0.6777	--++-	0.0	2.824	4	0.5877
7 : 52481483 : SNP	a	g	0.5971	0.0111	0.5870	0.6133	-0.0257	0.0086	0.00277	---+-	0.0	3.781	4	0.4364
4 : 56061996 : SNP	t	g	0.9890	0.0000	0.9890	0.9890	0.0360	0.0596	0.5461	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 11916654 : SNP	t	c	0.4994	0.0104	0.4817	0.5071	0.0356	0.0262	0.1745	??-++	31.0	2.900	2	0.2345
2 : 79284545 : SNP	a	g	0.1357	0.0153	0.1262	0.1822	0.0081	0.0133	0.5404	+-+++	0.0	1.266	4	0.8671
4 : 18303044 : SNP	a	g	0.9808	0.0000	0.9808	0.9808	0.0260	0.0455	0.5676	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 7950816 : SNP	c	g	0.8387	0.0072	0.8222	0.8496	-0.0014	0.0114	0.8997	-++--	40.1	6.675	4	0.1541
12 : 39379938 : INDEL	d	r	0.3492	0.0190	0.2979	0.3655	0.0055	0.0092	0.547	-++++	0.0	2.481	4	0.6481
9 : 9650858 : SNP	a	g	0.9840	0.0000	0.9840	0.9840	-0.0940	0.0546	0.08506	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 89125917 : SNP	a	g	0.4128	0.0195	0.3862	0.4560	-0.0020	0.0086	0.818	-+--+	50.7	8.121	4	0.08725
16 : 76248410 : SNP	a	g	0.6954	0.0103	0.6644	0.7080	0.0083	0.0092	0.3624	+++++	0.0	2.238	4	0.6921
15 : 24371962 : SNP	a	c	0.5627	0.0191	0.5489	0.6451	0.0050	0.0090	0.584	-++++	0.0	3.900	4	0.4198
3 : 76920477 : SNP	a	g	0.5332	0.0102	0.4974	0.5422	0.0110	0.0118	0.3491	+0-++	0.0	2.277	4	0.6849
3 : 45418301 : SNP	c	g	0.3004	0.0083	0.2784	0.3312	0.0159	0.0092	0.08472	+++-+	0.0	2.814	4	0.5895
1 : 30407178 : SNP	a	t	0.8302	0.0115	0.8166	0.8595	-0.0030	0.0126	0.8111	-+++-	0.0	1.688	4	0.7929
5 : 5168806 : INDEL	i	r	0.8544	0.0152	0.8216	0.8739	-0.0078	0.0155	0.6135	-+--0	56.3	9.160	4	0.05723
10 : 61290795 : SNP	a	g	0.9698	0.0083	0.9608	0.9775	0.0039	0.0341	0.9094	-+???	0.0	0.062	1	0.8035
19 : 21833294 : SNP	t	c	0.2325	0.0083	0.2189	0.2529	0.0077	0.0142	0.5867	?+--+	0.0	0.071	3	0.9951
10 : 44844079 : SNP	t	c	0.5826	0.0082	0.5753	0.5936	0.0082	0.0085	0.336	++---	0.0	3.395	4	0.494
3 : 21335782 : SNP	a	g	0.9398	0.0047	0.9302	0.9444	0.0134	0.0187	0.4739	++?-+	0.0	1.499	3	0.6824
9 : 132900791 : SNP	t	c	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	-0.0200	0.0475	0.6738	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 21023559 : SNP	c	g	0.8624	0.0074	0.8413	0.8776	-0.0281	0.0124	0.02318	----+	27.3	5.499	4	0.2398
17 : 2430330 : SNP	t	c	0.0587	0.0122	0.0472	0.0782	0.0057	0.0204	0.7805	+-?++	0.0	1.660	3	0.6459
2 : 176284813 : SNP	t	c	0.1245	0.0047	0.1143	0.1340	-0.0011	0.0131	0.9335	---++	37.8	6.434	4	0.169
4 : 124414039 : SNP	a	g	0.7642	0.0102	0.7499	0.7864	-0.0075	0.0100	0.4573	--+--	0.0	3.967	4	0.4104
19 : 19224343 : SNP	t	c	0.1769	0.0093	0.1553	0.1832	-0.0092	0.0115	0.422	+--+-	48.8	7.812	4	0.0987
12 : 2684413 : SNP	t	c	0.0916	0.0154	0.0783	0.1326	-0.0022	0.0160	0.8898	+-?--	0.0	0.281	3	0.9636
14 : 39555961 : SNP	a	c	0.0804	0.0073	0.0644	0.0901	0.0141	0.0162	0.3833	+-?++	36.4	4.719	3	0.1936
5 : 86905677 : SNP	t	g	0.9349	0.0103	0.9253	0.9615	0.0256	0.0181	0.1586	++??+	0.0	0.603	2	0.7397
16 : 73112455 : SNP	t	c	0.0265	0.0000	0.0265	0.0265	0.0530	0.0576	0.3577	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 6427553 : INDEL	i	r	0.1406	0.0064	0.1294	0.1570	0.0188	0.0124	0.1289	+-+++	0.0	2.606	4	0.6257
11 : 116332373 : INDEL	i	r	0.1319	0.0119	0.1214	0.1538	0.0155	0.0133	0.2444	++--+	50.1	8.019	4	0.09087
17 : 36987834 : SNP	t	c	0.1476	0.0148	0.1165	0.1636	0.0207	0.0122	0.09022	++-++	0.0	1.309	4	0.8599
8 : 76238911 : SNP	a	g	0.0470	0.0076	0.0387	0.0570	0.0094	0.0215	0.6619	++??-	0.0	1.496	2	0.4734
9 : 11503956 : SNP	a	g	0.2260	0.0089	0.1883	0.2305	0.0018	0.0101	0.8589	+---+	0.0	3.952	4	0.4125
16 : 24725130 : SNP	t	c	0.3372	0.0099	0.3270	0.3655	0.0088	0.0094	0.3459	0++-+	0.0	2.264	4	0.6874
2 : 69361621 : SNP	a	c	0.9240	0.0060	0.9076	0.9299	0.0098	0.0160	0.5395	-+-++	0.0	1.479	4	0.8304
1 : 236682413 : SNP	a	g	0.0516	0.0000	0.0516	0.0516	-0.0270	0.0475	0.5698	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 55822998 : SNP	t	c	0.8804	0.0033	0.8646	0.8867	0.0262	0.0136	0.05429	+++--	25.1	5.339	4	0.2543
1 : 28575472 : SNP	t	c	0.9317	0.0087	0.9091	0.9383	0.0254	0.0173	0.1419	++?-+	56.3	6.872	3	0.07608
1 : 205243942 : SNP	a	g	0.6442	0.0102	0.6319	0.6749	0.0257	0.0092	0.005219	+++++	19.3	4.958	4	0.2917
3 : 107526043 : SNP	t	c	0.9231	0.0108	0.9016	0.9504	0.0085	0.0173	0.6243	-+-?+	33.3	4.500	3	0.2123
10 : 15400417 : SNP	a	g	0.6147	0.0110	0.6004	0.6386	-0.0129	0.0089	0.1478	--+--	11.7	4.528	4	0.3392
21 : 40221741 : SNP	t	c	0.7409	0.0117	0.7240	0.7571	-0.0052	0.0099	0.5942	--+-+	0.0	3.687	4	0.4501
11 : 40849386 : SNP	a	t	0.2043	0.0047	0.1924	0.2135	0.0175	0.0107	0.1023	+-+++	0.0	1.928	4	0.749
2 : 126405736 : SNP	t	c	0.4624	0.0181	0.4304	0.4801	0.0072	0.0085	0.3976	+++--	48.2	7.728	4	0.1021
7 : 54173722 : SNP	a	g	0.0700	0.0031	0.0667	0.0779	0.0142	0.0172	0.4089	++?++	0.0	0.929	3	0.8185
11 : 129964076 : SNP	c	g	0.0536	0.0056	0.0465	0.0632	-0.0156	0.0199	0.4322	--?-+	79.3	14.509	3	0.002289
21 : 43880977 : SNP	a	g	0.2146	0.0098	0.2026	0.2242	0.0014	0.0107	0.8932	+-+-+	0.0	0.821	4	0.9357
5 : 114145525 : SNP	a	t	0.7142	0.0145	0.6902	0.7463	-0.0002	0.0094	0.9861	+--+-	9.5	4.421	4	0.352
14 : 34620029 : SNP	a	g	0.5226	0.0202	0.5055	0.5625	-0.0149	0.0090	0.09938	--+-+	0.0	3.513	4	0.476
2 : 137152529 : INDEL	d	r	0.2587	0.0168	0.2399	0.2756	-0.0016	0.0101	0.8765	-+++-	45.7	7.364	4	0.1178
3 : 10090968 : SNP	a	t	0.0776	0.0080	0.0574	0.0827	-0.0252	0.0220	0.2512	--??-	0.0	0.053	2	0.974
9 : 22199474 : SNP	c	g	0.0494	0.0000	0.0494	0.0494	-0.1090	0.0505	0.03104	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 61912285 : SNP	a	c	0.0156	0.0000	0.0156	0.0156	0.0070	0.0505	0.8898	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 108989852 : SNP	a	g	0.9839	0.0000	0.9839	0.9839	-0.0510	0.0657	0.4376	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 85064129 : SNP	a	g	0.1030	0.0060	0.0963	0.1217	-0.0025	0.0142	0.8613	-++--	0.0	0.677	4	0.9541
17 : 67610955 : SNP	a	g	0.8814	0.0089	0.8489	0.8865	0.0004	0.0136	0.9779	+-+--	0.0	0.843	4	0.9327
13 : 69022757 : SNP	t	g	0.9267	0.0083	0.9154	0.9477	0.0174	0.0166	0.2924	+++-+	0.0	0.862	4	0.9299
18 : 37276815 : SNP	a	g	0.0320	0.0003	0.0318	0.0323	0.0421	0.0276	0.1268	++???	0.0	0.071	1	0.7906
2 : 224888540 : SNP	t	c	0.9159	0.0088	0.8905	0.9238	-0.0084	0.0154	0.584	---++	6.2	4.263	4	0.3716
7 : 77374804 : SNP	a	g	0.5028	0.0145	0.4737	0.5186	0.0085	0.0085	0.3177	+++++	0.0	0.386	4	0.9836
8 : 17461421 : SNP	t	g	0.1169	0.0110	0.0868	0.1281	0.0168	0.0136	0.2165	++---	25.2	5.350	4	0.2532
11 : 56331652 : SNP	a	g	0.9135	0.0047	0.9049	0.9178	0.0060	0.0153	0.6964	+++-+	0.0	1.784	4	0.7754
7 : 15308585 : SNP	a	c	0.1650	0.0083	0.1441	0.1724	0.0079	0.0115	0.4925	-++--	45.8	7.373	4	0.1174
8 : 18707878 : SNP	t	c	0.9129	0.0055	0.9076	0.9204	-0.0420	0.0179	0.01862	--?+-	0.0	2.020	3	0.5683
10 : 33566936 : SNP	t	c	0.8622	0.0031	0.8565	0.8668	-0.0165	0.0127	0.1931	-+---	18.8	4.929	4	0.2947
14 : 59320349 : INDEL	d	r	0.4954	0.0092	0.4747	0.5062	-0.0002	0.0085	0.9807	-+--+	0.0	0.882	4	0.9271
6 : 119194357 : SNP	a	g	0.9008	0.0090	0.8924	0.9127	-0.0025	0.0187	0.8941	-+?--	0.0	1.354	3	0.7164
21 : 28178262 : SNP	t	c	0.9798	0.0000	0.9798	0.9798	-0.0090	0.0516	0.8614	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 19482727 : INDEL	i	r	0.0680	0.0033	0.0650	0.0724	0.0167	0.0174	0.3373	-+?++	0.0	2.684	3	0.4429
18 : 50018542 : SNP	a	t	0.9649	0.0044	0.9563	0.9696	-0.0016	0.0246	0.9496	+-??+	34.9	3.074	2	0.2151
3 : 141285060 : SNP	a	g	0.0589	0.0016	0.0572	0.0638	0.0119	0.0204	0.5578	+-?-?	0.0	0.994	2	0.6084
11 : 98996838 : SNP	a	g	0.0602	0.0027	0.0564	0.0638	0.0232	0.0188	0.2174	++??-	35.1	3.082	2	0.2141
11 : 24886552 : SNP	c	g	0.8483	0.0052	0.8327	0.8525	-0.0010	0.0118	0.9309	-+-++	0.0	2.794	4	0.5928
10 : 133325030 : SNP	t	g	0.6346	0.0247	0.6060	0.6996	0.0040	0.0092	0.6684	+-++-	17.1	4.823	4	0.3059
5 : 178942899 : SNP	t	g	0.7519	0.0207	0.7193	0.7753	-0.0153	0.0200	0.4441	?+-+-	0.0	2.626	3	0.453
6 : 36623243 : SNP	a	t	0.7536	0.0074	0.7308	0.7592	-0.0011	0.0099	0.9101	+---+	0.0	3.351	4	0.5009
1 : 201637811 : SNP	t	c	0.1471	0.0088	0.1227	0.1512	-0.0160	0.0122	0.1914	---+-	41.2	6.804	4	0.1466
1 : 169717288 : SNP	t	c	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	0.0370	0.0556	0.5057	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 105211925 : SNP	a	g	0.9539	0.0068	0.9372	0.9634	-0.0018	0.0210	0.9326	+-?-+	0.0	0.971	3	0.8083
4 : 65376429 : SNP	a	g	0.1178	0.0040	0.1084	0.1236	0.0037	0.0132	0.7813	+-+++	20.3	5.021	4	0.2851
1 : 61833691 : SNP	t	c	0.0239	0.0000	0.0239	0.0239	-0.0410	0.0425	0.3342	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 63140536 : SNP	a	g	0.9511	0.0044	0.9480	0.9578	0.0063	0.0230	0.7824	++??-	59.7	4.960	2	0.08376
11 : 66951966 : SNP	c	g	0.0502	0.0000	0.0502	0.0502	0.0490	0.0414	0.2371	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 530307 : SNP	a	g	0.7038	0.0108	0.6870	0.7107	-0.0029	0.0333	0.9317	???-+	85.0	6.682	1	0.009738
7 : 114380943 : SNP	a	t	0.6409	0.0089	0.6342	0.6743	0.0010	0.0089	0.9139	--++-	0.0	3.909	4	0.4185
18 : 9582286 : SNP	t	c	0.1570	0.0079	0.1422	0.1858	-0.0086	0.0117	0.4621	-+---	0.0	2.448	4	0.6539
4 : 153629761 : SNP	t	c	0.2611	0.0179	0.2109	0.2783	-0.0050	0.0101	0.6195	0-+-+	0.0	1.860	4	0.7615
11 : 12359490 : SNP	a	g	0.0798	0.0070	0.0630	0.0843	-0.0073	0.0162	0.6526	+-?--	24.6	3.979	3	0.2638
9 : 25232978 : SNP	a	g	0.1075	0.0070	0.0886	0.1104	-0.0274	0.0145	0.05943	--?+-	0.0	2.065	3	0.559
3 : 82966747 : SNP	a	t	0.0923	0.0093	0.0785	0.1049	0.0364	0.0178	0.04125	++?-+	0.0	2.410	3	0.4917
8 : 77730148 : SNP	a	g	0.9743	0.0000	0.9743	0.9743	0.0450	0.0374	0.2289	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 209304483 : INDEL	d	r	0.5748	0.0106	0.5663	0.5896	0.0023	0.0092	0.7991	++--+	0.0	2.460	4	0.6519
13 : 73866744 : SNP	a	g	0.2335	0.0162	0.1952	0.2440	-0.0017	0.0101	0.8642	-+-+-	60.0	10.001	4	0.04041
1 : 24690676 : SNP	a	g	0.0400	0.0016	0.0388	0.0421	-0.0206	0.0285	0.4702	--???	0.0	0.419	1	0.5173
6 : 159904894 : SNP	a	g	0.1277	0.0036	0.1249	0.1393	0.0193	0.0126	0.1241	+++-+	30.6	5.761	4	0.2177
5 : 108532976 : SNP	t	c	0.1159	0.0084	0.1006	0.1261	0.0050	0.0138	0.7177	+++--	38.1	6.459	4	0.1674
5 : 157526367 : SNP	a	g	0.1856	0.0042	0.1814	0.2015	0.0047	0.0112	0.6719	-+-+-	32.3	5.913	4	0.2058
16 : 51659416 : SNP	a	g	0.2039	0.0140	0.1935	0.2318	0.0193	0.0105	0.06602	+++++	0.0	2.791	4	0.5934
4 : 170287324 : SNP	t	c	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	-0.0300	0.0627	0.6322	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 161074672 : SNP	t	c	0.7088	0.0258	0.6800	0.7625	-0.0093	0.0093	0.3148	--+++	0.0	2.308	4	0.6794
3 : 193564921 : INDEL	i	r	0.6159	0.0088	0.6016	0.6243	0.0111	0.0091	0.2241	+++-+	0.0	1.893	4	0.7555
6 : 30902533 : SNP	t	c	0.0794	0.0213	0.0660	0.1143	-0.0393	0.0348	0.2593	??-+-	0.0	1.800	2	0.4066
2 : 150429419 : SNP	t	g	0.0200	0.0000	0.0200	0.0200	-0.0190	0.0495	0.7013	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 25543417 : SNP	a	g	0.0327	0.0035	0.0308	0.0401	-0.0233	0.0253	0.3576	+-??-	57.4	4.690	2	0.09586
21 : 31391903 : SNP	t	c	0.0821	0.0051	0.0693	0.0877	-0.0056	0.0158	0.7202	-++-+	37.8	6.430	4	0.1693
7 : 713504 : SNP	t	c	0.1031	0.0116	0.0951	0.1200	-0.0643	0.0361	0.07496	???--	0.0	0.590	1	0.4423
21 : 20435745 : SNP	a	g	0.9244	0.0031	0.9226	0.9320	0.0110	0.0166	0.5099	++??+	0.0	0.503	2	0.7776
3 : 117941314 : SNP	a	g	0.3483	0.0101	0.3234	0.3560	-0.0104	0.0091	0.2546	--+--	0.0	0.652	4	0.9571
18 : 45836861 : SNP	t	c	0.2003	0.0102	0.1917	0.2299	-0.0068	0.0110	0.5327	--++-	0.0	3.283	4	0.5117
15 : 55849875 : SNP	a	g	0.1979	0.0182	0.1686	0.2126	0.0087	0.0132	0.5064	+++++	0.0	0.240	4	0.9934
3 : 26635222 : SNP	t	c	0.1934	0.0045	0.1732	0.1973	-0.0212	0.0107	0.04668	--+++	9.7	4.429	4	0.351
4 : 1717306 : SNP	a	g	0.7415	0.0120	0.7279	0.7743	-0.0034	0.0096	0.726	+-+--	59.2	9.806	4	0.04382
5 : 35390835 : SNP	a	c	0.0434	0.0054	0.0331	0.0475	0.0259	0.0229	0.2578	++??+	0.0	1.009	2	0.6039
10 : 15660745 : SNP	a	c	0.7626	0.0101	0.7348	0.7741	0.0053	0.0100	0.5972	-+-++	42.9	7.006	4	0.1356
11 : 134543719 : INDEL	d	r	0.2052	0.0199	0.1583	0.2178	0.0020	0.0108	0.8517	-++-+	55.8	9.054	4	0.05975
4 : 34533200 : SNP	a	g	0.9751	0.0000	0.9751	0.9751	-0.0260	0.0445	0.5588	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 85909601 : SNP	t	c	0.0898	0.0061	0.0864	0.1102	-0.0211	0.0148	0.1525	-++--	0.0	2.608	4	0.6253
15 : 88763373 : SNP	t	g	0.8916	0.0060	0.8727	0.8954	-0.0078	0.0140	0.5768	--+--	0.0	1.426	4	0.8397
8 : 36666183 : SNP	a	g	0.1730	0.0097	0.1663	0.1944	0.0004	0.0111	0.9725	+-+--	0.0	1.487	4	0.8289
2 : 16844177 : SNP	t	c	0.9685	0.0056	0.9589	0.9739	0.0025	0.0264	0.9252	--??+	16.3	2.391	2	0.3026
3 : 17960497 : SNP	a	g	0.0654	0.0052	0.0562	0.0696	-0.0029	0.0185	0.8743	--?-+	0.0	2.986	3	0.3938
5 : 126892761 : SNP	t	g	0.2747	0.0184	0.2588	0.3303	0.0009	0.0097	0.9298	-+-+-	0.0	1.408	4	0.8427
14 : 32878062 : SNP	a	g	0.7372	0.0203	0.7129	0.7769	0.0063	0.0099	0.5269	+-+++	37.2	6.373	4	0.173
14 : 101280661 : SNP	a	g	0.1591	0.0172	0.1033	0.1703	0.0006	0.0124	0.964	+-?+-	0.0	0.521	3	0.9143
14 : 57042804 : SNP	a	g	0.6768	0.0136	0.6407	0.6889	0.0175	0.0091	0.05476	+++--	0.0	3.517	4	0.4753
6 : 109507842 : SNP	a	t	0.7073	0.0034	0.7008	0.7151	0.0149	0.0097	0.1251	+-+++	30.1	5.719	4	0.2211
9 : 109449544 : SNP	t	c	0.8931	0.0139	0.8585	0.9046	-0.0017	0.0136	0.9	++---	0.0	1.855	4	0.7624
10 : 3818058 : SNP	a	g	0.6990	0.0113	0.6888	0.7127	0.0101	0.0093	0.281	++++-	0.0	1.167	4	0.8835
8 : 113626000 : SNP	t	c	0.5179	0.0156	0.4844	0.5260	-0.0005	0.0086	0.9544	++---	31.4	5.832	4	0.212
16 : 80350823 : SNP	a	g	0.7127	0.0058	0.7075	0.7202	-0.0003	0.0097	0.9756	+---+	50.0	8.008	4	0.0913
7 : 63966609 : SNP	c	g	0.2361	0.0133	0.1989	0.2426	-0.0086	0.0099	0.388	+-+--	59.7	9.930	4	0.04163
3 : 36460427 : SNP	t	g	0.9818	0.0000	0.9818	0.9818	-0.1250	0.0556	0.02456	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 44154689 : INDEL	d	r	0.0975	0.0066	0.0847	0.1096	0.0096	0.0145	0.5062	+-++-	0.0	2.890	4	0.5764
3 : 149285471 : SNP	a	g	0.0350	0.0040	0.0283	0.0396	-0.0192	0.0255	0.4503	-+??-	0.0	1.003	2	0.6057
4 : 179640780 : SNP	t	g	0.9078	0.0133	0.8840	0.9217	-0.0019	0.0153	0.9023	-++--	38.1	6.458	4	0.1675
2 : 228244107 : SNP	t	c	0.0849	0.0092	0.0622	0.0933	0.0245	0.0165	0.1372	++?++	0.0	2.607	3	0.4563
18 : 71192763 : INDEL	i	r	0.0189	0.0000	0.0189	0.0189	-0.0690	0.0576	0.2311	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 232927900 : SNP	c	g	0.8586	0.0075	0.8516	0.8687	-0.0167	0.0125	0.1824	---+-	0.0	2.817	4	0.5889
5 : 51643598 : SNP	a	g	0.9269	0.0110	0.9143	0.9365	0.0223	0.0191	0.2426	++???	33.0	1.492	1	0.222
2 : 32192141 : SNP	c	g	0.1125	0.0176	0.0981	0.1454	0.0079	0.0137	0.5653	+-++-	34.3	6.090	4	0.1925
11 : 82372852 : SNP	a	t	0.0501	0.0015	0.0488	0.0518	0.0041	0.0261	0.8754	+-???	0.0	0.158	1	0.6906
17 : 53665567 : SNP	t	c	0.0119	0.0000	0.0119	0.0119	0.0810	0.0617	0.189	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 50754443 : SNP	a	g	0.1982	0.0165	0.1885	0.2446	-0.0102	0.0110	0.3528	----+	0.0	3.589	4	0.4645
2 : 225310530 : SNP	a	c	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	0.0150	0.0414	0.7174	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 135707779 : SNP	t	g	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	-0.0370	0.0516	0.4729	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 99450400 : SNP	t	g	0.3509	0.0081	0.3283	0.3608	-0.0085	0.0091	0.3505	-+---	29.9	5.707	4	0.2221
1 : 191688949 : SNP	a	g	0.8088	0.0140	0.7972	0.8431	0.0024	0.0108	0.8261	++---	0.0	2.320	4	0.6772
4 : 188006776 : SNP	a	g	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	-0.0280	0.0546	0.608	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 126582578 : SNP	t	c	0.9348	0.0049	0.9284	0.9420	-0.0022	0.0176	0.8996	+-?--	0.0	2.019	3	0.5685
11 : 10381176 : SNP	a	g	0.7003	0.0069	0.6845	0.7081	-0.0123	0.0092	0.1804	----+	0.0	0.551	4	0.9683
21 : 47668528 : INDEL	i	r	0.3128	0.0085	0.2851	0.3216	0.0060	0.0094	0.5221	+--+-	58.2	9.568	4	0.04836
20 : 15491886 : SNP	a	c	0.5688	0.0182	0.5496	0.6024	-0.0233	0.0089	0.008842	---+-	0.0	1.903	4	0.7536
5 : 1582156 : SNP	c	g	0.3501	0.0243	0.3001	0.3786	0.0073	0.0107	0.4956	+-++-	0.0	1.809	4	0.7708
10 : 126144179 : SNP	a	c	0.3317	0.0166	0.2960	0.3598	-0.0028	0.0120	0.8179	+-+--	16.8	4.811	4	0.3073
2 : 209413479 : SNP	a	g	0.0662	0.0078	0.0606	0.0864	0.0009	0.0182	0.9597	-+?++	0.0	0.596	3	0.8974
11 : 97966591 : SNP	t	g	0.7715	0.0084	0.7574	0.7871	0.0006	0.0100	0.9506	-+-++	0.0	2.621	4	0.6231
12 : 43119618 : SNP	t	c	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	0.0060	0.0526	0.9091	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 19743510 : SNP	c	g	0.0250	0.0000	0.0250	0.0250	0.0040	0.0394	0.9192	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 109483007 : SNP	t	g	0.1713	0.0079	0.1635	0.1907	-0.0252	0.0113	0.02554	---++	43.8	7.115	4	0.1299
3 : 11576047 : SNP	t	c	0.0392	0.0056	0.0334	0.0500	-0.0103	0.0250	0.6809	--??-	0.0	0.104	2	0.9495
14 : 25600457 : SNP	t	c	0.9302	0.0008	0.9278	0.9307	0.0334	0.0260	0.1984	-??++	59.6	4.951	2	0.08412
5 : 129531204 : SNP	a	g	0.8733	0.0118	0.8503	0.9001	0.0060	0.0128	0.6368	+--++	0.0	2.494	4	0.6457
5 : 122571493 : SNP	a	g	0.2538	0.0030	0.2497	0.2581	0.0081	0.0098	0.4126	+-+-+	26.5	5.444	4	0.2447
4 : 12323492 : SNP	a	g	0.0189	0.0000	0.0189	0.0189	-0.0260	0.0536	0.6275	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 46110347 : SNP	a	t	0.7957	0.0049	0.7821	0.8004	0.0054	0.0115	0.6414	-+++-	0.0	3.873	4	0.4235
6 : 92370678 : SNP	a	g	0.9878	0.0000	0.9878	0.9878	-0.0680	0.0566	0.2297	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 54520603 : SNP	t	c	0.7591	0.0043	0.7441	0.7632	0.0064	0.0100	0.5251	+--++	0.0	2.826	4	0.5873
16 : 1578914 : SNP	a	g	0.8696	0.0061	0.8547	0.8789	0.0228	0.0130	0.08018	+++-+	0.0	2.037	4	0.729
11 : 133225569 : SNP	a	g	0.8716	0.0077	0.8604	0.8798	-0.0336	0.0129	0.009346	-----	0.0	2.463	4	0.6513
10 : 133220189 : SNP	a	g	0.5519	0.0080	0.5211	0.5572	-0.0132	0.0086	0.1243	-+-+-	0.0	2.458	4	0.6523
1 : 7735380 : SNP	t	c	0.1098	0.0279	0.0774	0.1761	-0.0205	0.0168	0.2232	--+--	0.0	1.542	4	0.8192
8 : 36487549 : SNP	t	c	0.9713	0.0022	0.9674	0.9726	-0.0317	0.0324	0.3281	-???-	0.0	0.080	1	0.7769
1 : 247340644 : SNP	t	c	0.5845	0.0189	0.5446	0.6035	0.0025	0.0086	0.7738	+0++-	0.0	2.070	4	0.7229
10 : 123852614 : INDEL	i	r	0.1028	0.0080	0.0989	0.1213	0.0083	0.0147	0.574	-++-+	0.0	0.905	4	0.9238
4 : 42163551 : INDEL	d	r	0.0293	0.0000	0.0293	0.0293	0.0680	0.0374	0.06905	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 240185494 : SNP	t	c	0.0171	0.0000	0.0171	0.0171	0.0030	0.0607	0.9606	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 195541363 : SNP	a	g	0.1917	0.0064	0.1725	0.1956	0.0082	0.0117	0.4813	++---	37.8	6.430	4	0.1693
16 : 29426917 : SNP	a	g	0.0434	0.0000	0.0434	0.0434	0.0393	0.0633	0.5347	????+	0.0	0.000	0	1
19 : 20621828 : SNP	t	c	0.6821	0.0144	0.6756	0.7140	0.0144	0.0291	0.6204	???-+	78.1	4.564	1	0.03265
11 : 37181737 : SNP	c	g	0.0500	0.0089	0.0438	0.0660	0.0314	0.0201	0.1189	++?-+	0.0	2.272	3	0.5179
12 : 69033639 : SNP	t	g	0.0271	0.0000	0.0271	0.0271	-0.1230	0.0617	0.04607	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 30530131 : SNP	a	g	0.9220	0.0116	0.9006	0.9304	0.0056	0.0158	0.7237	0+-+-	0.0	1.011	4	0.9081
13 : 27506708 : SNP	t	g	0.0793	0.0097	0.0721	0.1065	-0.0023	0.0168	0.8909	-+?++	0.0	0.384	3	0.9435
10 : 55750727 : SNP	a	g	0.9592	0.0067	0.9448	0.9639	0.0116	0.0221	0.5999	-+?++	48.9	5.873	3	0.118
8 : 9834227 : SNP	t	c	0.0432	0.0015	0.0412	0.0443	-0.0656	0.0251	0.009061	--???	23.6	1.310	1	0.2524
7 : 88584588 : SNP	t	c	0.7054	0.0081	0.6856	0.7175	0.0124	0.0094	0.1842	+++-+	0.0	2.074	4	0.7221
4 : 133340212 : SNP	a	c	0.7084	0.0055	0.7051	0.7313	-0.0030	0.0092	0.7433	--+-+	0.0	1.295	4	0.8622
3 : 147072486 : SNP	a	t	0.4088	0.0141	0.3827	0.4220	0.0022	0.0086	0.7966	-+--+	0.0	1.298	4	0.8618
14 : 33636315 : SNP	a	g	0.9210	0.0026	0.9191	0.9282	-0.0062	0.0161	0.6989	--?++	0.0	2.489	3	0.4773
9 : 23995190 : SNP	a	g	0.5080	0.0132	0.4945	0.5239	-0.0015	0.0091	0.8697	----+	9.1	4.398	4	0.3548
12 : 57086512 : SNP	a	g	0.6322	0.0188	0.5909	0.6659	-0.0104	0.0091	0.2507	-+-+-	15.9	4.754	4	0.3135
15 : 96603474 : SNP	t	g	0.0125	0.0000	0.0125	0.0125	-0.0610	0.0607	0.3145	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 50291112 : SNP	t	c	0.7181	0.0122	0.7083	0.7456	0.0193	0.0103	0.06051	+++++	0.0	0.113	4	0.9985
19 : 55054196 : SNP	a	g	0.9262	0.0039	0.9165	0.9286	-0.0119	0.0284	0.6765	+??+-	16.4	2.392	2	0.3024
13 : 48772196 : INDEL	i	r	0.1388	0.0046	0.1325	0.1429	-0.0314	0.0123	0.01093	-----	0.0	3.911	4	0.4181
11 : 103139828 : SNP	a	g	0.1130	0.0138	0.0799	0.1270	0.0162	0.0137	0.2354	++---	2.3	4.093	4	0.3936
20 : 13659789 : SNP	c	g	0.9068	0.0050	0.9007	0.9175	-0.0134	0.0154	0.3844	--?++	75.3	12.153	3	0.006878
18 : 67349615 : SNP	t	c	0.9891	0.0000	0.9891	0.9891	0.0100	0.0576	0.8622	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 138195803 : SNP	t	c	0.9115	0.0106	0.8912	0.9185	0.0050	0.0153	0.7427	-+?-+	14.8	3.521	3	0.318
1 : 48585580 : INDEL	d	r	0.3109	0.0083	0.2866	0.3196	0.0028	0.0106	0.7903	-+--+	57.4	9.400	4	0.05185
1 : 13794594 : SNP	a	g	0.5945	0.0080	0.5808	0.6170	0.0005	0.0086	0.9505	--+++	0.0	2.835	4	0.5858
1 : 119577666 : SNP	t	g	0.4220	0.0197	0.3841	0.4381	-0.0079	0.0086	0.3567	--++-	0.0	2.163	4	0.7058
19 : 17850189 : SNP	t	c	0.7865	0.0047	0.7822	0.7979	0.0018	0.0106	0.8647	++---	0.0	1.466	4	0.8326
22 : 20834255 : SNP	c	g	0.0292	0.0000	0.0292	0.0292	0.0520	0.0435	0.2316	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 80940507 : SNP	a	g	0.9750	0.0000	0.9750	0.9750	-0.0360	0.0414	0.3851	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 31686694 : SNP	a	g	0.2200	0.0053	0.2069	0.2250	0.0014	0.0101	0.8934	+--++	0.0	1.570	4	0.8142
6 : 9102386 : SNP	a	g	0.5618	0.0128	0.5138	0.5824	0.0135	0.0091	0.1369	++-+-	0.0	1.994	4	0.7368
16 : 21095027 : INDEL	i	r	0.2644	0.0129	0.2556	0.2919	-0.0006	0.0098	0.9509	+-+--	30.4	5.750	4	0.2186
15 : 99810484 : SNP	a	c	0.9445	0.0062	0.9389	0.9514	0.0053	0.0248	0.8295	++??+	0.0	0.064	2	0.9687
4 : 190750669 : SNP	a	g	0.5185	0.0171	0.4747	0.5415	-0.0003	0.0095	0.9759	+++--	0.0	1.209	4	0.8766
2 : 30122294 : SNP	a	g	0.9673	0.0015	0.9662	0.9694	-0.0088	0.0263	0.7377	+-???	76.3	4.227	1	0.03978
12 : 12889301 : INDEL	d	r	0.4131	0.0164	0.3771	0.4253	0.0023	0.0091	0.8046	+-+--	0.0	0.633	4	0.9593
19 : 22156482 : SNP	t	g	0.4392	0.0105	0.4301	0.4578	0.0120	0.0089	0.1753	++---	55.7	9.033	4	0.06028
1 : 87818407 : SNP	a	g	0.9321	0.0055	0.9276	0.9411	0.0055	0.0194	0.7772	--??+	53.0	4.254	2	0.1192
19 : 55571034 : SNP	a	t	0.0728	0.0052	0.0672	0.0787	0.0129	0.0213	0.5449	+-?-+	0.0	2.837	3	0.4174
18 : 20049669 : SNP	t	c	0.6149	0.0110	0.6048	0.6420	-0.0064	0.0086	0.4582	-++--	0.0	2.668	4	0.6149
7 : 81804135 : SNP	t	c	0.1261	0.0130	0.1179	0.1526	-0.0253	0.0135	0.06095	--+--	0.0	0.872	4	0.9285
22 : 18485836 : SNP	t	g	0.6989	0.0074	0.6856	0.7055	-0.0046	0.0106	0.6635	-++--	0.0	1.949	4	0.7451
9 : 122274969 : SNP	a	g	0.9202	0.0194	0.8906	0.9417	0.0412	0.0203	0.04307	++?-+	0.0	2.581	3	0.4608
10 : 101372411 : SNP	t	c	0.1288	0.0141	0.1184	0.1547	-0.0064	0.0129	0.6188	--++-	17.9	4.872	4	0.3007
1 : 117251813 : INDEL	i	r	0.1433	0.0062	0.1301	0.1477	-0.0101	0.0148	0.4958	-+++-	0.0	3.655	4	0.4547
14 : 33434940 : SNP	c	g	0.9760	0.0000	0.9760	0.9760	0.0380	0.0425	0.3708	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 56307352 : SNP	a	c	0.9229	0.0054	0.9081	0.9300	0.0267	0.0166	0.107	++?-+	0.0	2.261	3	0.5201
10 : 109571413 : SNP	a	g	0.1451	0.0157	0.1016	0.1611	0.0048	0.0122	0.6918	+--+-	0.0	2.295	4	0.6817
14 : 99154589 : SNP	t	g	0.3169	0.0069	0.3103	0.3262	0.0037	0.0092	0.6879	++--+	0.0	2.332	4	0.6749
9 : 73384688 : INDEL	d	r	0.4941	0.0078	0.4645	0.5165	0.0008	0.0085	0.925	++-+-	0.0	1.243	4	0.871
9 : 90447165 : SNP	a	g	0.0819	0.0123	0.0514	0.0926	-0.0021	0.0163	0.897	+-?+-	50.6	6.070	3	0.1082
2 : 43481077 : SNP	t	c	0.0183	0.0000	0.0183	0.0183	0.0110	0.0475	0.8169	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 37270446 : SNP	a	t	0.8399	0.0071	0.8272	0.8580	0.0001	0.0145	0.994	--++-	0.0	3.835	4	0.4288
2 : 60463594 : SNP	a	g	0.0436	0.0035	0.0385	0.0481	-0.0214	0.0218	0.3255	--??-	0.0	1.948	2	0.3776
3 : 195842387 : SNP	a	c	0.1956	0.0108	0.1727	0.2137	-0.0042	0.0117	0.7225	--+++	0.0	2.159	4	0.7065
7 : 32374912 : SNP	t	c	0.9867	0.0000	0.9867	0.9867	-0.0610	0.0516	0.2367	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 27848634 : SNP	a	g	0.9033	0.0078	0.8937	0.9109	0.0085	0.0151	0.5736	+++-+	0.0	2.299	4	0.681
1 : 227023762 : SNP	t	c	0.2561	0.0319	0.1761	0.2982	0.0086	0.0100	0.3865	++-+-	0.0	2.611	4	0.625
16 : 49098036 : SNP	t	g	0.9833	0.0000	0.9833	0.9833	0.1180	0.0485	0.01502	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 81880313 : SNP	c	g	0.7982	0.0172	0.7770	0.8346	-0.0041	0.0112	0.7142	+-++-	39.6	6.620	4	0.1574
20 : 906938 : SNP	a	t	0.0272	0.0013	0.0261	0.0288	-0.0396	0.0295	0.1794	--???	0.0	0.402	1	0.5262
10 : 81887949 : SNP	a	t	0.0691	0.0046	0.0622	0.0730	-0.0170	0.0194	0.381	-+?-+	0.0	1.586	3	0.6625
1 : 119451815 : SNP	t	c	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	0.0910	0.0495	0.06618	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 98125288 : SNP	a	c	0.6425	0.0107	0.6300	0.6944	-0.0002	0.0096	0.9818	++---	0.0	2.610	4	0.625
12 : 28303296 : SNP	t	c	0.3297	0.0090	0.2996	0.3388	-0.0169	0.0092	0.06439	-----	34.4	6.101	4	0.1917
12 : 111885351 : INDEL	d	r	0.2091	0.0106	0.1953	0.2446	-0.0141	0.0106	0.1842	--+-+	25.3	5.358	4	0.2525
2 : 190317730 : SNP	a	c	0.0357	0.0006	0.0343	0.0360	0.0344	0.0244	0.1584	++??+	0.0	0.815	2	0.6652
8 : 8761970 : SNP	t	c	0.0961	0.0071	0.0696	0.1035	0.0046	0.0157	0.7711	-+-++	54.6	8.812	4	0.06598
2 : 240593434 : SNP	a	g	0.5110	0.0145	0.4809	0.5231	-0.0116	0.0097	0.2309	--+++	0.0	1.259	4	0.8682
13 : 62720885 : SNP	a	g	0.2331	0.0062	0.2223	0.2390	-0.0052	0.0106	0.6222	----+	0.0	3.219	4	0.5218
20 : 12738353 : SNP	a	g	0.6478	0.0106	0.6407	0.6733	0.0091	0.0120	0.4441	+-+-+	57.3	9.363	4	0.05264
17 : 32079951 : SNP	c	g	0.4913	0.0117	0.4616	0.5012	-0.0007	0.0085	0.9372	+----	0.0	0.482	4	0.9753
4 : 156159680 : SNP	a	g	0.9409	0.0026	0.9367	0.9425	-0.0203	0.0318	0.5235	-???+	0.0	0.637	1	0.4248
6 : 32966363 : SNP	a	g	0.0377	0.0106	0.0302	0.0527	0.0121	0.0306	0.6918	+???-	0.0	0.255	1	0.6136
19 : 22143339 : SNP	t	g	0.4210	0.0046	0.4018	0.4278	-0.0039	0.0085	0.6457	--+++	50.1	8.023	4	0.09074
15 : 101775043 : SNP	a	g	0.2186	0.0251	0.2037	0.2818	0.0102	0.0104	0.3301	++--+	0.0	1.729	4	0.7855
12 : 102081498 : SNP	a	g	0.5919	0.0070	0.5867	0.6163	-0.0101	0.0091	0.2687	+----	39.8	6.644	4	0.1559
21 : 22913435 : SNP	t	c	0.8866	0.0047	0.8792	0.8935	0.0028	0.0134	0.837	+-+-+	0.0	2.446	4	0.6543
21 : 30268381 : SNP	c	g	0.0864	0.0037	0.0820	0.0910	0.0039	0.0151	0.7976	++---	0.0	2.169	4	0.7048
4 : 7974925 : SNP	c	g	0.2221	0.0129	0.1924	0.2343	0.0028	0.0107	0.7922	-0++-	0.0	3.983	4	0.4083
3 : 182706017 : INDEL	i	r	0.0274	0.0000	0.0274	0.0274	0.0080	0.0586	0.8915	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 107818547 : SNP	a	t	0.0598	0.0057	0.0573	0.0794	0.0206	0.0218	0.3465	++?--	23.6	3.926	3	0.2695
4 : 30073569 : SNP	t	g	0.8658	0.0117	0.8492	0.8848	-0.0044	0.0130	0.7352	-+--+	0.0	2.213	4	0.6967
21 : 46495467 : SNP	t	c	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	0.0370	0.0607	0.5418	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 37123250 : SNP	a	g	0.4679	0.0132	0.4564	0.4959	0.0015	0.0085	0.8611	-+-++	0.0	2.739	4	0.6024
15 : 23261646 : SNP	t	c	0.5115	0.0261	0.4610	0.5250	0.0028	0.0290	0.9228	??-?+	12.3	1.141	1	0.2855
1 : 199583780 : SNP	a	c	0.1573	0.0095	0.1344	0.1630	-0.0016	0.0115	0.8896	+-+++	0.0	2.838	4	0.5853
11 : 5587210 : INDEL	i	r	0.4634	0.0147	0.4497	0.4961	0.0179	0.0085	0.03601	++-+-	21.9	5.124	4	0.2748
2 : 53081430 : SNP	a	t	0.9054	0.0141	0.8926	0.9421	-0.0150	0.0154	0.3305	-+??-	0.0	1.722	2	0.4228
11 : 84330224 : SNP	a	c	0.0146	0.0000	0.0146	0.0146	-0.0210	0.0647	0.7455	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 104900841 : SNP	t	c	0.0165	0.0000	0.0165	0.0165	0.0070	0.0475	0.8829	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 48356124 : SNP	t	c	0.8780	0.0040	0.8644	0.8810	-0.0025	0.0139	0.8557	-+?-+	0.0	1.676	3	0.6423
6 : 15920218 : SNP	a	g	0.0213	0.0000	0.0213	0.0213	0.0470	0.0435	0.2796	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 30290017 : INDEL	i	r	0.2735	0.0246	0.2507	0.3196	0.0087	0.0098	0.3754	++---	62.1	10.560	4	0.03198
1 : 165073037 : SNP	a	g	0.4635	0.0157	0.4426	0.4983	0.0166	0.0085	0.05098	++++-	0.0	1.734	4	0.7845
15 : 68240748 : SNP	t	c	0.3686	0.0035	0.3583	0.3727	0.0136	0.0091	0.1343	+++++	41.3	6.818	4	0.1458
7 : 64894175 : SNP	t	c	0.5668	0.0241	0.5505	0.6208	-0.0041	0.0086	0.6318	+0---	0.0	2.495	4	0.6456
3 : 75129539 : SNP	a	c	0.1627	0.0090	0.1507	0.1799	-0.0271	0.0130	0.0378	-----	0.0	2.241	4	0.6915
3 : 126432373 : SNP	a	c	0.1077	0.0065	0.0909	0.1155	-0.0111	0.0136	0.4169	--+-+	0.0	1.914	4	0.7515
17 : 41655069 : SNP	a	t	0.5210	0.0149	0.5016	0.5611	-0.0050	0.0086	0.5556	+---+	0.0	3.519	4	0.4749
8 : 1401614 : SNP	a	g	0.4669	0.0194	0.4476	0.4934	-0.0239	0.0096	0.01327	-----	0.0	3.637	4	0.4574
14 : 40781643 : SNP	a	g	0.0297	0.0059	0.0255	0.0381	0.0199	0.0339	0.5561	-???+	31.9	1.469	1	0.2255
5 : 98324406 : SNP	t	c	0.8123	0.0066	0.7996	0.8184	0.0151	0.0118	0.1988	++-++	0.0	2.832	4	0.5863
10 : 121846052 : SNP	a	g	0.8317	0.0090	0.8187	0.8426	0.0090	0.0117	0.4395	+--++	0.0	2.841	4	0.5848
10 : 15342715 : SNP	a	c	0.7470	0.0108	0.7371	0.7725	0.0073	0.0098	0.4568	++-++	0.0	1.585	4	0.8115
5 : 95503776 : SNP	a	g	0.0134	0.0000	0.0134	0.0134	0.0450	0.0586	0.4428	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 96143967 : INDEL	d	r	0.2552	0.0132	0.2448	0.2737	0.0121	0.0110	0.2744	0++++	0.0	1.600	4	0.8089
8 : 33342495 : SNP	a	t	0.6532	0.0108	0.6403	0.6881	0.0112	0.0091	0.2185	++-++	0.0	1.018	4	0.9071
11 : 46183407 : INDEL	d	r	0.1094	0.0043	0.1010	0.1142	-0.0036	0.0159	0.8211	+-?-+	38.4	4.868	3	0.1817
5 : 44406610 : SNP	a	g	0.0117	0.0000	0.0117	0.0117	-0.0290	0.0627	0.6436	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 4019637 : SNP	t	c	0.1226	0.0076	0.1089	0.1379	-0.0059	0.0128	0.6457	++---	0.0	2.262	4	0.6876
15 : 24445906 : SNP	c	g	0.1017	0.0148	0.0888	0.1236	0.0070	0.0195	0.7204	-+?++	0.0	2.865	3	0.4128
18 : 58099094 : SNP	a	g	0.2355	0.0186	0.2080	0.2540	0.0189	0.0119	0.1134	++-++	0.0	0.847	4	0.932
7 : 126582274 : SNP	t	c	0.7153	0.0168	0.6815	0.7403	0.0087	0.0093	0.3496	+-+--	44.1	7.160	4	0.1277
2 : 118811103 : SNP	a	t	0.9759	0.0024	0.9730	0.9779	-0.0332	0.0326	0.3094	--???	0.0	0.400	1	0.527
6 : 160465065 : SNP	t	c	0.0135	0.0000	0.0135	0.0135	-0.0610	0.0586	0.2981	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 136991749 : SNP	t	c	0.5746	0.0193	0.5496	0.5947	0.0317	0.0166	0.0554	?+--+	48.8	5.858	3	0.1187
1 : 189297519 : SNP	a	t	0.5296	0.0090	0.5254	0.5633	-0.0012	0.0085	0.8861	+++--	21.7	5.107	4	0.2765
14 : 47859454 : SNP	a	g	0.8283	0.0083	0.8015	0.8386	0.0041	0.0113	0.714	+-+-+	0.0	2.210	4	0.6972
17 : 1016197 : SNP	a	g	0.4780	0.0154	0.4551	0.4968	0.0017	0.0113	0.8818	-+++-	0.0	2.723	4	0.6052
10 : 89467422 : SNP	a	g	0.1287	0.0126	0.1157	0.1568	-0.0032	0.0162	0.8454	--+-+	6.6	4.282	4	0.3691
17 : 72177592 : SNP	a	t	0.8771	0.0044	0.8639	0.8820	-0.0041	0.0135	0.7613	+----	33.1	5.976	4	0.201
1 : 202916652 : SNP	a	t	0.0551	0.0084	0.0415	0.0608	-0.0132	0.0220	0.5505	-+??-	29.4	2.831	2	0.2427
11 : 100530419 : SNP	t	c	0.9844	0.0000	0.9844	0.9844	-0.0550	0.0536	0.3046	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 69103602 : SNP	a	g	0.4792	0.0146	0.4651	0.5113	0.0167	0.0110	0.1299	-++-+	12.4	4.568	4	0.3346
4 : 55801550 : SNP	t	g	0.5686	0.0110	0.5463	0.5797	0.0127	0.0089	0.1542	++--+	0.0	3.319	4	0.5059
6 : 11666436 : SNP	c	g	0.4049	0.0188	0.3728	0.4228	0.0033	0.0086	0.7013	-+-+-	0.0	3.239	4	0.5186
13 : 42319396 : SNP	c	g	0.2121	0.0140	0.2046	0.2409	-0.0048	0.0105	0.6454	-++--	0.0	0.880	4	0.9274
6 : 53113448 : SNP	a	g	0.0736	0.0140	0.0606	0.0961	0.0379	0.0169	0.02532	++?-+	0.0	1.540	3	0.673
16 : 12677759 : SNP	a	g	0.3300	0.0196	0.2888	0.3428	0.0173	0.0090	0.05508	++--+	0.0	1.203	4	0.8776
7 : 44255536 : SNP	a	g	0.9271	0.0009	0.9250	0.9281	0.0163	0.0183	0.3738	++?-?	0.0	0.641	2	0.7259
21 : 26615065 : SNP	a	g	0.0307	0.0038	0.0279	0.0383	-0.0242	0.0259	0.3503	-+??+	56.6	4.613	2	0.09959
6 : 145137793 : INDEL	i	r	0.3939	0.0102	0.3824	0.4269	-0.0178	0.0086	0.03785	---+-	0.0	2.367	4	0.6685
13 : 24162875 : SNP	t	c	0.2942	0.0120	0.2668	0.3030	-0.0019	0.0094	0.8417	-+-+-	35.1	6.166	4	0.1871
15 : 31343085 : SNP	a	g	0.1438	0.0102	0.1083	0.1557	0.0228	0.0122	0.06117	++-++	24.7	5.312	4	0.2568
16 : 28608816 : SNP	t	c	0.0418	0.0050	0.0389	0.0506	0.0362	0.0261	0.1651	-+??+	28.1	2.780	2	0.2491
18 : 59636923 : SNP	a	g	0.9803	0.0000	0.9803	0.9803	0.0360	0.0536	0.5016	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 170811491 : SNP	c	g	0.1193	0.0077	0.1011	0.1253	-0.0215	0.0130	0.09831	-+---	0.0	1.305	4	0.8606
6 : 152867993 : SNP	t	c	0.7867	0.0088	0.7748	0.8024	-0.0104	0.0106	0.3235	+----	9.9	4.439	4	0.3499
6 : 15312363 : SNP	a	t	0.0416	0.0026	0.0382	0.0435	0.0199	0.0244	0.4148	++???	0.0	0.046	1	0.8293
13 : 72982368 : SNP	t	c	0.2071	0.0060	0.1979	0.2289	0.0072	0.0113	0.5214	-++++	29.1	5.639	4	0.2278
12 : 73951537 : SNP	a	g	0.1013	0.0088	0.0850	0.1188	0.0181	0.0146	0.2166	++++-	64.6	11.305	4	0.02335
19 : 325865 : SNP	a	g	0.9085	0.0069	0.8952	0.9185	0.0034	0.0161	0.8341	+-?++	0.0	0.853	3	0.8368
12 : 113450080 : SNP	t	g	0.4023	0.0130	0.3941	0.4309	0.0068	0.0091	0.4556	-++++	7.0	4.299	4	0.367
2 : 53017429 : INDEL	d	r	0.0260	0.0016	0.0247	0.0281	-0.0268	0.0310	0.3862	--???	0.0	0.801	1	0.3709
3 : 36395934 : SNP	t	c	0.0313	0.0000	0.0313	0.0313	0.0020	0.0374	0.9574	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 154104221 : INDEL	d	r	0.8572	0.0110	0.8445	0.8735	0.0016	0.0127	0.9018	0+--+	53.2	8.546	4	0.07349
6 : 79148365 : SNP	a	g	0.7110	0.0087	0.6972	0.7250	-0.0028	0.0094	0.7621	-+-+-	0.0	3.469	4	0.4826
8 : 106897758 : SNP	t	c	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	-0.0250	0.0425	0.556	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 111459294 : SNP	a	c	0.7749	0.0125	0.7452	0.7873	0.0085	0.0104	0.4137	+---+	17.2	4.832	4	0.305
3 : 65804876 : SNP	t	g	0.9665	0.0069	0.9565	0.9713	0.0149	0.0341	0.6617	+???-	0.0	0.409	1	0.5223
4 : 91230579 : SNP	a	g	0.0983	0.0067	0.0866	0.1043	0.0069	0.0145	0.6341	++---	6.2	4.265	4	0.3713
7 : 97268095 : SNP	a	g	0.0913	0.0163	0.0754	0.1294	-0.0261	0.0155	0.09241	-+?+-	26.0	4.057	3	0.2554
15 : 93875923 : SNP	a	g	0.3826	0.0045	0.3796	0.3896	-0.0092	0.0093	0.3222	+---+	1.5	4.061	4	0.3978
9 : 24340921 : SNP	t	c	0.0188	0.0000	0.0188	0.0188	-0.0800	0.0566	0.1576	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 29506649 : SNP	a	t	0.1276	0.0025	0.1258	0.1329	-0.0019	0.0129	0.884	-++-+	61.2	10.305	4	0.03558
3 : 151637432 : SNP	t	c	0.9856	0.0000	0.9856	0.9856	-0.1080	0.0536	0.04382	-????	0.0	0.000	0	1
19 : 15278714 : INDEL	d	r	0.8667	0.0257	0.8310	0.9035	0.0094	0.0143	0.5103	+-++-	0.0	2.730	4	0.6039
19 : 2844957 : SNP	a	g	0.5644	0.0320	0.5187	0.6151	-0.0044	0.0092	0.6285	----+	0.0	0.673	4	0.9546
13 : 103929435 : SNP	a	g	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	0.0080	0.0576	0.8896	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 159984005 : SNP	t	c	0.1622	0.0090	0.1576	0.1883	0.0040	0.0117	0.7331	--+++	0.0	1.342	4	0.8542
14 : 55811327 : SNP	a	g	0.5818	0.0255	0.5652	0.6392	0.0075	0.0087	0.3907	++++-	51.6	8.260	4	0.08249
18 : 29103383 : SNP	a	g	0.9534	0.0027	0.9502	0.9557	0.0389	0.0263	0.1399	++???	0.0	0.201	1	0.6539
10 : 127145715 : SNP	t	c	0.2983	0.0102	0.2899	0.3293	-0.0084	0.0092	0.3595	--+-+	7.6	4.327	4	0.3636
6 : 78067324 : INDEL	d	r	0.1664	0.0163	0.1329	0.1809	0.0105	0.0149	0.482	++++-	0.0	0.677	4	0.9541
12 : 70605333 : SNP	t	g	0.0809	0.0089	0.0696	0.0965	0.0103	0.0159	0.5177	+-?++	0.0	2.783	3	0.4264
10 : 55329632 : SNP	t	c	0.5086	0.0105	0.4979	0.5249	-0.0034	0.0085	0.6894	---++	0.0	1.853	4	0.7629
8 : 102251727 : SNP	a	g	0.0118	0.0000	0.0118	0.0118	0.0500	0.0617	0.4174	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 61616718 : SNP	a	g	0.9638	0.0070	0.9408	0.9668	0.0230	0.0261	0.3796	+-?+?	20.6	2.519	2	0.2838
10 : 14348067 : SNP	c	g	0.1286	0.0334	0.0988	0.1842	0.0203	0.0131	0.1219	++-++	0.0	2.144	4	0.7093
6 : 107028613 : SNP	a	c	0.1166	0.0176	0.1014	0.1500	-0.0231	0.0135	0.08845	--+-+	25.4	5.365	4	0.2519
2 : 30273791 : SNP	t	c	0.0827	0.0059	0.0804	0.1069	0.0017	0.0156	0.9152	-++-+	11.0	4.493	4	0.3434
2 : 151550148 : SNP	a	g	0.0723	0.0050	0.0690	0.0879	0.0271	0.0174	0.1188	++-?+	6.0	3.193	3	0.3629
14 : 65848123 : SNP	t	c	0.9196	0.0054	0.9080	0.9263	0.0137	0.0158	0.3842	++---	67.1	12.152	4	0.01625
5 : 159713851 : INDEL	d	r	0.0414	0.0012	0.0404	0.0429	-0.0106	0.0285	0.71	-+???	20.9	1.265	1	0.2607
2 : 127944619 : SNP	t	g	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	-0.0900	0.0576	0.1183	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 44181453 : SNP	c	g	0.0764	0.0066	0.0566	0.0797	-0.0170	0.0190	0.3701	-+?--	22.8	3.887	3	0.274
10 : 6830881 : SNP	a	g	0.9222	0.0026	0.9117	0.9235	-0.0047	0.0164	0.7733	-+?++	67.3	9.179	3	0.02701
8 : 18607860 : SNP	t	g	0.0153	0.0000	0.0153	0.0153	0.0840	0.0526	0.11	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 91777848 : SNP	a	g	0.4864	0.0164	0.4510	0.5025	0.0059	0.0085	0.4861	+--+-	0.0	1.093	4	0.8953
11 : 3524590 : SNP	c	g	0.3152	0.0231	0.3004	0.3534	0.0108	0.0251	0.667	??++-	25.1	2.669	2	0.2633
13 : 41450505 : SNP	a	c	0.6929	0.0100	0.6796	0.7074	0.0062	0.0093	0.5081	++-++	0.0	0.227	4	0.994
2 : 214298413 : SNP	a	g	0.3970	0.0233	0.3781	0.4432	0.0004	0.0087	0.9651	0+---	0.0	3.883	4	0.4221
14 : 88111039 : INDEL	i	r	0.5309	0.0158	0.5134	0.5709	0.0252	0.0097	0.009842	+++++	0.0	1.989	4	0.7378
20 : 55605991 : SNP	a	g	0.6614	0.0122	0.6403	0.6770	-0.0109	0.0093	0.241	-+--+	34.0	6.061	4	0.1946
14 : 35369603 : SNP	a	g	0.2136	0.0078	0.2062	0.2237	0.0115	0.0105	0.2724	0++--	25.7	5.385	4	0.25
8 : 18369107 : SNP	a	c	0.0162	0.0000	0.0162	0.0162	-0.0470	0.0505	0.3524	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 121719939 : SNP	a	g	0.2015	0.0185	0.1542	0.2107	-0.0036	0.0109	0.7404	-+-+-	25.7	5.382	4	0.2503
9 : 89538720 : SNP	a	t	0.0110	0.0000	0.0110	0.0110	0.0570	0.0627	0.3631	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 157783003 : SNP	a	g	0.5849	0.0105	0.5650	0.6004	-0.0142	0.0085	0.09551	--++-	5.7	4.240	4	0.3745
7 : 23693043 : SNP	t	c	0.2592	0.0145	0.2267	0.2703	-0.0097	0.0099	0.3274	-+-+-	35.9	6.244	4	0.1816
3 : 56904851 : INDEL	i	r	0.4869	0.0186	0.4285	0.5000	-0.0058	0.0092	0.5244	-+--+	21.2	5.074	4	0.2798
10 : 32381664 : SNP	a	g	0.2155	0.0055	0.2037	0.2254	-0.0203	0.0106	0.05589	---+-	0.0	2.649	4	0.6181
9 : 125321901 : SNP	t	c	0.9053	0.0095	0.8818	0.9117	0.0061	0.0158	0.6997	-+?++	27.9	4.163	3	0.2444
6 : 82967906 : SNP	t	g	0.0173	0.0000	0.0173	0.0173	-0.0150	0.0485	0.7572	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 79215568 : SNP	t	c	0.2687	0.0157	0.2324	0.2890	0.0060	0.0111	0.5882	+-++?	0.0	2.903	3	0.4069
12 : 47904361 : SNP	a	t	0.9827	0.0000	0.9827	0.9827	-0.0120	0.0546	0.826	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 68104297 : SNP	a	g	0.3195	0.0095	0.3044	0.3374	0.0079	0.0092	0.3852	++--+	0.0	1.956	4	0.7439
19 : 3277094 : SNP	t	c	0.7719	0.0097	0.7466	0.7915	-0.0094	0.0104	0.367	-0-+-	0.0	3.421	4	0.49
8 : 3300844 : SNP	t	c	0.0284	0.0000	0.0284	0.0284	-0.0840	0.0384	0.02876	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 125542017 : SNP	a	g	0.9808	0.0000	0.9808	0.9808	0.0140	0.0445	0.7529	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 95885995 : SNP	a	g	0.9852	0.0000	0.9852	0.9852	0.0060	0.0596	0.9199	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 125157638 : INDEL	d	r	0.4514	0.0053	0.4439	0.4670	-0.0410	0.0116	0.0004139	-----	0.0	0.646	4	0.9578
4 : 125290498 : SNP	t	c	0.9041	0.0092	0.8985	0.9315	0.0243	0.0151	0.1081	+++++	0.0	1.797	4	0.7731
10 : 64931047 : INDEL	d	r	0.7661	0.0249	0.7059	0.7806	-0.0251	0.0105	0.01648	----+	0.0	2.550	4	0.6357
1 : 199139523 : SNP	t	c	0.9843	0.0000	0.9843	0.9843	0.0050	0.0495	0.9196	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 113845547 : SNP	a	c	0.9153	0.0092	0.9081	0.9290	0.0299	0.0173	0.08482	++?+-	0.0	1.978	3	0.5769
5 : 27672328 : SNP	c	g	0.7064	0.0181	0.6954	0.7655	0.0273	0.0100	0.006404	++--+	0.0	3.006	4	0.5569
3 : 14536735 : SNP	a	g	0.0193	0.0000	0.0193	0.0193	-0.0260	0.0536	0.6275	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 106505058 : SNP	a	g	0.0100	0.0000	0.0100	0.0100	0.0050	0.0637	0.9374	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 66749755 : SNP	a	g	0.5473	0.0071	0.5373	0.5532	-0.0093	0.0085	0.2775	--+-+	37.5	6.395	4	0.1715
5 : 174850622 : SNP	c	g	0.0399	0.0012	0.0383	0.0408	-0.0039	0.0266	0.8832	--???	0.0	0.003	1	0.9567
3 : 52496369 : SNP	c	g	0.9892	0.0000	0.9892	0.9892	-0.0030	0.0617	0.9612	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 83624964 : SNP	t	c	0.0113	0.0000	0.0113	0.0113	0.0480	0.0637	0.451	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 7455858 : SNP	a	c	0.8012	0.0080	0.7837	0.8089	0.0031	0.0110	0.7744	++-+-	34.7	6.124	4	0.1901
16 : 86127869 : SNP	a	g	0.4132	0.0229	0.3630	0.4284	0.0065	0.0087	0.451	+-+++	38.5	6.501	4	0.1647
18 : 73422547 : INDEL	d	r	0.0595	0.0069	0.0446	0.0671	-0.0363	0.0185	0.04941	--?+-	0.0	0.961	3	0.8108
11 : 117433686 : SNP	a	c	0.6722	0.0055	0.6488	0.6765	-0.0019	0.0091	0.838	++---	0.0	2.707	4	0.6079
14 : 35820643 : SNP	a	g	0.4170	0.0080	0.3954	0.4459	-0.0095	0.0085	0.2659	--+--	0.0	1.166	4	0.8837
13 : 28420532 : SNP	a	c	0.2703	0.0153	0.2430	0.2843	-0.0071	0.0095	0.4541	-+--+	0.0	2.555	4	0.6348
1 : 113037364 : SNP	c	g	0.0225	0.0000	0.0225	0.0225	-0.0120	0.0556	0.8291	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 25724335 : INDEL	d	r	0.2399	0.0183	0.1901	0.2551	-0.0084	0.0100	0.3978	+-++-	40.3	6.704	4	0.1524
2 : 193494292 : SNP	t	g	0.0486	0.0000	0.0486	0.0486	-0.0340	0.0445	0.4446	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 7417256 : SNP	t	c	0.3325	0.0092	0.3251	0.3714	0.0058	0.0091	0.5273	+-+-+	0.4	4.016	4	0.4038
3 : 33769820 : SNP	t	c	0.0140	0.0000	0.0140	0.0140	0.0900	0.0576	0.1183	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 72528499 : SNP	a	g	0.4738	0.0115	0.4586	0.4920	-0.0027	0.0085	0.7541	++---	0.0	2.436	4	0.6562
19 : 43234647 : SNP	a	t	0.0163	0.0000	0.0163	0.0163	-0.0060	0.0607	0.9212	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 125615464 : SNP	t	c	0.8164	0.0048	0.8076	0.8218	-0.0102	0.0110	0.3533	----+	0.0	0.666	4	0.9555
12 : 13599538 : SNP	a	g	0.5816	0.0210	0.5713	0.6366	-0.0037	0.0086	0.6632	+-+--	9.2	4.404	4	0.3541
2 : 45462638 : SNP	a	g	0.3026	0.0252	0.2432	0.3192	-0.0016	0.0093	0.8601	+-+++	1.4	4.058	4	0.3982
3 : 16946273 : INDEL	d	r	0.0410	0.0032	0.0325	0.0429	-0.0136	0.0229	0.5507	--??+	53.6	4.306	2	0.1161
16 : 88793823 : SNP	t	c	0.1203	0.0082	0.1146	0.1378	0.0258	0.0160	0.1063	++-++	0.0	1.311	4	0.8594
16 : 75391937 : SNP	t	c	0.4141	0.0096	0.3886	0.4404	-0.0039	0.0085	0.6516	-+-++	0.0	2.924	4	0.5707
19 : 22760939 : SNP	a	t	0.0729	0.0029	0.0705	0.0778	-0.0120	0.0188	0.5243	--?++	37.6	4.810	3	0.1862
4 : 116407582 : SNP	a	t	0.7280	0.0208	0.6861	0.7409	-0.0051	0.0097	0.6	+--+-	0.0	1.803	4	0.7719
18 : 48803644 : SNP	t	g	0.4289	0.0233	0.4080	0.4766	0.0028	0.0085	0.7387	+-+--	0.0	2.748	4	0.6008
10 : 18936646 : SNP	a	c	0.6469	0.0060	0.6334	0.6720	-0.0047	0.0091	0.6042	-++++	0.0	1.266	4	0.8671
16 : 24469940 : SNP	t	c	0.8144	0.0090	0.8023	0.8310	0.0052	0.0108	0.6341	+-++-	33.1	5.980	4	0.2006
20 : 17871333 : SNP	t	c	0.9005	0.0144	0.8703	0.9094	-0.0058	0.0143	0.6855	-+--+	0.0	2.574	4	0.6314
12 : 62053967 : SNP	t	c	0.9190	0.0080	0.9040	0.9237	0.0173	0.0191	0.3668	--?-+	64.3	8.394	3	0.03853
7 : 79188882 : SNP	t	c	0.9255	0.0123	0.9035	0.9336	-0.0031	0.0173	0.8557	--?++	3.9	3.122	3	0.3733
1 : 196149104 : SNP	t	c	0.1010	0.0073	0.0858	0.1283	-0.0293	0.0142	0.03961	--+--	57.8	9.485	4	0.05005
18 : 57558070 : INDEL	d	r	0.0974	0.0098	0.0657	0.1085	0.0165	0.0156	0.2905	++?-+	27.4	4.132	3	0.2475
11 : 51312323 : SNP	a	t	0.5361	0.0231	0.5221	0.5890	-0.0003	0.0086	0.9735	+--+-	32.8	5.956	4	0.2025
2 : 188794339 : SNP	a	g	0.0186	0.0000	0.0186	0.0186	0.0070	0.0455	0.8777	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 128218297 : SNP	a	g	0.2921	0.0143	0.2769	0.3226	-0.0170	0.0094	0.06916	--+--	0.0	1.309	4	0.8598
16 : 88885080 : SNP	t	c	0.3088	0.0189	0.2978	0.3654	-0.0099	0.0096	0.3018	--+++	24.1	5.270	4	0.2607
1 : 196818474 : SNP	t	c	0.0302	0.0000	0.0302	0.0302	0.0060	0.0536	0.9108	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 33867867 : SNP	a	g	0.0111	0.0000	0.0111	0.0111	-0.0030	0.0556	0.957	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 76931679 : SNP	a	g	0.5136	0.0121	0.4853	0.5286	0.0008	0.0085	0.9223	+-++-	45.1	7.292	4	0.1212
13 : 37714547 : SNP	t	c	0.0202	0.0000	0.0202	0.0202	0.0580	0.0435	0.1821	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 107056457 : SNP	a	t	0.2087	0.0298	0.1617	0.2439	-0.0134	0.0144	0.3494	---+?	0.0	2.533	3	0.4694
4 : 38856384 : SNP	a	g	0.5035	0.0234	0.4839	0.5528	-0.0008	0.0085	0.9233	-++--	0.0	3.782	4	0.4363
1 : 70116412 : INDEL	i	r	0.5852	0.0172	0.5502	0.6014	-0.0059	0.0099	0.5489	+-+--	0.0	2.658	4	0.6166
8 : 94070845 : SNP	c	g	0.0670	0.0032	0.0594	0.0700	-0.0291	0.0173	0.09189	--?--	0.0	0.733	3	0.8654
10 : 21342961 : INDEL	d	r	0.9085	0.0063	0.9027	0.9166	0.0162	0.0161	0.3125	-+?++	23.3	3.909	3	0.2715
10 : 48339911 : SNP	a	t	0.0426	0.0043	0.0399	0.0519	-0.0151	0.0241	0.5311	--??+	0.0	0.196	2	0.9065
3 : 166042723 : SNP	a	g	0.1651	0.0175	0.1513	0.2048	-0.0076	0.0117	0.5148	--+-+	0.0	1.850	4	0.7633
4 : 2021285 : SNP	t	c	0.5338	0.0091	0.5113	0.5502	-0.0061	0.0125	0.6218	----+	0.0	0.679	4	0.9539
7 : 84449359 : SNP	t	c	0.2323	0.0060	0.2292	0.2532	-0.0101	0.0100	0.3112	-+--+	63.6	10.985	4	0.02673
1 : 194122508 : SNP	t	c	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	0.0340	0.0445	0.4446	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 17720533 : SNP	a	c	0.9629	0.0000	0.9629	0.9629	-0.0190	0.0455	0.6762	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 35969890 : SNP	t	c	0.3044	0.0183	0.2920	0.3431	0.0122	0.0103	0.2384	-++++	23.0	5.197	4	0.2676
12 : 127768190 : SNP	t	c	0.2184	0.0137	0.1867	0.2344	-0.0117	0.0123	0.3417	---+-	20.0	4.998	4	0.2875
1 : 170283495 : SNP	c	g	0.1119	0.0043	0.1047	0.1177	0.0219	0.0141	0.1184	++-++	0.0	2.605	4	0.6259
10 : 119035474 : SNP	a	c	0.8356	0.0089	0.8186	0.8456	-0.0156	0.0119	0.1896	-++--	26.2	5.422	4	0.2467
18 : 45616828 : SNP	t	c	0.0357	0.0056	0.0322	0.0467	0.0178	0.0272	0.5135	+-??+	10.1	2.225	2	0.3287
10 : 120961606 : SNP	a	g	0.2044	0.0099	0.1984	0.2270	-0.0156	0.0108	0.1478	-----	0.0	1.294	4	0.8623
5 : 43480894 : SNP	t	c	0.4817	0.0168	0.4247	0.5007	0.0004	0.0085	0.9648	++---	27.5	5.514	4	0.2385
9 : 10098054 : SNP	t	c	0.9788	0.0000	0.9788	0.9788	0.0140	0.0465	0.7634	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 223594372 : SNP	a	g	0.1322	0.0060	0.1276	0.1493	0.0153	0.0125	0.2196	-+-+-	50.4	8.063	4	0.08928
4 : 115760387 : SNP	c	g	0.8450	0.0078	0.8376	0.8610	0.0107	0.0120	0.3714	-++++	0.0	3.512	4	0.4761
21 : 34202997 : SNP	a	t	0.8901	0.0097	0.8710	0.9000	0.0078	0.0138	0.5727	+++--	0.6	4.023	4	0.4029
13 : 109075521 : INDEL	i	r	0.1130	0.0050	0.1076	0.1319	0.0302	0.0134	0.02463	+++-+	0.0	3.503	4	0.4774
16 : 10522172 : SNP	t	g	0.9830	0.0000	0.9830	0.9830	0.0460	0.0516	0.3723	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 21504427 : SNP	a	g	0.9600	0.0007	0.9590	0.9609	0.0031	0.0227	0.8917	-+??-	0.0	0.766	2	0.682
17 : 13518794 : SNP	t	c	0.7160	0.0074	0.7013	0.7240	-0.0037	0.0099	0.7074	--+--	0.0	1.618	4	0.8055
13 : 63514879 : INDEL	i	r	0.3017	0.0080	0.2824	0.3168	0.0085	0.0094	0.3615	+++-+	9.5	4.418	4	0.3524
19 : 55069620 : INDEL	i	r	0.0799	0.0012	0.0783	0.0808	-0.0377	0.0319	0.2364	-???-	0.0	0.236	1	0.6273
9 : 35949558 : SNP	t	c	0.8849	0.0061	0.8781	0.9145	0.0117	0.0135	0.3849	+++-+	0.0	3.076	4	0.5453
6 : 32589000 : INDEL	i	r	0.2930	0.0152	0.2581	0.3017	-0.0297	0.0202	0.1416	??+--	0.0	1.533	2	0.4645
6 : 79280131 : SNP	t	c	0.0115	0.0000	0.0115	0.0115	0.0050	0.0586	0.932	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 20863142 : SNP	c	g	0.3513	0.0150	0.3113	0.3703	0.0124	0.0094	0.1877	++-+-	0.0	3.349	4	0.5013
3 : 174841750 : SNP	a	t	0.5163	0.0174	0.4993	0.5438	-0.0163	0.0091	0.07395	--+--	52.1	8.347	4	0.07967
2 : 45164060 : SNP	a	t	0.9865	0.0000	0.9865	0.9865	-0.0330	0.0556	0.5528	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 125542513 : SNP	t	g	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	-0.0150	0.0445	0.7359	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 135047919 : SNP	c	g	0.7340	0.0304	0.6721	0.7569	-0.0113	0.0098	0.2488	--+-+	41.1	6.789	4	0.1475
10 : 129519438 : SNP	t	c	0.1712	0.0077	0.1658	0.1866	0.0144	0.0112	0.2005	++-+-	31.7	5.853	4	0.2104
15 : 102105793 : SNP	t	g	0.0758	0.0083	0.0543	0.0845	-0.0317	0.0166	0.05563	--?--	9.6	3.319	3	0.345
11 : 123781044 : SNP	a	g	0.6901	0.0185	0.6579	0.7378	-0.0139	0.0092	0.1316	--+++	0.0	2.001	4	0.7356
3 : 175021433 : SNP	t	c	0.1257	0.0109	0.1191	0.1487	-0.0067	0.0136	0.6225	+----	2.7	4.112	4	0.391
3 : 113176915 : SNP	t	c	0.0118	0.0000	0.0118	0.0118	-0.0350	0.0556	0.529	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 142228095 : SNP	a	t	0.3772	0.0201	0.3227	0.4056	-0.0035	0.0112	0.7511	-+---	3.7	4.155	4	0.3854
11 : 84485668 : SNP	c	g	0.5079	0.0072	0.4967	0.5182	0.0036	0.0086	0.6698	-+-++	0.0	1.898	4	0.7546
19 : 58643841 : SNP	a	g	0.1853	0.0051	0.1781	0.1970	-0.0079	0.0113	0.4834	+-+-+	44.4	7.191	4	0.1261
18 : 3331417 : SNP	a	t	0.4174	0.0096	0.4019	0.4266	0.0147	0.0086	0.08688	++-+-	0.0	2.966	4	0.5636
7 : 51765492 : SNP	t	c	0.2111	0.0094	0.2020	0.2239	0.0002	0.0105	0.9842	++-+-	0.0	1.588	4	0.8109
15 : 52601189 : SNP	t	c	0.3166	0.0215	0.2972	0.3704	-0.0053	0.0094	0.5684	-++--	46.1	7.423	4	0.1152
9 : 24531881 : SNP	t	c	0.0388	0.0010	0.0376	0.0397	0.0116	0.0236	0.6234	-+??-	70.5	6.779	2	0.03373
11 : 44793623 : SNP	t	c	0.0316	0.0000	0.0316	0.0316	0.0770	0.0505	0.1276	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 62894657 : SNP	t	c	0.4365	0.0187	0.4204	0.4713	0.0097	0.0089	0.2731	++---	37.2	6.372	4	0.173
6 : 10297504 : SNP	a	t	0.5267	0.0199	0.4819	0.5405	-0.0030	0.0085	0.7259	+--+-	0.0	0.888	4	0.9263
1 : 160657058 : INDEL	d	r	0.3309	0.0172	0.3166	0.3866	-0.0020	0.0130	0.8803	+-+-+	47.5	7.614	4	0.1068
2 : 18639426 : SNP	a	g	0.0203	0.0000	0.0203	0.0203	0.0420	0.0435	0.3339	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 55296211 : SNP	t	g	0.1917	0.0023	0.1826	0.1935	0.0033	0.0119	0.78	--++?	0.0	1.500	3	0.6824
11 : 108918938 : SNP	a	g	0.0724	0.0064	0.0672	0.0815	0.0059	0.0170	0.7268	+-?--	0.0	1.305	3	0.7279
10 : 33812395 : SNP	t	g	0.8165	0.0056	0.8120	0.8304	-0.0065	0.0113	0.5617	-+-+-	0.0	2.665	4	0.6153
8 : 140336879 : SNP	a	c	0.2243	0.0076	0.2201	0.2394	-0.0342	0.0324	0.2907	??-+-	21.7	2.556	2	0.2786
12 : 7762328 : SNP	t	c	0.0233	0.0000	0.0233	0.0233	0.0010	0.0475	0.9832	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 55335482 : SNP	a	g	0.9105	0.0155	0.8812	0.9332	-0.0003	0.0181	0.9886	-+?+-	69.2	9.749	3	0.02083
9 : 104351338 : SNP	t	c	0.0691	0.0031	0.0613	0.0721	-0.0307	0.0173	0.07675	-+?--	5.8	3.186	3	0.3639
2 : 2110503 : SNP	t	c	0.7551	0.0200	0.7362	0.8004	0.0133	0.0105	0.2036	++++-	0.0	2.528	4	0.6396
12 : 98313546 : SNP	t	c	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	0.0400	0.0637	0.5299	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 40470086 : SNP	t	c	0.6862	0.0115	0.6488	0.6931	-0.0081	0.0091	0.3731	--+-+	0.0	2.820	4	0.5883
1 : 81398341 : INDEL	d	r	0.0744	0.0157	0.0634	0.1068	-0.0047	0.0170	0.7826	-+?-+	21.0	3.798	3	0.2841
6 : 9690843 : SNP	a	g	0.8543	0.0092	0.8346	0.8635	-0.0030	0.0120	0.8019	+---+	0.0	2.726	4	0.6047
11 : 116870766 : SNP	a	g	0.2482	0.0081	0.2366	0.2698	-0.0105	0.0100	0.2899	--+--	0.0	2.988	4	0.5598
6 : 77458882 : SNP	a	g	0.8025	0.0130	0.7693	0.8200	0.0104	0.0114	0.3606	+++--	0.0	1.531	4	0.8211
14 : 24211330 : SNP	a	c	0.1112	0.0057	0.1049	0.1171	-0.0091	0.0142	0.5219	-+--+	0.0	3.046	4	0.5502
1 : 62642299 : SNP	a	g	0.0558	0.0036	0.0514	0.0665	-0.0177	0.0203	0.3835	--?--	0.0	0.524	3	0.9136
2 : 136222634 : SNP	a	g	0.9156	0.0306	0.8574	0.9405	-0.0230	0.0162	0.1552	-----	0.0	1.381	4	0.8476
8 : 59801049 : SNP	t	c	0.5922	0.0089	0.5854	0.6223	-0.0111	0.0085	0.1928	--+--	0.0	0.290	4	0.9904
1 : 59901944 : SNP	t	c	0.5685	0.0219	0.5376	0.6133	-0.0028	0.0086	0.7461	----+	0.0	0.333	4	0.9876
6 : 48630130 : SNP	c	g	0.1364	0.0085	0.1027	0.1411	-0.0032	0.0126	0.8014	-+-+-	0.0	2.115	4	0.7145
3 : 113955320 : SNP	t	c	0.6228	0.0119	0.6044	0.6314	-0.0048	0.0085	0.5764	0---+	0.0	0.760	4	0.9437
22 : 23938606 : INDEL	d	r	0.4024	0.0046	0.3978	0.4102	0.0068	0.0095	0.4761	+--?+	0.0	2.090	3	0.5539
1 : 158172964 : SNP	a	g	0.8756	0.0086	0.8705	0.8970	0.0193	0.0132	0.1428	++--+	0.0	2.390	4	0.6644
17 : 40237595 : SNP	a	t	0.4562	0.0309	0.3983	0.4908	-0.0015	0.0099	0.88	-++--	68.9	12.855	4	0.012
18 : 65876793 : SNP	c	g	0.7708	0.0076	0.7595	0.7995	0.0255	0.0103	0.01352	+++++	0.0	1.499	4	0.8269
11 : 121688837 : SNP	a	t	0.9268	0.0165	0.9006	0.9433	0.0004	0.0193	0.9851	-+?+-	0.0	1.571	3	0.6659
6 : 118148148 : SNP	a	g	0.2108	0.0214	0.1864	0.2495	-0.0156	0.0106	0.1417	-+---	7.3	4.317	4	0.3648
4 : 49173669 : SNP	t	c	0.5305	0.0112	0.5197	0.5422	0.0244	0.0392	0.5335	??+-?	0.0	0.561	1	0.4539
2 : 14537149 : SNP	a	t	0.9534	0.0044	0.9504	0.9641	-0.0529	0.0215	0.01372	--??+	36.6	3.155	2	0.2065
6 : 74872584 : SNP	a	t	0.1118	0.0084	0.0924	0.1184	0.0109	0.0158	0.4895	+-+-+	22.1	5.132	4	0.274
7 : 4411496 : SNP	t	c	0.7785	0.0097	0.7645	0.7875	0.0002	0.0104	0.982	+--+-	0.0	2.848	4	0.5835
9 : 124172288 : SNP	t	g	0.6977	0.0154	0.6862	0.7525	-0.0005	0.0092	0.9574	+----	0.0	1.521	4	0.823
6 : 45468074 : SNP	t	g	0.7863	0.0064	0.7715	0.7927	0.0167	0.0104	0.1076	+++++	0.0	2.068	4	0.7233
1 : 1012517 : SNP	t	c	0.6171	0.0195	0.5714	0.6286	0.0352	0.0242	0.1449	??+++	0.0	1.113	2	0.5732
2 : 52667944 : SNP	a	c	0.7661	0.0106	0.7534	0.7863	0.0008	0.0099	0.9379	+0--+	0.0	0.830	4	0.9344
4 : 101494746 : SNP	t	g	0.7144	0.0162	0.6932	0.7525	0.0017	0.0093	0.8553	+--+-	38.5	6.500	4	0.1648
12 : 63868399 : SNP	a	g	0.6574	0.0167	0.6406	0.7076	-0.0001	0.0092	0.9873	----+	0.0	3.486	4	0.48
1 : 191645302 : SNP	a	g	0.9836	0.0000	0.9836	0.9836	0.0300	0.0556	0.5895	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 29791859 : SNP	t	c	0.0439	0.0018	0.0413	0.0454	-0.0102	0.0226	0.6524	+-??-	0.0	0.649	2	0.7229
1 : 29815348 : SNP	t	c	0.0101	0.0000	0.0101	0.0101	0.0100	0.0637	0.8752	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 221659549 : SNP	t	c	0.4078	0.0082	0.3975	0.4254	-0.0024	0.0085	0.778	+---+	0.0	1.369	4	0.8496
4 : 103448525 : SNP	a	c	0.9497	0.0042	0.9466	0.9606	-0.0170	0.0206	0.4095	+-??-	61.0	5.131	2	0.07686
8 : 6183831 : SNP	t	g	0.8631	0.0089	0.8569	0.8850	0.0150	0.0125	0.2291	+++-+	0.0	1.628	4	0.8038
15 : 41511092 : SNP	t	c	0.9421	0.0047	0.9367	0.9517	0.0358	0.0191	0.06097	+-??+	4.0	2.084	2	0.3528
1 : 43575602 : SNP	t	c	0.0934	0.0045	0.0761	0.1014	0.0055	0.0151	0.7169	++-+-	0.0	0.847	4	0.932
2 : 14279741 : SNP	a	t	0.0132	0.0000	0.0132	0.0132	0.1010	0.0627	0.1071	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 64610596 : SNP	t	c	0.9572	0.0041	0.9525	0.9608	-0.0045	0.0236	0.8482	-+???	0.0	0.212	1	0.645
5 : 45636786 : SNP	a	c	0.2724	0.0161	0.2200	0.2823	0.0012	0.0098	0.9006	+--++	0.0	1.360	4	0.8511
3 : 154230084 : SNP	t	c	0.0737	0.0103	0.0677	0.0926	0.0040	0.0171	0.8136	++?+-	0.0	1.131	3	0.7695
17 : 48195335 : SNP	a	g	0.0135	0.0000	0.0135	0.0135	0.0740	0.0586	0.2069	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 57651876 : INDEL	d	r	0.0198	0.0000	0.0198	0.0198	0.0040	0.0516	0.9382	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 139940926 : SNP	a	g	0.8263	0.0141	0.7947	0.8334	0.0182	0.0111	0.1026	+++-+	0.0	1.832	4	0.7666
3 : 153394998 : SNP	t	c	0.3569	0.0100	0.3474	0.3798	0.0124	0.0089	0.1655	+-++-	0.0	3.994	4	0.4068
2 : 68622952 : SNP	c	g	0.4566	0.0079	0.4523	0.4922	0.0141	0.0085	0.09949	++--+	49.7	7.956	4	0.0932
3 : 178741462 : SNP	t	c	0.8179	0.0184	0.8091	0.8602	-0.0339	0.0113	0.002786	---+-	42.9	7.005	4	0.1356
14 : 54398753 : SNP	t	c	0.3707	0.0079	0.3627	0.3817	-0.0081	0.0090	0.3684	-----	0.0	2.354	4	0.671
3 : 135986938 : INDEL	i	r	0.3790	0.0327	0.3446	0.4286	0.0072	0.0097	0.4614	++++-	0.0	1.592	4	0.8102
4 : 5789229 : SNP	t	c	0.1010	0.0123	0.0627	0.1101	-0.0103	0.0149	0.49	--+?+	0.0	2.121	3	0.5476
16 : 50449561 : SNP	c	g	0.9821	0.0000	0.9821	0.9821	0.1000	0.0566	0.07731	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 66568679 : SNP	a	c	0.1448	0.0078	0.1302	0.1542	-0.0236	0.0121	0.05048	-----	0.0	1.714	4	0.7882
5 : 58081489 : SNP	a	c	0.2242	0.0073	0.2138	0.2349	0.0153	0.0104	0.141	++-++	0.0	3.572	4	0.467
7 : 2155615 : INDEL	i	r	0.2106	0.0070	0.2047	0.2236	-0.0047	0.0106	0.6564	-++-+	27.2	5.496	4	0.2401
18 : 66326742 : SNP	a	g	0.8899	0.0247	0.8427	0.9127	-0.0087	0.0138	0.5298	--++-	0.0	1.330	4	0.8562
5 : 89637473 : SNP	t	g	0.5993	0.0157	0.5846	0.6361	0.0120	0.0086	0.1622	+-+++	19.2	4.952	4	0.2922
5 : 44187283 : SNP	a	t	0.0641	0.0045	0.0595	0.0727	0.0161	0.0238	0.5002	+-??-	60.7	5.085	2	0.07866
11 : 57797192 : SNP	a	g	0.7125	0.0094	0.7041	0.7341	-0.0120	0.0092	0.1931	-----	0.0	0.286	4	0.9907
10 : 109451167 : SNP	t	c	0.2100	0.0112	0.1832	0.2165	0.0008	0.0107	0.9403	-++--	0.0	2.728	4	0.6043
5 : 5031963 : SNP	t	c	0.3928	0.0212	0.3291	0.4033	0.0108	0.0089	0.2288	++-++	0.0	1.104	4	0.8936
18 : 72987524 : SNP	t	c	0.5579	0.0064	0.5394	0.5657	-0.0009	0.0087	0.9176	0++--	0.0	2.702	4	0.6089
1 : 64093854 : SNP	a	t	0.1221	0.0069	0.1183	0.1383	-0.0051	0.0142	0.7207	--?++	51.8	6.229	3	0.101
8 : 13685696 : SNP	c	g	0.5130	0.0104	0.4878	0.5265	0.0038	0.0085	0.6578	++---	0.0	1.605	4	0.8079
12 : 52860685 : SNP	t	c	0.6255	0.0090	0.6178	0.6463	0.0130	0.0089	0.1447	++-++	0.0	1.180	4	0.8813
21 : 25219511 : SNP	a	c	0.1062	0.0088	0.0919	0.1151	-0.0053	0.0144	0.7103	-+---	0.0	1.665	4	0.797
14 : 44715997 : SNP	t	c	0.9664	0.0024	0.9640	0.9688	0.0053	0.0254	0.8357	++??-	0.0	1.857	2	0.3952
6 : 152564752 : SNP	a	g	0.0833	0.0075	0.0775	0.1010	-0.0019	0.0157	0.9022	--++-	0.0	2.682	4	0.6123
16 : 4929392 : SNP	a	g	0.8430	0.0247	0.7925	0.8603	-0.0019	0.0117	0.8725	-++-+	16.4	4.786	4	0.31
7 : 46955822 : SNP	c	g	0.6754	0.0131	0.6308	0.7002	-0.0099	0.0092	0.2793	---++	0.0	2.838	4	0.5853
2 : 35640139 : SNP	a	g	0.8693	0.0044	0.8526	0.8717	-0.0017	0.0139	0.9029	+--+-	0.0	1.921	4	0.7503
2 : 188245890 : SNP	a	g	0.6683	0.0154	0.6527	0.6845	0.0031	0.0092	0.7369	++---	0.0	1.654	4	0.799
13 : 82082152 : INDEL	i	r	0.0252	0.0000	0.0252	0.0252	-0.0190	0.0546	0.7278	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 194599350 : SNP	t	c	0.0162	0.0000	0.0162	0.0162	-0.0100	0.0536	0.8519	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 122686440 : SNP	a	g	0.6206	0.0142	0.5847	0.6292	-0.0041	0.0091	0.6496	+-++-	53.5	8.608	4	0.07169
2 : 169536085 : SNP	t	c	0.5337	0.0178	0.5208	0.5746	-0.0022	0.0086	0.7982	+----	0.0	1.041	4	0.9036
4 : 58874167 : SNP	t	c	0.5829	0.0030	0.5732	0.5933	-0.0083	0.0089	0.351	--+-+	0.0	2.650	4	0.618
5 : 51075745 : SNP	a	t	0.9236	0.0029	0.9174	0.9255	0.0522	0.0166	0.001645	++?++	0.0	1.958	3	0.5811
4 : 148356429 : SNP	t	c	0.4240	0.0264	0.3832	0.4478	0.0085	0.0102	0.4064	+--++	0.0	3.876	4	0.423
3 : 174773546 : SNP	t	c	0.0220	0.0000	0.0220	0.0220	-0.0230	0.0455	0.6131	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 77682338 : SNP	a	c	0.9831	0.0000	0.9831	0.9831	-0.0200	0.0475	0.6738	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 117186592 : SNP	a	t	0.2336	0.0201	0.1883	0.2537	-0.0059	0.0100	0.5536	-+-+-	15.3	4.724	4	0.3168
20 : 34368442 : SNP	t	c	0.0307	0.0022	0.0296	0.0355	0.0179	0.0259	0.4907	+-??+	19.1	2.474	2	0.2903
20 : 54522965 : SNP	t	g	0.0218	0.0000	0.0218	0.0218	-0.0110	0.0425	0.7956	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 20379236 : SNP	t	c	0.8987	0.0019	0.8919	0.9037	0.0258	0.0143	0.07182	++-++	0.0	2.936	4	0.5686
12 : 56445680 : SNP	t	c	0.0830	0.0056	0.0698	0.0856	0.0012	0.0161	0.9425	+-?+-	13.6	3.473	3	0.3243
5 : 116610207 : SNP	t	c	0.3373	0.0140	0.3270	0.3793	0.0133	0.0091	0.1426	+-++-	5.7	4.244	4	0.374
22 : 45573154 : SNP	t	c	0.5315	0.0106	0.5149	0.5584	-0.0027	0.0085	0.7499	+-+--	0.0	2.731	4	0.6039
13 : 47040924 : SNP	a	c	0.0592	0.0005	0.0584	0.0595	0.0017	0.0336	0.9595	-???+	0.0	0.032	1	0.8576
6 : 87235122 : SNP	t	c	0.0199	0.0000	0.0199	0.0199	0.1440	0.0526	0.006154	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 14245337 : SNP	t	c	0.1825	0.0057	0.1579	0.1857	0.0109	0.0112	0.329	++-++	0.0	1.372	4	0.849
2 : 32981228 : SNP	t	c	0.0565	0.0042	0.0521	0.0618	0.0174	0.0188	0.3546	-+?++	0.0	2.053	3	0.5615
5 : 34466988 : SNP	t	c	0.3931	0.0161	0.3613	0.4309	0.0034	0.0086	0.6956	++--+	0.0	2.782	4	0.5949
12 : 112961739 : SNP	c	g	0.9066	0.0066	0.9030	0.9221	-0.0039	0.0149	0.7935	-+---	0.0	1.550	4	0.8178
22 : 40395530 : SNP	c	g	0.7309	0.0122	0.7152	0.7630	-0.0037	0.0099	0.7062	+-+--	0.0	2.731	4	0.6037
6 : 26747827 : SNP	c	g	0.4177	0.0174	0.3872	0.4437	0.0012	0.0208	0.9543	??--+	0.0	0.322	2	0.8511
4 : 179918390 : SNP	a	c	0.3368	0.0116	0.3114	0.3726	-0.0087	0.0092	0.3415	--+-+	7.4	4.319	4	0.3645
5 : 128996128 : SNP	a	g	0.0848	0.0073	0.0616	0.0917	-0.0189	0.0149	0.2026	---+-	0.0	0.678	4	0.9541
6 : 23620356 : SNP	a	g	0.7784	0.0200	0.7552	0.8102	0.0377	0.0157	0.01642	++--+	51.0	8.171	4	0.08551
19 : 6937011 : SNP	t	c	0.2656	0.0279	0.2470	0.3210	0.0169	0.0099	0.08654	++-++	0.0	3.171	4	0.5297
3 : 8299534 : INDEL	i	r	0.0226	0.0000	0.0226	0.0226	-0.0880	0.0566	0.1201	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 230282997 : SNP	a	c	0.8031	0.0036	0.8001	0.8144	-0.0078	0.0107	0.4688	-----	0.0	1.077	4	0.8979
4 : 149526501 : SNP	a	g	0.9552	0.0013	0.9535	0.9571	0.0420	0.0215	0.05033	++??-	0.0	1.954	2	0.3765
8 : 139716961 : SNP	t	g	0.5309	0.0063	0.5214	0.5516	-0.0007	0.0092	0.9392	-++-+	0.0	0.997	4	0.9103
11 : 90518158 : SNP	a	g	0.4912	0.0115	0.4798	0.5044	-0.0045	0.0085	0.5944	---+-	0.0	0.337	4	0.9873
1 : 40180565 : SNP	t	c	0.1192	0.0065	0.1138	0.1341	0.0083	0.0132	0.5299	-++++	0.0	2.263	4	0.6876
16 : 82148819 : SNP	a	g	0.4835	0.0144	0.4718	0.5117	-0.0087	0.0085	0.3056	-----	0.0	0.393	4	0.9831
6 : 114517186 : SNP	t	c	0.2150	0.0217	0.2024	0.2623	-0.0156	0.0105	0.1355	--+-+	0.0	2.459	4	0.6521
11 : 132704515 : SNP	a	g	0.2891	0.0212	0.2485	0.3171	-0.0157	0.0096	0.1038	---+-	24.1	5.270	4	0.2607
2 : 82025695 : SNP	t	c	0.0529	0.0035	0.0437	0.0542	0.0187	0.0197	0.3418	++??+	0.0	0.213	2	0.8991
2 : 68245308 : SNP	a	g	0.9597	0.0053	0.9503	0.9654	0.0471	0.0243	0.05295	+-??+	33.6	3.012	2	0.2218
3 : 55230215 : SNP	a	c	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	0.0740	0.0485	0.1272	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 73068585 : SNP	t	c	0.6975	0.0313	0.6347	0.7163	-0.0022	0.0096	0.815	+-+--	0.0	2.979	4	0.5613
10 : 81797031 : SNP	c	g	0.1001	0.0125	0.0850	0.1324	-0.0263	0.0145	0.06961	--+-+	20.7	5.046	4	0.2826
11 : 39507547 : SNP	a	t	0.0186	0.0000	0.0186	0.0186	-0.0070	0.0516	0.892	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 210779545 : SNP	t	c	0.0849	0.0076	0.0785	0.1021	0.0092	0.0160	0.5668	-+?++	0.0	0.965	3	0.8098
18 : 62166285 : SNP	a	g	0.4357	0.0214	0.3879	0.4501	0.0087	0.0086	0.3111	+++++	0.0	0.224	4	0.9942
1 : 223630129 : SNP	t	c	0.0588	0.0099	0.0530	0.0800	0.0209	0.0192	0.2765	++?++	0.0	1.603	3	0.6588
11 : 34471665 : INDEL	i	r	0.0557	0.0070	0.0366	0.0608	0.0284	0.0196	0.148	-+??+	45.6	3.674	2	0.1593
4 : 71160899 : SNP	t	c	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	-0.0490	0.0576	0.3951	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 81144727 : SNP	t	c	0.8365	0.0192	0.7888	0.8564	-0.0001	0.0114	0.9948	+---+	51.7	8.288	4	0.08157
13 : 55622263 : SNP	t	c	0.6575	0.0138	0.6246	0.6719	0.0111	0.0091	0.2233	+--++	17.4	4.841	4	0.304
7 : 2314627 : INDEL	d	r	0.9652	0.0069	0.9518	0.9692	-0.0553	0.0247	0.02505	-+??-	77.1	8.747	2	0.01261
4 : 167979867 : SNP	a	g	0.9637	0.0024	0.9617	0.9682	0.0058	0.0242	0.8095	++??+	0.0	0.090	2	0.9561
6 : 73055228 : SNP	c	g	0.7218	0.0135	0.7065	0.7668	-0.0059	0.0093	0.5277	-+---	42.1	6.907	4	0.1409
8 : 68289466 : SNP	t	c	0.0216	0.0000	0.0216	0.0216	0.0580	0.0485	0.232	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 125421169 : SNP	a	c	0.9691	0.0015	0.9680	0.9712	-0.0075	0.0270	0.781	+-???	45.5	1.834	1	0.1756
21 : 31815022 : SNP	a	g	0.0369	0.0025	0.0348	0.0399	-0.0031	0.0273	0.9082	+-???	0.0	0.652	1	0.4192
3 : 98739257 : SNP	a	g	0.9447	0.0015	0.9414	0.9456	0.0447	0.0206	0.02975	++??+	0.0	0.287	2	0.8663
9 : 113721301 : SNP	t	c	0.1023	0.0056	0.0895	0.1103	-0.0182	0.0143	0.2028	---+-	0.0	1.153	4	0.8858
13 : 85274669 : SNP	c	g	0.4058	0.0085	0.3835	0.4115	-0.0127	0.0086	0.1382	--+++	0.0	2.178	4	0.703
7 : 70424680 : SNP	t	c	0.7990	0.0274	0.7738	0.8465	0.0043	0.0153	0.7803	-++-+	28.5	5.595	4	0.2315
20 : 52424998 : SNP	t	g	0.3826	0.0136	0.3527	0.4099	0.0029	0.0091	0.7501	-+-++	0.0	0.582	4	0.965
16 : 84752463 : SNP	a	g	0.0452	0.0064	0.0401	0.0574	0.0130	0.0240	0.5896	+-??+	0.0	0.488	2	0.7834
1 : 95419193 : SNP	t	c	0.0937	0.0037	0.0824	0.1007	-0.0093	0.0144	0.5205	----+	0.0	1.901	4	0.754
2 : 84672683 : SNP	t	c	0.9900	0.0000	0.9900	0.9900	-0.0130	0.0657	0.8432	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 83353221 : SNP	t	c	0.7194	0.0085	0.7061	0.7275	-0.0099	0.0099	0.3182	-----	0.0	2.978	4	0.5615
2 : 235381169 : SNP	t	c	0.4315	0.0237	0.3775	0.4435	0.0005	0.0086	0.9533	++--+	0.0	3.784	4	0.4361
7 : 4147668 : SNP	t	c	0.4910	0.0150	0.4762	0.5119	-0.0028	0.0099	0.7806	---++	0.0	0.732	4	0.9474
2 : 59791393 : SNP	a	t	0.2086	0.0146	0.1620	0.2203	-0.0112	0.0109	0.3029	---+-	29.8	5.696	4	0.223
10 : 65479890 : SNP	a	g	0.3069	0.0157	0.2692	0.3164	-0.0094	0.0093	0.3104	--+--	0.0	0.603	4	0.9627
2 : 191690783 : SNP	t	c	0.2477	0.0135	0.2375	0.2829	0.0061	0.0098	0.5298	-+++-	0.0	3.904	4	0.4192
19 : 35188287 : SNP	c	g	0.0396	0.0000	0.0396	0.0396	-0.0250	0.0384	0.5152	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 134342175 : SNP	t	g	0.4082	0.0133	0.3976	0.4483	-0.0023	0.0086	0.7837	+++--	0.0	1.404	4	0.8435
21 : 45334108 : SNP	t	c	0.0138	0.0000	0.0138	0.0138	-0.0860	0.0627	0.17	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 156495011 : SNP	t	g	0.9253	0.0151	0.9007	0.9378	-0.0024	0.0188	0.8993	+-?--	0.0	1.450	3	0.694
8 : 53037423 : INDEL	i	r	0.1656	0.0118	0.1548	0.1818	0.0172	0.0117	0.1418	++-++	23.1	5.202	4	0.2672
6 : 19191046 : SNP	t	c	0.9085	0.0128	0.8969	0.9250	0.0037	0.0171	0.8295	+-?-+	6.1	3.193	3	0.3627
18 : 455276 : SNP	t	c	0.2242	0.0061	0.2147	0.2295	0.0099	0.0102	0.3307	-++-+	23.0	5.193	4	0.2681
14 : 20323037 : SNP	a	g	0.5772	0.0000	0.5772	0.5772	0.0345	0.0612	0.5729	???+?	0.0	0.000	0	1
2 : 149892374 : SNP	t	c	0.3835	0.0177	0.3346	0.4014	-0.0194	0.0090	0.03097	----+	10.3	4.457	4	0.3476
3 : 133784988 : SNP	t	c	0.8539	0.0071	0.8477	0.8734	0.0050	0.0127	0.6952	+---+	0.0	2.997	4	0.5583
10 : 38537203 : SNP	t	g	0.0556	0.0090	0.0520	0.0822	-0.0100	0.0234	0.669	+-?+?	1.6	2.033	2	0.3619
1 : 219613301 : INDEL	d	r	0.3050	0.0041	0.2994	0.3192	0.0096	0.0098	0.3271	+---+	0.0	3.214	4	0.5227
1 : 79681014 : SNP	a	g	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	-0.0260	0.0505	0.607	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 91693538 : SNP	a	g	0.1040	0.0074	0.0908	0.1127	-0.0033	0.0153	0.8297	--+-+	0.0	2.344	4	0.6728
7 : 15057728 : SNP	a	g	0.4365	0.0102	0.4062	0.4481	0.0102	0.0085	0.2308	+++-+	0.0	0.979	4	0.9129
15 : 40855901 : INDEL	d	r	0.2255	0.0112	0.1959	0.2387	-0.0008	0.0119	0.9453	-+-++	0.0	1.643	4	0.801
12 : 123196078 : SNP	c	g	0.9299	0.0082	0.9207	0.9407	-0.0154	0.0233	0.5076	+-?-+	0.0	1.446	3	0.6949
2 : 187055061 : SNP	a	g	0.8946	0.0116	0.8705	0.9014	-0.0163	0.0140	0.2438	----+	0.0	2.063	4	0.7242
7 : 86642095 : SNP	t	g	0.6872	0.0107	0.6784	0.7197	-0.0003	0.0092	0.9746	-++-+	20.9	5.057	4	0.2815
17 : 75922557 : SNP	t	c	0.1043	0.0098	0.0815	0.1159	0.0018	0.0139	0.895	+++--	0.0	1.607	4	0.8075
20 : 5468355 : SNP	a	g	0.8324	0.0180	0.7956	0.8486	-0.0030	0.0115	0.7967	++-+-	33.4	6.009	4	0.1985
5 : 136288106 : INDEL	d	r	0.0265	0.0000	0.0265	0.0265	-0.0320	0.0414	0.4401	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 116900032 : SNP	a	g	0.4685	0.0066	0.4556	0.4750	-0.0004	0.0085	0.9609	++---	0.0	3.175	4	0.529
6 : 163135652 : SNP	t	c	0.2158	0.0059	0.1948	0.2223	0.0031	0.0105	0.7651	++--+	0.0	0.170	4	0.9966
8 : 131788920 : SNP	t	c	0.0484	0.0041	0.0453	0.0537	0.0092	0.0232	0.6931	+-???	55.5	2.248	1	0.1337
2 : 35897038 : SNP	t	c	0.6118	0.0017	0.6113	0.6192	-0.0009	0.0089	0.9181	-++-+	0.0	2.389	4	0.6646
4 : 150993704 : SNP	t	c	0.8041	0.0114	0.7796	0.8173	-0.0093	0.0110	0.3976	-----	0.0	2.569	4	0.6324
9 : 26084723 : SNP	t	c	0.9680	0.0011	0.9666	0.9689	0.0065	0.0283	0.8192	+-???	62.9	2.692	1	0.1008
16 : 78082906 : SNP	a	g	0.3735	0.0107	0.3674	0.3974	-0.0009	0.0091	0.9195	0++--	0.0	1.173	4	0.8824
11 : 116570968 : SNP	a	c	0.4092	0.0132	0.3676	0.4233	-0.0028	0.0086	0.744	+-+-+	0.0	2.905	4	0.5738
3 : 60486579 : SNP	a	g	0.6805	0.0039	0.6716	0.6853	-0.0101	0.0093	0.2779	---+-	0.0	2.210	4	0.6971
8 : 138112067 : SNP	a	t	0.6691	0.0085	0.6543	0.6771	0.0072	0.0092	0.4346	+-++-	32.1	5.894	4	0.2072
8 : 99929455 : SNP	a	c	0.1647	0.0046	0.1612	0.1782	-0.0085	0.0116	0.4646	+-+--	0.0	2.514	4	0.6421
17 : 71675946 : SNP	t	c	0.1015	0.0020	0.0974	0.1064	-0.0003	0.0141	0.9822	00+-+	0.0	0.074	4	0.9993
14 : 95127324 : SNP	t	c	0.1342	0.0169	0.1226	0.1693	-0.0148	0.0125	0.2375	+----	0.0	2.850	4	0.5832
12 : 83378937 : SNP	a	g	0.9650	0.0000	0.9650	0.9650	-0.0250	0.0414	0.5464	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 13249140 : SNP	a	g	0.0863	0.0078	0.0751	0.0994	0.0118	0.0163	0.4669	+-?-+	24.2	3.960	3	0.2658
12 : 38317803 : SNP	t	c	0.5118	0.0350	0.4735	0.5576	-0.0058	0.0094	0.5327	+--+-	14.9	4.700	4	0.3195
19 : 7233301 : SNP	a	g	0.6591	0.0159	0.6312	0.6950	-0.0078	0.0092	0.3943	-+++-	3.0	4.122	4	0.3897
18 : 62379435 : SNP	a	g	0.9857	0.0000	0.9857	0.9857	-0.0700	0.0495	0.1576	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 30222053 : SNP	a	g	0.6175	0.0157	0.6034	0.6387	-0.0185	0.0087	0.03353	---+-	0.0	0.905	4	0.9238
12 : 11665592 : SNP	t	c	0.1502	0.0039	0.1436	0.1555	-0.0088	0.0126	0.4885	---++	3.9	4.163	4	0.3844
13 : 39751341 : SNP	a	g	0.3993	0.0094	0.3866	0.4079	-0.0089	0.0089	0.3211	--++-	10.3	4.461	4	0.3472
13 : 94327445 : SNP	c	g	0.6992	0.0076	0.6890	0.7171	-0.0026	0.0092	0.78	--+++	0.0	3.659	4	0.4542
17 : 42846629 : SNP	a	g	0.8760	0.0170	0.8636	0.9200	0.0143	0.0131	0.275	+++--	0.0	2.862	4	0.5812
21 : 20050384 : SNP	t	c	0.7049	0.0219	0.6463	0.7193	-0.0019	0.0097	0.8426	+---+	22.1	5.134	4	0.2739
13 : 61761836 : SNP	a	g	0.0365	0.0037	0.0334	0.0408	-0.0152	0.0261	0.559	-+???	11.2	1.127	1	0.2885
12 : 80713081 : SNP	c	g	0.9530	0.0040	0.9473	0.9558	0.0195	0.0356	0.5842	+???-	62.1	2.642	1	0.1041
1 : 195303210 : SNP	a	g	0.0283	0.0067	0.0241	0.0390	0.0013	0.0325	0.9689	+???-	0.0	0.226	1	0.6348
12 : 119482052 : SNP	t	c	0.9703	0.0004	0.9700	0.9708	0.0068	0.0293	0.815	+-???	47.6	1.908	1	0.1672
1 : 151783324 : SNP	t	g	0.9082	0.0083	0.8930	0.9182	-0.0448	0.0174	0.0101	--?--	0.0	0.236	3	0.9716
7 : 39262556 : SNP	t	c	0.0242	0.0000	0.0242	0.0242	0.0310	0.0414	0.4545	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 88396044 : SNP	c	g	0.7146	0.0218	0.6693	0.7295	-0.0022	0.0093	0.8126	+--+-	62.1	10.556	4	0.03203
12 : 103075442 : SNP	a	t	0.6621	0.0193	0.6519	0.7094	0.0121	0.0092	0.1882	+-+-+	0.0	3.887	4	0.4215
5 : 131306262 : SNP	c	g	0.2299	0.0045	0.2252	0.2407	0.0101	0.0104	0.3323	++---	19.1	4.944	4	0.2931
8 : 24889031 : INDEL	i	r	0.2003	0.0216	0.1781	0.2366	-0.0136	0.0127	0.2867	---+-	0.0	0.665	4	0.9556
18 : 67962628 : SNP	a	g	0.8477	0.0133	0.8049	0.8557	-0.0021	0.0124	0.8626	+-++-	17.2	4.828	4	0.3054
15 : 79129779 : SNP	t	g	0.9601	0.0057	0.9519	0.9641	0.0208	0.0323	0.5196	+???+	0.0	0.028	1	0.8661
11 : 41164213 : SNP	t	c	0.8439	0.0103	0.8074	0.8525	-0.0060	0.0120	0.6143	--++-	0.0	1.062	4	0.9003
6 : 26187334 : SNP	t	g	0.0891	0.0034	0.0869	0.0983	0.0113	0.0152	0.4597	+-+--	17.1	4.825	4	0.3057
15 : 29675224 : SNP	a	g	0.9285	0.0096	0.9189	0.9500	-0.0197	0.0172	0.2526	--?+-	65.4	8.674	3	0.03396
13 : 110890656 : SNP	c	g	0.1320	0.0077	0.1219	0.1420	0.0261	0.0141	0.06517	+-+++	0.0	3.347	4	0.5015
8 : 100469561 : SNP	a	g	0.0425	0.0012	0.0416	0.0440	0.0012	0.0254	0.9608	-+???	0.0	0.742	1	0.3891
2 : 238513300 : INDEL	i	r	0.1073	0.0126	0.0965	0.1385	-0.0031	0.0145	0.8285	-+?--	0.0	1.894	3	0.5946
3 : 197308957 : SNP	t	g	0.8187	0.0165	0.7915	0.8363	0.0031	0.0127	0.8067	--+-+	0.0	1.596	4	0.8096
5 : 95916644 : SNP	a	c	0.0741	0.0035	0.0709	0.0790	-0.0141	0.0190	0.4558	-+?+-	0.0	2.285	3	0.5155
2 : 118324021 : SNP	t	c	0.9647	0.0078	0.9442	0.9698	0.0163	0.0238	0.4953	-+?+-	0.0	2.640	3	0.4506
15 : 52246415 : SNP	t	c	0.5872	0.0108	0.5625	0.6009	-0.0039	0.0085	0.6476	---++	0.0	3.276	4	0.5127
18 : 56969154 : SNP	a	g	0.2792	0.0032	0.2765	0.2915	-0.0006	0.0092	0.9453	-+++-	0.0	0.824	4	0.9353
19 : 47925495 : SNP	t	g	0.0425	0.0014	0.0390	0.0431	-0.0141	0.0229	0.5382	--??+	0.0	1.180	2	0.5544
1 : 205362249 : SNP	a	g	0.4424	0.0243	0.4277	0.4963	0.0001	0.0089	0.993	-+--+	0.0	1.763	4	0.7793
2 : 161995587 : SNP	a	c	0.0370	0.0014	0.0359	0.0400	0.0034	0.0235	0.8865	++??-	0.0	1.665	2	0.435
6 : 31474820 : SNP	t	c	0.0393	0.0055	0.0311	0.0430	-0.0417	0.0252	0.09701	--???	0.0	0.049	1	0.8251
7 : 25221348 : SNP	t	c	0.2575	0.0081	0.2502	0.2748	-0.0269	0.0100	0.007091	---+-	23.7	5.245	4	0.263
11 : 118199295 : SNP	a	g	0.2842	0.0130	0.2604	0.2948	-0.0174	0.0097	0.07441	---+-	0.0	0.794	4	0.9392
11 : 11040806 : SNP	t	c	0.3047	0.0205	0.2819	0.3451	-0.0184	0.0093	0.04693	-----	0.0	2.498	4	0.645
12 : 27349991 : SNP	a	g	0.3184	0.0253	0.2532	0.3322	0.0065	0.0092	0.4815	+-+--	55.6	9.013	4	0.06077
2 : 4982578 : SNP	t	c	0.8817	0.0083	0.8689	0.8916	0.0004	0.0163	0.9792	---++	0.0	1.315	4	0.8589
9 : 35436662 : SNP	c	g	0.6859	0.0141	0.6753	0.7143	0.0082	0.0092	0.3704	++-++	0.0	0.897	4	0.925
7 : 113204903 : SNP	t	c	0.5855	0.0077	0.5699	0.5945	-0.0102	0.0085	0.2324	-0++-	0.0	2.776	4	0.596
18 : 8225815 : SNP	t	c	0.8474	0.0080	0.8250	0.8603	0.0174	0.0120	0.1483	++-++	0.0	1.867	4	0.7602
7 : 123133781 : INDEL	d	r	0.4844	0.0204	0.4380	0.5178	0.0016	0.0093	0.8652	-+++-	0.0	2.065	4	0.7238
10 : 86892793 : SNP	c	g	0.4617	0.0038	0.4523	0.4644	0.0035	0.0085	0.677	+0-+-	0.0	3.126	4	0.5369
7 : 44953973 : SNP	a	g	0.1605	0.0036	0.1580	0.1729	0.0118	0.0126	0.3495	++-++	0.0	0.805	4	0.9378
2 : 139090640 : SNP	c	g	0.0118	0.0000	0.0118	0.0118	-0.0520	0.0596	0.3833	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 125857458 : SNP	t	c	0.3600	0.0135	0.3322	0.3705	0.0072	0.0087	0.4099	-+-++	7.5	4.325	4	0.3638
12 : 133343778 : SNP	t	g	0.1798	0.0123	0.1300	0.1873	-0.0152	0.0116	0.1894	--+-+	0.0	1.782	4	0.7757
15 : 91827077 : SNP	a	c	0.0771	0.0114	0.0709	0.1126	-0.0082	0.0170	0.6275	-+?+-	0.5	3.016	3	0.3891
16 : 59846457 : SNP	a	g	0.2516	0.0170	0.2091	0.2929	0.0059	0.0099	0.5555	-++-+	0.0	3.213	4	0.5229
16 : 47893831 : SNP	t	c	0.9519	0.0000	0.9519	0.9519	-0.0340	0.0394	0.3885	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 12484274 : SNP	a	t	0.9033	0.0149	0.8794	0.9233	0.0140	0.0152	0.3587	+-?--	16.7	3.600	3	0.3081
12 : 118819806 : SNP	a	g	0.1667	0.0149	0.1521	0.1983	-0.0081	0.0115	0.4811	--+-+	0.0	3.511	4	0.4762
2 : 14090535 : SNP	a	g	0.9805	0.0000	0.9805	0.9805	-0.0210	0.0435	0.629	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 85998236 : SNP	t	c	0.6732	0.0155	0.6424	0.6852	0.0109	0.0091	0.2302	++--+	0.0	0.647	4	0.9577
11 : 75988667 : SNP	a	g	0.0449	0.0025	0.0427	0.0477	0.0232	0.0251	0.3554	++???	0.0	0.306	1	0.5799
2 : 164443778 : SNP	a	g	0.6876	0.0331	0.6386	0.7371	-0.0084	0.0127	0.5059	-+-+-	1.5	4.062	4	0.3977
4 : 41362659 : SNP	a	g	0.1409	0.0158	0.1247	0.1768	-0.0138	0.0138	0.3165	0-+--	0.0	1.785	4	0.7752
19 : 57023856 : SNP	a	c	0.4510	0.0056	0.4461	0.4590	0.0165	0.0089	0.0631	++-++	0.0	1.953	4	0.7444
9 : 23674344 : SNP	c	g	0.8287	0.0026	0.8260	0.8348	-0.0050	0.0125	0.6904	+--++	12.8	4.586	4	0.3325
4 : 20532389 : SNP	a	t	0.8933	0.0054	0.8819	0.9062	-0.0079	0.0143	0.5825	-+?+-	0.0	0.914	3	0.822
22 : 43086173 : SNP	a	t	0.5850	0.0091	0.5707	0.5985	-0.0018	0.0086	0.8322	++---	0.0	3.113	4	0.5391
17 : 54156938 : SNP	t	c	0.7656	0.0043	0.7632	0.7830	-0.0073	0.0104	0.4808	+--+-	31.7	5.859	4	0.2099
12 : 58314756 : SNP	t	g	0.0445	0.0091	0.0396	0.0616	0.0044	0.0224	0.8458	+-??-	75.1	8.040	2	0.01795
13 : 95154278 : INDEL	i	r	0.2961	0.0099	0.2726	0.3039	-0.0100	0.0100	0.3194	--+--	0.0	0.464	4	0.9769
6 : 153182017 : SNP	a	g	0.9426	0.0029	0.9405	0.9498	0.0146	0.0189	0.441	0+??+	45.1	3.640	2	0.162
15 : 70441251 : SNP	a	c	0.9227	0.0040	0.9150	0.9276	0.0195	0.0173	0.2603	0+?+-	0.0	2.987	3	0.3937
3 : 14727017 : INDEL	d	r	0.7060	0.0108	0.6850	0.7196	0.0051	0.0122	0.6792	++---	0.0	1.951	4	0.7448
2 : 102926362 : SNP	a	g	0.3758	0.0054	0.3527	0.3774	0.0059	0.0099	0.5503	-+++?	39.4	4.947	3	0.1757
14 : 105349220 : SNP	t	g	0.3420	0.0072	0.3294	0.3560	-0.0003	0.0091	0.978	+-+++	0.0	1.290	4	0.8631
9 : 99001495 : SNP	t	c	0.0541	0.0097	0.0424	0.0726	-0.0035	0.0195	0.8567	--?-+	0.0	2.851	3	0.4151
15 : 60655206 : INDEL	d	r	0.3935	0.0080	0.3782	0.4107	-0.0049	0.0091	0.5934	--++-	0.0	0.726	4	0.9481
2 : 190636014 : SNP	a	g	0.1990	0.0093	0.1825	0.2312	0.0027	0.0107	0.8024	0++-+	0.0	2.434	4	0.6564
7 : 33260144 : SNP	a	c	0.8283	0.0074	0.8145	0.8397	-0.0062	0.0113	0.5861	-++--	0.0	1.815	4	0.7698
3 : 117928767 : SNP	t	g	0.8445	0.0065	0.8245	0.8518	-0.0009	0.0119	0.9386	-++-+	3.3	4.138	4	0.3876
18 : 75536590 : INDEL	d	r	0.1185	0.0062	0.1059	0.1269	0.0127	0.0132	0.3369	++---	35.5	6.199	4	0.1848
10 : 17519969 : SNP	a	t	0.7756	0.0123	0.7648	0.8101	-0.0116	0.0101	0.2506	--++-	0.0	2.082	4	0.7206
2 : 140465816 : INDEL	i	r	0.0780	0.0192	0.0595	0.1141	0.0089	0.0169	0.5973	-+?-+	4.2	3.132	3	0.3717
1 : 207664721 : SNP	a	g	0.6875	0.0177	0.6488	0.7146	0.0018	0.0092	0.8458	+---+	0.0	1.411	4	0.8423
2 : 230343104 : SNP	a	g	0.6895	0.0080	0.6766	0.7220	0.0058	0.0092	0.5237	+++--	25.4	5.361	4	0.2522
20 : 2386973 : SNP	t	c	0.6664	0.0065	0.6569	0.6757	-0.0053	0.0092	0.5632	-+-+-	36.1	6.256	4	0.1808
2 : 42409655 : SNP	t	c	0.0454	0.0035	0.0427	0.0502	0.0389	0.0237	0.1011	++??+	0.0	0.156	2	0.9248
1 : 211020557 : SNP	t	c	0.2694	0.0047	0.2477	0.2711	0.0098	0.0098	0.3169	+--++	0.0	3.621	4	0.4598
11 : 5192729 : SNP	a	g	0.0752	0.0046	0.0670	0.0845	0.0005	0.0162	0.9735	+--+-	0.0	2.954	4	0.5655
11 : 59869090 : SNP	a	g	0.5506	0.0161	0.5034	0.5647	0.0063	0.0085	0.4572	+++++	0.0	0.686	4	0.9531
4 : 90746329 : SNP	t	c	0.5994	0.0160	0.5779	0.6279	0.0139	0.0086	0.1046	++++-	0.0	1.327	4	0.8567
3 : 85390552 : SNP	a	g	0.0341	0.0025	0.0304	0.0358	0.0170	0.0283	0.5485	++???	0.0	0.000	1	1
8 : 19371674 : SNP	c	g	0.6478	0.0077	0.6343	0.6569	-0.0108	0.0092	0.2376	-----	0.0	1.435	4	0.838
5 : 66993696 : SNP	a	g	0.3231	0.0075	0.3120	0.3383	0.0012	0.0091	0.8959	-+++-	0.0	1.561	4	0.8157
13 : 34432536 : SNP	a	c	0.0101	0.0000	0.0101	0.0101	0.0550	0.0637	0.3878	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 41142595 : SNP	a	g	0.6005	0.0093	0.5953	0.6351	0.0070	0.0085	0.4146	++++-	0.0	2.422	4	0.6586
7 : 107451211 : SNP	a	g	0.3843	0.0078	0.3754	0.4054	0.0101	0.0086	0.2391	++++-	0.0	1.486	4	0.8292
8 : 14331493 : SNP	a	c	0.6792	0.0058	0.6614	0.6991	0.0130	0.0091	0.153	+++++	14.0	4.650	4	0.3251
3 : 197327043 : SNP	t	c	0.3335	0.0097	0.2983	0.3400	0.0100	0.0096	0.2986	+-+-+	0.0	3.419	4	0.4903
1 : 64141295 : SNP	t	c	0.1203	0.0085	0.0974	0.1270	0.0068	0.0130	0.6029	+-++-	5.6	4.236	4	0.375
6 : 93699154 : SNP	t	c	0.0617	0.0072	0.0554	0.0794	0.0387	0.0188	0.03967	++?++	0.0	0.620	3	0.8919
10 : 49996025 : SNP	t	c	0.9629	0.0000	0.9629	0.9629	-0.0380	0.0516	0.4611	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 23066512 : SNP	t	c	0.5116	0.0154	0.4945	0.5446	0.0024	0.0085	0.7831	+++--	0.0	2.693	4	0.6104
6 : 89215922 : SNP	t	c	0.8615	0.0194	0.8179	0.8733	0.0113	0.0124	0.3603	++---	0.0	1.944	4	0.746
10 : 54912834 : SNP	t	c	0.2394	0.0195	0.2021	0.2629	0.0123	0.0099	0.2147	++-++	0.0	0.722	4	0.9485
5 : 142325843 : SNP	a	g	0.2981	0.0122	0.2700	0.3092	-0.0017	0.0094	0.8561	-+---	46.9	7.535	4	0.1102
4 : 166379360 : SNP	a	g	0.7044	0.0065	0.6794	0.7090	-0.0057	0.0098	0.5605	-----	0.0	0.264	4	0.992
16 : 27887991 : SNP	a	g	0.3170	0.0170	0.2961	0.3332	-0.0115	0.0093	0.2154	-+--+	30.7	5.769	4	0.2171
10 : 124290230 : SNP	a	t	0.1571	0.0136	0.1282	0.1655	-0.0215	0.0137	0.1169	-+---	54.7	8.831	4	0.06547
7 : 136908933 : SNP	c	g	0.9803	0.0000	0.9803	0.9803	0.0070	0.0455	0.8777	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 24067647 : SNP	t	c	0.8576	0.0214	0.8077	0.8713	0.0047	0.0125	0.7083	+-+++	0.0	1.458	4	0.8341
8 : 94749437 : INDEL	i	r	0.0371	0.0000	0.0371	0.0371	0.0550	0.0505	0.2765	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 16658279 : INDEL	i	r	0.5949	0.0357	0.5623	0.6743	-0.0090	0.0094	0.3345	--+--	0.0	3.864	4	0.4247
2 : 112378194 : SNP	a	g	0.0308	0.0000	0.0308	0.0308	0.0080	0.0394	0.8392	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 54755620 : SNP	a	g	0.4914	0.0231	0.4792	0.5447	0.0015	0.0085	0.8581	-+-+-	0.0	1.384	4	0.847
4 : 15765605 : SNP	a	g	0.6827	0.0096	0.6568	0.6928	0.0127	0.0091	0.164	+++++	0.0	1.275	4	0.8657
12 : 68362784 : SNP	c	g	0.9340	0.0054	0.9249	0.9388	-0.0055	0.0177	0.7543	--?++	0.0	2.300	3	0.5126
19 : 2912198 : INDEL	d	r	0.4071	0.0197	0.3679	0.4279	0.0134	0.0093	0.1481	+++++	0.0	2.507	4	0.6434
9 : 27710690 : SNP	a	c	0.9387	0.0030	0.9335	0.9469	0.0043	0.0182	0.8148	+-?++	64.8	8.530	3	0.03624
1 : 80811206 : SNP	t	c	0.7071	0.0131	0.6945	0.7283	0.0075	0.0094	0.4231	+-+-+	44.4	7.193	4	0.126
2 : 1430509 : SNP	a	g	0.7770	0.0198	0.7349	0.7912	-0.0032	0.0104	0.7556	-+++-	0.0	3.561	4	0.4687
18 : 65866542 : SNP	a	g	0.6591	0.0093	0.6446	0.6740	-0.0101	0.0088	0.2476	-++--	0.0	3.739	4	0.4424
12 : 62239600 : SNP	a	c	0.9066	0.0047	0.9009	0.9214	0.0051	0.0154	0.7415	+-+--	0.0	1.341	4	0.8543
20 : 54984412 : INDEL	d	r	0.1249	0.0148	0.0917	0.1424	-0.0081	0.0152	0.5927	---+-	0.0	0.762	4	0.9435
2 : 141840322 : SNP	a	c	0.8839	0.0083	0.8760	0.8955	-0.0351	0.0131	0.007425	---+-	0.0	0.764	4	0.9432
17 : 63202904 : SNP	t	g	0.0173	0.0000	0.0173	0.0173	0.0680	0.0505	0.1785	+????	0.0	0.000	0	1
22 : 24020575 : SNP	t	c	0.4842	0.0086	0.4660	0.4913	-0.0047	0.0085	0.5818	-+-+-	46.6	7.486	4	0.1123
19 : 10374167 : SNP	t	c	0.0155	0.0000	0.0155	0.0155	0.0280	0.0546	0.608	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 20221195 : SNP	c	g	0.8165	0.0071	0.7945	0.8354	0.0031	0.0108	0.7717	++-+-	0.0	2.950	4	0.5663
4 : 131849315 : SNP	t	c	0.5549	0.0114	0.5359	0.5917	-0.0051	0.0085	0.5499	--+++	0.0	2.377	4	0.6668
22 : 36351343 : SNP	t	g	0.9148	0.0083	0.9092	0.9351	0.0236	0.0154	0.1247	++?-+	0.0	2.119	3	0.548
1 : 58533356 : SNP	t	c	0.9689	0.0030	0.9640	0.9717	0.0296	0.0271	0.2731	+-??+	15.0	2.353	2	0.3084
4 : 99992652 : SNP	a	g	0.0431	0.0003	0.0428	0.0435	-0.0082	0.0235	0.7263	--???	0.0	0.028	1	0.8673
13 : 109799820 : SNP	a	t	0.6337	0.0220	0.5655	0.6643	0.0100	0.0088	0.251	++---	0.0	2.645	4	0.619
5 : 98042809 : SNP	a	c	0.1008	0.0018	0.0993	0.1034	-0.0107	0.0141	0.4499	+-++-	0.0	2.855	4	0.5824
9 : 38067388 : SNP	t	c	0.9636	0.0000	0.9636	0.9636	0.0290	0.0374	0.4381	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 108250477 : SNP	t	c	0.5756	0.0119	0.5450	0.5964	-0.0089	0.0085	0.2955	-++--	0.0	1.718	4	0.7874
20 : 1846405 : SNP	t	c	0.9862	0.0000	0.9862	0.9862	0.0100	0.0566	0.8598	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 132404718 : SNP	t	c	0.6003	0.0208	0.5620	0.6233	0.0045	0.0091	0.6197	++--+	0.0	0.931	4	0.92
18 : 44199078 : SNP	a	c	0.9402	0.0104	0.9095	0.9507	0.0066	0.0188	0.7254	+-?++	0.0	2.674	3	0.4447
6 : 50601590 : SNP	c	g	0.9795	0.0000	0.9795	0.9795	-0.0780	0.0445	0.07949	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 123853929 : SNP	a	g	0.5825	0.0186	0.5323	0.5989	0.0024	0.0112	0.8293	0++--	0.0	1.680	4	0.7943
1 : 182639561 : SNP	c	g	0.0115	0.0000	0.0115	0.0115	0.0180	0.0596	0.7628	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 181084796 : SNP	a	g	0.9829	0.0000	0.9829	0.9829	-0.0270	0.0586	0.6451	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 74021622 : SNP	a	g	0.1082	0.0059	0.0949	0.1115	-0.0209	0.0137	0.1291	--+--	0.0	3.076	4	0.5452
13 : 89865072 : SNP	c	g	0.1798	0.0058	0.1654	0.1867	-0.0026	0.0114	0.8217	--+-+	0.0	1.860	4	0.7615
2 : 123871499 : SNP	t	g	0.0130	0.0000	0.0130	0.0130	-0.0260	0.0526	0.6209	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 41999647 : INDEL	d	r	0.2482	0.0179	0.2261	0.2768	0.0048	0.0117	0.6813	+-+++	0.0	2.649	4	0.6182
5 : 113148874 : SNP	a	g	0.6647	0.0117	0.6586	0.6923	-0.0076	0.0092	0.4088	-++-+	67.7	12.386	4	0.0147
5 : 150542666 : SNP	a	g	0.3056	0.0066	0.2854	0.3162	0.0103	0.0092	0.2637	+++++	0.0	2.999	4	0.5581
13 : 50432227 : SNP	a	g	0.5747	0.0082	0.5500	0.5971	-0.0023	0.0086	0.7896	-+++-	0.0	0.899	4	0.9247
4 : 108673461 : SNP	a	g	0.8638	0.0106	0.8433	0.8882	-0.0074	0.0127	0.5623	--+-+	20.5	5.031	4	0.2841
15 : 48142316 : SNP	t	c	0.9609	0.0043	0.9558	0.9646	-0.0161	0.0254	0.5251	-+???	0.0	0.607	1	0.4359
15 : 89965609 : SNP	a	t	0.6667	0.0071	0.6472	0.6719	0.0063	0.0093	0.4981	+++-+	0.0	0.650	4	0.9573
2 : 187275311 : SNP	t	c	0.9461	0.0027	0.9432	0.9489	-0.0161	0.0194	0.4082	-+?-+	0.0	2.497	3	0.4758
5 : 94650304 : SNP	t	c	0.1967	0.0169	0.1561	0.2106	-0.0032	0.0109	0.7654	--+--	0.0	0.122	4	0.9982
15 : 24022660 : SNP	a	g	0.9788	0.0000	0.9788	0.9788	-0.1070	0.0475	0.02431	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 106008316 : SNP	t	c	0.1540	0.0048	0.1460	0.1579	0.0219	0.0304	0.4721	??+++	0.0	0.207	2	0.9016
22 : 44813332 : SNP	t	c	0.0205	0.0000	0.0205	0.0205	0.0480	0.0485	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 13518076 : INDEL	d	r	0.7081	0.0148	0.6904	0.7430	0.0026	0.0093	0.7835	+-+++	0.0	1.170	4	0.883
10 : 38585318 : SNP	a	c	0.5210	0.0086	0.4960	0.5276	-0.0035	0.0105	0.7397	+---?	16.4	3.589	3	0.3094
8 : 142086708 : SNP	t	c	0.5637	0.0032	0.5607	0.5697	0.0013	0.0091	0.8867	+---+	1.2	4.049	4	0.3994
1 : 214519615 : SNP	a	g	0.5394	0.0197	0.5259	0.5825	-0.0046	0.0086	0.5933	+----	0.0	2.494	4	0.6457
10 : 68812288 : SNP	t	g	0.4422	0.0329	0.3625	0.4834	0.0073	0.0086	0.3964	+-+-+	0.0	2.230	4	0.6936
15 : 89125207 : SNP	t	g	0.3474	0.0241	0.3254	0.4014	-0.0003	0.0091	0.9721	-+-+-	0.0	2.488	4	0.6468
4 : 46473640 : SNP	t	c	0.9756	0.0000	0.9756	0.9756	-0.0070	0.0425	0.869	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 225231895 : SNP	a	c	0.9086	0.0132	0.8972	0.9306	0.0046	0.0173	0.788	+-?+-	0.0	1.675	3	0.6426
7 : 64671823 : INDEL	i	r	0.3115	0.0359	0.2717	0.3532	0.0139	0.0172	0.4204	?++++	0.0	1.260	3	0.7386
5 : 75394915 : SNP	t	g	0.8079	0.0079	0.7919	0.8161	0.0077	0.0108	0.4735	-+-++	0.0	1.337	4	0.8551
5 : 111931990 : SNP	t	c	0.1337	0.0102	0.1161	0.1418	-0.0013	0.0125	0.9145	-++--	55.7	9.022	4	0.06056
2 : 185474789 : SNP	a	g	0.8280	0.0093	0.8147	0.8422	-0.0074	0.0111	0.5063	+----	30.8	5.777	4	0.2164
4 : 57596159 : SNP	a	g	0.2063	0.0067	0.1961	0.2151	0.0042	0.0108	0.699	+-+-+	43.7	7.104	4	0.1305
7 : 130675843 : INDEL	d	r	0.1147	0.0048	0.1095	0.1256	-0.0015	0.0154	0.9221	-+--+	46.0	7.411	4	0.1157
12 : 110681518 : SNP	a	c	0.9898	0.0000	0.9898	0.9898	0.0720	0.0607	0.2352	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 53236079 : SNP	t	c	0.1041	0.0193	0.0566	0.1239	0.0125	0.0145	0.3898	-+-++	0.0	3.627	4	0.4589
12 : 58776861 : SNP	a	c	0.9800	0.0000	0.9800	0.9800	0.0110	0.0465	0.813	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 106337993 : INDEL	i	r	0.0750	0.0094	0.0526	0.0817	-0.0097	0.0191	0.6123	+-??-	0.0	1.320	2	0.5169
11 : 133748630 : INDEL	i	r	0.0324	0.0023	0.0297	0.0366	-0.0112	0.0260	0.6659	--??+	0.0	1.720	2	0.4232
16 : 30886643 : SNP	t	c	0.3863	0.0040	0.3748	0.3892	0.0170	0.0099	0.08402	+--+?	0.0	2.703	3	0.4396
17 : 50324028 : SNP	t	c	0.1383	0.0107	0.1117	0.1479	-0.0123	0.0126	0.329	-----	0.0	2.234	4	0.6928
11 : 103740756 : SNP	a	g	0.0190	0.0000	0.0190	0.0190	-0.0390	0.0485	0.4215	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 80376117 : SNP	t	c	0.9185	0.0109	0.9141	0.9502	0.0021	0.0167	0.9023	-+??+	0.0	1.381	2	0.5014
2 : 180556522 : SNP	t	c	0.9607	0.0020	0.9567	0.9629	-0.0131	0.0230	0.5698	-+??+	30.6	2.883	2	0.2366
8 : 26735781 : SNP	t	c	0.0835	0.0058	0.0776	0.0969	-0.0049	0.0152	0.7451	--+++	0.0	3.890	4	0.4211
3 : 148288255 : SNP	a	c	0.2861	0.0090	0.2651	0.2961	-0.0051	0.0094	0.5861	-+-+-	0.0	1.690	4	0.7925
5 : 150281503 : INDEL	d	r	0.0413	0.0040	0.0362	0.0483	-0.0389	0.0224	0.08206	--??-	9.3	2.206	2	0.3319
2 : 141366395 : INDEL	d	r	0.0559	0.0056	0.0410	0.0584	-0.0140	0.0197	0.4759	-+??-	44.7	3.620	2	0.1637
1 : 238836812 : SNP	c	g	0.9791	0.0000	0.9791	0.9791	0.0460	0.0425	0.2786	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 74149008 : SNP	a	g	0.9478	0.0083	0.9414	0.9606	0.0244	0.0222	0.2725	++??+	26.5	2.722	2	0.2563
10 : 35316252 : SNP	t	g	0.8301	0.0047	0.8204	0.8376	-0.0086	0.0113	0.4493	+----	0.0	3.270	4	0.5137
20 : 9254574 : SNP	t	c	0.9864	0.0000	0.9864	0.9864	-0.0230	0.0546	0.6735	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 162303613 : SNP	t	c	0.7447	0.0029	0.7422	0.7505	-0.0083	0.0098	0.4004	----+	0.0	3.262	4	0.515
16 : 78957575 : SNP	t	g	0.3772	0.0104	0.3622	0.3930	0.0151	0.0099	0.1259	+++--	16.7	4.804	4	0.308
18 : 61135775 : SNP	t	c	0.3301	0.0059	0.3184	0.3396	0.0213	0.0099	0.03087	+-+--	62.4	10.635	4	0.03099
22 : 24539171 : INDEL	d	r	0.0608	0.0070	0.0551	0.0743	-0.0027	0.0337	0.936	-??-+	0.0	1.046	2	0.5926
4 : 143759037 : SNP	a	t	0.9552	0.0002	0.9549	0.9554	-0.0497	0.0232	0.03224	--???	0.0	0.729	1	0.3932
6 : 78970204 : SNP	t	c	0.0517	0.0022	0.0474	0.0542	0.0028	0.0230	0.9021	+-??+	0.0	0.580	2	0.7484
1 : 217775002 : SNP	a	t	0.3868	0.0185	0.3761	0.4263	0.0046	0.0085	0.5859	+-+-+	30.8	5.778	4	0.2163
1 : 58853709 : SNP	c	g	0.8636	0.0056	0.8550	0.8886	0.0040	0.0126	0.75	-+++-	20.1	5.007	4	0.2865
2 : 1464486 : SNP	c	g	0.5029	0.0108	0.4933	0.5235	0.0088	0.0085	0.3016	--+++	53.6	8.625	4	0.07119
3 : 117760645 : SNP	c	g	0.9653	0.0023	0.9636	0.9684	-0.0073	0.0259	0.7784	--???	0.0	0.001	1	0.9704
14 : 91311213 : SNP	a	g	0.1004	0.0113	0.0922	0.1335	-0.0093	0.0146	0.5222	-----	0.0	0.274	4	0.9915
14 : 49926368 : SNP	a	c	0.8910	0.0184	0.8570	0.9108	-0.0132	0.0142	0.3531	---++	0.0	3.944	4	0.4137
3 : 148868984 : INDEL	i	r	0.0263	0.0000	0.0263	0.0263	-0.0510	0.0465	0.2727	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 33921509 : INDEL	i	r	0.0649	0.0049	0.0600	0.0754	-0.0015	0.0179	0.9317	-+?--	74.8	11.891	3	0.007766
4 : 124947265 : SNP	t	c	0.3498	0.0110	0.3389	0.3723	0.0172	0.0090	0.05705	+++--	0.0	2.151	4	0.7079
12 : 104869783 : SNP	t	c	0.1229	0.0048	0.1204	0.1369	-0.0037	0.0140	0.7934	--++-	0.0	1.660	4	0.7979
2 : 10575771 : SNP	t	c	0.1776	0.0092	0.1452	0.1921	-0.0151	0.0120	0.2076	----+	0.0	2.275	4	0.6853
18 : 63109072 : SNP	a	c	0.2557	0.0105	0.2485	0.2869	0.0009	0.0098	0.927	--+++	0.0	1.378	4	0.8479
3 : 12409699 : SNP	c	g	0.0730	0.0024	0.0715	0.0770	0.0048	0.0285	0.8648	-???+	30.4	1.437	1	0.2306
4 : 28093476 : SNP	a	t	0.0256	0.0000	0.0256	0.0256	-0.0300	0.0384	0.4348	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 27000891 : SNP	t	c	0.2031	0.0248	0.1705	0.2477	0.0007	0.0127	0.9543	-++-+	0.0	3.259	4	0.5154
4 : 60064086 : SNP	t	c	0.6612	0.0112	0.6439	0.6861	-0.0019	0.0091	0.8353	-+--+	0.0	1.435	4	0.8381
1 : 30176103 : SNP	t	c	0.0791	0.0062	0.0600	0.0834	-0.0094	0.0164	0.5653	-+?++	63.5	8.215	3	0.04177
1 : 76118503 : SNP	a	c	0.7011	0.0098	0.6668	0.7060	0.0117	0.0099	0.2362	++--+	0.0	0.635	4	0.9591
6 : 35676885 : SNP	t	c	0.3053	0.0082	0.2949	0.3226	-0.0197	0.0093	0.03407	---+-	0.0	3.870	4	0.4239
19 : 3912195 : SNP	t	g	0.5274	0.0107	0.4813	0.5422	0.0054	0.0086	0.5281	+++-+	0.0	2.678	4	0.6131
15 : 38136955 : SNP	c	g	0.2719	0.0092	0.2559	0.2901	0.0085	0.0094	0.3642	+0+-+	32.2	5.896	4	0.207
13 : 74844324 : SNP	a	g	0.5281	0.0297	0.4634	0.5479	-0.0030	0.0085	0.7223	-+++-	0.0	3.077	4	0.5451
3 : 10348993 : INDEL	d	r	0.2220	0.0125	0.1915	0.2322	0.0139	0.0106	0.1891	++-++	0.0	3.102	4	0.5409
2 : 2869804 : SNP	t	c	0.1218	0.0059	0.1135	0.1263	-0.0056	0.0257	0.8265	-??-+	34.1	3.035	2	0.2192
7 : 44557035 : SNP	a	g	0.0408	0.0079	0.0307	0.0565	0.0156	0.0226	0.4911	0+?+-	0.0	2.615	3	0.4549
7 : 139959147 : SNP	a	g	0.9162	0.0079	0.9101	0.9359	0.0037	0.0167	0.8231	-+?--	0.0	2.097	3	0.5524
4 : 11830849 : SNP	t	c	0.1160	0.0074	0.1105	0.1330	0.0253	0.0133	0.05776	+--++	16.4	4.786	4	0.31
2 : 105906742 : SNP	t	c	0.8813	0.0034	0.8772	0.8935	-0.0177	0.0132	0.1797	---+-	0.0	1.815	4	0.7696
10 : 117485247 : INDEL	i	r	0.3703	0.0077	0.3431	0.3767	-0.0147	0.0091	0.1049	--+--	0.0	1.427	4	0.8395
1 : 221969556 : SNP	a	g	0.0806	0.0066	0.0681	0.0864	0.0034	0.0161	0.8341	+-?+-	14.7	3.516	3	0.3187
1 : 165085190 : INDEL	i	r	0.5738	0.0249	0.5477	0.6293	0.0103	0.0089	0.2509	++++-	0.0	3.459	4	0.4842
7 : 7103608 : SNP	t	c	0.2264	0.0078	0.1907	0.2299	-0.0297	0.0105	0.004707	-----	0.0	0.763	4	0.9434
4 : 106128760 : SNP	a	g	0.6810	0.0103	0.6585	0.6973	-0.0125	0.0092	0.1731	--+--	21.6	5.104	4	0.2768
8 : 83643170 : SNP	t	g	0.0574	0.0016	0.0548	0.0595	-0.0140	0.0186	0.4502	--?--	0.0	0.494	3	0.9201
4 : 176777962 : SNP	a	g	0.3483	0.0063	0.3442	0.3619	-0.0031	0.0093	0.742	-+-++	13.2	4.610	4	0.3296
12 : 104320876 : INDEL	i	r	0.2493	0.0068	0.2406	0.2619	0.0073	0.0106	0.4899	+++++	0.0	0.210	4	0.9949
10 : 112378649 : SNP	a	g	0.0618	0.0087	0.0558	0.0862	0.0036	0.0207	0.8631	+-?++	0.0	2.818	3	0.4206
6 : 166920710 : SNP	a	g	0.0226	0.0000	0.0226	0.0226	-0.0390	0.0627	0.5338	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 16507654 : SNP	t	g	0.0413	0.0022	0.0392	0.0463	-0.0075	0.0232	0.7462	+-??+	0.0	0.380	2	0.8268
16 : 79745582 : SNP	c	g	0.0443	0.0075	0.0389	0.0580	-0.0262	0.0261	0.3166	-??+-	0.0	1.544	2	0.462
5 : 50264239 : SNP	a	t	0.8648	0.0127	0.8523	0.9186	-0.0039	0.0137	0.7753	-+-+?	0.0	0.543	3	0.9093
7 : 61518800 : SNP	a	g	0.2196	0.0000	0.2196	0.2196	0.0576	0.0758	0.4471	??+??	0.0	0.000	0	1
2 : 161870239 : SNP	t	c	0.1770	0.0136	0.1518	0.1938	-0.0004	0.0112	0.9744	-+---	0.0	0.471	4	0.9762
5 : 110558492 : SNP	a	g	0.7279	0.0099	0.7140	0.7444	-0.0017	0.0098	0.865	--+++	0.0	2.375	4	0.6671
6 : 6545949 : SNP	c	g	0.9733	0.0004	0.9730	0.9738	0.0241	0.0297	0.4174	++???	0.0	0.067	1	0.7953
7 : 66639971 : SNP	a	g	0.7434	0.0215	0.7125	0.7610	0.0207	0.0125	0.09858	+++++	0.0	3.370	4	0.498
19 : 36380446 : SNP	a	g	0.0260	0.0000	0.0260	0.0260	-0.0110	0.0455	0.8089	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 124006842 : SNP	t	c	0.8378	0.0067	0.8332	0.8502	0.0245	0.0261	0.3479	??-++	8.7	2.192	2	0.3343
10 : 69945623 : SNP	a	g	0.9820	0.0000	0.9820	0.9820	-0.1190	0.0475	0.01226	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 10378631 : SNP	t	g	0.3826	0.0148	0.3457	0.4032	-0.0081	0.0097	0.4055	-0+--	41.9	6.882	4	0.1423
2 : 177596315 : SNP	t	c	0.9769	0.0000	0.9769	0.9769	-0.0690	0.0455	0.1293	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 118084896 : SNP	a	g	0.0131	0.0000	0.0131	0.0131	-0.0460	0.0586	0.4327	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 23585858 : INDEL	d	r	0.0628	0.0037	0.0576	0.0682	0.0016	0.0181	0.9292	-+?+-	0.0	2.843	3	0.4165
19 : 13805880 : INDEL	d	r	0.0575	0.0043	0.0519	0.0631	-0.0451	0.0264	0.08809	--??-	21.1	2.536	2	0.2814
1 : 242006428 : SNP	a	g	0.4081	0.0156	0.3629	0.4565	0.0127	0.0092	0.1691	+++--	53.2	8.548	4	0.07344
1 : 116165273 : SNP	t	c	0.0536	0.0071	0.0473	0.0670	0.0415	0.0198	0.03576	++?+-	6.6	3.212	3	0.3601
2 : 209950142 : SNP	t	c	0.7069	0.0102	0.6788	0.7203	-0.0041	0.0094	0.6592	+--++	0.0	1.981	4	0.7393
2 : 99986644 : SNP	t	c	0.5610	0.0109	0.5513	0.5779	0.0182	0.0085	0.03255	++-++	0.0	2.070	4	0.723
7 : 22648104 : SNP	t	c	0.1306	0.0153	0.0855	0.1422	-0.0139	0.0133	0.2973	-0---	0.0	0.919	4	0.9218
11 : 100361415 : SNP	t	c	0.1228	0.0086	0.1157	0.1533	0.0060	0.0136	0.6613	+++--	0.0	3.641	4	0.4568
3 : 3959010 : SNP	c	g	0.9792	0.0000	0.9792	0.9792	-0.0300	0.0435	0.4901	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 26890434 : SNP	t	g	0.1795	0.0147	0.1703	0.2110	-0.0090	0.0111	0.4179	---++	0.0	1.806	4	0.7715
10 : 106835404 : SNP	t	g	0.0764	0.0025	0.0747	0.0847	-0.0166	0.0161	0.3029	+-?--	22.4	3.865	3	0.2764
2 : 221238694 : SNP	a	g	0.7987	0.0097	0.7632	0.8044	0.0099	0.0107	0.3554	++---	0.0	2.192	4	0.7005
1 : 88518170 : SNP	t	c	0.6385	0.0170	0.6001	0.6569	0.0039	0.0091	0.6656	+--++	0.0	3.533	4	0.4728
1 : 201953881 : SNP	t	c	0.4080	0.0124	0.3963	0.4313	-0.0280	0.0087	0.001274	-----	0.0	3.767	4	0.4385
6 : 31298240 : SNP	a	g	0.2842	0.0248	0.2650	0.3359	0.0182	0.0202	0.3677	??++-	71.9	7.126	2	0.02835
9 : 103677664 : SNP	a	g	0.3286	0.0050	0.3167	0.3326	-0.0145	0.0092	0.1119	-++--	43.6	7.094	4	0.131
15 : 36314609 : SNP	a	g	0.0786	0.0100	0.0673	0.0972	0.0215	0.0165	0.1925	++?+-	40.0	5.002	3	0.1716
12 : 23957330 : SNP	c	g	0.5844	0.0117	0.5769	0.6157	0.0088	0.0086	0.3056	+++-+	23.7	5.243	4	0.2633
9 : 105404012 : SNP	a	g	0.0212	0.0000	0.0212	0.0212	0.0380	0.0455	0.4035	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 105859965 : SNP	a	g	0.3111	0.0088	0.3012	0.3467	0.0012	0.0094	0.8993	-+--+	0.0	0.808	4	0.9374
2 : 104885323 : SNP	a	t	0.9727	0.0000	0.9727	0.9727	-0.0880	0.0495	0.07563	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 50314751 : SNP	a	g	0.3426	0.0166	0.3050	0.3582	0.0104	0.0092	0.2568	-+-++	37.8	6.433	4	0.1691
2 : 210983130 : SNP	a	g	0.0393	0.0017	0.0373	0.0407	0.0117	0.0295	0.6923	++???	0.0	0.188	1	0.6645
1 : 202534962 : SNP	a	g	0.9811	0.0000	0.9811	0.9811	0.0130	0.0576	0.8215	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 69072103 : SNP	t	g	0.9020	0.0035	0.8949	0.9047	-0.0243	0.0152	0.1086	--?+-	0.0	0.663	3	0.8818
16 : 64749828 : SNP	a	g	0.3251	0.0101	0.2955	0.3375	-0.0057	0.0091	0.5339	+---+	52.8	8.478	4	0.07557
1 : 79022668 : SNP	a	g	0.9815	0.0000	0.9815	0.9815	0.0310	0.0465	0.505	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 15474869 : SNP	a	g	0.3605	0.0088	0.3477	0.3752	-0.0041	0.0091	0.6561	+++--	66.0	11.752	4	0.0193
6 : 68142297 : SNP	a	c	0.9553	0.0030	0.9518	0.9608	-0.0136	0.0229	0.553	+-??-	0.0	1.906	2	0.3856
13 : 88642337 : SNP	t	c	0.1284	0.0089	0.1213	0.1406	-0.0135	0.0242	0.5763	-??--	0.0	0.189	2	0.9096
9 : 20675477 : SNP	a	t	0.9704	0.0037	0.9643	0.9726	0.0624	0.0330	0.0586	+???+	0.0	0.226	1	0.6346
14 : 86736480 : SNP	t	c	0.8245	0.0079	0.8087	0.8316	-0.0064	0.0112	0.5675	--+++	17.2	4.832	4	0.3049
7 : 26614428 : INDEL	i	r	0.0815	0.0071	0.0680	0.0901	0.0002	0.0166	0.9893	--?++	0.0	1.142	3	0.7669
6 : 22010535 : SNP	a	c	0.0835	0.0080	0.0613	0.1016	-0.0098	0.0152	0.5203	+--+-	0.0	2.254	4	0.6891
16 : 49710044 : SNP	c	g	0.8104	0.0125	0.7935	0.8347	0.0030	0.0113	0.7886	+-+++	0.0	2.983	4	0.5606
6 : 88135943 : SNP	t	c	0.0280	0.0026	0.0264	0.0324	0.0438	0.0329	0.1836	+???+	0.0	0.154	1	0.6943
6 : 36642128 : SNP	a	c	0.1444	0.0176	0.1217	0.1830	-0.0075	0.0128	0.558	+--++	11.8	4.537	4	0.3382
2 : 218743211 : SNP	a	t	0.9464	0.0091	0.9293	0.9560	0.0120	0.0202	0.552	+-?+-	0.0	1.271	3	0.736
3 : 103440960 : SNP	t	c	0.9736	0.0000	0.9736	0.9736	-0.0820	0.0505	0.1047	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 151573527 : SNP	t	c	0.0322	0.0024	0.0302	0.0350	0.0215	0.0295	0.4662	+-???	68.0	3.126	1	0.07707
9 : 12302928 : SNP	a	g	0.4094	0.0171	0.3899	0.4348	-0.0000	0.0091	0.9992	++-+-	0.0	3.802	4	0.4335
8 : 143394929 : SNP	t	c	0.1641	0.0098	0.1493	0.1746	-0.0088	0.0115	0.4423	-----	0.0	0.252	4	0.9927
9 : 81702558 : INDEL	d	r	0.3041	0.0099	0.2913	0.3136	0.0013	0.0099	0.8956	-++--	0.0	1.256	4	0.8687
1 : 220504699 : SNP	t	c	0.8886	0.0121	0.8779	0.9149	-0.0127	0.0134	0.3462	----+	0.0	2.745	4	0.6013
4 : 57297689 : SNP	a	g	0.0229	0.0000	0.0229	0.0229	0.0040	0.0414	0.9231	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 102358397 : SNP	a	t	0.8235	0.0054	0.8189	0.8354	-0.0027	0.0114	0.8155	-++--	0.0	1.453	4	0.8349
18 : 21640515 : SNP	a	g	0.7634	0.0099	0.7544	0.7830	0.0025	0.0101	0.808	-+--+	31.3	5.827	4	0.2125
2 : 160891055 : SNP	t	c	0.1407	0.0121	0.1320	0.1723	0.0064	0.0120	0.593	++--+	3.8	4.158	4	0.385
10 : 17683977 : SNP	t	g	0.9696	0.0000	0.9696	0.9696	0.0030	0.0404	0.9409	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 62162404 : SNP	a	g	0.7575	0.0063	0.7335	0.7652	-0.0192	0.0100	0.05527	-----	0.0	1.101	4	0.8941
9 : 85469605 : SNP	t	c	0.6877	0.0167	0.6638	0.7134	0.0200	0.0093	0.03133	-++-+	42.8	6.991	4	0.1364
12 : 28441020 : SNP	t	c	0.7053	0.0108	0.6961	0.7303	0.0187	0.0092	0.04235	+++++	0.0	3.768	4	0.4383
11 : 19246042 : SNP	a	g	0.3512	0.0219	0.3199	0.3837	-0.0100	0.0111	0.366	+----	7.1	4.304	4	0.3665
8 : 42908832 : INDEL	d	r	0.7458	0.0317	0.7188	0.7968	0.0169	0.0131	0.1972	-+-++	52.6	8.442	4	0.07666
11 : 78455929 : INDEL	d	r	0.1233	0.0068	0.1132	0.1420	0.0264	0.0130	0.04223	++-+-	51.7	8.288	4	0.08158
6 : 149609420 : SNP	t	c	0.1843	0.0064	0.1777	0.1965	0.0099	0.0111	0.369	++-+-	60.1	10.028	4	0.03995
10 : 115109553 : SNP	a	g	0.0475	0.0105	0.0427	0.0734	-0.0019	0.0211	0.9283	-+?+-	10.0	3.332	3	0.3432
7 : 146977646 : SNP	c	g	0.9451	0.0092	0.9355	0.9650	-0.0184	0.0198	0.3524	--??+	0.0	0.663	2	0.7178
4 : 155062442 : SNP	a	c	0.1767	0.0091	0.1625	0.2042	0.0160	0.0112	0.1543	+-+-+	13.2	4.607	4	0.33
10 : 50630276 : SNP	t	c	0.4863	0.0154	0.4640	0.5084	-0.0002	0.0092	0.9824	-+-+-	0.0	2.089	4	0.7195
12 : 20577642 : SNP	a	g	0.0168	0.0000	0.0168	0.0168	-0.0360	0.0505	0.4763	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 7509854 : SNP	c	g	0.7591	0.0228	0.7388	0.8260	0.0035	0.0101	0.7292	+---+	26.1	5.412	4	0.2475
5 : 7511431 : SNP	c	g	0.1700	0.0078	0.1452	0.1774	-0.0171	0.0114	0.1338	----+	0.0	1.947	4	0.7454
4 : 120500039 : SNP	t	c	0.7665	0.0138	0.7342	0.8075	-0.0036	0.0105	0.7297	--+--	0.0	0.797	4	0.9388
10 : 5550015 : SNP	t	g	0.0744	0.0055	0.0668	0.0792	0.0128	0.0179	0.4752	++?++	0.0	0.191	3	0.9791
10 : 79507431 : SNP	t	c	0.8852	0.0061	0.8720	0.8899	-0.0258	0.0139	0.06256	-----	0.0	3.597	4	0.4632
10 : 85561203 : SNP	t	c	0.0432	0.0012	0.0423	0.0447	0.0234	0.0249	0.347	++???	0.0	0.254	1	0.6145
15 : 95066100 : SNP	a	g	0.8609	0.0080	0.8513	0.8767	0.0222	0.0128	0.08237	+++++	0.0	0.417	4	0.9811
1 : 209738214 : SNP	a	g	0.2768	0.0073	0.2686	0.2989	0.0088	0.0100	0.3765	++-++	0.0	0.393	4	0.983
18 : 60979534 : SNP	a	c	0.4283	0.0048	0.4212	0.4449	-0.0159	0.0086	0.0643	--++-	0.0	1.981	4	0.7393
18 : 6927348 : SNP	a	g	0.3576	0.0138	0.3434	0.3792	0.0130	0.0098	0.1846	++--+	0.0	2.319	4	0.6773
18 : 51352453 : SNP	t	c	0.5457	0.0056	0.5319	0.5633	-0.0088	0.0085	0.3024	--++-	44.8	7.249	4	0.1233
5 : 131785977 : SNP	a	g	0.7825	0.0182	0.7731	0.8280	0.0063	0.0102	0.5389	++-+-	56.1	9.105	4	0.05853
16 : 50678189 : SNP	a	g	0.0658	0.0091	0.0537	0.0785	-0.0092	0.0232	0.6902	+-?--	0.0	2.637	3	0.4511
15 : 31423332 : SNP	a	g	0.3409	0.0081	0.3261	0.3638	0.0040	0.0090	0.6543	+--+-	0.0	3.946	4	0.4134
15 : 50562149 : SNP	a	c	0.6482	0.0120	0.6380	0.6799	0.0041	0.0095	0.6649	0-++-	15.7	4.742	4	0.3148
11 : 104150088 : SNP	c	g	0.4374	0.0123	0.4020	0.4477	0.0009	0.0085	0.9144	-+-++	0.0	0.951	4	0.9171
3 : 190775418 : SNP	t	c	0.5520	0.0102	0.5414	0.5668	-0.0022	0.0085	0.7924	---++	71.1	13.839	4	0.007827
4 : 91721915 : SNP	t	c	0.6794	0.0248	0.6500	0.7250	-0.0072	0.0090	0.425	-+---	27.0	5.477	4	0.2417
12 : 29356078 : SNP	t	c	0.6919	0.0064	0.6750	0.6976	0.0100	0.0092	0.2751	++++-	18.2	4.889	4	0.2989
9 : 116835781 : SNP	t	g	0.8147	0.0100	0.8007	0.8354	-0.0166	0.0131	0.2078	-----	0.0	0.595	4	0.9637
8 : 141246327 : SNP	a	g	0.5010	0.0239	0.4466	0.5218	0.0107	0.0092	0.2422	+--++	65.6	11.629	4	0.02034
21 : 38361962 : SNP	a	g	0.2683	0.0069	0.2579	0.2747	-0.0047	0.0100	0.6346	+---+	52.0	8.327	4	0.08032
15 : 98908640 : SNP	a	g	0.0181	0.0000	0.0181	0.0181	-0.0080	0.0556	0.8856	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 8274130 : INDEL	d	r	0.7597	0.0222	0.7443	0.8291	0.0077	0.0106	0.4674	+++-+	47.5	7.617	4	0.1067
6 : 16391223 : SNP	a	c	0.1326	0.0025	0.1303	0.1373	0.0022	0.0125	0.8579	-+-++	0.0	2.011	4	0.7338
10 : 39009157 : SNP	a	g	0.3855	0.0498	0.3398	0.4397	-0.0257	0.0376	0.4952	??--?	0.0	0.046	1	0.8299
9 : 109960037 : SNP	t	c	0.8507	0.0090	0.8319	0.8696	0.0007	0.0121	0.9508	---++	35.8	6.235	4	0.1823
5 : 38843882 : SNP	t	g	0.9784	0.0000	0.9784	0.9784	0.0430	0.0465	0.3551	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 162480441 : SNP	t	c	0.6246	0.0272	0.5645	0.6699	0.0010	0.0092	0.9126	-+---	30.0	5.714	4	0.2216
7 : 155934039 : SNP	t	g	0.5125	0.0053	0.5050	0.5167	-0.0058	0.0085	0.4976	+--++	0.0	3.358	4	0.4998
12 : 26984864 : SNP	a	t	0.7728	0.0058	0.7544	0.7797	0.0029	0.0106	0.7837	++--+	0.0	1.861	4	0.7613
20 : 62764598 : SNP	t	c	0.1019	0.0000	0.1019	0.1019	0.0376	0.0552	0.4958	????+	0.0	0.000	0	1
22 : 37530332 : SNP	a	g	0.7598	0.0123	0.7380	0.7841	0.0078	0.0100	0.4322	++-++	0.0	0.505	4	0.973
14 : 69696336 : SNP	c	g	0.6608	0.0167	0.6448	0.6935	0.0164	0.0092	0.07349	+++++	0.0	3.322	4	0.5054
12 : 85097962 : SNP	a	c	0.2595	0.0084	0.2470	0.2776	-0.0019	0.0099	0.8453	----+	0.0	3.206	4	0.524
14 : 28733012 : SNP	a	t	0.9772	0.0000	0.9772	0.9772	-0.0010	0.0414	0.9808	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 43901333 : SNP	t	c	0.0421	0.0015	0.0392	0.0433	-0.0043	0.0225	0.8472	--??+	0.0	0.880	2	0.644
7 : 99707262 : INDEL	i	r	0.8063	0.0133	0.7872	0.8343	0.0133	0.0109	0.2225	+-+++	0.0	2.567	4	0.6326
6 : 148119189 : SNP	t	g	0.9008	0.0097	0.8886	0.9136	-0.0305	0.0178	0.08707	--?-+	0.0	2.641	3	0.4504
6 : 79976707 : SNP	a	c	0.9598	0.0081	0.9452	0.9678	0.0272	0.0228	0.2337	++?++	0.0	0.120	3	0.9894
8 : 97940555 : SNP	a	g	0.9709	0.0039	0.9648	0.9734	-0.0091	0.0332	0.7838	-???+	0.0	0.217	1	0.6414
11 : 113082548 : SNP	t	g	0.7804	0.0026	0.7730	0.7902	0.0177	0.0104	0.08895	+++++	0.0	0.503	4	0.9732
3 : 43057085 : SNP	a	g	0.5661	0.0114	0.5400	0.5802	-0.0119	0.0085	0.1643	-+---	0.0	3.404	4	0.4926
7 : 122528627 : SNP	a	g	0.0404	0.0000	0.0404	0.0404	-0.0360	0.0394	0.3612	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 34757934 : SNP	a	c	0.0485	0.0080	0.0387	0.0615	0.0215	0.0249	0.3897	-+??+	58.8	4.851	2	0.08845
13 : 63052725 : SNP	a	t	0.3232	0.0022	0.3169	0.3271	-0.0035	0.0091	0.702	+---+	21.8	5.116	4	0.2756
1 : 233757721 : SNP	t	c	0.0893	0.0065	0.0822	0.0986	0.0173	0.0164	0.2929	++?-+	0.0	1.653	3	0.6475
20 : 12067997 : SNP	t	g	0.1600	0.0049	0.1452	0.1663	-0.0008	0.0122	0.9458	---++	0.0	1.487	4	0.8289
8 : 52598483 : SNP	a	g	0.7847	0.0094	0.7761	0.7991	0.0012	0.0106	0.9103	+-++-	0.0	1.500	4	0.8266
12 : 80579702 : SNP	a	c	0.5455	0.0166	0.5320	0.5800	0.0016	0.0086	0.8491	-+-++	0.0	2.697	4	0.6097
10 : 66714173 : SNP	t	c	0.0806	0.0117	0.0698	0.1011	0.0049	0.0182	0.787	-+?+-	62.8	8.074	3	0.04451
7 : 50892858 : SNP	t	c	0.0841	0.0074	0.0670	0.0887	-0.0057	0.0160	0.7218	+-?++	0.0	1.038	3	0.792
1 : 183970736 : SNP	a	g	0.0562	0.0057	0.0514	0.0683	0.0347	0.0249	0.1639	++??+	0.0	1.400	2	0.4965
12 : 59015840 : SNP	a	t	0.6188	0.0102	0.5981	0.6293	-0.0007	0.0089	0.9416	++---	21.7	5.108	4	0.2764
2 : 213536571 : SNP	a	g	0.0213	0.0000	0.0213	0.0213	-0.0080	0.0505	0.8742	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 45729389 : SNP	a	g	0.9378	0.0030	0.9334	0.9422	0.0286	0.0193	0.1387	++?-+	0.0	2.853	3	0.4148
8 : 33301396 : SNP	t	c	0.0286	0.0017	0.0272	0.0322	-0.0386	0.0273	0.1573	-+??-	0.0	1.076	2	0.5839
8 : 136489459 : SNP	a	g	0.7432	0.0156	0.7139	0.7545	0.0106	0.0099	0.2826	+-++-	43.1	7.033	4	0.1342
11 : 69630504 : SNP	a	g	0.2375	0.0085	0.2054	0.2486	-0.0131	0.0101	0.1916	-----	0.0	1.839	4	0.7654
7 : 70758445 : SNP	a	t	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	0.0580	0.0526	0.2699	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 124375146 : INDEL	d	r	0.2045	0.0110	0.1875	0.2123	-0.0142	0.0125	0.2548	---+-	24.9	5.325	4	0.2555
3 : 142773738 : SNP	t	c	0.6233	0.0100	0.6024	0.6383	-0.0235	0.0086	0.006023	--++-	0.0	1.629	4	0.8035
8 : 141220970 : SNP	c	g	0.9768	0.0000	0.9768	0.9768	0.0260	0.0465	0.5761	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 37370139 : SNP	t	c	0.0288	0.0000	0.0288	0.0288	0.0680	0.0637	0.2856	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 71512235 : SNP	a	t	0.9712	0.0005	0.9707	0.9716	0.0172	0.0302	0.5687	++???	0.0	0.052	1	0.8196
14 : 53494151 : SNP	t	c	0.1556	0.0192	0.1382	0.1919	0.0047	0.0119	0.6955	-+++-	8.3	4.363	4	0.3591
8 : 60112130 : SNP	a	t	0.1412	0.0057	0.1308	0.1512	0.0070	0.0123	0.5665	-++++	0.0	3.886	4	0.4216
8 : 377273 : SNP	c	g	0.1060	0.0049	0.0991	0.1144	0.0107	0.0258	0.6791	+??--	0.0	0.401	2	0.8182
15 : 72316306 : INDEL	d	r	0.0679	0.0058	0.0631	0.0811	0.0053	0.0182	0.7706	++?--	0.0	2.239	3	0.5243
10 : 95814569 : SNP	a	g	0.7453	0.0167	0.7088	0.7553	0.0176	0.0099	0.07515	++-++	0.0	1.525	4	0.8221
6 : 36807323 : SNP	a	c	0.0143	0.0000	0.0143	0.0143	0.0550	0.0526	0.2954	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 145134017 : SNP	t	g	0.5268	0.0126	0.5085	0.5444	0.0126	0.0085	0.1389	+---+	47.9	7.672	4	0.1044
9 : 94244588 : SNP	a	t	0.0178	0.0000	0.0178	0.0178	-0.0010	0.0485	0.9836	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 63193775 : SNP	t	c	0.8027	0.0076	0.7904	0.8275	-0.0157	0.0107	0.1426	+----	0.0	3.276	4	0.5128
12 : 95969395 : SNP	t	c	0.4144	0.0169	0.3882	0.4362	-0.0018	0.0085	0.8293	-+++-	0.0	3.205	4	0.5241
11 : 123490413 : SNP	t	c	0.3433	0.0086	0.3339	0.3610	0.0022	0.0091	0.8114	++-+-	0.0	2.749	4	0.6007
9 : 36155535 : SNP	c	g	0.2976	0.0079	0.2732	0.3044	0.0106	0.0095	0.2626	++-++	0.0	1.456	4	0.8344
8 : 90512760 : SNP	c	g	0.2790	0.0057	0.2733	0.2991	-0.0094	0.0098	0.3383	-0--+	0.0	3.530	4	0.4734
18 : 42379511 : SNP	a	g	0.0696	0.0052	0.0620	0.0740	-0.0148	0.0171	0.3851	-+?--	0.0	2.965	3	0.397
1 : 236226786 : INDEL	d	r	0.1330	0.0082	0.1230	0.1488	0.0201	0.0169	0.2337	+-+++	52.3	8.391	4	0.07825
18 : 69430267 : SNP	a	g	0.0567	0.0042	0.0509	0.0676	-0.0079	0.0189	0.6745	-+?--	56.3	6.867	3	0.07625
6 : 15948451 : INDEL	i	r	0.4365	0.0170	0.4147	0.4625	0.0054	0.0089	0.5474	+++-+	0.0	1.361	4	0.8509
12 : 39596661 : SNP	t	g	0.1082	0.0032	0.1052	0.1152	0.0015	0.0140	0.9148	+-+--	34.0	6.063	4	0.1945
2 : 17940697 : SNP	a	g	0.0142	0.0000	0.0142	0.0142	-0.0540	0.0566	0.3401	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 69617589 : INDEL	d	r	0.7107	0.0082	0.6930	0.7218	-0.0046	0.0095	0.6326	--+++	50.6	8.099	4	0.08802
1 : 80041569 : SNP	a	c	0.9892	0.0000	0.9892	0.9892	0.0610	0.0607	0.3145	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 93998872 : SNP	a	g	0.4009	0.0118	0.3730	0.4128	0.0011	0.0086	0.9006	+-++-	25.1	5.341	4	0.254
10 : 23647402 : INDEL	i	r	0.0718	0.0055	0.0650	0.0878	-0.0032	0.0208	0.8786	--?+-	0.0	2.010	3	0.5703
16 : 80415330 : SNP	t	c	0.1636	0.0140	0.1406	0.1842	0.0063	0.0115	0.5854	-+++-	0.0	2.358	4	0.6702
4 : 107227049 : SNP	a	g	0.1753	0.0149	0.1400	0.1838	-0.0075	0.0113	0.5028	---+-	0.0	0.409	4	0.9818
7 : 48040196 : SNP	t	c	0.4290	0.0247	0.4148	0.4874	0.0174	0.0085	0.04044	++-+-	54.6	8.804	4	0.06619
3 : 189245986 : INDEL	d	r	0.4424	0.0063	0.4271	0.4466	0.0008	0.0086	0.9292	+-+-+	0.0	1.923	4	0.7499
14 : 94968958 : SNP	t	c	0.3347	0.0109	0.3217	0.3644	0.0157	0.0091	0.08567	++-++	0.0	2.372	4	0.6676
2 : 125441847 : SNP	a	g	0.7918	0.0146	0.7787	0.8246	-0.0130	0.0107	0.2219	--+-+	0.0	2.078	4	0.7214
18 : 52365194 : SNP	a	c	0.6020	0.0267	0.5829	0.6607	-0.0042	0.0086	0.6289	+--+-	48.6	7.785	4	0.09976
10 : 132336475 : SNP	t	c	0.8060	0.0062	0.7985	0.8354	-0.0034	0.0107	0.7532	-+++-	0.0	2.666	4	0.6152
13 : 104588847 : SNP	a	g	0.9188	0.0033	0.9164	0.9261	-0.0156	0.0172	0.3653	-+?--	21.9	3.840	3	0.2793
8 : 143823876 : SNP	a	g	0.3194	0.0134	0.2916	0.3389	-0.0194	0.0092	0.03439	----+	0.0	3.050	4	0.5495
19 : 4926847 : SNP	t	c	0.6964	0.0209	0.6554	0.7164	0.0138	0.0096	0.153	+-+++	36.2	6.269	4	0.1799
19 : 28007799 : SNP	t	c	0.9513	0.0051	0.9371	0.9545	-0.0361	0.0259	0.164	--?+?	0.0	0.568	2	0.7527
4 : 80339467 : SNP	a	g	0.0798	0.0081	0.0684	0.1049	0.0057	0.0163	0.7253	+-+--	0.0	2.664	4	0.6156
2 : 25420865 : SNP	a	c	0.8174	0.0047	0.8100	0.8290	0.0066	0.0109	0.5461	+---+	56.4	9.173	4	0.05692
20 : 58319681 : SNP	t	c	0.0502	0.0093	0.0436	0.0647	0.0176	0.0239	0.462	+??-+	0.0	1.948	2	0.3775
15 : 87109359 : SNP	t	c	0.4801	0.0288	0.4465	0.5416	-0.0000	0.0089	0.9987	+----	41.1	6.787	4	0.1476
12 : 81613228 : SNP	c	g	0.0165	0.0000	0.0165	0.0165	-0.0520	0.0485	0.2839	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 49268243 : SNP	a	g	0.1483	0.0036	0.1422	0.1504	0.0102	0.0388	0.7928	???-+	62.7	2.679	1	0.1016
2 : 208568524 : SNP	a	g	0.0712	0.0052	0.0666	0.0870	-0.0078	0.0166	0.638	-+---	0.0	2.596	4	0.6276
2 : 221394034 : SNP	a	g	0.9032	0.0092	0.8865	0.9152	-0.0008	0.0145	0.9537	+--++	0.0	0.498	4	0.9737
7 : 92988726 : SNP	a	g	0.9211	0.0075	0.9160	0.9400	-0.0064	0.0171	0.7086	-+??+	0.0	1.883	2	0.3901
8 : 93289102 : SNP	a	g	0.2710	0.0166	0.2302	0.2950	0.0089	0.0098	0.3675	++-++	0.0	2.393	4	0.6639
2 : 204525733 : SNP	a	g	0.9850	0.0000	0.9850	0.9850	-0.0320	0.0516	0.5348	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 80967118 : SNP	a	g	0.0143	0.0000	0.0143	0.0143	-0.0160	0.0607	0.7919	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 5290114 : SNP	a	g	0.7811	0.0095	0.7696	0.7980	0.0181	0.0107	0.09185	++---	25.2	5.349	4	0.2533
2 : 64770525 : SNP	a	g	0.6628	0.0135	0.6378	0.6743	-0.0006	0.0091	0.9496	0+--+	49.3	7.882	4	0.096
3 : 61159086 : SNP	t	c	0.9562	0.0035	0.9548	0.9655	0.0159	0.0222	0.4754	++??-	0.0	0.782	2	0.6763
5 : 13865484 : SNP	a	g	0.8567	0.0060	0.8438	0.8673	-0.0137	0.0122	0.2611	---++	0.0	2.789	4	0.5938
15 : 53720024 : SNP	a	c	0.2463	0.0255	0.1896	0.2700	-0.0013	0.0108	0.9031	+-+++	0.0	1.140	4	0.8879
12 : 8488085 : SNP	t	c	0.2171	0.0095	0.1975	0.2230	-0.0172	0.0278	0.5374	??+--	0.0	1.914	2	0.384
16 : 56579604 : SNP	a	g	0.3135	0.0254	0.2556	0.3371	-0.0105	0.0093	0.2582	+--+-	67.7	12.369	4	0.01481
8 : 8726986 : SNP	t	c	0.0114	0.0000	0.0114	0.0114	0.0440	0.0596	0.4607	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 98996775 : SNP	a	g	0.9394	0.0023	0.9362	0.9413	-0.0240	0.0188	0.2006	--??+	30.4	2.875	2	0.2375
5 : 179506577 : SNP	a	g	0.0152	0.0000	0.0152	0.0152	0.0600	0.0516	0.2445	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 80062347 : SNP	t	c	0.0200	0.0000	0.0200	0.0200	-0.0070	0.0455	0.8777	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 7002699 : SNP	a	g	0.0435	0.0000	0.0435	0.0435	-0.0774	0.0671	0.2487	????-	0.0	0.000	0	1
19 : 40606625 : SNP	t	c	0.9850	0.0000	0.9850	0.9850	0.0500	0.0516	0.3321	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 170813789 : SNP	t	c	0.4084	0.0123	0.3828	0.4155	-0.0065	0.0086	0.448	-+---	7.4	4.319	4	0.3645
9 : 9757571 : SNP	a	c	0.0602	0.0156	0.0431	0.0945	-0.0148	0.0188	0.4321	--?-+	0.0	2.138	3	0.5443
12 : 116027637 : SNP	t	c	0.1165	0.0099	0.1077	0.1369	0.0141	0.0132	0.2882	+++--	0.0	1.101	4	0.8941
20 : 6350752 : SNP	a	g	0.0112	0.0000	0.0112	0.0112	-0.1090	0.0576	0.05853	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 86966337 : SNP	t	c	0.0299	0.0008	0.0292	0.0309	0.0115	0.0300	0.7024	++???	0.0	0.052	1	0.8199
6 : 121707449 : SNP	a	g	0.1237	0.0167	0.0910	0.1381	-0.0040	0.0132	0.7609	+--+-	14.3	4.669	4	0.323
11 : 134611417 : SNP	a	t	0.3619	0.0057	0.3537	0.3709	-0.0141	0.0093	0.1306	--+-+	0.0	3.640	4	0.4569
1 : 57605515 : SNP	t	c	0.1678	0.0351	0.1394	0.2324	-0.0014	0.0117	0.9069	+---+	0.0	1.612	4	0.8067
2 : 556990 : SNP	a	g	0.9859	0.0000	0.9859	0.9859	0.0580	0.0596	0.3308	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 95721150 : SNP	a	g	0.1274	0.0067	0.1239	0.1444	0.0005	0.0156	0.9735	-+?-+	0.0	1.150	3	0.7651
5 : 22614445 : SNP	a	g	0.0106	0.0000	0.0106	0.0106	-0.0120	0.0637	0.8505	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 153279654 : SNP	a	g	0.8338	0.0127	0.8243	0.8634	0.0031	0.0115	0.7883	+--++	0.0	3.104	4	0.5406
10 : 101396564 : SNP	a	g	0.4043	0.0189	0.3581	0.4188	-0.0035	0.0086	0.6832	+-+--	0.0	1.416	4	0.8415
9 : 132756711 : INDEL	d	r	0.0206	0.0000	0.0206	0.0206	0.0110	0.0425	0.7956	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 46126597 : SNP	a	t	0.9832	0.0000	0.9832	0.9832	-0.0240	0.0505	0.6349	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 138904572 : SNP	a	g	0.0683	0.0071	0.0639	0.0811	-0.0088	0.0175	0.6149	-+?--	42.3	5.204	3	0.1575
5 : 25973666 : SNP	a	g	0.1226	0.0079	0.1201	0.1545	-0.0206	0.0133	0.1209	----+	0.0	3.246	4	0.5176
16 : 83347016 : SNP	a	t	0.9005	0.0018	0.8941	0.9048	-0.0132	0.0141	0.3491	+-+--	0.0	2.105	4	0.7164
5 : 128575288 : INDEL	d	r	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	0.1050	0.0586	0.07331	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 117375276 : SNP	a	g	0.9686	0.0000	0.9686	0.9686	-0.0240	0.0425	0.5719	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 51046683 : SNP	t	c	0.9617	0.0042	0.9569	0.9653	-0.0321	0.0254	0.205	-+???	39.5	1.652	1	0.1986
6 : 162868414 : INDEL	d	r	0.3812	0.0234	0.3606	0.4305	0.0054	0.0085	0.5274	-+--+	0.0	0.995	4	0.9106
2 : 19792986 : SNP	t	c	0.7079	0.0075	0.6989	0.7252	-0.0099	0.0096	0.3007	+----	0.0	2.574	4	0.6314
6 : 14752712 : SNP	a	g	0.0337	0.0073	0.0288	0.0445	-0.0340	0.0311	0.2736	-???-	0.0	0.112	1	0.7374
6 : 55399432 : SNP	a	c	0.0179	0.0000	0.0179	0.0179	0.0120	0.0505	0.8123	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 46215619 : SNP	a	g	0.2942	0.0114	0.2585	0.3035	-0.0069	0.0092	0.4542	-----	0.0	1.358	4	0.8514
8 : 107494484 : SNP	a	g	0.9074	0.0114	0.8849	0.9194	0.0112	0.0149	0.4522	+++-+	0.0	1.649	4	0.7999
5 : 44174239 : SNP	a	g	0.6958	0.0094	0.6812	0.7157	0.0034	0.0092	0.7131	+--++	0.0	2.381	4	0.666
11 : 4806248 : SNP	t	c	0.8614	0.0272	0.8115	0.8846	-0.0181	0.0125	0.1464	-----	0.0	0.419	4	0.9809
5 : 164582743 : SNP	a	g	0.0800	0.0024	0.0770	0.0850	-0.0385	0.0163	0.01827	--?--	0.0	1.255	3	0.7399
16 : 19794347 : SNP	a	g	0.1696	0.0115	0.1613	0.1960	-0.0196	0.0114	0.08452	-+-+-	0.0	2.134	4	0.7111
6 : 4684400 : SNP	a	g	0.2068	0.0109	0.1967	0.2214	-0.0080	0.0105	0.4426	-++--	0.0	2.844	4	0.5842
12 : 62354369 : SNP	a	c	0.8783	0.0047	0.8717	0.8883	-0.0193	0.0133	0.1459	-+-+-	34.8	6.137	4	0.1891
7 : 48885239 : SNP	a	c	0.9430	0.0000	0.9430	0.9430	-0.0030	0.0344	0.9304	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 74713556 : SNP	t	c	0.0355	0.0127	0.0270	0.0564	0.0094	0.0261	0.7173	++??-	26.5	2.723	2	0.2563
22 : 17974850 : SNP	t	c	0.1803	0.0046	0.1617	0.1880	0.0114	0.0113	0.3125	-++++	0.0	3.088	4	0.5432
11 : 113548935 : SNP	t	c	0.1814	0.0073	0.1717	0.1965	-0.0013	0.0111	0.9037	+---+	29.4	5.665	4	0.2256
6 : 66251985 : SNP	t	c	0.8779	0.0066	0.8646	0.8825	0.0115	0.0131	0.3771	++--+	0.0	2.224	4	0.6946
5 : 744428 : SNP	t	c	0.2861	0.0167	0.2494	0.3010	0.0551	0.0257	0.03226	??+++	0.0	1.573	2	0.4554
13 : 36281302 : SNP	t	c	0.2952	0.0173	0.2707	0.3184	0.0176	0.0117	0.1332	-+-++	42.6	6.967	4	0.1376
2 : 103374098 : SNP	t	c	0.5911	0.0154	0.5719	0.6279	-0.0142	0.0086	0.09748	--+--	0.0	2.893	4	0.5759
8 : 143291396 : SNP	t	c	0.0844	0.0066	0.0771	0.1059	-0.0111	0.0162	0.4908	--++-	0.0	1.613	4	0.8065
3 : 1734545 : INDEL	i	r	0.1531	0.0060	0.1354	0.1593	0.0103	0.0130	0.4302	++-++	0.0	1.882	4	0.7575
3 : 5568313 : SNP	a	t	0.4861	0.0141	0.4678	0.5117	0.0157	0.0102	0.1238	++--+	0.0	3.297	4	0.5094
3 : 174139023 : SNP	t	c	0.6628	0.0108	0.6565	0.6880	0.0142	0.0092	0.1196	++-++	0.0	3.905	4	0.419
12 : 73267848 : INDEL	d	r	0.1827	0.0106	0.1579	0.1907	-0.0131	0.0113	0.2482	---++	0.0	1.728	4	0.7857
15 : 54523695 : INDEL	i	r	0.4166	0.0123	0.3945	0.4306	-0.0136	0.0089	0.1248	---+-	0.0	1.656	4	0.7988
1 : 52280065 : SNP	c	g	0.9571	0.0041	0.9487	0.9603	0.0159	0.0228	0.4858	+-??+	30.0	2.859	2	0.2394
2 : 130331738 : SNP	a	t	0.8156	0.0186	0.7785	0.8286	0.0124	0.0111	0.2624	++-++	0.0	1.854	4	0.7627
2 : 159704293 : SNP	t	c	0.2897	0.0080	0.2723	0.2954	-0.0017	0.0095	0.8595	-+---	0.0	1.211	4	0.8763
8 : 20591535 : SNP	t	c	0.0464	0.0041	0.0444	0.0554	-0.0111	0.0207	0.5908	+-??+	68.9	6.422	2	0.04032
10 : 134924360 : SNP	a	g	0.8662	0.0039	0.8589	0.8716	-0.0003	0.0136	0.9845	+-+--	66.3	11.853	4	0.01848
10 : 108938264 : SNP	a	t	0.4972	0.0085	0.4775	0.5287	-0.0094	0.0086	0.272	--+++	23.6	5.238	4	0.2637
3 : 5540618 : SNP	c	g	0.3766	0.0157	0.3581	0.4282	0.0036	0.0098	0.7114	-+--+	17.8	4.866	4	0.3013
7 : 84127398 : SNP	t	c	0.6460	0.0091	0.6224	0.6588	0.0088	0.0091	0.3366	-+-+-	69.7	13.220	4	0.01025
15 : 24452501 : SNP	a	g	0.1496	0.0206	0.1293	0.1892	-0.0010	0.0124	0.9333	-++++	0.0	1.696	4	0.7915
1 : 199307113 : SNP	a	g	0.9406	0.0047	0.9300	0.9438	0.0118	0.0186	0.5263	++?--	37.0	4.762	3	0.1901
2 : 106931456 : SNP	t	g	0.4844	0.0182	0.4432	0.5002	0.0153	0.0086	0.07321	++-+-	54.4	8.781	4	0.06681
13 : 57830671 : SNP	a	c	0.1721	0.0073	0.1610	0.1851	-0.0030	0.0114	0.7931	-++--	0.0	3.282	4	0.5118
5 : 3348418 : SNP	a	g	0.3390	0.0085	0.3307	0.3618	-0.0169	0.0091	0.06408	----+	36.9	6.340	4	0.1752
5 : 96960452 : SNP	t	c	0.1283	0.0071	0.1226	0.1512	0.0198	0.0127	0.1194	+++++	0.0	1.355	4	0.852
8 : 134460457 : SNP	c	g	0.0523	0.0064	0.0452	0.0611	-0.0049	0.0206	0.8122	--?++	0.0	2.857	3	0.4142
5 : 40950475 : SNP	a	g	0.5883	0.0116	0.5610	0.5968	0.0128	0.0089	0.1495	-++-+	18.2	4.891	4	0.2986
6 : 32574360 : SNP	t	c	0.3579	0.0165	0.3288	0.3826	-0.0307	0.0194	0.1129	??+--	9.6	2.211	2	0.331
11 : 49332487 : SNP	a	g	0.0876	0.0061	0.0816	0.1020	0.0049	0.0163	0.7643	+-++-	61.7	10.457	4	0.0334
8 : 50125803 : SNP	c	g	0.5250	0.0067	0.5215	0.5527	0.0067	0.0085	0.4307	0+-+-	22.2	5.141	4	0.2732
19 : 47118344 : SNP	a	g	0.1282	0.0103	0.1193	0.1626	0.0245	0.0137	0.0745	++-+-	0.0	2.668	4	0.6148
15 : 47552814 : SNP	a	g	0.9578	0.0142	0.9404	0.9696	-0.0534	0.0272	0.04959	-??+-	29.1	2.822	2	0.2439
19 : 16119001 : SNP	a	g	0.0651	0.0058	0.0502	0.0696	-0.0099	0.0186	0.5942	--??-	0.0	0.650	2	0.7224
12 : 29059802 : SNP	t	c	0.0239	0.0000	0.0239	0.0239	0.0400	0.0394	0.3103	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 32644353 : SNP	a	g	0.0371	0.0034	0.0325	0.0396	-0.0076	0.0268	0.7777	+-???	0.0	0.232	1	0.63
2 : 128771994 : SNP	t	c	0.3435	0.0073	0.3368	0.3622	0.0209	0.0109	0.05506	+++-+	0.0	1.237	4	0.872
7 : 16624640 : SNP	a	g	0.0468	0.0004	0.0463	0.0472	0.0216	0.0244	0.3776	0+???	17.2	1.207	1	0.2718
6 : 160596712 : SNP	t	g	0.3784	0.0058	0.3725	0.4064	0.0023	0.0086	0.7921	++++-	74.0	15.372	4	0.003988
2 : 142889421 : INDEL	d	r	0.0389	0.0003	0.0385	0.0391	0.0241	0.0283	0.3941	++???	0.0	0.935	1	0.3334
9 : 123595114 : INDEL	d	r	0.1492	0.0088	0.1356	0.1557	-0.0206	0.0122	0.09249	--+-+	0.0	3.146	4	0.5336
11 : 20367596 : SNP	t	c	0.0154	0.0000	0.0154	0.0154	0.0750	0.0596	0.2086	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 124870596 : SNP	t	c	0.3086	0.0154	0.2836	0.3191	0.0113	0.0094	0.2293	++---	46.5	7.472	4	0.1129
3 : 82452328 : SNP	a	g	0.7995	0.0113	0.7845	0.8283	-0.0119	0.0106	0.2595	-+---	0.0	1.530	4	0.8213
3 : 150823744 : SNP	c	g	0.3252	0.0055	0.3214	0.3435	-0.0134	0.0092	0.1416	--++-	0.0	0.628	4	0.9599
2 : 45865972 : SNP	a	g	0.0241	0.0000	0.0241	0.0241	-0.0320	0.0546	0.5577	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 63494738 : SNP	t	g	0.1806	0.0154	0.1572	0.2084	-0.0129	0.0114	0.2582	-----	0.0	0.275	4	0.9914
13 : 20652106 : SNP	t	c	0.0534	0.0023	0.0516	0.0567	-0.0347	0.0199	0.08189	--??+	58.2	4.784	2	0.09144
21 : 24517874 : SNP	t	g	0.4817	0.0053	0.4577	0.4857	-0.0142	0.0085	0.09672	---++	0.0	3.527	4	0.4738
16 : 28631585 : SNP	t	g	0.3733	0.0135	0.3243	0.3823	-0.0025	0.0093	0.7909	--++?	0.0	2.430	3	0.488
3 : 17761826 : SNP	t	c	0.0579	0.0091	0.0494	0.0735	0.0438	0.0212	0.03922	++?-+	0.0	1.322	3	0.7239
12 : 59214607 : SNP	t	c	0.3791	0.0169	0.3424	0.3896	0.0089	0.0086	0.3032	++--+	29.3	5.657	4	0.2262
1 : 100926901 : SNP	t	c	0.1959	0.0052	0.1871	0.2076	0.0092	0.0112	0.4093	--+++	76.7	17.191	4	0.001775
6 : 35227832 : SNP	t	c	0.1389	0.0099	0.1231	0.1470	-0.0008	0.0123	0.9481	-++--	62.3	10.623	4	0.03115
12 : 33429292 : SNP	t	g	0.0306	0.0016	0.0286	0.0319	-0.0585	0.0285	0.04031	--???	37.1	1.590	1	0.2073
5 : 148043753 : SNP	t	c	0.4043	0.0030	0.3984	0.4081	0.0054	0.0085	0.5266	+++--	0.0	3.652	4	0.4551
21 : 47265786 : SNP	a	g	0.0569	0.0068	0.0535	0.0772	0.0060	0.0193	0.7564	+-?++	0.0	2.452	3	0.484
8 : 112444900 : SNP	t	c	0.8521	0.0147	0.8435	0.8850	-0.0061	0.0122	0.6168	-++-+	57.4	9.398	4	0.05188
10 : 29898431 : SNP	t	c	0.0993	0.0075	0.0897	0.1122	0.0174	0.0145	0.2309	++-+-	0.0	1.123	4	0.8906
6 : 29092579 : SNP	c	g	0.4822	0.0435	0.3844	0.5059	0.0065	0.0181	0.7185	??--+	36.3	3.138	2	0.2083
5 : 4879336 : SNP	c	g	0.0579	0.0021	0.0552	0.0608	0.0270	0.0197	0.171	++??+	0.0	0.025	2	0.9875
3 : 113919489 : SNP	a	g	0.0309	0.0001	0.0308	0.0311	-0.0461	0.0292	0.1147	-+???	50.7	2.030	1	0.1542
2 : 45630658 : SNP	a	g	0.0563	0.0202	0.0413	0.0950	0.0083	0.0198	0.6769	++?-+	0.0	0.896	3	0.8265
5 : 124702082 : SNP	c	g	0.0591	0.0024	0.0567	0.0618	0.0024	0.0185	0.8946	++?+-	0.0	1.572	3	0.6658
10 : 12069476 : SNP	a	g	0.8313	0.0168	0.8027	0.8463	-0.0047	0.0115	0.6822	-++-+	0.0	1.746	4	0.7823
6 : 5133916 : SNP	t	c	0.3759	0.0186	0.3357	0.3920	0.0025	0.0086	0.771	-++++	0.0	1.012	4	0.9079
8 : 121825293 : SNP	a	t	0.9315	0.0113	0.9106	0.9392	0.0008	0.0184	0.9667	-+?-+	38.1	4.845	3	0.1835
6 : 162580545 : SNP	t	g	0.9722	0.0000	0.9722	0.9722	0.0860	0.0465	0.06439	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 81517158 : SNP	a	g	0.8407	0.0069	0.8191	0.8488	0.0119	0.0119	0.3199	++++-	0.0	2.347	4	0.6723
16 : 16920941 : SNP	a	g	0.6301	0.0123	0.6161	0.6427	-0.0116	0.0091	0.2011	-----	0.0	2.006	4	0.7347
2 : 105908061 : SNP	a	g	0.0436	0.0001	0.0435	0.0436	-0.0161	0.0237	0.498	-+???	32.0	1.471	1	0.2251
12 : 43327157 : SNP	a	g	0.1485	0.0158	0.1387	0.1888	-0.0058	0.0118	0.6239	--+++	0.0	1.665	4	0.7971
3 : 110965554 : SNP	a	g	0.1546	0.0057	0.1505	0.1631	-0.0197	0.0117	0.09243	----+	40.8	6.759	4	0.1492
4 : 117716133 : SNP	t	g	0.7630	0.0064	0.7436	0.7674	0.0052	0.0100	0.6019	++--+	0.0	2.374	4	0.6673
9 : 8971756 : SNP	t	g	0.3515	0.0106	0.3294	0.3607	-0.0006	0.0089	0.9448	-++--	0.0	3.906	4	0.4189
6 : 1353844 : SNP	a	g	0.9041	0.0118	0.8869	0.9186	-0.0006	0.0171	0.9697	+--+-	0.0	3.153	4	0.5326
3 : 171221253 : SNP	a	g	0.2343	0.0095	0.2178	0.2469	0.0085	0.0104	0.4112	+-++-	0.0	2.071	4	0.7228
7 : 52884986 : SNP	a	t	0.2734	0.0156	0.2393	0.3123	0.0050	0.0097	0.6043	+-+--	25.7	5.385	4	0.25
1 : 95198777 : SNP	c	g	0.3398	0.0132	0.3284	0.3650	-0.0043	0.0098	0.6617	+--+-	0.0	2.397	4	0.6631
6 : 77392558 : SNP	a	t	0.0269	0.0000	0.0269	0.0269	-0.0250	0.0516	0.6277	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 84223443 : SNP	a	g	0.9594	0.0000	0.9594	0.9594	0.0090	0.0495	0.8558	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 9853645 : SNP	a	c	0.1416	0.0078	0.1117	0.1454	0.0050	0.0123	0.6853	-+-++	45.5	7.340	4	0.119
2 : 63449561 : SNP	a	g	0.8633	0.0127	0.8561	0.8927	-0.0166	0.0128	0.196	-----	0.0	3.896	4	0.4202
4 : 113651509 : SNP	t	c	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	0.0440	0.0586	0.453	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 12800929 : INDEL	d	r	0.2628	0.0097	0.2509	0.2772	0.0010	0.0098	0.9197	-+--+	0.0	3.084	4	0.5438
4 : 66888267 : SNP	a	g	0.7717	0.0022	0.7670	0.7803	-0.0138	0.0100	0.1685	--+--	0.0	1.924	4	0.7498
12 : 41183195 : INDEL	d	r	0.9185	0.0021	0.9156	0.9200	0.0010	0.0253	0.9672	?+??-	52.3	2.096	1	0.1477
5 : 20377305 : SNP	a	g	0.1856	0.0097	0.1605	0.1963	-0.0088	0.0108	0.4137	-+---	57.8	9.486	4	0.05003
19 : 1527772 : SNP	a	g	0.2760	0.0060	0.2711	0.3010	-0.0052	0.0102	0.6101	-++-+	20.6	5.037	4	0.2835
3 : 57412195 : SNP	a	g	0.2303	0.0060	0.2244	0.2426	0.0097	0.0100	0.3305	+-+++	0.0	2.128	4	0.7123
6 : 169665049 : SNP	t	c	0.2115	0.0104	0.2055	0.2322	-0.0048	0.0106	0.6478	-++--	19.7	4.983	4	0.289
3 : 87087905 : SNP	a	g	0.2380	0.0223	0.2136	0.2904	-0.0083	0.0103	0.4232	-++--	0.0	3.198	4	0.5253
9 : 15740061 : SNP	t	g	0.0505	0.0088	0.0437	0.0698	0.0355	0.0203	0.08029	++?++	0.0	0.773	3	0.856
2 : 47238254 : SNP	a	g	0.0445	0.0117	0.0369	0.0634	-0.0074	0.0218	0.7354	--?-+	0.0	0.256	3	0.9681
1 : 43013503 : SNP	t	c	0.1722	0.0225	0.1548	0.2174	0.0081	0.0113	0.4724	-+-++	0.0	2.340	4	0.6736
22 : 49168973 : SNP	t	g	0.0362	0.0010	0.0343	0.0375	0.0413	0.0233	0.07659	++??+	0.0	0.681	2	0.7112
10 : 130094708 : SNP	a	g	0.7996	0.0066	0.7920	0.8134	0.0030	0.0107	0.7794	+---+	0.0	3.721	4	0.4451
12 : 103470245 : SNP	c	g	0.0139	0.0000	0.0139	0.0139	0.0070	0.0536	0.896	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 98550938 : SNP	t	c	0.9228	0.0099	0.9147	0.9413	0.0069	0.0194	0.7234	+-?+-	0.0	0.877	3	0.8309
4 : 19579081 : SNP	a	g	0.3816	0.0132	0.3551	0.3936	-0.0133	0.0086	0.1215	+-+--	54.5	8.798	4	0.06636
10 : 113727534 : SNP	a	c	0.4295	0.0160	0.4164	0.4643	-0.0137	0.0089	0.1261	----+	1.9	4.079	4	0.3954
2 : 116251448 : SNP	t	c	0.2754	0.0112	0.2616	0.2920	-0.0047	0.0098	0.6317	--+-+	37.7	6.421	4	0.1699
14 : 28958393 : SNP	a	c	0.0252	0.0000	0.0252	0.0252	0.0030	0.0384	0.9377	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 25854960 : SNP	a	g	0.8837	0.0085	0.8657	0.8901	0.0032	0.0136	0.8128	+-+++	24.0	5.266	4	0.2611
6 : 44253617 : SNP	t	c	0.8079	0.0158	0.7853	0.8314	0.0084	0.0107	0.4324	+-+-+	0.0	1.744	4	0.7826
6 : 136013534 : SNP	t	c	0.6257	0.0086	0.6105	0.6338	-0.0095	0.0090	0.2917	-+---	8.4	4.368	4	0.3585
3 : 2491076 : SNP	a	g	0.6272	0.0066	0.6210	0.6406	-0.0006	0.0087	0.9463	+---+	25.9	5.399	4	0.2488
19 : 31885009 : SNP	a	g	0.0891	0.0099	0.0832	0.1111	0.0315	0.0156	0.04359	+++++	0.0	1.110	4	0.8927
6 : 159573610 : SNP	a	c	0.8749	0.0194	0.8565	0.9259	-0.0129	0.0135	0.3392	+-+--	0.0	3.506	4	0.477
17 : 1519097 : SNP	a	g	0.4645	0.0284	0.4017	0.5078	0.0121	0.0111	0.2748	+-+++	39.3	6.593	4	0.159
8 : 107038617 : SNP	a	c	0.0777	0.0059	0.0659	0.0839	-0.0308	0.0171	0.07187	--?--	0.0	2.784	3	0.4262
2 : 78793879 : SNP	a	g	0.2286	0.0132	0.2131	0.2669	-0.0029	0.0104	0.7827	--+-+	33.0	5.971	4	0.2014
15 : 62823187 : SNP	a	g	0.0287	0.0010	0.0278	0.0299	0.0172	0.0285	0.5456	++???	0.0	0.024	1	0.8762
6 : 130455899 : SNP	c	g	0.3558	0.0062	0.3428	0.3598	-0.0033	0.0091	0.7149	---++	0.0	2.240	4	0.6918
8 : 104431403 : SNP	t	c	0.0845	0.0025	0.0815	0.0876	0.0013	0.0155	0.9344	++---	61.3	10.325	4	0.0353
9 : 139024724 : SNP	t	c	0.2099	0.0066	0.2044	0.2292	0.0068	0.0112	0.5423	++++-	0.0	2.687	4	0.6114
7 : 22835787 : SNP	a	g	0.2226	0.0123	0.2120	0.2590	0.0048	0.0106	0.6491	-+-++	38.8	6.536	4	0.1625
3 : 110145731 : SNP	a	g	0.7331	0.0040	0.7211	0.7406	0.0093	0.0098	0.3441	+0+++	0.0	1.818	4	0.7692
8 : 113799262 : SNP	t	c	0.7513	0.0033	0.7426	0.7551	0.0246	0.0103	0.01725	+++++	0.0	1.705	4	0.7898
10 : 119749223 : SNP	t	c	0.0360	0.0016	0.0352	0.0395	-0.0452	0.0244	0.06434	-+??-	32.8	2.976	2	0.2258
4 : 142917294 : INDEL	d	r	0.0850	0.0066	0.0716	0.0936	-0.0067	0.0155	0.6655	-+-+-	0.0	0.733	4	0.9473
15 : 54772611 : SNP	a	c	0.6325	0.0079	0.6252	0.6588	0.0127	0.0091	0.1621	++---	41.4	6.830	4	0.1452
9 : 17152143 : SNP	t	c	0.8865	0.0109	0.8695	0.9063	0.0141	0.0135	0.2955	++--+	0.0	0.906	4	0.9236
21 : 18893097 : SNP	t	c	0.7901	0.0099	0.7837	0.8221	-0.0191	0.0106	0.07049	-+---	0.0	2.625	4	0.6224
3 : 175140535 : SNP	a	c	0.8956	0.0036	0.8919	0.9092	0.0251	0.0139	0.07152	++-++	25.0	5.335	4	0.2547
18 : 9006849 : SNP	t	g	0.0478	0.0008	0.0468	0.0484	0.0043	0.0244	0.8593	+-???	63.1	2.711	1	0.09969
9 : 86542206 : SNP	a	g	0.8707	0.0056	0.8606	0.8792	0.0186	0.0127	0.1417	+0+++	0.0	1.934	4	0.7478
12 : 125812122 : SNP	t	c	0.6239	0.0362	0.5364	0.6611	-0.0033	0.0091	0.7191	--++-	43.4	7.066	4	0.1324
2 : 116998711 : SNP	a	g	0.0832	0.0036	0.0725	0.0876	-0.0097	0.0156	0.5365	--+--	0.0	1.248	4	0.8701
2 : 42892535 : INDEL	d	r	0.6931	0.0061	0.6783	0.7170	-0.0209	0.0092	0.02269	---+-	0.0	1.940	4	0.7468
4 : 60945221 : SNP	a	t	0.9554	0.0041	0.9516	0.9653	-0.0339	0.0218	0.1199	--??+	45.1	3.642	2	0.1618
3 : 161913179 : INDEL	i	r	0.0192	0.0000	0.0192	0.0192	-0.0260	0.0445	0.5588	-????	0.0	0.000	0	1
21 : 20438823 : SNP	a	g	0.9242	0.0032	0.9223	0.9320	0.0101	0.0166	0.5454	0+??+	0.0	0.516	2	0.7725
1 : 33360343 : SNP	a	g	0.0309	0.0014	0.0298	0.0327	-0.0037	0.0283	0.8966	+-???	20.7	1.260	1	0.2616
10 : 103281994 : INDEL	d	r	0.0761	0.0076	0.0554	0.0802	0.0059	0.0163	0.7151	-+?-+	0.0	1.668	3	0.6441
18 : 75154059 : SNP	a	g	0.6497	0.0136	0.6316	0.6960	-0.0024	0.0091	0.7949	-0+++	0.0	2.179	4	0.7029
1 : 34264138 : SNP	a	g	0.9333	0.0132	0.9063	0.9405	0.0098	0.0196	0.6158	++?-+	0.0	1.334	3	0.7212
1 : 198200311 : SNP	t	g	0.1060	0.0115	0.0979	0.1304	-0.0023	0.0140	0.8693	+--+-	23.7	5.244	4	0.2632
4 : 80832499 : SNP	a	g	0.0969	0.0162	0.0840	0.1347	0.0134	0.0147	0.361	-++++	0.0	1.540	4	0.8196
5 : 132227677 : SNP	a	g	0.0921	0.0029	0.0894	0.0968	0.0084	0.0150	0.5767	-++-+	31.7	5.860	4	0.2099
6 : 118417193 : SNP	a	g	0.7869	0.0081	0.7747	0.7972	-0.0074	0.0105	0.4786	+--+-	41.1	6.793	4	0.1472
18 : 14683411 : SNP	c	g	0.7317	0.0081	0.7240	0.7478	-0.0046	0.0209	0.8272	??++-	38.3	3.239	2	0.198
9 : 36928389 : SNP	a	c	0.5458	0.0091	0.5263	0.5541	0.0105	0.0085	0.2173	++-+-	0.0	3.124	4	0.5372
7 : 131471196 : INDEL	i	r	0.7027	0.0125	0.6655	0.7171	-0.0085	0.0097	0.3824	--++-	0.0	3.173	4	0.5293
16 : 66822466 : SNP	t	c	0.4271	0.0226	0.4079	0.4703	0.0060	0.0086	0.4857	+++++	0.0	0.341	4	0.987
8 : 17868219 : SNP	t	c	0.0819	0.0073	0.0758	0.0998	-0.0016	0.0165	0.9235	+-++-	59.8	9.957	4	0.04115
7 : 110007612 : SNP	a	c	0.9784	0.0000	0.9784	0.9784	-0.0170	0.0445	0.7023	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 71312469 : SNP	a	t	0.3880	0.0095	0.3809	0.4103	0.0136	0.0085	0.1111	++++-	0.0	3.176	4	0.5289
3 : 126983447 : SNP	t	c	0.1443	0.0084	0.1229	0.1517	0.0021	0.0122	0.866	+-+--	46.0	7.404	4	0.116
19 : 33098632 : SNP	c	g	0.5596	0.0260	0.4516	0.5861	-0.0086	0.0086	0.3128	--+-+	33.5	6.016	4	0.198
9 : 75948703 : SNP	t	c	0.0280	0.0012	0.0263	0.0288	-0.0023	0.0296	0.9387	+-???	30.1	1.432	1	0.2315
3 : 45765748 : SNP	a	g	0.1276	0.0080	0.1098	0.1323	-0.0127	0.0127	0.3177	-++--	71.7	14.141	4	0.006857
18 : 61458169 : SNP	a	t	0.0228	0.0000	0.0228	0.0228	-0.0310	0.0414	0.4545	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 53593297 : SNP	a	g	0.0650	0.0051	0.0606	0.0761	-0.0112	0.0176	0.5244	-+?--	0.0	2.778	3	0.4272
6 : 33035143 : SNP	c	g	0.2102	0.0236	0.1555	0.2304	-0.0536	0.0227	0.01805	??---	0.0	0.558	2	0.7567
1 : 65662117 : SNP	t	c	0.7006	0.0104	0.6902	0.7213	0.0043	0.0098	0.6629	-++++	0.0	2.047	4	0.7271
15 : 73248544 : SNP	t	c	0.7834	0.0066	0.7702	0.7905	0.0070	0.0104	0.5025	++-++	0.0	2.604	4	0.6261
12 : 70955961 : SNP	a	g	0.1633	0.0129	0.1315	0.1714	0.0036	0.0125	0.7702	+--++	25.0	5.332	4	0.2549
18 : 8571754 : SNP	t	g	0.7171	0.0039	0.7092	0.7238	-0.0084	0.0094	0.3692	-+---	0.0	1.365	4	0.8502
19 : 31874910 : SNP	t	c	0.4528	0.0207	0.4408	0.5171	0.0162	0.0085	0.05723	+++++	0.0	2.315	4	0.678
5 : 95954309 : SNP	a	g	0.7021	0.0080	0.6967	0.7265	0.0053	0.0093	0.5646	-+-+-	23.0	5.196	4	0.2677
9 : 2089913 : SNP	c	g	0.9190	0.0096	0.9150	0.9441	-0.0213	0.0164	0.1931	-+?--	0.0	1.689	3	0.6394
4 : 119200594 : SNP	t	c	0.8589	0.0057	0.8355	0.8625	-0.0068	0.0125	0.5888	+-+--	30.6	5.761	4	0.2177
13 : 40408335 : SNP	t	c	0.0211	0.0000	0.0211	0.0211	0.0110	0.0435	0.8002	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 65623182 : INDEL	d	r	0.0799	0.0157	0.0659	0.1174	-0.0013	0.0189	0.9471	+-?-+	84.0	18.791	3	0.000302
1 : 248559096 : SNP	c	g	0.1197	0.0170	0.1083	0.1508	-0.0216	0.0282	0.444	??---	0.0	0.099	2	0.9517
16 : 6686776 : SNP	a	t	0.1935	0.0169	0.1670	0.2078	0.0152	0.0150	0.3121	+---+	27.2	5.494	4	0.2402
6 : 49425521 : SNP	t	c	0.6143	0.0243	0.5628	0.6270	0.0059	0.0090	0.5168	0++++	0.0	1.607	4	0.8075
7 : 12088138 : SNP	t	c	0.9187	0.0055	0.9109	0.9276	-0.0194	0.0161	0.2301	--?--	0.0	0.300	3	0.96
12 : 8693689 : SNP	t	g	0.4402	0.0168	0.4302	0.4748	-0.0145	0.0085	0.08916	--++-	0.0	3.441	4	0.4869
10 : 25099979 : SNP	c	g	0.9849	0.0000	0.9849	0.9849	0.1090	0.0536	0.0419	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 94489996 : SNP	c	g	0.1365	0.0181	0.1192	0.1724	-0.0099	0.0125	0.4296	-+---	0.0	1.051	4	0.9019
2 : 134948050 : SNP	t	c	0.9775	0.0000	0.9775	0.9775	0.0280	0.0435	0.5195	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 38107306 : SNP	c	g	0.4284	0.0164	0.4159	0.4617	0.0181	0.0095	0.05724	++-++	0.0	1.713	4	0.7884
19 : 20786252 : SNP	a	g	0.8941	0.0094	0.8820	0.9064	-0.0087	0.0163	0.5952	+---+	0.0	3.591	4	0.4641
6 : 37841185 : SNP	t	c	0.6085	0.0311	0.5928	0.7022	-0.0072	0.0086	0.406	+---+	6.6	4.282	4	0.3691
14 : 81086804 : SNP	t	c	0.8772	0.0059	0.8730	0.8907	-0.0023	0.0129	0.8602	--++-	0.0	0.984	4	0.9122
2 : 46286046 : SNP	a	g	0.7172	0.0102	0.6859	0.7268	0.0037	0.0098	0.705	++-+-	10.3	4.460	4	0.3474
7 : 44059926 : INDEL	d	r	0.1214	0.0021	0.1174	0.1240	-0.0095	0.0158	0.5469	-0++-	0.0	2.047	4	0.7271
3 : 101727374 : SNP	t	c	0.1851	0.0095	0.1672	0.1952	0.0063	0.0111	0.5718	+-+-+	0.0	3.404	4	0.4926
2 : 187096427 : SNP	a	g	0.8949	0.0105	0.8737	0.9011	-0.0088	0.0145	0.5457	+---+	0.0	2.409	4	0.6609
14 : 45700863 : SNP	t	c	0.0176	0.0000	0.0176	0.0176	-0.0040	0.0526	0.9393	-????	0.0	0.000	0	1
22 : 50591455 : SNP	t	c	0.0139	0.0000	0.0139	0.0139	-0.0560	0.0576	0.3311	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 175517602 : SNP	t	c	0.0948	0.0056	0.0776	0.1007	-0.0104	0.0147	0.4814	---0-	0.0	0.054	4	0.9996
12 : 91081434 : SNP	t	c	0.0679	0.0201	0.0528	0.1017	0.0123	0.0186	0.5099	+-?-+	32.9	4.470	3	0.215
17 : 14545847 : SNP	a	c	0.1370	0.0147	0.1217	0.1734	0.0146	0.0123	0.2362	+++++	0.0	3.100	4	0.5413
16 : 631752 : SNP	a	g	0.3871	0.0349	0.3095	0.4101	-0.0038	0.0092	0.6791	+---+	72.7	14.642	4	0.005505
6 : 123738325 : SNP	t	c	0.8483	0.0075	0.8401	0.8728	-0.0039	0.0118	0.7417	-+---	0.0	1.297	4	0.8618
17 : 13354208 : SNP	t	c	0.3990	0.0128	0.3717	0.4067	0.0136	0.0087	0.1171	+++-+	27.7	5.532	4	0.2369
1 : 66130982 : SNP	a	g	0.8104	0.0131	0.7854	0.8210	-0.0001	0.0114	0.9956	++---	42.1	6.914	4	0.1405
8 : 103048115 : SNP	t	c	0.6780	0.0116	0.6447	0.6937	0.0042	0.0092	0.6481	+--++	0.0	3.644	4	0.4564
1 : 112713371 : SNP	t	c	0.3389	0.0058	0.3360	0.3594	0.0141	0.0091	0.1226	+++++	0.0	0.176	4	0.9964
11 : 13020258 : SNP	t	c	0.2725	0.0058	0.2658	0.2870	-0.0093	0.0097	0.34	--++-	65.3	11.538	4	0.02114
2 : 189854348 : SNP	a	t	0.0196	0.0000	0.0196	0.0196	0.0700	0.0455	0.1238	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 197065902 : SNP	t	c	0.6990	0.0089	0.6876	0.7078	0.0180	0.0106	0.08864	++-++	0.0	0.637	4	0.9589
6 : 34103954 : SNP	t	c	0.6145	0.0241	0.5995	0.6830	0.0008	0.0086	0.9296	--++-	0.0	2.170	4	0.7046
5 : 51194135 : INDEL	i	r	0.3315	0.0145	0.2975	0.3430	0.0177	0.0094	0.06028	++--+	0.0	2.400	4	0.6625
1 : 89091336 : SNP	a	g	0.2493	0.0102	0.2212	0.2557	-0.0007	0.0099	0.9432	--+++	9.5	4.421	4	0.352
2 : 76144675 : SNP	t	c	0.9638	0.0004	0.9629	0.9640	-0.0070	0.0238	0.768	-+??-	0.0	1.654	2	0.4374
8 : 20220541 : SNP	a	c	0.6030	0.0084	0.5959	0.6277	0.0085	0.0086	0.3239	++++-	0.0	2.298	4	0.6812
15 : 65569188 : SNP	t	c	0.0268	0.0000	0.0268	0.0268	0.0060	0.0607	0.9212	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 155760742 : SNP	a	c	0.7108	0.0103	0.7019	0.7362	-0.0218	0.0101	0.03066	-----	0.0	1.156	4	0.8852
10 : 27505213 : SNP	t	c	0.9706	0.0000	0.9706	0.9706	-0.0640	0.0374	0.08706	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 30994394 : SNP	a	g	0.0339	0.0057	0.0303	0.0428	0.0056	0.0316	0.8601	-???+	64.3	2.802	1	0.09413
10 : 111828615 : SNP	a	g	0.0377	0.0036	0.0323	0.0411	0.0088	0.0257	0.7319	-+??+	0.0	1.827	2	0.4011
5 : 12478925 : SNP	a	g	0.0377	0.0103	0.0294	0.0575	-0.0264	0.0320	0.4088	-??--	0.0	0.342	2	0.8429
5 : 122374820 : SNP	a	g	0.9621	0.0005	0.9617	0.9627	-0.0087	0.0261	0.7389	-+???	0.0	0.109	1	0.7418
11 : 124196725 : SNP	c	g	0.1068	0.0074	0.0902	0.1136	-0.0041	0.0173	0.8131	--?-+	0.0	0.241	3	0.9707
1 : 21926600 : SNP	a	g	0.2922	0.0226	0.2786	0.3523	0.0029	0.0093	0.7543	0+-+-	26.4	5.436	4	0.2454
1 : 209568355 : SNP	a	t	0.9868	0.0000	0.9868	0.9868	0.0150	0.0617	0.8078	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 88754468 : SNP	a	g	0.0231	0.0000	0.0231	0.0231	-0.0180	0.0475	0.7048	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 118605794 : SNP	t	c	0.2946	0.0052	0.2829	0.3005	0.0075	0.0097	0.4412	+--++	0.0	2.557	4	0.6344
6 : 63299332 : SNP	t	g	0.3827	0.0108	0.3448	0.3924	-0.0090	0.0092	0.3278	--++?	61.3	7.744	3	0.05161
11 : 92306160 : SNP	a	g	0.1228	0.0066	0.1080	0.1324	-0.0005	0.0129	0.9701	---++	12.7	4.582	4	0.3329
16 : 75669266 : SNP	a	g	0.2020	0.0083	0.1972	0.2188	-0.0154	0.0112	0.1699	-----	0.0	0.442	4	0.9789
13 : 104992510 : SNP	t	c	0.2012	0.0107	0.1783	0.2276	-0.0108	0.0106	0.3077	----+	0.0	2.614	4	0.6243
2 : 159091970 : SNP	a	g	0.6109	0.0213	0.5956	0.6651	-0.0038	0.0086	0.6603	-+---	0.0	2.404	4	0.6619
7 : 30590222 : SNP	t	c	0.0753	0.0074	0.0647	0.0814	0.0027	0.0165	0.8682	+-?+-	3.1	3.096	3	0.377
6 : 170538848 : SNP	t	c	0.1235	0.0019	0.1222	0.1262	-0.0210	0.0182	0.2483	-??+-	0.0	1.120	2	0.5712
11 : 98774476 : SNP	a	g	0.2862	0.0159	0.2598	0.3055	0.0103	0.0096	0.2826	+-+++	0.0	1.866	4	0.7603
3 : 127246816 : SNP	t	c	0.8295	0.0164	0.8020	0.8715	-0.0059	0.0113	0.6005	0-+--	18.9	4.935	4	0.294
3 : 190901761 : SNP	t	c	0.0175	0.0000	0.0175	0.0175	0.0110	0.0617	0.8584	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 189111244 : SNP	t	c	0.0486	0.0049	0.0422	0.0570	0.0256	0.0210	0.2212	++??+	0.0	0.667	2	0.7165
4 : 75388031 : SNP	t	c	0.0289	0.0000	0.0289	0.0289	-0.0160	0.0374	0.6688	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 103058695 : SNP	a	c	0.9066	0.0046	0.8977	0.9120	0.0115	0.0151	0.4452	-+?+-	7.4	3.238	3	0.3563
20 : 6348717 : INDEL	d	r	0.0234	0.0089	0.0162	0.0345	-0.0050	0.0401	0.9012	-???+	56.3	2.289	1	0.1303
6 : 47117215 : SNP	t	c	0.1323	0.0035	0.1227	0.1388	0.0096	0.0127	0.4491	+++--	12.6	4.574	4	0.3338
14 : 47020237 : SNP	t	g	0.1703	0.0041	0.1538	0.1749	0.0028	0.0113	0.8077	+-+-+	0.0	3.927	4	0.416
8 : 18646833 : SNP	a	t	0.9480	0.0035	0.9454	0.9575	0.0519	0.0205	0.01128	++??-	65.3	5.771	2	0.05582
9 : 17742186 : SNP	a	g	0.0163	0.0000	0.0163	0.0163	0.0210	0.0485	0.6652	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 42159902 : SNP	a	g	0.1591	0.0092	0.1324	0.1645	-0.0118	0.0116	0.308	--+-+	0.0	2.494	4	0.6456
8 : 108185139 : SNP	a	g	0.0211	0.0000	0.0211	0.0211	0.0620	0.0505	0.2199	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 114032640 : SNP	t	c	0.9594	0.0007	0.9580	0.9599	-0.0185	0.0228	0.4176	+-??+	51.1	4.090	2	0.1294
18 : 69176943 : SNP	a	t	0.1370	0.0155	0.1006	0.1509	-0.0008	0.0123	0.9491	+-+-+	0.0	0.143	4	0.9976
9 : 78191921 : SNP	t	c	0.3345	0.0311	0.2598	0.3700	0.0060	0.0093	0.5187	++--+	0.0	2.615	4	0.6241
7 : 83733381 : SNP	c	g	0.5171	0.0116	0.4860	0.5381	-0.0153	0.0085	0.07266	---++	37.9	6.438	4	0.1687
8 : 135926202 : SNP	a	g	0.7836	0.0183	0.7731	0.8219	-0.0219	0.0106	0.03838	---+-	16.9	4.814	4	0.307
18 : 76497205 : SNP	a	g	0.0417	0.0066	0.0377	0.0629	-0.0094	0.0228	0.6801	-+?-+	37.9	4.830	3	0.1847
8 : 59375193 : SNP	c	g	0.2688	0.0162	0.2196	0.2802	0.0122	0.0099	0.2146	+++-+	22.7	5.177	4	0.2696
13 : 82947989 : SNP	t	g	0.9127	0.0062	0.9056	0.9223	-0.0101	0.0184	0.5827	--?-+	0.0	1.097	3	0.7778
1 : 47106925 : INDEL	i	r	0.2339	0.0209	0.1850	0.2516	-0.0009	0.0100	0.9271	+-++-	0.0	1.414	4	0.8418
5 : 54444983 : SNP	a	g	0.1603	0.0123	0.1228	0.1774	0.0031	0.0116	0.7928	--+++	0.0	3.280	4	0.5121
1 : 45299848 : SNP	a	g	0.8376	0.0161	0.8254	0.8736	-0.0069	0.0116	0.552	-+++-	12.4	4.568	4	0.3346
1 : 189294569 : SNP	a	c	0.0193	0.0000	0.0193	0.0193	0.0680	0.0445	0.1263	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 85100145 : SNP	a	t	0.9865	0.0000	0.9865	0.9865	0.0260	0.0546	0.6339	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 17410052 : SNP	t	g	0.0647	0.0034	0.0617	0.0685	0.0012	0.0265	0.9647	-+???	0.0	0.741	1	0.3892
1 : 145716763 : SNP	a	g	0.4316	0.0301	0.4100	0.5012	-0.0044	0.0096	0.6485	+---+	0.0	2.600	4	0.6268
4 : 6935003 : SNP	t	c	0.0619	0.0020	0.0585	0.0631	-0.0493	0.0329	0.1346	-???-	80.9	5.230	1	0.02221
13 : 76783570 : SNP	a	g	0.0814	0.0117	0.0512	0.0928	0.0116	0.0177	0.513	+-??-	76.9	8.646	2	0.01326
8 : 71997727 : SNP	c	g	0.1658	0.0034	0.1643	0.1795	-0.0035	0.0113	0.7541	--+-+	47.2	7.580	4	0.1082
1 : 108356935 : SNP	t	c	0.9130	0.0086	0.9093	0.9343	0.0054	0.0151	0.7212	-+-+-	0.0	1.153	4	0.8858
6 : 92370325 : SNP	t	c	0.8239	0.0036	0.8157	0.8297	0.0133	0.0113	0.2367	++++-	13.6	4.627	4	0.3277
4 : 110466758 : SNP	a	c	0.9569	0.0041	0.9536	0.9620	0.0038	0.0220	0.8632	--??+	0.0	1.601	2	0.449
2 : 160415752 : SNP	a	t	0.9780	0.0000	0.9780	0.9780	0.1000	0.0414	0.01583	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 94034883 : SNP	t	c	0.8431	0.0146	0.8364	0.8832	-0.0019	0.0122	0.8739	-+++-	0.0	3.895	4	0.4204
2 : 190003488 : SNP	a	c	0.9177	0.0047	0.9064	0.9220	-0.0155	0.0159	0.3298	--?++	0.0	1.546	3	0.6717
2 : 178818029 : SNP	a	g	0.2485	0.0171	0.2391	0.2908	-0.0075	0.0099	0.4474	+-+--	26.0	5.404	4	0.2483
4 : 19420093 : SNP	c	g	0.7087	0.0092	0.6959	0.7171	-0.0091	0.0099	0.357	---+-	0.0	2.810	4	0.5901
7 : 111326482 : SNP	t	c	0.9862	0.0000	0.9862	0.9862	0.0140	0.0526	0.79	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 31375617 : SNP	a	g	0.3472	0.0156	0.3015	0.3704	0.0037	0.0092	0.6868	++---	0.0	2.666	4	0.6153
4 : 32529807 : SNP	a	g	0.9634	0.0027	0.9593	0.9671	-0.0256	0.0238	0.2821	+-??-	28.1	2.782	2	0.2489
2 : 111855882 : SNP	t	c	0.0148	0.0000	0.0148	0.0148	0.0430	0.0516	0.4042	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 36541271 : SNP	t	c	0.7204	0.0259	0.6908	0.7688	0.0043	0.0097	0.6552	-+++-	0.0	1.935	4	0.7476
8 : 11222919 : SNP	a	g	0.0473	0.0036	0.0441	0.0534	-0.0239	0.0217	0.2723	--??-	0.0	0.050	2	0.9752
11 : 87534658 : SNP	t	c	0.1646	0.0108	0.1504	0.1979	-0.0060	0.0116	0.6027	++---	0.0	3.200	4	0.5249
3 : 9030014 : SNP	t	c	0.0843	0.0039	0.0790	0.0877	-0.0279	0.0167	0.09454	--?-+	0.0	0.840	3	0.8398
2 : 143657163 : SNP	a	g	0.5544	0.0102	0.5457	0.5875	-0.0069	0.0085	0.4219	-----	0.0	2.013	4	0.7333
10 : 4892905 : SNP	t	c	0.3375	0.0171	0.3191	0.3803	-0.0034	0.0091	0.7071	+-++-	22.6	5.170	4	0.2703
19 : 15119800 : SNP	t	c	0.7165	0.0099	0.6975	0.7433	-0.0053	0.0099	0.595	-+++-	0.0	2.652	4	0.6177
5 : 2784567 : SNP	t	c	0.9704	0.0000	0.9704	0.9704	-0.0060	0.0516	0.9073	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 80559532 : SNP	a	t	0.3616	0.0127	0.3327	0.3961	0.0042	0.0091	0.6472	-++--	21.1	5.067	4	0.2805
6 : 96494538 : INDEL	i	r	0.0418	0.0029	0.0356	0.0439	-0.0467	0.0236	0.0475	--??+	0.0	1.054	2	0.5902
17 : 13071577 : SNP	t	c	0.0562	0.0048	0.0493	0.0642	0.0330	0.0193	0.08737	++?-+	1.5	3.047	3	0.3845
1 : 188274292 : SNP	a	g	0.4116	0.0172	0.3981	0.4547	-0.0148	0.0090	0.1004	-+-++	77.9	18.133	4	0.001162
17 : 65138859 : INDEL	d	r	0.4821	0.0046	0.4797	0.5016	-0.0047	0.0085	0.5823	+--+-	0.0	0.667	4	0.9553
1 : 171098268 : SNP	a	g	0.7764	0.0195	0.7484	0.8271	-0.0082	0.0102	0.4181	---++	0.0	2.617	4	0.6238
14 : 64500282 : SNP	a	t	0.0263	0.0062	0.0222	0.0357	-0.0191	0.0346	0.5819	-???+	28.4	1.396	1	0.2374
10 : 9999468 : SNP	a	t	0.5375	0.0291	0.4762	0.5954	-0.0037	0.0085	0.6647	-++-+	0.0	3.555	4	0.4696
19 : 18009721 : SNP	a	g	0.7608	0.0073	0.7439	0.7775	-0.0045	0.0105	0.6702	+----	0.0	1.192	4	0.8794
9 : 98708079 : SNP	t	c	0.4361	0.0142	0.4003	0.4452	-0.0010	0.0085	0.9031	+--+-	17.4	4.840	4	0.3041
6 : 38572099 : INDEL	d	r	0.0819	0.0052	0.0667	0.0875	0.0066	0.0155	0.6728	+-+++	10.9	4.491	4	0.3436
3 : 178475940 : SNP	a	g	0.9406	0.0000	0.9406	0.9406	0.0762	0.0624	0.222	????+	0.0	0.000	0	1
11 : 45365538 : SNP	a	g	0.8992	0.0044	0.8942	0.9091	0.0001	0.0142	0.9943	-0+-+	52.6	8.437	4	0.07683
2 : 177205860 : SNP	t	c	0.0159	0.0000	0.0159	0.0159	-0.0270	0.0526	0.6075	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 112732692 : SNP	t	g	0.4137	0.0278	0.3565	0.4403	0.0027	0.0086	0.7493	-++++	0.0	2.332	4	0.6749
7 : 12728862 : SNP	c	g	0.9271	0.0050	0.9240	0.9383	0.0219	0.0180	0.222	++?+-	10.3	3.343	3	0.3417
6 : 45011154 : SNP	a	g	0.9081	0.0147	0.8819	0.9240	-0.0063	0.0152	0.6807	-++--	0.0	3.104	4	0.5406
4 : 44168708 : SNP	t	c	0.9511	0.0051	0.9488	0.9658	-0.0232	0.0208	0.2654	--??+	36.8	3.164	2	0.2056
6 : 31228868 : SNP	t	c	0.2102	0.0183	0.1869	0.2381	0.0014	0.0154	0.9296	++-+-	40.2	6.684	4	0.1536
10 : 69952035 : SNP	a	c	0.0996	0.0104	0.0860	0.1086	0.0098	0.0175	0.5736	+-??+	0.0	1.018	2	0.6012
1 : 95164465 : SNP	t	c	0.5276	0.0147	0.5198	0.5660	-0.0144	0.0085	0.09275	-----	0.0	3.458	4	0.4842
13 : 42773322 : SNP	a	c	0.7405	0.0062	0.7347	0.7529	0.0076	0.0100	0.4456	+++-+	0.0	0.204	4	0.9951
5 : 114045342 : SNP	t	c	0.9675	0.0024	0.9629	0.9695	-0.0163	0.0252	0.5173	--??-	0.0	0.228	2	0.8922
1 : 83901256 : SNP	a	g	0.5605	0.0098	0.5521	0.5778	0.0099	0.0097	0.3051	++--+	0.0	3.523	4	0.4744
2 : 71324220 : SNP	t	c	0.1217	0.0153	0.0946	0.1504	-0.0031	0.0134	0.8193	-+++-	0.0	1.457	4	0.8342
4 : 145141188 : SNP	a	g	0.3878	0.0031	0.3790	0.3906	-0.0011	0.0086	0.8999	-+---	0.0	2.697	4	0.6098
7 : 144490523 : SNP	a	g	0.9387	0.0050	0.9280	0.9413	0.0120	0.0212	0.5708	-+??+	0.0	0.905	2	0.6359
3 : 28397119 : SNP	c	g	0.4931	0.0317	0.4564	0.5515	-0.0138	0.0091	0.1277	--+-+	17.4	4.843	4	0.3038
10 : 56142041 : SNP	t	c	0.9589	0.0014	0.9579	0.9608	0.0144	0.0246	0.5571	+-???	0.0	0.233	1	0.6296
20 : 5486579 : SNP	a	g	0.2020	0.0070	0.1966	0.2167	-0.0107	0.0112	0.3412	-+-+-	0.0	3.780	4	0.4366
1 : 158616035 : INDEL	d	r	0.0425	0.0000	0.0425	0.0425	0.0750	0.0323	0.02042	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 36203846 : SNP	a	g	0.3353	0.0175	0.3057	0.3542	-0.0036	0.0096	0.7046	+-+--	36.6	6.313	4	0.177
2 : 121180803 : SNP	a	g	0.1489	0.0095	0.1355	0.1832	0.0002	0.0123	0.984	+--++	0.0	3.071	4	0.5461
4 : 169821659 : INDEL	d	r	0.0122	0.0000	0.0122	0.0122	-0.0400	0.0637	0.5299	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 53761674 : SNP	t	g	0.0446	0.0013	0.0413	0.0454	-0.0103	0.0227	0.6503	--??+	0.0	1.674	2	0.433
14 : 36410712 : SNP	t	c	0.8231	0.0062	0.8138	0.8320	0.0240	0.0120	0.04659	++++-	0.0	2.743	4	0.6017
7 : 108999186 : SNP	a	g	0.0739	0.0140	0.0640	0.0988	0.0094	0.0162	0.564	+-+++	0.0	1.769	4	0.7781
11 : 21141994 : SNP	t	g	0.1622	0.0151	0.1278	0.1731	0.0072	0.0117	0.5363	+++--	0.0	1.850	4	0.7634
20 : 44031241 : SNP	a	g	0.2318	0.0107	0.2192	0.2546	0.0230	0.0100	0.02134	+++-+	11.5	4.521	4	0.3401
4 : 16407072 : SNP	t	c	0.8612	0.0051	0.8506	0.8691	-0.0126	0.0143	0.3776	+-+--	0.0	2.635	4	0.6206
1 : 233579736 : SNP	a	g	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	-0.0210	0.0596	0.7248	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 34282757 : SNP	c	g	0.5771	0.0166	0.5571	0.6106	-0.0077	0.0085	0.3683	---++	0.0	3.751	4	0.4408
9 : 79996558 : SNP	t	c	0.3179	0.0121	0.2956	0.3291	0.0106	0.0092	0.2471	++-+-	0.0	3.203	4	0.5244
15 : 33051810 : SNP	a	g	0.3289	0.0195	0.3183	0.3800	-0.0038	0.0091	0.6771	+---+	0.0	3.275	4	0.5129
21 : 24968912 : SNP	a	g	0.9737	0.0083	0.9629	0.9800	-0.0027	0.0369	0.9423	-???+	0.0	0.007	1	0.9344
3 : 164182131 : SNP	t	g	0.3554	0.0116	0.3332	0.3655	0.0177	0.0091	0.05292	+0+++	34.9	6.148	4	0.1884
1 : 14059111 : SNP	t	c	0.9806	0.0000	0.9806	0.9806	0.0310	0.0435	0.4757	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 107565776 : SNP	t	g	0.8054	0.0069	0.7906	0.8190	-0.0058	0.0106	0.5832	--++-	0.0	2.749	4	0.6007
13 : 47737637 : SNP	c	g	0.9804	0.0000	0.9804	0.9804	0.0030	0.0445	0.9462	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 79489783 : SNP	t	g	0.1089	0.0119	0.0966	0.1302	0.0020	0.0139	0.8877	-+++-	57.6	9.423	4	0.05135
3 : 183202911 : SNP	a	g	0.8876	0.0037	0.8845	0.9014	-0.0013	0.0137	0.9271	+---+	0.0	0.530	4	0.9705
18 : 52873938 : INDEL	d	r	0.0562	0.0033	0.0488	0.0587	0.0117	0.0186	0.5296	+-?++	1.4	3.044	3	0.3849
1 : 209209163 : INDEL	d	r	0.4615	0.0107	0.4370	0.4747	0.0008	0.0091	0.9293	-++-+	1.6	4.065	4	0.3972
9 : 28173138 : SNP	t	c	0.5931	0.0075	0.5832	0.6038	0.0004	0.0086	0.9648	---++	0.0	3.045	4	0.5503
13 : 21701590 : SNP	a	g	0.0677	0.0019	0.0657	0.0703	-0.0009	0.0178	0.961	-+?+-	0.0	1.106	3	0.7756
20 : 39915589 : INDEL	d	r	0.3841	0.0030	0.3778	0.3894	0.0036	0.0089	0.6814	++++-	41.5	6.842	4	0.1444
20 : 46464342 : SNP	t	g	0.9111	0.0038	0.9089	0.9175	0.0041	0.0296	0.8898	+???-	0.0	0.933	1	0.3341
13 : 108279790 : SNP	t	c	0.6506	0.0053	0.6462	0.6621	-0.0041	0.0091	0.6564	-+++-	9.9	4.441	4	0.3496
10 : 7399607 : SNP	a	c	0.2403	0.0177	0.2264	0.2754	0.0025	0.0100	0.8058	+---+	0.0	3.908	4	0.4186
15 : 100290339 : SNP	t	c	0.3275	0.0136	0.3058	0.3386	-0.0114	0.0143	0.4269	--+-+	0.0	1.099	4	0.8945
4 : 151199080 : SNP	a	g	0.2779	0.0117	0.2330	0.2842	0.0010	0.0094	0.9137	++-+-	0.0	2.667	4	0.6151
11 : 99649024 : SNP	c	g	0.6793	0.0073	0.6643	0.6945	0.0080	0.0091	0.382	++--+	0.0	1.888	4	0.7564
10 : 7943692 : SNP	t	g	0.9861	0.0000	0.9861	0.9861	0.0320	0.0505	0.5267	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 17664951 : SNP	a	g	0.1547	0.0092	0.1462	0.1732	0.0222	0.0121	0.0668	++-+-	0.0	3.599	4	0.463
4 : 178881319 : SNP	c	g	0.4836	0.0126	0.4682	0.5045	0.0125	0.0085	0.1414	+-+++	75.9	16.574	4	0.002338
3 : 177527363 : SNP	a	g	0.5880	0.0092	0.5569	0.5983	0.0128	0.0087	0.1395	+++-+	1.9	4.078	4	0.3956
5 : 100635462 : SNP	t	c	0.9776	0.0074	0.9675	0.9830	0.0096	0.0376	0.7992	+???-	24.2	1.320	1	0.2506
19 : 9997238 : SNP	t	c	0.7199	0.0075	0.7113	0.7470	0.0025	0.0093	0.7888	+-+-+	0.0	3.232	4	0.5198
7 : 145380653 : SNP	t	g	0.7092	0.0092	0.6848	0.7198	0.0003	0.0093	0.9771	-++--	0.0	3.878	4	0.4228
9 : 133343744 : SNP	a	g	0.0734	0.0044	0.0696	0.0830	0.0047	0.0168	0.7809	-+?-+	0.0	1.955	3	0.5819
9 : 93674554 : SNP	a	c	0.2366	0.0066	0.2314	0.2495	0.0102	0.0105	0.3303	++-++	0.0	1.041	4	0.9035
1 : 93248228 : SNP	t	c	0.1050	0.0070	0.0990	0.1148	0.0066	0.0138	0.633	-+-+-	59.6	9.908	4	0.04201
7 : 102838025 : SNP	a	g	0.9377	0.0096	0.9299	0.9554	0.0115	0.0206	0.5745	+0??-	0.0	0.767	2	0.6814
13 : 73386303 : SNP	a	g	0.9856	0.0000	0.9856	0.9856	0.0040	0.0596	0.9465	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 133535898 : INDEL	d	r	0.0558	0.0010	0.0544	0.0566	-0.0293	0.0227	0.1966	--???	30.8	1.446	1	0.2292
2 : 16916674 : SNP	c	g	0.0771	0.0036	0.0737	0.0863	0.0108	0.0167	0.5205	++++-	0.0	2.333	4	0.6749
2 : 170463547 : SNP	t	c	0.8653	0.0173	0.8435	0.8947	0.0071	0.0126	0.5744	+-+-+	14.6	4.683	4	0.3215
1 : 200435300 : SNP	a	c	0.3955	0.0112	0.3625	0.4090	0.0070	0.0086	0.417	-+++-	0.0	1.907	4	0.7528
1 : 86258603 : SNP	a	g	0.6039	0.0102	0.5860	0.6177	-0.0161	0.0086	0.06035	----0	0.0	2.413	4	0.6602
8 : 137285704 : SNP	a	g	0.1195	0.0130	0.1021	0.1507	0.0078	0.0134	0.5599	++-+-	0.0	1.195	4	0.8789
4 : 44984763 : SNP	t	c	0.0330	0.0000	0.0330	0.0330	-0.0360	0.0394	0.3612	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 33903874 : SNP	a	g	0.7626	0.0051	0.7571	0.7755	-0.0069	0.0099	0.486	--++-	0.0	2.906	4	0.5736
8 : 73003919 : SNP	a	c	0.0160	0.0000	0.0160	0.0160	-0.0450	0.0505	0.3733	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 156029964 : SNP	t	c	0.9670	0.0000	0.9670	0.9670	0.0570	0.0475	0.2302	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 86529958 : SNP	a	c	0.9340	0.0035	0.9318	0.9435	0.0134	0.0184	0.4684	+-??+	0.0	0.953	2	0.6208
20 : 17474587 : SNP	a	g	0.0228	0.0000	0.0228	0.0228	0.0140	0.0435	0.7474	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 191562855 : SNP	a	c	0.0247	0.0000	0.0247	0.0247	0.0220	0.0414	0.5955	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 29312301 : SNP	t	c	0.6764	0.0144	0.6635	0.7149	-0.0190	0.0091	0.03792	-----	0.0	1.554	4	0.8171
20 : 48444557 : SNP	t	g	0.2038	0.0045	0.1849	0.2069	-0.0003	0.0105	0.9757	+--+-	23.6	5.237	4	0.2638
6 : 117822251 : SNP	t	c	0.7914	0.0028	0.7850	0.7965	0.0076	0.0106	0.4721	++-+-	0.0	2.268	4	0.6866
14 : 33320452 : SNP	a	g	0.5583	0.0129	0.5482	0.5777	-0.0056	0.0122	0.6457	---++	0.0	1.424	4	0.8401
8 : 20564362 : SNP	t	g	0.1557	0.0090	0.1384	0.1761	-0.0056	0.0118	0.6387	+-++-	28.5	5.594	4	0.2316
5 : 84564913 : INDEL	i	r	0.1740	0.0056	0.1564	0.1833	-0.0063	0.0121	0.5999	+----	0.0	2.408	4	0.6612
11 : 3552766 : SNP	a	g	0.1384	0.0095	0.1315	0.1551	0.0064	0.0315	0.838	??++-	69.0	6.454	2	0.03967
2 : 231967886 : SNP	t	c	0.9650	0.0008	0.9640	0.9656	-0.0069	0.0261	0.7928	--???	0.0	0.035	1	0.8522
8 : 20805609 : SNP	t	c	0.9396	0.0049	0.9283	0.9422	-0.0088	0.0213	0.6788	+-?--	0.0	1.846	3	0.6049
3 : 6408580 : SNP	t	c	0.2597	0.0104	0.2516	0.2840	0.0144	0.0097	0.1392	+++++	0.0	1.899	4	0.7543
3 : 176826581 : SNP	a	g	0.9156	0.0118	0.8929	0.9231	-0.0062	0.0160	0.6986	-+?+-	0.0	2.498	3	0.4757
12 : 63234010 : SNP	a	g	0.7993	0.0038	0.7938	0.8070	0.0107	0.0108	0.3232	-++++	0.0	3.566	4	0.4679
14 : 66968609 : SNP	a	g	0.0425	0.0115	0.0334	0.0649	-0.0198	0.0223	0.3737	--?+-	0.0	1.332	3	0.7216
11 : 7708281 : SNP	a	g	0.8255	0.0232	0.7793	0.8515	0.0150	0.0116	0.1959	-++-+	0.0	3.075	4	0.5454
4 : 162163821 : INDEL	i	r	0.2525	0.0102	0.2436	0.2879	-0.0177	0.0099	0.07496	---++	31.2	5.813	4	0.2136
1 : 171424830 : SNP	t	c	0.0414	0.0000	0.0414	0.0414	-0.0080	0.0394	0.8392	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 111293041 : SNP	a	g	0.4357	0.0090	0.4124	0.4472	0.0115	0.0085	0.1756	++-++	2.3	4.093	4	0.3936
14 : 96297061 : SNP	t	c	0.0515	0.0031	0.0498	0.0601	-0.0255	0.0214	0.2332	--?-+	0.0	1.112	3	0.7742
16 : 1147857 : INDEL	i	r	0.0399	0.0000	0.0399	0.0399	-0.0150	0.0546	0.7835	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 111387819 : SNP	a	g	0.9052	0.0062	0.8923	0.9094	-0.0340	0.0148	0.02127	-----	0.0	3.161	4	0.5312
13 : 34346395 : SNP	a	g	0.0474	0.0064	0.0380	0.0524	-0.0109	0.0225	0.6284	--??+	0.0	1.712	2	0.4249
1 : 205887389 : SNP	a	c	0.1228	0.0199	0.1088	0.1702	0.0022	0.0135	0.8709	--++-	30.8	5.777	4	0.2164
2 : 33412535 : SNP	a	c	0.5300	0.0104	0.4947	0.5452	-0.0107	0.0085	0.2099	----+	0.0	0.418	4	0.981
20 : 61550176 : INDEL	i	r	0.2098	0.0062	0.1911	0.2142	0.0003	0.0106	0.9784	+--+-	14.8	4.697	4	0.3198
1 : 201052312 : SNP	a	c	0.6284	0.0099	0.6202	0.6555	-0.0056	0.0088	0.5211	-+-++	28.4	5.583	4	0.2325
7 : 68446504 : SNP	t	c	0.9733	0.0008	0.9723	0.9740	0.0062	0.0300	0.8364	-+???	74.2	3.870	1	0.04915
14 : 106466372 : SNP	t	c	0.4805	0.0000	0.4805	0.4805	-0.0052	0.0625	0.9337	???-?	0.0	0.000	0	1
13 : 36210456 : SNP	t	c	0.2075	0.0118	0.1841	0.2226	-0.0090	0.0105	0.3909	-+--+	40.8	6.755	4	0.1494
14 : 103799443 : SNP	t	g	0.0390	0.0030	0.0371	0.0439	-0.0207	0.0302	0.4931	-???+	57.5	2.351	1	0.1252
7 : 79035526 : SNP	t	c	0.9732	0.0000	0.9732	0.9732	-0.0150	0.0516	0.7711	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 10346856 : SNP	a	t	0.6817	0.0093	0.6373	0.6855	0.0028	0.0092	0.7573	---++	12.6	4.576	4	0.3336
16 : 12648460 : SNP	a	g	0.1479	0.0043	0.1431	0.1569	-0.0067	0.0121	0.5782	+-++-	0.0	3.366	4	0.4986
3 : 72522025 : SNP	a	g	0.3209	0.0273	0.2795	0.3475	0.0096	0.0109	0.3808	++-++	0.0	0.785	4	0.9404
16 : 62694171 : SNP	a	t	0.9709	0.0000	0.9709	0.9709	-0.0160	0.0384	0.677	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 105648679 : SNP	t	c	0.8817	0.0074	0.8640	0.9018	-0.0080	0.0135	0.552	+--+-	0.0	2.578	4	0.6307
6 : 90845036 : SNP	t	c	0.4823	0.0262	0.4071	0.5283	0.0141	0.0086	0.09914	++++-	29.2	5.652	4	0.2267
19 : 43964028 : SNP	a	g	0.3821	0.0144	0.3701	0.4105	-0.0030	0.0091	0.7422	-+--+	0.0	3.378	4	0.4966
1 : 45268032 : SNP	a	c	0.8325	0.0043	0.8183	0.8358	0.0046	0.0113	0.6844	++---	64.2	11.163	4	0.02479
7 : 46252866 : SNP	a	g	0.2278	0.0115	0.2056	0.2504	-0.0017	0.0105	0.8732	--+-+	30.9	5.787	4	0.2156
7 : 106182055 : SNP	t	c	0.5575	0.0340	0.5329	0.6447	0.0006	0.0086	0.9465	-+-++	0.0	1.098	4	0.8945
2 : 120440725 : SNP	t	c	0.0204	0.0000	0.0204	0.0204	0.0220	0.0435	0.6128	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 45068536 : SNP	t	g	0.0214	0.0000	0.0214	0.0214	0.0030	0.0556	0.957	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 57822932 : SNP	c	g	0.0159	0.0000	0.0159	0.0159	0.0130	0.0505	0.797	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 63890872 : SNP	t	g	0.6122	0.0155	0.5739	0.6214	0.0092	0.0086	0.2813	+++++	0.0	0.961	4	0.9156
15 : 35288694 : INDEL	d	r	0.0334	0.0000	0.0334	0.0334	-0.0320	0.0445	0.4719	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 74424587 : SNP	t	c	0.4593	0.0116	0.4487	0.4873	-0.0007	0.0085	0.937	+--++	27.0	5.477	4	0.2418
5 : 106085916 : SNP	t	g	0.7018	0.0085	0.6896	0.7147	-0.0147	0.0093	0.1136	-----	0.0	1.684	4	0.7935
1 : 94394049 : SNP	a	g	0.9874	0.0000	0.9874	0.9874	0.0250	0.0566	0.6588	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 144517892 : SNP	a	g	0.9159	0.0094	0.9077	0.9300	-0.0180	0.0174	0.3024	+-?+-	38.4	4.872	3	0.1814
2 : 119403722 : SNP	t	c	0.2522	0.0111	0.2095	0.2583	0.0085	0.0099	0.3877	++---	29.3	5.658	4	0.2262
8 : 113734518 : INDEL	i	r	0.4301	0.0118	0.4180	0.4435	-0.0191	0.0091	0.03555	0----	41.9	6.887	4	0.142
5 : 77529174 : SNP	c	g	0.7682	0.0108	0.7624	0.7947	0.0008	0.0101	0.9381	+-+--	8.3	4.362	4	0.3592
10 : 72431438 : SNP	a	g	0.9041	0.0037	0.9010	0.9099	-0.0074	0.0149	0.62	+-+--	0.0	2.827	4	0.5872
6 : 104073767 : SNP	a	g	0.2839	0.0052	0.2793	0.2957	-0.0121	0.0093	0.1936	-----	0.0	1.789	4	0.7745
7 : 146718456 : SNP	a	g	0.9620	0.0011	0.9606	0.9629	-0.0494	0.0254	0.05171	-+???	87.0	7.702	1	0.005517
2 : 84654106 : SNP	a	t	0.9887	0.0000	0.9887	0.9887	-0.0200	0.0647	0.7572	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 94774965 : SNP	t	c	0.2097	0.0162	0.1680	0.2193	-0.0093	0.0107	0.3885	----+	0.0	3.332	4	0.5039
12 : 83875453 : SNP	a	g	0.9631	0.0009	0.9624	0.9643	-0.0084	0.0292	0.7747	-+???	33.7	1.508	1	0.2194
6 : 159324194 : SNP	a	t	0.8651	0.0102	0.8588	0.8921	0.0151	0.0132	0.2547	+-+++	34.1	6.073	4	0.1938
8 : 2438697 : SNP	a	c	0.9167	0.0156	0.8781	0.9274	0.0019	0.0161	0.907	+-?+-	74.2	11.618	3	0.008814
20 : 23100202 : SNP	a	g	0.0929	0.0100	0.0678	0.0995	0.0183	0.0148	0.2142	++++-	0.0	3.922	4	0.4166
19 : 16450965 : SNP	a	c	0.6751	0.0105	0.6656	0.6920	0.0019	0.0097	0.8473	+-+-+	0.0	3.278	4	0.5125
13 : 112739973 : SNP	t	c	0.9466	0.0010	0.9451	0.9494	-0.0136	0.0209	0.516	--?+-	40.9	5.079	3	0.1661
13 : 36511169 : SNP	t	c	0.0668	0.0055	0.0526	0.0706	-0.0165	0.0180	0.36	0-?+-	3.6	3.112	3	0.3746
7 : 53033452 : SNP	t	c	0.9473	0.0040	0.9444	0.9567	-0.0194	0.0197	0.3259	--??+	0.0	0.394	2	0.8212
20 : 18975479 : SNP	c	g	0.8413	0.0040	0.8280	0.8455	-0.0158	0.0120	0.1862	---++	0.0	3.972	4	0.4098
6 : 4544338 : SNP	a	c	0.5937	0.0080	0.5861	0.6044	-0.0143	0.0086	0.09475	---+-	0.0	1.671	4	0.796
3 : 120314961 : SNP	c	g	0.9705	0.0000	0.9705	0.9705	0.0170	0.0414	0.6817	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 19628989 : SNP	a	g	0.6746	0.0234	0.6565	0.7248	-0.0139	0.0092	0.133	--+--	0.0	1.192	4	0.8794
2 : 26069524 : INDEL	i	r	0.3094	0.0084	0.2812	0.3143	0.0097	0.0092	0.2921	++-++	0.0	2.600	4	0.6268
16 : 85306753 : SNP	t	c	0.9668	0.0000	0.9668	0.9668	-0.0620	0.0576	0.2819	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 81928098 : SNP	t	g	0.0146	0.0000	0.0146	0.0146	-0.0910	0.0637	0.153	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 162536393 : SNP	a	g	0.2511	0.0101	0.2324	0.2641	0.0068	0.0100	0.4941	+-+-+	0.0	2.002	4	0.7353
7 : 10360116 : SNP	a	g	0.2295	0.0105	0.2059	0.2459	0.0055	0.0107	0.6066	-+-+-	0.0	3.624	4	0.4593
1 : 186561765 : SNP	a	g	0.0244	0.0000	0.0244	0.0244	-0.0350	0.0536	0.5136	-????	0.0	0.000	0	1
9 : 28312560 : SNP	a	g	0.9494	0.0044	0.9395	0.9516	-0.0274	0.0210	0.1921	-+??-	0.0	1.279	2	0.5276
11 : 29517394 : SNP	a	g	0.1417	0.0018	0.1369	0.1434	0.0204	0.0126	0.1057	++--+	0.0	2.476	4	0.649
11 : 30648357 : SNP	t	c	0.0132	0.0000	0.0132	0.0132	0.0250	0.0607	0.6802	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 45675361 : SNP	c	g	0.9821	0.0000	0.9821	0.9821	-0.0180	0.0455	0.6923	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 45454485 : SNP	t	g	0.8039	0.0097	0.7926	0.8207	-0.0038	0.0109	0.7297	-+-++	0.0	2.409	4	0.661
12 : 118384984 : INDEL	d	r	0.1172	0.0045	0.1147	0.1278	-0.0150	0.0139	0.278	--?++	15.7	3.560	3	0.3131
3 : 47036756 : SNP	c	g	0.5946	0.0077	0.5898	0.6132	0.0141	0.0085	0.09921	-++++	48.8	7.807	4	0.0989
10 : 45078111 : SNP	t	c	0.2222	0.0146	0.1977	0.2465	-0.0004	0.0101	0.9697	++-+-	0.0	3.189	4	0.5268
1 : 204351149 : SNP	t	c	0.1526	0.0076	0.1442	0.1775	0.0047	0.0124	0.7033	+-+--	0.0	1.643	4	0.8011
2 : 112681220 : SNP	a	c	0.2245	0.0238	0.1671	0.2355	-0.0061	0.0100	0.5442	--+++	49.4	7.902	4	0.09523
16 : 23670044 : INDEL	i	r	0.0137	0.0000	0.0137	0.0137	0.0110	0.0526	0.8342	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 116945241 : SNP	a	g	0.5626	0.0113	0.5160	0.5872	0.0062	0.0085	0.4647	+----	0.0	2.581	4	0.6302
3 : 112835950 : SNP	a	g	0.8373	0.0138	0.8032	0.8535	0.0198	0.0118	0.09477	++++-	0.0	1.128	4	0.8898
4 : 168127646 : SNP	a	t	0.7929	0.0279	0.7585	0.8371	0.0068	0.0130	0.6005	++-++	0.0	1.093	4	0.8954
9 : 20538099 : SNP	a	g	0.7790	0.0086	0.7735	0.7973	0.0141	0.0105	0.1789	+--++	6.9	4.295	4	0.3676
3 : 112940849 : SNP	t	c	0.0566	0.0041	0.0514	0.0598	0.0148	0.0247	0.5486	+-???	0.0	0.619	1	0.4314
10 : 17748228 : INDEL	d	r	0.1082	0.0145	0.0986	0.1359	0.0160	0.0150	0.2878	++-+-	0.0	2.640	4	0.6198
2 : 52163170 : INDEL	d	r	0.3011	0.0023	0.2971	0.3033	-0.0105	0.0112	0.3465	+----	40.8	6.757	4	0.1493
7 : 52897554 : SNP	t	c	0.9302	0.0110	0.9109	0.9419	-0.0008	0.0172	0.962	-+?--	0.0	0.495	3	0.92
16 : 78271066 : SNP	t	c	0.0959	0.0074	0.0844	0.1127	-0.0062	0.0160	0.6981	--+-+	0.0	2.713	4	0.6069
18 : 39122938 : SNP	a	g	0.0252	0.0024	0.0232	0.0281	0.0309	0.0312	0.3219	++???	0.0	0.099	1	0.753
6 : 17529841 : SNP	t	c	0.0341	0.0056	0.0305	0.0427	-0.0060	0.0339	0.8582	+???-	46.0	1.851	1	0.1737
10 : 426951 : SNP	a	t	0.0162	0.0000	0.0162	0.0162	-0.0540	0.0607	0.3733	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 46248032 : SNP	t	c	0.0313	0.0038	0.0290	0.0375	0.0053	0.0319	0.8688	+???+	0.0	0.000	1	0.9889
2 : 111886914 : SNP	t	c	0.5366	0.0248	0.4874	0.5604	-0.0142	0.0085	0.09595	--+++	0.0	2.917	4	0.5719
6 : 6153848 : SNP	a	g	0.0180	0.0000	0.0180	0.0180	-0.0170	0.0465	0.7147	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 104185659 : SNP	a	g	0.1729	0.0058	0.1598	0.1806	0.0078	0.0115	0.494	+--++	0.0	2.163	4	0.7058
16 : 20120504 : SNP	c	g	0.6107	0.0263	0.5871	0.6846	0.0071	0.0091	0.4383	+++--	0.0	2.551	4	0.6356
10 : 33840033 : SNP	a	c	0.4358	0.0090	0.4281	0.4484	0.0018	0.0085	0.8353	+++--	39.0	6.561	4	0.161
8 : 108092272 : SNP	a	t	0.0467	0.0030	0.0426	0.0488	0.0521	0.0246	0.03414	++???	0.0	0.252	1	0.6159
3 : 80651788 : SNP	t	g	0.3271	0.0102	0.3025	0.3363	0.0052	0.0092	0.5705	+-++-	31.3	5.821	4	0.2129
12 : 104809738 : SNP	c	g	0.4000	0.0196	0.3427	0.4122	0.0132	0.0092	0.1509	+-+++	58.4	9.605	4	0.04763
17 : 63470609 : SNP	t	c	0.0797	0.0038	0.0713	0.0823	-0.0075	0.0281	0.7894	-??-+	0.0	1.431	2	0.4889
4 : 58147714 : SNP	t	c	0.8431	0.0040	0.8316	0.8490	-0.0124	0.0116	0.2827	---+-	0.0	2.560	4	0.6339
20 : 56086652 : SNP	t	c	0.1025	0.0081	0.0913	0.1178	0.0101	0.0161	0.5323	+-+++	0.0	3.943	4	0.4138
12 : 71830369 : SNP	t	c	0.1670	0.0053	0.1627	0.1780	0.0032	0.0113	0.774	0+++-	0.0	0.680	4	0.9538
11 : 74681409 : SNP	a	g	0.4999	0.0044	0.4906	0.5048	0.0069	0.0085	0.4205	-++++	0.0	2.037	4	0.7289
11 : 119839219 : SNP	a	g	0.0895	0.0055	0.0763	0.0926	-0.0128	0.0154	0.4079	+-?--	47.6	5.721	3	0.126
3 : 165765880 : SNP	a	c	0.2795	0.0156	0.2666	0.3098	0.0289	0.0097	0.002864	+++++	27.4	5.510	4	0.2388
4 : 187730631 : SNP	a	g	0.5998	0.0271	0.5857	0.6665	-0.0063	0.0086	0.4632	---+-	0.0	0.547	4	0.9688
7 : 1114209 : SNP	t	c	0.1769	0.0133	0.1499	0.1862	0.0090	0.0121	0.4578	++--+	0.0	2.679	4	0.6129
8 : 40970192 : SNP	a	g	0.2258	0.0171	0.2075	0.2623	-0.0045	0.0105	0.6691	-++--	4.3	4.181	4	0.382
1 : 24186934 : SNP	t	c	0.8994	0.0112	0.8770	0.9058	-0.0002	0.0157	0.9875	+-?--	0.0	2.380	3	0.4974
11 : 132968796 : SNP	t	c	0.4379	0.0236	0.3864	0.4661	0.0115	0.0086	0.1779	+++-+	43.9	7.124	4	0.1295
16 : 82788400 : SNP	a	g	0.0539	0.0022	0.0483	0.0551	-0.0060	0.0198	0.7624	0-??+	0.0	0.778	2	0.6776
8 : 49121689 : SNP	t	c	0.0902	0.0037	0.0827	0.1001	0.0118	0.0165	0.4739	-+-++	0.0	3.239	4	0.5187
14 : 22635650 : SNP	t	g	0.7164	0.0156	0.7050	0.7488	0.0086	0.0094	0.3584	+++-+	0.0	1.518	4	0.8235
6 : 111939921 : SNP	t	c	0.0174	0.0000	0.0174	0.0174	0.0380	0.0465	0.4138	+????	0.0	0.000	0	1
21 : 17178337 : SNP	c	g	0.0896	0.0010	0.0858	0.0904	-0.0263	0.0151	0.08102	-----	0.7	4.028	4	0.4022
21 : 15304394 : INDEL	d	r	0.0872	0.0000	0.0872	0.0872	0.0255	0.0603	0.6724	????+	0.0	0.000	0	1
4 : 138947838 : SNP	a	t	0.9094	0.0071	0.9051	0.9263	0.0233	0.0150	0.1197	+++--	0.0	2.391	4	0.6643
3 : 111633287 : SNP	a	g	0.0356	0.0010	0.0348	0.0369	-0.0069	0.0259	0.7904	-+???	84.9	6.614	1	0.01012
9 : 113526327 : SNP	a	g	0.1968	0.0073	0.1755	0.2032	0.0056	0.0107	0.5972	+---+	0.0	3.025	4	0.5536
1 : 182675168 : SNP	a	t	0.9180	0.0068	0.9120	0.9275	-0.0093	0.0196	0.637	--??+	0.0	1.633	2	0.4421
22 : 21026228 : SNP	t	c	0.5458	0.0042	0.5329	0.5509	0.0061	0.0091	0.5022	+-++-	0.0	3.338	4	0.5029
7 : 132146609 : SNP	a	g	0.0721	0.0069	0.0624	0.0865	0.0433	0.0182	0.01741	++?--	0.0	2.467	3	0.4814
3 : 27530208 : SNP	a	g	0.2363	0.0128	0.2038	0.2480	0.0142	0.0100	0.1574	++-+-	48.0	7.696	4	0.1034
3 : 57141490 : SNP	a	c	0.2732	0.0142	0.2610	0.3152	-0.0022	0.0096	0.8191	---++	12.2	4.553	4	0.3363
14 : 25629797 : SNP	t	c	0.2416	0.0095	0.2303	0.2648	-0.0007	0.0099	0.947	--++-	0.0	2.770	4	0.597
1 : 70275666 : SNP	a	t	0.0729	0.0068	0.0650	0.0844	0.0007	0.0208	0.9721	-+?++	0.0	2.044	3	0.5632
10 : 21554006 : SNP	c	g	0.9289	0.0045	0.9185	0.9336	0.0005	0.0187	0.9787	++?--	0.0	0.855	3	0.8362
3 : 19741932 : SNP	c	g	0.0819	0.0117	0.0622	0.0962	0.0513	0.0166	0.00199	++?+-	23.0	3.897	3	0.2728
11 : 733426 : SNP	t	g	0.0936	0.0039	0.0855	0.1044	0.0161	0.0154	0.2972	++-+-	0.0	2.052	4	0.7262
2 : 47743427 : SNP	a	g	0.2968	0.0066	0.2748	0.3032	0.0032	0.0092	0.728	+--+-	23.9	5.258	4	0.2618
8 : 96726063 : SNP	t	c	0.7237	0.0094	0.7053	0.7300	-0.0023	0.0097	0.8148	-+-++	25.1	5.337	4	0.2544
9 : 34636399 : SNP	a	g	0.0579	0.0054	0.0431	0.0603	-0.0447	0.0195	0.02209	--??-	0.0	0.582	2	0.7475
11 : 107595628 : SNP	t	c	0.4117	0.0134	0.3827	0.4211	0.0113	0.0086	0.188	+--+-	9.2	4.405	4	0.354
6 : 5246833 : SNP	t	c	0.1918	0.0150	0.1825	0.2239	-0.0053	0.0109	0.6271	---+-	0.0	1.311	4	0.8595
1 : 227331101 : SNP	a	g	0.9257	0.0077	0.9084	0.9305	0.0010	0.0179	0.9555	+-?-+	10.2	3.339	3	0.3422
18 : 48291193 : SNP	a	g	0.9288	0.0126	0.9042	0.9405	0.0078	0.0175	0.6558	++?+-	0.0	2.610	3	0.4558
10 : 85343502 : INDEL	i	r	0.0205	0.0000	0.0205	0.0205	-0.0040	0.0435	0.9267	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 79038584 : SNP	a	t	0.8574	0.0097	0.8312	0.8656	0.0021	0.0122	0.8647	++---	0.0	2.587	4	0.6292
15 : 31697531 : SNP	a	g	0.3453	0.0188	0.3337	0.3937	-0.0085	0.0091	0.3497	+-+-+	0.0	2.659	4	0.6164
7 : 139647817 : SNP	t	c	0.0889	0.0067	0.0732	0.0996	-0.0049	0.0152	0.7481	-+?-+	0.0	1.025	3	0.7951
1 : 80399705 : INDEL	i	r	0.0209	0.0000	0.0209	0.0209	0.0340	0.0546	0.5334	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 96983802 : SNP	c	g	0.2253	0.0156	0.1898	0.2339	0.0170	0.0108	0.1131	+++-+	0.0	0.633	4	0.9594
14 : 102155274 : SNP	a	g	0.0271	0.0000	0.0271	0.0271	-0.0450	0.0384	0.2414	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 100116170 : SNP	t	c	0.9357	0.0074	0.9284	0.9531	0.0309	0.0182	0.08947	++??+	0.0	0.328	2	0.8488
12 : 97242712 : SNP	a	t	0.5325	0.0082	0.5133	0.5427	0.0052	0.0085	0.5459	+----	14.8	4.692	4	0.3204
2 : 62472420 : SNP	c	g	0.2208	0.0073	0.1841	0.2346	0.0057	0.0107	0.5928	+-+--	34.0	6.060	4	0.1947
12 : 83374514 : SNP	a	g	0.0837	0.0085	0.0614	0.0901	-0.0078	0.0160	0.6254	+-?--	37.5	4.799	3	0.1871
2 : 173411004 : SNP	c	g	0.0548	0.0049	0.0422	0.0575	0.0074	0.0201	0.7115	+-??+	41.7	3.428	2	0.1801
8 : 26726863 : SNP	t	c	0.9475	0.0069	0.9394	0.9623	-0.0165	0.0203	0.4185	-+??-	0.0	1.705	2	0.4263
2 : 231056536 : SNP	c	g	0.2201	0.0056	0.2033	0.2291	-0.0069	0.0112	0.5369	---++	0.0	2.255	4	0.6889
2 : 46369692 : SNP	t	c	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	-0.0300	0.0455	0.5096	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 82710137 : SNP	c	g	0.4127	0.0113	0.4044	0.4428	0.0009	0.0086	0.918	0++-+	9.1	4.401	4	0.3544
10 : 96516575 : SNP	t	c	0.9370	0.0034	0.9250	0.9386	-0.0251	0.0176	0.1551	-+?+-	0.0	1.899	3	0.5937
15 : 45987795 : SNP	t	c	0.5345	0.0168	0.5102	0.5588	-0.0056	0.0086	0.5177	+-+--	0.0	3.515	4	0.4757
14 : 60146348 : SNP	t	c	0.7457	0.0202	0.7068	0.7701	0.0024	0.0099	0.8045	+-++-	45.3	7.309	4	0.1204
4 : 171429417 : SNP	t	c	0.0347	0.0039	0.0322	0.0428	0.0252	0.0254	0.3221	++??+	0.0	0.428	2	0.8075
3 : 33226130 : INDEL	i	r	0.6637	0.0199	0.6482	0.7054	-0.0139	0.0092	0.1305	--+--	0.0	3.367	4	0.4984
16 : 87516650 : SNP	a	t	0.8632	0.0056	0.8589	0.8783	0.0276	0.0132	0.03711	+++--	50.6	8.103	4	0.08787
20 : 22319152 : SNP	t	c	0.9657	0.0054	0.9571	0.9691	0.0473	0.0299	0.1137	+???+	67.6	3.082	1	0.07914
7 : 49058965 : SNP	a	g	0.4813	0.0248	0.4345	0.5028	-0.0140	0.0083	0.09312	--+--	0.0	3.348	4	0.5013
11 : 86887073 : SNP	a	g	0.9800	0.0000	0.9800	0.9800	-0.0040	0.0546	0.9416	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 40704811 : SNP	t	g	0.3848	0.0182	0.3536	0.4211	0.0121	0.0086	0.1591	++--+	0.8	4.032	4	0.4016
6 : 140143193 : SNP	c	g	0.3397	0.0122	0.3278	0.3664	-0.0103	0.0091	0.2582	-+--+	0.0	2.412	4	0.6604
15 : 26143652 : SNP	t	c	0.1518	0.0132	0.1320	0.1734	-0.0018	0.0122	0.8807	+----	0.0	1.206	4	0.8772
1 : 42103382 : SNP	t	c	0.3983	0.0100	0.3887	0.4167	-0.0028	0.0089	0.7529	0-++-	23.3	5.214	4	0.266
7 : 54331972 : SNP	a	c	0.4062	0.0085	0.3812	0.4137	-0.0041	0.0091	0.6563	---++	0.0	3.820	4	0.4309
3 : 192394299 : SNP	a	g	0.1106	0.0167	0.0638	0.1277	0.0119	0.0161	0.4611	+-+--	55.4	8.970	4	0.06185
6 : 117544308 : SNP	t	c	0.2702	0.0063	0.2558	0.2796	-0.0078	0.0094	0.4078	-+++-	47.0	7.551	4	0.1095
3 : 195783481 : SNP	t	c	0.0727	0.0052	0.0611	0.0772	-0.0066	0.0167	0.6918	--?+-	0.0	0.243	3	0.9704
16 : 66309268 : SNP	a	c	0.8435	0.0230	0.7965	0.8641	0.0052	0.0120	0.6638	-++++	25.5	5.371	4	0.2513
3 : 98233415 : INDEL	i	r	0.5319	0.0281	0.4809	0.5691	0.0051	0.0085	0.5483	-+--+	0.0	3.989	4	0.4075
11 : 87666556 : INDEL	d	r	0.0433	0.0000	0.0433	0.0433	0.0290	0.0465	0.5329	+????	0.0	0.000	0	1
17 : 80805421 : SNP	c	g	0.2704	0.0245	0.2521	0.3239	-0.0002	0.0098	0.9798	---++	39.4	6.597	4	0.1588
8 : 87126178 : SNP	c	g	0.1572	0.0026	0.1457	0.1611	-0.0013	0.0117	0.9085	--+++	31.5	5.843	4	0.2112
1 : 14575412 : SNP	a	g	0.3680	0.0250	0.3528	0.4209	-0.0112	0.0090	0.2163	+-+--	4.0	4.165	4	0.3841
4 : 75271356 : SNP	a	g	0.2241	0.0176	0.1826	0.2557	-0.0085	0.0102	0.4047	-+--+	0.0	1.282	4	0.8645
11 : 41961204 : SNP	a	t	0.2073	0.0089	0.2008	0.2340	-0.0019	0.0104	0.8584	+-+-+	0.0	0.678	4	0.954
13 : 90396478 : SNP	t	c	0.4220	0.0126	0.4076	0.4449	0.0031	0.0085	0.716	++-+-	69.0	12.896	4	0.01179
1 : 173019182 : SNP	a	g	0.9618	0.0029	0.9592	0.9663	0.0344	0.0240	0.1507	++??+	0.0	0.982	2	0.612
13 : 76621741 : SNP	a	g	0.8925	0.0077	0.8840	0.9129	-0.0129	0.0137	0.3482	+----	0.0	2.705	4	0.6084
10 : 67427274 : SNP	c	g	0.9578	0.0001	0.9576	0.9579	-0.0005	0.0259	0.9855	-+???	0.0	0.413	1	0.5202
4 : 112792569 : SNP	a	g	0.7585	0.0049	0.7532	0.7784	0.0044	0.0100	0.6623	0+++-	0.0	0.823	4	0.9353
3 : 163836812 : SNP	a	g	0.2106	0.0102	0.1803	0.2191	-0.0177	0.0107	0.098	---+-	0.0	2.533	4	0.6387
2 : 128119441 : SNP	t	c	0.6141	0.0063	0.6044	0.6202	0.0119	0.0086	0.1647	+++++	0.0	0.570	4	0.9663
10 : 106848624 : SNP	a	g	0.0179	0.0000	0.0179	0.0179	-0.0440	0.0465	0.344	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 113857195 : SNP	a	g	0.3175	0.0217	0.2666	0.3283	0.0163	0.0093	0.07976	++-++	0.0	2.319	4	0.6773
22 : 50284974 : SNP	t	c	0.0744	0.0056	0.0642	0.0806	0.0095	0.0169	0.5739	-+?--	55.1	6.684	3	0.0827
19 : 53931031 : SNP	a	g	0.1868	0.0073	0.1802	0.2033	0.0114	0.0131	0.3834	++?--	0.0	1.769	3	0.6218
4 : 172452784 : SNP	a	g	0.0264	0.0000	0.0264	0.0264	0.0560	0.0384	0.1449	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 124904183 : SNP	t	c	0.0636	0.0027	0.0598	0.0736	-0.0067	0.0181	0.712	-+?+-	0.0	2.631	3	0.452
13 : 35291566 : SNP	a	g	0.2038	0.0133	0.1897	0.2284	-0.0017	0.0107	0.8761	+-++-	33.6	6.022	4	0.1975
9 : 4332305 : SNP	a	c	0.6727	0.0147	0.6558	0.6954	0.0038	0.0106	0.7198	+-+-+	0.0	1.604	4	0.8081
6 : 21853601 : SNP	a	g	0.1803	0.0101	0.1723	0.2117	-0.0212	0.0128	0.09731	-++--	18.7	4.918	4	0.2958
4 : 185922902 : SNP	t	c	0.1769	0.0322	0.1426	0.2419	0.0127	0.0146	0.3839	++--+	22.4	5.152	4	0.2721
2 : 154049727 : SNP	t	c	0.8261	0.0059	0.8168	0.8496	-0.0046	0.0114	0.6834	+-+--	0.0	3.625	4	0.4591
3 : 106685595 : SNP	a	c	0.1805	0.0118	0.1559	0.1940	-0.0088	0.0112	0.4329	-++--	0.0	1.833	4	0.7665
19 : 14590433 : SNP	a	g	0.9192	0.0062	0.8976	0.9251	0.0306	0.0173	0.07685	++?-+	10.8	3.363	3	0.339
14 : 80230501 : INDEL	d	r	0.4567	0.0338	0.4362	0.5285	0.0053	0.0091	0.5607	-++++	0.0	2.108	4	0.7159
22 : 35981984 : INDEL	d	r	0.2221	0.0106	0.2147	0.2462	0.0069	0.0106	0.5183	++-?-	0.0	2.141	3	0.5436
16 : 80876767 : SNP	a	g	0.0218	0.0000	0.0218	0.0218	-0.1150	0.0505	0.02289	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 75921829 : SNP	t	g	0.2533	0.0226	0.2061	0.2753	-0.0025	0.0099	0.802	-+---	1.2	4.049	4	0.3995
4 : 101679397 : SNP	t	g	0.2651	0.0086	0.2562	0.2832	0.0082	0.0098	0.4031	++-++	17.8	4.865	4	0.3014
5 : 155029920 : SNP	t	g	0.1832	0.0031	0.1788	0.1876	-0.0057	0.0111	0.6086	+-+--	0.0	1.447	4	0.836
8 : 14923785 : SNP	t	c	0.0401	0.0046	0.0320	0.0430	0.0085	0.0233	0.7145	-+??+	65.9	5.858	2	0.05345
8 : 80060094 : SNP	t	c	0.9652	0.0000	0.9652	0.9652	-0.0010	0.0465	0.9828	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 57193282 : SNP	a	g	0.7767	0.0171	0.7535	0.8104	-0.0174	0.0113	0.1227	---+-	1.5	4.061	4	0.3978
18 : 46295025 : SNP	a	g	0.9603	0.0009	0.9592	0.9610	0.0015	0.0252	0.9527	-+???	31.1	1.451	1	0.2283
16 : 83149233 : SNP	c	g	0.0318	0.0000	0.0318	0.0318	0.0080	0.0344	0.8159	+????	0.0	0.000	0	1
19 : 47148789 : INDEL	d	r	0.1443	0.0037	0.1349	0.1476	0.0052	0.0152	0.7332	++?--	9.1	3.299	3	0.3478
2 : 206168101 : SNP	t	c	0.3073	0.0159	0.2954	0.3392	-0.0031	0.0093	0.7426	+---+	0.0	3.984	4	0.4082
10 : 103156493 : SNP	a	g	0.4639	0.0216	0.4516	0.5165	-0.0004	0.0085	0.9591	+--++	0.0	0.623	4	0.9605
3 : 111695124 : SNP	t	c	0.7961	0.0093	0.7729	0.8076	-0.0003	0.0106	0.9741	--++-	0.0	2.692	4	0.6106
6 : 40905509 : SNP	a	t	0.0388	0.0017	0.0374	0.0408	0.0079	0.0259	0.7588	-+???	0.0	0.224	1	0.6364
12 : 40739852 : SNP	a	t	0.1444	0.0114	0.1252	0.1601	-0.0126	0.0121	0.2941	-+---	14.4	4.673	4	0.3225
11 : 23948810 : SNP	a	g	0.6900	0.0098	0.6850	0.7336	0.0029	0.0093	0.7521	---++	35.4	6.197	4	0.1849
12 : 120893057 : SNP	t	c	0.3076	0.0184	0.2743	0.3227	0.0026	0.0094	0.7842	+-+--	0.0	0.907	4	0.9235
8 : 118302648 : SNP	a	t	0.4496	0.0122	0.4299	0.4785	-0.0159	0.0087	0.06736	+----	18.3	4.896	4	0.2981
10 : 37620700 : INDEL	d	r	0.0642	0.0080	0.0423	0.0705	-0.0193	0.0185	0.2986	--??-	0.0	0.258	2	0.8792
19 : 41259357 : SNP	a	g	0.5720	0.0120	0.5528	0.5902	0.0081	0.0094	0.3879	-+++-	35.9	6.238	4	0.182
14 : 51894422 : SNP	t	g	0.9177	0.0063	0.9037	0.9258	-0.0216	0.0158	0.1713	--?-+	25.7	4.040	3	0.2572
3 : 64011657 : SNP	a	t	0.9032	0.0133	0.8727	0.9131	0.0193	0.0149	0.1955	+-+--	43.1	7.029	4	0.1344
16 : 54499408 : SNP	a	g	0.1361	0.0138	0.1263	0.1682	-0.0194	0.0130	0.1347	-+---	0.0	1.262	4	0.8678
3 : 155161255 : SNP	a	g	0.1983	0.0129	0.1787	0.2294	-0.0074	0.0110	0.503	--++-	0.0	1.029	4	0.9054
8 : 28418723 : SNP	a	g	0.5471	0.0165	0.5284	0.5666	-0.0058	0.0091	0.5213	+--+-	0.0	2.697	4	0.6098
2 : 150324491 : SNP	t	c	0.0707	0.0056	0.0618	0.0787	0.0029	0.0173	0.8652	-+?+-	0.0	1.659	3	0.6461
1 : 161393769 : SNP	c	g	0.0765	0.0031	0.0749	0.0854	0.0206	0.0283	0.4677	+??--	0.0	1.059	2	0.5889
4 : 38204421 : SNP	t	c	0.3191	0.0159	0.3098	0.3737	-0.0082	0.0093	0.3765	+----	0.0	3.765	4	0.4388
12 : 76382445 : SNP	t	c	0.4071	0.0106	0.3959	0.4486	0.0024	0.0086	0.7772	++--+	0.0	3.411	4	0.4915
10 : 35255101 : SNP	a	g	0.5675	0.0124	0.5547	0.5915	-0.0154	0.0091	0.09264	+--+-	46.6	7.487	4	0.1123
1 : 71515154 : SNP	t	c	0.1034	0.0060	0.0991	0.1159	-0.0070	0.0139	0.6115	+-+-+	0.0	3.097	4	0.5417
17 : 3833487 : SNP	t	c	0.2786	0.0105	0.2623	0.2957	-0.0017	0.0118	0.8856	++---	0.0	2.513	4	0.6423
5 : 76842516 : SNP	a	g	0.4251	0.0106	0.4127	0.4446	0.0174	0.0085	0.04157	++-++	64.9	11.400	4	0.02242
15 : 91122971 : SNP	t	c	0.9164	0.0085	0.8980	0.9211	-0.0126	0.0157	0.4212	+-?--	29.0	4.228	3	0.2379
3 : 122079848 : SNP	t	g	0.0148	0.0000	0.0148	0.0148	-0.0050	0.0505	0.9212	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 15169685 : SNP	a	g	0.7343	0.0110	0.7217	0.7585	-0.0090	0.0095	0.3418	-+++-	6.7	4.288	4	0.3684
6 : 95875107 : SNP	t	c	0.6995	0.0066	0.6937	0.7118	-0.0085	0.0098	0.3857	-+---	0.0	1.228	4	0.8735
2 : 47794426 : SNP	t	c	0.6750	0.0287	0.6433	0.7298	0.0118	0.0091	0.1919	++-++	0.0	2.343	4	0.673
1 : 170910613 : SNP	a	t	0.9406	0.0120	0.9206	0.9523	0.0313	0.0199	0.1151	++?-+	0.0	1.855	3	0.603
18 : 73601954 : SNP	a	g	0.4167	0.0072	0.4017	0.4263	-0.0153	0.0090	0.08734	---++	0.0	2.549	4	0.6358
6 : 21492238 : SNP	t	c	0.6006	0.0132	0.5737	0.6174	-0.0029	0.0089	0.7427	---++	0.0	3.116	4	0.5386
7 : 153671676 : SNP	a	g	0.9229	0.0000	0.9229	0.9229	0.0562	0.0613	0.3592	????+	0.0	0.000	0	1
3 : 109357722 : SNP	c	g	0.8615	0.0131	0.8486	0.8963	-0.0088	0.0122	0.4707	--++-	0.0	1.457	4	0.8343
10 : 24836922 : SNP	a	g	0.0858	0.0043	0.0789	0.0896	0.0132	0.0157	0.3994	++?++	0.0	0.802	3	0.849
8 : 15676448 : SNP	t	g	0.8464	0.0107	0.8139	0.8644	0.0049	0.0117	0.6725	+-+--	47.0	7.545	4	0.1097
4 : 36420931 : SNP	t	c	0.8164	0.0114	0.7969	0.8270	-0.0044	0.0112	0.6933	---++	0.0	0.712	4	0.9498
2 : 52638323 : SNP	a	g	0.3783	0.0318	0.3567	0.4500	0.0020	0.0091	0.8289	-++-+	5.5	4.232	4	0.3755
7 : 106540171 : SNP	t	g	0.7458	0.0219	0.7224	0.7901	-0.0170	0.0099	0.08603	0----	42.9	7.000	4	0.1359
7 : 97211897 : SNP	a	c	0.9269	0.0223	0.8844	0.9477	0.0134	0.0173	0.4381	+-?++	34.5	4.579	3	0.2053
16 : 84379530 : SNP	a	t	0.9822	0.0000	0.9822	0.9822	0.0310	0.0465	0.505	+????	0.0	0.000	0	1
10 : 21326895 : SNP	a	g	0.6130	0.0195	0.5720	0.6246	-0.0045	0.0085	0.5977	----+	7.9	4.342	4	0.3617
5 : 154650946 : SNP	t	g	0.2160	0.0124	0.1887	0.2370	-0.0085	0.0106	0.4216	+--++	67.4	12.259	4	0.01552
8 : 61518393 : INDEL	d	r	0.0604	0.0086	0.0546	0.0732	-0.0168	0.0310	0.5881	+???-	0.0	0.990	1	0.3197
9 : 77679508 : SNP	c	g	0.8061	0.0096	0.7970	0.8189	-0.0247	0.0108	0.02224	---+-	10.8	4.483	4	0.3446
11 : 125106678 : SNP	c	g	0.8483	0.0055	0.8326	0.8584	-0.0011	0.0121	0.9302	++-+-	0.0	1.794	4	0.7735
8 : 17135976 : SNP	t	g	0.3647	0.0304	0.3468	0.4305	-0.0002	0.0091	0.9859	-+--+	4.6	4.191	4	0.3807
11 : 74549391 : SNP	a	g	0.2227	0.0136	0.2102	0.2495	0.0040	0.0105	0.702	--+++	0.0	3.617	4	0.4603
16 : 75478447 : SNP	a	g	0.4199	0.0098	0.3971	0.4494	-0.0021	0.0085	0.8055	-+-++	0.0	2.032	4	0.73
4 : 149612142 : SNP	a	g	0.2450	0.0136	0.2247	0.2689	-0.0144	0.0100	0.1497	-+---	0.0	2.119	4	0.7139
18 : 37829147 : SNP	a	c	0.9558	0.0012	0.9542	0.9567	-0.0108	0.0239	0.6513	-+???	0.0	0.501	1	0.4789
5 : 140716677 : INDEL	i	r	0.8299	0.0126	0.8042	0.8387	-0.0104	0.0118	0.3752	--+--	0.0	2.863	4	0.5809
5 : 159237795 : SNP	t	c	0.0147	0.0000	0.0147	0.0147	0.0320	0.0495	0.5183	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 104623089 : SNP	a	g	0.7248	0.0196	0.7134	0.7724	-0.0007	0.0095	0.9449	++-+-	0.0	0.609	4	0.962
12 : 114894375 : SNP	a	c	0.9220	0.0047	0.9177	0.9288	-0.0040	0.0163	0.8079	-+?-+	0.0	2.101	3	0.5518
8 : 130676008 : INDEL	i	r	0.4374	0.0218	0.3917	0.4560	-0.0034	0.0090	0.7066	--+--	0.0	1.312	4	0.8593
12 : 104897650 : SNP	a	g	0.0387	0.0027	0.0346	0.0408	0.0099	0.0237	0.6749	-+??+	0.0	0.427	2	0.8077
4 : 124032887 : SNP	a	c	0.8988	0.0077	0.8733	0.9028	0.0123	0.0170	0.47	-++++	0.0	1.402	4	0.8439
14 : 26130439 : SNP	t	c	0.0386	0.0014	0.0375	0.0405	-0.0275	0.0254	0.2789	-+???	66.3	2.967	1	0.08497
2 : 51087308 : SNP	t	c	0.1080	0.0083	0.0894	0.1141	-0.0134	0.0137	0.3282	-+-++	0.0	2.714	4	0.6067
3 : 88287719 : SNP	t	c	0.1296	0.0054	0.1224	0.1418	0.0079	0.0137	0.565	+-++?	0.0	1.282	3	0.7333
2 : 146348037 : SNP	a	g	0.5786	0.0046	0.5694	0.5872	-0.0061	0.0091	0.5009	--+++	8.5	4.371	4	0.3582
2 : 72121650 : SNP	c	g	0.0165	0.0000	0.0165	0.0165	0.0480	0.0465	0.3019	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 50095366 : SNP	t	c	0.9575	0.0060	0.9454	0.9622	-0.0165	0.0226	0.4653	--??-	0.0	0.622	2	0.7326
2 : 189396005 : SNP	a	g	0.9760	0.0000	0.9760	0.9760	0.0090	0.0384	0.8148	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 49402828 : SNP	c	g	0.1261	0.0214	0.0936	0.1508	0.0111	0.0185	0.547	-+?-+	60.2	7.546	3	0.05639
14 : 102037900 : SNP	t	c	0.7980	0.0123	0.7834	0.8157	-0.0158	0.0115	0.1716	-+-+-	17.9	4.870	4	0.3009
2 : 112655396 : SNP	t	g	0.0313	0.0000	0.0313	0.0313	-0.0400	0.0364	0.2717	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 31860866 : SNP	t	c	0.0206	0.0000	0.0206	0.0206	0.0090	0.0425	0.8321	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 18611644 : SNP	t	c	0.3461	0.0141	0.3282	0.3760	-0.0041	0.0091	0.6499	+++--	0.0	3.725	4	0.4445
12 : 14062615 : SNP	a	g	0.0156	0.0000	0.0156	0.0156	-0.1290	0.0596	0.03055	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 37798465 : SNP	t	c	0.1157	0.0104	0.1080	0.1359	-0.0048	0.0176	0.7839	-+++-	10.9	4.487	4	0.3441
10 : 36889519 : SNP	a	c	0.0147	0.0000	0.0147	0.0147	0.0580	0.0586	0.3225	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 59050823 : SNP	t	c	0.9614	0.0029	0.9593	0.9654	-0.0175	0.0263	0.5056	--???	0.0	0.203	1	0.6521
4 : 162221101 : SNP	a	g	0.7904	0.0046	0.7860	0.8061	0.0031	0.0106	0.7695	++++-	0.0	0.344	4	0.9868
8 : 1244448 : SNP	t	c	0.0252	0.0000	0.0252	0.0252	-0.0570	0.0384	0.1378	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 129169432 : SNP	a	c	0.3135	0.0113	0.3041	0.3433	0.0046	0.0092	0.6178	+-+++	0.0	1.724	4	0.7863
3 : 14556175 : SNP	a	g	0.4301	0.0041	0.4211	0.4444	-0.0006	0.0085	0.9394	--+++	0.0	2.544	4	0.6368
4 : 127752570 : SNP	t	c	0.9611	0.0024	0.9560	0.9633	0.0425	0.0242	0.07862	+-??-	77.2	8.767	2	0.01248
6 : 112875688 : SNP	t	c	0.4255	0.0081	0.3993	0.4307	-0.0021	0.0086	0.8044	-+-+-	0.0	3.297	4	0.5094
13 : 31084699 : SNP	t	c	0.9442	0.0043	0.9325	0.9491	-0.0351	0.0203	0.08439	--?-?	0.0	0.262	2	0.8772
21 : 24547609 : SNP	c	g	0.9504	0.0111	0.9325	0.9613	-0.0194	0.0201	0.3335	--?+-	0.0	0.760	3	0.859
5 : 45537784 : SNP	t	c	0.0379	0.0021	0.0361	0.0403	0.0066	0.0292	0.822	+-???	0.0	0.960	1	0.3271
20 : 30668251 : SNP	t	c	0.6352	0.0197	0.5948	0.6493	0.0011	0.0091	0.899	--+++	0.0	3.469	4	0.4826
18 : 58398047 : INDEL	d	r	0.0200	0.0000	0.0200	0.0200	-0.0140	0.0475	0.7682	-????	0.0	0.000	0	1
18 : 61674570 : SNP	t	c	0.6100	0.0326	0.5363	0.6306	-0.0043	0.0089	0.6318	-0+++	12.8	4.586	4	0.3325
9 : 4370145 : SNP	t	c	0.6534	0.0147	0.6327	0.6664	0.0017	0.0091	0.8497	+---+	0.0	2.197	4	0.6995
14 : 41088724 : INDEL	d	r	0.2277	0.0091	0.2135	0.2496	-0.0006	0.0118	0.956	+----	40.9	6.771	4	0.1485
4 : 152916814 : SNP	a	g	0.1728	0.0082	0.1617	0.1802	0.0032	0.0113	0.7786	+-++-	0.0	2.285	4	0.6835
12 : 21995555 : SNP	a	c	0.5915	0.0083	0.5866	0.6119	0.0005	0.0086	0.9563	+--+-	0.0	1.614	4	0.8062
6 : 69232494 : SNP	t	c	0.1604	0.0100	0.1338	0.1680	-0.0068	0.0116	0.5589	---++	6.7	4.285	4	0.3688
1 : 28470653 : SNP	t	c	0.9659	0.0000	0.9659	0.9659	-0.0060	0.0384	0.8759	-????	0.0	0.000	0	1
8 : 93271795 : SNP	a	c	0.8089	0.0050	0.8053	0.8207	0.0156	0.0117	0.1814	-++++	0.0	2.740	4	0.6023
3 : 147488113 : SNP	a	t	0.2862	0.0098	0.2628	0.3062	-0.0062	0.0098	0.5249	-+-+-	0.0	2.483	4	0.6477
7 : 37340398 : SNP	t	g	0.4145	0.0158	0.3781	0.4369	0.0121	0.0092	0.1851	+++-+	0.0	3.936	4	0.4148
7 : 151204476 : INDEL	d	r	0.4942	0.0170	0.4860	0.5411	-0.0080	0.0085	0.3476	---++	0.0	1.899	4	0.7543
1 : 211657634 : SNP	t	g	0.1167	0.0050	0.1121	0.1280	0.0013	0.0134	0.9205	--+++	69.1	12.926	4	0.01164
16 : 54497237 : SNP	t	c	0.1375	0.0125	0.1277	0.1659	-0.0178	0.0130	0.1713	-+---	0.0	1.312	4	0.8594
9 : 37690437 : SNP	a	t	0.2222	0.0072	0.1999	0.2269	-0.0016	0.0102	0.8743	-++--	0.0	2.827	4	0.5872
6 : 160092786 : SNP	t	c	0.0624	0.0054	0.0592	0.0755	-0.0042	0.0180	0.8144	-+?+-	46.1	5.570	3	0.1345
4 : 61251106 : SNP	t	c	0.0872	0.0121	0.0668	0.0975	0.0205	0.0171	0.2297	++?+-	65.7	8.748	3	0.03283
7 : 75057345 : SNP	a	g	0.7933	0.0062	0.7804	0.7968	0.0014	0.0253	0.9564	??++-	0.0	0.527	2	0.7684
2 : 76565997 : SNP	t	c	0.9617	0.0028	0.9583	0.9640	-0.0346	0.0249	0.1651	+-???	77.6	4.455	1	0.03479
7 : 84925967 : SNP	a	t	0.9654	0.0024	0.9624	0.9676	0.0482	0.0245	0.04879	++??-	15.6	2.370	2	0.3058
3 : 78737947 : SNP	a	c	0.0166	0.0000	0.0166	0.0166	-0.0050	0.0485	0.9179	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 117031337 : SNP	t	g	0.4654	0.0187	0.4367	0.5003	-0.0053	0.0112	0.6369	+----	0.0	2.857	4	0.5821
14 : 21715494 : SNP	a	g	0.9858	0.0000	0.9858	0.9858	-0.0090	0.0576	0.8759	-????	0.0	0.000	0	1
10 : 563378 : SNP	t	c	0.0602	0.0047	0.0573	0.0712	0.0202	0.0188	0.282	++?--	0.0	1.626	3	0.6534
7 : 117629585 : SNP	c	g	0.3962	0.0164	0.3654	0.4228	0.0004	0.0086	0.9653	++-+-	0.0	1.102	4	0.894
14 : 44314376 : SNP	a	g	0.2329	0.0117	0.2157	0.2442	0.0028	0.0101	0.7793	+--+-	0.0	1.955	4	0.744
1 : 21889635 : SNP	t	c	0.0575	0.0026	0.0536	0.0665	-0.0180	0.0189	0.3395	-+?++	55.5	6.746	3	0.08043
12 : 41852427 : SNP	a	g	0.4782	0.0168	0.4391	0.4942	-0.0136	0.0085	0.1097	----+	37.2	6.369	4	0.1733
2 : 122197375 : SNP	t	c	0.9423	0.0069	0.9327	0.9480	-0.0198	0.0201	0.3237	--?-+	0.0	1.173	3	0.7594
21 : 36122682 : SNP	a	g	0.2116	0.0080	0.1714	0.2188	0.0038	0.0107	0.7225	+-++-	0.0	1.533	4	0.8207
16 : 5069960 : SNP	t	c	0.8309	0.0115	0.8060	0.8394	0.0002	0.0112	0.9836	+-++-	0.0	2.459	4	0.652
6 : 67538984 : SNP	t	c	0.2418	0.0108	0.2264	0.2731	0.0040	0.0100	0.6857	--+++	0.0	2.972	4	0.5625
13 : 39782091 : SNP	a	g	0.2960	0.0089	0.2593	0.3139	-0.0174	0.0092	0.05916	--++-	0.0	3.762	4	0.4391
14 : 100331085 : SNP	t	g	0.6682	0.0046	0.6624	0.6800	-0.0114	0.0090	0.2029	+----	0.0	3.715	4	0.4459
3 : 7975407 : SNP	t	c	0.5534	0.0157	0.5344	0.5998	0.0142	0.0091	0.1179	+-+++	0.0	2.878	4	0.5784
1 : 226709011 : SNP	t	c	0.2306	0.0159	0.2148	0.2670	0.0023	0.0104	0.8241	+--++	0.0	2.263	4	0.6876
9 : 138378856 : SNP	a	g	0.1827	0.0103	0.1628	0.1928	-0.0098	0.0146	0.5039	-+--+	0.0	1.327	4	0.8568
12 : 32442234 : SNP	t	c	0.7073	0.0142	0.6883	0.7241	0.0028	0.0095	0.7657	----+	53.4	8.580	4	0.07251
14 : 62511876 : SNP	a	t	0.9301	0.0032	0.9271	0.9379	-0.0155	0.0178	0.3862	-+?+-	31.9	4.405	3	0.2209
17 : 4132166 : SNP	t	c	0.0152	0.0000	0.0152	0.0152	0.0120	0.0505	0.8123	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 164989659 : INDEL	d	r	0.2550	0.0116	0.2440	0.2773	-0.0116	0.0098	0.234	---+-	68.4	12.669	4	0.01301
14 : 46922703 : INDEL	d	r	0.3839	0.0094	0.3578	0.3922	0.0021	0.0086	0.8065	+---+	0.0	2.292	4	0.6822
1 : 218850927 : SNP	t	c	0.6546	0.0079	0.6474	0.6762	-0.0049	0.0092	0.5965	+----	0.0	1.600	4	0.8089
8 : 34226763 : SNP	a	g	0.0514	0.0074	0.0462	0.0620	-0.0172	0.0348	0.6206	+???-	20.8	1.262	1	0.2612
5 : 32749417 : INDEL	i	r	0.2262	0.0074	0.2196	0.2453	0.0124	0.0110	0.2579	+-++-	21.7	5.111	4	0.2761
3 : 172098902 : SNP	t	g	0.0333	0.0000	0.0333	0.0333	-0.0160	0.0414	0.6995	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 27491077 : SNP	a	g	0.1374	0.0067	0.1320	0.1595	0.0016	0.0144	0.9101	-+?+-	0.0	1.849	3	0.6043
14 : 71745146 : SNP	c	g	0.9562	0.0040	0.9527	0.9619	-0.0200	0.0236	0.3974	-+??+	0.0	1.422	2	0.4911
12 : 24998096 : SNP	t	c	0.9486	0.0043	0.9454	0.9553	0.0275	0.0208	0.1864	++??-	0.0	1.103	2	0.5762
21 : 43229270 : SNP	a	t	0.3544	0.0110	0.3235	0.3769	-0.0056	0.0091	0.5356	+--+-	0.0	1.206	4	0.8771
2 : 89020644 : SNP	a	g	0.7011	0.0356	0.6276	0.7449	-0.0161	0.0098	0.09956	-----	44.3	7.187	4	0.1263
5 : 100136378 : SNP	a	g	0.2985	0.0073	0.2880	0.3052	-0.0106	0.0092	0.2506	--++-	9.5	4.417	4	0.3524
6 : 11321294 : SNP	c	g	0.0734	0.0050	0.0640	0.0776	0.0153	0.0165	0.3534	++?++	0.0	2.311	3	0.5104
7 : 148927211 : INDEL	d	r	0.2687	0.0084	0.2574	0.2848	0.0115	0.0099	0.2432	0+++-	19.7	4.984	4	0.289
16 : 16323968 : SNP	t	g	0.3011	0.0129	0.2772	0.3097	-0.0119	0.0233	0.6089	??++-	70.3	6.728	2	0.03459
10 : 2211960 : SNP	a	c	0.0272	0.0000	0.0272	0.0272	0.0020	0.0394	0.9595	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 72409082 : SNP	t	c	0.5012	0.0106	0.4796	0.5128	-0.0216	0.0086	0.01249	---+-	0.0	0.748	4	0.9453
7 : 20300622 : SNP	a	c	0.9376	0.0053	0.9186	0.9408	0.0192	0.0189	0.3118	++?++	0.0	0.543	3	0.9094
2 : 221333507 : SNP	a	g	0.7900	0.0140	0.7648	0.8026	-0.0148	0.0105	0.1579	-----	41.4	6.828	4	0.1452
6 : 9702482 : SNP	t	c	0.7351	0.0135	0.7016	0.7525	-0.0131	0.0098	0.1785	-+---	7.6	4.327	4	0.3635
2 : 202913107 : SNP	a	g	0.0760	0.0078	0.0665	0.0866	0.0241	0.0166	0.1457	+-?++	38.0	4.835	3	0.1843
13 : 60958901 : SNP	a	g	0.9010	0.0189	0.8722	0.9253	-0.0053	0.0155	0.7344	+-+--	17.9	4.875	4	0.3004
9 : 17697028 : INDEL	i	r	0.0741	0.0082	0.0542	0.0835	-0.0014	0.0165	0.9321	+---+	5.6	4.236	4	0.3751
1 : 162227205 : SNP	a	g	0.9559	0.0000	0.9559	0.9559	-0.0570	0.0526	0.2782	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 141349456 : SNP	t	c	0.2497	0.0176	0.2097	0.2693	0.0098	0.0099	0.3217	++---	46.5	7.473	4	0.1129
17 : 173906 : SNP	a	g	0.2685	0.0216	0.2413	0.2961	0.0165	0.0123	0.1769	+-+--	48.4	7.757	4	0.1009
10 : 10007326 : SNP	t	g	0.4627	0.0277	0.4034	0.5193	0.0031	0.0085	0.7122	+--+-	0.0	3.543	4	0.4714
15 : 79084411 : SNP	a	t	0.9784	0.0000	0.9784	0.9784	0.0760	0.0576	0.1872	+????	0.0	0.000	0	1
4 : 14922271 : SNP	t	c	0.0547	0.0058	0.0504	0.0704	0.0021	0.0201	0.9161	++?--	0.0	0.114	3	0.9901
8 : 86336475 : SNP	t	c	0.2279	0.0135	0.1866	0.2543	0.0124	0.0100	0.215	+++++	0.0	1.931	4	0.7484
14 : 52978412 : SNP	c	g	0.7426	0.0197	0.7180	0.7786	-0.0108	0.0099	0.2741	+-++-	51.9	8.309	4	0.08088
7 : 130928547 : SNP	t	c	0.7483	0.0094	0.7135	0.7716	0.0182	0.0107	0.08912	+++-+	37.5	6.405	4	0.1709
5 : 3582378 : SNP	a	g	0.0668	0.0063	0.0514	0.0698	-0.0244	0.0179	0.1724	--?++	30.5	4.318	3	0.2291
17 : 1191979 : SNP	t	c	0.1415	0.0236	0.1032	0.1655	-0.0082	0.0182	0.6522	--?--	0.0	0.127	3	0.9885
11 : 97235655 : SNP	a	g	0.0348	0.0084	0.0286	0.0461	0.0180	0.0326	0.5798	+???+	0.0	0.252	1	0.616
20 : 18724632 : SNP	t	c	0.9841	0.0000	0.9841	0.9841	0.0350	0.0586	0.5505	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 45522941 : SNP	a	g	0.9847	0.0000	0.9847	0.9847	-0.0640	0.0516	0.2145	-????	0.0	0.000	0	1
16 : 65820957 : SNP	t	c	0.8798	0.0054	0.8742	0.8973	0.0059	0.0133	0.6537	++++-	20.9	5.055	4	0.2817
5 : 67489723 : SNP	t	g	0.9762	0.0033	0.9726	0.9793	0.0164	0.0326	0.6155	-+???	51.5	2.062	1	0.151
9 : 36279233 : SNP	a	g	0.1940	0.0076	0.1860	0.2125	0.0055	0.0110	0.6168	0--++	0.0	1.795	4	0.7734
7 : 47456851 : SNP	a	t	0.0626	0.0018	0.0613	0.0690	-0.0230	0.0178	0.1972	--?+-	0.0	1.382	3	0.7097
17 : 30069957 : SNP	a	g	0.1616	0.0116	0.1337	0.1686	-0.0050	0.0120	0.6805	---++	33.8	6.043	4	0.1959
6 : 141128651 : SNP	t	c	0.3961	0.0071	0.3701	0.4049	0.0055	0.0089	0.5349	-+-++	0.0	1.072	4	0.8987
2 : 57299510 : SNP	a	g	0.8609	0.0064	0.8462	0.8665	-0.0153	0.0124	0.2178	--+--	0.8	4.032	4	0.4017
6 : 32973599 : SNP	t	c	0.1566	0.0164	0.1207	0.1709	-0.0041	0.0119	0.7325	+--++	49.1	7.865	4	0.09663
12 : 83394469 : SNP	a	c	0.8342	0.0084	0.8256	0.8510	0.0061	0.0119	0.6082	+--++	0.0	3.433	4	0.4882
22 : 37293780 : SNP	t	c	0.9586	0.0040	0.9539	0.9620	0.0256	0.0285	0.3688	++???	0.0	0.120	1	0.7292
3 : 119777330 : SNP	a	t	0.9554	0.0027	0.9518	0.9576	0.0335	0.0223	0.1329	++??+	0.0	0.294	2	0.8634
18 : 29063072 : INDEL	d	r	0.0189	0.0000	0.0189	0.0189	-0.0040	0.0475	0.9329	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 97801668 : SNP	a	c	0.3184	0.0108	0.3080	0.3318	0.0151	0.0092	0.1008	++-++	0.0	1.880	4	0.7579
8 : 3814378 : SNP	c	g	0.4738	0.0074	0.4509	0.4829	0.0067	0.0085	0.4303	+-+-+	2.0	4.082	4	0.3951
5 : 72648367 : SNP	a	g	0.0596	0.0009	0.0585	0.0603	-0.0129	0.0208	0.5358	--???	0.0	0.005	1	0.9444
8 : 115677310 : SNP	a	g	0.8106	0.0120	0.7814	0.8322	-0.0055	0.0111	0.6182	0++--	8.8	4.385	4	0.3564
8 : 20481649 : SNP	a	g	0.9457	0.0027	0.9427	0.9483	0.0093	0.0190	0.6253	-+??-	39.0	3.276	2	0.1944
1 : 245992986 : SNP	a	g	0.7251	0.0095	0.7192	0.7633	0.0004	0.0098	0.9657	-++-+	0.0	3.926	4	0.4161
8 : 128703679 : SNP	a	g	0.9398	0.0024	0.9366	0.9420	-0.0097	0.0193	0.6159	--?+?	16.5	2.394	2	0.3021
2 : 26329718 : SNP	t	c	0.0399	0.0000	0.0399	0.0399	0.0690	0.0344	0.04469	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 4599400 : SNP	t	c	0.3349	0.0179	0.3067	0.3745	-0.0111	0.0094	0.2376	-----	0.0	1.470	4	0.8319
4 : 112073797 : SNP	a	c	0.1535	0.0160	0.1366	0.1773	-0.0165	0.0121	0.1723	---+-	31.8	5.866	4	0.2094
10 : 125388834 : SNP	c	g	0.9669	0.0035	0.9601	0.9697	0.0385	0.0258	0.1345	++??+	75.5	8.150	2	0.01699
20 : 54275592 : SNP	a	g	0.2819	0.0157	0.2701	0.3141	-0.0005	0.0097	0.9622	0+-+-	5.6	4.238	4	0.3748
8 : 82774442 : SNP	t	c	0.2603	0.0140	0.2220	0.2686	0.0059	0.0097	0.5443	++-+-	37.1	6.361	4	0.1738
5 : 118155662 : SNP	t	g	0.9730	0.0058	0.9635	0.9766	0.0013	0.0327	0.9693	+???-	0.0	0.019	1	0.8916
14 : 100481808 : SNP	a	g	0.7940	0.0066	0.7873	0.8070	-0.0033	0.0109	0.7604	-+---	49.3	7.891	4	0.09564
1 : 203120775 : SNP	t	c	0.4137	0.0038	0.4096	0.4264	0.0031	0.0086	0.7189	++-++	18.1	4.883	4	0.2995
14 : 61954272 : SNP	t	c	0.8367	0.0050	0.8325	0.8463	-0.0001	0.0115	0.991	-++--	10.9	4.490	4	0.3437
8 : 57170336 : SNP	t	c	0.8441	0.0272	0.7940	0.8717	-0.0060	0.0121	0.6205	---+-	0.0	0.503	4	0.9732
9 : 5843734 : INDEL	d	r	0.0415	0.0000	0.0415	0.0415	0.0030	0.0374	0.9361	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 48525457 : SNP	c	g	0.9245	0.0088	0.9163	0.9434	0.0029	0.0169	0.8618	+-?++	67.9	9.358	3	0.02489
2 : 195326223 : SNP	t	c	0.9499	0.0057	0.9458	0.9578	0.0178	0.0229	0.4371	+-???	59.8	2.485	1	0.1149
2 : 202816996 : SNP	a	g	0.0517	0.0075	0.0415	0.0616	0.0282	0.0253	0.2653	++?-?	48.3	3.871	2	0.1444
6 : 165319353 : SNP	a	g	0.1131	0.0125	0.0824	0.1271	-0.0029	0.0138	0.834	+--+-	13.1	4.605	4	0.3303
14 : 71560586 : SNP	t	c	0.9860	0.0000	0.9860	0.9860	-0.0550	0.0516	0.286	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 21966872 : SNP	a	g	0.9861	0.0000	0.9861	0.9861	0.0270	0.0536	0.6143	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 26697732 : SNP	c	g	0.9158	0.0207	0.8803	0.9313	-0.0127	0.0163	0.4359	-+---	0.0	1.545	4	0.8186
21 : 24800891 : SNP	a	g	0.7761	0.0120	0.7484	0.7992	-0.0123	0.0103	0.2326	--+--	18.1	4.883	4	0.2995
19 : 16129858 : SNP	c	g	0.4363	0.0050	0.4216	0.4399	0.0001	0.0091	0.9913	+-+-+	0.0	3.490	4	0.4794
3 : 36492958 : INDEL	d	r	0.1055	0.0045	0.0922	0.1099	0.0022	0.0153	0.8868	+---+	3.5	4.147	4	0.3864
2 : 28403291 : SNP	t	c	0.2397	0.0154	0.2084	0.2546	-0.0047	0.0099	0.6378	-+--+	16.3	4.781	4	0.3105
2 : 117720431 : SNP	t	c	0.0496	0.0039	0.0468	0.0570	-0.0264	0.0202	0.1919	--?--	0.0	0.955	3	0.8122
9 : 85300784 : SNP	t	c	0.0994	0.0092	0.0898	0.1133	0.0005	0.0141	0.9711	++-+-	0.0	2.023	4	0.7315
10 : 28503477 : INDEL	i	r	0.0174	0.0000	0.0174	0.0174	0.0080	0.0526	0.879	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 76033136 : SNP	c	g	0.2344	0.0055	0.2228	0.2391	-0.0047	0.0104	0.6499	0--+-	0.0	0.784	4	0.9406
3 : 5167618 : SNP	a	g	0.2745	0.0121	0.2532	0.2913	0.0168	0.0107	0.1148	+++++	0.0	1.403	4	0.8436
3 : 18123689 : SNP	c	g	0.9367	0.0045	0.9325	0.9476	-0.0033	0.0181	0.8538	-+?+-	0.0	2.969	3	0.3965
3 : 131059774 : SNP	t	c	0.9757	0.0000	0.9757	0.9757	-0.0310	0.0404	0.4433	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 17954125 : SNP	t	c	0.8741	0.0127	0.8483	0.8829	0.0043	0.0130	0.7386	-++++	0.0	1.447	4	0.836
8 : 23944938 : SNP	t	c	0.0388	0.0032	0.0361	0.0446	-0.0034	0.0241	0.8882	--??+	68.8	6.419	2	0.04039
4 : 12168880 : SNP	a	t	0.0394	0.0030	0.0331	0.0426	-0.0110	0.0231	0.6349	-+??-	0.0	1.126	2	0.5696
9 : 26747174 : SNP	a	c	0.3511	0.0322	0.2805	0.3742	0.0046	0.0092	0.6156	-++--	0.0	2.989	4	0.5597
3 : 167510214 : SNP	a	g	0.6001	0.0134	0.5891	0.6267	-0.0029	0.0089	0.7462	---++	12.3	4.559	4	0.3356
21 : 35615555 : SNP	a	g	0.6749	0.0084	0.6505	0.6811	-0.0089	0.0099	0.3655	-+--?	33.9	4.535	3	0.2092
1 : 42176691 : SNP	a	g	0.0227	0.0000	0.0227	0.0227	0.0030	0.0526	0.9545	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 5154307 : SNP	a	g	0.9576	0.0021	0.9549	0.9593	-0.0243	0.0244	0.3201	--???	0.0	0.057	1	0.8105
8 : 42618319 : SNP	a	c	0.9779	0.0000	0.9779	0.9779	-0.0210	0.0455	0.6443	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 94377008 : SNP	a	c	0.0490	0.0048	0.0460	0.0627	-0.0088	0.0211	0.6769	-+?--	5.5	3.174	3	0.3656
2 : 16943002 : INDEL	d	r	0.0283	0.0000	0.0283	0.0283	-0.0060	0.0384	0.8759	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 51051759 : SNP	a	g	0.0833	0.0090	0.0626	0.0922	0.0194	0.0157	0.2152	++--+	0.0	1.516	4	0.8237
5 : 10723635 : SNP	t	g	0.1999	0.0053	0.1937	0.2196	-0.0163	0.0105	0.1193	-----	0.0	0.615	4	0.9614
10 : 26007210 : SNP	c	g	0.9322	0.0070	0.9235	0.9391	0.0147	0.0191	0.4422	-+?+-	0.0	2.967	3	0.3968
9 : 32532133 : INDEL	d	r	0.2645	0.0037	0.2488	0.2731	0.0037	0.0098	0.7067	++-+-	0.0	1.001	4	0.9096
11 : 61815645 : INDEL	i	r	0.0186	0.0000	0.0186	0.0186	0.1100	0.0596	0.06513	+????	0.0	0.000	0	1
18 : 43629465 : SNP	a	t	0.9195	0.0108	0.8971	0.9254	0.0041	0.0161	0.7978	++?--	25.7	4.035	3	0.2577
5 : 103089955 : SNP	a	t	0.0307	0.0000	0.0307	0.0307	0.0710	0.0465	0.1268	+????	0.0	0.000	0	1
6 : 29576393 : SNP	a	g	0.7971	0.0210	0.7814	0.8470	0.0062	0.0224	0.7818	??--+	65.0	5.718	2	0.05734
9 : 10699461 : SNP	a	t	0.8165	0.0064	0.8099	0.8368	0.0088	0.0111	0.4285	+-+-+	31.7	5.858	4	0.21
7 : 120945217 : SNP	a	g	0.6419	0.0145	0.6072	0.6714	-0.0139	0.0091	0.1281	----+	0.0	1.685	4	0.7934
1 : 57874866 : SNP	t	c	0.1502	0.0053	0.1453	0.1618	0.0057	0.0121	0.6351	++---	28.3	5.579	4	0.2329
1 : 30401705 : SNP	a	g	0.0566	0.0037	0.0469	0.0589	0.0086	0.0196	0.6595	+-??+	0.0	1.191	2	0.5512
8 : 15107100 : SNP	a	g	0.8406	0.0075	0.8252	0.8534	0.0053	0.0118	0.6504	+---+	63.8	11.036	4	0.02616
21 : 39018843 : SNP	t	c	0.0220	0.0000	0.0220	0.0220	0.0160	0.0475	0.7363	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 66269464 : SNP	t	c	0.7682	0.0144	0.7413	0.7985	0.0132	0.0099	0.1845	+++++	0.0	0.199	4	0.9954
5 : 174012309 : INDEL	d	r	0.4467	0.0151	0.4277	0.4897	0.0013	0.0092	0.8884	-+++-	48.4	7.748	4	0.1012
13 : 90377264 : SNP	t	g	0.0414	0.0004	0.0409	0.0418	-0.0234	0.0226	0.3015	0-??+	57.1	4.663	2	0.09717
4 : 140310520 : SNP	t	c	0.8280	0.0103	0.7984	0.8370	0.0032	0.0112	0.7729	+-++-	0.0	3.218	4	0.522
3 : 72364573 : SNP	c	g	0.6978	0.0174	0.6573	0.7138	0.0071	0.0094	0.4508	+--++	0.0	2.314	4	0.6782
15 : 91064533 : SNP	a	g	0.3066	0.0074	0.2742	0.3118	-0.0127	0.0094	0.1759	---++	18.9	4.930	4	0.2946
6 : 32539744 : SNP	a	t	0.9065	0.0000	0.9065	0.9065	-0.0541	0.0454	0.2334	????-	0.0	0.000	0	1
4 : 156358742 : SNP	t	c	0.3461	0.0219	0.2972	0.4041	-0.0100	0.0090	0.2671	--++0	0.0	1.494	4	0.8278
12 : 38623304 : SNP	t	c	0.4770	0.0170	0.4469	0.4924	0.0020	0.0086	0.8195	-++-+	52.0	8.338	4	0.07994
11 : 13106802 : SNP	t	c	0.5294	0.0092	0.5105	0.5359	0.0069	0.0085	0.4197	-+-++	25.3	5.358	4	0.2525
3 : 99494215 : SNP	a	g	0.1324	0.0037	0.1274	0.1394	-0.0189	0.0127	0.1348	-----	0.0	3.107	4	0.5401
8 : 13341312 : SNP	a	g	0.0332	0.0057	0.0290	0.0442	-0.0051	0.0249	0.839	-+??-	0.0	0.081	2	0.9601
9 : 72494969 : INDEL	i	r	0.5546	0.0169	0.5269	0.5807	-0.0036	0.0093	0.6996	+-++-	0.0	2.023	4	0.7315
9 : 6664282 : SNP	a	g	0.4033	0.0278	0.3415	0.4373	0.0080	0.0086	0.354	++-+-	0.0	2.035	4	0.7294
18 : 2006440 : SNP	a	g	0.4006	0.0104	0.3898	0.4122	0.0026	0.0089	0.7699	+-+-+	0.0	3.658	4	0.4543
14 : 27600379 : SNP	t	c	0.9047	0.0048	0.8910	0.9118	-0.0177	0.0146	0.2228	-++--	46.8	7.513	4	0.1111
3 : 1899211 : SNP	t	c	0.8673	0.0089	0.8553	0.8917	0.0008	0.0127	0.9512	-+-++	0.0	0.702	4	0.9511
6 : 123770005 : SNP	a	g	0.2691	0.0094	0.2364	0.2778	0.0108	0.0099	0.2711	++-++	0.0	3.647	4	0.4559
4 : 177688889 : SNP	a	g	0.0968	0.0090	0.0871	0.1156	-0.0009	0.0144	0.9506	--++-	0.0	3.518	4	0.4751
12 : 110629246 : SNP	c	g	0.0102	0.0000	0.0102	0.0102	-0.0720	0.0607	0.2352	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 39358819 : SNP	a	g	0.3425	0.0114	0.3364	0.3688	-0.0041	0.0091	0.648	+----	51.3	8.217	4	0.08393
4 : 132491126 : SNP	a	t	0.0592	0.0059	0.0535	0.0763	-0.0358	0.0201	0.07522	--?+-	13.3	3.460	3	0.326
20 : 9321507 : SNP	a	g	0.0655	0.0066	0.0565	0.0713	0.0188	0.0179	0.2928	++?+-	0.0	0.842	3	0.8394
19 : 36456441 : SNP	c	g	0.9720	0.0000	0.9720	0.9720	-0.1120	0.0586	0.0561	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 201095842 : SNP	a	c	0.0279	0.0094	0.0216	0.0419	0.0302	0.0360	0.4021	+???-	0.0	0.733	1	0.3919
2 : 25853230 : SNP	c	g	0.9874	0.0000	0.9874	0.9874	-0.1580	0.0627	0.0117	-????	0.0	0.000	0	1
13 : 102572890 : SNP	t	c	0.0270	0.0000	0.0270	0.0270	-0.0110	0.0435	0.8002	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 196511217 : SNP	a	c	0.9235	0.0054	0.9110	0.9345	-0.0361	0.0163	0.02697	-+---	56.8	9.256	4	0.05502
17 : 29096006 : SNP	t	c	0.0693	0.0037	0.0670	0.0752	0.0136	0.0426	0.7495	???-+	3.6	1.038	1	0.3084
1 : 112346109 : SNP	t	c	0.7514	0.0128	0.7395	0.7780	0.0012	0.0101	0.905	+--++	0.0	3.172	4	0.5294
11 : 121730623 : SNP	a	g	0.0555	0.0090	0.0483	0.0714	-0.0068	0.0199	0.7323	+-?--	0.0	1.429	3	0.6987
9 : 126879343 : SNP	t	c	0.7786	0.0126	0.7555	0.8089	0.0040	0.0105	0.7026	-+-++	0.0	1.425	4	0.8399
2 : 24237207 : SNP	a	g	0.9838	0.0000	0.9838	0.9838	-0.0570	0.0505	0.2594	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 192036701 : SNP	t	c	0.8608	0.0104	0.8509	0.8770	-0.0110	0.0128	0.3923	---+-	0.0	2.002	4	0.7353
2 : 29464624 : SNP	t	c	0.9025	0.0121	0.8835	0.9201	0.0434	0.0191	0.02303	+++++	0.0	3.925	4	0.4162
12 : 6531927 : SNP	t	c	0.2647	0.0115	0.2402	0.2890	0.0244	0.0111	0.02733	+++++	0.0	0.858	4	0.9306
1 : 116784787 : SNP	a	g	0.9494	0.0064	0.9371	0.9541	0.0063	0.0206	0.7619	+-??-	0.0	1.083	2	0.582
4 : 101827678 : SNP	t	c	0.0180	0.0000	0.0180	0.0180	0.0340	0.0505	0.5011	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 14656393 : SNP	c	g	0.9555	0.0008	0.9548	0.9568	0.0290	0.0222	0.1911	0+??+	25.4	2.680	2	0.2619
21 : 44369343 : SNP	t	c	0.8021	0.0077	0.7859	0.8069	-0.0060	0.0112	0.5921	-+-+-	0.0	1.056	4	0.9011
6 : 53734552 : INDEL	d	r	0.3959	0.0273	0.3566	0.4366	0.0214	0.0099	0.03043	++-++	0.0	2.310	4	0.6789
10 : 45478681 : SNP	t	g	0.8543	0.0113	0.8299	0.8630	-0.0008	0.0120	0.9447	+-+-+	0.0	2.856	4	0.5822
13 : 78691879 : INDEL	d	r	0.0425	0.0059	0.0351	0.0474	-0.0381	0.0225	0.09064	--??+	0.0	0.926	2	0.6295
2 : 44573671 : SNP	t	g	0.7426	0.0114	0.7295	0.7539	-0.0027	0.0098	0.7844	-0+++	0.0	0.436	4	0.9794
4 : 488844 : SNP	t	c	0.0331	0.0109	0.0246	0.0470	-0.0081	0.0334	0.809	+???-	0.0	0.120	1	0.7293
5 : 157895049 : SNP	t	c	0.2725	0.0200	0.2458	0.3111	-0.0078	0.0093	0.4034	--+-+	0.0	2.614	4	0.6244
15 : 92708742 : INDEL	d	r	0.0822	0.0048	0.0683	0.0862	0.0332	0.0160	0.03841	++?++	0.0	0.182	3	0.9805
12 : 97767591 : SNP	a	g	0.1099	0.0066	0.1064	0.1345	0.0204	0.0139	0.1428	-+--+	58.1	9.548	4	0.04877
12 : 27370095 : SNP	t	c	0.6405	0.0135	0.6254	0.6548	-0.0005	0.0089	0.9592	+-+-+	0.0	2.973	4	0.5623
2 : 182503768 : SNP	a	g	0.6278	0.0080	0.5959	0.6346	0.0083	0.0091	0.3623	++-++	1.5	4.061	4	0.3979
1 : 83886390 : SNP	t	c	0.9163	0.0062	0.9118	0.9295	0.0005	0.0182	0.9781	++?+-	73.9	11.480	3	0.009395
3 : 66308746 : SNP	a	g	0.9329	0.0088	0.9258	0.9468	-0.0078	0.0211	0.7112	+-??-	0.0	1.252	2	0.5348
8 : 10495027 : SNP	a	g	0.2448	0.0158	0.2039	0.2560	-0.0039	0.0119	0.74	+---+	32.7	5.944	4	0.2034
4 : 29750065 : SNP	a	g	0.0480	0.0024	0.0432	0.0500	0.0036	0.0214	0.8674	-+??+	23.7	2.622	2	0.2695
3 : 156617272 : INDEL	d	r	0.0216	0.0000	0.0216	0.0216	-0.0140	0.0576	0.808	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 39413784 : SNP	t	c	0.0387	0.0036	0.0334	0.0411	-0.0074	0.0252	0.7696	+-???	84.7	6.555	1	0.01046
10 : 37985902 : SNP	a	g	0.0222	0.0000	0.0222	0.0222	-0.0500	0.0536	0.3507	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 17740102 : SNP	c	g	0.1386	0.0040	0.1282	0.1415	0.0044	0.0122	0.721	+-+--	0.0	3.364	4	0.4988
9 : 5263058 : SNP	a	g	0.2492	0.0059	0.2382	0.2571	0.0191	0.0100	0.05656	++++-	0.0	3.977	4	0.4091
6 : 106568034 : SNP	t	c	0.6645	0.0155	0.6458	0.6949	-0.0015	0.0092	0.8736	--+-+	0.0	2.572	4	0.6317
6 : 24297361 : INDEL	i	r	0.1111	0.0082	0.1064	0.1290	-0.0087	0.0140	0.5342	-+-+-	20.1	5.007	4	0.2866
16 : 63798930 : SNP	t	c	0.6676	0.0130	0.6381	0.6874	-0.0151	0.0092	0.0988	--++-	29.1	5.642	4	0.2275
4 : 165402518 : SNP	c	g	0.3138	0.0069	0.3034	0.3268	0.0060	0.0093	0.5143	+++-+	0.0	0.744	4	0.9457
8 : 13753124 : SNP	a	g	0.5475	0.0135	0.5227	0.5604	-0.0139	0.0086	0.1051	--++-	0.0	0.618	4	0.961
5 : 66502693 : SNP	a	t	0.0221	0.0000	0.0221	0.0221	0.0230	0.0455	0.6131	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 80170072 : SNP	a	g	0.4605	0.0114	0.4450	0.4850	0.0032	0.0085	0.7027	+-+-+	0.0	3.857	4	0.4257
10 : 38954757 : SNP	a	g	0.1491	0.0000	0.1491	0.1491	-0.0249	0.0730	0.733	???-?	0.0	0.000	0	1
9 : 108956449 : SNP	a	t	0.2846	0.0150	0.2685	0.3076	-0.0046	0.0095	0.6312	+-++-	18.1	4.887	4	0.2991
16 : 79158451 : SNP	t	c	0.6296	0.0167	0.6214	0.6701	-0.0048	0.0088	0.5825	+----	0.0	2.486	4	0.6471
12 : 122804256 : SNP	t	c	0.2678	0.0270	0.2509	0.3620	-0.0025	0.0105	0.8144	+--++	43.3	7.059	4	0.1328
15 : 90172834 : SNP	t	g	0.6680	0.0067	0.6545	0.6731	0.0103	0.0091	0.2587	++++-	0.0	1.213	4	0.8759
8 : 34096359 : SNP	c	g	0.5748	0.0053	0.5480	0.5770	-0.0023	0.0087	0.7943	--+-+	0.0	2.409	4	0.661
12 : 106070478 : SNP	t	c	0.5110	0.0259	0.4947	0.5686	-0.0002	0.0086	0.9797	-+--+	3.4	4.141	4	0.3873
3 : 19790647 : INDEL	d	r	0.2522	0.0228	0.1869	0.2651	0.0082	0.0103	0.4303	-++-+	0.0	2.742	4	0.6019
17 : 44205500 : SNP	a	g	0.7296	0.0295	0.7145	0.8010	0.0163	0.0203	0.4229	??-++	37.7	3.210	2	0.2009
11 : 129558637 : SNP	a	g	0.2738	0.0208	0.2553	0.3120	0.0002	0.0105	0.9826	-+-++	0.0	2.528	4	0.6396
16 : 78988000 : SNP	c	g	0.6010	0.0093	0.5830	0.6182	0.0176	0.0089	0.04863	++++-	0.0	3.983	4	0.4083
17 : 69283575 : SNP	a	c	0.0272	0.0000	0.0272	0.0272	-0.0310	0.0425	0.4653	-????	0.0	0.000	0	1
3 : 89783117 : SNP	t	c	0.0500	0.0054	0.0468	0.0657	-0.0184	0.0244	0.4514	+-?+?	65.9	5.868	2	0.05317
12 : 64505468 : SNP	a	g	0.9714	0.0012	0.9700	0.9724	0.0255	0.0300	0.3951	++???	0.0	0.021	1	0.8837
12 : 26173605 : SNP	t	g	0.2621	0.0168	0.2292	0.2845	0.0060	0.0098	0.5397	-++-+	8.1	4.353	4	0.3603
15 : 81496736 : SNP	a	t	0.1026	0.0020	0.0979	0.1045	-0.0074	0.0141	0.5993	-+-++	0.0	2.746	4	0.6011
6 : 70772545 : SNP	c	g	0.4888	0.0128	0.4700	0.5074	0.0097	0.0092	0.2878	+++++	0.0	1.303	4	0.8608
8 : 16557982 : SNP	a	g	0.0332	0.0053	0.0285	0.0392	0.0008	0.0325	0.9794	-+???	87.6	8.057	1	0.004533
1 : 40099619 : SNP	t	c	0.0807	0.0018	0.0766	0.0822	-0.0276	0.0167	0.09948	--?--	0.0	0.434	3	0.9332
6 : 3074021 : SNP	a	g	0.2819	0.0126	0.2650	0.2933	0.0198	0.0102	0.05194	++--+	29.0	5.637	4	0.2279
10 : 109677886 : SNP	a	g	0.1577	0.0142	0.1442	0.1851	-0.0097	0.0139	0.4843	----+	0.0	3.270	4	0.5138
20 : 11733631 : SNP	t	c	0.4468	0.0122	0.4382	0.4754	0.0001	0.0086	0.9892	-++-+	0.0	0.713	4	0.9497
6 : 154265001 : INDEL	d	r	0.2274	0.0312	0.2005	0.2902	-0.0027	0.0104	0.7925	+----	60.0	10.001	4	0.0404
5 : 31465849 : INDEL	d	r	0.6601	0.0171	0.6091	0.6694	0.0087	0.0091	0.338	+++++	0.0	0.063	4	0.9995
6 : 13159526 : SNP	a	g	0.4583	0.0155	0.4124	0.4920	0.0118	0.0091	0.197	++-+-	73.3	14.959	4	0.004786
20 : 8810198 : SNP	a	g	0.3182	0.0174	0.3071	0.3551	0.0104	0.0091	0.2502	++-+-	0.0	1.814	4	0.77
5 : 27902899 : SNP	t	c	0.4439	0.0107	0.4234	0.4534	-0.0005	0.0085	0.9509	-+-++	66.3	11.882	4	0.01825
7 : 8481646 : SNP	a	g	0.7984	0.0097	0.7904	0.8213	-0.0103	0.0107	0.3355	-----	0.0	0.937	4	0.9192
11 : 76275703 : SNP	t	c	0.4171	0.0046	0.4099	0.4203	0.0107	0.0085	0.2095	++++-	0.0	2.588	4	0.629
21 : 35797177 : SNP	a	t	0.5003	0.0104	0.4777	0.5111	0.0009	0.0086	0.9131	++-++	0.0	2.999	4	0.558
18 : 64992502 : SNP	a	t	0.3253	0.0180	0.2660	0.3429	-0.0089	0.0092	0.3319	----+	28.2	5.574	4	0.2333
5 : 118719900 : SNP	t	c	0.0525	0.0038	0.0479	0.0596	0.0309	0.0195	0.1131	-+?++	46.7	5.627	3	0.1312
15 : 55570323 : SNP	t	c	0.9488	0.0082	0.9331	0.9555	-0.0251	0.0200	0.2089	--?-+	0.0	2.814	3	0.4213
7 : 119745640 : SNP	a	g	0.9849	0.0000	0.9849	0.9849	0.0840	0.0536	0.1169	+????	0.0	0.000	0	1
20 : 60853588 : SNP	t	c	0.4309	0.0179	0.3989	0.4571	0.0180	0.0091	0.04742	+++++	0.0	1.091	4	0.8957
17 : 14304647 : INDEL	d	r	0.0745	0.0040	0.0684	0.0797	0.0168	0.0167	0.3148	++?++	0.0	0.394	3	0.9415
2 : 187996654 : SNP	a	g	0.9880	0.0000	0.9880	0.9880	0.0510	0.0607	0.4004	+????	0.0	0.000	0	1
12 : 52719032 : SNP	a	g	0.3463	0.0164	0.3346	0.3824	0.0012	0.0091	0.8973	-++++	0.0	0.998	4	0.9102
17 : 43557084 : INDEL	i	r	0.1112	0.0115	0.1035	0.1285	-0.0250	0.0416	0.5479	???--	0.0	0.403	1	0.5257
18 : 25683891 : SNP	t	c	0.9839	0.0000	0.9839	0.9839	-0.0510	0.0505	0.313	-????	0.0	0.000	0	1
17 : 6133917 : SNP	t	g	0.0184	0.0000	0.0184	0.0184	-0.0210	0.0505	0.6778	-????	0.0	0.000	0	1
15 : 26347280 : INDEL	i	r	0.0491	0.0040	0.0436	0.0527	0.0017	0.0232	0.9426	++??-	0.0	0.853	2	0.6528
7 : 13428692 : SNP	a	g	0.7167	0.0083	0.6946	0.7245	0.0020	0.0096	0.8327	+-++-	0.0	3.818	4	0.4312
7 : 3453379 : SNP	c	g	0.2853	0.0142	0.2604	0.3018	0.0077	0.0096	0.4247	++-+-	0.0	3.317	4	0.5062
12 : 31747374 : SNP	a	t	0.0280	0.0000	0.0280	0.0280	-0.0580	0.0455	0.2023	-????	0.0	0.000	0	1
14 : 52838798 : SNP	t	c	0.9382	0.0055	0.9264	0.9415	0.0133	0.0183	0.4672	++?-+	0.0	0.177	3	0.9812
4 : 112320855 : SNP	t	g	0.9815	0.0000	0.9815	0.9815	0.0830	0.0536	0.1213	+????	0.0	0.000	0	1
9 : 16120893 : SNP	t	g	0.0161	0.0000	0.0161	0.0161	0.0610	0.0495	0.2181	+????	0.0	0.000	0	1
5 : 180318311 : SNP	c	g	0.8987	0.0077	0.8867	0.9054	-0.0124	0.0346	0.7186	??+--	0.0	0.215	2	0.8982
12 : 87984547 : SNP	t	c	0.9428	0.0050	0.9361	0.9535	-0.0373	0.0193	0.05283	--?--	0.0	1.718	3	0.6328
4 : 94040040 : SNP	a	g	0.9893	0.0000	0.9893	0.9893	-0.0210	0.0596	0.7248	-????	0.0	0.000	0	1
20 : 45560871 : SNP	a	g	0.0250	0.0000	0.0250	0.0250	0.0130	0.0586	0.8245	+????	0.0	0.000	0	1
15 : 24606904 : SNP	c	g	0.1918	0.0030	0.1899	0.1980	-0.0143	0.0127	0.2593	-?++-	46.6	5.616	3	0.1318
9 : 126570251 : SNP	t	g	0.1057	0.0072	0.0994	0.1215	0.0071	0.0139	0.6078	+++++	0.0	0.518	4	0.9717
4 : 157494311 : SNP	a	t	0.2468	0.0145	0.2134	0.2647	-0.0028	0.0101	0.7792	-0-+-	39.3	6.585	4	0.1595
6 : 23707515 : SNP	t	c	0.0133	0.0000	0.0133	0.0133	0.1880	0.0627	0.002703	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 95881337 : SNP	c	g	0.0211	0.0000	0.0211	0.0211	0.0330	0.0505	0.5138	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 199743569 : SNP	a	c	0.1104	0.0210	0.0754	0.1245	0.0033	0.0211	0.8748	+-?++	16.2	3.581	3	0.3104
4 : 78358601 : SNP	t	c	0.1693	0.0106	0.1577	0.1909	-0.0066	0.0115	0.5693	-+---	33.1	5.981	4	0.2006
15 : 75790127 : SNP	a	g	0.2520	0.0196	0.2070	0.2638	0.0042	0.0101	0.6765	+-++-	5.2	4.221	4	0.3769
6 : 108251515 : INDEL	d	r	0.6439	0.0155	0.6272	0.6693	0.0038	0.0129	0.7708	+---+	19.0	4.939	4	0.2936
2 : 206226135 : SNP	c	g	0.2754	0.0089	0.2629	0.2924	-0.0050	0.0099	0.6108	----+	0.0	1.909	4	0.7525
2 : 127435986 : SNP	a	g	0.1573	0.0181	0.1381	0.1785	-0.0228	0.0161	0.1565	--+--	0.0	1.795	4	0.7734
2 : 111657794 : INDEL	i	r	0.3645	0.0155	0.3535	0.3957	0.0009	0.0090	0.9246	+-+++	3.3	4.136	4	0.3879
2 : 240585745 : SNP	t	g	0.7002	0.0078	0.6906	0.7081	-0.0106	0.0092	0.2495	----+	0.0	2.224	4	0.6946
13 : 95582752 : SNP	a	g	0.5614	0.0226	0.5389	0.6082	-0.0009	0.0091	0.9247	-++++	0.0	0.976	4	0.9135
2 : 7748757 : SNP	t	c	0.4510	0.0316	0.3729	0.4890	0.0088	0.0086	0.3025	-+-++	56.0	9.088	4	0.05893
2 : 222074548 : SNP	t	c	0.1865	0.0040	0.1807	0.1901	0.0069	0.0112	0.5373	-++++	26.3	5.427	4	0.2462
6 : 31907168 : SNP	t	c	0.1058	0.0236	0.0786	0.1463	0.0266	0.0145	0.06721	++?-+	0.0	0.681	3	0.8777
9 : 80873884 : SNP	a	g	0.9857	0.0000	0.9857	0.9857	-0.0330	0.0536	0.5379	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 220463977 : SNP	t	c	0.5193	0.0219	0.4917	0.5403	-0.0001	0.0086	0.9903	--++-	10.3	4.460	4	0.3473
14 : 47221559 : SNP	a	g	0.8243	0.0062	0.8137	0.8478	-0.0012	0.0113	0.9161	-++++	24.8	5.319	4	0.2561
10 : 2863045 : SNP	t	c	0.6155	0.0114	0.6074	0.6494	-0.0043	0.0087	0.62	-+--+	0.0	3.592	4	0.464
5 : 56310501 : SNP	a	g	0.0987	0.0060	0.0818	0.1064	-0.0200	0.0146	0.1705	-----	0.0	0.946	4	0.9178
12 : 69169316 : SNP	a	g	0.0539	0.0134	0.0456	0.0820	-0.0124	0.0219	0.5696	--?+-	38.2	4.852	3	0.183
13 : 42694222 : SNP	a	g	0.1686	0.0137	0.1583	0.2015	-0.0143	0.0113	0.2072	-+-++	8.2	4.357	4	0.3599
15 : 56916011 : SNP	c	g	0.0262	0.0000	0.0262	0.0262	-0.0130	0.0374	0.7282	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 55235152 : SNP	t	c	0.5533	0.0071	0.5439	0.5687	-0.0050	0.0087	0.5671	+-+--	52.3	8.384	4	0.07849
19 : 46586689 : SNP	a	g	0.0188	0.0000	0.0188	0.0188	0.0080	0.0445	0.8573	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 112405722 : INDEL	d	r	0.1461	0.0138	0.1141	0.1533	0.0078	0.0122	0.5214	+--+-	60.6	10.152	4	0.03794
10 : 35440293 : SNP	a	g	0.1735	0.0032	0.1678	0.1835	0.0089	0.0112	0.4269	-++++	0.0	3.519	4	0.475
3 : 117647272 : SNP	t	g	0.0262	0.0099	0.0184	0.0387	0.0084	0.0365	0.817	+???-	74.0	3.845	1	0.04989
12 : 100367537 : INDEL	d	r	0.0298	0.0000	0.0298	0.0298	0.0230	0.0455	0.6131	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 103538861 : SNP	a	g	0.1946	0.0185	0.1834	0.2426	-0.0062	0.0110	0.5739	+----	28.5	5.594	4	0.2316
8 : 74458455 : SNP	a	g	0.0354	0.0027	0.0318	0.0374	0.0421	0.0259	0.1036	++???	0.0	0.376	1	0.5399
1 : 75797131 : SNP	c	g	0.8200	0.0212	0.7972	0.8674	0.0074	0.0113	0.5166	+--++	0.0	3.768	4	0.4384
12 : 60981217 : INDEL	d	r	0.0144	0.0000	0.0144	0.0144	0.0300	0.0516	0.5606	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 124646612 : SNP	t	g	0.0432	0.0107	0.0357	0.0676	-0.0170	0.0224	0.4479	+-?--	62.4	7.986	3	0.04631
18 : 64524332 : SNP	a	g	0.0516	0.0000	0.0516	0.0516	-0.0060	0.0455	0.8951	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 170848736 : SNP	a	t	0.9433	0.0053	0.9299	0.9462	-0.0074	0.0192	0.7002	+-?--	0.0	2.420	3	0.49
12 : 96888917 : INDEL	d	r	0.1187	0.0057	0.1134	0.1290	-0.0093	0.0131	0.4813	+----	39.9	6.651	4	0.1555
13 : 69398670 : SNP	a	g	0.8001	0.0212	0.7466	0.8140	0.0071	0.0105	0.4987	++++-	1.6	4.065	4	0.3973
1 : 102284319 : SNP	t	c	0.0532	0.0041	0.0491	0.0614	-0.0024	0.0229	0.918	+-?+-	41.6	5.136	3	0.1621
1 : 60729984 : SNP	t	c	0.0364	0.0000	0.0364	0.0364	-0.0550	0.0394	0.163	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 71745857 : SNP	t	c	0.1812	0.0085	0.1519	0.1880	-0.0050	0.0112	0.6534	---++	51.2	8.190	4	0.08486
4 : 97319650 : SNP	a	g	0.1959	0.0048	0.1848	0.2005	-0.0164	0.0107	0.1259	----+	20.7	5.042	4	0.2831
1 : 231996709 : SNP	a	t	0.5401	0.0071	0.5293	0.5477	0.0094	0.0085	0.2699	++++-	54.5	8.801	4	0.06628
6 : 157338328 : SNP	t	c	0.5012	0.0139	0.4905	0.5410	-0.0006	0.0085	0.9406	+-++-	0.0	2.786	4	0.5943
19 : 6991543 : SNP	a	g	0.1059	0.0102	0.0986	0.1202	0.0140	0.0445	0.7527	???+-	0.0	0.444	1	0.5053
6 : 154660046 : SNP	t	c	0.0154	0.0000	0.0154	0.0154	-0.0550	0.0566	0.3313	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 171839787 : SNP	a	g	0.0874	0.0059	0.0817	0.0975	-0.0026	0.0157	0.8692	-+---	0.0	0.579	4	0.9653
10 : 134050758 : SNP	t	c	0.2519	0.0048	0.2417	0.2588	0.0017	0.0102	0.8697	--++-	32.8	5.955	4	0.2025
1 : 240477268 : SNP	t	g	0.8824	0.0054	0.8756	0.8942	0.0020	0.0131	0.8767	++---	0.0	2.203	4	0.6985
7 : 6977214 : SNP	t	c	0.3234	0.0088	0.3097	0.3299	0.0140	0.0266	0.5993	??+++	0.0	0.126	2	0.9391
1 : 84950678 : SNP	t	c	0.0206	0.0000	0.0206	0.0206	0.0110	0.0435	0.8002	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 34616251 : SNP	t	c	0.3070	0.0087	0.2727	0.3157	-0.0049	0.0107	0.6458	--+-+	0.0	1.076	4	0.8981
3 : 161686913 : INDEL	d	r	0.1588	0.0103	0.1452	0.1735	0.0062	0.0119	0.5991	-+++-	28.9	5.623	4	0.2292
12 : 127041027 : SNP	t	c	0.0717	0.0235	0.0526	0.1153	-0.0198	0.0181	0.2743	-+?--	0.0	1.313	3	0.726
2 : 224161626 : SNP	t	g	0.7734	0.0092	0.7653	0.7901	-0.0010	0.0101	0.9205	+---+	0.0	2.326	4	0.676
5 : 124816478 : SNP	a	g	0.0614	0.0035	0.0519	0.0632	0.0320	0.0188	0.08881	++?--	0.0	2.056	3	0.5609
3 : 39318797 : SNP	t	g	0.2730	0.0158	0.2223	0.2845	-0.0044	0.0096	0.6448	-+-+-	7.8	4.340	4	0.362
9 : 100455363 : INDEL	d	r	0.3057	0.0064	0.2979	0.3214	-0.0016	0.0093	0.8612	-+-++	10.3	4.459	4	0.3474
12 : 21150272 : SNP	c	g	0.0568	0.0045	0.0527	0.0686	0.0387	0.0190	0.04143	++?--	0.0	2.890	3	0.4089
10 : 1333929 : SNP	a	g	0.0801	0.0120	0.0711	0.1050	-0.0257	0.0266	0.334	-??--	0.0	0.741	2	0.6904
2 : 28335336 : SNP	a	g	0.0376	0.0036	0.0350	0.0450	-0.0042	0.0238	0.8611	-+??+	0.0	1.023	2	0.5996
9 : 140753497 : SNP	a	g	0.2110	0.0021	0.2099	0.2149	-0.0120	0.0276	0.663	??+?-	0.0	0.265	1	0.6069
2 : 128746734 : SNP	a	g	0.7675	0.0078	0.7465	0.7776	-0.0002	0.0100	0.9839	++-+-	18.9	4.933	4	0.2943
6 : 50813611 : SNP	t	c	0.0197	0.0000	0.0197	0.0197	0.0040	0.0505	0.9369	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 107718332 : SNP	a	g	0.5638	0.0063	0.5460	0.5671	0.0137	0.0085	0.1101	+++++	0.0	0.796	4	0.939
10 : 56541956 : SNP	t	c	0.9325	0.0047	0.9263	0.9363	-0.0022	0.0192	0.9076	-+?++	63.9	8.322	3	0.03981
1 : 179362501 : SNP	a	g	0.6123	0.0176	0.5774	0.6234	0.0031	0.0089	0.7242	+---+	0.0	1.694	4	0.7918
10 : 44876461 : SNP	a	g	0.0116	0.0000	0.0116	0.0116	0.0700	0.0657	0.2867	+????	0.0	0.000	0	1
13 : 84238849 : SNP	a	g	0.8243	0.0159	0.7947	0.8345	-0.0193	0.0112	0.08448	--+-+	0.0	1.775	4	0.777
1 : 14408759 : SNP	t	g	0.8771	0.0070	0.8515	0.8809	0.0082	0.0130	0.5275	-+-++	0.0	3.044	4	0.5504
12 : 125752359 : INDEL	i	r	0.0662	0.0091	0.0560	0.0745	0.0104	0.0216	0.6301	++??-	42.0	3.446	2	0.1786
3 : 3082429 : SNP	t	c	0.9067	0.0063	0.9011	0.9248	0.0188	0.0149	0.2062	++--+	0.0	3.890	4	0.4211
7 : 128223717 : SNP	a	c	0.5495	0.0137	0.5187	0.5673	0.0051	0.0085	0.5537	+0-++	0.0	3.741	4	0.4422
3 : 81027695 : SNP	a	g	0.7601	0.0095	0.7514	0.7764	-0.0092	0.0101	0.3596	-+-++	30.0	5.716	4	0.2214
14 : 52995786 : SNP	t	g	0.5940	0.0131	0.5756	0.6049	-0.0001	0.0091	0.9911	+-++-	30.7	5.769	4	0.2171
1 : 88503855 : SNP	t	c	0.3749	0.0168	0.3583	0.4095	-0.0070	0.0091	0.4408	-+---	21.1	5.071	4	0.2801
17 : 80011975 : SNP	a	g	0.0983	0.0281	0.0714	0.1344	0.0032	0.0185	0.8628	--?++	54.9	6.657	3	0.08367
3 : 126215314 : SNP	a	g	0.0741	0.0034	0.0676	0.0759	-0.0069	0.0269	0.7972	-???+	13.3	1.154	1	0.2828
6 : 150759986 : SNP	a	g	0.5340	0.0087	0.5171	0.5431	0.0096	0.0085	0.2617	++++-	19.1	4.945	4	0.293
11 : 108767169 : SNP	a	g	0.1570	0.0070	0.1504	0.1803	0.0158	0.0128	0.2163	+-++?	0.0	2.845	3	0.4162
19 : 24067702 : SNP	t	c	0.1797	0.0034	0.1688	0.1829	-0.0012	0.0112	0.9118	++--+	50.0	8.003	4	0.09149
2 : 142321518 : SNP	t	c	0.9817	0.0000	0.9817	0.9817	-0.0570	0.0445	0.2	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 130700711 : SNP	t	c	0.9356	0.0048	0.9297	0.9395	-0.0034	0.0196	0.8632	+-???	0.0	0.275	1	0.5997
18 : 34229141 : SNP	t	g	0.0350	0.0060	0.0296	0.0417	0.0208	0.0315	0.5085	-+???	0.0	0.957	1	0.3278
1 : 180920534 : SNP	a	g	0.1530	0.0108	0.1273	0.1595	0.0032	0.0122	0.7951	-+-++	0.0	2.196	4	0.6997
10 : 97316516 : SNP	t	c	0.1654	0.0073	0.1510	0.1746	0.0177	0.0114	0.1195	++-+-	41.6	6.847	4	0.1442
9 : 25830482 : SNP	t	c	0.0176	0.0000	0.0176	0.0176	-0.0110	0.0455	0.8089	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 83514395 : SNP	a	g	0.2394	0.0105	0.2328	0.2742	0.0075	0.0101	0.4593	+-+++	0.0	3.309	4	0.5075
5 : 113626908 : INDEL	d	r	0.7739	0.0161	0.7331	0.7869	-0.0071	0.0105	0.4985	-0---	0.0	3.063	4	0.5474
11 : 102477395 : SNP	a	g	0.5333	0.0067	0.5284	0.5499	0.0065	0.0085	0.4446	-+++-	41.4	6.822	4	0.1456
11 : 24757168 : SNP	t	c	0.2294	0.0127	0.2008	0.2486	0.0029	0.0101	0.7754	-+-++	0.0	3.385	4	0.4955
8 : 101786671 : SNP	t	c	0.9711	0.0000	0.9711	0.9711	0.0190	0.0505	0.707	+????	0.0	0.000	0	1
16 : 55080252 : SNP	a	g	0.4377	0.0096	0.4188	0.4561	-0.0185	0.0085	0.02967	-----	0.0	1.427	4	0.8396
10 : 26336588 : SNP	t	c	0.0568	0.0000	0.0568	0.0568	0.0000	0.0384	1	0????	0.0	0.000	0	1
14 : 35967108 : SNP	t	g	0.5756	0.0101	0.5585	0.5844	0.0074	0.0086	0.3846	+-+++	0.0	3.654	4	0.4548
3 : 76443728 : SNP	a	g	0.8306	0.0106	0.8178	0.8549	-0.0081	0.0114	0.4773	--++-	0.0	2.565	4	0.633
2 : 97492479 : SNP	a	g	0.0743	0.0120	0.0638	0.1027	0.0127	0.0171	0.4569	++?--	13.8	3.481	3	0.3233
7 : 53333500 : SNP	a	g	0.1585	0.0125	0.1509	0.1851	0.0080	0.0118	0.4952	++-+-	19.0	4.938	4	0.2937
22 : 39304509 : SNP	t	c	0.7834	0.0111	0.7613	0.8113	-0.0087	0.0118	0.4638	-+---	0.0	2.758	4	0.599
16 : 86050359 : SNP	c	g	0.7622	0.0265	0.7072	0.7810	-0.0281	0.0185	0.128	-?++-	0.0	2.430	3	0.488
10 : 129825454 : SNP	t	g	0.2122	0.0115	0.1883	0.2369	0.0139	0.0106	0.1892	+++-+	0.0	1.574	4	0.8135
8 : 104055636 : SNP	t	c	0.1086	0.0067	0.0925	0.1168	-0.0097	0.0137	0.4798	+-+--	0.0	2.300	4	0.6808
5 : 180570386 : SNP	a	g	0.1945	0.0075	0.1797	0.2130	-0.0202	0.0119	0.0883	----+	0.0	2.018	4	0.7324
2 : 81350538 : SNP	t	c	0.1154	0.0082	0.1012	0.1227	0.0142	0.0132	0.2804	++--+	6.6	4.283	4	0.3691
20 : 4263533 : SNP	a	g	0.9487	0.0063	0.9450	0.9665	0.0069	0.0206	0.7384	++??-	0.0	0.395	2	0.8206
10 : 129786646 : SNP	t	c	0.0202	0.0000	0.0202	0.0202	0.0730	0.0505	0.1487	+????	0.0	0.000	0	1
11 : 40800411 : SNP	t	g	0.0717	0.0120	0.0526	0.0834	-0.0047	0.0217	0.8273	-+?+-	17.4	3.633	3	0.3039
18 : 42454688 : SNP	t	c	0.4336	0.0128	0.4196	0.4733	0.0050	0.0085	0.556	0++++	0.0	1.105	4	0.8935
8 : 140284626 : SNP	a	g	0.0372	0.0039	0.0322	0.0410	-0.0522	0.0269	0.05235	--??-	32.5	2.963	2	0.2272
2 : 12971850 : INDEL	d	r	0.5379	0.0182	0.5109	0.5691	-0.0001	0.0085	0.9947	+0+--	0.0	2.642	4	0.6194
18 : 52665271 : SNP	a	g	0.7266	0.0053	0.7223	0.7406	-0.0104	0.0094	0.2697	-++--	16.3	4.778	4	0.3109
15 : 38554355 : SNP	c	g	0.2316	0.0094	0.1984	0.2424	0.0089	0.0104	0.3938	++---	0.0	2.559	4	0.634
1 : 195506335 : SNP	a	g	0.6760	0.0210	0.6583	0.7211	-0.0096	0.0092	0.2955	-----	0.0	0.431	4	0.9799
12 : 52516351 : SNP	t	g	0.8910	0.0082	0.8617	0.8972	-0.0123	0.0141	0.3839	-0++-	14.8	4.693	4	0.3203
19 : 24237847 : SNP	a	t	0.1956	0.0095	0.1834	0.2157	-0.0039	0.0109	0.7178	-+---	0.0	3.273	4	0.5132
16 : 16943833 : SNP	a	g	0.8407	0.0148	0.8265	0.8585	-0.0006	0.0117	0.9586	-+-++	0.0	0.872	4	0.9285
11 : 14192423 : SNP	a	g	0.1650	0.0090	0.1486	0.1900	0.0028	0.0121	0.8153	++---	61.3	10.346	4	0.03499
6 : 30228879 : SNP	t	c	0.3064	0.0374	0.2159	0.3321	0.0004	0.0195	0.9817	??+-+	46.4	3.729	2	0.155
5 : 40203125 : SNP	t	g	0.7408	0.0036	0.7276	0.7442	0.0088	0.0097	0.3685	+++++	0.0	0.149	4	0.9973
4 : 21064139 : SNP	a	g	0.0783	0.0072	0.0735	0.0925	0.0105	0.0169	0.5356	+-?-+	0.0	1.707	3	0.6353
13 : 102424419 : SNP	t	c	0.9644	0.0043	0.9597	0.9683	0.0178	0.0269	0.5078	++???	0.0	0.017	1	0.897
4 : 64257346 : INDEL	d	r	0.2291	0.0080	0.2078	0.2331	0.0170	0.0101	0.09127	++---	0.0	3.830	4	0.4295
11 : 95243717 : SNP	c	g	0.3843	0.0121	0.3731	0.4125	0.0190	0.0087	0.02977	++++-	45.4	7.332	4	0.1193
12 : 73497640 : SNP	t	c	0.5425	0.0097	0.5229	0.5770	-0.0143	0.0085	0.09261	-+---	46.6	7.494	4	0.112
1 : 76124517 : SNP	a	g	0.2989	0.0109	0.2929	0.3304	-0.0120	0.0098	0.2196	--++-	0.0	0.516	4	0.9719
7 : 12958160 : SNP	a	g	0.2270	0.0269	0.1966	0.2773	-0.0128	0.0105	0.2198	-----	0.0	0.345	4	0.9867
8 : 23356673 : SNP	c	g	0.9557	0.0030	0.9517	0.9603	-0.0290	0.0220	0.1882	--??+	0.0	1.104	2	0.5757
7 : 135002030 : SNP	a	c	0.1734	0.0060	0.1662	0.1978	-0.0153	0.0117	0.1905	----+	31.4	5.828	4	0.2124
2 : 188472896 : SNP	a	g	0.5802	0.0109	0.5478	0.5885	-0.0056	0.0090	0.5327	--+-+	42.8	6.997	4	0.136
14 : 101306841 : INDEL	d	r	0.4143	0.0236	0.3964	0.4493	0.0147	0.0092	0.112	+++-+	0.0	1.141	4	0.8878
6 : 113006181 : SNP	a	t	0.9619	0.0000	0.9619	0.9619	-0.0270	0.0374	0.4704	-????	0.0	0.000	0	1
6 : 15155672 : SNP	t	c	0.9669	0.0021	0.9643	0.9686	0.0148	0.0273	0.5884	++???	0.0	0.003	1	0.9571
15 : 24760674 : SNP	a	g	0.9469	0.0000	0.9469	0.9469	0.0601	0.0591	0.3092	????+	0.0	0.000	0	1
4 : 65215785 : INDEL	d	r	0.1932	0.0202	0.1788	0.2320	0.0152	0.0110	0.1691	+++++	0.0	0.181	4	0.9962
13 : 23449887 : SNP	t	c	0.8767	0.0071	0.8726	0.8991	-0.0027	0.0147	0.855	-+?--	0.0	1.260	3	0.7386
2 : 7545894 : SNP	t	c	0.5363	0.0162	0.5214	0.5645	-0.0122	0.0085	0.1525	--+--	0.0	1.146	4	0.887
1 : 89954247 : SNP	c	g	0.9621	0.0099	0.9401	0.9690	-0.0089	0.0316	0.779	-??++	3.7	2.077	2	0.3539
6 : 135784532 : SNP	a	g	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	-0.0580	0.0485	0.232	-????	0.0	0.000	0	1
7 : 134801851 : SNP	a	c	0.0478	0.0020	0.0438	0.0494	-0.0143	0.0218	0.5123	--??+	0.0	0.425	2	0.8088
3 : 14796144 : SNP	t	c	0.0649	0.0066	0.0585	0.0809	-0.0276	0.0181	0.1284	--?-+	40.0	5.001	3	0.1717
3 : 196155551 : SNP	t	c	0.0272	0.0000	0.0272	0.0272	0.0890	0.0435	0.04061	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 52726877 : SNP	a	g	0.6679	0.0071	0.6583	0.6879	0.0118	0.0091	0.1953	+++-+	0.0	1.705	4	0.7898
15 : 38404425 : SNP	t	c	0.1152	0.0163	0.1030	0.1584	-0.0135	0.0134	0.3132	-----	0.0	0.478	4	0.9756
2 : 163689074 : SNP	a	c	0.4048	0.0142	0.3906	0.4525	0.0133	0.0090	0.1386	++-++	27.8	5.539	4	0.2363
11 : 17135084 : SNP	t	c	0.9357	0.0123	0.9166	0.9490	0.0141	0.0191	0.4606	--?++	0.0	2.518	3	0.4721
17 : 69033760 : SNP	a	g	0.3664	0.0129	0.3393	0.3766	-0.0135	0.0091	0.1411	-+---	14.0	4.653	4	0.3247
8 : 57750193 : SNP	a	g	0.9852	0.0000	0.9852	0.9852	-0.0260	0.0637	0.6831	-????	0.0	0.000	0	1
11 : 57911704 : SNP	t	c	0.9630	0.0002	0.9629	0.9633	-0.0266	0.0266	0.3173	--???	0.0	0.066	1	0.7965
5 : 121802585 : SNP	a	g	0.9752	0.0000	0.9752	0.9752	0.0760	0.0485	0.1173	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 106443617 : SNP	a	g	0.5384	0.0128	0.5264	0.5703	0.0009	0.0091	0.9211	+--++	0.0	2.263	4	0.6874
1 : 41189835 : SNP	a	g	0.3426	0.0076	0.3224	0.3486	0.0112	0.0092	0.2205	+0+-+	0.0	1.718	4	0.7875
9 : 79028204 : SNP	c	g	0.9450	0.0071	0.9294	0.9491	0.0317	0.0196	0.1048	++?--	4.0	3.125	3	0.3727
20 : 23487503 : SNP	t	c	0.4700	0.0192	0.4294	0.4837	0.0070	0.0085	0.4104	+--++	0.0	2.670	4	0.6144
10 : 94466403 : SNP	t	c	0.0172	0.0000	0.0172	0.0172	0.0740	0.0475	0.1193	+????	0.0	0.000	0	1
1 : 55950041 : SNP	t	c	0.0143	0.0000	0.0143	0.0143	0.0240	0.0505	0.6349	+????	0.0	0.000	0	1
14 : 43713490 : SNP	t	c	0.8447	0.0152	0.8214	0.8647	-0.0165	0.0120	0.1677	---+-	0.0	1.032	4	0.905
7 : 53618477 : SNP	a	g	0.0540	0.0042	0.0504	0.0622	-0.0093	0.0189	0.6232	++?+-	64.2	8.383	3	0.03873
1 : 150018719 : SNP	t	c	0.8367	0.0077	0.8125	0.8609	-0.0219	0.0114	0.05615	----+	0.0	1.666	4	0.7968
2 : 7341851 : SNP	a	g	0.2523	0.0052	0.2322	0.2603	-0.0007	0.0098	0.946	0++--	15.1	4.713	4	0.3181
15 : 56290020 : SNP	a	t	0.1056	0.0080	0.0919	0.1166	-0.0184	0.0138	0.1811	-----	0.0	0.752	4	0.9448
9 : 6982952 : SNP	a	c	0.0185	0.0000	0.0185	0.0185	0.0020	0.0455	0.9649	+????	0.0	0.000	0	1
7 : 133475358 : SNP	a	g	0.9827	0.0000	0.9827	0.9827	-0.0470	0.0607	0.4384	-????	0.0	0.000	0	1
1 : 162493123 : SNP	a	g	0.5338	0.0106	0.5255	0.5633	-0.0065	0.0085	0.4448	--+--	0.0	1.749	4	0.7818
15 : 93077969 : SNP	a	g	0.9300	0.0052	0.9256	0.9420	-0.0069	0.0173	0.6916	-+?--	35.0	4.616	3	0.2022
11 : 133347470 : SNP	a	g	0.0156	0.0000	0.0156	0.0156	-0.0440	0.0505	0.384	-????	0.0	0.000	0	1
12 : 113086315 : SNP	t	c	0.0209	0.0000	0.0209	0.0209	-0.0260	0.0435	0.5497	-????	0.0	0.000	0	1
4 : 104991444 : SNP	t	c	0.2082	0.0039	0.2028	0.2117	0.0053	0.0106	0.6153	+---+	39.1	6.567	4	0.1606
1 : 29121670 : SNP	t	c	0.1439	0.0130	0.1306	0.1761	-0.0107	0.0123	0.3856	-+-+-	35.9	6.240	4	0.1819
1 : 4491953 : SNP	a	g	0.0442	0.0016	0.0421	0.0453	-0.0107	0.0244	0.6612	-+???	0.0	0.922	1	0.3369
3 : 129463505 : SNP	t	c	0.0828	0.0049	0.0633	0.0860	-0.0343	0.0166	0.03896	--?--	0.0	2.305	3	0.5115
8 : 56938244 : INDEL	d	r	0.2623	0.0281	0.2477	0.3194	0.0033	0.0098	0.7389	-++++	0.0	1.722	4	0.7868
11 : 3080102 : SNP	a	g	0.4008	0.0090	0.3728	0.4108	0.0066	0.0089	0.4591	+-+-+	21.2	5.078	4	0.2794
12 : 18408533 : SNP	t	g	0.4159	0.0083	0.4049	0.4351	-0.0119	0.0085	0.1633	--+-+	28.5	5.597	4	0.2313
20 : 62459862 : INDEL	d	r	0.0544	0.0035	0.0495	0.0575	0.0174	0.0214	0.4163	++??+	0.0	0.494	2	0.7813
11 : 28472025 : SNP	t	c	0.9583	0.0091	0.9437	0.9639	0.0215	0.0335	0.521	+???+	0.0	0.629	1	0.4276
14 : 33184890 : SNP	a	g	0.0848	0.0053	0.0703	0.0980	-0.0022	0.0155	0.8884	-++++	71.4	13.969	4	0.007396
10 : 35008523 : SNP	a	c	0.9574	0.0039	0.9522	0.9613	-0.0390	0.0225	0.08244	--??-	0.0	1.643	2	0.4397
1 : 150633007 : INDEL	d	r	0.5038	0.0192	0.4517	0.5161	-0.0002	0.0085	0.9828	-+-+-	16.0	4.763	4	0.3125
14 : 106063104 : SNP	t	g	0.2670	0.0037	0.2626	0.2701	-0.0084	0.0480	0.861	??-+?	70.0	3.335	1	0.06781
1 : 188440722 : SNP	t	g	0.0879	0.0093	0.0789	0.1096	-0.0016	0.0149	0.9123	-+-++	0.0	3.733	4	0.4433
12 : 49257992 : SNP	t	c	0.0590	0.0031	0.0508	0.0603	-0.0150	0.0190	0.4308	-+??-	38.0	3.225	2	0.1993
8 : 6921357 : SNP	a	g	0.0405	0.0000	0.0405	0.0405	0.0590	0.0394	0.1345	+????	0.0	0.000	0	1
2 : 230987609 : SNP	a	c	0.8159	0.0084	0.7982	0.8221	-0.0137	0.0113	0.2269	----+	0.0	3.418	4	0.4904
14 : 64766149 : SNP	t	c	0.0214	0.0000	0.0214	0.0214	0.0630	0.0617	0.3069	+????	0.0	0.000	0	1
3 : 96862313 : SNP	a	g	0.9749	0.0000	0.9749	0.9749	0.0060	0.0495	0.9036	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 103675352 : SNP	a	g	0.0266	0.0000	0.0266	0.0266	-0.0180	0.0445	0.6857	-????	0.0	0.000	0	1
5 : 26841837 : SNP	t	g	0.0165	0.0000	0.0165	0.0165	0.0870	0.0586	0.1378	+????	0.0	0.000	0	1
8 : 112368155 : SNP	t	c	0.9564	0.0000	0.9564	0.9564	-0.0100	0.0323	0.7572	-????	0.0	0.000	0	1
2 : 17803475 : SNP	a	g	0.9360	0.0030	0.9251	0.9389	0.0113	0.0181	0.5335	++?+-	41.5	5.